]> git.uio.no Git - u/mrichter/AliRoot.git/blobdiff - TPC/AliTPC.cxx
- AddTrackReference moved to AliModule
[u/mrichter/AliRoot.git] / TPC / AliTPC.cxx
index 26c6c1c2cc3326b05d1e5d0bc891cf213eb70320..24a1d5a490acf4a11d9849a15225556e7fa29ae1 100644 (file)
 
 /*
 $Log$
-Revision 1.20  2000/06/30 12:07:49  kowal2
-Updated from the TPC-PreRelease branch
+Revision 1.67  2003/03/03 16:36:16  kowal2
+Added LoadTPCParam method
+
+Revision 1.66  2003/02/11 16:54:07  hristov
+Updated AliTrackReference class (S.Radomski)
+
+Revision 1.65  2002/11/21 22:43:32  alibrary
+Removing AliMC and AliMCProcess
+
+Revision 1.64  2002/10/23 07:17:33  alibrary
+Introducing Riostream.h
+
+Revision 1.63  2002/10/14 14:57:42  hristov
+Merging the VirtualMC branch to the main development branch (HEAD)
+
+Revision 1.54.4.3  2002/10/11 08:34:48  hristov
+Updating VirtualMC to v3-09-02
+
+Revision 1.62  2002/09/23 09:22:56  hristov
+The address of the TrackReferences is set (M.Ivanov)
+
+Revision 1.61  2002/09/10 07:06:42  kowal2
+Corrected for the memory leak. Thanks to J. Chudoba and M. Ivanov
+
+Revision 1.60  2002/06/12 14:56:56  kowal2
+Added track length to the reference hits
+
+Revision 1.59  2002/06/05 15:37:31  kowal2
+Added cross-talk from the wires beyond the first and the last rows
+
+Revision 1.58  2002/05/27 14:33:14  hristov
+The new class AliTrackReference used (M.Ivanov)
+
+Revision 1.57  2002/05/07 17:23:11  kowal2
+Linear gain inefficiency instead of the step one at the wire edges.
+
+Revision 1.56  2002/04/04 16:26:33  kowal2
+Digits (Sdigits) go to separate files now.
+
+Revision 1.55  2002/03/29 06:57:45  kowal2
+Restored backward compatibility to use the hits from Dec. 2000 production.
+
+Revision 1.54  2002/03/18 17:59:13  kowal2
+Chnges in the pad geometry - 3 pad lengths introduced.
+
+Revision 1.53  2002/02/25 11:02:56  kowal2
+Changes towards speeding up the code. Thanks to Marian Ivanov.
+
+Revision 1.52  2002/02/18 09:26:09  kowal2
+Removed compiler warning
+
+Revision 1.51  2002/01/21 17:13:21  kowal2
+New track hits using root containers. Setting active sectors added.
+
+Revision 1.50  2001/12/06 14:16:19  kowal2
+meaningfull printouts
+
+Revision 1.49  2001/11/30 11:55:37  hristov
+Noise table created in Hits2SDigits (M.Ivanov)
+
+Revision 1.48  2001/11/24 16:10:21  kowal2
+Faster algorithms.
+
+Revision 1.47  2001/11/19 10:25:34  kowal2
+Nearest integer instead of integer when converting to ADC counts
+
+Revision 1.46  2001/11/07 06:47:12  kowal2
+Removed printouts
+
+Revision 1.45  2001/11/03 13:33:48  kowal2
+Updated algorithms in Hits2SDigits, SDigits2Digits,
+Hits2ExactClusters.
+Added method Merge
+
+Revision 1.44  2001/08/30 09:28:48  hristov
+TTree names are explicitly set via SetName(name) and then Write() is called
+
+Revision 1.43  2001/07/28 12:02:54  hristov
+Branch split level set to 99
+
+Revision 1.42  2001/07/28 11:38:52  hristov
+Loop variable declared once
+
+Revision 1.41  2001/07/28 10:53:50  hristov
+Digitisation done according to the general scheme (M.Ivanov)
+
+Revision 1.40  2001/07/27 13:03:14  hristov
+Default Branch split level set to 99
+
+Revision 1.39  2001/07/26 09:09:34  kowal2
+Hits2Reco method added
+
+Revision 1.38  2001/07/20 14:32:43  kowal2
+Processing of many events possible now
+
+Revision 1.37  2001/06/12 07:17:18  kowal2
+Hits2SDigits method implemented (summable digits)
+
+Revision 1.36  2001/05/16 14:57:25  alibrary
+New files for folders and Stack
+
+Revision 1.35  2001/05/08 16:02:22  kowal2
+Updated material specifications
+
+Revision 1.34  2001/05/08 15:00:15  hristov
+Corrections for tracking in arbitrary magnenetic field. Changes towards a concept of global Alice track. Back propagation of reconstructed tracks (Yu.Belikov)
+
+Revision 1.33  2001/04/03 12:40:43  kowal2
+Removed printouts
+
+Revision 1.32  2001/03/12 17:47:36  hristov
+Changes needed on Sun with CC 5.0
+
+Revision 1.31  2001/03/12 08:21:50  kowal2
+Corrected C++ bug in the material definitions
+
+Revision 1.30  2001/03/01 17:34:47  kowal2
+Correction due to the accuracy problem
+
+Revision 1.29  2001/02/28 16:34:40  kowal2
+Protection against nonphysical values of the avalanche size,
+10**6 is the maximum
+
+Revision 1.28  2001/01/26 19:57:19  hristov
+Major upgrade of AliRoot code
+
+Revision 1.27  2001/01/13 17:29:33  kowal2
+Sun compiler correction
+
+Revision 1.26  2001/01/10 07:59:43  kowal2
+Corrections to load points from the noncompressed hits.
+
+Revision 1.25  2000/11/02 07:25:31  kowal2
+Changes due to the new hit structure.
+Memory leak removed.
+
+Revision 1.24  2000/10/05 16:06:09  kowal2
+Forward declarations. Changes due to a new class AliComplexCluster.
+
+Revision 1.23  2000/10/02 21:28:18  fca
+Removal of useless dependecies via forward declarations
+
+Revision 1.22  2000/07/10 20:57:39  hristov
+Update of TPC code and macros by M.Kowalski
 
 Revision 1.19.2.4  2000/06/26 07:39:42  kowal2
 Changes to obey the coding rules
@@ -90,11 +232,15 @@ Introduction of the Copyright and cvs Log
 #include <TObjectTable.h>
 #include "TParticle.h"
 #include "AliTPC.h"
-#include <TFile.h>       
+#include <TFile.h>  
+#include <TROOT.h>
+#include <TSystem.h>     
 #include "AliRun.h"
-#include <iostream.h>
-#include <fstream.h>
-#include "AliMC.h"
+#include <Riostream.h>
+#include <stdlib.h>
+#include <Riostream.h>
+#include "AliMagF.h"
+#include "AliTrackReference.h"
 
 
 #include "AliTPCParamSR.h"
@@ -102,9 +248,14 @@ Introduction of the Copyright and cvs Log
 #include "AliTPCRF1D.h"
 #include "AliDigits.h"
 #include "AliSimDigits.h"
+#include "AliTPCTrackHits.h"
+#include "AliTPCTrackHitsV2.h"
+#include "AliPoints.h"
+#include "AliArrayBranch.h"
+
 
 #include "AliTPCDigitsArray.h"
-#include "AliCluster.h"
+#include "AliComplexCluster.h"
 #include "AliClusters.h"
 #include "AliTPCClustersRow.h"
 #include "AliTPCClustersArray.h"
@@ -114,9 +265,39 @@ Introduction of the Copyright and cvs Log
 #include "AliTPCtracker.h"
 
 #include <TInterpreter.h>
+#include <TTree.h>
+
+
 
 ClassImp(AliTPC) 
 
+//_____________________________________________________________________________
+// helper class for fast matrix and vector manipulation - no range checking
+// origin - Marian Ivanov
+
+class AliTPCFastMatrix : public TMatrix {
+public :
+  AliTPCFastMatrix(Int_t row_lwb, Int_t row_upb, Int_t col_lwb, Int_t col_upb);
+  inline Float_t & UncheckedAt(Int_t rown, Int_t coln) const  {return  (fIndex[coln])[rown];} //fast acces   
+  inline Float_t   UncheckedAtFast(Int_t rown, Int_t coln) const  {return  (fIndex[coln])[rown];} //fast acces   
+};
+
+AliTPCFastMatrix::AliTPCFastMatrix(Int_t row_lwb, Int_t row_upb, Int_t col_lwb, Int_t col_upb):
+  TMatrix(row_lwb, row_upb,col_lwb,col_upb)
+   {
+   };
+//_____________________________________________________________________________
+class AliTPCFastVector : public TVector {
+public :
+  AliTPCFastVector(Int_t size);
+  virtual ~AliTPCFastVector(){;}
+  inline Float_t & UncheckedAt(Int_t index) const  {return  fElements[index];} //fast acces  
+  
+};
+
+AliTPCFastVector::AliTPCFastVector(Int_t size):TVector(size){
+};
+
 //_____________________________________________________________________________
 AliTPC::AliTPC()
 {
@@ -127,10 +308,16 @@ AliTPC::AliTPC()
   fHits     = 0;
   fDigits   = 0;
   fNsectors = 0;
-  //MI changes
   fDigitsArray = 0;
   fClustersArray = 0;
-  fTPCParam=0;
+  fDefaults = 0;
+  fTrackHits = 0; 
+  fTrackHitsOld = 0;   
+  fHitType = 2; //default CONTAINERS - based on ROOT structure 
+  fTPCParam = 0;    
+  fNoiseTable = 0;
+  fActiveSectors =0;
+
 }
  
 //_____________________________________________________________________________
@@ -144,10 +331,25 @@ AliTPC::AliTPC(const char *name, const char *title)
   //
   // Initialise arrays of hits and digits 
   fHits     = new TClonesArray("AliTPChit",  176);
-  gAlice->AddHitList(fHits);
-  //MI change  
+  gAlice->AddHitList(fHits); 
   fDigitsArray = 0;
   fClustersArray= 0;
+  fDefaults = 0;
+  //
+  fTrackHits = new AliTPCTrackHitsV2;  
+  fTrackHits->SetHitPrecision(0.002);
+  fTrackHits->SetStepPrecision(0.003);  
+  fTrackHits->SetMaxDistance(100);
+
+  fTrackHitsOld = new AliTPCTrackHits;  //MI - 13.09.2000
+  fTrackHitsOld->SetHitPrecision(0.002);
+  fTrackHitsOld->SetStepPrecision(0.003);  
+  fTrackHitsOld->SetMaxDistance(100); 
+
+  fNoiseTable =0;
+
+  fHitType = 2;
+  fActiveSectors = 0;
   //
   // Initialise counters
   fNsectors = 0;
@@ -162,8 +364,9 @@ AliTPC::AliTPC(const char *name, const char *title)
   //  Set TPC parameters
   //
 
-  if (!strcmp(title,"Default")) {  
-     fTPCParam = new AliTPCParamSR;
+
+  if (!strcmp(title,"Default")) {       
+    fTPCParam = new AliTPCParamSR;
   } else {
     cerr<<"AliTPC warning: in Config.C you must set non-default parameters\n";
     fTPCParam=0;
@@ -182,6 +385,10 @@ AliTPC::~AliTPC()
   delete fHits;
   delete fDigits;
   delete fTPCParam;
+  delete fTrackHits; //MI 15.09.2000
+  delete fTrackHitsOld; //MI 10.12.2001
+  if (fNoiseTable) delete [] fNoiseTable;
+
 }
 
 //_____________________________________________________________________________
@@ -190,8 +397,14 @@ void AliTPC::AddHit(Int_t track, Int_t *vol, Float_t *hits)
   //
   // Add a hit to the list
   //
-  TClonesArray &lhits = *fHits;
-  new(lhits[fNhits++]) AliTPChit(fIshunt,track,vol,hits);
+  //  TClonesArray &lhits = *fHits;
+  //  new(lhits[fNhits++]) AliTPChit(fIshunt,track,vol,hits);
+  if (fHitType&1){
+    TClonesArray &lhits = *fHits;
+    new(lhits[fNhits++]) AliTPChit(fIshunt,track,vol,hits);
+  }
+  if (fHitType>1)
+   AddHit2(track,vol,hits);
 }
  
 //_____________________________________________________________________________
@@ -293,14 +506,15 @@ void AliTPC::Clusters2Tracks(TFile *of) {
   //-----------------------------------------------------------------
   // This is a track finder.
   //-----------------------------------------------------------------
-  AliTPCtracker::Clusters2Tracks(fTPCParam,of);
+  AliTPCtracker tracker(fTPCParam);
+  tracker.Clusters2Tracks(gFile,of);
 }
 
 //_____________________________________________________________________________
 void AliTPC::CreateMaterials()
 {
   //-----------------------------------------------
-  // Create Materials for for TPC
+  // Create Materials for for TPC simulations
   //-----------------------------------------------
 
   //-----------------------------------------------------------------
@@ -315,37 +529,36 @@ void AliTPC::CreateMaterials()
   Float_t wmat[5]; // proportions
 
   Float_t density;
+  Float_t apure[2];
 
-  //  ********************* Gases *******************
 
-  //--------------------------------------------------------------
+  //***************** Gases *************************
+  
+  //-------------------------------------------------
   // pure gases
-  //--------------------------------------------------------------
+  //-------------------------------------------------
 
-  // Ne
+  // Neon
 
 
-  Float_t aNe = 20.18;
-  Float_t zNe = 10.;
-  
+  amat[0]= 20.18;
+  zmat[0]= 10.;  
   density = 0.0009;
+  apure[0]=amat[0];
 
-  AliMaterial(20,"Ne",aNe,zNe,density,999.,999.);
+  AliMaterial(20,"Ne",amat[0],zmat[0],density,999.,999.);
 
-  // Ar
+  // Argon
 
-  Float_t aAr = 39.948;
-  Float_t zAr = 18.;
+  amat[0]= 39.948;
+  zmat[0]= 18.;  
+  density = 0.001782;  
 
-  density = 0.001782;
-  AliMaterial(21,"Ar",aAr,zAr,density,999.,999.);
+  apure[1]=amat[0];
 
-  Float_t aPure[2];
-  
-  aPure[0] = aNe;
-  aPure[1] = aAr;
-  
+  AliMaterial(21,"Ar",amat[0],zmat[0],density,999.,999.);
 
   //--------------------------------------------------------------
   // gases - compounds
@@ -353,7 +566,7 @@ void AliTPC::CreateMaterials()
 
   Float_t amol[3];
 
-  //  CO2
+  // CO2
 
   amat[0]=12.011;
   amat[1]=15.9994;
@@ -369,7 +582,7 @@ void AliTPC::CreateMaterials()
   amol[0] = amat[0]*wmat[0]+amat[1]*wmat[1];
 
   AliMixture(10,"CO2",amat,zmat,density,-2,wmat);
-
+  
   // CF4
 
   amat[0]=12.011;
@@ -387,6 +600,7 @@ void AliTPC::CreateMaterials()
 
   AliMixture(11,"CF4",amat,zmat,density,-2,wmat); 
 
+
   // CH4
 
   amat[0]=12.011;
@@ -407,29 +621,28 @@ void AliTPC::CreateMaterials()
   //----------------------------------------------------------------
   // gases - mixtures, ID >= 20 pure gases, <= 10 ID < 20 -compounds
   //----------------------------------------------------------------
-  char namate[21];
+
+  char namate[21]; 
   density = 0.;
   Float_t am=0;
   Int_t nc;
-
-  Float_t a,z,rho,absl,x0,buf[1];
+  Float_t rho,absl,X0,buf[1];
   Int_t nbuf;
+  Float_t a,z;
 
   for(nc = 0;nc<fNoComp;nc++)
     {
     
       // retrive material constants
       
-      gMC->Gfmate((*fIdmate)[fMixtComp[nc]],namate,a,z,rho,x0,absl,buf,nbuf);
+      gMC->Gfmate((*fIdmate)[fMixtComp[nc]],namate,a,z,rho,X0,absl,buf,nbuf);
 
       amat[nc] = a;
       zmat[nc] = z;
 
       Int_t nnc = (fMixtComp[nc]>=20) ? fMixtComp[nc]%20 : fMixtComp[nc]%10;
  
-      am += fMixtProp[nc]*((fMixtComp[nc]>=20) ? aPure[nnc] : amol[nnc]); 
+      am += fMixtProp[nc]*((fMixtComp[nc]>=20) ? apure[nnc] : amol[nnc]); 
       density += fMixtProp[nc]*rho;  // density of the mixture
       
     }
@@ -441,41 +654,92 @@ void AliTPC::CreateMaterials()
 
       Int_t nnc = (fMixtComp[nc]>=20) ? fMixtComp[nc]%20 : fMixtComp[nc]%10;
 
-      wmat[nc] = fMixtProp[nc]*((fMixtComp[nc]>=20) ? aPure[nnc] : amol[nnc])/am;
+      wmat[nc] = fMixtProp[nc]*((fMixtComp[nc]>=20) ? 
+                 apure[nnc] : amol[nnc])/am;
+
+    } 
+
+  // Drift gases 1 - nonsensitive, 2 - sensitive
 
-    }  
-  
   AliMixture(31,"Drift gas 1",amat,zmat,density,fNoComp,wmat);
   AliMixture(32,"Drift gas 2",amat,zmat,density,fNoComp,wmat);
-  AliMixture(33,"Drift gas 3",amat,zmat,density,fNoComp,wmat); 
 
-  AliMedium(2, "Drift gas 1", 31, 0, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999.,.1, .001, .001);
-  AliMedium(3, "Drift gas 2", 32, 0, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999.,.1, .001, .001);
-  AliMedium(4, "Drift gas 3", 33, 1, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999.,.1, .001, .001);
 
-  // Air 
+  // Air
+
+  amat[0] = 14.61;
+  zmat[0] = 7.3;
+  density = 0.001205;
 
-  AliMaterial(24, "Air", 14.61, 7.3, .001205, 30420., 67500.);
+  AliMaterial(24,"Air",amat[0],zmat[0],density,999.,999.); 
 
-  AliMedium(24, "Air", 24, 0, iSXFLD, sXMGMX, 10., .1, .1, .1, .1);
 
   //----------------------------------------------------------------------
   //               solid materials
   //----------------------------------------------------------------------
 
-  // Al
 
-  AliMaterial(30, "Al", 26.98, 13., 2.7, 8.9, 37.2);
+  // Kevlar C14H22O2N2
 
-  AliMedium(0, "Al",30, 0, iSXFLD, sXMGMX, 10., .1, .1, .1,   .1);
+  amat[0] = 12.011;
+  amat[1] = 1.;
+  amat[2] = 15.999;
+  amat[3] = 14.006;
 
-  // Si
+  zmat[0] = 6.;
+  zmat[1] = 1.;
+  zmat[2] = 8.;
+  zmat[3] = 7.;
+
+  wmat[0] = 14.;
+  wmat[1] = 22.;
+  wmat[2] = 2.;
+  wmat[3] = 2.;
+
+  density = 1.45;
+
+  AliMixture(34,"Kevlar",amat,zmat,density,-4,wmat);  
+
+  // NOMEX
+
+  amat[0] = 12.011;
+  amat[1] = 1.;
+  amat[2] = 15.999;
+  amat[3] = 14.006;
+
+  zmat[0] = 6.;
+  zmat[1] = 1.;
+  zmat[2] = 8.;
+  zmat[3] = 7.;
+
+  wmat[0] = 14.;
+  wmat[1] = 22.;
+  wmat[2] = 2.;
+  wmat[3] = 2.;
+
+  density = 0.03;
+
+  
+  AliMixture(35,"NOMEX",amat,zmat,density,-4,wmat);
+
+  // Makrolon C16H18O3
+
+  amat[0] = 12.011;
+  amat[1] = 1.;
+  amat[2] = 15.999;
 
-  AliMaterial(31, "Si", 28.086, 14.,2.33, 9.36, 999.);
+  zmat[0] = 6.;
+  zmat[1] = 1.;
+  zmat[2] = 8.;
 
-  AliMedium(7, "Al",31, 0, iSXFLD, sXMGMX, 10., .1, .1, .1,   .1);
+  wmat[0] = 16.;
+  wmat[1] = 18.;
+  wmat[2] = 3.;
   
+  density = 1.2;
 
+  AliMixture(36,"Makrolon",amat,zmat,density,-3,wmat);
+  
   // Mylar C5H4O2
 
   amat[0]=12.011;
@@ -492,105 +756,276 @@ void AliTPC::CreateMaterials()
 
   density = 1.39;
   
-  AliMixture(32, "Mylar",amat,zmat,density,-3,wmat);
+  AliMixture(37, "Mylar",amat,zmat,density,-3,wmat); 
 
-  AliMedium(5, "Mylar",32, 0, iSXFLD, sXMGMX, 10., .1, .1, .001, .01);
+  // SiO2 - used later for the glass fiber
 
+  amat[0]=28.086;
+  amat[1]=15.9994;
 
+  zmat[0]=14.;
+  zmat[1]=8.;
 
+  wmat[0]=1.;
+  wmat[1]=2.;
 
-  // Carbon (normal)
 
-  AliMaterial(33,"C normal",12.011,6.,2.265,18.8,999.);
+  AliMixture(38,"SiO2",amat,zmat,2.2,-2,wmat); //SiO2 - quartz (rho=2.2)
 
-  AliMedium(6,"C normal",33,0, iSXFLD, sXMGMX, 10., .1, .1, .001, .01);
+  // Al
 
-  // G10 for inner and outr field cage
-  // G10 is 60% SiO2 + 40% epoxy, right now I use A and Z for SiO2
+  amat[0] = 26.98;
+  zmat[0] = 13.;
 
-  Float_t rhoFactor;
+  density = 2.7;
 
-  amat[0]=28.086;
-  amat[1]=15.9994;
+  AliMaterial(40,"Al",amat[0],zmat[0],density,999.,999.);
 
-  zmat[0]=14.;
-  zmat[1]=8.;
+  // Si
 
-  wmat[0]=1.;
-  wmat[1]=2.;
+  amat[0] = 28.086;
+  zmat[0] = 14.;
 
-  density = 1.7;
-  
+  density = 2.33;
 
-  AliMixture(34,"G10 aux.",amat,zmat,density,-2,wmat);
+  AliMaterial(41,"Si",amat[0],zmat[0],density,999.,999.);
 
+  // Cu
 
-  gMC->Gfmate((*fIdmate)[34],namate,a,z,rho,x0,absl,buf,nbuf);
+  amat[0] = 63.546;
+  zmat[0] = 29.;
 
-  Float_t thickX0 = 0.0052; // field cage in X0 units
-  
-  Float_t thick = 2.; // in cm
+  density = 8.96;
+
+  AliMaterial(42,"Cu",amat[0],zmat[0],density,999.,999.);
+
+  // Tedlar C2H3F
+
+  amat[0] = 12.011;
+  amat[1] = 1.;
+  amat[2] = 18.998;
+
+  zmat[0] = 6.;
+  zmat[1] = 1.;
+  zmat[2] = 9.;
+
+  wmat[0] = 2.;
+  wmat[1] = 3.; 
+  wmat[2] = 1.;
+
+  density = 1.71;
+
+  AliMixture(43, "Tedlar",amat,zmat,density,-3,wmat);  
 
-  x0=19.4; // G10 
 
-  rhoFactor = x0*thickX0/thick;
-  density = rho*rhoFactor;
+  // Plexiglas  C5H8O2
 
-  AliMaterial(35,"G10-fc",a,z,density,999.,999.);
+  amat[0]=12.011;
+  amat[1]=1.;
+  amat[2]=15.9994;
+
+  zmat[0]=6.;
+  zmat[1]=1.;
+  zmat[2]=8.;
 
-  AliMedium(8,"G10-fc",35,0, iSXFLD, sXMGMX, 10., .1, .1, .001, .01);
+  wmat[0]=5.;
+  wmat[1]=8.;
+  wmat[2]=2.;
 
-  thickX0 = 0.0027; // inner vessel (eta <0.9)
-  thick=0.5;
-  rhoFactor = x0*thickX0/thick;
-  density = rho*rhoFactor;
+  density=1.18;
 
-  AliMaterial(36,"G10-iv",a,z,density,999.,999.);  
+  AliMixture(44,"Plexiglas",amat,zmat,density,-3,wmat);
 
-  AliMedium(9,"G10-iv",36,0, iSXFLD, sXMGMX, 10., .1, .1, .001, .01);
+  // Epoxy - C14 H20 O3
 
-  //  Carbon fibre  
   
-  gMC->Gfmate((*fIdmate)[33],namate,a,z,rho,x0,absl,buf,nbuf);
+  amat[0]=12.011;
+  amat[1]=1.;
+  amat[2]=15.9994;
+
+  zmat[0]=6.;
+  zmat[1]=1.;
+  zmat[2]=8.;
+
+  wmat[0]=14.;
+  wmat[1]=20.;
+  wmat[2]=3.;
+
+  density=1.25;
+
+  AliMixture(45,"Epoxy",amat,zmat,density,-3,wmat);
+
+  // Carbon
+
+  amat[0]=12.011;
+  zmat[0]=6.;
+  density= 2.265;
+
+  AliMaterial(46,"C",amat[0],zmat[0],density,999.,999.);
+
+  // get epoxy
 
-  thickX0 = 0.0133; // outer vessel
-  thick=3.0;
-  rhoFactor = x0*thickX0/thick;
-  density = rho*rhoFactor;
+  gMC->Gfmate((*fIdmate)[45],namate,amat[1],zmat[1],rho,X0,absl,buf,nbuf);
 
+  // Carbon fiber
 
-  AliMaterial(37,"C-ov",a,z,density,999.,999.);
+  wmat[0]=0.644; // by weight!
+  wmat[1]=0.356;
 
-  AliMedium(10,"C-ov",37,0, iSXFLD, sXMGMX, 10., .1, .1, .001, .01);  
+  density=0.5*(1.25+2.265);
+
+  AliMixture(47,"Cfiber",amat,zmat,density,2,wmat);
+
+  // get SiO2
+
+  gMC->Gfmate((*fIdmate)[38],namate,amat[0],zmat[0],rho,X0,absl,buf,nbuf); 
+
+  wmat[0]=0.725; // by weight!
+  wmat[1]=0.275;
+
+  density=1.7;
+
+  AliMixture(39,"G10",amat,zmat,density,2,wmat);
+
+
+
+  //----------------------------------------------------------
+  // tracking media for gases
+  //----------------------------------------------------------
+
+  AliMedium(0, "Air", 24, 0, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999., .1, .01, .1);
+  AliMedium(1, "Drift gas 1", 31, 0, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999.,.1,.001, .001);
+  AliMedium(2, "Drift gas 2", 32, 1, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999.,.1,.001, .001);
+  AliMedium(3,"CO2",10,0, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999.,.1, .001, .001); 
+
+  //-----------------------------------------------------------  
+  // tracking media for solids
+  //-----------------------------------------------------------
+  
+  AliMedium(4,"Al",40,0, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999., .1, .0005, .001);
+  AliMedium(5,"Kevlar",34,0, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999., .1, .0005, .001);
+  AliMedium(6,"Nomex",35,0, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999., .1, .001, .001);
+  AliMedium(7,"Makrolon",36,0, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999., .1, .001, .001);
+  AliMedium(8,"Mylar",37,0, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999., .1, .0005, .001);
+  AliMedium(9,"Tedlar",43,0, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999., .1, .0005, .001);
+  AliMedium(10,"Cu",42,0, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999., .1, .001, .001);
+  AliMedium(11,"Si",41,0, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999., .1, .001, .001);
+  AliMedium(12,"G10",39,0, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999., .1, .001, .001);
+  AliMedium(13,"Plexiglas",44,0, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999., .1, .001, .001);
+  AliMedium(14,"Epoxy",45,0, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999., .1, .0005, .001);
+  AliMedium(15,"Cfiber",47,0, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999., .1, .001, .001);
+    
+}
 
-  thickX0=0.015; // inner vessel (cone, eta > 0.9)
-  thick=1.5;
-  rhoFactor = x0*thickX0/thick;
-  density = rho*rhoFactor;
+void AliTPC::GenerNoise(Int_t tablesize)
+{
+  //
+  //Generate table with noise
+  //
+  if (fTPCParam==0) {
+    // error message
+    fNoiseDepth=0;
+    return;
+  }
+  if (fNoiseTable)  delete[] fNoiseTable;
+  fNoiseTable = new Float_t[tablesize];
+  fNoiseDepth = tablesize; 
+  fCurrentNoise =0; //!index of the noise in  the noise table 
+  
+  Float_t norm = fTPCParam->GetNoise()*fTPCParam->GetNoiseNormFac();
+  for (Int_t i=0;i<tablesize;i++) fNoiseTable[i]= gRandom->Gaus(0,norm);      
+}
 
-  AliMaterial(38,"C-ivc",a,z,density,999.,999.);
+Float_t AliTPC::GetNoise()
+{
+  // get noise from table
+  //  if ((fCurrentNoise%10)==0) 
+  //  fCurrentNoise= gRandom->Rndm()*fNoiseDepth;
+  if (fCurrentNoise>=fNoiseDepth) fCurrentNoise=0;
+  return fNoiseTable[fCurrentNoise++];
+  //gRandom->Gaus(0, fTPCParam->GetNoise()*fTPCParam->GetNoiseNormFac()); 
+}
 
-  AliMedium(11,"C-ivc",38,0, iSXFLD, sXMGMX, 10., .1, .1, .001, .01);
 
+Bool_t  AliTPC::IsSectorActive(Int_t sec)
+{
   //
+  // check if the sector is active
+  if (!fActiveSectors) return kTRUE;
+  else return fActiveSectors[sec]; 
+}
 
-  AliMedium(12,"CO2",10,0, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999.,.1, .001, .001);
+void    AliTPC::SetActiveSectors(Int_t * sectors, Int_t n)
+{
+  // activate interesting sectors
+  if (fActiveSectors) delete [] fActiveSectors;
+  fActiveSectors = new Bool_t[fTPCParam->GetNSector()];
+  for (Int_t i=0;i<fTPCParam->GetNSector();i++) fActiveSectors[i]=kFALSE;
+  for (Int_t i=0;i<n;i++) 
+    if ((sectors[i]>=0) && sectors[i]<fTPCParam->GetNSector())  fActiveSectors[sectors[i]]=kTRUE;
     
 }
 
+void    AliTPC::SetActiveSectors(Int_t flag)
+{
+  //
+  // activate sectors which were hitted by tracks 
+  //loop over tracks
+  if (fHitType==0) return;  // if Clones hit - not short volume ID information
+  if (fActiveSectors) delete [] fActiveSectors;
+  fActiveSectors = new Bool_t[fTPCParam->GetNSector()];
+  if (flag) {
+    for (Int_t i=0;i<fTPCParam->GetNSector();i++) fActiveSectors[i]=kTRUE;
+    return;
+  }
+  for (Int_t i=0;i<fTPCParam->GetNSector();i++) fActiveSectors[i]=kFALSE;
+  TBranch * branch=0;
+  if (fHitType>1) branch = gAlice->TreeH()->GetBranch("TPC2");
+  else branch = gAlice->TreeH()->GetBranch("TPC");
+  Stat_t ntracks = gAlice->TreeH()->GetEntries();
+  // loop over all hits
+  for(Int_t track=0;track<ntracks;track++){
+    ResetHits();
+    //
+    if (fTrackHits && fHitType&4) {
+      TBranch * br1 = gAlice->TreeH()->GetBranch("fVolumes");
+      TBranch * br2 = gAlice->TreeH()->GetBranch("fNVolumes");    
+      br1->GetEvent(track);
+      br2->GetEvent(track);
+      Int_t *volumes = fTrackHits->GetVolumes();
+      for (Int_t j=0;j<fTrackHits->GetNVolumes(); j++)
+       fActiveSectors[volumes[j]]=kTRUE;
+    }
+    
+    //
+    if (fTrackHitsOld && fHitType&2) {
+      TBranch * br = gAlice->TreeH()->GetBranch("fTrackHitsInfo");
+      br->GetEvent(track);
+      AliObjectArray * ar = fTrackHitsOld->fTrackHitsInfo;
+      for (UInt_t j=0;j<ar->GetSize();j++){
+       fActiveSectors[((AliTrackHitsInfo*)ar->At(j))->fVolumeID] =kTRUE;
+      } 
+    }    
+  }
+  
+}  
+
+
 
-void AliTPC::Digits2Clusters(TFile *of)
+
+void AliTPC::Digits2Clusters(TFile *of, Int_t eventnumber)
 {
   //-----------------------------------------------------------------
   // This is a simple cluster finder.
   //-----------------------------------------------------------------
-  AliTPCclusterer::Digits2Clusters(fTPCParam,of);
+  AliTPCclusterer::Digits2Clusters(fTPCParam,of,eventnumber);
 }
 
 extern Double_t SigmaY2(Double_t, Double_t, Double_t);
 extern Double_t SigmaZ2(Double_t, Double_t);
 //_____________________________________________________________________________
-void AliTPC::Hits2Clusters(TFile *of)
+void AliTPC::Hits2Clusters(TFile *of, Int_t eventn)
 {
   //--------------------------------------------------------
   // TPC simple cluster generator from hits
@@ -629,17 +1064,13 @@ void AliTPC::Hits2Clusters(TFile *of)
      return;
   }
 
-   if(fTPCParam == 0){
-     printf("AliTPCParam MUST be created firstly\n");
-     return;
-   }
+  //if(fDefaults == 0) SetDefaults();
 
   Float_t sigmaRphi,sigmaZ,clRphi,clZ;
   //
   TParticle *particle; // pointer to a given particle
   AliTPChit *tpcHit; // pointer to a sigle TPC hit
-  TClonesArray *particles; //pointer to the particle list
-  Int_t sector,nhits;
+  Int_t sector;
   Int_t ipart;
   Float_t xyz[5];
   Float_t pl,pt,tanth,rpad,ratio;
@@ -651,11 +1082,14 @@ void AliTPC::Hits2Clusters(TFile *of)
   
   TTree *tH = gAlice->TreeH();
   Stat_t ntracks = tH->GetEntries();
-  particles=gAlice->Particles();
 
   //Switch to the output file
   of->cd();
 
+  char   cname[100];
+
+  sprintf(cname,"TreeC_TPC_%d",eventn);
+
   fTPCParam->Write(fTPCParam->GetTitle());
   AliTPCClustersArray carray;
   carray.Setup(fTPCParam);
@@ -686,24 +1120,31 @@ void AliTPC::Hits2Clusters(TFile *of)
       tH->GetEvent(track);
       //
       //  Get number of the TPC hits
-      //
-      nhits=fHits->GetEntriesFast();
-      //
+      //     
+       tpcHit = (AliTPChit*)FirstHit(-1);
+
       // Loop over hits
       //
-      for(Int_t hit=0;hit<nhits;hit++){
-       tpcHit=(AliTPChit*)fHits->UncheckedAt(hit);
-        if (tpcHit->fQ == 0.) continue; //information about track (I.Belikov)
+       while(tpcHit){
+        if (tpcHit->fQ == 0.) {
+           tpcHit = (AliTPChit*) NextHit();
+           continue; //information about track (I.Belikov)
+        }
        sector=tpcHit->fSector; // sector number
-       if(sector != isec) continue; //terminate iteration
-       ipart=tpcHit->fTrack;
-       particle=(TParticle*)particles->UncheckedAt(ipart);
+
+       if(sector != isec){
+        tpcHit = (AliTPChit*) NextHit();
+        continue; 
+       }
+       ipart=tpcHit->Track();
+       particle=gAlice->Particle(ipart);
        pl=particle->Pz();
        pt=particle->Pt();
        if(pt < 1.e-9) pt=1.e-9;
        tanth=pl/pt;
        tanth = TMath::Abs(tanth);
-       rpad=TMath::Sqrt(tpcHit->fX*tpcHit->fX + tpcHit->fY*tpcHit->fY);
+       rpad=TMath::Sqrt(tpcHit->X()*tpcHit->X() + tpcHit->Y()*tpcHit->Y());
        ratio=0.001*rpad/pt; // pt must be in MeV/c - historical reason
 
        //   space-point resolutions
@@ -729,27 +1170,30 @@ void AliTPC::Hits2Clusters(TFile *of)
        // smearing --> rotate to the 1 (13) or to the 25 (49) sector,
        // then the inaccuracy in a X-Y plane is only along Y (pad row)!
        //
-        Float_t xprim= tpcHit->fX*cph + tpcHit->fY*sph;
-       Float_t yprim=-tpcHit->fX*sph + tpcHit->fY*cph;
+        Float_t xprim= tpcHit->X()*cph + tpcHit->Y()*sph;
+       Float_t yprim=-tpcHit->X()*sph + tpcHit->Y()*cph;
        xyz[0]=gRandom->Gaus(yprim,TMath::Sqrt(sigmaRphi));   // y
           Float_t alpha=(isec < fTPCParam->GetNInnerSector()) ?
          fTPCParam->GetInnerAngle() : fTPCParam->GetOuterAngle();
           Float_t ymax=xprim*TMath::Tan(0.5*alpha);
           if (TMath::Abs(xyz[0])>ymax) xyz[0]=yprim; 
-       xyz[1]=gRandom->Gaus(tpcHit->fZ,TMath::Sqrt(sigmaZ)); // z
-          if (TMath::Abs(xyz[1])>fTPCParam->GetZLength()) xyz[1]=tpcHit->fZ
-       xyz[2]=tpcHit->fQ;                                     // q
-       xyz[3]=sigmaRphi;                                     // fSigmaY2
-       xyz[4]=sigmaZ;                                        // fSigmaZ2
+       xyz[1]=gRandom->Gaus(tpcHit->Z(),TMath::Sqrt(sigmaZ)); // z
+          if (TMath::Abs(xyz[1])>fTPCParam->GetZLength()) xyz[1]=tpcHit->Z()
+       xyz[2]=sigmaRphi;                                     // fSigmaY2
+       xyz[3]=sigmaZ;                                        // fSigmaZ2
+       xyz[4]=tpcHit->fQ;                                    // q
 
         AliTPCClustersRow *clrow=carray.GetRow(sector,tpcHit->fPadRow);
         if (!clrow) clrow=carray.CreateRow(sector,tpcHit->fPadRow);    
 
-        Int_t tracks[3]={tpcHit->fTrack, -1, -1};
-       AliTPCcluster cluster(xyz,tracks);
+        Int_t tracks[3]={tpcHit->Track(), -1, -1};
+       AliTPCcluster cluster(tracks,xyz);
 
         clrow->InsertCluster(&cluster); nclusters++;
 
+        tpcHit = (AliTPChit*)NextHit();
+        
+
       } // end of loop over hits
 
     }   // end of loop over tracks
@@ -765,7 +1209,7 @@ void AliTPC::Hits2Clusters(TFile *of)
   } // end of loop over sectors  
 
   cerr<<"Number of made clusters : "<<nclusters<<"                        \n";
-
+  carray.GetTree()->SetName(cname);
   carray.GetTree()->Write();
 
   savedir->cd(); //switch back to the input file
@@ -790,12 +1234,11 @@ void AliTPC::Hits2ExactClustersSector(Int_t isec)
   //
   TParticle *particle; // pointer to a given particle
   AliTPChit *tpcHit; // pointer to a sigle TPC hit
-  TClonesArray *particles; //pointer to the particle list
-  Int_t sector,nhits;
+  //  Int_t sector,nhits;
   Int_t ipart;
   const Int_t kcmaxhits=30000;
-  TVector * xxxx = new TVector(kcmaxhits*4);
-  TVector & xxx = *xxxx;
+  AliTPCFastVector * xxxx = new AliTPCFastVector(kcmaxhits*4);
+  AliTPCFastVector & xxx = *xxxx;
   Int_t maxhits = kcmaxhits;
   //construct array for each padrow
   for (Int_t i=0; i<fTPCParam->GetNRow(isec);i++) 
@@ -807,40 +1250,51 @@ void AliTPC::Hits2ExactClustersSector(Int_t isec)
   
   TTree *tH = gAlice->TreeH();
   Stat_t ntracks = tH->GetEntries();
-  particles=gAlice->Particles();
-  Int_t npart = particles->GetEntriesFast();
-    
+  Int_t npart = gAlice->GetNtrack();
+  //MI change
+  TBranch * branch=0;
+  if (fHitType>1) branch = tH->GetBranch("TPC2");
+  else branch = tH->GetBranch("TPC");
+
   //------------------------------------------------------------
   // Loop over tracks
   //------------------------------------------------------------
-  
-  for(Int_t track=0;track<ntracks;track++){
+
+  for(Int_t track=0;track<ntracks;track++){ 
+    Bool_t isInSector=kTRUE;
     ResetHits();
-    tH->GetEvent(track);
+     isInSector = TrackInVolume(isec,track);
+    if (!isInSector) continue;
+    //MI change
+    branch->GetEntry(track); // get next track
     //
     //  Get number of the TPC hits and a pointer
     //  to the particles
-    //
-    nhits=fHits->GetEntriesFast();
-    //
     // Loop over hits
     //
     Int_t currentIndex=0;
     Int_t lastrow=-1;  //last writen row
-    for(Int_t hit=0;hit<nhits;hit++){
-      tpcHit=(AliTPChit*)fHits->UncheckedAt(hit);
-      if (tpcHit==0) continue;
-      sector=tpcHit->fSector; // sector number
-      if(sector != isec) continue; 
-      ipart=tpcHit->fTrack;
-      if (ipart<npart) particle=(TParticle*)particles->UncheckedAt(ipart);
+
+    //M.I. changes
+
+    tpcHit = (AliTPChit*)FirstHit(-1);
+    while(tpcHit){
+      
+      Int_t sector=tpcHit->fSector; // sector number
+      if(sector != isec){
+       tpcHit = (AliTPChit*) NextHit();
+       continue; 
+      }
+
+      ipart=tpcHit->Track();
+      if (ipart<npart) particle=gAlice->Particle(ipart);
       
       //find row number
 
-      Float_t  x[3]={tpcHit->fX,tpcHit->fY,tpcHit->fZ};
+      Float_t  x[3]={tpcHit->X(),tpcHit->Y(),tpcHit->Z()};
       Int_t    index[3]={1,isec,0};
       Int_t    currentrow = fTPCParam->GetPadRow(x,index) ;    
-      if (currentrow<0) continue;
+      if (currentrow<0) {tpcHit = (AliTPChit*)NextHit(); continue;}
       if (lastrow<0) lastrow=currentrow;
       if (currentrow==lastrow){
        if ( currentIndex>=maxhits){
@@ -898,28 +1352,35 @@ void AliTPC::Hits2ExactClustersSector(Int_t isec)
          Float_t detbz=currentIndex*(sumxz*sumx4-sumx2z*sumx3)-sumz*(sumx*sumx4-sumx2*sumx3)+
            sumx2*(sumx*sumx2z-sumx2*sumxz);
          
+         if (TMath::Abs(det)<0.00001){
+            tpcHit = (AliTPChit*)NextHit();
+           continue;
+         }
+       
          Float_t y=detay/det+centralPad;
          Float_t z=detaz/det;  
          Float_t by=detby/det; //y angle
          Float_t bz=detbz/det; //z angle
          sumy/=Float_t(currentIndex);
          sumz/=Float_t(currentIndex);
-         AliCluster cl;
-         cl.fX=z;
-         cl.fY=y;
-         cl.fQ=sumq;
-         cl.fSigmaX2=bz;
-         cl.fSigmaY2=by;
-         cl.fTracks[0]=ipart;
-         
+
          AliTPCClustersRow * row = (fClustersArray->GetRow(isec,lastrow));
-         if (row!=0) row->InsertCluster(&cl);
+         if (row!=0) {
+           AliComplexCluster* cl = new((AliComplexCluster*)row->Append()) AliComplexCluster ;
+           //    AliComplexCluster cl;
+           cl->fX=z;
+           cl->fY=y;
+           cl->fQ=sumq;
+           cl->fSigmaX2=bz;
+           cl->fSigmaY2=by;
+           cl->fTracks[0]=ipart;
+         }
          currentIndex=0;
          lastrow=currentrow;
        } //end of calculating cluster for given row
        
        
-       
+      tpcHit = (AliTPChit*)NextHit();
     } // end of loop over hits
   }   // end of loop over tracks 
   //write padrows to tree 
@@ -931,68 +1392,504 @@ void AliTPC::Hits2ExactClustersSector(Int_t isec)
  
 }
 
-//__________________________________________________________________  
-void AliTPC::Hits2Digits()  
-{ 
- //----------------------------------------------------
- // Loop over all sectors
- //----------------------------------------------------
 
-  if(fTPCParam == 0){
-    printf("AliTPCParam MUST be created firstly\n");
+
+//__
+void AliTPC::SDigits2Digits2(Int_t eventnumber)  
+{
+  //create digits from summable digits
+  GenerNoise(500000); //create teble with noise
+  char  sname[100];
+  char  dname[100];
+  sprintf(sname,"TreeS_%s_%d",fTPCParam->GetTitle(),eventnumber);
+  sprintf(dname,"TreeD_%s_%d",fTPCParam->GetTitle(),eventnumber);
+
+  //conect tree with sSDigits
+  TTree *t;
+  if (gAlice->GetTreeDFile()) {
+    t = (TTree *)gAlice->GetTreeDFile()->Get(sname); 
+  } else {
+    t = (TTree *)gDirectory->Get(sname); 
+  }
+  if (!t) {
+    cerr<<"TPC tree with sdigits not found"<<endl;
     return;
-  } 
+  }
+  AliSimDigits digarr, *dummy=&digarr;
+  t->GetBranch("Segment")->SetAddress(&dummy);
+  Stat_t nentries = t->GetEntries();
 
- for(Int_t isec=0;isec<fTPCParam->GetNSector();isec++) Hits2DigitsSector(isec);
+  // set zero suppression
 
-}
+  fTPCParam->SetZeroSup(2);
 
+  // get zero suppression
 
-//_____________________________________________________________________________
-void AliTPC::Hits2DigitsSector(Int_t isec)
-{
-  //-------------------------------------------------------------------
-  // TPC conversion from hits to digits.
-  //------------------------------------------------------------------- 
+  Int_t zerosup = fTPCParam->GetZeroSup();
 
-  //-----------------------------------------------------------------
-  // Origin: Marek Kowalski  IFJ, Krakow, Marek.Kowalski@ifj.edu.pl
-  //-----------------------------------------------------------------
+  //make tree with digits 
+  
+  AliTPCDigitsArray *arr = new AliTPCDigitsArray; 
+  arr->SetClass("AliSimDigits");
+  arr->Setup(fTPCParam);
+// Note that methods arr->MakeTree have different signatures
+  if (gAlice->GetTreeDFile()) {
+    arr->MakeTree(gAlice->GetTreeDFile());
+  } else {
+    arr->MakeTree(fDigitsFile);
+  }
+  
+  AliTPCParam * par =fTPCParam;
 
-  //-------------------------------------------------------
-  //  Get the access to the track hits
-  //-------------------------------------------------------
+  //Loop over segments of the TPC
 
+  for (Int_t n=0; n<nentries; n++) {
+    t->GetEvent(n);
+    Int_t sec, row;
+    if (!par->AdjustSectorRow(digarr.GetID(),sec,row)) {
+      cerr<<"AliTPC warning: invalid segment ID ! "<<digarr.GetID()<<endl;
+      continue;
+    }
+    if (!IsSectorActive(sec)) continue;
+    AliSimDigits * digrow =(AliSimDigits*) arr->CreateRow(sec,row);
+    Int_t nrows = digrow->GetNRows();
+    Int_t ncols = digrow->GetNCols();
 
-  TTree *tH = gAlice->TreeH(); // pointer to the hits tree
-  Stat_t ntracks = tH->GetEntries();
+    digrow->ExpandBuffer();
+    digarr.ExpandBuffer();
+    digrow->ExpandTrackBuffer();
+    digarr.ExpandTrackBuffer();
 
-  if( ntracks > 0){
+    
+    Short_t * pamp0 = digarr.GetDigits();
+    Int_t   * ptracks0 = digarr.GetTracks();
+    Short_t * pamp1 = digrow->GetDigits();
+    Int_t   * ptracks1 = digrow->GetTracks();
+    Int_t  nelems =nrows*ncols;
+    Int_t saturation = fTPCParam->GetADCSat();
+    //use internal structure of the AliDigits - for speed reason
+    //if you cahnge implementation
+    //of the Alidigits - it must be rewriten -
+    for (Int_t i= 0; i<nelems; i++){
+      //      Float_t q = *pamp0;
+      //q/=16.;  //conversion faktor
+      //Float_t noise= GetNoise(); 
+      //q+=noise;      
+      //q= TMath::Nint(q);
+      Float_t q = TMath::Nint(Float_t(*pamp0)/16.+GetNoise());
+      if (q>zerosup){
+       if (q>saturation) q=saturation;      
+       *pamp1=(Short_t)q;
+       //if (ptracks0[0]==0)
+       //  ptracks1[0]=1;
+       //else
+       ptracks1[0]=ptracks0[0];        
+       ptracks1[nelems]=ptracks0[nelems];
+       ptracks1[2*nelems]=ptracks0[2*nelems];
+      }
+      pamp0++;
+      pamp1++;
+      ptracks0++;
+      ptracks1++;       
+    }
 
-  //------------------------------------------- 
-  //  Only if there are any tracks...
-  //-------------------------------------------
+    arr->StoreRow(sec,row);
+    arr->ClearRow(sec,row);   
+    // cerr<<sec<<"\t"<<row<<"\n";   
+  }  
 
-    TObjArray **row;
     
-      printf("*** Processing sector number %d ***\n",isec);
+  //write results
 
-      Int_t nrows =fTPCParam->GetNRow(isec);
+  
+  arr->GetTree()->SetName(dname);  
+  arr->GetTree()->AutoSave();  
+  delete arr;
+}
+//_________________________________________
+void AliTPC::Merge(TTree * intree, Int_t *mask, Int_t nin, Int_t outid)
+{
+  
+  //intree - pointer to array of trees with s digits
+  //mask   - mask for each 
+  //nin    - number of inputs
+  //outid  - event  number of the output event
+
+  //create digits from summable digits 
+  //conect tree with sSDigits
+
+    
+  AliSimDigits ** digarr = new AliSimDigits*[nin];
+  for (Int_t i1=0;i1<nin; i1++){
+    digarr[i1]=0;
+    intree[i1].GetBranch("Segment")->SetAddress(&digarr[i1]);
+  }
+  Stat_t nentries = intree[0].GetEntries();
+  
+  //make tree with digits   
+  char  dname[100];
+  sprintf(dname,"TreeD_%s_%d",fTPCParam->GetTitle(),outid);
+  AliTPCDigitsArray *arr = new AliTPCDigitsArray; 
+  arr->SetClass("AliSimDigits");
+  arr->Setup(fTPCParam);
+  arr->MakeTree(fDigitsFile);  
+
+  // set zero suppression
+
+  fTPCParam->SetZeroSup(2);
+
+  // get zero suppression
+
+  Int_t zerosup = fTPCParam->GetZeroSup();
+
+
+  AliTPCParam * par =fTPCParam;
+
+  //Loop over segments of the TPC
+  for (Int_t n=0; n<nentries; n++) {
+    
+    for (Int_t i=0;i<nin; i++){ 
+      //connect proper digits
+      intree[i].GetEvent(n);      
+      digarr[i]->ExpandBuffer();
+      digarr[i]->ExpandTrackBuffer();
+    }      
+    Int_t sec, row;
+    if (!par->AdjustSectorRow(digarr[0]->GetID(),sec,row)) {
+      cerr<<"AliTPC warning: invalid segment ID ! "<<digarr[0]->GetID()<<endl;
+      continue;
+    }
+
+    AliSimDigits * digrow =(AliSimDigits*) arr->CreateRow(sec,row);
+    Int_t nrows = digrow->GetNRows();
+    Int_t ncols = digrow->GetNCols();
+
+    digrow->ExpandBuffer();
+    digrow->ExpandTrackBuffer();
+   
+    for (Int_t rows=0;rows<nrows; rows++){
+      for (Int_t col=0;col<ncols; col++){
+        Float_t q=0;
+        Int_t label[1000]; // i hope no more than 300 events merged
+        Int_t labptr = 0;
+        // looop over digits
+        for (Int_t i=0;i<nin; i++){ 
+          q  += digarr[i]->GetDigitFast(rows,col);
+          for (Int_t tr=0;tr<3;tr++) {
+            Int_t lab = digarr[i]->GetTrackIDFast(rows,col,tr);
+            if ( lab > 1) {
+              label[labptr]=lab+mask[i]-2;
+              labptr++;
+            }
+          }
+        }
+        //add noise
+        q = gRandom->Gaus(q,fTPCParam->GetNoise()*fTPCParam->GetNoiseNormFac()*16); 
+        
+        q/=16;  //conversion faktor
+        q=(Short_t)q;
+
+        if (q> zerosup){
+
+          if(q > fTPCParam->GetADCSat()) q = fTPCParam->GetADCSat();
+          digrow->SetDigitFast((Short_t)q,rows,col);  
+          for (Int_t tr=0;tr<3;tr++){
+            if (tr<labptr)
+              ((AliSimDigits*)digrow)->SetTrackIDFast(label[tr],rows,col,tr);
+            else
+              ((AliSimDigits*)digrow)->SetTrackIDFast(-1,rows,col,tr);
+          }
+        }
+      } 
+     }         
+      arr->StoreRow(sec,row);
+
+      arr->ClearRow(sec,row);   
+  }  
+  
+  delete digarr;
+  arr->GetTree()->SetName(dname); 
+  arr->GetTree()->Write(); 
+  delete arr;  
+  
+}
+
+/*_________________________________________
+void AliTPC::SDigits2Digits(Int_t eventnumber)
+{
+
+
+  cerr<<"Digitizing TPC...\n";
+
+  Hits2Digits(eventnumber);
+   
+    
+  //write results
+
+  //  char treeName[100];
+
+  //  sprintf(treeName,"TreeD_%s_%d",fTPCParam->GetTitle(),eventnumber);
+  
+  //  GetDigitsArray()->GetTree()->Write(treeName);  
+}
+*/
+//__________________________________________________________________
+void AliTPC::SetDefaults(){
+
+   
+   cerr<<"Setting default parameters...\n";
+
+  // Set response functions
+
+  AliTPCParamSR *param=(AliTPCParamSR*)gDirectory->Get("75x40_100x60");
+  if(param){
+    printf("You are using 2 pad-length geom hits with 3 pad-lenght geom digits...\n");
+    delete param;
+    param = new AliTPCParamSR();
+  }
+  else {
+    param=(AliTPCParamSR*)gDirectory->Get("75x40_100x60_150x60");
+  }
+  if(!param){
+    printf("No TPC parameters found\n");
+    exit(4);
+  }
+
+
+  AliTPCPRF2D    * prfinner   = new AliTPCPRF2D;
+  AliTPCPRF2D    * prfouter1   = new AliTPCPRF2D;
+  AliTPCPRF2D    * prfouter2   = new AliTPCPRF2D;  
+  AliTPCRF1D     * rf    = new AliTPCRF1D(kTRUE);
+  rf->SetGauss(param->GetZSigma(),param->GetZWidth(),1.);
+  rf->SetOffset(3*param->GetZSigma());
+  rf->Update();
+  
+  TDirectory *savedir=gDirectory;
+  TFile *f=TFile::Open("$ALICE_ROOT/TPC/AliTPCprf2d.root");
+  if (!f->IsOpen()) { 
+    cerr<<"Can't open $ALICE_ROOT/TPC/AliTPCprf2d.root !\n" ;
+     exit(3);
+  }
+  prfinner->Read("prf_07504_Gati_056068_d02");
+  prfouter1->Read("prf_10006_Gati_047051_d03");
+  prfouter2->Read("prf_15006_Gati_047051_d03");  
+  f->Close();
+  savedir->cd();
+
+  param->SetInnerPRF(prfinner);
+  param->SetOuter1PRF(prfouter1); 
+  param->SetOuter2PRF(prfouter2);
+  param->SetTimeRF(rf);
+
+  // set fTPCParam
+
+  SetParam(param);
+
+
+  fDefaults = 1;
+
+}
+//__________________________________________________________________  
+void AliTPC::Hits2Digits(Int_t eventnumber)  
+{ 
+ //----------------------------------------------------
+ // Loop over all sectors for a single event
+ //----------------------------------------------------
+
+
+  if(fDefaults == 0) SetDefaults();  // check if the parameters are set
+  GenerNoise(500000); //create teble with noise
+
+  //setup TPCDigitsArray 
+
+  if(GetDigitsArray()) delete GetDigitsArray();
+
+  AliTPCDigitsArray *arr = new AliTPCDigitsArray; 
+  arr->SetClass("AliSimDigits");
+  arr->Setup(fTPCParam);
+// Note that methods arr->MakeTree have different signatures
+  if (gAlice->GetTreeDFile()) {
+    arr->MakeTree(gAlice->GetTreeDFile());
+  } else {
+    arr->MakeTree(fDigitsFile);
+  }
+  SetDigitsArray(arr);
+
+  fDigitsSwitch=0; // standard digits
+
+  cerr<<"Digitizing TPC -- normal digits...\n";
+
+  for(Int_t isec=0;isec<fTPCParam->GetNSector();isec++) if (IsSectorActive(isec)) Hits2DigitsSector(isec); 
+   
+  // write results
+
+  char treeName[100];
+
+  sprintf(treeName,"TreeD_%s_%d",fTPCParam->GetTitle(),eventnumber);
+  
+  GetDigitsArray()->GetTree()->SetName(treeName);  
+  GetDigitsArray()->GetTree()->AutoSave();  
+
+
+}
+
+
+
+//__________________________________________________________________
+void AliTPC::Hits2SDigits2(Int_t eventnumber)  
+{ 
+
+  //-----------------------------------------------------------
+  //   summable digits - 16 bit "ADC", no noise, no saturation
+  //-----------------------------------------------------------
+
+ //----------------------------------------------------
+ // Loop over all sectors for a single event
+ //----------------------------------------------------
+
+
+  if(fDefaults == 0) SetDefaults();
+  GenerNoise(500000); //create table with noise
+  //setup TPCDigitsArray 
+
+  if(GetDigitsArray()) delete GetDigitsArray();
+
+  AliTPCDigitsArray *arr = new AliTPCDigitsArray; 
+  arr->SetClass("AliSimDigits");
+  arr->Setup(fTPCParam);
+// Note that methods arr->MakeTree have different signatures
+  if (gAlice->GetTreeSFile()) {
+    arr->MakeTree(gAlice->GetTreeSFile());
+  } else {
+    arr->MakeTree(fDigitsFile);
+  }
+  SetDigitsArray(arr);
+
+  cerr<<"Digitizing TPC -- summable digits...\n"; 
+
+  fDigitsSwitch=1; // summable digits
+  
+    // set zero suppression to "0"
+
+  fTPCParam->SetZeroSup(0);
+
+ for(Int_t isec=0;isec<fTPCParam->GetNSector();isec++) if (IsSectorActive(isec)) Hits2DigitsSector(isec);
+
+
+  // write results
+
+  char treeName[100];
+
+  sprintf(treeName,"TreeS_%s_%d",fTPCParam->GetTitle(),eventnumber);
+  
+  GetDigitsArray()->GetTree()->SetName(treeName); 
+  GetDigitsArray()->GetTree()->AutoSave(); 
+
+}
+
+
+
+//__________________________________________________________________
+void AliTPC::Hits2SDigits()  
+{ 
+
+  //-----------------------------------------------------------
+  //   summable digits - 16 bit "ADC", no noise, no saturation
+  //-----------------------------------------------------------
+
+ //----------------------------------------------------
+ // Loop over all sectors for a single event
+ //----------------------------------------------------
+  //MI change - for pp run
+  Int_t eventnumber = gAlice->GetEvNumber();
+
+  if(fDefaults == 0) SetDefaults();
+  GenerNoise(500000); //create table with noise
+
+  //setup TPCDigitsArray 
+
+  if(GetDigitsArray()) delete GetDigitsArray();
+
+  AliTPCDigitsArray *arr = new AliTPCDigitsArray; 
+  arr->SetClass("AliSimDigits");
+  arr->Setup(fTPCParam);
+// Note that methods arr->MakeTree have different signatures
+  if (gAlice->GetTreeSFile()) {
+    arr->MakeTree(gAlice->GetTreeSFile());
+  } else {
+    arr->MakeTree(fDigitsFile);
+  }
+  SetDigitsArray(arr);
+
+  cerr<<"Digitizing TPC -- summable digits...\n"; 
+
+  //  fDigitsSwitch=1; // summable digits  -for the moment direct
+
+  for(Int_t isec=0;isec<fTPCParam->GetNSector();isec++) if (IsSectorActive(isec)) Hits2DigitsSector(isec);
 
-      row= new TObjArray* [nrows];
+
+  // write results
+  char treeName[100];
+
+  sprintf(treeName,"TreeD_%s_%d",fTPCParam->GetTitle(),eventnumber);
+  
+  GetDigitsArray()->GetTree()->SetName(treeName); 
+  GetDigitsArray()->GetTree()->AutoSave(); 
+
+}
+
+
+//_____________________________________________________________________________
+void AliTPC::Hits2DigitsSector(Int_t isec)
+{
+  //-------------------------------------------------------------------
+  // TPC conversion from hits to digits.
+  //------------------------------------------------------------------- 
+
+  //-----------------------------------------------------------------
+  // Origin: Marek Kowalski  IFJ, Krakow, Marek.Kowalski@ifj.edu.pl
+  //-----------------------------------------------------------------
+
+  //-------------------------------------------------------
+  //  Get the access to the track hits
+  //-------------------------------------------------------
+
+  // check if the parameters are set - important if one calls this method
+  // directly, not from the Hits2Digits
+
+  if(fDefaults == 0) SetDefaults();
+
+  TTree *tH = gAlice->TreeH(); // pointer to the hits tree
+  Stat_t ntracks = tH->GetEntries();
+
+  if( ntracks > 0){
+
+  //------------------------------------------- 
+  //  Only if there are any tracks...
+  //-------------------------------------------
+
+    TObjArray **row;
+    
+    //printf("*** Processing sector number %d ***\n",isec);
+
+      Int_t nrows =fTPCParam->GetNRow(isec);
+
+      row= new TObjArray* [nrows+2]; // 2 extra rows for cross talk
     
       MakeSector(isec,nrows,tH,ntracks,row);
 
       //--------------------------------------------------------
       //   Digitize this sector, row by row
-      //   row[i] is the pointer to the TObjArray of TVectors,
+      //   row[i] is the pointer to the TObjArray of AliTPCFastVectors,
       //   each one containing electrons accepted on this
       //   row, assigned into tracks
       //--------------------------------------------------------
 
       Int_t i;
 
-      if (fDigitsArray->GetTree()==0) fDigitsArray->MakeTree();
+      if (fDigitsArray->GetTree()==0) fDigitsArray->MakeTree(fDigitsFile);
 
       for (i=0;i<nrows;i++){
 
@@ -1003,16 +1900,16 @@ void AliTPC::Hits2DigitsSector(Int_t isec)
        fDigitsArray->StoreRow(isec,i);
 
        Int_t ndig = dig->GetDigitSize(); 
-       printf("*** Sector, row, compressed digits %d %d %d ***\n",isec,i,ndig);
-       
+       if (gDebug > 10) printf("*** Sector, row, compressed digits %d %d %d ***\n",isec,i,ndig);        
+       
         fDigitsArray->ClearRow(isec,i);  
 
    
        } // end of the sector digitization
 
-      for(i=0;i<nrows;i++){
-        row[i]->Delete();     
+      for(i=0;i<nrows+2;i++){
+        row[i]->Delete();  
+        delete row[i];   
       }
       
        delete [] row; // delete the array of pointers to TObjArray-s
@@ -1037,7 +1934,7 @@ void AliTPC::DigitizeRow(Int_t irow,Int_t isec,TObjArray **rows)
  
 
   Float_t zerosup = fTPCParam->GetZeroSup();
-  Int_t nrows =fTPCParam->GetNRow(isec);
+  //  Int_t nrows =fTPCParam->GetNRow(isec);
   fCurrentIndex[1]= isec;
   
 
@@ -1048,10 +1945,11 @@ void AliTPC::DigitizeRow(Int_t irow,Int_t isec,TObjArray **rows)
   //  Integrated signal for this row
   //  and a single track signal
   //    
-  TMatrix *m1   = new TMatrix(0,nofPads,0,nofTbins); // integrated
-  TMatrix *m2   = new TMatrix(0,nofPads,0,nofTbins); // single
+
+  AliTPCFastMatrix *m1 = new AliTPCFastMatrix(0,nofPads,0,nofTbins); // integrated
+  AliTPCFastMatrix *m2 = new AliTPCFastMatrix(0,nofPads,0,nofTbins); // single
   //
-  TMatrix &total  = *m1;
+  AliTPCFastMatrix &total  = *m1;
 
   //  Array of pointers to the label-signal list
 
@@ -1064,14 +1962,16 @@ void AliTPC::DigitizeRow(Int_t irow,Int_t isec,TObjArray **rows)
   //
   //calculate signal 
   //
-  Int_t row1 = TMath::Max(irow-fTPCParam->GetNCrossRows(),0);
-  Int_t row2 = TMath::Min(irow+fTPCParam->GetNCrossRows(),nrows-1);
+  //Int_t row1 = TMath::Max(irow-fTPCParam->GetNCrossRows(),0);
+  //Int_t row2 = TMath::Min(irow+fTPCParam->GetNCrossRows(),nrows-1);
+  Int_t row1=irow;
+  Int_t row2=irow+2; 
   for (Int_t row= row1;row<=row2;row++){
     Int_t nTracks= rows[row]->GetEntries();
     for (i1=0;i1<nTracks;i1++){
       fCurrentIndex[2]= row;
-      fCurrentIndex[3]=irow;
-      if (row==irow){
+      fCurrentIndex[3]=irow+1;
+      if (row==irow+1){
        m2->Zero();  // clear single track signal matrix
        Float_t trackLabel = GetSignal(rows[row],i1,m2,m1,indexRange); 
        GetList(trackLabel,nofPads,m2,indexRange,pList);
@@ -1083,26 +1983,35 @@ void AliTPC::DigitizeRow(Int_t irow,Int_t isec,TObjArray **rows)
   Int_t tracks[3];
 
   AliDigits *dig = fDigitsArray->GetRow(isec,irow);
-  for(Int_t ip=0;ip<nofPads;ip++){
-    for(Int_t it=0;it<nofTbins;it++){
-
-      Float_t q = total(ip,it);
-
-      Int_t gi =it*nofPads+ip; // global index
+  Int_t gi=-1;
+  Float_t fzerosup = zerosup+0.5;
+  for(Int_t it=0;it<nofTbins;it++){
+    Float_t *pq = &(total.UncheckedAt(0,it));
+    for(Int_t ip=0;ip<nofPads;ip++){
+      gi++;
+      Float_t q=*pq;      
+      pq++;
+      if(fDigitsSwitch == 0){
+       q+=GetNoise();
+        if(q <=fzerosup) continue; // do not fill zeros
+        q = TMath::Nint(q);
+        if(q > fTPCParam->GetADCSat()) q = fTPCParam->GetADCSat();  // saturation
 
-      q = gRandom->Gaus(q,fTPCParam->GetNoise()*fTPCParam->GetNoiseNormFac()); 
-
-      q = (Int_t)q;
+      }
 
-      if(q <=zerosup) continue; // do not fill zeros
-      if(q > fTPCParam->GetADCSat()) q = fTPCParam->GetADCSat();  // saturation
+      else {
+       if(q <= 0.) continue; // do not fill zeros
+       if(q>2000.) q=2000.;
+       q *= 16.;
+       q = TMath::Nint(q);
+      }
 
       //
       //  "real" signal or electronic noise (list = -1)?
       //    
 
       for(Int_t j1=0;j1<3;j1++){
-        tracks[j1] = (pList[gi]) ?(Int_t)(*(pList[gi]+j1)) : -1;
+       tracks[j1] = (pList[gi]) ?(Int_t)(*(pList[gi]+j1)) : -2;
       }
 
 //Begin_Html
@@ -1141,8 +2050,8 @@ void AliTPC::DigitizeRow(Int_t irow,Int_t isec,TObjArray **rows)
 
 //_____________________________________________________________________________
 
-Float_t AliTPC::GetSignal(TObjArray *p1, Int_t ntr, TMatrix *m1, TMatrix *m2,
-                          Int_t *indexRange)
+Float_t AliTPC::GetSignal(TObjArray *p1, Int_t ntr, 
+             AliTPCFastMatrix *m1, AliTPCFastMatrix *m2,Int_t *indexRange)
 {
 
   //---------------------------------------------------------------
@@ -1156,13 +2065,13 @@ Float_t AliTPC::GetSignal(TObjArray *p1, Int_t ntr, TMatrix *m1, TMatrix *m2,
   // Modified: Marian Ivanov 
   //-----------------------------------------------------------------
 
-  TVector *tv;
-  tv = (TVector*)p1->At(ntr); // pointer to a track
-  TVector &v = *tv;
+  AliTPCFastVector *tv;
+
+  tv = (AliTPCFastVector*)p1->At(ntr); // pointer to a track
+  AliTPCFastVector &v = *tv;
   
   Float_t label = v(0);
-  Int_t centralPad = (fTPCParam->GetNPads(fCurrentIndex[1],fCurrentIndex[3])-1)/2;
+  Int_t centralPad = (fTPCParam->GetNPads(fCurrentIndex[1],fCurrentIndex[3]-1)-1)/2;
 
   Int_t nElectrons = (tv->GetNrows()-1)/4;
   indexRange[0]=9999; // min pad
@@ -1170,10 +2079,8 @@ Float_t AliTPC::GetSignal(TObjArray *p1, Int_t ntr, TMatrix *m1, TMatrix *m2,
   indexRange[2]=9999; //min time
   indexRange[3]=-1; // max time
 
-  //  Float_t IneffFactor = 0.5; // inefficiency in the gain close to the edge, as above
-
-  TMatrix &signal = *m1;
-  TMatrix &total = *m2;
+  AliTPCFastMatrix &signal = *m1;
+  AliTPCFastMatrix &total = *m2;
   //
   //  Loop over all electrons
   //
@@ -1182,22 +2089,28 @@ Float_t AliTPC::GetSignal(TObjArray *p1, Int_t ntr, TMatrix *m1, TMatrix *m2,
     Float_t aval =  v(idx+4);
     Float_t eltoadcfac=aval*fTPCParam->GetTotalNormFac(); 
     Float_t xyz[3]={v(idx+1),v(idx+2),v(idx+3)};
-    Int_t n = fTPCParam->CalcResponse(xyz,fCurrentIndex,fCurrentIndex[3]);
-    
-    if (n>0) for (Int_t i =0; i<n; i++){
-       Int_t *index = fTPCParam->GetResBin(i);        
+    Int_t n = ((AliTPCParamSR*)fTPCParam)->CalcResponseFast(xyz,fCurrentIndex,fCurrentIndex[3]);
+
+    Int_t *index = fTPCParam->GetResBin(0);  
+    Float_t *weight = & (fTPCParam->GetResWeight(0));
+
+    if (n>0) for (Int_t i =0; i<n; i++){       
        Int_t pad=index[1]+centralPad;  //in digit coordinates central pad has coordinate 0
-       if ( ( pad<(fTPCParam->GetNPads(fCurrentIndex[1],fCurrentIndex[3]))) && (pad>0)) {
+
+         if (pad>=0){
         Int_t time=index[2];    
-        Float_t weight = fTPCParam->GetResWeight(i); //we normalise response to ADC channel
-        weight *= eltoadcfac;
+         Float_t qweight = *(weight)*eltoadcfac;
         
-        if (m1!=0) signal(pad,time)+=weight; 
-        total(pad,time)+=weight;
-        indexRange[0]=TMath::Min(indexRange[0],pad);
-        indexRange[1]=TMath::Max(indexRange[1],pad);
-        indexRange[2]=TMath::Min(indexRange[2],time);
-        indexRange[3]=TMath::Max(indexRange[3],time); 
+        if (m1!=0) signal.UncheckedAt(pad,time)+=qweight;
+         total.UncheckedAt(pad,time)+=qweight;
+        if (indexRange[0]>pad) indexRange[0]=pad;
+        if (indexRange[1]<pad) indexRange[1]=pad;
+        if (indexRange[2]>time) indexRange[2]=time;
+        if (indexRange[3]<time) indexRange[3]=time;
+
+        index+=3;
+        weight++;      
+
        }        
     }
   } // end of loop over electrons
@@ -1206,8 +2119,8 @@ Float_t AliTPC::GetSignal(TObjArray *p1, Int_t ntr, TMatrix *m1, TMatrix *m2,
 }
 
 //_____________________________________________________________________________
-void AliTPC::GetList(Float_t label,Int_t np,TMatrix *m,Int_t *indexRange,
-                     Float_t **pList)
+void AliTPC::GetList(Float_t label,Int_t np,AliTPCFastMatrix *m,
+                     Int_t *indexRange, Float_t **pList)
 {
   //----------------------------------------------------------------------
   //  Updates the list of tracks contributing to digits for a given row
@@ -1217,7 +2130,7 @@ void AliTPC::GetList(Float_t label,Int_t np,TMatrix *m,Int_t *indexRange,
   // Origin: Marek Kowalski  IFJ, Krakow, Marek.Kowalski@ifj.edu.pl
   //-----------------------------------------------------------------
 
-  TMatrix &signal = *m;
+  AliTPCFastMatrix &signal = *m;
 
   // lop over nonzero digits
 
@@ -1317,21 +2230,29 @@ void AliTPC::MakeSector(Int_t isec,Int_t nrows,TTree *TH,
   Float_t xyz[4]; 
 
   AliTPChit *tpcHit; // pointer to a sigle TPC hit    
+  //MI change
+  TBranch * branch=0;
+  if (fHitType>1) branch = TH->GetBranch("TPC2");
+  else branch = TH->GetBranch("TPC");
+
  
   //----------------------------------------------
   // Create TObjArray-s, one for each row,
-  // each TObjArray will store the TVectors
-  // of electrons, one TVector per each track.
+  // each TObjArray will store the AliTPCFastVectors
+  // of electrons, one AliTPCFastVectors per each track.
   //---------------------------------------------- 
     
-  Int_t *nofElectrons = new Int_t [nrows]; // electron counter for each row
-  TVector **tracks = new TVector* [nrows]; //pointers to the track vectors
-  for(i=0; i<nrows; i++){
+  Int_t *nofElectrons = new Int_t [nrows+2]; // electron counter for each row
+  AliTPCFastVector **tracks = new AliTPCFastVector* [nrows+2]; //pointers to the track vectors
+
+  for(i=0; i<nrows+2; i++){
     row[i] = new TObjArray;
     nofElectrons[i]=0;
     tracks[i]=0;
   }
 
+
   //--------------------------------------------------------------------
   //  Loop over tracks, the "track" contains the full history
   //--------------------------------------------------------------------
@@ -1340,46 +2261,53 @@ void AliTPC::MakeSector(Int_t isec,Int_t nrows,TTree *TH,
   previousTrack = -1; // nothing to store so far!
 
   for(Int_t track=0;track<ntracks;track++){
-
+    Bool_t isInSector=kTRUE;
     ResetHits();
+    isInSector = TrackInVolume(isec,track);
+    if (!isInSector) continue;
+    //MI change
+    branch->GetEntry(track); // get next track
 
-    TH->GetEvent(track); // get next track
-    Int_t nhits = fHits->GetEntriesFast(); // get number of hits for this track
+    //M.I. changes
 
-    if(nhits == 0) continue; // no hits in the TPC for this track
+    tpcHit = (AliTPChit*)FirstHit(-1);
 
     //--------------------------------------------------------------
     //  Loop over hits
     //--------------------------------------------------------------
 
-    for(Int_t hit=0;hit<nhits;hit++){
 
-      tpcHit = (AliTPChit*)fHits->UncheckedAt(hit); // get a pointer to a hit
+    while(tpcHit){
       
       Int_t sector=tpcHit->fSector; // sector number
-      if(sector != isec) continue; 
+      if(sector != isec){
+       tpcHit = (AliTPChit*) NextHit();
+       continue; 
+      }
+
+       currentTrack = tpcHit->Track(); // track number
+
 
-       currentTrack = tpcHit->fTrack; // track number
         if(currentTrack != previousTrack){
                           
            // store already filled fTrack
               
-          for(i=0;i<nrows;i++){
+          for(i=0;i<nrows+2;i++){
              if(previousTrack != -1){
               if(nofElectrons[i]>0){
-                TVector &v = *tracks[i];
+                 AliTPCFastVector &v = *tracks[i];
                 v(0) = previousTrack;
                  tracks[i]->ResizeTo(4*nofElectrons[i]+1); // shrink if necessary
                 row[i]->Add(tracks[i]);                     
               }
                else{
-                 delete tracks[i]; // delete empty TVector
+                 delete tracks[i]; // delete empty AliTPCFastVector
                  tracks[i]=0;
               }
             }
 
              nofElectrons[i]=0;
-             tracks[i] = new TVector(481); // TVectors for the next fTrack
+             tracks[i] = new AliTPCFastVector(481); // AliTPCFastVectors for the next fTrack
 
           } // end of loop over rows
               
@@ -1393,7 +2321,7 @@ void AliTPC::MakeSector(Int_t isec,Int_t nrows,TTree *TH,
        //---------------------------------------------------
 
 
-        Float_t time = 1.e6*(fTPCParam->GetZLength()-TMath::Abs(tpcHit->fZ))
+        Float_t time = 1.e6*(fTPCParam->GetZLength()-TMath::Abs(tpcHit->Z()))
                                                         /fTPCParam->GetDriftV(); 
        // in microseconds!     
        Float_t attProb = fTPCParam->GetAttCoef()*
@@ -1407,19 +2335,39 @@ void AliTPC::MakeSector(Int_t isec,Int_t nrows,TTree *TH,
         for(Int_t nel=0;nel<qI;nel++){
           // skip if electron lost due to the attachment
           if((gRandom->Rndm(0)) < attProb) continue; // electron lost!
-         xyz[0]=tpcHit->fX;
-         xyz[1]=tpcHit->fY;
-         xyz[2]=tpcHit->fZ;      
-         xyz[3]= (Float_t) (-gasgain*TMath::Log(gRandom->Rndm()));
+         xyz[0]=tpcHit->X();
+         xyz[1]=tpcHit->Y();
+         xyz[2]=tpcHit->Z();   
+         //
+         // protection for the nonphysical avalanche size (10**6 maximum)
+         //  
+          Double_t rn=TMath::Max(gRandom->Rndm(0),1.93e-22);
+         xyz[3]= (Float_t) (-gasgain*TMath::Log(rn)); 
          index[0]=1;
          
-         TransportElectron(xyz,index); //MI change -august       
+         TransportElectron(xyz,index);    
          Int_t rowNumber;
-         fTPCParam->GetPadRow(xyz,index); //MI change august
-         rowNumber = index[2];
+         fTPCParam->GetPadRow(xyz,index); 
+         // row 0 - cross talk from the innermost row
+         // row fNRow+1 cross talk from the outermost row
+         rowNumber = index[2]+1; 
          //transform position to local digit coordinates
          //relative to nearest pad row 
-         if ((rowNumber<0)||rowNumber>=fTPCParam->GetNRow(isec)) continue;       
+         if ((rowNumber<0)||rowNumber>fTPCParam->GetNRow(isec)+1) continue;
+          Float_t x1,y1;
+         if (isec <fTPCParam->GetNInnerSector()) {
+           x1 = xyz[1]*fTPCParam->GetInnerPadPitchWidth();
+           y1 = fTPCParam->GetYInner(rowNumber);
+         }
+         else{
+           x1=xyz[1]*fTPCParam->GetOuterPadPitchWidth();
+           y1 = fTPCParam->GetYOuter(rowNumber);
+         }
+         // gain inefficiency at the wires edges - linear
+         x1=TMath::Abs(x1);
+         y1-=1.;
+          if(x1>y1) xyz[3]*=TMath::Max(1.e-6,(y1-x1+1.));      
+       
          nofElectrons[rowNumber]++;      
          //----------------------------------
          // Expand vector if necessary
@@ -1432,14 +2380,14 @@ void AliTPC::MakeSector(Int_t isec,Int_t nrows,TTree *TH,
            }
          }
          
-         TVector &v = *tracks[rowNumber];
+          AliTPCFastVector &v = *tracks[rowNumber];
          Int_t idx = 4*nofElectrons[rowNumber]-3;
-
-         v(idx)=  xyz[0];   // X - pad row coordinate
-         v(idx+1)=xyz[1];   // Y - pad coordinate (along the pad-row)
-          v(idx+2)=xyz[2];   // Z - time bin coordinate
-         v(idx+3)=xyz[3];   // avalanche size  
+         Real_t * position = &(((AliTPCFastVector&)v).UncheckedAt(idx)); //make code faster
+         memcpy(position,xyz,4*sizeof(Float_t));
        } // end of loop over electrons
+
+        tpcHit = (AliTPChit*)NextHit();
         
       } // end of loop over hits
     } // end of loop over tracks
@@ -1448,9 +2396,9 @@ void AliTPC::MakeSector(Int_t isec,Int_t nrows,TTree *TH,
     //   store remaining track (the last one) if not empty
     //
 
-     for(i=0;i<nrows;i++){
+     for(i=0;i<nrows+2;i++){
        if(nofElectrons[i]>0){
-          TVector &v = *tracks[i];
+          AliTPCFastVector &v = *tracks[i];
          v(0) = previousTrack;
           tracks[i]->ResizeTo(4*nofElectrons[i]+1); // shrink if necessary
          row[i]->Add(tracks[i]);  
@@ -1476,18 +2424,20 @@ void AliTPC::Init()
   //
   Int_t i;
   //
-  printf("\n");
-  for(i=0;i<35;i++) printf("*");
-  printf(" TPC_INIT ");
-  for(i=0;i<35;i++) printf("*");
-  printf("\n");
-  //
-  for(i=0;i<80;i++) printf("*");
-  printf("\n");
+  if(fDebug) {
+    printf("\n%s: ",ClassName());
+    for(i=0;i<35;i++) printf("*");
+    printf(" TPC_INIT ");
+    for(i=0;i<35;i++) printf("*");
+    printf("\n%s: ",ClassName());
+    //
+    for(i=0;i<80;i++) printf("*");
+    printf("\n");
+  }
 }
 
 //_____________________________________________________________________________
-void AliTPC::MakeBranch(Option_t* option)
+void AliTPC::MakeBranch(Option_t* option, const char *file)
 {
   //
   // Create Tree branches for the TPC.
@@ -1496,14 +2446,16 @@ void AliTPC::MakeBranch(Option_t* option)
   char branchname[10];
   sprintf(branchname,"%s",GetName());
 
-  AliDetector::MakeBranch(option);
+  AliDetector::MakeBranch(option,file);
 
-  char *d = strstr(option,"D");
+  const char *d = strstr(option,"D");
 
   if (fDigits   && gAlice->TreeD() && d) {
-    gAlice->TreeD()->Branch(branchname,&fDigits, buffersize);
-    printf("Making Branch %s for digits\n",branchname);
+      MakeBranchInTree(gAlice->TreeD(), 
+                       branchname, &fDigits, buffersize, file);
   }    
+
+  if (fHitType>1) MakeBranch2(option,file); // MI change 14.09.2000
 }
  
 //_____________________________________________________________________________
@@ -1605,6 +2557,7 @@ void AliTPC::SetSens(Int_t sens)
 
   fSens = sens;
 }
+
  
 void AliTPC::SetSide(Float_t side=0.)
 {
@@ -1660,30 +2613,10 @@ void AliTPC::TransportElectron(Float_t *xyz, Int_t *index)
   // ExB
   
   if (fTPCParam->GetMWPCReadout()==kTRUE){
-    Float_t x1=xyz[0];
-    fTPCParam->Transform2to2NearestWire(xyz,index);
-    Float_t dx=xyz[0]-x1;
+    Float_t dx = fTPCParam->Transform2to2NearestWire(xyz,index);
     xyz[1]+=dx*(fTPCParam->GetOmegaTau());
   }
-  //add nonisochronity (not implemented yet)
-  
-}
-//_____________________________________________________________________________
-void AliTPC::Streamer(TBuffer &R__b)
-{
-  //
-  // Stream an object of class AliTPC.
-  //
-   if (R__b.IsReading()) {
-      Version_t R__v = R__b.ReadVersion(); if (R__v) { }
-      AliDetector::Streamer(R__b);
-      if (R__v < 2) return;
-      R__b >> fNsectors;
-   } else {
-      R__b.WriteVersion(AliTPC::IsA());
-      AliDetector::Streamer(R__b);
-      R__b << fNsectors;
-   }
+  //add nonisochronity (not implemented yet)  
 }
   
 ClassImp(AliTPCdigit)
@@ -1721,3 +2654,671 @@ AliHit(shunt,track)
 }
  
 
+//________________________________________________________________________
+// Additional code because of the AliTPCTrackHitsV2
+
+void AliTPC::MakeBranch2(Option_t *option,const char *file)
+{
+  //
+  // Create a new branch in the current Root Tree
+  // The branch of fHits is automatically split
+  // MI change 14.09.2000
+  if (fHitType<2) return;
+  char branchname[10];
+  sprintf(branchname,"%s2",GetName());  
+  //
+  // Get the pointer to the header
+  const char *cH = strstr(option,"H");
+  //
+  if (fTrackHits   && gAlice->TreeH() && cH && fHitType&4) {    
+    //    AliObjectBranch * branch = new AliObjectBranch(branchname,"AliTPCTrackHitsV2",&fTrackHits, 
+    //                                            gAlice->TreeH(),fBufferSize,99);
+    //TBranch * branch = 
+    gAlice->TreeH()->Branch(branchname,"AliTPCTrackHitsV2",&fTrackHits, 
+                                                  fBufferSize,99);
+
+    // gAlice->TreeH()->GetListOfBranches()->Add(branch);
+    if (GetDebug()>1) 
+      printf("* AliDetector::MakeBranch * Making Branch %s for trackhits\n",branchname);
+    const char folder [] = "RunMC/Event/Data";
+    if (GetDebug())
+      printf("%15s: Publishing %s to %s\n",ClassName(),branchname,folder);
+    Publish(folder,&fTrackHits,branchname);
+    if (file) {
+        TBranch *b = gAlice->TreeH()->GetBranch(branchname);
+        TDirectory *wd = gDirectory;
+        b->SetFile(file);
+        TIter next( b->GetListOfBranches());
+        while ((b=(TBranch*)next())) {
+         b->SetFile(file);
+        }
+        wd->cd(); 
+        if (GetDebug()>1) 
+             cout << "Diverting branch " << branchname << " to file " << file << endl;  
+    }
+  }    
+
+  if (fTrackHitsOld   && gAlice->TreeH() && cH && fHitType&2) {    
+    AliObjectBranch * branch = new AliObjectBranch(branchname,"AliTPCTrackHits",&fTrackHitsOld, 
+                                                  gAlice->TreeH(),fBufferSize,99);
+    //TBranch * branch = gAlice->TreeH()->Branch(branchname,"AliTPCTrackHitsV2",&fTrackHits, 
+    //                                                    fBufferSize,99);
+
+    gAlice->TreeH()->GetListOfBranches()->Add(branch);
+    if (GetDebug()>1) 
+      printf("* AliDetector::MakeBranch * Making Branch %s for trackhits\n",branchname);
+    const char folder [] = "RunMC/Event/Data";
+    if (GetDebug())
+      printf("%15s: Publishing %s to %s\n",ClassName(),branchname,folder);
+    Publish(folder,&fTrackHitsOld,branchname);
+    if (file) {
+        TBranch *b = gAlice->TreeH()->GetBranch(branchname);
+        TDirectory *wd = gDirectory;
+        b->SetFile(file);
+        TIter next( b->GetListOfBranches());
+        while ((b=(TBranch*)next())) {
+         b->SetFile(file);
+        }
+        wd->cd(); 
+        if (GetDebug()>1) 
+             cout << "Diverting branch " << branchname << " to file " << file << endl;  
+    }
+  }    
+}
+
+void AliTPC::SetTreeAddress()
+{
+  if (fHitType<=1) AliDetector::SetTreeAddress();
+  if (fHitType>1) SetTreeAddress2();
+}
+
+void AliTPC::SetTreeAddress2()
+{
+  //
+  // Set branch address for the TrackHits Tree
+  // 
+  TBranch *branch;
+  char branchname[20];
+  sprintf(branchname,"%s2",GetName());
+  //
+  // Branch address for hit tree
+  TTree *treeH = gAlice->TreeH();
+  if ((treeH)&&(fHitType&4)) {
+    branch = treeH->GetBranch(branchname);
+    if (branch) branch->SetAddress(&fTrackHits);
+  }
+  if ((treeH)&&(fHitType&2)) {
+    branch = treeH->GetBranch(branchname);
+    if (branch) branch->SetAddress(&fTrackHitsOld);
+  }
+  //set address to TREETR
+  TTree *treeTR = gAlice->TreeTR();
+  if (treeTR && fTrackReferences) {
+    branch = treeTR->GetBranch(GetName());
+    if (branch) branch->SetAddress(&fTrackReferences);
+  }
+
+
+}
+
+void AliTPC::FinishPrimary()
+{
+  if (fTrackHits &&fHitType&4)      fTrackHits->FlushHitStack();  
+  if (fTrackHitsOld && fHitType&2)  fTrackHitsOld->FlushHitStack();  
+}
+
+
+void AliTPC::AddHit2(Int_t track, Int_t *vol, Float_t *hits)
+{ 
+  //
+  // add hit to the list  
+  Int_t rtrack;
+  if (fIshunt) {
+    int primary = gAlice->GetPrimary(track);
+    gAlice->Particle(primary)->SetBit(kKeepBit);
+    rtrack=primary;
+  } else {
+    rtrack=track;
+    gAlice->FlagTrack(track);
+  }  
+  //AliTPChit *hit = (AliTPChit*)fHits->UncheckedAt(fNhits-1);
+  //if (hit->fTrack!=rtrack)
+  //  cout<<"bad track number\n";
+  if (fTrackHits && fHitType&4) 
+    fTrackHits->AddHitKartez(vol[0],rtrack, hits[0],
+                            hits[1],hits[2],(Int_t)hits[3]);
+  if (fTrackHitsOld &&fHitType&2 ) 
+    fTrackHitsOld->AddHitKartez(vol[0],rtrack, hits[0],
+                            hits[1],hits[2],(Int_t)hits[3]);
+  
+}
+
+void AliTPC::ResetHits()
+{
+  if (fHitType&1) AliDetector::ResetHits();
+  if (fHitType>1) ResetHits2();
+}
+
+void AliTPC::ResetHits2()
+{
+  //
+  //reset hits
+  if (fTrackHits && fHitType&4) fTrackHits->Clear();
+  if (fTrackHitsOld && fHitType&2) fTrackHitsOld->Clear();
+
+}   
+
+AliHit* AliTPC::FirstHit(Int_t track)
+{
+  if (fHitType>1) return FirstHit2(track);
+  return AliDetector::FirstHit(track);
+}
+AliHit* AliTPC::NextHit()
+{
+  if (fHitType>1) return NextHit2();
+  
+  return AliDetector::NextHit();
+}
+
+AliHit* AliTPC::FirstHit2(Int_t track)
+{
+  //
+  // Initialise the hit iterator
+  // Return the address of the first hit for track
+  // If track>=0 the track is read from disk
+  // while if track<0 the first hit of the current
+  // track is returned
+  // 
+  if(track>=0) {
+    gAlice->ResetHits();
+    gAlice->TreeH()->GetEvent(track);
+  }
+  //
+  if (fTrackHits && fHitType&4) {
+    fTrackHits->First();
+    return fTrackHits->GetHit();
+  }
+  if (fTrackHitsOld && fHitType&2) {
+    fTrackHitsOld->First();
+    return fTrackHitsOld->GetHit();
+  }
+
+  else return 0;
+}
+
+AliHit* AliTPC::NextHit2()
+{
+  //
+  //Return the next hit for the current track
+
+
+  if (fTrackHitsOld && fHitType&2) {
+    fTrackHitsOld->Next();
+    return fTrackHitsOld->GetHit();
+  }
+  if (fTrackHits) {
+    fTrackHits->Next();
+    return fTrackHits->GetHit();
+  }
+  else 
+    return 0;
+}
+
+void AliTPC::LoadPoints(Int_t)
+{
+  //
+  Int_t a = 0;
+  /*  if(fHitType==1) return AliDetector::LoadPoints(a);
+  LoadPoints2(a);
+  */
+  if(fHitType==1) AliDetector::LoadPoints(a);
+  else LoadPoints2(a);
+   
+  // LoadPoints3(a);
+
+}
+
+
+void AliTPC::RemapTrackHitIDs(Int_t *map)
+{
+  if (!fTrackHits) return;
+  
+  if (fTrackHitsOld && fHitType&2){
+    AliObjectArray * arr = fTrackHitsOld->fTrackHitsInfo;
+    for (UInt_t i=0;i<arr->GetSize();i++){
+      AliTrackHitsInfo * info = (AliTrackHitsInfo *)(arr->At(i));
+      info->fTrackID = map[info->fTrackID];
+    }
+  }
+  if (fTrackHitsOld && fHitType&4){
+    TClonesArray * arr = fTrackHits->GetArray();;
+    for (Int_t i=0;i<arr->GetEntriesFast();i++){
+      AliTrackHitsParamV2 * info = (AliTrackHitsParamV2 *)(arr->At(i));
+      info->fTrackID = map[info->fTrackID];
+    }
+  }
+}
+
+Bool_t   AliTPC::TrackInVolume(Int_t id,Int_t track)
+{
+  //return bool information - is track in given volume
+  //load only part of the track information 
+  //return true if current track is in volume
+  //
+  //  return kTRUE;
+  if (fTrackHitsOld && fHitType&2) {
+    TBranch * br = gAlice->TreeH()->GetBranch("fTrackHitsInfo");
+    br->GetEvent(track);
+    AliObjectArray * ar = fTrackHitsOld->fTrackHitsInfo;
+    for (UInt_t j=0;j<ar->GetSize();j++){
+      if (  ((AliTrackHitsInfo*)ar->At(j))->fVolumeID==id) return kTRUE;
+    } 
+  }
+
+  if (fTrackHits && fHitType&4) {
+    TBranch * br1 = gAlice->TreeH()->GetBranch("fVolumes");
+    TBranch * br2 = gAlice->TreeH()->GetBranch("fNVolumes");    
+    br2->GetEvent(track);
+    br1->GetEvent(track);    
+    Int_t *volumes = fTrackHits->GetVolumes();
+    Int_t nvolumes = fTrackHits->GetNVolumes();
+    if (!volumes && nvolumes>0) {
+      printf("Problematic track\t%d\t%d",track,nvolumes);
+      return kFALSE;
+    }
+    for (Int_t j=0;j<nvolumes; j++)
+      if (volumes[j]==id) return kTRUE;    
+  }
+
+  if (fHitType&1) {
+    TBranch * br = gAlice->TreeH()->GetBranch("fSector");
+    br->GetEvent(track);
+    for (Int_t j=0;j<fHits->GetEntriesFast();j++){
+      if (  ((AliTPChit*)fHits->At(j))->fSector==id) return kTRUE;
+    } 
+  }
+  return kFALSE;  
+
+}
+
+//_____________________________________________________________________________
+void AliTPC::LoadPoints2(Int_t)
+{
+  //
+  // Store x, y, z of all hits in memory
+  //
+  if (fTrackHits == 0 && fTrackHitsOld==0) return;
+  //
+  Int_t nhits =0;
+  if (fHitType&4) nhits = fTrackHits->GetEntriesFast();
+  if (fHitType&2) nhits = fTrackHitsOld->GetEntriesFast();
+  
+  if (nhits == 0) return;
+  Int_t tracks = gAlice->GetNtrack();
+  if (fPoints == 0) fPoints = new TObjArray(tracks);
+  AliHit *ahit;
+  //
+  Int_t *ntrk=new Int_t[tracks];
+  Int_t *limi=new Int_t[tracks];
+  Float_t **coor=new Float_t*[tracks];
+  for(Int_t i=0;i<tracks;i++) {
+    ntrk[i]=0;
+    coor[i]=0;
+    limi[i]=0;
+  }
+  //
+  AliPoints *points = 0;
+  Float_t *fp=0;
+  Int_t trk;
+  Int_t chunk=nhits/4+1;
+  //
+  // Loop over all the hits and store their position
+  //
+  ahit = FirstHit2(-1);
+  while (ahit){
+    trk=ahit->GetTrack();
+    if(ntrk[trk]==limi[trk]) {
+      //
+      // Initialise a new track
+      fp=new Float_t[3*(limi[trk]+chunk)];
+      if(coor[trk]) {
+       memcpy(fp,coor[trk],sizeof(Float_t)*3*limi[trk]);
+       delete [] coor[trk];
+      }
+      limi[trk]+=chunk;
+      coor[trk] = fp;
+    } else {
+      fp = coor[trk];
+    }
+    fp[3*ntrk[trk]  ] = ahit->X();
+    fp[3*ntrk[trk]+1] = ahit->Y();
+    fp[3*ntrk[trk]+2] = ahit->Z();
+    ntrk[trk]++;
+    ahit = NextHit2();
+  }
+
+
+
+  //
+  for(trk=0; trk<tracks; ++trk) {
+    if(ntrk[trk]) {
+      points = new AliPoints();
+      points->SetMarkerColor(GetMarkerColor());
+      points->SetMarkerSize(GetMarkerSize());
+      points->SetDetector(this);
+      points->SetParticle(trk);
+      points->SetPolyMarker(ntrk[trk],coor[trk],GetMarkerStyle());
+      fPoints->AddAt(points,trk);
+      delete [] coor[trk];
+      coor[trk]=0;
+    }
+  }
+  delete [] coor;
+  delete [] ntrk;
+  delete [] limi;
+}
+
+
+//_____________________________________________________________________________
+void AliTPC::LoadPoints3(Int_t)
+{
+  //
+  // Store x, y, z of all hits in memory
+  // - only intersection point with pad row
+  if (fTrackHits == 0) return;
+  //
+  Int_t nhits = fTrackHits->GetEntriesFast();
+  if (nhits == 0) return;
+  Int_t tracks = gAlice->GetNtrack();
+  if (fPoints == 0) fPoints = new TObjArray(2*tracks);
+  fPoints->Expand(2*tracks);
+  AliHit *ahit;
+  //
+  Int_t *ntrk=new Int_t[tracks];
+  Int_t *limi=new Int_t[tracks];
+  Float_t **coor=new Float_t*[tracks];
+  for(Int_t i=0;i<tracks;i++) {
+    ntrk[i]=0;
+    coor[i]=0;
+    limi[i]=0;
+  }
+  //
+  AliPoints *points = 0;
+  Float_t *fp=0;
+  Int_t trk;
+  Int_t chunk=nhits/4+1;
+  //
+  // Loop over all the hits and store their position
+  //
+  ahit = FirstHit2(-1);
+  //for (Int_t hit=0;hit<nhits;hit++) {
+
+  Int_t lastrow = -1;
+  while (ahit){
+    //    ahit = (AliHit*)fHits->UncheckedAt(hit);
+    trk=ahit->GetTrack(); 
+    Float_t  x[3]={ahit->X(),ahit->Y(),ahit->Z()};
+    Int_t    index[3]={1,((AliTPChit*)ahit)->fSector,0};
+    Int_t    currentrow = fTPCParam->GetPadRow(x,index) ;
+    if (currentrow!=lastrow){
+      lastrow = currentrow;
+      //later calculate intersection point           
+      if(ntrk[trk]==limi[trk]) {
+       //
+       // Initialise a new track
+       fp=new Float_t[3*(limi[trk]+chunk)];
+       if(coor[trk]) {
+         memcpy(fp,coor[trk],sizeof(Float_t)*3*limi[trk]);
+         delete [] coor[trk];
+       }
+       limi[trk]+=chunk;
+       coor[trk] = fp;
+      } else {
+       fp = coor[trk];
+      }
+      fp[3*ntrk[trk]  ] = ahit->X();
+      fp[3*ntrk[trk]+1] = ahit->Y();
+      fp[3*ntrk[trk]+2] = ahit->Z();
+      ntrk[trk]++;
+    }
+    ahit = NextHit2();
+  }
+  
+  //
+  for(trk=0; trk<tracks; ++trk) {
+    if(ntrk[trk]) {
+      points = new AliPoints();
+      points->SetMarkerColor(GetMarkerColor()+1);
+      points->SetMarkerStyle(5);
+      points->SetMarkerSize(0.2);
+      points->SetDetector(this);
+      points->SetParticle(trk);
+      //      points->SetPolyMarker(ntrk[trk],coor[trk],GetMarkerStyle()20);
+      points->SetPolyMarker(ntrk[trk],coor[trk],30);
+      fPoints->AddAt(points,tracks+trk);
+      delete [] coor[trk];
+      coor[trk]=0;
+    }
+  }
+  delete [] coor;
+  delete [] ntrk;
+  delete [] limi;
+}
+
+
+
+void AliTPC::FindTrackHitsIntersection(TClonesArray * arr)
+{
+
+  //
+  //fill clones array with intersection of current point with the
+  //middle of the row
+  Int_t sector;
+  Int_t ipart;
+  
+  const Int_t kcmaxhits=30000;
+  AliTPCFastVector * xxxx = new AliTPCFastVector(kcmaxhits*4);
+  AliTPCFastVector & xxx = *xxxx;
+  Int_t maxhits = kcmaxhits;
+      
+  //
+  AliTPChit * tpcHit=0;
+  tpcHit = (AliTPChit*)FirstHit2(-1);
+  Int_t currentIndex=0;
+  Int_t lastrow=-1;  //last writen row
+
+  while (tpcHit){
+    if (tpcHit==0) continue;
+    sector=tpcHit->fSector; // sector number
+    ipart=tpcHit->Track();
+    
+    //find row number
+    
+    Float_t  x[3]={tpcHit->X(),tpcHit->Y(),tpcHit->Z()};
+    Int_t    index[3]={1,sector,0};
+    Int_t    currentrow = fTPCParam->GetPadRow(x,index) ;      
+    if (currentrow<0) continue;
+    if (lastrow<0) lastrow=currentrow;
+    if (currentrow==lastrow){
+      if ( currentIndex>=maxhits){
+       maxhits+=kcmaxhits;
+       xxx.ResizeTo(4*maxhits);
+      }     
+      xxx(currentIndex*4)=x[0];
+      xxx(currentIndex*4+1)=x[1];
+      xxx(currentIndex*4+2)=x[2];      
+      xxx(currentIndex*4+3)=tpcHit->fQ;
+      currentIndex++;  
+    }
+    else 
+      if (currentIndex>2){
+       Float_t sumx=0;
+       Float_t sumx2=0;
+       Float_t sumx3=0;
+       Float_t sumx4=0;
+       Float_t sumy=0;
+       Float_t sumxy=0;
+       Float_t sumx2y=0;
+       Float_t sumz=0;
+       Float_t sumxz=0;
+       Float_t sumx2z=0;
+       Float_t sumq=0;
+       for (Int_t index=0;index<currentIndex;index++){
+         Float_t x,x2,x3,x4;
+         x=x2=x3=x4=xxx(index*4);
+         x2*=x;
+         x3*=x2;
+         x4*=x3;
+         sumx+=x;
+         sumx2+=x2;
+         sumx3+=x3;
+         sumx4+=x4;
+         sumy+=xxx(index*4+1);
+         sumxy+=xxx(index*4+1)*x;
+         sumx2y+=xxx(index*4+1)*x2;
+         sumz+=xxx(index*4+2);
+         sumxz+=xxx(index*4+2)*x;
+         sumx2z+=xxx(index*4+2)*x2;     
+         sumq+=xxx(index*4+3);
+       }
+       Float_t centralPad = (fTPCParam->GetNPads(sector,lastrow)-1)/2;
+       Float_t det=currentIndex*(sumx2*sumx4-sumx3*sumx3)-sumx*(sumx*sumx4-sumx2*sumx3)+
+         sumx2*(sumx*sumx3-sumx2*sumx2);
+       
+       Float_t detay=sumy*(sumx2*sumx4-sumx3*sumx3)-sumx*(sumxy*sumx4-sumx2y*sumx3)+
+         sumx2*(sumxy*sumx3-sumx2y*sumx2);
+       Float_t detaz=sumz*(sumx2*sumx4-sumx3*sumx3)-sumx*(sumxz*sumx4-sumx2z*sumx3)+
+         sumx2*(sumxz*sumx3-sumx2z*sumx2);
+       
+       Float_t detby=currentIndex*(sumxy*sumx4-sumx2y*sumx3)-sumy*(sumx*sumx4-sumx2*sumx3)+
+         sumx2*(sumx*sumx2y-sumx2*sumxy);
+       Float_t detbz=currentIndex*(sumxz*sumx4-sumx2z*sumx3)-sumz*(sumx*sumx4-sumx2*sumx3)+
+         sumx2*(sumx*sumx2z-sumx2*sumxz);
+       
+       Float_t y=detay/det+centralPad;
+       Float_t z=detaz/det;    
+       Float_t by=detby/det; //y angle
+       Float_t bz=detbz/det; //z angle
+       sumy/=Float_t(currentIndex);
+       sumz/=Float_t(currentIndex);
+       
+       AliComplexCluster cl;
+       cl.fX=z;
+       cl.fY=y;
+       cl.fQ=sumq;
+       cl.fSigmaX2=bz;
+       cl.fSigmaY2=by;
+       cl.fTracks[0]=ipart;
+       
+       AliTPCClustersRow * row = (fClustersArray->GetRow(sector,lastrow));
+       if (row!=0) row->InsertCluster(&cl);
+       currentIndex=0;
+       lastrow=currentrow;
+      } //end of calculating cluster for given row
+               
+  } // end of loop over hits
+  xxxx->Delete();
+
+}
+//_______________________________________________________________________________
+void AliTPC::Digits2Reco(Int_t firstevent,Int_t lastevent)
+{
+  // produces rec points from digits and writes them on the root file
+  // AliTPCclusters.root
+
+  TDirectory *cwd = gDirectory;
+
+
+  AliTPCParamSR *dig=(AliTPCParamSR *)gDirectory->Get("75x40_100x60");
+  if(dig){
+    printf("You are running 2 pad-length geom hits with 3 pad-length geom digits\n");
+    delete dig;
+    dig = new AliTPCParamSR();
+  }
+  else
+  {
+   dig=(AliTPCParamSR *)gDirectory->Get("75x40_100x60_150x60"); 
+  }
+  if(!dig){
+   printf("No TPC parameters found\n");
+   exit(3);
+  }
+   
+  SetParam(dig);
+  cout<<"AliTPC::Digits2Reco: TPC parameteres have been set"<<endl; 
+  TFile *out;
+  if(!gSystem->Getenv("CONFIG_FILE")){
+    out=TFile::Open("AliTPCclusters.root","recreate");
+  }
+  else {
+    const char *tmp1;
+    const char *tmp2;
+    char tmp3[80];
+    tmp1=gSystem->Getenv("CONFIG_FILE_PREFIX");
+    tmp2=gSystem->Getenv("CONFIG_OUTDIR");
+    sprintf(tmp3,"%s%s/AliTPCclusters.root",tmp1,tmp2);
+    out=TFile::Open(tmp3,"recreate");
+  }
+
+  TStopwatch timer;
+  cout<<"AliTPC::Digits2Reco - determination of rec points begins"<<endl;
+  timer.Start();
+  cwd->cd();
+  for(Int_t iev=firstevent;iev<lastevent+1;iev++){
+
+    printf("Processing event %d\n",iev);
+    Digits2Clusters(out,iev);
+  }
+  cout<<"AliTPC::Digits2Reco - determination of rec points ended"<<endl;
+  timer.Stop();
+  timer.Print();
+  out->Close();
+  cwd->cd(); 
+
+
+}
+
+////////////////////////////////////////////////////////////////////////
+AliTPCParam* AliTPC::LoadTPCParam(TFile *file) {
+//
+// load TPC paarmeters from a given file or create new if the object
+// is not found there
+//
+  char paramName[50];
+  sprintf(paramName,"75x40_100x60_150x60");
+  AliTPCParam *paramTPC=(AliTPCParam*)file->Get(paramName);
+  if (paramTPC) {
+    cout<<"TPC parameters "<<paramName<<" found."<<endl;
+  } else {
+    cerr<<"TPC parameters not found. Create new (they may be incorrect)."
+       <<endl;    
+    paramTPC = new AliTPCParamSR;
+  }
+  return paramTPC;
+
+// the older version of parameters can be accessed with this code.
+// In some cases, we have old parameters saved in the file but 
+// digits were created with new parameters, it can be distinguish 
+// by the name of TPC TreeD. The code here is just for the case 
+// we would need to compare with old data, uncomment it if needed.
+//
+//  char paramName[50];
+//  sprintf(paramName,"75x40_100x60");
+//  AliTPCParam *paramTPC=(AliTPCParam*)in->Get(paramName);
+//  if (paramTPC) {
+//    cout<<"TPC parameters "<<paramName<<" found."<<endl;
+//  } else {
+//    sprintf(paramName,"75x40_100x60_150x60");
+//    paramTPC=(AliTPCParam*)in->Get(paramName);
+//    if (paramTPC) {
+//     cout<<"TPC parameters "<<paramName<<" found."<<endl;
+//    } else {
+//     cerr<<"TPC parameters not found. Create new (they may be incorrect)."
+//         <<endl;    
+//     paramTPC = new AliTPCParamSR;
+//    }
+//  }
+//  return paramTPC;
+
+}
+