]> git.uio.no Git - u/mrichter/AliRoot.git/blobdiff - TOF/AliTOFClusterFinder.cxx
some coverity fixes
[u/mrichter/AliRoot.git] / TOF / AliTOFClusterFinder.cxx
index 48503ee7b3a85392d02f2cdeebb5838f2355e602..3cd99b50ecde72cc9da4957d0726919bb053e308 100644 (file)
@@ -129,13 +129,21 @@ Revision 0.01  2005/07/25 A. De Caro
 #include "AliTOFdigit.h"
 #include "AliTOFGeometry.h"
 #include "AliTOFrawData.h"
-#include "AliTOFRawStream.h"
+
+#include "AliTOFDeltaBCOffset.h"
+#include "AliTOFCTPLatency.h"
+#include "AliTOFRunParams.h"
 
 //extern TFile *gFile;
 
+using std::cout;
+using std::endl;
+using std::ofstream;
+using std::ios;
 ClassImp(AliTOFClusterFinder)
 
 AliTOFClusterFinder::AliTOFClusterFinder(AliTOFcalib *calib):
+  TTask("AliTOFClusterFinder",""),
   fRunLoader(0),
   fTOFLoader(0),
   fTreeD(0),
@@ -143,18 +151,31 @@ AliTOFClusterFinder::AliTOFClusterFinder(AliTOFcalib *calib):
   fDigits(new TClonesArray("AliTOFdigit", 4000)),
   fRecPoints(new TClonesArray("AliTOFcluster", 4000)),
   fNumberOfTofClusters(0),
+  fNumberOfTofTrgPads(0),
   fVerbose(0),
   fDecoderVersion(0),
-  fTOFcalib(calib)
+  fTOFcalib(calib),
+  fTOFRawStream(AliTOFRawStream())
 {
 //
 // Constructor
 //
 
+  for (Int_t ii=0; ii<kTofMaxCluster; ii++) fTofClusters[ii]=0x0;
+
+  TString validity = (TString)fTOFcalib->GetOfflineValidity();
+  if (validity.CompareTo("valid")==0) {
+    AliInfo(Form(" validity = %s - Using offline calibration parameters",validity.Data()));
+  } else {
+    AliInfo(Form(" validity = %s - Using online calibration parameters",validity.Data()));
+  }
+
 }
+
 //______________________________________________________________________________
 
 AliTOFClusterFinder::AliTOFClusterFinder(AliRunLoader* runLoader, AliTOFcalib *calib):
+  TTask("AliTOFClusterFinder",""),
   fRunLoader(runLoader),
   fTOFLoader(runLoader->GetLoader("TOFLoader")),
   fTreeD(0),
@@ -162,35 +183,46 @@ AliTOFClusterFinder::AliTOFClusterFinder(AliRunLoader* runLoader, AliTOFcalib *c
   fDigits(new TClonesArray("AliTOFdigit", 4000)),
   fRecPoints(new TClonesArray("AliTOFcluster", 4000)),
   fNumberOfTofClusters(0),
+  fNumberOfTofTrgPads(0),
   fVerbose(0),
   fDecoderVersion(0),
-  fTOFcalib(calib)
+  fTOFcalib(calib),
+  fTOFRawStream(AliTOFRawStream())
 {
 //
 // Constructor
 //
 
+  for (Int_t ii=0; ii<kTofMaxCluster; ii++) fTofClusters[ii]=0x0;
+
+  TString validity = (TString)fTOFcalib->GetOfflineValidity();
+  if (validity.CompareTo("valid")==0) {
+    AliInfo(Form(" validity = %s - Using offline calibration parameters",validity.Data()));
+  } else {
+    AliInfo(Form(" validity = %s - Using online calibration parameters",validity.Data()));
+  }
+
 }
 
 //------------------------------------------------------------------------
-AliTOFClusterFinder::AliTOFClusterFinder(const AliTOFClusterFinder &source)
-  :TObject(),
+AliTOFClusterFinder::AliTOFClusterFinder(const AliTOFClusterFinder &source) :
+  TTask(source),
   fRunLoader(0),
   fTOFLoader(0),
   fTreeD(0),
   fTreeR(0),
-  fDigits(new TClonesArray("AliTOFdigit", 4000)),
-  fRecPoints(new TClonesArray("AliTOFcluster", 4000)),
+  fDigits(source.fDigits),
+  fRecPoints(source.fRecPoints),
   fNumberOfTofClusters(0),
+  fNumberOfTofTrgPads(0),
   fVerbose(0),
-  fDecoderVersion(0),
-  fTOFcalib(0)
+  fDecoderVersion(source.fDecoderVersion),
+  fTOFcalib(source.fTOFcalib),
+  fTOFRawStream(source.fTOFRawStream)
 {
   // copy constructor
-  this->fDigits=source.fDigits;
-  this->fRecPoints=source.fRecPoints;
-  this->fDecoderVersion=source.fDecoderVersion;
-  this->fTOFcalib=source.fTOFcalib;
+
+  for (Int_t ii=0; ii<kTofMaxCluster; ii++) fTofClusters[ii]=source.fTofClusters[ii];
 
 }
 
@@ -198,11 +230,19 @@ AliTOFClusterFinder::AliTOFClusterFinder(const AliTOFClusterFinder &source)
 AliTOFClusterFinder& AliTOFClusterFinder::operator=(const AliTOFClusterFinder &source)
 {
   // ass. op.
-  this->fDigits=source.fDigits;
-  this->fRecPoints=source.fRecPoints;
-  this->fVerbose=source.fVerbose;
-  this->fDecoderVersion=source.fDecoderVersion;
-  this->fTOFcalib=source.fTOFcalib;
+
+  if (this == &source)
+    return *this;
+
+  TTask::operator=(source);  
+  fDigits=source.fDigits;
+  fRecPoints=source.fRecPoints;
+  fVerbose=source.fVerbose;
+  fDecoderVersion=source.fDecoderVersion;
+  fTOFcalib=source.fTOFcalib;
+  fTOFRawStream=source.fTOFRawStream;
+  for (Int_t ii=0; ii<kTofMaxCluster; ii++) fTofClusters[ii]=source.fTofClusters[ii];
+
   return *this;
 
 }
@@ -228,6 +268,17 @@ AliTOFClusterFinder::~AliTOFClusterFinder()
       fRecPoints=0;
     }
 
+  //if (fTofClusters || fNumberOfTofClusters) {
+  if (fNumberOfTofClusters) {
+    for (Int_t ii=0; ii<kTofMaxCluster; ii++) {
+      if (fTofClusters[ii]) fTofClusters[ii]->Delete();
+      delete fTofClusters[ii];
+    }
+    fNumberOfTofClusters=0;
+   }
+
+   fNumberOfTofTrgPads=0;
+
 }
 //______________________________________________________________________________
 
@@ -240,24 +291,19 @@ void AliTOFClusterFinder::Digits2RecPoints(Int_t iEvent)
   TStopwatch stopwatch;
   stopwatch.Start();
 
+  Int_t inholes = 0;
+
   fRunLoader->GetEvent(iEvent);
 
   fTreeD = fTOFLoader->TreeD();
-  if (fTreeD == 0x0)
-    {
-      AliFatal("AliTOFClusterFinder: Can not get TreeD");
-    }
-
-  TBranch *branch = fTreeD->GetBranch("TOF");
-  if (!branch) { 
-    AliError("can't get the branch with the TOF digits !");
+  if (fTreeD == 0x0) {
+    AliFatal("AliTOFClusterFinder: Can not get TreeD");
     return;
   }
 
-  TClonesArray staticdigits("AliTOFdigit",10000);
-  staticdigits.Clear();
-  TClonesArray *digits =&staticdigits;
-  branch->SetAddress(&digits);
+  fDigits->Clear();
+  fTreeD->GetBranch("TOF")->SetAutoDelete(kFALSE);
+  fTreeD->SetBranchAddress("TOF",&fDigits);
 
   ResetRecpoint();
 
@@ -272,28 +318,41 @@ void AliTOFClusterFinder::Digits2RecPoints(Int_t iEvent)
   fTreeR->Branch("TOF", &fRecPoints, bufsize);
 
   fTreeD->GetEvent(0);
-  Int_t nDigits = digits->GetEntriesFast();
+  Int_t nDigits = fDigits->GetEntriesFast();
   AliDebug(2,Form("Number of TOF digits: %d",nDigits));
 
   Int_t ii;
-  Int_t dig[5]; //cluster detector indeces
-  Int_t  parTOF[5]; //The TOF signal parameters
+  Int_t dig[5]={-1,-1,-1,-1,-1}; //cluster detector indeces
+  Int_t parTOF[7]={0,0,0,0,0,0,0}; //The TOF signal parameters
   Bool_t status=kTRUE; // assume all sim channels ok in the beginning...
   for (ii=0; ii<nDigits; ii++) {
-    AliTOFdigit *d = (AliTOFdigit*)digits->UncheckedAt(ii);
+    AliTOFdigit *d = (AliTOFdigit*)fDigits->UncheckedAt(ii);
     dig[0]=d->GetSector();
     dig[1]=d->GetPlate();
     dig[2]=d->GetStrip();
     dig[3]=d->GetPadz();
     dig[4]=d->GetPadx();
 
-    //    AliDebug(2,Form(" %2i  %1i  %2i  %1i  %2i ",dig[0],dig[1],dig[2],dig[3],dig[4]));
+    /* check valid index */
+    if (dig[0]==-1||dig[1]==-1||dig[2]==-1||dig[3]==-1||dig[4]==-1) continue;
+
+    // Do not reconstruct anything in the holes
+    if (dig[0]==13 || dig[0]==14 || dig[0]==15 ) { // sectors with holes
+      if (dig[1]==2) { // plate with holes
+       inholes++;
+       continue;
+      }
+    }
+
+    AliDebug(2,Form(" %2d  %1d  %2d  %1d  %2d ",dig[0],dig[1],dig[2],dig[3],dig[4]));
 
     parTOF[0] = d->GetTdc(); //the TDC signal
     parTOF[1] = d->GetToT(); //the ToT signal
     parTOF[2] = d->GetAdc(); // the adc charge
     parTOF[3] = d->GetTdcND(); // non decalibrated sim time
     parTOF[4] = d->GetTdc(); // raw time, == Tdc time for the moment
+    parTOF[5] = 0; // deltaBC
+    parTOF[6] = 0; // L0-L1 latency
     Double_t posClus[3];
     Double_t covClus[6];
     UShort_t volIdClus=GetClusterVolIndex(dig);
@@ -303,19 +362,20 @@ void AliTOFClusterFinder::Digits2RecPoints(Int_t iEvent)
 
   }
 
-  AliInfo(Form("Number of found clusters: %i for event: %i", fNumberOfTofClusters, iEvent));
+  AliDebug(1,Form("Number of found clusters: %d for event: %d", fNumberOfTofClusters, iEvent));
 
   CalibrateRecPoint();
   FillRecPoint();
 
   fTreeR->Fill();
-  ResetRecpoint();
+//  ResetRecpoint();
 
   fTOFLoader = fRunLoader->GetLoader("TOFLoader");  
   fTOFLoader->WriteRecPoints("OVERWRITE");
 
-  AliInfo(Form("Execution time to read TOF digits and to write TOF clusters : R:%.4fs C:%.4fs",
-              stopwatch.RealTime(),stopwatch.CpuTime()));
+  AliDebug(1,Form("Execution time to read TOF digits and to write TOF clusters : R:%.4fs C:%.4fs",
+                 stopwatch.RealTime(),stopwatch.CpuTime()));
+  if (inholes) AliWarning(Form("Clusters in the TOF holes: %d",inholes));
 
 }
 
@@ -330,73 +390,78 @@ void AliTOFClusterFinder::Digits2RecPoints(TTree* digitsTree, TTree* clusterTree
   TStopwatch stopwatch;
   stopwatch.Start();
 
-  ///  fRunLoader->GetEvent(iEvent);
+  Int_t inholes = 0;
 
-  if (digitsTree == 0x0)
-    {
-      AliFatal("AliTOFClusterFinder: Can not get TreeD");
-    }
-
-  TBranch *branch = digitsTree->GetBranch("TOF");
-  if (!branch) { 
-    AliError("can't get the branch with the TOF digits !");
+  if (digitsTree == 0x0) {
+    AliFatal("AliTOFClusterFinder: Can not get TreeD");
     return;
   }
 
-  TClonesArray staticdigits("AliTOFdigit",10000);
-  staticdigits.Clear();
-  TClonesArray *digits = & staticdigits;
-  branch->SetAddress(&digits);
+  fDigits->Clear();
+  digitsTree->GetBranch("TOF")->SetAutoDelete(kFALSE);
+  digitsTree->SetBranchAddress("TOF",&fDigits);
 
   ResetRecpoint();
-
-  fTreeR=clusterTree;
   Int_t bufsize = 32000;
-  fTreeR->Branch("TOF", &fRecPoints, bufsize);
+  clusterTree->Branch("TOF", &fRecPoints, bufsize);
 
   digitsTree->GetEvent(0);
-  Int_t nDigits = digits->GetEntriesFast();
+  Int_t nDigits = fDigits->GetEntriesFast();
   AliDebug(2,Form("Number of TOF digits: %d",nDigits));
 
   Int_t ii;
-  Int_t dig[5]; //cluster detector indeces
-  Int_t  parTOF[5]; //The TOF signal parameters
+  Int_t dig[5]={-1,-1,-1,-1,-1}; //cluster detector indeces
+  Int_t parTOF[7]={0,0,0,0,0,0,0}; //The TOF signal parameters
   Bool_t status=kTRUE; // assume all sim channels ok in the beginning...
   for (ii=0; ii<nDigits; ii++) {
-    AliTOFdigit *d = (AliTOFdigit*)digits->UncheckedAt(ii);
+    AliTOFdigit *d = (AliTOFdigit*)fDigits->UncheckedAt(ii);
     dig[0]=d->GetSector();
     dig[1]=d->GetPlate();
     dig[2]=d->GetStrip();
     dig[3]=d->GetPadz();
     dig[4]=d->GetPadx();
 
-    //    AliDebug(2,Form(" %2i  %1i  %2i  %1i  %2i ",dig[0],dig[1],dig[2],dig[3],dig[4]));
+    /* check valid index */
+    if (dig[0]==-1||dig[1]==-1||dig[2]==-1||dig[3]==-1||dig[4]==-1) continue;
+
+    // Do not reconstruct anything in the holes
+    if (dig[0]==13 || dig[0]==14 || dig[0]==15 ) { // sectors with holes
+      if (dig[1]==2) { // plate with holes
+       inholes++;
+       continue;
+      }
+    }
+
+    //    AliDebug(2,Form(" %2d  %1d  %2d  %1d  %2d ",dig[0],dig[1],dig[2],dig[3],dig[4]));
 
     parTOF[0] = d->GetTdc(); //the TDC signal
     parTOF[1] = d->GetToT(); //the ToT signal
     parTOF[2] = d->GetAdc(); // the adc charge
     parTOF[3] = d->GetTdcND(); // non decalibrated sim time
     parTOF[4] = d->GetTdc(); // raw time, == Tdc time for the moment
+    parTOF[5] = 0; // deltaBC
+    parTOF[6] = 0; // L0-L1 latency
     
     Double_t posClus[3];
     Double_t covClus[6];
     UShort_t volIdClus=GetClusterVolIndex(dig);
     GetClusterPars(dig,posClus,covClus);
-   AliTOFcluster *tofCluster = new AliTOFcluster(volIdClus,posClus[0],posClus[1],posClus[2],covClus[0],covClus[1],covClus[2],covClus[3],covClus[4],covClus[5],d->GetTracks(),dig,parTOF,status,ii);
+    AliTOFcluster *tofCluster = new AliTOFcluster(volIdClus,posClus[0],posClus[1],posClus[2],covClus[0],covClus[1],covClus[2],covClus[3],covClus[4],covClus[5],d->GetTracks(),dig,parTOF,status,ii);
     InsertCluster(tofCluster);
 
   }
 
-  AliInfo(Form("Number of found clusters: %i", fNumberOfTofClusters));
+  AliDebug(1,Form("Number of found clusters: %d", fNumberOfTofClusters));
 
   CalibrateRecPoint();
   FillRecPoint();
 
   clusterTree->Fill();
-  ResetRecpoint();
+//  ResetRecpoint();
 
-  AliInfo(Form("Execution time to read TOF digits and to write TOF clusters : R:%.4fs C:%.4fs",
-              stopwatch.RealTime(),stopwatch.CpuTime()));
+  AliDebug(1,Form("Execution time to read TOF digits and to write TOF clusters : R:%.4fs C:%.4fs",
+                 stopwatch.RealTime(),stopwatch.CpuTime()));
+  if (inholes) AliWarning(Form("Clusters in the TOF holes: %d",inholes));
 
 }
 //______________________________________________________________________________
@@ -411,7 +476,8 @@ void AliTOFClusterFinder::Digits2RecPoints(AliRawReader *rawReader,
   TStopwatch stopwatch;
   stopwatch.Start();
 
-  //const Int_t kDDL = fTOFGeometry->NDDL()*fTOFGeometry->NSectors();
+  Int_t inholes = 0;
+
   const Int_t kDDL = AliDAQ::NumberOfDdls("TOF");
 
   ResetRecpoint();
@@ -420,28 +486,42 @@ void AliTOFClusterFinder::Digits2RecPoints(AliRawReader *rawReader,
   clustersTree->Branch("TOF", &fRecPoints, bufsize);
 
   TClonesArray * clonesRawData;
-
   Int_t dummy = -1;
 
-  Int_t detectorIndex[5];
-  Int_t parTOF[5];
+  Int_t detectorIndex[5]={-1,-1,-1,-1,-1};
+  Int_t parTOF[7]={-1,-1,-1,-1,-1,-1,-1};
 
   ofstream ftxt;
   if (fVerbose==2) ftxt.open("TOFdigitsRead.txt",ios::app);
 
-  AliTOFRawStream tofInput(rawReader);
+  fTOFRawStream.Clear();
+  fTOFRawStream.SetRawReader(rawReader);
+
+  if (fDecoderVersion == 1) {
+    AliInfo("Using New Decoder");
+  }
+  else if (fDecoderVersion == 2) {
+    AliInfo("Using Enhanced Decoder");
+  }
+  else {
+    AliInfo("Using Old Decoder");
+  }
 
   Int_t indexDDL = 0;
   for (indexDDL = 0; indexDDL < kDDL; indexDDL++) {
 
     rawReader->Reset();
-    if (fDecoderVersion) {
-      AliInfo("Using New Decoder \n"); 
-      tofInput.LoadRawDataBuffers(indexDDL,fVerbose);
+    if (fDecoderVersion == 1) {
+      fTOFRawStream.LoadRawDataBuffers(indexDDL,fVerbose);
     }
-    else tofInput.LoadRawData(indexDDL);
-
-    clonesRawData = (TClonesArray*)tofInput.GetRawData();
+    else if (fDecoderVersion == 2) {
+      fTOFRawStream.LoadRawDataBuffersV2(indexDDL,fVerbose);
+    }
+    else  {
+      fTOFRawStream.LoadRawData(indexDDL);
+    }
+    
+    clonesRawData = (TClonesArray*)fTOFRawStream.GetRawData();
 
     for (Int_t iRawData = 0; iRawData<clonesRawData->GetEntriesFast(); iRawData++) {
 
@@ -461,8 +541,13 @@ void AliTOFClusterFinder::Digits2RecPoints(AliRawReader *rawReader,
        ftxt << "  " << tofRawDatum->GetTDCchannel();
       }
 
-      tofInput.EquipmentId2VolumeId(indexDDL, tofRawDatum->GetTRM(), tofRawDatum->GetTRMchain(),
-                                   tofRawDatum->GetTDC(), tofRawDatum->GetTDCchannel(), detectorIndex);
+      if ( tofRawDatum->GetTRM()==3 &&
+         (tofRawDatum->GetTDC()> 11 && tofRawDatum->GetTDC()< 15) ) FillTOFtriggerMap(indexDDL, tofRawDatum);
+
+      for (Int_t aa=0; aa<5; aa++) detectorIndex[aa] = -1;
+
+      fTOFRawStream.EquipmentId2VolumeId(indexDDL, tofRawDatum->GetTRM(), tofRawDatum->GetTRMchain(),
+                                        tofRawDatum->GetTDC(), tofRawDatum->GetTDCchannel(), detectorIndex);
       dummy = detectorIndex[3];
       detectorIndex[3] = detectorIndex[4];
       detectorIndex[4] = dummy;
@@ -478,18 +563,31 @@ void AliTOFClusterFinder::Digits2RecPoints(AliRawReader *rawReader,
        else              ftxt << " " << detectorIndex[4];
       }
 
+    /* check valid index */
+    if (detectorIndex[0]==-1||detectorIndex[1]==-1||detectorIndex[2]==-1||detectorIndex[3]==-1||detectorIndex[4]==-1) continue;
+
+      // Do not reconstruct anything in the holes
+      if (detectorIndex[0]==13 || detectorIndex[0]==14 || detectorIndex[0]==15 ) { // sectors with holes
+       if (detectorIndex[1]==2) { // plate with holes
+         inholes++;
+         continue;
+       }
+      }
+
       parTOF[0] = tofRawDatum->GetTOF(); //TDC
       parTOF[1] = tofRawDatum->GetTOT(); // TOT
       parTOF[2] = tofRawDatum->GetTOT(); //ADC==TOF
-      parTOF[3] = -1;//raw data: no track of undecalib sim time
+      parTOF[3] = 0;//raw data: no track of undecalib sim time
       parTOF[4] = tofRawDatum->GetTOF(); // RAW time
+      parTOF[5] = tofRawDatum->GetDeltaBC(); // deltaBC
+      parTOF[6] = tofRawDatum->GetL0L1Latency(); // L0-L1 latency
       Double_t posClus[3];
       Double_t covClus[6];
       UShort_t volIdClus=GetClusterVolIndex(detectorIndex);
       Int_t lab[3]={-1,-1,-1};
       Bool_t status=kTRUE;
       GetClusterPars(detectorIndex,posClus,covClus);
-     AliTOFcluster *tofCluster = new AliTOFcluster(volIdClus,posClus[0],posClus[1],posClus[2],covClus[0],covClus[1],covClus[2],covClus[3],covClus[4],covClus[5],lab,detectorIndex,parTOF,status,-1);
+      AliTOFcluster *tofCluster = new AliTOFcluster(volIdClus,posClus[0],posClus[1],posClus[2],covClus[0],covClus[1],covClus[2],covClus[3],covClus[4],covClus[5],lab,detectorIndex,parTOF,status,-1);
       InsertCluster(tofCluster);
 
       if (fVerbose==2) {
@@ -499,28 +597,29 @@ void AliTOFClusterFinder::Digits2RecPoints(AliRawReader *rawReader,
        if (parTOF[0]<10) ftxt << "      " << parTOF[0] << endl;
        else if (parTOF[0]>=10 && parTOF[0]<100)   ftxt << "    " << parTOF[0] << endl;
        else if (parTOF[0]>=100 && parTOF[0]<1000) ftxt << "    " << parTOF[0] << endl;
-       else ftxt << "   " << parTOF[3] << endl;
+       else ftxt << "   " << parTOF[0] << endl;
       }
 
     } // closed loop on TOF raw data per current DDL file
 
-    clonesRawData->Clear();
+    clonesRawData->Clear("C");
 
   } // closed loop on DDL index
 
   if (fVerbose==2) ftxt.close();
 
-  AliInfo(Form("Number of found clusters: %i", fNumberOfTofClusters));
+  AliDebug(1,Form("Number of found clusters: %d", fNumberOfTofClusters));
 
-  CalibrateRecPoint();
+  CalibrateRecPoint(rawReader->GetTimestamp());
   FillRecPoint();
 
   clustersTree->Fill();
 
-  ResetRecpoint();
+//  ResetRecpoint();
 
   AliDebug(1, Form("Execution time to read TOF raw data and to write TOF clusters : R:%.4fs C:%.4fs",
                   stopwatch.RealTime(),stopwatch.CpuTime()));
+  if (inholes) AliWarning(Form("Clusters in the TOF holes: %d",inholes));
 
 }
 //______________________________________________________________________________
@@ -534,12 +633,13 @@ void AliTOFClusterFinder::Digits2RecPoints(Int_t iEvent, AliRawReader *rawReader
   TStopwatch stopwatch;
   stopwatch.Start();
 
-  //const Int_t kDDL = fTOFGeometry->NDDL()*fTOFGeometry->NSectors();
+  Int_t inholes = 0;
+
   const Int_t kDDL = AliDAQ::NumberOfDdls("TOF");
 
   fRunLoader->GetEvent(iEvent);
 
-  AliDebug(2,Form(" Event number %2i ", iEvent));
+  AliDebug(2,Form(" Event number %2d ", iEvent));
 
   fTreeR = fTOFLoader->TreeR();
 
@@ -556,23 +656,38 @@ void AliTOFClusterFinder::Digits2RecPoints(Int_t iEvent, AliRawReader *rawReader
   Int_t dummy = -1;
 
   Int_t detectorIndex[5] = {-1, -1, -1, -1, -1};
-  Int_t parTOF[5];
+  Int_t parTOF[7];
   ofstream ftxt;
   if (fVerbose==2) ftxt.open("TOFdigitsRead.txt",ios::app);
 
-  AliTOFRawStream tofInput(rawReader);
+  fTOFRawStream.Clear();
+  fTOFRawStream.SetRawReader(rawReader);
+
+  if (fDecoderVersion == 1) {
+    AliInfo("Using New Decoder");
+  }
+  else if (fDecoderVersion == 2) {
+    AliInfo("Using Enhanced Decoder");
+  }
+  else {
+    AliInfo("Using Old Decoder");
+  }
 
   Int_t indexDDL = 0;
   for (indexDDL = 0; indexDDL < kDDL; indexDDL++) {
 
     rawReader->Reset();
-    if (fDecoderVersion) {
-      AliInfo("Using New Decoder \n"); 
-      tofInput.LoadRawDataBuffers(indexDDL,fVerbose);
+    if (fDecoderVersion == 1) {
+      fTOFRawStream.LoadRawDataBuffers(indexDDL,fVerbose);
+    }
+    else if (fDecoderVersion == 2) {
+      fTOFRawStream.LoadRawDataBuffersV2(indexDDL,fVerbose);
+    }
+    else {
+      fTOFRawStream.LoadRawData(indexDDL);
     }
-    else tofInput.LoadRawData(indexDDL);
 
-    clonesRawData = (TClonesArray*)tofInput.GetRawData();
+    clonesRawData = (TClonesArray*)fTOFRawStream.GetRawData();
 
     for (Int_t iRawData = 0; iRawData<clonesRawData->GetEntriesFast(); iRawData++) {
 
@@ -592,8 +707,8 @@ void AliTOFClusterFinder::Digits2RecPoints(Int_t iEvent, AliRawReader *rawReader
        ftxt << "  " << tofRawDatum->GetTDCchannel();
       }
 
-      tofInput.EquipmentId2VolumeId(indexDDL, tofRawDatum->GetTRM(), tofRawDatum->GetTRMchain(),
-                                   tofRawDatum->GetTDC(), tofRawDatum->GetTDCchannel(), detectorIndex);
+      fTOFRawStream.EquipmentId2VolumeId(indexDDL, tofRawDatum->GetTRM(), tofRawDatum->GetTRMchain(),
+                                        tofRawDatum->GetTDC(), tofRawDatum->GetTDCchannel(), detectorIndex);
       dummy = detectorIndex[3];
       detectorIndex[3] = detectorIndex[4];
       detectorIndex[4] = dummy;
@@ -609,11 +724,24 @@ void AliTOFClusterFinder::Digits2RecPoints(Int_t iEvent, AliRawReader *rawReader
        else              ftxt << " " << detectorIndex[4];
       }
 
+    /* check valid index */
+    if (detectorIndex[0]==-1||detectorIndex[1]==-1||detectorIndex[2]==-1||detectorIndex[3]==-1||detectorIndex[4]==-1) continue;
+
+      // Do not reconstruct anything in the holes
+      if (detectorIndex[0]==13 || detectorIndex[0]==14 || detectorIndex[0]==15 ) { // sectors with holes
+       if (detectorIndex[1]==2) { // plate with holes
+         inholes++;
+         continue;
+       }
+      }
+
       parTOF[0] = tofRawDatum->GetTOF(); // TDC
       parTOF[1] = tofRawDatum->GetTOT(); // TOT
       parTOF[2] = tofRawDatum->GetTOT(); // raw data have ADC=TOT
-      parTOF[3] = -1; //raw data: no track of the undecalib sim time
+      parTOF[3] = 0; //raw data: no track of the undecalib sim time
       parTOF[4] = tofRawDatum->GetTOF(); // Raw time == TDC
+      parTOF[5] = tofRawDatum->GetDeltaBC(); // deltaBC
+      parTOF[6] = tofRawDatum->GetL0L1Latency(); // L0-L1 latency
       Double_t posClus[3];
       Double_t covClus[6];
       UShort_t volIdClus=GetClusterVolIndex(detectorIndex);
@@ -630,30 +758,31 @@ void AliTOFClusterFinder::Digits2RecPoints(Int_t iEvent, AliRawReader *rawReader
        if (parTOF[0]<10) ftxt << "      " << parTOF[0] << endl;
        else if (parTOF[0]>=10 && parTOF[0]<100)   ftxt << "    " << parTOF[0] << endl;
        else if (parTOF[0]>=100 && parTOF[0]<1000) ftxt << "    " << parTOF[0] << endl;
-       else ftxt << "   " << parTOF[3] << endl;
+       else ftxt << "   " << parTOF[0] << endl;
       }
 
     } // closed loop on TOF raw data per current DDL file
 
-    clonesRawData->Clear();
+    clonesRawData->Clear("C");
 
   } // closed loop on DDL index
 
   if (fVerbose==2) ftxt.close();
 
-  AliInfo(Form("Number of found clusters: %i for event: %i", fNumberOfTofClusters, iEvent));
+  AliDebug(1,Form("Number of found clusters: %d for event: %d", fNumberOfTofClusters, iEvent));
 
-  CalibrateRecPoint();
+  CalibrateRecPoint(rawReader->GetTimestamp());
   FillRecPoint();
 
   fTreeR->Fill();
-  ResetRecpoint();
+//  ResetRecpoint();
 
   fTOFLoader = fRunLoader->GetLoader("TOFLoader");
   fTOFLoader->WriteRecPoints("OVERWRITE");
   
   AliDebug(1, Form("Execution time to read TOF raw data and to write TOF clusters : R:%.4fs C:%.4fs",
               stopwatch.RealTime(),stopwatch.CpuTime()));
+  if (inholes) AliWarning(Form("Clusters in the TOF holes: %d",inholes));
 
 }
 //______________________________________________________________________________
@@ -669,7 +798,6 @@ void AliTOFClusterFinder::Raw2Digits(Int_t iEvent, AliRawReader *rawReader)
   TStopwatch stopwatch;
   stopwatch.Start();
 
-  //const Int_t kDDL = fTOFGeometry->NDDL()*fTOFGeometry->NSectors();
   const Int_t kDDL = AliTOFGeometry::NDDL()*AliTOFGeometry::NSectors();
 
   fRunLoader->GetEvent(iEvent);
@@ -682,14 +810,18 @@ void AliTOFClusterFinder::Raw2Digits(Int_t iEvent, AliRawReader *rawReader)
     fTOFLoader->MakeTree("D");
     fTreeD = fTOFLoader->TreeD();
     }
+  else {
+    AliFatal("Can not get TreeD");
+    return;
+  }
 
-  TClonesArray *tofDigits = new TClonesArray("AliTOFdigit",10000);
   Int_t bufsize = 32000;
-  fTreeD->Branch("TOF", &tofDigits, bufsize);
+  fDigits->Clear();
+  fTreeD->Branch("TOF", &fDigits, bufsize);
 
   fRunLoader->GetEvent(iEvent);
 
-  AliDebug(2,Form(" Event number %2i ", iEvent));
+  AliDebug(2,Form(" Event number %2d ", iEvent));
 
   TClonesArray * clonesRawData;
 
@@ -698,46 +830,62 @@ void AliTOFClusterFinder::Raw2Digits(Int_t iEvent, AliRawReader *rawReader)
   Int_t detectorIndex[5];
   Int_t digit[4];
 
-  AliTOFRawStream tofInput(rawReader);
+  fTOFRawStream.Clear();
+  fTOFRawStream.SetRawReader(rawReader);
+
+  if (fDecoderVersion == 1) {
+    AliInfo("Using New Decoder");
+  }
+  else if (fDecoderVersion == 2) {
+    AliInfo("Using Enhanced Decoder");
+  }
+  else {
+    AliInfo("Using Old Decoder");
+  }
 
   Int_t indexDDL = 0;
   for (indexDDL = 0; indexDDL < kDDL; indexDDL++) {
 
     rawReader->Reset();
-    if (fDecoderVersion) {
-      AliInfo("Using New Decoder \n"); 
-      tofInput.LoadRawDataBuffers(indexDDL,fVerbose);
+    if (fDecoderVersion == 1) {
+      fTOFRawStream.LoadRawDataBuffers(indexDDL,fVerbose);
+    }
+    else if (fDecoderVersion == 2) {
+      fTOFRawStream.LoadRawDataBuffersV2(indexDDL,fVerbose);
+    }
+    else {
+      fTOFRawStream.LoadRawData(indexDDL);
     }
-    else tofInput.LoadRawData(indexDDL);
 
-    clonesRawData = (TClonesArray*)tofInput.GetRawData();
+    clonesRawData = (TClonesArray*)fTOFRawStream.GetRawData();
 
     for (Int_t iRawData = 0; iRawData<clonesRawData->GetEntriesFast(); iRawData++) {
 
       AliTOFrawData *tofRawDatum = (AliTOFrawData*)clonesRawData->UncheckedAt(iRawData);
 
-      if (!tofRawDatum->GetTOT() || !tofRawDatum->GetTOF()) continue;
+      //if (!tofRawDatum->GetTOT() || !tofRawDatum->GetTOF()) continue;
+      if (tofRawDatum->GetTOF()==-1) continue;
 
-      tofInput.EquipmentId2VolumeId(indexDDL, tofRawDatum->GetTRM(), tofRawDatum->GetTRMchain(),
-                                   tofRawDatum->GetTDC(), tofRawDatum->GetTDCchannel(), detectorIndex);
+      fTOFRawStream.EquipmentId2VolumeId(indexDDL, tofRawDatum->GetTRM(), tofRawDatum->GetTRMchain(),
+                                        tofRawDatum->GetTDC(), tofRawDatum->GetTDCchannel(), detectorIndex);
       dummy = detectorIndex[3];
       detectorIndex[3] = detectorIndex[4];
       detectorIndex[4] = dummy;
 
-      digit[0] = tofInput.GetTofBin();
-      digit[1] = tofInput.GetToTbin();
-      digit[2] = tofInput.GetToTbin();
-      digit[3] = -1;
+      digit[0] = fTOFRawStream.GetTofBin();
+      digit[1] = fTOFRawStream.GetToTbin();
+      digit[2] = fTOFRawStream.GetToTbin();
+      digit[3] = 0;
 
       Int_t tracknum[3]={-1,-1,-1};
 
-      TClonesArray &aDigits = *tofDigits;
-      Int_t last=tofDigits->GetEntriesFast();
+      TClonesArray &aDigits = *fDigits;
+      Int_t last=fDigits->GetEntriesFast();
       new (aDigits[last]) AliTOFdigit(tracknum, detectorIndex, digit);
 
     } // while loop
 
-    clonesRawData->Clear();
+    clonesRawData->Clear("C");
 
   } // DDL Loop
 
@@ -745,7 +893,7 @@ void AliTOFClusterFinder::Raw2Digits(Int_t iEvent, AliRawReader *rawReader)
 
   fTOFLoader = fRunLoader->GetLoader("TOFLoader");
   fTOFLoader->WriteDigits("OVERWRITE");
-  
+
   AliDebug(1, Form("Execution time to read TOF raw data and to write TOF clusters : R:%.2fs C:%.2fs",
                   stopwatch.RealTime(),stopwatch.CpuTime()));
 
@@ -771,67 +919,77 @@ void AliTOFClusterFinder::Raw2Digits(AliRawReader *rawReader, TTree* digitsTree)
     return;
     }
 
-  TClonesArray *tofDigits = new TClonesArray("AliTOFdigit",10000);
   Int_t bufsize = 32000;
-  digitsTree->Branch("TOF", &tofDigits, bufsize);
-
-  ///  fRunLoader->GetEvent(iEvent);
-
-  ///  AliDebug(2,Form(" Event number %2i ", iEvent));
+  digitsTree->Branch("TOF", &fDigits, bufsize);
 
   TClonesArray * clonesRawData;
-
   Int_t dummy = -1;
 
   Int_t detectorIndex[5];
   Int_t digit[4];
 
-  AliTOFRawStream tofInput(rawReader);
+  fTOFRawStream.Clear();
+  fTOFRawStream.SetRawReader(rawReader);
+
+  if (fDecoderVersion == 1) {
+    AliInfo("Using New Decoder");
+  }
+  else if (fDecoderVersion == 2) {
+    AliInfo("Using Enhanced Decoder");
+  }
+  else {
+    AliInfo("Using Old Decoder");
+  }
 
   Int_t indexDDL = 0;
   for (indexDDL = 0; indexDDL < kDDL; indexDDL++) {
 
     rawReader->Reset();
-    if (fDecoderVersion) {
-      AliInfo("Using New Decoder \n"); 
-      tofInput.LoadRawDataBuffers(indexDDL,fVerbose);
+    if (fDecoderVersion == 1) {
+      fTOFRawStream.LoadRawDataBuffers(indexDDL,fVerbose);
+    }
+    else if (fDecoderVersion == 2) {
+      fTOFRawStream.LoadRawDataBuffersV2(indexDDL,fVerbose);
+    }
+    else {
+      fTOFRawStream.LoadRawData(indexDDL);
     }
-    else tofInput.LoadRawData(indexDDL);
 
-    clonesRawData = (TClonesArray*)tofInput.GetRawData();
+    clonesRawData = (TClonesArray*)fTOFRawStream.GetRawData();
 
     for (Int_t iRawData = 0; iRawData<clonesRawData->GetEntriesFast(); iRawData++) {
 
       AliTOFrawData *tofRawDatum = (AliTOFrawData*)clonesRawData->UncheckedAt(iRawData);
 
-      if (!tofRawDatum->GetTOT() || !tofRawDatum->GetTOF()) continue;
+      //if (!tofRawDatum->GetTOT() || !tofRawDatum->GetTOF()) continue;
+      if (tofRawDatum->GetTOF()==-1) continue;
 
-      tofInput.EquipmentId2VolumeId(indexDDL, tofRawDatum->GetTRM(), tofRawDatum->GetTRMchain(),
-                                   tofRawDatum->GetTDC(), tofRawDatum->GetTDCchannel(), detectorIndex);
+      fTOFRawStream.EquipmentId2VolumeId(indexDDL, tofRawDatum->GetTRM(), tofRawDatum->GetTRMchain(),
+                                        tofRawDatum->GetTDC(), tofRawDatum->GetTDCchannel(), detectorIndex);
       dummy = detectorIndex[3];
       detectorIndex[3] = detectorIndex[4];
       detectorIndex[4] = dummy;
 
-      digit[0] = tofInput.GetTofBin();
-      digit[1] = tofInput.GetToTbin();
-      digit[2] = tofInput.GetToTbin();
-      digit[3] = -1;
+      digit[0] = fTOFRawStream.GetTofBin();
+      digit[1] = fTOFRawStream.GetToTbin();
+      digit[2] = fTOFRawStream.GetToTbin();
+      digit[3] = 0;
 
       Int_t tracknum[3]={-1,-1,-1};
 
-      TClonesArray &aDigits = *tofDigits;
-      Int_t last=tofDigits->GetEntriesFast();
+      TClonesArray &aDigits = *fDigits;
+      Int_t last=fDigits->GetEntriesFast();
       new (aDigits[last]) AliTOFdigit(tracknum, detectorIndex, digit);
 
     } // while loop
 
-    clonesRawData->Clear();
+    clonesRawData->Clear("C");
 
   } // DDL Loop
 
   digitsTree->Fill();
 
-  AliDebug(1, Form("Got %d digits: ", tofDigits->GetEntries()));
+  AliDebug(1, Form("Got %d digits: ", fDigits->GetEntries()));
   AliDebug(1, Form("Execution time to read TOF raw data and fill TOF digit tree : R:%.2fs C:%.2fs",
                   stopwatch.RealTime(),stopwatch.CpuTime()));
 
@@ -891,7 +1049,7 @@ void AliTOFClusterFinder::FillRecPoint()
   Int_t ii, jj;
 
   Int_t detectorIndex[5];
-  Int_t parTOF[5];
+  Int_t parTOF[7];
   Int_t trackLabels[3];
   Int_t digitIndex = -1;
   Bool_t status=kTRUE;
@@ -899,28 +1057,51 @@ void AliTOFClusterFinder::FillRecPoint()
   TClonesArray &lRecPoints = *fRecPoints;
   
   for (ii=0; ii<fNumberOfTofClusters; ii++) {
-
-    digitIndex = fTofClusters[ii]->GetIndex();
-    for(jj=0; jj<5; jj++) detectorIndex[jj] = fTofClusters[ii]->GetDetInd(jj);
-    for(jj=0; jj<3; jj++) trackLabels[jj] = fTofClusters[ii]->GetLabel(jj);
-    parTOF[0] = fTofClusters[ii]->GetTDC(); // TDC
-    parTOF[1] = fTofClusters[ii]->GetToT(); // TOT
-    parTOF[2] = fTofClusters[ii]->GetADC(); // ADC=TOT
-    parTOF[3] = fTofClusters[ii]->GetTDCND(); // TDCND
-    parTOF[4] = fTofClusters[ii]->GetTDCRAW();//RAW
-    status=fTofClusters[ii]->GetStatus();
+    AliTOFcluster* clOr = fTofClusters[ii];
+    fTofClusters[ii] = 0;
+    digitIndex = clOr->GetIndex();
+    for(jj=0; jj<5; jj++) detectorIndex[jj] = clOr->GetDetInd(jj);
+    for(jj=0; jj<3; jj++) trackLabels[jj] = clOr->GetLabel(jj);
+    parTOF[0] = clOr->GetTDC(); // TDC
+    parTOF[1] = clOr->GetToT(); // TOT
+    parTOF[2] = clOr->GetADC(); // ADC=TOT
+    parTOF[3] = clOr->GetTDCND(); // TDCND
+    parTOF[4] = clOr->GetTDCRAW();//RAW
+    parTOF[5] = clOr->GetDeltaBC();//deltaBC
+    parTOF[6] = clOr->GetL0L1Latency();//L0-L1 latency
+    status=clOr->GetStatus();
     Double_t posClus[3];
     Double_t covClus[6];
     UShort_t volIdClus=GetClusterVolIndex(detectorIndex);
     GetClusterPars(detectorIndex,posClus,covClus);
     new(lRecPoints[ii]) AliTOFcluster(volIdClus,posClus[0],posClus[1],posClus[2],covClus[0],covClus[1],covClus[2],covClus[3],covClus[4],covClus[5],trackLabels,detectorIndex, parTOF,status,digitIndex);
 
+    AliDebug(2, Form(" %4d  %4d  %f %f %f  %f %f %f %f %f %f  %3d %3d %3d  %2d %1d %2d %1d %2d  %4d %3d %3d %4d %4d  %1d  %4d", 
+                    ii, volIdClus, posClus[0], posClus[1], posClus[2],
+                    clOr->GetSigmaX2(),
+                    clOr->GetSigmaXY(),
+                    clOr->GetSigmaXZ(),
+                    clOr->GetSigmaY2(),
+                    clOr->GetSigmaYZ(),
+                    clOr->GetSigmaZ2(),
+                    trackLabels[0], trackLabels[1], trackLabels[2],
+                    detectorIndex[0], detectorIndex[1], detectorIndex[2], detectorIndex[3], detectorIndex[4],
+                    parTOF[0], parTOF[1], parTOF[2], parTOF[3], parTOF[4],
+                    status, digitIndex));
+
+    delete clOr;
   } // loop on clusters
 
 }
 
 //_________________________________________________________________________
-void AliTOFClusterFinder::CalibrateRecPoint()
+
+/*
+ * OLD CALIBRATE REC POINTS FUNCTION
+ */
+
+#if 0
+void AliTOFClusterFinder::CalibrateRecPoint(UInt_t timestamp)
 {
   //
   // Copy the global array of AliTOFcluster, i.e. fTofClusters (sorted
@@ -935,22 +1116,30 @@ void AliTOFClusterFinder::CalibrateRecPoint()
   Double_t tToT;
   Double_t timeCorr;
   Int_t   tdcCorr;
-  AliInfo(" Calibrating TOF Clusters: ")
-  
+  Float_t tdcLatencyWindow;
+  AliDebug(1," Calibrating TOF Clusters");
+
   AliTOFChannelOnlineArray *calDelay = fTOFcalib->GetTOFOnlineDelay();  
   AliTOFChannelOnlineStatusArray *calStatus = fTOFcalib->GetTOFOnlineStatus();  
   TObjArray *calTOFArrayOffline = fTOFcalib->GetTOFCalArrayOffline();
+  
+  AliTOFDeltaBCOffset *deltaBCOffsetObj = fTOFcalib->GetDeltaBCOffset();
+  Int_t deltaBCOffset = deltaBCOffsetObj->GetDeltaBCOffset();
+  AliTOFCTPLatency *ctpLatencyObj = fTOFcalib->GetCTPLatency();
+  Float_t ctpLatency = ctpLatencyObj->GetCTPLatency();
+  AliTOFRunParams *runParamsObj = fTOFcalib->GetRunParams();
+  Float_t t0 = runParamsObj->EvalT0(timestamp);
+
   TString validity = (TString)fTOFcalib->GetOfflineValidity();
-  AliInfo(Form(" validity = %s",validity.Data()));
   Int_t calibration = -1;
   if (validity.CompareTo("valid")==0) {
-    AliInfo(" Using offline calibration parameters");
+    //AliInfo(Form(" validity = %s - Using offline calibration parameters",validity.Data()));
     calibration = 1;
-  }
-  else {
-    AliInfo(" Using online calibration parameters");
+  } else {
+    //AliInfo(Form(" validity = %s - Using online calibration parameters",validity.Data()));
     calibration = 0 ;
   }
+
   for (ii=0; ii<fNumberOfTofClusters; ii++) {
     digitIndex = fTofClusters[ii]->GetIndex();
     for(jj=0; jj<5; jj++) detectorIndex[jj] = fTofClusters[ii]->GetDetInd(jj);
@@ -961,16 +1150,17 @@ void AliTOFClusterFinder::CalibrateRecPoint()
     UChar_t statusNoise=calStatus->GetNoiseStatus(index);
     UChar_t statusHW=calStatus->GetHWStatus(index);
     UChar_t status=calStatus->GetStatus(index);
-
+    tdcLatencyWindow = calStatus->GetLatencyWindow(index) * 1.e3; /* ns -> ps */
+    
     //check the status, also unknown is fine!!!!!!!
 
-    AliDebug(2, Form(" Status for channel %i = %i",index, (Int_t)status));
+    AliDebug(2, Form(" Status for channel %d = %d",index, (Int_t)status));
     if((statusPulser & AliTOFChannelOnlineStatusArray::kTOFPulserBad)==(AliTOFChannelOnlineStatusArray::kTOFPulserBad)||(statusNoise & AliTOFChannelOnlineStatusArray::kTOFNoiseBad)==(AliTOFChannelOnlineStatusArray::kTOFNoiseBad)||(statusHW & AliTOFChannelOnlineStatusArray::kTOFHWBad)==(AliTOFChannelOnlineStatusArray::kTOFHWBad)){
-      AliDebug(2, Form(" Bad Status for channel %i",index));
+      AliDebug(2, Form(" Bad Status for channel %d",index));
       fTofClusters[ii]->SetStatus(kFALSE); //odd convention, to avoid conflict with calibration objects currently in the db (temporary solution).
     }
     else {
-      AliDebug(2, Form(" Good Status for channel %i",index));
+      AliDebug(2, Form(" Good Status for channel %d",index));
     }
     // Get Rough channel online equalization 
     Double_t roughDelay=(Double_t)calDelay->GetDelay(index);  // in ns
@@ -983,9 +1173,14 @@ void AliTOFClusterFinder::CalibrateRecPoint()
        par[j]=(Double_t)calChannelOffline->GetSlewPar(j);
      } 
       AliDebug(2,Form(" Calib Pars = %f, %f, %f, %f, %f, %f ",par[0],par[1],par[2],par[3],par[4],par[5]));
-      AliDebug(2,Form(" The ToT and Time, uncorr (counts) = %i , %i", fTofClusters[ii]->GetToT(),fTofClusters[ii]->GetTDC()));
-      tToT = (Double_t)(fTofClusters[ii]->GetToT()*AliTOFGeometry::ToTBinWidth());    
+      AliDebug(2,Form(" The ToT and Time, uncorr (counts) = %d , %d", fTofClusters[ii]->GetToT(),fTofClusters[ii]->GetTDC()));
+      tToT = (Double_t)(fTofClusters[ii]->GetToT()*AliTOFGeometry::ToTBinWidth());
       tToT*=1.E-3; //ToT in ns
+
+      /* check TOT limits and set new TOT in case */
+      if (tToT < AliTOFGeometry::SlewTOTMin()) tToT = AliTOFGeometry::SlewTOTMin();
+      if (tToT > AliTOFGeometry::SlewTOTMax()) tToT = AliTOFGeometry::SlewTOTMax();
+
       AliDebug(2,Form(" The ToT and Time, uncorr (ns)= %e, %e",fTofClusters[ii]->GetTDC()*AliTOFGeometry::TdcBinWidth()*1.E-3,tToT));
       timeCorr=par[0]+par[1]*tToT+par[2]*tToT*tToT+par[3]*tToT*tToT*tToT+par[4]*tToT*tToT*tToT*tToT+par[5]*tToT*tToT*tToT*tToT*tToT; // the time correction (ns)
     }
@@ -997,11 +1192,101 @@ void AliTOFClusterFinder::CalibrateRecPoint()
     timeCorr=(Double_t)(fTofClusters[ii]->GetTDC())*AliTOFGeometry::TdcBinWidth()*1.E-3-timeCorr;//redefine the time
     timeCorr*=1.E3;
     AliDebug(2,Form(" The channel time, corr (ps)= %e",timeCorr ));
+
+    /* here timeCorr should be already corrected for calibration. 
+     * we now go into further corrections keeping in mind that timeCorr
+     * is in ps.
+     *
+     * the following corrections are performed in this way:
+     *
+     *    time = timeRaw - deltaBC + L0L1Latency + CTPLatency - TDCLatencyWindow - T0
+     *
+     */
+
+    AliDebug(2, Form("applying further corrections (DeltaBC): DeltaBC=%d (BC bins), DeltaBCoffset=%d (BC bins)", fTofClusters[ii]->GetDeltaBC(), deltaBCOffset));
+    AliDebug(2, Form("applying further corrections (L0L1Latency): L0L1Latency=%d (BC bins)", fTofClusters[ii]->GetL0L1Latency()));
+    AliDebug(2, Form("applying further corrections (CTPLatency): CTPLatency=%f (ps)", ctpLatency));
+    AliDebug(2, Form("applying further corrections (TDCLatencyWindow): TDCLatencyWindow=%f (ps)", tdcLatencyWindow));
+    AliDebug(2, Form("applying further corrections (T0): T0=%f (ps)", t0));
+
+    /* deltaBC correction (inhibited for the time being) */
+    //    timeCorr -= (fTofClusters[ii]->GetDeltaBC() - deltaBCOffset) * AliTOFGeometry::BunchCrossingBinWidth();
+    /* L0L1-latency correction */
+    timeCorr += fTofClusters[ii]->GetL0L1Latency() * AliTOFGeometry::BunchCrossingBinWidth();
+    /* CTP-latency correction (from OCDB) */
+    timeCorr += ctpLatency;
+    /* TDC latency-window correction (from OCDB) */
+    timeCorr -= tdcLatencyWindow;
+    /* T0 correction (from OCDB) */
+    timeCorr -= t0;
+
+    /*
+     * end of furhter corrections
+     */
+
     tdcCorr=(Int_t)(timeCorr/AliTOFGeometry::TdcBinWidth()); //the corrected time (tdc counts)
     fTofClusters[ii]->SetTDC(tdcCorr);
+
+  } // loop on clusters
+
+}
+#endif
+
+//_________________________________________________________________________
+
+void AliTOFClusterFinder::CalibrateRecPoint(UInt_t timestamp)
+{
+  //
+  // Copy the global array of AliTOFcluster, i.e. fTofClusters (sorted
+  // in Z) in the global TClonesArray of AliTOFcluster,
+  // i.e. fRecPoints.
+  //
+
+  Int_t detectorIndex[5];
+  Double_t time, tot, corr;
+  Int_t deltaBC, l0l1, tdcBin;
+  for (Int_t ii = 0; ii < fNumberOfTofClusters; ii++) {
+    for(Int_t jj = 0; jj < 5; jj++) detectorIndex[jj] = fTofClusters[ii]->GetDetInd(jj);
+
+    Int_t index = AliTOFGeometry::GetIndex(detectorIndex);
+
+    /* check channel enabled */
+    if (!fTOFcalib->IsChannelEnabled(index)) fTofClusters[ii]->SetStatus(kFALSE);
+    
+    /* get cluster info */
+    time = fTofClusters[ii]->GetTDC() * AliTOFGeometry::TdcBinWidth(); /* ps */
+    tot = fTofClusters[ii]->GetToT() * AliTOFGeometry::ToTBinWidth() * 1.e-3; /* ns */
+    deltaBC = fTofClusters[ii]->GetDeltaBC();
+    l0l1 = fTofClusters[ii]->GetL0L1Latency();
+
+    /* get correction */
+    corr = fTOFcalib->GetTimeCorrection(index, tot, deltaBC, l0l1, timestamp); /* ps */
+    AliDebug(2, Form("calibrate index %d: time=%f (ps) tot=%f (ns) deltaBC=%d l0l1=%d timestamp=%d corr=%f (ps)", index, time, tot, deltaBC, l0l1, timestamp, corr));
+
+    /* apply time correction */
+    time -= corr;
+
+    /* convert in TDC bins and set cluster */
+    //tdcBin = (Int_t)(time / AliTOFGeometry::TdcBinWidth()); //the corrected time (tdc counts)
+    tdcBin = TMath::Nint(time / AliTOFGeometry::TdcBinWidth()); //the corrected time (tdc counts)
+    fTofClusters[ii]->SetTDC(tdcBin);
+
+    // noferini
+    Float_t pos[3];
+    AliTOFGeometry::GetPosPar(detectorIndex, pos);
+    Float_t length = 0.;
+    for (Int_t ic = 0; ic < 3; ic++) length += pos[ic] * pos[ic];
+    length = TMath::Sqrt(length);
+    Float_t timealligned = tdcBin*24.4 - length * 0.0333564095198152043; // subtract the minimal time in
+
+    if(timealligned > -1000 && timealligned < 24000 && fTOFcalib->IsChannelEnabled(index)){
+      fNumberOfTofTrgPads++;
+    }
+
   } // loop on clusters
 
 }
+
 //______________________________________________________________________________
 
 void AliTOFClusterFinder::ResetRecpoint()
@@ -1011,6 +1296,7 @@ void AliTOFClusterFinder::ResetRecpoint()
   //
 
   fNumberOfTofClusters = 0;
+  fNumberOfTofTrgPads = 0;
   if (fRecPoints) fRecPoints->Clear();
 
 }
@@ -1061,7 +1347,7 @@ void AliTOFClusterFinder::UnLoadClusters()
 
 }
 //-------------------------------------------------------------------------
-UShort_t AliTOFClusterFinder::GetClusterVolIndex(Int_t *ind) const {
+UShort_t AliTOFClusterFinder::GetClusterVolIndex(const Int_t * const ind) const {
 
   //First of all get the volume ID to retrieve the l2t transformation...
   //
@@ -1129,24 +1415,28 @@ void AliTOFClusterFinder::GetClusterPars(Int_t *ind, Double_t* pos,Double_t* cov
   // -----------------------------------------------------   |
   // x <-----------------------------------------------------
 
-  Float_t localX=(ind[4]-23.5)*2.5; 
-  Float_t localY=0; 
-  Float_t localZ=(ind[3]-0.5)*3.5; 
-
+  /*
+  Float_t localX = (ind[4]-23.5)*AliTOFGeometry::XPad();
+  Float_t localY = 0;
+  Float_t localZ = (ind[3]- 0.5)*AliTOFGeometry::ZPad();
+  */
+  Float_t localX = (ind[4]-AliTOFGeometry::NpadX()/2)*AliTOFGeometry::XPad()+AliTOFGeometry::XPad()/2.;
+  Float_t localY = 0;
+  Float_t localZ = (ind[3]-AliTOFGeometry::NpadZ()/2)*AliTOFGeometry::ZPad()+AliTOFGeometry::ZPad()/2.;
   //move to the tracking ref system
 
   Double_t lpos[3];
-  lpos[0]=localX;
-  lpos[1]=localY;
-  lpos[2]=localZ; 
+  lpos[0] = localX;
+  lpos[1] = localY;
+  lpos[2] = localZ; 
 
   const TGeoHMatrix *l2t= AliGeomManager::GetTracking2LocalMatrix(volIndex);
   // Get The position in the track ref system
   Double_t tpos[3];
   l2t->MasterToLocal(lpos,tpos);
-  pos[0]=tpos[0];
-  pos[1]=tpos[1];
-  pos[2]=tpos[2];
+  pos[0] = tpos[0];
+  pos[1] = tpos[1];
+  pos[2] = tpos[2];
 
   //Get The cluster covariance in the track ref system
   Double_t lcov[9];
@@ -1156,15 +1446,15 @@ void AliTOFClusterFinder::GetClusterPars(Int_t *ind, Double_t* pos,Double_t* cov
   // 0     0   0
   // 0     0   sz2
 
-  lcov[0]=2.5*2.5/12.;
-  lcov[1]=0;
-  lcov[2]=0;
-  lcov[3]=0;
-  lcov[4]=0;
-  lcov[5]=0;
-  lcov[6]=0;
-  lcov[7]=0;
-  lcov[8]=3.5*3.5/12.;
+  lcov[0] = AliTOFGeometry::XPad()*AliTOFGeometry::XPad()/12.;
+  lcov[1] = 0;
+  lcov[2] = 0;
+  lcov[3] = 0;
+  lcov[4] = 0;
+  lcov[5] = 0;
+  lcov[6] = 0;
+  lcov[7] = 0;
+  lcov[8] = AliTOFGeometry::ZPad()*AliTOFGeometry::ZPad()/12.;
 
   //cluster covariance in the tracking system:
   TGeoHMatrix m;
@@ -1179,3 +1469,58 @@ void AliTOFClusterFinder::GetClusterPars(Int_t *ind, Double_t* pos,Double_t* cov
   return;
 
 }
+//-------------------------------------------------------------------------
+void AliTOFClusterFinder::FillTOFtriggerMap(Int_t iDDL, AliTOFrawData *tofRawDatum)
+{
+
+  /* get cluster info */
+  //Int_t trm = tofRawDatum->GetTRM();
+  // Int_t tdc = tofRawDatum->GetTDC();
+//   Int_t tdc_ch = tofRawDatum->GetTDCchannel();
+  Int_t chain = tofRawDatum->GetTRMchain();
+  Int_t l0l1 = tofRawDatum->GetL0L1Latency();
+  Double_t corr = l0l1 * AliTOFGeometry::BunchCrossingBinWidth();
+  AliTOFCTPLatency *ctpLatencyObj = fTOFcalib->GetCTPLatency();
+  Float_t ctpLatency = ctpLatencyObj->GetCTPLatency();
+  corr += ctpLatency;
+
+  Double_t timeTOF=tofRawDatum->GetTOF()*AliTOFGeometry::TdcBinWidth();
+  timeTOF-=corr;
+  //Int_t timeRaw_bc = Int_t(timeTOF/1000/24.4); // per ora non usata
+
+  //Int_t timeRaw_bc = Int_t((tofRawDatum->GetTOF()*AliTOFGeometry::TdcBinWidth())/1000/24.4); // per ora non usata
+
+  /*
+  const  Int_t crate_CTTM[72] = { 0,  1, 37, 36,  2,  3, 39, 38,  4,  5,
+                                 41, 40,  6,  7, 43, 42,  8,  9, 45, 44,
+                                 10, 11, 47, 46, 12, 13, 49, 48, 14, 15,
+                                 51, 50, 16, 17, 53, 52, 18, 19, 55, 54,
+                                 20, 21, 57, 56, 22, 23, 59, 58, 24, 25,
+                                 61, 60, 26, 27, 63, 62, 28, 29, 65, 64,
+                                 30, 31, 67, 66, 32, 33, 69, 68, 34, 35,
+                                 71, 70};
+  */
+
+  Int_t cttmCrate=-1;
+//   Int_t cttmBit = tdc_ch + (tdc-12)*AliTOFGeometry::NCh();
+  switch(iDDL%AliTOFGeometry::NDDL()){
+  case 1:
+    cttmCrate=1;
+    break;
+  case 3:
+    cttmCrate=36;
+    break;
+  default:
+    break;
+  }
+  cttmCrate+=2*(Int_t)(iDDL/AliTOFGeometry::NDDL());
+  if(chain==0) {
+    if (iDDL<36) cttmCrate--;
+    else cttmCrate++;
+  }
+
+
+
+
+}
+