]> git.uio.no Git - u/mrichter/AliRoot.git/blobdiff - STEER/AliSimulation.cxx
Fixes for bug #52499: Field polarities inconsistiency
[u/mrichter/AliRoot.git] / STEER / AliSimulation.cxx
index a3881924a26ed024168dca16407edb0a40854fa8..d017b446624b8782c6243314ad4d62f665226e32 100644 (file)
 //                                                                           //
 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
 
-#include <TVirtualMCApplication.h>
-#include <TVirtualMC.h>
+#include <TCint.h>
+#include <TFile.h>
+#include <TGeoGlobalMagField.h>
 #include <TGeoManager.h>
 #include <TObjString.h>
-#include <TSystem.h>
-#include <TFile.h>
 #include <TROOT.h>
+#include <TSystem.h>
+#include <TVirtualMC.h>
+#include <TVirtualMCApplication.h>
 
-#include "AliCodeTimer.h"
-#include "AliCDBStorage.h"
+#include "AliAlignObj.h"
 #include "AliCDBEntry.h"
 #include "AliCDBManager.h"
-#include "AliGeomManager.h"
-#include "AliAlignObj.h"
+#include "AliCDBStorage.h"
+#include "AliCTPRawData.h"
 #include "AliCentralTrigger.h"
+#include "AliCentralTrigger.h"
+#include "AliCodeTimer.h"
 #include "AliDAQ.h"
 #include "AliDigitizer.h"
+#include "AliESDEvent.h"
+#include "AliGRPObject.h"
+#include "AliGenEventHeader.h"
 #include "AliGenerator.h"
+#include "AliGeomManager.h"
+#include "AliHLTSimulation.h"
+#include "AliHeader.h"
+#include "AliLego.h"
+#include "AliLegoGenerator.h"
 #include "AliLog.h"
+#include "AliMC.h"
+#include "AliMagF.h"
 #include "AliModule.h"
+#include "AliPDG.h"
+#include "AliRawReaderDate.h"
+#include "AliRawReaderFile.h"
+#include "AliRawReaderRoot.h"
 #include "AliRun.h"
 #include "AliRunDigitizer.h"
 #include "AliRunLoader.h"
 #include "AliSimulation.h"
-#include "AliVertexGenFile.h"
-#include "AliCentralTrigger.h"
-#include "AliCTPRawData.h"
-#include "AliRawReaderFile.h"
-#include "AliRawReaderRoot.h"
-#include "AliRawReaderDate.h"
-#include "AliESD.h"
-#include "AliHeader.h"
-#include "AliGenEventHeader.h"
-#include "AliMC.h"
-#include "AliHLTSimulation.h"
 #include "AliSysInfo.h"
-#include "AliMagF.h"
-#include "AliGRPObject.h"
+#include "AliVertexGenFile.h"
 
 ClassImp(AliSimulation)
 
@@ -176,6 +181,7 @@ AliSimulation::AliSimulation(const char* configFileName,
   fUseBkgrdVertex(kTRUE),
   fRegionOfInterest(kFALSE),
   fCDBUri(""),
+  fQARefUri(""), 
   fSpecCDBUri(),
   fRun(-1),
   fSeed(0),
@@ -183,12 +189,14 @@ AliSimulation::AliSimulation(const char* configFileName,
   fInitRunNumberCalled(kFALSE),
   fSetRunNumberFromDataCalled(kFALSE),
   fEmbeddingFlag(kFALSE),
+  fLego(NULL),
   fQADetectors("ALL"),                  
   fQATasks("ALL"),     
-  fQASteer(NULL), 
   fRunQA(kTRUE), 
   fEventSpecie(AliRecoParam::kDefault),
+  fWriteQAExpertData(kTRUE), 
   fRunHLT("default"),
+  fpHLT(NULL),
   fWriteGRPEntry(kTRUE)
 {
 // create simulation object with default parameters
@@ -196,10 +204,10 @@ AliSimulation::AliSimulation(const char* configFileName,
   SetGAliceFile("galice.root");
   
 // for QA
-       fQASteer = new AliQADataMakerSteer("sim") ; 
-       fQASteer->SetActiveDetectors(fQADetectors) ; 
-       fQATasks = Form("%d %d %d", AliQA::kHITS, AliQA::kSDIGITS, AliQA::kDIGITS) ; 
-       fQASteer->SetTasks(fQATasks) ;  
+       AliQAManager * qam = AliQAManager::QAManager(AliQAv1::kSIMMODE) ; 
+       qam->SetActiveDetectors(fQADetectors) ; 
+       fQATasks = Form("%d %d %d", AliQAv1::kHITS, AliQAv1::kSDIGITS, AliQAv1::kDIGITS) ; 
+       qam->SetTasks(fQATasks) ;       
 }
 
 //_____________________________________________________________________________
@@ -219,8 +227,8 @@ AliSimulation::~AliSimulation()
   fSpecCDBUri.Delete();
   if (fgInstance==this) fgInstance = 0;
 
-       delete fQASteer ; 
-       
+  AliQAManager::QAManager()->ShowQA() ; 
+  AliQAManager::Destroy() ;    
   AliCodeTimer::Instance()->Print();
 }
 
@@ -233,6 +241,45 @@ void AliSimulation::SetNumberOfEvents(Int_t nEvents)
   fNEvents = nEvents;
 }
 
+//_____________________________________________________________________________
+void AliSimulation::InitQA()
+{
+  // activate a default CDB storage
+  // First check if we have any CDB storage set, because it is used 
+  // to retrieve the calibration and alignment constants
+  
+  if (fInitCDBCalled) return;
+  fInitCDBCalled = kTRUE;
+
+  AliQAManager * qam = AliQAManager::QAManager(AliQAv1::kSIMMODE) ; 
+  qam->SetActiveDetectors(fQADetectors) ; 
+  fQATasks = Form("%d %d %d", AliQAv1::kHITS, AliQAv1::kSDIGITS, AliQAv1::kDIGITS) ; 
+  qam->SetTasks(fQATasks) ;
+       if (fWriteQAExpertData)
+    qam->SetWriteExpert() ; 
+  
+  if (qam->IsDefaultStorageSet()) {
+    AliWarning("!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!");
+    AliWarning("Default QA reference storage has been already set !");
+    AliWarning(Form("Ignoring the default storage declared in AliSimulation: %s",fQARefUri.Data()));
+    AliWarning("!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!");
+    fQARefUri = qam->GetDefaultStorage()->GetURI();
+  } else {
+      if (fQARefUri.Length() > 0) {
+        AliDebug(2,"!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!");
+        AliDebug(2, Form("Default QA reference storage is set to: %s", fQARefUri.Data()));
+        AliDebug(2, "!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!");
+      } else {
+        fQARefUri="local://$ALICE_ROOT/QARef";
+        AliWarning("!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!");
+        AliWarning("Default QA reference storage not yet set !!!!");
+        AliWarning(Form("Setting it now to: %s", fQARefUri.Data()));
+        AliWarning("!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!");
+      }
+    qam->SetDefaultStorage(fQARefUri);
+  }
+}
+
 //_____________________________________________________________________________
 void AliSimulation::InitCDB()
 {
@@ -259,7 +306,7 @@ void AliSimulation::InitCDB()
        AliDebug(2, Form("Default CDB storage is set to: %s", fCDBUri.Data()));
        AliDebug(2, "!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!");
     } else {
-       fCDBUri="local://$ALICE_ROOT";
+       fCDBUri="local://$ALICE_ROOT/OCDB";
        AliWarning("!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!");
        AliWarning("Default CDB storage not yet set !!!!");
        AliWarning(Form("Setting it now to: %s", fCDBUri.Data()));
@@ -296,16 +343,11 @@ void AliSimulation::InitRunNumber(){
   }
     
   if(fRun >= 0) {
-       AliDebug(2,"!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!");
        AliDebug(2, Form("Setting CDB run number to: %d",fRun));
-       AliDebug(2, "!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!");
   } else {
        fRun=0;
-       AliWarning("!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!");
-       AliWarning("Run number not yet set !!!!");
-       AliWarning(Form("Setting it now to: %d", fRun));
-       AliWarning("!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!");
-       
+       AliWarning(Form("Run number not yet set !!!! Setting it now to: %d",
+                       fRun));
   }
   man->SetRun(fRun);
 
@@ -323,11 +365,20 @@ void AliSimulation::SetCDBLock() {
 
 //_____________________________________________________________________________
 void AliSimulation::SetDefaultStorage(const char* uri) {
-// Store the desired default CDB storage location
-// Activate it later within the Run() method
-
+  // Store the desired default CDB storage location
+  // Activate it later within the Run() method
+  
   fCDBUri = uri;
+  
+}
 
+//_____________________________________________________________________________
+void AliSimulation::SetQARefDefaultStorage(const char* uri) {
+  // Store the desired default CDB storage location
+  // Activate it later within the Run() method
+  
+  fQARefUri = uri;
+  AliQAv1::SetQARefStorage(fQARefUri.Data()) ;
 }
 
 //_____________________________________________________________________________
@@ -551,23 +602,34 @@ Bool_t AliSimulation::Run(Int_t nEvents)
 
  
   AliCodeTimerAuto("")
+  AliSysInfo::AddStamp("Start_Run");
   
   // Load run number and seed from environmental vars
   ProcessEnvironmentVars();
+  AliSysInfo::AddStamp("ProcessEnvironmentVars");
 
   gRandom->SetSeed(fSeed);
    
   if (nEvents > 0) fNEvents = nEvents;
 
+  // create and setup the HLT instance
+  if (!fRunHLT.IsNull() && !CreateHLT()) {
+    if (fStopOnError) return kFALSE;
+    // disable HLT
+    fRunHLT="";
+  }
+  
   // generation and simulation -> hits
   if (fRunGeneration) {
     if (!RunSimulation()) if (fStopOnError) return kFALSE;
   }
+  AliSysInfo::AddStamp("RunSimulation");
            
   // initialize CDB storage from external environment
   // (either CDB manager or AliSimulation setters),
   // if not already done in RunSimulation()
   InitCDB();
+  AliSysInfo::AddStamp("InitCDB");
   
   // Set run number in CDBManager from data 
   // From this point on the run number must be always loaded from data!
@@ -581,6 +643,8 @@ Bool_t AliSimulation::Run(Int_t nEvents)
   if (!AliGeomManager::GetGeometry()) {
     // Initialize the geometry manager
     AliGeomManager::LoadGeometry("geometry.root");
+  AliSysInfo::AddStamp("GetGeometry");
+
     
 //    // Check that the consistency of symbolic names for the activated subdetectors
 //    // in the geometry loaded by AliGeomManager
@@ -603,6 +667,7 @@ Bool_t AliSimulation::Run(Int_t nEvents)
     // Misalign geometry
     if(!MisalignGeometry()) if (fStopOnError) return kFALSE;
   }
+  AliSysInfo::AddStamp("MissalignGeometry");
 
 
   // hits -> summable digits
@@ -637,6 +702,7 @@ Bool_t AliSimulation::Run(Int_t nEvents)
     }
   }
 
+  AliSysInfo::AddStamp("Hits2Digits");
   
   
   // digits -> trigger
@@ -644,6 +710,7 @@ Bool_t AliSimulation::Run(Int_t nEvents)
     if (fStopOnError) return kFALSE;
   }
 
+  AliSysInfo::AddStamp("RunTrigger");
   
   
   // digits -> raw data
@@ -654,6 +721,7 @@ Bool_t AliSimulation::Run(Int_t nEvents)
     }
   }
 
+  AliSysInfo::AddStamp("WriteRaw");
   
   // run HLT simulation on simulated digit data if raw data is not
   // simulated, otherwise its called as part of WriteRawData
@@ -662,6 +730,8 @@ Bool_t AliSimulation::Run(Int_t nEvents)
       if (fStopOnError) return kFALSE;
     }
   }
+
+  AliSysInfo::AddStamp("RunHLT");
   
   //QA
        if (fRunQA) {
@@ -671,12 +741,152 @@ Bool_t AliSimulation::Run(Int_t nEvents)
                                return kFALSE ;         
        }
 
+  AliSysInfo::AddStamp("RunQA");
+
   // Cleanup of CDB manager: cache and active storages!
   AliCDBManager::Instance()->ClearCache();
 
   return kTRUE;
 }
 
+//_______________________________________________________________________
+Bool_t AliSimulation::RunLego(const char *setup, Int_t nc1, Float_t c1min,
+                    Float_t c1max,Int_t nc2,Float_t c2min,Float_t c2max,
+                    Float_t rmin,Float_t rmax,Float_t zmax, AliLegoGenerator* gener, Int_t nev)
+{
+  //
+  // Generates lego plots of:
+  //    - radiation length map phi vs theta
+  //    - radiation length map phi vs eta
+  //    - interaction length map
+  //    - g/cm2 length map
+  //
+  //  ntheta    bins in theta, eta
+  //  themin    minimum angle in theta (degrees)
+  //  themax    maximum angle in theta (degrees)
+  //  nphi      bins in phi
+  //  phimin    minimum angle in phi (degrees)
+  //  phimax    maximum angle in phi (degrees)
+  //  rmin      minimum radius
+  //  rmax      maximum radius
+  //  
+  //
+  //  The number of events generated = ntheta*nphi
+  //  run input parameters in macro setup (default="Config.C")
+  //
+  //  Use macro "lego.C" to visualize the 3 lego plots in spherical coordinates
+  //Begin_Html
+  /*
+    <img src="picts/AliRunLego1.gif">
+  */
+  //End_Html
+  //Begin_Html
+  /*
+    <img src="picts/AliRunLego2.gif">
+  */
+  //End_Html
+  //Begin_Html
+  /*
+    <img src="picts/AliRunLego3.gif">
+  */
+  //End_Html
+  //
+
+// run the generation and simulation
+
+  AliCodeTimerAuto("")
+
+  // initialize CDB storage and run number from external environment
+  // (either CDB manager or AliSimulation setters)
+  InitCDB();
+  InitRunNumber();
+  SetCDBLock();
+  
+  if (!gAlice) {
+    AliError("no gAlice object. Restart aliroot and try again.");
+    return kFALSE;
+  }
+  if (gAlice->Modules()->GetEntries() > 0) {
+    AliError("gAlice was already run. Restart aliroot and try again.");
+    return kFALSE;
+  }
+
+  AliInfo(Form("initializing gAlice with config file %s",
+          fConfigFileName.Data()));
+
+  // Number of events 
+    if (nev == -1) nev  = nc1 * nc2;
+    
+  // check if initialisation has been done
+  // If runloader has been initialized, set the number of events per file to nc1 * nc2
+    
+  // Set new generator
+  if (!gener) gener  = new AliLegoGenerator();
+  //
+  // Configure Generator
+
+  gener->SetRadiusRange(rmin, rmax);
+  gener->SetZMax(zmax);
+  gener->SetCoor1Range(nc1, c1min, c1max);
+  gener->SetCoor2Range(nc2, c2min, c2max);
+  
+  
+  //Create Lego object  
+  fLego = new AliLego("lego",gener);
+
+  //__________________________________________________________________________
+
+  gAlice->Announce();
+
+  gROOT->LoadMacro(setup);
+  gInterpreter->ProcessLine(gAlice->GetConfigFunction());
+
+  if(AliCDBManager::Instance()->GetRun() >= 0) { 
+    SetRunNumber(AliCDBManager::Instance()->GetRun());
+  } else {
+    AliWarning("Run number not initialized!!");
+  }
+
+  AliRunLoader::Instance()->CdGAFile();
+  
+  AliPDG::AddParticlesToPdgDataBase();  
+  
+  gAlice->GetMCApp()->Init();
+  
+  gMC->SetMagField(TGeoGlobalMagField::Instance()->GetField());
+
+  
+  //Must be here because some MCs (G4) adds detectors here and not in Config.C
+  gAlice->InitLoaders();
+  AliRunLoader::Instance()->MakeTree("E");
+  
+  //
+  // Save stuff at the beginning of the file to avoid file corruption
+  AliRunLoader::Instance()->CdGAFile();
+  gAlice->Write();
+
+  //Save current generator
+  AliGenerator *gen=gAlice->GetMCApp()->Generator();
+  gAlice->GetMCApp()->ResetGenerator(gener);
+  //Prepare MC for Lego Run
+  gMC->InitLego();
+  
+  //Run Lego Object
+  
+  
+  AliRunLoader::Instance()->SetNumberOfEventsPerFile(nev);
+  gMC->ProcessRun(nev);
+  
+  // End of this run, close files
+  FinishRun();
+  // Restore current generator
+  gAlice->GetMCApp()->ResetGenerator(gen);
+  // Delete Lego Object
+  delete fLego;
+
+  return kTRUE;
+}
+
 //_____________________________________________________________________________
 Bool_t AliSimulation::RunTrigger(const char* config, const char* detectors)
 {
@@ -749,9 +959,12 @@ Bool_t AliSimulation::RunSimulation(Int_t nEvents)
 
   // initialize CDB storage and run number from external environment
   // (either CDB manager or AliSimulation setters)
+  AliSysInfo::AddStamp("RunSimulation_Begin");
   InitCDB();
+  AliSysInfo::AddStamp("RunSimulation_InitCDB");
   InitRunNumber();
   SetCDBLock();
+  AliSysInfo::AddStamp("RunSimulation_SetCDBLock");
   
   if (!gAlice) {
     AliError("no gAlice object. Restart aliroot and try again.");
@@ -764,9 +977,47 @@ Bool_t AliSimulation::RunSimulation(Int_t nEvents)
 
   AliInfo(Form("initializing gAlice with config file %s",
           fConfigFileName.Data()));
-  StdoutToAliInfo(StderrToAliError(
-    gAlice->Init(fConfigFileName.Data());
-  ););
+
+  //
+  // Initialize ALICE Simulation run
+  //
+
+  gAlice->Announce();
+
+  gROOT->LoadMacro(fConfigFileName.Data());
+  gInterpreter->ProcessLine(gAlice->GetConfigFunction());
+  AliSysInfo::AddStamp("RunSimulation_Config");
+
+  if(AliCDBManager::Instance()->GetRun() >= 0) { 
+    AliRunLoader::Instance()->SetRunNumber(AliCDBManager::Instance()->GetRun());
+    AliRunLoader::Instance()->SetNumberOfEventsPerRun(fNEvents);
+  } else {
+       AliWarning("Run number not initialized!!");
+  }
+  
+   AliRunLoader::Instance()->CdGAFile();
+    
+   AliPDG::AddParticlesToPdgDataBase();  
+
+   gAlice->GetMCApp()->Init();
+   AliSysInfo::AddStamp("RunSimulation_InitMCApp");
+
+   gMC->SetMagField(TGeoGlobalMagField::Instance()->GetField());
+   AliSysInfo::AddStamp("RunSimulation_GetField");
+   
+   //Must be here because some MCs (G4) adds detectors here and not in Config.C
+   gAlice->InitLoaders();
+   AliRunLoader::Instance()->MakeTree("E");
+   AliRunLoader::Instance()->LoadKinematics("RECREATE");
+   AliRunLoader::Instance()->LoadTrackRefs("RECREATE");
+   AliRunLoader::Instance()->LoadHits("all","RECREATE");
+   //
+   // Save stuff at the beginning of the file to avoid file corruption
+   AliRunLoader::Instance()->CdGAFile();
+   gAlice->Write();
+   gAlice->SetEventNrInRun(-1); //important - we start Begin event from increasing current number in run
+   AliSysInfo::AddStamp("RunSimulation_InitLoaders");
+  //___________________________________________________________________________________________
   
   // Get the trigger descriptor string
   // Either from AliSimulation or from
@@ -777,11 +1028,12 @@ Bool_t AliSimulation::RunSimulation(Int_t nEvents)
   }
   else
     gAlice->SetTriggerDescriptor(fMakeTrigger.Data());
+  AliSysInfo::AddStamp("RunSimulation_TriggerDescriptor");
 
   // Set run number in CDBManager
   AliInfo(Form("Run number: %d",AliCDBManager::Instance()->GetRun()));
 
-  AliRunLoader* runLoader = AliRunLoader::GetRunLoader();
+  AliRunLoader* runLoader = AliRunLoader::Instance();
   if (!runLoader) {
              AliError(Form("gAlice has no run loader object. "
                             "Check your config file: %s", fConfigFileName.Data()));
@@ -806,9 +1058,10 @@ Bool_t AliSimulation::RunSimulation(Int_t nEvents)
   if(!AliGeomManager::CheckSymNamesLUT(detsToBeChecked.Data()))
     AliFatalClass("Current loaded geometry differs in the definition of symbolic names!");
   MisalignGeometry(runLoader);
+  AliSysInfo::AddStamp("RunSimulation_MisalignGeometry");
 #endif
 
-//   AliRunLoader* runLoader = AliRunLoader::GetRunLoader();
+//   AliRunLoader* runLoader = AliRunLoader::Instance();
 //   if (!runLoader) {
 //     AliError(Form("gAlice has no run loader object. "
 //                   "Check your config file: %s", fConfigFileName.Data()));
@@ -816,7 +1069,7 @@ Bool_t AliSimulation::RunSimulation(Int_t nEvents)
 //   }
 //   SetGAliceFile(runLoader->GetFileName());
 
-  if (!gAlice->Generator()) {
+  if (!gAlice->GetMCApp()->Generator()) {
     AliError(Form("gAlice has no generator object. "
                   "Check your config file: %s", fConfigFileName.Data()));
     return kFALSE;
@@ -825,6 +1078,7 @@ Bool_t AliSimulation::RunSimulation(Int_t nEvents)
   // Write GRP entry corresponding to the setting found in Cofig.C
   if (fWriteGRPEntry)
     WriteGRPEntry();
+  AliSysInfo::AddStamp("RunSimulation_WriteGRP");
 
   if (nEvents <= 0) nEvents = fNEvents;
 
@@ -838,11 +1092,11 @@ Bool_t AliSimulation::RunSimulation(Int_t nEvents)
                  "file %s with nSignalPerBackground = %d", 
                  fileName, signalPerBkgrd));
     AliVertexGenFile* vtxGen = new AliVertexGenFile(fileName, signalPerBkgrd);
-    gAlice->Generator()->SetVertexGenerator(vtxGen);
+    gAlice->GetMCApp()->Generator()->SetVertexGenerator(vtxGen);
   }
 
   if (!fRunSimulation) {
-    gAlice->Generator()->SetTrackingFlag(0);
+    gAlice->GetMCApp()->Generator()->SetTrackingFlag(0);
   }
 
   // set the number of events per file for given detectors and data types
@@ -873,19 +1127,17 @@ Bool_t AliSimulation::RunSimulation(Int_t nEvents)
   }
 
   AliInfo("running gAlice");
-  AliSysInfo::AddStamp("Start_simulation");
+  AliSysInfo::AddStamp("Start_ProcessRun");
 
-  gAlice->InitMC("Config.C");
-  
   // Create the Root Tree with one branch per detector
   //Hits moved to begin event -> now we are crating separate tree for each event
 
   gMC->ProcessRun(nEvents);
 
   // End of this run, close files
-  if(nEvents>0) gAlice->FinishRun();
+  if(nEvents>0) FinishRun();
 
-  AliSysInfo::AddStamp("Stop_simulation");
+  AliSysInfo::AddStamp("Stop_ProcessRun");
   delete runLoader;
 
   return kTRUE;
@@ -896,7 +1148,7 @@ Bool_t AliSimulation::RunSDigitization(const char* detectors)
 {
 // run the digitization and produce summable digits
   static Int_t eventNr=0;
-  AliCodeTimerAuto("")
+  AliCodeTimerAuto("") ;
 
   // initialize CDB storage, run number, set CDB lock
   InitCDB();
@@ -913,8 +1165,9 @@ Bool_t AliSimulation::RunSDigitization(const char* detectors)
     if (!det || !det->IsActive()) continue;
     if (IsSelected(det->GetName(), detStr)) {
       AliInfo(Form("creating summable digits for %s", det->GetName()));
-      AliCodeTimerAuto(Form("creating summable digits for %s", det->GetName()));
+      AliCodeTimerStart(Form("creating summable digits for %s", det->GetName()));
       det->Hits2SDigits();
+      AliCodeTimerStop(Form("creating summable digits for %s", det->GetName()));
       AliSysInfo::AddStamp(Form("Digit_%s_%d",det->GetName(),eventNr), 0,1, eventNr);
     }
   }
@@ -944,7 +1197,7 @@ Bool_t AliSimulation::RunDigitization(const char* detectors,
   if (!SetRunNumberFromData()) if (fStopOnError) return kFALSE;
   SetCDBLock();
   
-  delete AliRunLoader::GetRunLoader();
+  delete AliRunLoader::Instance();
   delete gAlice;
   gAlice = NULL;
 
@@ -1051,19 +1304,28 @@ Bool_t AliSimulation::WriteRawData(const char* detectors,
 // accoring to the trigger cluster.
 
   AliCodeTimerAuto("")
+  AliSysInfo::AddStamp("WriteRawData_Start");
   
   TString detStr = detectors;
   if (!WriteRawFiles(detStr.Data())) {
     if (fStopOnError) return kFALSE;
   }
+  AliSysInfo::AddStamp("WriteRawFiles");
 
   // run HLT simulation on simulated DDL raw files
   // and produce HLT ddl raw files to be included in date/root file
-  if (IsSelected("HLT", detStr) && !fRunHLT.IsNull()) {
+  // bugfix 2009-06-26: the decision whether to write HLT raw data
+  // is taken in RunHLT. Here HLT always needs to be run in order to
+  // create HLT digits, unless its switched off. This is due to the
+  // special placement of the HLT between the generation of DDL files
+  // and conversion to DATE/Root file.
+  detStr.ReplaceAll("HLT", "");
+  if (!fRunHLT.IsNull()) {
     if (!RunHLT()) {
       if (fStopOnError) return kFALSE;
     }
   }
+  AliSysInfo::AddStamp("WriteRawData_RunHLT");
 
   TString dateFileName(fileName);
   if (!dateFileName.IsNull()) {
@@ -1077,6 +1339,7 @@ Bool_t AliSimulation::WriteRawData(const char* detectors,
     if (!ConvertRawFilesToDate(dateFileName,selDateFileName)) {
       if (fStopOnError) return kFALSE;
     }
+    AliSysInfo::AddStamp("ConvertRawFilesToDate");
     if (deleteIntermediateFiles) {
       AliRunLoader* runLoader = LoadRun("READ");
       if (runLoader) for (Int_t iEvent = 0; 
@@ -1091,6 +1354,7 @@ Bool_t AliSimulation::WriteRawData(const char* detectors,
       if (!ConvertDateToRoot(dateFileName, fileName)) {
        if (fStopOnError) return kFALSE;
       }
+      AliSysInfo::AddStamp("ConvertDateToRoot");
       if (deleteIntermediateFiles) {
        gSystem->Unlink(dateFileName);
       }
@@ -1388,7 +1652,7 @@ AliRunLoader* AliSimulation::LoadRun(const char* mode) const
 {
 // delete existing run loaders, open a new one and load gAlice
 
-  delete AliRunLoader::GetRunLoader();
+  delete AliRunLoader::Instance();
   AliRunLoader* runLoader = 
     AliRunLoader::Open(fGAliceFileName.Data(), 
                       AliConfig::GetDefaultEventFolderName(), mode);
@@ -1502,17 +1766,46 @@ Bool_t AliSimulation::ConvertRaw2SDigits(const char* rawDirectory, const char* e
 //
 // If an ESD file is given the reconstructed vertex is taken from it and stored in the event header.
 //
-    if (!gAlice) {
-       AliError("no gAlice object. Restart aliroot and try again.");
-       return kFALSE;
-    }
-    if (gAlice->Modules()->GetEntries() > 0) {
-       AliError("gAlice was already run. Restart aliroot and try again.");
-       return kFALSE;
-    }
+  if (!gAlice) {
+    AliError("no gAlice object. Restart aliroot and try again.");
+    return kFALSE;
+  }
+  if (gAlice->Modules()->GetEntries() > 0) {
+    AliError("gAlice was already run. Restart aliroot and try again.");
+    return kFALSE;
+  }
+  
+  AliInfo(Form("initializing gAlice with config file %s",fConfigFileName.Data()));
+  
+  gAlice->Announce();
+  
+  gROOT->LoadMacro(fConfigFileName.Data());
+  gInterpreter->ProcessLine(gAlice->GetConfigFunction());
+  
+  if(AliCDBManager::Instance()->GetRun() >= 0) { 
+       SetRunNumber(AliCDBManager::Instance()->GetRun());
+  } else {
+       AliWarning("Run number not initialized!!");
+  }
+  
+   AliRunLoader::Instance()->CdGAFile();
     
-    AliInfo(Form("initializing gAlice with config file %s",fConfigFileName.Data()));
-    StdoutToAliInfo(StderrToAliError(gAlice->Init(fConfigFileName.Data());););
+   AliPDG::AddParticlesToPdgDataBase();  
+
+   gAlice->GetMCApp()->Init();
+
+   gMC->SetMagField(TGeoGlobalMagField::Instance()->GetField());
+   
+   //Must be here because some MCs (G4) adds detectors here and not in Config.C
+   gAlice->InitLoaders();
+   AliRunLoader::Instance()->MakeTree("E");
+   AliRunLoader::Instance()->LoadKinematics("RECREATE");
+   AliRunLoader::Instance()->LoadTrackRefs("RECREATE");
+   AliRunLoader::Instance()->LoadHits("all","RECREATE");
+   //
+   // Save stuff at the beginning of the file to avoid file corruption
+   AliRunLoader::Instance()->CdGAFile();
+   gAlice->Write();
 //
 //  Initialize CDB     
     InitCDB();
@@ -1522,22 +1815,15 @@ Bool_t AliSimulation::ConvertRaw2SDigits(const char* rawDirectory, const char* e
     Int_t iDet;
     //
     // Get the runloader
-    AliRunLoader* runLoader = AliRunLoader::GetRunLoader();
+    AliRunLoader* runLoader = AliRunLoader::Instance();
     //
     // Open esd file if available
     TFile* esdFile = TFile::Open(esdFileName);
-    Bool_t esdOK = (esdFile != 0);
-    AliESD* esd = new AliESD;
     TTree* treeESD = 0;
-    if (esdOK) {
-       treeESD = (TTree*) esdFile->Get("esdTree");
-       if (!treeESD) {
-           AliWarning("No ESD tree found");
-           esdOK = kFALSE;
-       } else {
-           treeESD->SetBranchAddress("ESD", &esd);
-       }
-    }
+    AliESDEvent* esd = new AliESDEvent();
+    esdFile->GetObject("esdTree", treeESD);
+    if (treeESD) esd->ReadFromTree(treeESD);
+
     //
     // Create the RawReader
     TString fileName(rawDirectory);
@@ -1578,7 +1864,7 @@ Bool_t AliSimulation::ConvertRaw2SDigits(const char* rawDirectory, const char* e
 
        //
        //  If ESD information available obtain reconstructed vertex and store in header.
-       if (esdOK) {
+       if (treeESD) {
            treeESD->GetEvent(nev);
            const AliESDVertex* esdVertex = esd->GetPrimaryVertex();
            Double_t position[3];
@@ -1609,6 +1895,40 @@ Bool_t AliSimulation::ConvertRaw2SDigits(const char* rawDirectory, const char* e
     return kTRUE;
 }
 
+//_____________________________________________________________________________
+void AliSimulation::FinishRun()
+{
+  //
+  // Called at the end of the run.
+  //
+
+  if(IsLegoRun()) 
+   {
+    AliDebug(1, "Finish Lego");
+    AliRunLoader::Instance()->CdGAFile();
+    fLego->FinishRun();
+   }
+  
+  // Clean detector information
+  TIter next(gAlice->Modules());
+  AliModule *detector;
+  while((detector = dynamic_cast<AliModule*>(next()))) {
+    AliDebug(2, Form("%s->FinishRun()", detector->GetName()));
+    detector->FinishRun();
+  }
+  
+  AliDebug(1, "AliRunLoader::Instance()->WriteHeader(OVERWRITE)");
+  AliRunLoader::Instance()->WriteHeader("OVERWRITE");
+
+  // Write AliRun info and all detectors parameters
+  AliRunLoader::Instance()->CdGAFile();
+  gAlice->Write(0,TObject::kOverwrite);//write AliRun
+  AliRunLoader::Instance()->Write(0,TObject::kOverwrite);//write RunLoader itself
+  
+  if(gAlice->GetMCApp()) gAlice->GetMCApp()->FinishRun();  
+  AliRunLoader::Instance()->Synchronize();
+}
+
 //_____________________________________________________________________________
 Int_t AliSimulation::GetDetIndex(const char* detector)
 {
@@ -1621,6 +1941,62 @@ Int_t AliSimulation::GetDetIndex(const char* detector)
   return index ; 
 }
 
+//_____________________________________________________________________________
+Bool_t AliSimulation::CreateHLT()
+{
+  // Init the HLT simulation.
+  // The function  loads the library and creates the instance of AliHLTSimulation.
+  // the main reason for the decoupled creation is to set the transient OCDB
+  // objects before the OCDB is locked
+
+  // load the library dynamically
+  gSystem->Load(ALIHLTSIMULATION_LIBRARY);
+
+  // check for the library version
+  AliHLTSimulationGetLibraryVersion_t fctVersion=(AliHLTSimulationGetLibraryVersion_t)(gSystem->DynFindSymbol(ALIHLTSIMULATION_LIBRARY, ALIHLTSIMULATION_GET_LIBRARY_VERSION));
+  if (!fctVersion) {
+    AliError(Form("can not load library %s", ALIHLTSIMULATION_LIBRARY));
+    return kFALSE;
+  }
+  if (fctVersion()!= ALIHLTSIMULATION_LIBRARY_VERSION) {
+    AliWarning(Form("%s version does not match: compiled for version %d, loaded %d", ALIHLTSIMULATION_LIBRARY, ALIHLTSIMULATION_LIBRARY_VERSION, fctVersion()));
+  }
+
+  // print compile info
+  typedef void (*CompileInfo)( const char*& date, const char*& time);
+  CompileInfo fctInfo=(CompileInfo)gSystem->DynFindSymbol(ALIHLTSIMULATION_LIBRARY, "CompileInfo");
+  if (fctInfo) {
+    const char* date="";
+    const char* time="";
+    (*fctInfo)(date, time);
+    if (!date) date="unknown";
+    if (!time) time="unknown";
+    AliInfo(Form("%s build on %s (%s)", ALIHLTSIMULATION_LIBRARY, date, time));
+  } else {
+    AliInfo(Form("no build info available for %s", ALIHLTSIMULATION_LIBRARY));
+  }
+
+  // create instance of the HLT simulation
+  AliHLTSimulationCreateInstance_t fctCreate=(AliHLTSimulationCreateInstance_t)(gSystem->DynFindSymbol(ALIHLTSIMULATION_LIBRARY, ALIHLTSIMULATION_CREATE_INSTANCE));
+  if (fctCreate==NULL || (fpHLT=(fctCreate()))==NULL) {
+    AliError(Form("can not create instance of HLT simulation (creator %p)", fctCreate));
+    return kFALSE;    
+  }
+
+  TString specObjects;
+  for (Int_t i = 0; i < fSpecCDBUri.GetEntriesFast(); i++) {
+    if (specObjects.Length()>0) specObjects+=" ";
+    specObjects+=fSpecCDBUri[i]->GetName();
+  }
+
+  AliHLTSimulationSetup_t fctSetup=(AliHLTSimulationSetup_t)(gSystem->DynFindSymbol(ALIHLTSIMULATION_LIBRARY, ALIHLTSIMULATION_SETUP));
+  if (fctSetup==NULL || fctSetup(fpHLT, this, specObjects.Data())<0) {
+    AliWarning(Form("failed to setup HLT simulation (function %p)", fctSetup));
+  }
+
+  return kTRUE;
+}
+
 //_____________________________________________________________________________
 Bool_t AliSimulation::RunHLT()
 {
@@ -1654,52 +2030,22 @@ Bool_t AliSimulation::RunHLT()
   //     raw data is simulated
 
   int iResult=0;
+
+  if (!fpHLT && !CreateHLT()) {
+    return kFALSE;
+  }
+  AliHLTSimulation* pHLT=fpHLT;
+
   AliRunLoader* pRunLoader = LoadRun("READ");
   if (!pRunLoader) return kFALSE;
 
   // initialize CDB storage, run number, set CDB lock
+  // thats for the case of running HLT simulation without all the other steps
+  // multiple calls are handled by the function, so we can just call
   InitCDB();
   if (!SetRunNumberFromData()) if (fStopOnError) return kFALSE;
   SetCDBLock();
   
-  // load the library dynamically
-  gSystem->Load(ALIHLTSIMULATION_LIBRARY);
-
-  // check for the library version
-  AliHLTSimulationGetLibraryVersion_t fctVersion=(AliHLTSimulationGetLibraryVersion_t)(gSystem->DynFindSymbol(ALIHLTSIMULATION_LIBRARY, ALIHLTSIMULATION_GET_LIBRARY_VERSION));
-  if (!fctVersion) {
-    AliError(Form("can not load library %s", ALIHLTSIMULATION_LIBRARY));
-    return kFALSE;
-  }
-  if (fctVersion()!= ALIHLTSIMULATION_LIBRARY_VERSION) {
-    AliError(Form("%s version does not match: compiled for version %d, loaded %d", ALIHLTSIMULATION_LIBRARY, ALIHLTSIMULATION_LIBRARY_VERSION, fctVersion()));
-    return kFALSE;
-  }
-
-  // print compile info
-  typedef void (*CompileInfo)( char*& date, char*& time);
-  CompileInfo fctInfo=(CompileInfo)gSystem->DynFindSymbol(ALIHLTSIMULATION_LIBRARY, "CompileInfo");
-  if (fctInfo) {
-    Char_t* date=0;
-    Char_t* time=0;
-    (*fctInfo)(date,time);
-    if (!date) {date=new Char_t[8]; strcpy(date,"unknown");}
-    if (!time) {time=new Char_t[8]; strcpy(time,"unknown");}
-    AliInfo(Form("%s build on %s (%s)", ALIHLTSIMULATION_LIBRARY, date, time));
-    delete date;
-    delete time;
-  } else {
-    AliInfo(Form("no build info available for %s", ALIHLTSIMULATION_LIBRARY));
-  }
-
-  // create instance of the HLT simulation
-  AliHLTSimulationCreateInstance_t fctCreate=(AliHLTSimulationCreateInstance_t)(gSystem->DynFindSymbol(ALIHLTSIMULATION_LIBRARY, ALIHLTSIMULATION_CREATE_INSTANCE));
-  AliHLTSimulation* pHLT=NULL;
-  if (fctCreate==NULL || (pHLT=(fctCreate()))==NULL) {
-    AliError(Form("can not create instance of HLT simulation (creator %p)", fctCreate));
-    return kFALSE;    
-  }
-
   // init the HLT simulation
   TString options;
   if (fRunHLT.CompareTo("default")!=0) options=fRunHLT;
@@ -1745,12 +2091,12 @@ Bool_t AliSimulation::RunQA()
        // run the QA on summable hits, digits or digits
        
   if(!gAlice) return kFALSE;
-       fQASteer->SetRunLoader(AliRunLoader::GetRunLoader()) ;
+       AliQAManager::QAManager()->SetRunLoader(AliRunLoader::Instance()) ;
 
        TString detectorsw("") ;  
        Bool_t rv = kTRUE ; 
-  fQASteer->SetEventSpecie(fEventSpecie) ;
-       detectorsw = fQASteer->Run(fQADetectors.Data()) ; 
+  AliQAManager::QAManager()->SetEventSpecie(fEventSpecie) ;
+       detectorsw = AliQAManager::QAManager()->Run(fQADetectors.Data()) ; 
        if ( detectorsw.IsNull() ) 
                rv = kFALSE ; 
        return rv ; 
@@ -1774,16 +2120,16 @@ Bool_t AliSimulation::SetRunQA(TString detAndAction)
                fQADetectors = Form("%s %s", fMakeDigits.Data(), fMakeDigitsFromHits.Data()) ; 
                fQATasks   = detAndAction(colon+1, detAndAction.Sizeof() ) ; 
        if (fQATasks.Contains("ALL") ) {
-               fQATasks = Form("%d %d %d", AliQA::kHITS, AliQA::kSDIGITS, AliQA::kDIGITS) ; 
+               fQATasks = Form("%d %d %d", AliQAv1::kHITS, AliQAv1::kSDIGITS, AliQAv1::kDIGITS) ; 
        } else {
                fQATasks.ToUpper() ; 
                TString tempo("") ; 
                if ( fQATasks.Contains("HIT") ) 
-                       tempo = Form("%d ", AliQA::kHITS) ; 
+                       tempo = Form("%d ", AliQAv1::kHITS) ; 
                if ( fQATasks.Contains("SDIGIT") ) 
-                       tempo += Form("%d ", AliQA::kSDIGITS) ; 
+                       tempo += Form("%d ", AliQAv1::kSDIGITS) ; 
                if ( fQATasks.Contains("DIGIT") ) 
-                       tempo += Form("%d ", AliQA::kDIGITS) ; 
+                       tempo += Form("%d ", AliQAv1::kDIGITS) ; 
                fQATasks = tempo ; 
                if (fQATasks.IsNull()) {
                        AliInfo("No QA requested\n")  ;
@@ -1792,15 +2138,15 @@ Bool_t AliSimulation::SetRunQA(TString detAndAction)
                }
        }       
        TString tempo(fQATasks) ; 
-    tempo.ReplaceAll(Form("%d", AliQA::kHITS), AliQA::GetTaskName(AliQA::kHITS))       ;
-    tempo.ReplaceAll(Form("%d", AliQA::kSDIGITS), AliQA::GetTaskName(AliQA::kSDIGITS)) ;       
-    tempo.ReplaceAll(Form("%d", AliQA::kDIGITS), AliQA::GetTaskName(AliQA::kDIGITS)) ;         
+    tempo.ReplaceAll(Form("%d", AliQAv1::kHITS), AliQAv1::GetTaskName(AliQAv1::kHITS))         ;
+    tempo.ReplaceAll(Form("%d", AliQAv1::kSDIGITS), AliQAv1::GetTaskName(AliQAv1::kSDIGITS)) ; 
+    tempo.ReplaceAll(Form("%d", AliQAv1::kDIGITS), AliQAv1::GetTaskName(AliQAv1::kDIGITS)) ;   
        AliInfo( Form("QA will be done on \"%s\" for \"%s\"\n", fQADetectors.Data(), tempo.Data()) ) ;  
        fRunQA = kTRUE ;
-       fQASteer->SetActiveDetectors(fQADetectors) ; 
-       fQASteer->SetTasks(fQATasks) ; 
-  for (Int_t det = 0 ; det < AliQA::kNDET ; det++) 
-    fQASteer->SetWriteExpert(AliQA::DETECTORINDEX_t(det)) ;
+       AliQAManager::QAManager()->SetActiveDetectors(fQADetectors) ; 
+       AliQAManager::QAManager()->SetTasks(fQATasks) ; 
+  for (Int_t det = 0 ; det < AliQAv1::kNDET ; det++) 
+    AliQAManager::QAManager()->SetWriteExpert(AliQAv1::DETECTORINDEX_t(det)) ;
   
        return kTRUE; 
 } 
@@ -1860,7 +2206,7 @@ void AliSimulation::WriteGRPEntry()
   grpObj->SetTimeStart(0);
   grpObj->SetTimeEnd(9999);
 
-  const AliGenerator *gen = gAlice->Generator();
+  const AliGenerator *gen = gAlice->GetMCApp()->Generator();
   if (gen) {
     grpObj->SetBeamEnergy(gen->GetEnergyCMS());
     TString projectile;
@@ -1916,27 +2262,24 @@ void AliSimulation::WriteGRPEntry()
   grpObj->SetLHCState("STABLE_BEAMS");
   grpObj->SetLHCLuminosity(0,(AliGRPObject::Stats)0);
   grpObj->SetBeamIntensity(0,(AliGRPObject::Stats)0);
+  //
+  AliMagF *field = (AliMagF*)TGeoGlobalMagField::Instance()->GetField();
+  Float_t solenoidField = field ? TMath::Abs(field->SolenoidField()) : 0;
 
-  AliMagF *field = gAlice->Field();
-  Float_t solenoidField = TMath::Abs(field->SolenoidField());
-  Float_t factor = field->Factor();
-  Float_t l3current = TMath::Abs(factor)*solenoidField*30000./5.;
-  grpObj->SetL3Current(l3current,(AliGRPObject::Stats)0);
-  
-  if (factor > 0) {
-    grpObj->SetL3Polarity(0);
-    grpObj->SetDipolePolarity(0);
-  }
-  else {
-    grpObj->SetL3Polarity(1);
-    grpObj->SetDipolePolarity(1);
-  }
-
-  if (TMath::Abs(factor) != 0)
-    grpObj->SetDipoleCurrent(6000,(AliGRPObject::Stats)0);
-  else 
-    grpObj->SetDipoleCurrent(0,(AliGRPObject::Stats)0);
-
+  Float_t factorSol     = field ? field->GetFactorSol() : 0;
+  Float_t currentSol    = TMath::Abs(factorSol)>1E-6 ? 
+    TMath::Nint(TMath::Abs(solenoidField/factorSol))/5.*30000.*TMath::Abs(factorSol) : 0;
+  //
+  Float_t factorDip     = field ? field->GetFactorDip() : 0;
+  Float_t currentDip    = 6000.*TMath::Abs(factorDip);
+  //
+  grpObj->SetL3Current(currentSol,(AliGRPObject::Stats)0);
+  grpObj->SetDipoleCurrent(currentDip,(AliGRPObject::Stats)0);  
+  grpObj->SetL3Polarity(factorSol>0 ? 0:1);  
+  grpObj->SetDipolePolarity(factorDip>0 ? 0:1);
+  grpObj->SetUniformBMap(field->IsUniform());            // for special MC with k5kGUniform map
+  grpObj->SetPolarityConventionLHC();                    // LHC convention +/+ current -> -/- field main components
+  //
   grpObj->SetCavernTemperature(0,(AliGRPObject::Stats)0);
   
   //grpMap->Add(new TObjString("fCavernPressure"),new TObjString("0")); ---> not inserted in simulation with the new object, since it is now an AliDCSSensor