]> git.uio.no Git - u/mrichter/AliRoot.git/blobdiff - STEER/AliRun.cxx
Modifications needed by Geant4 (I.Hrivnacova)
[u/mrichter/AliRoot.git] / STEER / AliRun.cxx
index c0e4580535d6fd96da3b68ec8ce8dc37254f35a3..d3eeaf5e7486681ab6b8094fe411ca63ae7f4ef2 100644 (file)
  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  **************************************************************************/
 
-/*
-$Log$
-Revision 1.21  1999/11/25 10:40:08  fca
-Fixing daughters information also in primary tracks
-
-Revision 1.20  1999/10/04 18:08:49  fca
-Adding protection against inconsistent Euclid files
-
-Revision 1.19  1999/09/29 07:50:40  fca
-Introduction of the Copyright and cvs Log
-
-*/
+/* $Id$ */
 
 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
 //                                                                           //
@@ -51,82 +40,111 @@ Introduction of the Copyright and cvs Log
 //                                                                           //
 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
 
-#include <TFile.h>
-#include <TRandom.h>
 #include <TBRIK.h> 
-#include <TNode.h> 
 #include <TCint.h> 
+#include <TDatabasePDG.h>
+#include <TGeometry.h>
+#include <TNode.h>
+#include <TROOT.h>
+#include <TRandom3.h>
 #include <TSystem.h>
-#include <TObjectTable.h>
-
-#include "TParticle.h"
-#include "AliRun.h"
+#include <TVirtualMC.h>
+// 
+#include "AliDetector.h"
 #include "AliDisplay.h"
+#include "AliHeader.h"
+#include "AliLego.h"
+#include "AliLegoGenerator.h"
+#include "AliMC.h"
+#include "AliMagFC.h"
+#include "AliMagFCM.h"
+#include "AliMagFDM.h"
+#include "AliPDG.h"
+#include "AliRun.h"
+#include "AliStack.h"
 
-#include "AliCallf77.h" 
-#include <stdlib.h>
-#include <stdio.h>
-#include <string.h>
 AliRun *gAlice;
 
-static AliHeader *header;
-
-#ifndef WIN32
-
-# define rxgtrak rxgtrak_
-# define rxstrak rxstrak_
-# define rxkeep  rxkeep_ 
-# define rxouth  rxouth_
-#else
-
-# define rxgtrak RXGTRAK 
-# define rxstrak RXSTRAK 
-# define rxkeep  RXKEEP  
-# define rxouth  RXOUTH
-#endif
-
-static TArrayF sEventEnergy;
-static TArrayF sSummEnergy;
-static TArrayF sSum2Energy;
 
 ClassImp(AliRun)
 
-//_____________________________________________________________________________
-AliRun::AliRun()
+//_______________________________________________________________________
+AliRun::AliRun():
+  fRun(0),
+  fEvent(0),
+  fEventNrInRun(0),
+  fEventsPerRun(0),
+  fDebug(0),
+  fModules(0),
+  fGeometry(0),
+  fMCApp(0),
+  fDisplay(0),
+  fField(0),
+  fMC(0),
+  fNdets(0),
+  fInitDone(kFALSE),
+  fLego(0),
+  fPDGDB(0),  //Particle factory object
+  fConfigFunction("\0"),
+  fRandom(0),
+  fRunLoader(0x0)
 {
   //
   // Default constructor for AliRun
   //
-  header=&fHeader;
-  fRun       = 0;
-  fEvent     = 0;
-  fCurrent   = -1;
-  fModules = 0;
-  fGenerator = 0;
-  fTreeD     = 0;
-  fTreeK     = 0;
-  fTreeH     = 0;
-  fTreeE     = 0;
-  fTreeR     = 0;
-  fParticles = 0;
-  fGeometry  = 0;
-  fDisplay   = 0;
-  fField     = 0;
-  fMC        = 0;
-  fNdets     = 0;
-  fImedia    = 0;
-  fTrRmax    = 1.e10;
-  fTrZmax    = 1.e10;
-  fInitDone  = kFALSE;
-  fLego      = 0;
-  fPDGDB     = 0;        //Particle factory object!
-}
-
-//_____________________________________________________________________________
-AliRun::AliRun(const char *name, const char *title)
-  : TNamed(name,title)
+  AliConfig::Instance();//skowron 29 Feb 2002
+                        //ensures that the folder structure is build
+}
+
+//_______________________________________________________________________
+AliRun::AliRun(const AliRun& arun):
+  TNamed(arun),
+  fRun(0),
+  fEvent(0),
+  fEventNrInRun(0),
+  fEventsPerRun(0),
+  fDebug(0),
+  fModules(0),
+  fGeometry(0),
+  fMCApp(0),
+  fDisplay(0),
+  fField(0),
+  fMC(0),
+  fNdets(0),
+  fInitDone(kFALSE),
+  fLego(0),
+  fPDGDB(0),  //Particle factory object
+  fConfigFunction("\0"),
+  fRandom(0),
+  fRunLoader(0x0)
+{
+  //
+  // Copy constructor for AliRun
+  //
+  arun.Copy(*this);
+}
+
+//_____________________________________________________________________________
+AliRun::AliRun(const char *name, const char *title):
+  TNamed(name,title),
+  fRun(0),
+  fEvent(0),
+  fEventNrInRun(0),
+  fEventsPerRun(0),
+  fDebug(0),
+  fModules(new TObjArray(77)), // Support list for the Detectors
+  fGeometry(0),
+  fMCApp(0),
+  fDisplay(0),
+  fField(0),
+  fMC(gMC),
+  fNdets(0),
+  fInitDone(kFALSE),
+  fLego(0),
+  fPDGDB(TDatabasePDG::Instance()),        //Particle factory object!
+  fConfigFunction("Config();"),
+  fRandom(new TRandom3()),
+  fRunLoader(0x0)
 {
   //
   //  Constructor for the main processor.
@@ -134,126 +152,72 @@ AliRun::AliRun(const char *name, const char *title)
   //  Creates the list of Detectors.
   //  Creates the list of particles.
   //
-  Int_t i;
-  
+
   gAlice     = this;
-  fTreeD     = 0;
-  fTreeK     = 0;
-  fTreeH     = 0;
-  fTreeE     = 0;
-  fTreeR     = 0;
-  fTrRmax    = 1.e10;
-  fTrZmax    = 1.e10;
-  fGenerator = 0;
-  fInitDone  = kFALSE;
-  fLego      = 0;
-  fField     = 0;
-  
+
+  // Set random number generator
+  gRandom = fRandom;
+
+  if (gSystem->Getenv("CONFIG_SEED")) {
+     gRandom->SetSeed(static_cast<UInt_t>(atoi(gSystem->Getenv("CONFIG_SEED"))));
+  }
+
+  // Add to list of browsable  
   gROOT->GetListOfBrowsables()->Add(this,name);
-  //
-  // create the support list for the various Detectors
-  fModules = new TObjArray(77);
-  //
   // Create the TNode geometry for the event display
-  
   BuildSimpleGeometry();
   
-
-  fNtrack=0;
-  fHgwmk=0;
-  fCurrent=-1;
-  header=&fHeader;
-  fRun       = 0;
-  fEvent     = 0;
-  //
-  // Create the particle stack
-  fParticles = new TClonesArray("TParticle",100);
-  
-  fDisplay = 0;
-  //
   // Create default mag field
   SetField();
-  //
-  fMC      = gMC;
-  //
-  // Prepare the tracking medium lists
-  fImedia = new TArrayI(1000);
-  for(i=0;i<1000;i++) (*fImedia)[i]=-99;
-  //
-  // Make particles
-  fPDGDB     = TDatabasePDG::Instance();        //Particle factory object!
+
+  // Add particle list to configuration
+  AliConfig::Instance()->Add(fPDGDB); 
+
 }
 
-//_____________________________________________________________________________
+
+//_______________________________________________________________________
 AliRun::~AliRun()
 {
   //
-  // Defaullt AliRun destructor
+  // Default AliRun destructor
   //
-  delete fImedia;
+  gROOT->GetListOfBrowsables()->Remove(this);
+
+  if (fRunLoader)
+   {
+    TFolder* evfold = fRunLoader->GetEventFolder();
+    TFolder* modfold = dynamic_cast<TFolder*>(evfold->FindObjectAny(AliConfig::GetModulesFolderName()));
+    TIter next(fModules);
+    AliModule *mod;
+    while((mod = (AliModule*)next()))
+     { 
+       modfold->Remove(mod);
+     }
+   }
+  
+  
   delete fField;
-  delete fMC;
+  delete fMCApp;
+  delete gMC; gMC=0;
   delete fGeometry;
   delete fDisplay;
-  delete fGenerator;
   delete fLego;
-  delete fTreeD;
-  delete fTreeK;
-  delete fTreeH;
-  delete fTreeE;
-  delete fTreeR;
   if (fModules) {
     fModules->Delete();
     delete fModules;
   }
-  if (fParticles) {
-    fParticles->Delete();
-    delete fParticles;
-  }
-}
-
-//_____________________________________________________________________________
-void AliRun::AddHit(Int_t id, Int_t track, Int_t *vol, Float_t *hits) const
-{
-  //
-  //  Add a hit to detector id
-  //
-  TObjArray &dets = *fModules;
-  if(dets[id]) ((AliModule*) dets[id])->AddHit(track,vol,hits);
-}
-
-//_____________________________________________________________________________
-void AliRun::AddDigit(Int_t id, Int_t *tracks, Int_t *digits) const
-{
-  //
-  // Add digit to detector id
-  //
-  TObjArray &dets = *fModules;
-  if(dets[id]) ((AliModule*) dets[id])->AddDigit(tracks,digits);
+  
+  delete fPDGDB;
 }
 
-//_____________________________________________________________________________
-void AliRun::Browse(TBrowser *b)
+//_______________________________________________________________________
+void AliRun::Copy(TObject &) const
 {
-  //
-  // Called when the item "Run" is clicked on the left pane
-  // of the Root browser.
-  // It displays the Root Trees and all detectors.
-  //
-  if (fTreeK) b->Add(fTreeK,fTreeK->GetName());
-  if (fTreeH) b->Add(fTreeH,fTreeH->GetName());
-  if (fTreeD) b->Add(fTreeD,fTreeD->GetName());
-  if (fTreeE) b->Add(fTreeE,fTreeE->GetName());
-  if (fTreeR) b->Add(fTreeR,fTreeR->GetName());
-  
-  TIter next(fModules);
-  AliModule *detector;
-  while((detector = (AliModule*)next())) {
-    b->Add(detector,detector->GetName());
-  }
+  Fatal("Copy","Not implemented!\n");
 }
 
-//_____________________________________________________________________________
+//_______________________________________________________________________
 void AliRun::Build()
 {
   //
@@ -262,7 +226,7 @@ void AliRun::Build()
   //
 }
  
-//_____________________________________________________________________________
+//_______________________________________________________________________
 void AliRun::BuildSimpleGeometry()
 {
   //
@@ -277,79 +241,40 @@ void AliRun::BuildSimpleGeometry()
   new TNode("alice","alice","S_alice");
 }
 
-//_____________________________________________________________________________
+//_______________________________________________________________________
 void AliRun::CleanDetectors()
 {
   //
   // Clean Detectors at the end of event
   //
-  TIter next(fModules);
-  AliModule *detector;
-  while((detector = (AliModule*)next())) {
-    detector->FinishEvent();
-  }
-}
-
-//_____________________________________________________________________________
-void AliRun::CleanParents()
-{
-  //
-  // Clean Particles stack.
-  // Set parent/daughter relations
-  //
-  TClonesArray &particles = *(gAlice->Particles());
-  TParticle *part;
-  int i;
-  for(i=0; i<fNtrack; i++) {
-    part = (TParticle *)particles.UncheckedAt(i);
-    if(!part->TestBit(Daughters_Bit)) {
-      part->SetFirstDaughter(-1);
-      part->SetLastDaughter(-1);
-    }
-  }
+   fRunLoader->CleanDetectors();
 }
 
-//_____________________________________________________________________________
-Int_t AliRun::DistancetoPrimitive(Int_t, Int_t)
+//_______________________________________________________________________
+void AliRun::ResetHits() 
 {
-  //
-  // Return the distance from the mouse to the AliRun object
-  // Dummy routine
-  //
-  return 9999;
+  fMCApp->ResetHits();
 }
 
-//_____________________________________________________________________________
-void AliRun::DumpPart (Int_t i)
+//_______________________________________________________________________
+AliGenerator* AliRun::Generator() const 
 {
-  //
-  // Dumps particle i in the stack
-  //
-  TClonesArray &particles = *fParticles;
-  ((TParticle*) particles[i])->Print();
+  return fMCApp->Generator();
 }
 
-//_____________________________________________________________________________
-void AliRun::DumpPStack ()
+//_______________________________________________________________________
+void  AliRun::SetField(AliMagF* magField)
 {
   //
-  // Dumps the particle stack
+  // Set Magnetic Field Map
   //
-  TClonesArray &particles = *fParticles;
-  printf(
-        "\n\n=======================================================================\n");
-  for (Int_t i=0;i<fNtrack;i++) 
-    {
-      printf("-> %d ",i); ((TParticle*) particles[i])->Print();
-      printf("--------------------------------------------------------------\n");
-    }
-  printf(
-        "\n=======================================================================\n\n");
+  fField = magField;
+  fField->ReadField();
 }
 
-//_____________________________________________________________________________
+//_______________________________________________________________________
 void AliRun::SetField(Int_t type, Int_t version, Float_t scale,
-                     Float_t maxField, char* filename)
+                     Float_t maxField, const char* filename)
 {
   //
   //  Set magnetic field parameters
@@ -360,17 +285,14 @@ void AliRun::SetField(Int_t type, Int_t version, Float_t scale,
 
   //
   // --- Sanity check on mag field flags
-  if(type<0 || type > 2) {
-    Warning("SetField",
-           "Invalid magnetic field flag: %5d; Helix tracking chosen instead\n"
-          ,type);
-    type=2;
-  }
   if(fField) delete fField;
   if(version==1) {
-    fField = new AliMagFC("Map1"," ",type,version,scale,maxField);
-  } else if(version<=3) {
-    fField = new AliMagFCM("Map2-3",filename,type,version,scale,maxField);
+    fField = new AliMagFC("Map1"," ",type,scale,maxField);
+  } else if(version<=2) {
+    fField = new AliMagFCM("Map2-3",filename,type,scale,maxField);
+    fField->ReadField();
+  } else if(version==3) {
+    fField = new AliMagFDM("Map4",filename,type,scale,maxField);
     fField->ReadField();
   } else {
     Warning("SetField","Invalid map %d\n",version);
@@ -378,250 +300,106 @@ void AliRun::SetField(Int_t type, Int_t version, Float_t scale,
 }
 
 //_____________________________________________________________________________
-void AliRun::FillTree()
-{
-  //
-  // Fills all AliRun TTrees
-  //
-  if (fTreeK) fTreeK->Fill();
-  if (fTreeH) fTreeH->Fill();
-  if (fTreeD) fTreeD->Fill();
-  if (fTreeR) fTreeR->Fill();
-}
-//_____________________________________________________________________________
-void AliRun::FinishPrimary()
-{
-  //
-  // Called  at the end of each primary track
-  //
-  
-  //  static Int_t count=0;
-  //  const Int_t times=10;
-  // This primary is finished, purify stack
-  gAlice->PurifyKine();
-
-  // Write out hits if any
-  if (gAlice->TreeH()) {
-    gAlice->TreeH()->Fill();
-  }
-  
-  // Reset Hits info
-  gAlice->ResetHits();
-
-  //
-  //  if(++count%times==1) gObjectTable->Print();
-}
 
-//_____________________________________________________________________________
-void AliRun::FinishEvent()
+void AliRun::InitLoaders()
 {
-  //
-  // Called at the end of the event.
-  //
-  
-  //Update the energy deposit tables
-  Int_t i;
-  for(i=0;i<sEventEnergy.GetSize();i++) {
-    sSummEnergy[i]+=sEventEnergy[i];
-    sSum2Energy[i]+=sEventEnergy[i]*sEventEnergy[i];
-  }
-  sEventEnergy.Reset();
-  
-  // Clean detector information
-  CleanDetectors();
-  
-  // Write out the kinematics
-  if (fTreeK) {
-    CleanParents();
-    fTreeK->Fill();
-  }
-  
-  // Write out the digits
-  if (fTreeD) {
-    fTreeD->Fill();
-    ResetDigits();
-  }
-  
-  // Write out reconstructed clusters  
-  if (fTreeR) {
-    fTreeR->Fill();
-  }
-
-  // Write out the event Header information
-  if (fTreeE) fTreeE->Fill();
-  
-  // Reset stack info
-  ResetStack();
-  
-  // Write Tree headers
-  //  Int_t ievent = fHeader.GetEvent();
-  //  char hname[30];
-  //  sprintf(hname,"TreeK%d",ievent);
-  if (fTreeK) fTreeK->Write();
-  //  sprintf(hname,"TreeH%d",ievent);
-  if (fTreeH) fTreeH->Write();
-  //  sprintf(hname,"TreeD%d",ievent);
-  if (fTreeD) fTreeD->Write();
-  //  sprintf(hname,"TreeR%d",ievent);
-  if (fTreeR) fTreeR->Write();
+  //creates list of getters
+  if (GetDebug()) Info("InitLoaders","");
+  TIter next(fModules);
+  AliModule *mod;
+  while((mod = (AliModule*)next()))
+   { 
+     mod->SetRunLoader(fRunLoader);
+     AliDetector *det = dynamic_cast<AliDetector*>(mod);
+     if (det) 
+      {
+        if (GetDebug()) Info("InitLoaders"," Adding %s ",det->GetName());
+        fRunLoader->AddLoader(det);
+      }
+   }
+  if (GetDebug()) Info("InitLoaders","Done");
 }
-
 //_____________________________________________________________________________
+
 void AliRun::FinishRun()
 {
   //
   // Called at the end of the run.
   //
-
+  
+  if(fLego) 
+   {
+    if (GetDebug()) Info("FinishRun"," Finish Lego");
+    fRunLoader->CdGAFile();
+    fLego->FinishRun();
+   }
+  
   // Clean detector information
   TIter next(fModules);
   AliModule *detector;
-  while((detector = (AliModule*)next())) {
+  while((detector = dynamic_cast<AliModule*>(next()))) {
+    if (GetDebug()) Info("FinishRun"," %s->FinishRun()",detector->GetName());
     detector->FinishRun();
   }
   
-  //Output energy summary tables
-  EnergySummary();
-  
-  // file is retrieved from whatever tree
-  TFile *File = 0;
-  if (fTreeK) File = fTreeK->GetCurrentFile();
-  if ((!File) && (fTreeH)) File = fTreeH->GetCurrentFile();
-  if ((!File) && (fTreeD)) File = fTreeD->GetCurrentFile();
-  if ((!File) && (fTreeE)) File = fTreeE->GetCurrentFile();
-  if( NULL==File ) {
-    Error("FinishRun","There isn't root file!");
-    exit(1);
-  }
-  File->cd();
-  fTreeE->Write();
-  
-  // Clean tree information
-  delete fTreeK; fTreeK = 0;
-  delete fTreeH; fTreeH = 0;
-  delete fTreeD; fTreeD = 0;
-  delete fTreeR; fTreeR = 0;
-  delete fTreeE; fTreeE = 0;
-  
+  if (GetDebug()) Info("FinishRun"," fRunLoader->WriteHeader(OVERWRITE)");
+  fRunLoader->WriteHeader("OVERWRITE");
+
   // Write AliRun info and all detectors parameters
-  Write();
+  fRunLoader->CdGAFile();
+  Write(0,TObject::kOverwrite);//write AliRun
+  fRunLoader->Write(0,TObject::kOverwrite);//write RunLoader itself
   
-  // Close output file
-  File->Write();
-  File->Close();
-}
+  // Clean tree information
+  if (GetDebug()) Info("FinishRun"," fRunLoader->Stack()->FinishRun()");
+  fRunLoader->Stack()->FinishRun();
 
-//_____________________________________________________________________________
-void AliRun::FlagTrack(Int_t track)
-{
-  //
-  // Flags a track and all its family tree to be kept
-  //
-  int curr;
-  TParticle *particle;
+  if(fMCApp) fMCApp->FinishRun();
 
-  curr=track;
-  while(1) {
-    particle=(TParticle*)fParticles->UncheckedAt(curr);
-    
-    // If the particle is flagged the three from here upward is saved already
-    if(particle->TestBit(Keep_Bit)) return;
-    
-    // Save this particle
-    particle->SetBit(Keep_Bit);
-    
-    // Move to father if any
-    if((curr=particle->GetFirstMother())==-1) return;
-  }
+  fRunLoader->Synchronize();
 }
-//_____________________________________________________________________________
-void AliRun::EnergySummary()
+
+//_______________________________________________________________________
+void AliRun::Announce() const
 {
   //
-  // Print summary of deposited energy
+  // Announce the current version of AliRoot
   //
+  printf("%70s",
+        "****************************************************************\n");
+  printf("%6s","*");printf("%64s","*\n");
 
-  Int_t ndep=0;
-  Float_t edtot=0;
-  Float_t ed, ed2;
-  Int_t kn, i, left, j, id;
-  const Float_t zero=0;
-  Int_t ievent=fHeader.GetEvent()+1;
-  //
-  // Energy loss information
-  if(ievent) {
-    printf("***************** Energy Loss Information per event (GEV) *****************\n");
-    for(kn=1;kn<sEventEnergy.GetSize();kn++) {
-      ed=sSummEnergy[kn];
-      if(ed>0) {
-       sEventEnergy[ndep]=kn;
-       if(ievent>1) {
-         ed=ed/ievent;
-         ed2=sSum2Energy[kn];
-         ed2=ed2/ievent;
-         ed2=100*TMath::Sqrt(TMath::Max(ed2-ed*ed,zero))/ed;
-       } else 
-         ed2=99;
-       sSummEnergy[ndep]=ed;
-       sSum2Energy[ndep]=TMath::Min((Float_t) 99.,TMath::Max(ed2,zero));
-       edtot+=ed;
-       ndep++;
-      }
-    }
-    for(kn=0;kn<(ndep-1)/3+1;kn++) {
-      left=ndep-kn*3;
-      for(i=0;i<(3<left?3:left);i++) {
-       j=kn*3+i;
-        id=Int_t (sEventEnergy[j]+0.1);
-       printf(" %s %10.3f +- %10.3f%%;",gMC->VolName(id),sSummEnergy[j],sSum2Energy[j]);
-      }
-      printf("\n");
-    }
-    //
-    // Relative energy loss in different detectors
-    printf("******************** Relative Energy Loss per event ********************\n");
-    printf("Total energy loss per event %10.3f GeV\n",edtot);
-    for(kn=0;kn<(ndep-1)/5+1;kn++) {
-      left=ndep-kn*5;
-      for(i=0;i<(5<left?5:left);i++) {
-       j=kn*5+i;
-        id=Int_t (sEventEnergy[j]+0.1);
-       printf(" %s %10.3f%%;",gMC->VolName(id),100*sSummEnergy[j]/edtot);
-      }
-      printf("\n");
-    }
-    for(kn=0;kn<75;kn++) printf("*"); 
-    printf("\n");
-  }
-  //
-  // Reset the TArray's
-  sEventEnergy.Set(0);
-  sSummEnergy.Set(0);
-  sSum2Energy.Set(0);
+  printf("%6s","*");
+  printf("    You are running AliRoot version NewIO\n");
+
+  printf("%6s","*");
+  printf("    The cvs tag for the current program is $Name$\n");
+
+  printf("%6s","*");printf("%64s","*\n");
+  printf("%70s",
+        "****************************************************************\n");
 }
 
-//_____________________________________________________________________________
-AliModule *AliRun::GetModule(const char *name)
+//_______________________________________________________________________
+AliModule *AliRun::GetModule(const char *name) const
 {
   //
   // Return pointer to detector from name
   //
-  return (AliModule*)fModules->FindObject(name);
+  return dynamic_cast<AliModule*>(fModules->FindObject(name));
 }
  
-//_____________________________________________________________________________
-AliDetector *AliRun::GetDetector(const char *name)
+//_______________________________________________________________________
+AliDetector *AliRun::GetDetector(const char *name) const
 {
   //
   // Return pointer to detector from name
   //
-  return (AliDetector*)fModules->FindObject(name);
+  return dynamic_cast<AliDetector*>(fModules->FindObject(name));
 }
  
-//_____________________________________________________________________________
-Int_t AliRun::GetModuleID(const char *name)
+//_______________________________________________________________________
+Int_t AliRun::GetModuleID(const char *name) const
 {
   //
   // Return galice internal detector identifier from name
@@ -632,78 +410,56 @@ Int_t AliRun::GetModuleID(const char *name)
   return i;
 }
  
-//_____________________________________________________________________________
+//_______________________________________________________________________
 Int_t AliRun::GetEvent(Int_t event)
 {
-  //
-  // Connect the Trees Kinematics and Hits for event # event
-  // Set branch addresses
-  //
-
-  // Reset existing structures
-  ResetStack();
-  ResetHits();
+//
+// Reloads data containers in folders # event
+// Set branch addresses
+//
+  if (fRunLoader == 0x0)
+   {
+     Error("GetEvent","RunLoader is not set. Can not load data.");
+     return -1;
+   }
+/*****************************************/ 
+/****   P R E    R E L O A D I N G    ****/
+/*****************************************/ 
+// Reset existing structures
+  fMCApp->ResetHits();
+  fMCApp->ResetTrackReferences();
   ResetDigits();
-  
-  // Delete Trees already connected
-  if (fTreeK) delete fTreeK;
-  if (fTreeH) delete fTreeH;
-  if (fTreeD) delete fTreeD;
-  if (fTreeR) delete fTreeR;
-
-  // Get header from file
-  if(fTreeE) fTreeE->GetEntry(event);
-  else Error("GetEvent","Cannot file Header Tree\n");
-  
-  // Get Kine Tree from file
-  char treeName[20];
-  sprintf(treeName,"TreeK%d",event);
-  fTreeK = (TTree*)gDirectory->Get(treeName);
-  if (fTreeK) fTreeK->SetBranchAddress("Particles", &fParticles);
-  else    Error("GetEvent","cannot find Kine Tree for event:%d\n",event);
-  
-  // Get Hits Tree header from file
-  sprintf(treeName,"TreeH%d",event);
-  fTreeH = (TTree*)gDirectory->Get(treeName);
-  if (!fTreeH) {
-    Error("GetEvent","cannot find Hits Tree for event:%d\n",event);
-  }
-  
-  // Get Digits Tree header from file
-  sprintf(treeName,"TreeD%d",event);
-  fTreeD = (TTree*)gDirectory->Get(treeName);
-  if (!fTreeD) {
-    Warning("GetEvent","cannot find Digits Tree for event:%d\n",event);
-  }
-  
-  
-  // Get Reconstruct Tree header from file
-  sprintf(treeName,"TreeR%d",event);
-  fTreeR = (TTree*)gDirectory->Get(treeName);
-  if (!fTreeR) {
-    //    printf("WARNING: cannot find Reconstructed Tree for event:%d\n",event);
-  }
+  ResetSDigits();
+
+/*****************************************/ 
+/****       R  E  L  O  A  D          ****/
+/*****************************************/
+
+  fRunLoader->GetEvent(event);
+
+/*****************************************/ 
+/****  P O S T    R E L O A D I N G   ****/
+/*****************************************/ 
+
   // Set Trees branch addresses
   TIter next(fModules);
   AliModule *detector;
-  while((detector = (AliModule*)next())) {
-    detector->SetTreeAddress();
-  }
-  
-  if (fTreeK) fTreeK->GetEvent(0);
-  fNtrack = Int_t (fParticles->GetEntries());
-  return fNtrack;
+  while((detector = dynamic_cast<AliModule*>(next()))) 
+   {
+     detector->SetTreeAddress();
+   }
+  return fRunLoader->GetHeader()->GetNtrack();
 }
 
-//_____________________________________________________________________________
+//_______________________________________________________________________
 TGeometry *AliRun::GetGeometry()
 {
   //
   // Import Alice geometry from current file
   // Return pointer to geometry object
   //
-  if (!fGeometry) fGeometry = (TGeometry*)gDirectory->Get("AliceGeom");
+  if (!fGeometry) fGeometry = dynamic_cast<TGeometry*>(gDirectory->Get("AliceGeom"));
   //
   // Unlink and relink nodes in detectors
   // This is bad and there must be a better way...
@@ -711,13 +467,12 @@ TGeometry *AliRun::GetGeometry()
   
   TIter next(fModules);
   AliModule *detector;
-  while((detector = (AliModule*)next())) {
-    detector->SetTreeAddress();
+  while((detector = dynamic_cast<AliModule*>(next()))) {
     TList *dnodes=detector->Nodes();
     Int_t j;
     TNode *node, *node1;
     for ( j=0; j<dnodes->GetSize(); j++) {
-      node = (TNode*) dnodes->At(j);
+      node = dynamic_cast<TNode*>(dnodes->At(j));
       node1 = fGeometry->GetNode(node->GetName());
       dnodes->Remove(node);
       dnodes->AddAt(node1,j);
@@ -726,553 +481,248 @@ TGeometry *AliRun::GetGeometry()
   return fGeometry;
 }
 
-//_____________________________________________________________________________
-void AliRun::GetNextTrack(Int_t &mtrack, Int_t &ipart, Float_t *pmom,
-                         Float_t &e, Float_t *vpos, Float_t *polar,
-                         Float_t &tof)
+//_______________________________________________________________________
+void AliRun::SetBaseFile(const char *filename)
 {
-  //
-  // Return next track from stack of particles
-  //
-  TVector3 pol;
-  fCurrent=-1;
-  TParticle *track;
-  for(Int_t i=fNtrack-1; i>=0; i--) {
-    track=(TParticle*) fParticles->UncheckedAt(i);
-    if(!track->TestBit(Done_Bit)) {
-      //
-      // The track has not yet been processed
-      fCurrent=i;
-      ipart=track->GetPdgCode();
-      pmom[0]=track->Px();
-      pmom[1]=track->Py(); 
-      pmom[2]=track->Pz();
-      e     =track->Energy();
-      vpos[0]=track->Vx();
-      vpos[1]=track->Vy();
-      vpos[2]=track->Vz();
-      track->GetPolarisation(pol);
-      polar[0]=pol.X();
-      polar[1]=pol.Y();
-      polar[2]=pol.Z();
-      tof=track->T();
-      track->SetBit(Done_Bit);
-      break;
-    }
-  }
-  mtrack=fCurrent;
-  //
-  // stop and start timer when we start a primary track
-  Int_t nprimaries = fHeader.GetNprimary();
-  if (fCurrent >= nprimaries) return;
-  if (fCurrent < nprimaries-1) {
-    fTimer.Stop();
-    track=(TParticle*) fParticles->UncheckedAt(fCurrent+1);
-    //    track->SetProcessTime(fTimer.CpuTime());
-  }
-  fTimer.Start();
+  fBaseFileName = filename;
 }
 
-//_____________________________________________________________________________
-Int_t AliRun::GetPrimary(Int_t track)
+//_______________________________________________________________________
+void AliRun::ResetDigits()
 {
   //
-  // return number of primary that has generated track
-  //
-  int current, parent;
-  TParticle *part;
+  //  Reset all Detectors digits
   //
-  parent=track;
-  while (1) {
-    current=parent;
-    part = (TParticle *)fParticles->UncheckedAt(current);
-    parent=part->GetFirstMother();
-    if(parent<0) return current;
+  TIter next(fModules);
+  AliModule *detector;
+  while((detector = dynamic_cast<AliModule*>(next()))) {
+     detector->ResetDigits();
   }
 }
-//_____________________________________________________________________________
-void AliRun::Init(const char *setup)
-{
-  //
-  // Initialize the Alice setup
-  //
 
-  gROOT->LoadMacro(setup);
-  gInterpreter->ProcessLine("Config();");
-
-  gMC->DefineParticles();  //Create standard MC particles
-
-  TObject *objfirst, *objlast;
-
-  fNdets = fModules->GetLast()+1;
-
-  //
-  //=================Create Materials, geometry, histograms, etc
-   TIter next(fModules);
-   AliModule *detector;
-   while((detector = (AliModule*)next())) {
-      detector->SetTreeAddress();
-      objlast = gDirectory->GetList()->Last();
-      
-      // Initialise detector materials, geometry, histograms,etc
-      detector->CreateMaterials();
-      detector->CreateGeometry();
-      detector->BuildGeometry();
-      detector->Init();
-      
-      // Add Detector histograms in Detector list of histograms
-      if (objlast) objfirst = gDirectory->GetList()->After(objlast);
-      else         objfirst = gDirectory->GetList()->First();
-      while (objfirst) {
-       detector->Histograms()->Add(objfirst);
-       objfirst = gDirectory->GetList()->After(objfirst);
-      }
-   }
-   SetTransPar(); //Read the cuts for all materials
-   
-   MediaTable(); //Build the special IMEDIA table
-   
-   //Close the geometry structure
-   gMC->Ggclos();
-   
-   //Initialise geometry deposition table
-   sEventEnergy.Set(gMC->NofVolumes()+1);
-   sSummEnergy.Set(gMC->NofVolumes()+1);
-   sSum2Energy.Set(gMC->NofVolumes()+1);
-   
-   //Create the color table
-   gMC->SetColors();
-   
-   //Compute cross-sections
-   gMC->Gphysi();
-   
-   //Write Geometry object to current file.
-   fGeometry->Write();
-   
-   fInitDone = kTRUE;
-}
-
-//_____________________________________________________________________________
-void AliRun::MediaTable()
+//_______________________________________________________________________
+void AliRun::ResetSDigits()
 {
   //
-  // Built media table to get from the media number to
-  // the detector id
-  //
-  Int_t kz, nz, idt, lz, i, k, ind;
-  //  Int_t ibeg;
-  TObjArray &dets = *gAlice->Detectors();
-  AliModule *det;
-  //
-  // For all detectors
-  for (kz=0;kz<fNdets;kz++) {
-    // If detector is defined
-    if((det=(AliModule*) dets[kz])) {
-        TArrayI &idtmed = *(det->GetIdtmed()); 
-        for(nz=0;nz<100;nz++) {
-       // Find max and min material number
-       if((idt=idtmed[nz])) {
-         det->LoMedium() = det->LoMedium() < idt ? det->LoMedium() : idt;
-         det->HiMedium() = det->HiMedium() > idt ? det->HiMedium() : idt;
-       }
-      }
-      if(det->LoMedium() > det->HiMedium()) {
-       det->LoMedium() = 0;
-       det->HiMedium() = 0;
-      } else {
-       if(det->HiMedium() > fImedia->GetSize()) {
-         Error("MediaTable","Increase fImedia from %d to %d",
-               fImedia->GetSize(),det->HiMedium());
-         return;
-       }
-       // Tag all materials in rage as belonging to detector kz
-       for(lz=det->LoMedium(); lz<= det->HiMedium(); lz++) {
-         (*fImedia)[lz]=kz;
-       }
-      }
-    }
-  }
+  //  Reset all Detectors digits
   //
-  // Print summary table
-  printf(" Traking media ranges:\n");
-  for(i=0;i<(fNdets-1)/6+1;i++) {
-    for(k=0;k< (6<fNdets-i*6?6:fNdets-i*6);k++) {
-      ind=i*6+k;
-      det=(AliModule*)dets[ind];
-      if(det)
-       printf(" %6s: %3d -> %3d;",det->GetName(),det->LoMedium(),
-              det->HiMedium());
-      else
-       printf(" %6s: %3d -> %3d;","NULL",0,0);
-    }
-    printf("\n");
+  TIter next(fModules);
+  AliModule *detector;
+  while((detector = dynamic_cast<AliModule*>(next()))) {
+     detector->ResetSDigits();
   }
 }
 
-//____________________________________________________________________________
-void AliRun::SetGenerator(AliGenerator *generator)
-{
-  //
-  // Load the event generator
-  //
-  if(!fGenerator) fGenerator = generator;
-}
 
-//____________________________________________________________________________
-void AliRun::SetTransPar(char* filename)
-{
-  //
-  // Read filename to set the transport parameters
-  //
-
-
-  const Int_t ncuts=10;
-  const Int_t nflags=11;
-  const Int_t npars=ncuts+nflags;
-  const char pars[npars][7] = {"CUTGAM" ,"CUTELE","CUTNEU","CUTHAD","CUTMUO",
-                              "BCUTE","BCUTM","DCUTE","DCUTM","PPCUTM","ANNI",
-                              "BREM","COMP","DCAY","DRAY","HADR","LOSS",
-                              "MULS","PAIR","PHOT","RAYL"};
-  char line[256];
-  char detName[7];
-  char* filtmp;
-  Float_t cut[ncuts];
-  Int_t flag[nflags];
-  Int_t i, itmed, iret, ktmed, kz;
-  FILE *lun;
-  //
-  // See whether the file is there
-  filtmp=gSystem->ExpandPathName(filename);
-  lun=fopen(filtmp,"r");
-  delete [] filtmp;
-  if(!lun) {
-    Warning("SetTransPar","File %s does not exist!\n",filename);
-    return;
-  }
-  //
-  printf(" "); for(i=0;i<60;i++) printf("*"); printf("\n");
-  printf(" *%59s\n","*");
-  printf(" *       Please check carefully what you are doing!%10s\n","*");
-  printf(" *%59s\n","*");
-  //
-  while(1) {
-    // Initialise cuts and flags
-    for(i=0;i<ncuts;i++) cut[i]=-99;
-    for(i=0;i<nflags;i++) flag[i]=-99;
-    itmed=0;
-    for(i=0;i<256;i++) line[i]='\0';
-    // Read up to the end of line excluded
-    iret=fscanf(lun,"%[^\n]",line);
-    if(iret<0) {
-      //End of file
-      fclose(lun);
-      printf(" *%59s\n","*");
-      printf(" "); for(i=0;i<60;i++) printf("*"); printf("\n");
-      return;
-    }
-    // Read the end of line
-    fscanf(lun,"%*c");
-    if(!iret) continue;
-    if(line[0]=='*') continue;
-    // Read the numbers
-    iret=sscanf(line,"%s %d %f %f %f %f %f %f %f %f %f %f %d %d %d %d %d %d %d %d %d %d %d",
-               detName,&itmed,&cut[0],&cut[1],&cut[2],&cut[3],&cut[4],&cut[5],&cut[6],&cut[7],&cut[8],
-               &cut[9],&flag[0],&flag[1],&flag[2],&flag[3],&flag[4],&flag[5],&flag[6],&flag[7],
-               &flag[8],&flag[9],&flag[10]);
-    if(!iret) continue;
-    if(iret<0) {
-      //reading error
-      Warning("SetTransPar","Error reading file %s\n",filename);
-      continue;
-    }
-    // Check that the module exist
-    AliModule *mod = GetModule(detName);
-    if(mod) {
-      // Get the array of media numbers
-      TArrayI &idtmed = *mod->GetIdtmed();
-      // Check that the tracking medium code is valid
-      if(0<=itmed && itmed < 100) {
-       ktmed=idtmed[itmed];
-       if(!ktmed) {
-         Warning("SetTransPar","Invalid tracking medium code %d for %s\n",itmed,mod->GetName());
-         continue;
-       }
-       // Set energy thresholds
-       for(kz=0;kz<ncuts;kz++) {
-         if(cut[kz]>=0) {
-           printf(" *  %-6s set to %10.3E for tracking medium code %4d for %s\n",
-                  pars[kz],cut[kz],itmed,mod->GetName());
-           gMC->Gstpar(ktmed,pars[kz],cut[kz]);
-         }
-       }
-       // Set transport mechanisms
-       for(kz=0;kz<nflags;kz++) {
-         if(flag[kz]>=0) {
-           printf(" *  %-6s set to %10d for tracking medium code %4d for %s\n",
-                  pars[ncuts+kz],flag[kz],itmed,mod->GetName());
-           gMC->Gstpar(ktmed,pars[ncuts+kz],Float_t(flag[kz]));
-         }
-       }
-      } else {
-       Warning("SetTransPar","Invalid medium code %d *\n",itmed);
-       continue;
-      }
-    } else {
-      Warning("SetTransPar","Module %s not present\n",detName);
-      continue;
-    }
-  }
-}
+//_______________________________________________________________________
 
-//_____________________________________________________________________________
-void AliRun::MakeTree(Option_t *option)
+void AliRun::ResetPoints()
 {
   //
-  //  Create the ROOT trees
-  //  Loop on all detectors to create the Root branch (if any)
-  //
-
-  //
-  // Analyse options
-  char *K = strstr(option,"K");
-  char *H = strstr(option,"H");
-  char *E = strstr(option,"E");
-  char *D = strstr(option,"D");
-  char *R = strstr(option,"R");
-  //
-  if (K && !fTreeK) fTreeK = new TTree("TreeK0","Kinematics");
-  if (H && !fTreeH) fTreeH = new TTree("TreeH0","Hits");
-  if (D && !fTreeD) fTreeD = new TTree("TreeD0","Digits");
-  if (E && !fTreeE) fTreeE = new TTree("TE","Header");
-  if (R && !fTreeR) fTreeR = new TTree("TreeR0","Reconstruction");
-  if (fTreeH) fTreeH->SetAutoSave(1000000000); //no autosave
+  // Reset all Detectors points
   //
-  // Create a branch for hits/digits for each detector
-  // Each branch is a TClonesArray. Each data member of the Hits classes
-  // will be in turn a subbranch of the detector master branch
   TIter next(fModules);
   AliModule *detector;
-  while((detector = (AliModule*)next())) {
-     if (H || D || R) detector->MakeBranch(option);
+  while((detector = dynamic_cast<AliModule*>(next()))) {
+     detector->ResetPoints();
   }
-  //  Create a branch for particles
-  if (fTreeK && K) fTreeK->Branch("Particles",&fParticles,4000);
-  
-  //  Create a branch for Header
-  if (fTreeE && E) fTreeE->Branch("Header","AliHeader",&header,4000);
 }
+//_______________________________________________________________________
 
-//_____________________________________________________________________________
-Int_t AliRun::PurifyKine(Int_t lastSavedTrack, Int_t nofTracks)
+void AliRun::InitMC(const char *setup)
 {
   //
-  // PurifyKine with external parameters
+  // Initialize ALICE Simulation run
   //
-  fHgwmk = lastSavedTrack;
-  fNtrack = nofTracks;
-  PurifyKine();
-  return fHgwmk;
-}
+  Announce();
 
-//_____________________________________________________________________________
-void AliRun::PurifyKine()
-{
-  //
-  // Compress kinematic tree keeping only flagged particles
-  // and renaming the particle id's in all the hits
-  //
-  TClonesArray &particles = *fParticles;
-  int nkeep=fHgwmk+1, parent, i;
-  TParticle *part, *partnew, *father;
-  AliHit *OneHit;
-  int *map = new int[particles.GetEntries()];
-
-  // Save in Header total number of tracks before compression
-  fHeader.SetNtrack(fHeader.GetNtrack()+fNtrack-fHgwmk);
-
-  // Preset map, to be removed later
-  for(i=0; i<fNtrack; i++) {
-    if(i<=fHgwmk) map[i]=i ; else map[i] = -99 ;}
-  // Second pass, build map between old and new numbering
-  for(i=fHgwmk+1; i<fNtrack; i++) {
-    part = (TParticle *)particles.UncheckedAt(i);
-    if(part->TestBit(Keep_Bit)) {
-      
-      // This particle has to be kept
-      map[i]=nkeep;
-      if(i!=nkeep) {
-       
-       // Old and new are different, have to copy
-       partnew = (TParticle *)particles.UncheckedAt(nkeep);
-       *partnew = *part;
-      } else partnew = part;
-      
-      // as the parent is always *before*, it must be already
-      // in place. This is what we are checking anyway!
-      if((parent=partnew->GetFirstMother())>fHgwmk) {
-       if(map[parent]==-99) printf("map[%d] = -99!\n",parent);
-       partnew->SetFirstMother(map[parent]);
-      }
-      nkeep++;
-    }
+  if(fInitDone) {
+    Warning("Init","Cannot initialise AliRun twice!\n");
+    return;
   }
-  fNtrack=nkeep;
-  
-  // Fix daughters information
-  for (i=0; i<fNtrack; i++) {
-    part = (TParticle *)particles.UncheckedAt(i);
-    parent = part->GetFirstMother();
-    if(parent>=0) {
-      father = (TParticle *)particles.UncheckedAt(parent);
-      if(father->TestBit(Daughters_Bit)) {
+    
+  if (!fMCApp)  
+    fMCApp=new AliMC(GetName(),GetTitle());
+    
+  gROOT->LoadMacro(setup);
+  gInterpreter->ProcessLine(fConfigFunction.Data());
+
+  fRunLoader->CdGAFile();
+
+  AliPDG::AddParticlesToPdgDataBase();  
+
+  fNdets = fModules->GetLast()+1;
+
+  TIter next(fModules);
+  for(Int_t i=0; i<fNdets; ++i)
+   {
+     TObject *objfirst, *objlast;
+     AliModule *detector=dynamic_cast<AliModule*>(fModules->At(i));
+     objlast = gDirectory->GetList()->Last();
       
-       if(i<father->GetFirstDaughter()) father->SetFirstDaughter(i);
-       if(i>father->GetLastDaughter())  father->SetLastDaughter(i);
-      } else {
-       // Iitialise daughters info for first pass
-       father->SetFirstDaughter(i);
-       father->SetLastDaughter(i);
-       father->SetBit(Daughters_Bit);
+     // Add Detector histograms in Detector list of histograms
+     if (objlast) objfirst = gDirectory->GetList()->After(objlast);
+     else         objfirst = gDirectory->GetList()->First();
+     while (objfirst) 
+      {
+        detector->Histograms()->Add(objfirst);
+        objfirst = gDirectory->GetList()->After(objfirst);
       }
+   }
+   
+   fMCApp->Init();
+   
+   //Must be here because some MCs (G4) adds detectors here and not in Config.C
+   InitLoaders();
+   fRunLoader->MakeTree("E");
+   if (fLego == 0x0)
+    {
+      fRunLoader->LoadKinematics("RECREATE");
+      fRunLoader->LoadTrackRefs("RECREATE");
+      fRunLoader->LoadHits("all","RECREATE");
     }
-  }
-  
-  // Now loop on all detectors and reset the hits
-  TIter next(fModules);
-  AliModule *detector;
-  while((detector = (AliModule*)next())) {
-    if (!detector->Hits()) continue;
-    TClonesArray &vHits=*(detector->Hits());
-    if(vHits.GetEntries() != detector->GetNhits())
-      printf("vHits.GetEntries()!=detector->GetNhits(): %d != %d\n",
-            vHits.GetEntries(),detector->GetNhits());
-    for (i=0; i<detector->GetNhits(); i++) {
-      OneHit = (AliHit *)vHits.UncheckedAt(i);
-      OneHit->SetTrack(map[OneHit->GetTrack()]);
-    }
-  }
-
-  fHgwmk=nkeep-1;
-  particles.SetLast(fHgwmk);
-  delete [] map;
+   fInitDone = kTRUE;
+   //
+   // Save stuff at the beginning of the file to avoid file corruption
+   fRunLoader->CdGAFile();
+   Write();
+   fEventNrInRun = -1; //important - we start Begin event from increasing current number in run
 }
 
-//_____________________________________________________________________________
-void AliRun::Reset(Int_t run, Int_t idevent)
+//_______________________________________________________________________
+
+void AliRun::RunMC(Int_t nevent, const char *setup)
 {
   //
-  //  Reset all Detectors & kinematics & trees
-  //
-  char hname[30];
+  // Main function to be called to process a galice run
+  // example
+  //    Root > gAlice.Run(); 
+  // a positive number of events will cause the finish routine
+  // to be called
   //
-  ResetStack();
-  ResetHits();
-  ResetDigits();
+  fEventsPerRun = nevent;
+  // check if initialisation has been done
+  if (!fInitDone) InitMC(setup);
+  
+  // Create the Root Tree with one branch per detector
+  //Hits moved to begin event -> now we are crating separate tree for each event
 
-  // Initialise event header
-  fHeader.Reset(run,idevent);
+  gMC->ProcessRun(nevent);
 
-  if(fTreeK) {
-    fTreeK->Reset();
-    sprintf(hname,"TreeK%d",idevent);
-    fTreeK->SetName(hname);
-  }
-  if(fTreeH) {
-    fTreeH->Reset();
-    sprintf(hname,"TreeH%d",idevent);
-    fTreeH->SetName(hname);
-  }
-  if(fTreeD) {
-    fTreeD->Reset();
-    sprintf(hname,"TreeD%d",idevent);
-    fTreeD->SetName(hname);
-  }
-  if(fTreeR) {
-    fTreeR->Reset();
-    sprintf(hname,"TreeR%d",idevent);
-    fTreeR->SetName(hname);
-  }
+  // End of this run, close files
+  if(nevent>0) FinishRun();
 }
 
-//_____________________________________________________________________________
-void AliRun::ResetDigits()
+//_______________________________________________________________________
+void AliRun::RunReco(const char *selected, Int_t first, Int_t last)
 {
   //
-  //  Reset all Detectors digits
-  //
-  TIter next(fModules);
-  AliModule *detector;
-  while((detector = (AliModule*)next())) {
-     detector->ResetDigits();
-  }
+  // Main function to be called to reconstruct Alice event
+  // 
+   Int_t nev = fRunLoader->GetNumberOfEvents();
+   if (GetDebug()) Info("RunReco","Found %d events",nev);
+   Int_t nFirst = first;
+   Int_t nLast  = (last < 0)? nev : last;
+   
+   for (Int_t nevent = nFirst; nevent <= nLast; nevent++) {
+     if (GetDebug()) Info("RunReco","Processing event %d",nevent);
+     GetEvent(nevent);
+     Digits2Reco(selected);
+   }
 }
 
-//_____________________________________________________________________________
-void AliRun::ResetHits()
-{
-  //
-  //  Reset all Detectors hits
-  //
-  TIter next(fModules);
-  AliModule *detector;
-  while((detector = (AliModule*)next())) {
-     detector->ResetHits();
-  }
-}
+//_______________________________________________________________________
 
-//_____________________________________________________________________________
-void AliRun::ResetPoints()
+void AliRun::Hits2Digits(const char *selected)
 {
-  //
-  // Reset all Detectors points
-  //
-  TIter next(fModules);
-  AliModule *detector;
-  while((detector = (AliModule*)next())) {
-     detector->ResetPoints();
-  }
+
+   // Convert Hits to sumable digits
+   // 
+   for (Int_t nevent=0; nevent<gAlice->TreeE()->GetEntries(); nevent++) {
+     GetEvent(nevent);
+     Hits2SDigits(selected);
+     SDigits2Digits(selected);
+   }  
 }
 
-//_____________________________________________________________________________
-void AliRun::Run(Int_t nevent, const char *setup)
-{
-  //
-  // Main function to be called to process a galice run
-  // example
-  //    Root > gAlice.Run(); 
-  // a positive number of events will cause the finish routine
-  // to be called
-  //
 
-  Int_t i, todo;
-  // check if initialisation has been done
-  if (!fInitDone) Init(setup);
-  
-  // Create the Root Tree with one branch per detector
-  if(!fEvent) {
-    gAlice->MakeTree("KHDER");
-  }
+//_______________________________________________________________________
 
-  todo = TMath::Abs(nevent);
-  for (i=0; i<todo; i++) {
-  // Process one run (one run = one event)
-     gAlice->Reset(fRun, fEvent);
-     gMC->Gtrigi();
-     gMC->Gtrigc();
-     gMC->Gtrig();
-     gAlice->FinishEvent();
-     fEvent++;
-  }
-  
-  // End of this run, close files
-  if(nevent>0) gAlice->FinishRun();
+void AliRun::Tree2Tree(Option_t *option, const char *selected)
+{
+  //
+  // Function to transform the content of
+  //  
+  // - TreeH to TreeS (option "S")
+  // - TreeS to TreeD (option "D")
+  // - TreeD to TreeR (option "R")
+  // 
+  // If multiple options are specified ("SDR"), transformation will be done in sequence for
+  // selected detector and for all detectors if none is selected (detector string 
+  // can contain blank separated list of detector names). 
+
+
+   const char *oS = strstr(option,"S");
+   const char *oD = strstr(option,"D");
+   const char *oR = strstr(option,"R");
+   
+   TObjArray *detectors = Detectors();
+
+   TIter next(detectors);
+
+   AliDetector *detector = 0;
+
+   while((detector = dynamic_cast<AliDetector*>(next()))) {
+     if (selected) 
+       if (strcmp(detector->GetName(),selected)) continue;
+     if (detector->IsActive())
+      { 
+       
+       AliLoader* loader = detector->GetLoader();
+       if (loader == 0x0) continue;
+       
+       if (oS) 
+        {
+          if (GetDebug()) Info("Tree2Tree","Processing Hits2SDigits for %s ...",detector->GetName());
+          loader->LoadHits("read");
+          if (loader->TreeS() == 0x0) loader->MakeTree("S");
+          detector->MakeBranch(option);
+          detector->SetTreeAddress();
+          detector->Hits2SDigits();
+          loader->UnloadHits();
+          loader->UnloadSDigits();
+        }  
+       if (oD) 
+        {
+          if (GetDebug()) Info("Tree2Tree","Processing SDigits2Digits for %s ...",detector->GetName());
+          loader->LoadSDigits("read");
+          if (loader->TreeD() == 0x0) loader->MakeTree("D");
+          detector->MakeBranch(option);
+          detector->SetTreeAddress();
+          detector->SDigits2Digits();
+          loader->UnloadSDigits();
+          loader->UnloadDigits();
+        } 
+       if (oR) 
+        {
+          if (GetDebug()) Info("Tree2Tree","Processing Digits2Reco for %s ...",detector->GetName());
+          loader->LoadDigits("read");
+          if (loader->TreeR() == 0x0) loader->MakeTree("R");
+          detector->MakeBranch(option);
+          detector->SetTreeAddress();
+          detector->Digits2Reco(); 
+          loader->UnloadDigits();
+          loader->UnloadRecPoints();
+
+        }
+     }   
+   }
 }
 
-//_____________________________________________________________________________
-void AliRun::RunLego(const char *setup,Int_t ntheta,Float_t themin,
-                    Float_t themax,Int_t nphi,Float_t phimin,Float_t phimax,
-                    Float_t rmin,Float_t rmax,Float_t zmax)
+//_______________________________________________________________________
+void AliRun::RunLego(const char *setup, Int_t nc1, Float_t c1min,
+                    Float_t c1max,Int_t nc2,Float_t c2min,Float_t c2max,
+                    Float_t rmin,Float_t rmax,Float_t zmax, AliLegoGenerator* gener)
 {
   //
   // Generates lego plots of:
@@ -1313,535 +763,180 @@ void AliRun::RunLego(const char *setup,Int_t ntheta,Float_t themin,
   //
 
   // check if initialisation has been done
-  if (!fInitDone) Init(setup);
-  
-  fLego = new AliLego("lego","lego");
-  fLego->Init(ntheta,themin,themax,nphi,phimin,phimax,rmin,rmax,zmax);
-  fLego->Run();
-  
-  // Create only the Root event Tree
-  gAlice->MakeTree("E");
-  
-  // End of this run, close files
-  gAlice->FinishRun();
-}
+  // If runloader has been initialized, set the number of events per file to nc1 * nc2
 
-//_____________________________________________________________________________
-void AliRun::SetCurrentTrack(Int_t track)
-{ 
+  // Set new generator
+  if (!gener) gener  = new AliLegoGenerator();
   //
-  // Set current track number
-  //
-  fCurrent = track; 
-}
-//_____________________________________________________________________________
-void AliRun::SetTrack(Int_t done, Int_t parent, Int_t pdg, Float_t *pmom,
-                     Float_t *vpos, Float_t *polar, Float_t tof,
-                     const char *mecha, Int_t &ntr, Float_t weight)
-{ 
-  //
-  // Load a track on the stack
-  //
-  // done     0 if the track has to be transported
-  //          1 if not
-  // parent   identifier of the parent track. -1 for a primary
-  // pdg    particle code
-  // pmom     momentum GeV/c
-  // vpos     position 
-  // polar    polarisation 
-  // tof      time of flight in seconds
-  // mecha    production mechanism
-  // ntr      on output the number of the track stored
-  //
-  TClonesArray &particles = *fParticles;
-  TParticle *particle;
-  Float_t mass;
-  const Int_t firstdaughter=-1;
-  const Int_t lastdaughter=-1;
-  const Int_t KS=0;
-  //  const Float_t tlife=0;
+  // Configure Generator
+  gener->SetRadiusRange(rmin, rmax);
+  gener->SetZMax(zmax);
+  gener->SetCoor1Range(nc1, c1min, c1max);
+  gener->SetCoor2Range(nc2, c2min, c2max);
   
-  //
-  // Here we get the static mass
-  // For MC is ok, but a more sophisticated method could be necessary
-  // if the calculated mass is required
-  // also, this method is potentially dangerous if the mass
-  // used in the MC is not the same of the PDG database
-  //
-  mass = TDatabasePDG::Instance()->GetParticle(pdg)->Mass();
-  Float_t e=TMath::Sqrt(mass*mass+pmom[0]*pmom[0]+
-                       pmom[1]*pmom[1]+pmom[2]*pmom[2]);
   
-  //printf("Loading particle %s mass %f ene %f No %d ip %d pos %f %f %f mom %f %f %f KS %d m %s\n",
-  //pname,mass,e,fNtrack,pdg,vpos[0],vpos[1],vpos[2],pmom[0],pmom[1],pmom[2],KS,mecha);
+  //Create Lego object  
+  fLego = new AliLego("lego",gener);
+
+  if (!fInitDone) InitMC(setup);
+  //Save current generator
   
-  particle=new(particles[fNtrack]) TParticle(pdg,KS,parent,-1,firstdaughter,
-                                            lastdaughter,pmom[0],pmom[1],pmom[2],
-                                            e,vpos[0],vpos[1],vpos[2],tof);
-  //                                        polar[0],polar[1],polar[2],tof,
-  //                                        mecha,weight);
-  ((TParticle*)particles[fNtrack])->SetPolarisation(TVector3(polar[0],polar[1],polar[2]));
-  ((TParticle*)particles[fNtrack])->SetWeight(weight);
-  if(!done) particle->SetBit(Done_Bit);
+  AliGenerator *gen=fMCApp->Generator();
+  fMCApp->ResetGenerator(gener);
+  //Prepare MC for Lego Run
+  gMC->InitLego();
   
-  if(parent>=0) {
-    particle=(TParticle*) fParticles->UncheckedAt(parent);
-    particle->SetLastDaughter(fNtrack);
-    if(particle->GetFirstDaughter()<0) particle->SetFirstDaughter(fNtrack);
-  } else { 
-    //
-    // This is a primary track. Set high water mark for this event
-    fHgwmk=fNtrack;
-    //
-    // Set also number if primary tracks
-    fHeader.SetNprimary(fHgwmk+1);
-    fHeader.SetNtrack(fHgwmk+1);
-  }
-  ntr = fNtrack++;
-}
+  //Run Lego Object
 
-//_____________________________________________________________________________
-void AliRun::KeepTrack(const Int_t track)
-{ 
-  //
-  // flags a track to be kept
-  //
-  TClonesArray &particles = *fParticles;
-  ((TParticle*)particles[track])->SetBit(Keep_Bit);
-}
-//_____________________________________________________________________________
-void AliRun::StepManager(Int_t id) const
-{
-  //
-  // Called at every step during transport
-  //
-
-  Int_t copy;
-  //
-  // --- If lego option, do it and leave 
-  if (fLego) {
-    fLego->StepManager();
-    return;
-  }
-  //Update energy deposition tables
-  sEventEnergy[gMC->CurrentVolID(copy)]+=gMC->Edep();
+  if (fRunLoader) fRunLoader->SetNumberOfEventsPerFile(nc1 * nc2);
+  //gMC->ProcessRun(nc1*nc2+1);
+  gMC->ProcessRun(nc1*nc2);
   
-  //Call the appropriate stepping routine;
-  AliModule *det = (AliModule*)fModules->At(id);
-  if(det) det->StepManager();
+  // End of this run, close files
+  FinishRun();
+  // Restore current generator
+  fMCApp->ResetGenerator(gen);
+  // Delete Lego Object
+  delete fLego; fLego=0;
 }
 
-//_____________________________________________________________________________
-void AliRun::ReadEuclid(const char* filnam, const AliModule *det, char* topvol)
+//_______________________________________________________________________
+void AliRun::SetConfigFunction(const char * config) 
 {
-  //                                                                     
-  //       read in the geometry of the detector in euclid file format    
-  //                                                                     
-  //        id_det : the detector identification (2=its,...)            
-  //        topvol : return parameter describing the name of the top    
-  //        volume of geometry.                                          
-  //                                                                     
-  //            author : m. maire                                        
-  //                                                                     
-  //     28.07.98
-  //     several changes have been made by miroslav helbich
-  //     subroutine is rewrited to follow the new established way of memory
-  //     booking for tracking medias and rotation matrices.
-  //     all used tracking media have to be defined first, for this you can use
-  //     subroutine  greutmed.
-  //     top volume is searched as only volume not positioned into another 
   //
-
-  Int_t i, nvol, iret, itmed, irot, numed, npar, ndiv, iaxe;
-  Int_t ndvmx, nr, flag;
-  char key[5], card[77], natmed[21];
-  char name[5], mother[5], shape[5], konly[5], volst[7000][5];
-  char *filtmp;
-  Float_t par[50];
-  Float_t teta1, phi1, teta2, phi2, teta3, phi3, orig, step;
-  Float_t xo, yo, zo;
-  const Int_t maxrot=5000;
-  Int_t idrot[maxrot],istop[7000];
-  FILE *lun;
+  // Set the signature of the function contained in Config.C to configure
+  // the run
   //
-  // *** The input filnam name will be with extension '.euc'
-  filtmp=gSystem->ExpandPathName(filnam);
-  lun=fopen(filtmp,"r");
-  delete [] filtmp;
-  if(!lun) {
-    Error("ReadEuclid","Could not open file %s\n",filnam);
-    return;
-  }
-  //* --- definition of rotation matrix 0 ---  
-  TArrayI &idtmed = *(det->GetIdtmed());
-  for(i=1; i<maxrot; ++i) idrot[i]=-99;
-  idrot[0]=0;
-  nvol=0;
- L10:
-  for(i=0;i<77;i++) card[i]=0;
-  iret=fscanf(lun,"%77[^\n]",card);
-  if(iret<=0) goto L20;
-  fscanf(lun,"%*c");
-  //*
-  strncpy(key,card,4);
-  key[4]='\0';
-  if (!strcmp(key,"TMED")) {
-    sscanf(&card[5],"%d '%[^']'",&itmed,natmed);
-    if( itmed<0 || itmed>=100 ) {
-      Error("ReadEuclid","TMED illegal medium number %d for %s\n",itmed,natmed);
-      exit(1);
-    }
-    //Pad the string with blanks
-    i=-1;
-    while(natmed[++i]);
-    while(i<20) natmed[i++]=' ';
-    natmed[i]='\0';
-    //
-    if( idtmed[itmed]<=0 ) {
-      Error("ReadEuclid","TMED undefined medium number %d for %s\n",itmed,natmed);
-      exit(1);
-    }
-    gMC->Gckmat(idtmed[itmed],natmed);
-    //*
-  } else if (!strcmp(key,"ROTM")) {
-    sscanf(&card[4],"%d %f %f %f %f %f %f",&irot,&teta1,&phi1,&teta2,&phi2,&teta3,&phi3);
-    if( irot<=0 || irot>=maxrot ) {
-      Error("ReadEuclid","ROTM rotation matrix number %d illegal\n",irot);
-      exit(1);
-    }
-    det->AliMatrix(idrot[irot],teta1,phi1,teta2,phi2,teta3,phi3);
-    //*
-  } else if (!strcmp(key,"VOLU")) {
-    sscanf(&card[5],"'%[^']' '%[^']' %d %d", name, shape, &numed, &npar);
-    if (npar>0) {
-      for(i=0;i<npar;i++) fscanf(lun,"%f",&par[i]);
-      fscanf(lun,"%*c");
-    }
-    gMC->Gsvolu( name, shape, idtmed[numed], par, npar);
-    //*     save the defined volumes
-    strcpy(volst[++nvol],name);
-    istop[nvol]=1;
-    //*
-  } else if (!strcmp(key,"DIVN")) {
-    sscanf(&card[5],"'%[^']' '%[^']' %d %d", name, mother, &ndiv, &iaxe);
-    gMC->Gsdvn  ( name, mother, ndiv, iaxe );
-    //*
-  } else if (!strcmp(key,"DVN2")) {
-    sscanf(&card[5],"'%[^']' '%[^']' %d %d %f %d",name, mother, &ndiv, &iaxe, &orig, &numed);
-    gMC->Gsdvn2( name, mother, ndiv, iaxe, orig,idtmed[numed]);
-    //*
-  } else if (!strcmp(key,"DIVT")) {
-    sscanf(&card[5],"'%[^']' '%[^']' %f %d %d %d", name, mother, &step, &iaxe, &numed, &ndvmx);
-    gMC->Gsdvt ( name, mother, step, iaxe, idtmed[numed], ndvmx);
-    //*
-  } else if (!strcmp(key,"DVT2")) {
-    sscanf(&card[5],"'%[^']' '%[^']' %f %d %f %d %d", name, mother, &step, &iaxe, &orig, &numed, &ndvmx);
-    gMC->Gsdvt2 ( name, mother, step, iaxe, orig, idtmed[numed], ndvmx );
-    //*
-  } else if (!strcmp(key,"POSI")) {
-    sscanf(&card[5],"'%[^']' %d '%[^']' %f %f %f %d '%[^']'", name, &nr, mother, &xo, &yo, &zo, &irot, konly);
-    if( irot<0 || irot>=maxrot ) {
-      Error("ReadEuclid","POSI %s#%d rotation matrix number %d illegal\n",name,nr,irot);
-      exit(1);
-    }
-    if( idrot[irot] == -99) {
-      Error("ReadEuclid","POSI %s#%d undefined matrix number %d\n",name,nr,irot);
-      exit(1);
-    }
-    //*** volume name cannot be the top volume
-    for(i=1;i<=nvol;i++) {
-      if (!strcmp(volst[i],name)) istop[i]=0;
-    }
-    //*
-    gMC->Gspos  ( name, nr, mother, xo, yo, zo, idrot[irot], konly );
-    //*
-  } else if (!strcmp(key,"POSP")) {
-    sscanf(&card[5],"'%[^']' %d '%[^']' %f %f %f %d '%[^']' %d", name, &nr, mother, &xo, &yo, &zo, &irot, konly, &npar);
-    if( irot<0 || irot>=maxrot ) {
-      Error("ReadEuclid","POSP %s#%d rotation matrix number %d illegal\n",name,nr,irot);
-      exit(1);
-    }
-    if( idrot[irot] == -99) {
-      Error("ReadEuclid","POSP %s#%d undefined matrix number %d\n",name,nr,irot);
-      exit(1);
-    }
-    if (npar > 0) {
-      for(i=0;i<npar;i++) fscanf(lun,"%f",&par[i]);
-      fscanf(lun,"%*c");
-    }
-    //*** volume name cannot be the top volume
-    for(i=1;i<=nvol;i++) {
-      if (!strcmp(volst[i],name)) istop[i]=0;
-    }
-    //*
-    gMC->Gsposp ( name, nr, mother, xo,yo,zo, idrot[irot], konly, par, npar);
-  }
-  //*
-  if (strcmp(key,"END")) goto L10;
-  //* find top volume in the geometry
-  flag=0;
-  for(i=1;i<=nvol;i++) {
-    if (istop[i] && flag) {
-      Warning("ReadEuclid"," %s is another possible top volume\n",volst[i]);
-    }
-    if (istop[i] && !flag) {
-      strcpy(topvol,volst[i]);
-      printf(" *** GREUCL *** volume %s taken as a top volume\n",topvol);
-      flag=1;
-    }
-  }
-  if (!flag) {
-    Warning("ReadEuclid","top volume not found\n");
-  }
-  fclose (lun);
-  //*
-  //*     commented out only for the not cernlib version
-  printf(" *** GREUCL *** file: %s is now read in\n",filnam);
-  //
-  return;
-  //*
-  L20:
-  Error("ReadEuclid","reading error or premature end of file\n");
+  fConfigFunction=config;
 }
 
-//_____________________________________________________________________________
-void AliRun::ReadEuclidMedia(const char* filnam, const AliModule *det)
+// 
+// MC Application
+// 
+
+//_______________________________________________________________________
+void AliRun::Field(const Double_t* x, Double_t *b) const
 {
-  //                                                                     
-  //       read in the materials and tracking media for the detector     
-  //                   in euclid file format                             
-  //                                                                     
-  //       filnam: name of the input file                                
-  //       id_det: id_det is the detector identification (2=its,...)     
-  //                                                                     
-  //            author : miroslav helbich                                
-  //
-  Float_t sxmgmx = gAlice->Field()->Max();
-  Int_t   isxfld = gAlice->Field()->Integ();
-  Int_t end, i, iret, itmed;
-  char key[5], card[130], natmed[21], namate[21];
-  Float_t ubuf[50];
-  char* filtmp;
-  FILE *lun;
-  Int_t imate;
-  Int_t nwbuf, isvol, ifield, nmat;
-  Float_t a, z, dens, radl, absl, fieldm, tmaxfd, stemax, deemax, epsil, stmin;
-  //
-  end=strlen(filnam);
-  for(i=0;i<end;i++) if(filnam[i]=='.') {
-    end=i;
-    break;
-  }
-  //
-  // *** The input filnam name will be with extension '.euc'
-  printf("The file name is %s\n",filnam); //Debug
-  filtmp=gSystem->ExpandPathName(filnam);
-  lun=fopen(filtmp,"r");
-  delete [] filtmp;
-  if(!lun) {
-    Warning("ReadEuclidMedia","Could not open file %s\n",filnam);
-    return;
-  }
   //
-  // Retrieve Mag Field parameters
-  Int_t ISXFLD=gAlice->Field()->Integ();
-  Float_t SXMGMX=gAlice->Field()->Max();
-  //  TArrayI &idtmed = *(det->GetIdtmed());
+  // Return the value of the magnetic field
   //
- L10:
-  for(i=0;i<130;i++) card[i]=0;
-  iret=fscanf(lun,"%4s %[^\n]",key,card);
-  if(iret<=0) goto L20;
-  fscanf(lun,"%*c");
-  //*
-  //* read material
-  if (!strcmp(key,"MATE")) {
-    sscanf(card,"%d '%[^']' %f %f %f %f %f %d",&imate,namate,&a,&z,&dens,&radl,&absl,&nwbuf);
-    if (nwbuf>0) for(i=0;i<nwbuf;i++) fscanf(lun,"%f",&ubuf[i]);
-    //Pad the string with blanks
-    i=-1;
-    while(namate[++i]);
-    while(i<20) namate[i++]=' ';
-    namate[i]='\0';
-    //
-    det->AliMaterial(imate,namate,a,z,dens,radl,absl,ubuf,nwbuf);
-    //* read tracking medium
-  } else if (!strcmp(key,"TMED")) {
-    sscanf(card,"%d '%[^']' %d %d %d %f %f %f %f %f %f %d",
-          &itmed,natmed,&nmat,&isvol,&ifield,&fieldm,&tmaxfd,
-          &stemax,&deemax,&epsil,&stmin,&nwbuf);
-    if (nwbuf>0) for(i=0;i<nwbuf;i++) fscanf(lun,"%f",&ubuf[i]);
-    if (ifield<0) ifield=isxfld;
-    if (fieldm<0) fieldm=sxmgmx;
-    //Pad the string with blanks
-    i=-1;
-    while(natmed[++i]);
-    while(i<20) natmed[i++]=' ';
-    natmed[i]='\0';
-    //
-    det->AliMedium(itmed,natmed,nmat,isvol,ISXFLD,SXMGMX,tmaxfd,
-                  stemax,deemax,epsil,stmin,ubuf,nwbuf);
-    //    (*fImedia)[idtmed[itmed]-1]=id_det;
-    //*
+  Float_t xfloat[3];
+  for (Int_t i=0; i<3; i++) xfloat[i] = x[i]; 
+  
+  if (Field()) {
+    Float_t bfloat[3];
+    Field()->Field(xfloat,bfloat);
+    for (Int_t j=0; j<3; j++) b[j] = bfloat[j]; 
+  } 
+  else {
+    printf("No mag field defined!\n");
+    b[0]=b[1]=b[2]=0.;
   }
-  //*
-  if (strcmp(key,"END")) goto L10;
-  fclose (lun);
-  //*
-  //*     commented out only for the not cernlib version
-  Warning("ReadEuclidMedia","file: %s is now read in\n",filnam);
-  //*
-  return;
-  //*
- L20:
-  Warning("ReadEuclidMedia","reading error or premature end of file\n");
-} 
-//_____________________________________________________________________________
+}      
+
+// 
+// End of MC Application
+// 
+
+//_______________________________________________________________________
 void AliRun::Streamer(TBuffer &R__b)
 {
-  //
   // Stream an object of class AliRun.
-  //
+
   if (R__b.IsReading()) {
-    Version_t R__v = R__b.ReadVersion(); if (R__v) { }
-    TNamed::Streamer(R__b);
     if (!gAlice) gAlice = this;
+    AliRun::Class()->ReadBuffer(R__b, this);
     gROOT->GetListOfBrowsables()->Add(this,"Run");
-    fTreeE = (TTree*)gDirectory->Get("TE");
-    if (fTreeE) fTreeE->SetBranchAddress("Header", &header);
-    else    Error("Streamer","cannot find Header Tree\n");
-    R__b >> fNtrack;
-    R__b >> fHgwmk;
-    R__b >> fDebug;
-    fHeader.Streamer(R__b);
-    R__b >> fModules;
-    R__b >> fParticles;
-    R__b >> fField; 
-    //    R__b >> fMC;
-    R__b >> fNdets;
-    R__b >> fTrRmax;
-    R__b >> fTrZmax;
-    R__b >> fGenerator;
-    if(R__v>1) {
-      R__b >> fPDGDB;        //Particle factory object!
-      fTreeE->GetEntry(0);
-    } else {
-      fHeader.SetEvent(0);
-      fPDGDB     = TDatabasePDG::Instance();        //Particle factory object!
-    }
+
+    gRandom = fRandom;
   } else {
-    R__b.WriteVersion(AliRun::IsA());
-    TNamed::Streamer(R__b);
-    R__b << fNtrack;
-    R__b << fHgwmk;
-    R__b << fDebug;
-    fHeader.Streamer(R__b);
-    R__b << fModules;
-    R__b << fParticles;
-    R__b << fField;
-    //    R__b << fMC;
-    R__b << fNdets;
-    R__b << fTrRmax;
-    R__b << fTrZmax;
-    R__b << fGenerator;
-    R__b << fPDGDB;        //Particle factory object!
+    AliRun::Class()->WriteBuffer(R__b, this);
   }
-} 
+}
+//_______________________________________________________________________
 
+void AliRun::SetGenEventHeader(AliGenEventHeader* header)
+{
+  fRunLoader->GetHeader()->SetGenEventHeader(header);
+}
+//_______________________________________________________________________
 
-//_____________________________________________________________________________
-//
-//                 Interfaces to Fortran
-//
-//_____________________________________________________________________________
+Int_t AliRun::GetEvNumber() const
+{ 
+//Returns number of current event  
+  if (fRunLoader == 0x0)
+   {
+     Error("GetEvent","RunLoader is not set. Can not load data.");
+     return -1;
+   }
 
-extern "C" void type_of_call  rxgtrak (Int_t &mtrack, Int_t &ipart, Float_t *pmom, 
-                                      Float_t &e, Float_t *vpos, Float_t *polar,
-                                      Float_t &tof)
-{
-  //
-  //     Fetches next track from the ROOT stack for transport. Called by the
-  //     modified version of GTREVE.
-  //
-  //              Track number in the ROOT stack. If MTRACK=0 no
-  //      mtrack  more tracks are left in the stack to be
-  //              transported.
-  //      ipart   Particle code in the GEANT conventions.
-  //      pmom[3] Particle momentum in GeV/c
-  //      e       Particle energy in GeV
-  //      vpos[3] Particle position
-  //      tof     Particle time of flight in seconds
-  //
-  Int_t pdg;
-  gAlice->GetNextTrack(mtrack, pdg, pmom, e, vpos, polar, tof);
-  ipart = gMC->IdFromPDG(pdg);
-  mtrack++;
+  return fRunLoader->GetEventNumber();
 }
+//_______________________________________________________________________
 
-//_____________________________________________________________________________
-extern "C" void type_of_call 
-#ifndef WIN32
-rxstrak (Int_t &keep, Int_t &parent, Int_t &ipart, Float_t *pmom, 
-              Float_t *vpos, Float_t &tof, const char* cmech, Int_t &ntr, const int cmlen)
-#else
-rxstrak (Int_t &keep, Int_t &parent, Int_t &ipart, Float_t *pmom,
-        Float_t *vpos, Float_t &tof, const char* cmech, const int cmlen,
-        Int_t &ntr)
-#endif
+void AliRun::SetRunLoader(AliRunLoader* rloader)
 {
   //
-  //     Fetches next track from the ROOT stack for transport. Called by GUKINE
-  //     and GUSTEP.
-  //
-  //              Status of the track. If keep=0 the track is put
-  //      keep    on the ROOT stack but it is not fetched for
-  //              transport.
-  //      parent  Parent track. If parent=0 the track is a primary.
-  //              In GUSTEP the routine is normally called to store
-  //              secondaries generated by the current track whose
-  //              ROOT stack number is MTRACK (common SCKINE.
-  //      ipart   Particle code in the GEANT conventions.
-  //      pmom[3] Particle momentum in GeV/c
-  //      vpos[3] Particle position
-  //      tof     Particle time of flight in seconds
-  //
-  //      cmech   (CHARACTER*10) Particle origin. This field is user
-  //              defined and it is not used inside the GALICE code.
-  //      ntr     Number assigned to the particle in the ROOT stack.
+  // Set the loader of the run
   //
-  char mecha[11];
-  Float_t polar[3]={0.,0.,0.};
-  for(int i=0; i<10 && i<cmlen; i++) mecha[i]=cmech[i];
-  mecha[10]=0;
-  Int_t pdg=gMC->PDGFromId(ipart);
-  gAlice->SetTrack(keep, parent-1, pdg, pmom, vpos, polar, tof, mecha, ntr);
-  ntr++;
-}
-
-//_____________________________________________________________________________
-extern "C" void type_of_call  rxkeep(const Int_t &n)
-{
-  if( NULL==gAlice ) exit(1);
+  fRunLoader = rloader;
+  if (fRunLoader == 0x0) return;
   
-  if( n<=0 || n>gAlice->Particles()->GetEntries() )
-    {
-      printf("  Bad index n=%d must be 0<n<=%d\n",
-            n,gAlice->Particles()->GetEntries());
-      exit(1);
-    }
+  TString evfoldname;
+  TFolder* evfold = fRunLoader->GetEventFolder();
+  if (evfold) evfoldname = evfold->GetName();
+  else Warning("SetRunLoader","Did not get Event Folder from Run Loader");
   
-  ((TParticle*)(gAlice->Particles()->UncheckedAt(n-1)))->SetBit(Keep_Bit);
+  if ( fRunLoader->GetAliRun() )
+   {//if alrun already exists in folder
+    if (fRunLoader->GetAliRun() != this )
+     {//and is different than this - crash
+       Fatal("AliRun","AliRun is already in Folder and it is not this object");
+       return;//pro forma
+     }//else do nothing
+   }
+  else
+   {
+     evfold->Add(this);//Post this AliRun to Folder
+   }
+  
+  TIter next(fModules);
+  AliModule *module;
+  while((module = (AliModule*)next())) 
+   {
+     if (evfold) AliConfig::Instance()->Add(module,evfoldname);
+     module->SetRunLoader(fRunLoader);
+     AliDetector* detector = dynamic_cast<AliDetector*>(module);
+     if (detector)
+      {
+        AliLoader* loader = fRunLoader->GetLoader(detector);
+        if (loader == 0x0)
+         {
+           Error("SetRunLoader","Can not get loader for detector %s",detector->GetName());
+         }
+        else
+         {
+           if (GetDebug()) Info("SetRunLoader","Setting loader for detector %s",detector->GetName());
+           detector->SetLoader(loader);
+         }
+      }
+   }
 }
 
-//_____________________________________________________________________________
-extern "C" void type_of_call  rxouth ()
+void AliRun::AddModule(AliModule* mod)
 {
   //
-  // Called by Gtreve at the end of each primary track
+  // Add a module to the module list
   //
-  gAlice->FinishPrimary();
-}
+  if (mod == 0x0) return;
+  if (strlen(mod->GetName()) == 0) return;
+  if (GetModuleID(mod->GetName()) >= 0) return;
+  
+  if (GetDebug()) Info("AddModule","%s",mod->GetName());
+  if (fRunLoader == 0x0) AliConfig::Instance()->Add(mod);
+  else AliConfig::Instance()->Add(mod,fRunLoader->GetEventFolder()->GetName());
 
+  Modules()->Add(mod);
+  
+  fNdets++;
+}