]> git.uio.no Git - u/mrichter/AliRoot.git/blobdiff - TPC/AliTPC.cxx
Hits2SDigits method implemented (summable digits)
[u/mrichter/AliRoot.git] / TPC / AliTPC.cxx
index 583fca3eee610a70cc1210d9c3277bba6c850d66..8148aacaf8ec9e02569bc7ea1f128dfe9ca904e4 100644 (file)
@@ -1,3 +1,111 @@
+/**************************************************************************
+ * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
+ *                                                                        *
+ * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
+ * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
+ *                                                                        *
+ * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
+ * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
+ * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
+ * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
+ * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
+ * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
+ * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
+ **************************************************************************/
+
+/*
+$Log$
+Revision 1.36  2001/05/16 14:57:25  alibrary
+New files for folders and Stack
+
+Revision 1.35  2001/05/08 16:02:22  kowal2
+Updated material specifications
+
+Revision 1.34  2001/05/08 15:00:15  hristov
+Corrections for tracking in arbitrary magnenetic field. Changes towards a concept of global Alice track. Back propagation of reconstructed tracks (Yu.Belikov)
+
+Revision 1.33  2001/04/03 12:40:43  kowal2
+Removed printouts
+
+Revision 1.32  2001/03/12 17:47:36  hristov
+Changes needed on Sun with CC 5.0
+
+Revision 1.31  2001/03/12 08:21:50  kowal2
+Corrected C++ bug in the material definitions
+
+Revision 1.30  2001/03/01 17:34:47  kowal2
+Correction due to the accuracy problem
+
+Revision 1.29  2001/02/28 16:34:40  kowal2
+Protection against nonphysical values of the avalanche size,
+10**6 is the maximum
+
+Revision 1.28  2001/01/26 19:57:19  hristov
+Major upgrade of AliRoot code
+
+Revision 1.27  2001/01/13 17:29:33  kowal2
+Sun compiler correction
+
+Revision 1.26  2001/01/10 07:59:43  kowal2
+Corrections to load points from the noncompressed hits.
+
+Revision 1.25  2000/11/02 07:25:31  kowal2
+Changes due to the new hit structure.
+Memory leak removed.
+
+Revision 1.24  2000/10/05 16:06:09  kowal2
+Forward declarations. Changes due to a new class AliComplexCluster.
+
+Revision 1.23  2000/10/02 21:28:18  fca
+Removal of useless dependecies via forward declarations
+
+Revision 1.22  2000/07/10 20:57:39  hristov
+Update of TPC code and macros by M.Kowalski
+
+Revision 1.19.2.4  2000/06/26 07:39:42  kowal2
+Changes to obey the coding rules
+
+Revision 1.19.2.3  2000/06/25 08:38:41  kowal2
+Splitted from AliTPCtracking
+
+Revision 1.19.2.2  2000/06/16 12:59:28  kowal2
+Changed parameter settings
+
+Revision 1.19.2.1  2000/06/09 07:15:07  kowal2
+
+Defaults loaded automatically (hard-wired)
+Optional parameters can be set via macro called in the constructor
+
+Revision 1.19  2000/04/18 19:00:59  fca
+Small bug fixes to TPC files
+
+Revision 1.18  2000/04/17 09:37:33  kowal2
+removed obsolete AliTPCDigitsDisplay.C
+
+Revision 1.17.2.2  2000/04/10 08:15:12  kowal2
+
+New, experimental data structure from M. Ivanov
+New tracking algorithm
+Different pad geometry for different sectors
+Digitization rewritten
+
+Revision 1.17.2.1  2000/04/10 07:56:53  kowal2
+Not used anymore - removed
+
+Revision 1.17  2000/01/19 17:17:30  fca
+Introducing a list of lists of hits -- more hits allowed for detector now
+
+Revision 1.16  1999/11/05 09:29:23  fca
+Accept only signals > 0
+
+Revision 1.15  1999/10/08 06:26:53  fca
+Removed ClustersIndex - not used anymore
+
+Revision 1.14  1999/09/29 09:24:33  fca
+Introduction of the Copyright and cvs Log
+
+*/
+
 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
 //                                                                           //
 //  Time Projection Chamber                                                  //
 //                                                                          //
 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
 
+//
+
 #include <TMath.h>
 #include <TRandom.h>
 #include <TVector.h>
 #include <TObjectTable.h>
 #include "TParticle.h"
 #include "AliTPC.h"
+#include <TFile.h>       
 #include "AliRun.h"
 #include <iostream.h>
+#include <stdlib.h>
 #include <fstream.h>
 #include "AliMC.h"
+#include "AliMagF.h"
+
 
-//MI change
-#include "AliTPCParam.h"
-#include "AliTPCD.h"
+#include "AliTPCParamSR.h"
 #include "AliTPCPRF2D.h"
 #include "AliTPCRF1D.h"
+#include "AliDigits.h"
+#include "AliSimDigits.h"
+#include "AliTPCTrackHits.h"
+#include "AliPoints.h"
+#include "AliArrayBranch.h"
+
+
+#include "AliTPCDigitsArray.h"
+#include "AliComplexCluster.h"
+#include "AliClusters.h"
+#include "AliTPCClustersRow.h"
+#include "AliTPCClustersArray.h"
+
+#include "AliTPCcluster.h"
+#include "AliTPCclusterer.h"
+#include "AliTPCtracker.h"
+
+#include <TInterpreter.h>
+#include <TTree.h>
 
 
 
@@ -46,16 +177,16 @@ AliTPC::AliTPC()
   // Default constructor
   //
   fIshunt   = 0;
-  fClusters = 0;
   fHits     = 0;
   fDigits   = 0;
-  fTracks   = 0;
   fNsectors = 0;
-  fNtracks  = 0;
-  fNclusters= 0;
   //MI changes
-  fDigParam= new AliTPCD();
-  fDigits = fDigParam->GetArray();
+  fDigitsArray = 0;
+  fClustersArray = 0;
+  fTPCParam=0;
+  fTrackHits = 0;  
+  fHitType = 2;  
+  fTPCParam = 0; 
 }
  
 //_____________________________________________________________________________
@@ -69,24 +200,38 @@ AliTPC::AliTPC(const char *name, const char *title)
   //
   // Initialise arrays of hits and digits 
   fHits     = new TClonesArray("AliTPChit",  176);
-  //  fDigits   = new TClonesArray("AliTPCdigit",10000);
-  //MI change
-  fDigParam= new AliTPCD;
-  fDigits = fDigParam->GetArray();
+  gAlice->AddHitList(fHits);
+  //MI change  
+  fDigitsArray = 0;
+  fClustersArray= 0;
+  //
+  fTrackHits = new AliTPCTrackHits;  //MI - 13.09.2000
+  fTrackHits->SetHitPrecision(0.002);
+  fTrackHits->SetStepPrecision(0.003);  
+  fTrackHits->SetMaxDistance(100); 
+
+  fHitType = 2;
   //
   // Initialise counters
-  fClusters = 0;
-  fTracks   = 0;
-  fNsectors = 72;
-  fNtracks  = 0;
-  fNclusters= 0;
-  fDigitsIndex = new Int_t[fNsectors+1];
-  fClustersIndex = new Int_t[fNsectors+1];
+  fNsectors = 0;
+
   //
   fIshunt     =  0;
   //
   // Initialise color attributes
   SetMarkerColor(kYellow);
+
+  //
+  //  Set TPC parameters
+  //
+
+  if (!strcmp(title,"Default")) {  
+     fTPCParam = new AliTPCParamSR;
+  } else {
+    cerr<<"AliTPC warning: in Config.C you must set non-default parameters\n";
+    fTPCParam=0;
+  }
+
 }
 
 //_____________________________________________________________________________
@@ -95,88 +240,38 @@ AliTPC::~AliTPC()
   //
   // TPC destructor
   //
+
   fIshunt   = 0;
   delete fHits;
   delete fDigits;
-  delete fClusters;
-  delete fTracks;
-  delete fDigParam;
-  if (fDigitsIndex)   delete [] fDigitsIndex;
-  if (fClustersIndex) delete [] fClustersIndex;
+  delete fTPCParam;
+  delete fTrackHits; //MI 15.09.2000
 }
 
-//_____________________________________________________________________________
-void AliTPC::AddCluster(Float_t *hits, Int_t *tracks)
-{
-  //
-  // Add a simulated cluster to the list
-  //
-  if(!fClusters) fClusters=new TClonesArray("AliTPCcluster",10000);
-  TClonesArray &lclusters = *fClusters;
-  new(lclusters[fNclusters++]) AliTPCcluster(hits,tracks);
-}
-//_____________________________________________________________________________
-void AliTPC::AddCluster(const AliTPCcluster &c)
-{
-  //
-  // Add a simulated cluster copy to the list
-  //
-  if(!fClusters) fClusters=new TClonesArray("AliTPCcluster",10000);
-  TClonesArray &lclusters = *fClusters;
-  new(lclusters[fNclusters++]) AliTPCcluster(c);
-}
-//_____________________________________________________________________________
-void AliTPC::AddDigit(Int_t *tracks, Int_t *digits)
-{
-  //
-  // Add a TPC digit to the list
-  //
-  //  TClonesArray &ldigits = *fDigits;
-  //MI change 
-  TClonesArray &ldigits = *fDigParam->GetArray();
-  new(ldigits[fNdigits++]) AliTPCdigit(tracks,digits);
-}
 //_____________________________________________________________________________
 void AliTPC::AddHit(Int_t track, Int_t *vol, Float_t *hits)
 {
   //
   // Add a hit to the list
   //
-  TClonesArray &lhits = *fHits;
-  new(lhits[fNhits++]) AliTPChit(fIshunt,track,vol,hits);
+  //  TClonesArray &lhits = *fHits;
+  //  new(lhits[fNhits++]) AliTPChit(fIshunt,track,vol,hits);
+  if (fHitType&1){
+    TClonesArray &lhits = *fHits;
+    new(lhits[fNhits++]) AliTPChit(fIshunt,track,vol,hits);
+  }
+  if (fHitType&2)
+   AddHit2(track,vol,hits);
 }
  
-//_____________________________________________________________________________
-void AliTPC::AddTrack(Float_t *hits)
-{
-  //
-  // Add a track to the list of tracks
-  //
-  TClonesArray &ltracks = *fTracks;
-  new(ltracks[fNtracks++]) AliTPCtrack(hits);
-}
-
-//_____________________________________________________________________________
-void AliTPC::AddTrack(const AliTPCtrack& t)
-{
-  //
-  // Add a track copy to the list of tracks
-  //
-  if(!fTracks) fTracks=new TClonesArray("AliTPCtrack",10000);
-  TClonesArray &ltracks = *fTracks;
-  new(ltracks[fNtracks++]) AliTPCtrack(t);
-}
-
 //_____________________________________________________________________________
 void AliTPC::BuildGeometry()
 {
+
   //
   // Build TPC ROOT TNode geometry for the event display
   //
-  TNode *Node, *Top;
+  TNode *nNode, *nTop;
   TTUBS *tubs;
   Int_t i;
   const int kColorTPC=19;
@@ -184,25 +279,24 @@ void AliTPC::BuildGeometry()
   const Double_t kDegrad=TMath::Pi()/180;
   const Double_t kRaddeg=180./TMath::Pi();
 
-  AliTPCParam * fTPCParam = &(fDigParam->GetParam());
 
-  Float_t InnerOpenAngle = fTPCParam->GetInnerAngle();
-  Float_t OuterOpenAngle = fTPCParam->GetOuterAngle();
+  Float_t innerOpenAngle = fTPCParam->GetInnerAngle();
+  Float_t outerOpenAngle = fTPCParam->GetOuterAngle();
 
-  Float_t InnerAngleShift = fTPCParam->GetInnerAngleShift();
-  Float_t OuterAngleShift = fTPCParam->GetOuterAngleShift();
+  Float_t innerAngleShift = fTPCParam->GetInnerAngleShift();
+  Float_t outerAngleShift = fTPCParam->GetOuterAngleShift();
 
   Int_t nLo = fTPCParam->GetNInnerSector()/2;
   Int_t nHi = fTPCParam->GetNOuterSector()/2;  
 
-  const Double_t loAng = (Double_t)TMath::Nint(InnerOpenAngle*kRaddeg);
-  const Double_t hiAng = (Double_t)TMath::Nint(OuterOpenAngle*kRaddeg);
-  const Double_t loAngSh = (Double_t)TMath::Nint(InnerAngleShift*kRaddeg);
-  const Double_t hiAngSh = (Double_t)TMath::Nint(OuterAngleShift*kRaddeg);  
+  const Double_t kloAng = (Double_t)TMath::Nint(innerOpenAngle*kRaddeg);
+  const Double_t khiAng = (Double_t)TMath::Nint(outerOpenAngle*kRaddeg);
+  const Double_t kloAngSh = (Double_t)TMath::Nint(innerAngleShift*kRaddeg);
+  const Double_t khiAngSh = (Double_t)TMath::Nint(outerAngleShift*kRaddeg);  
 
 
-  const Double_t loCorr = 1/TMath::Cos(0.5*loAng*kDegrad);
-  const Double_t hiCorr = 1/TMath::Cos(0.5*hiAng*kDegrad);
+  const Double_t kloCorr = 1/TMath::Cos(0.5*kloAng*kDegrad);
+  const Double_t khiCorr = 1/TMath::Cos(0.5*khiAng*kDegrad);
 
   Double_t rl,ru;
   
@@ -211,12 +305,12 @@ void AliTPC::BuildGeometry()
   // Get ALICE top node
   //
 
-  Top=gAlice->GetGeometry()->GetNode("alice");
+  nTop=gAlice->GetGeometry()->GetNode("alice");
 
   //  inner sectors
 
-  rl = fTPCParam->GetInSecLowEdge();
-  ru = fTPCParam->GetInSecUpEdge();
+  rl = fTPCParam->GetInnerRadiusLow();
+  ru = fTPCParam->GetInnerRadiusUp();
  
 
   for(i=0;i<nLo;i++) {
@@ -225,36 +319,35 @@ void AliTPC::BuildGeometry()
     sprintf(title,"TPC low sector %3d",i);
     title[24]='\0';
     
-    tubs = new TTUBS(name,title,"void",rl*loCorr,ru*loCorr,250.,
-                     loAng*(i-0.5)+loAngSh,loAng*(i+0.5)+loAngSh);
+    tubs = new TTUBS(name,title,"void",rl*kloCorr,ru*kloCorr,250.,
+                     kloAng*(i-0.5)+kloAngSh,kloAng*(i+0.5)+kloAngSh);
     tubs->SetNumberOfDivisions(1);
-    Top->cd();
-    Node = new TNode(name,title,name,0,0,0,"");
-    Node->SetLineColor(kColorTPC);
-    fNodes->Add(Node);
+    nTop->cd();
+    nNode = new TNode(name,title,name,0,0,0,"");
+    nNode->SetLineColor(kColorTPC);
+    fNodes->Add(nNode);
   }
 
   // Outer sectors
 
-  rl = fTPCParam->GetOuSecLowEdge();
-  ru = fTPCParam->GetOuSecUpEdge();
+  rl = fTPCParam->GetOuterRadiusLow();
+  ru = fTPCParam->GetOuterRadiusUp();
 
   for(i=0;i<nHi;i++) {
     sprintf(name,"US%2.2d",i);
     name[4]='\0';
     sprintf(title,"TPC upper sector %d",i);
     title[24]='\0';
-    tubs = new TTUBS(name,title,"void",rl*hiCorr,ru*hiCorr,250,
-                     hiAng*(i-0.5)+hiAngSh,hiAng*(i+0.5)+hiAngSh);
+    tubs = new TTUBS(name,title,"void",rl*khiCorr,ru*khiCorr,250,
+                     khiAng*(i-0.5)+khiAngSh,khiAng*(i+0.5)+khiAngSh);
     tubs->SetNumberOfDivisions(1);
-    Top->cd();
-    Node = new TNode(name,title,name,0,0,0,"");
-    Node->SetLineColor(kColorTPC);
-    fNodes->Add(Node);
+    nTop->cd();
+    nNode = new TNode(name,title,name,0,0,0,"");
+    nNode->SetLineColor(kColorTPC);
+    fNodes->Add(nNode);
   }
-}  
-  
-  
+
+}    
 
 //_____________________________________________________________________________
 Int_t AliTPC::DistancetoPrimitive(Int_t , Int_t )
@@ -266,367 +359,63 @@ Int_t AliTPC::DistancetoPrimitive(Int_t , Int_t )
   return 9999;
 }
 
-//_____________________________________________________________________________
-//const int MAX_CLUSTER=nrow_low+nrow_up; 
-const int MAX_CLUSTER=200; 
-const int S_MAXSEC=24;
-const int L_MAXSEC=48;
-const int ROWS_TO_SKIP=21;
-const Float_t MAX_CHI2=12.;
-
-
-//_____________________________________________________________________________
-static Double_t SigmaY2(Double_t r, Double_t tgl, Double_t pt)
-{
-  //
-  // Calculate spread in Y
-  //
-  pt=TMath::Abs(pt)*1000.;
-  Double_t x=r/pt;
-  tgl=TMath::Abs(tgl);
-  Double_t s=a_rphi - b_rphi*r*tgl + c_rphi*x*x + d_rphi*x;
-  if (s<0.4e-3) s=0.4e-3;
-  return s;
-}
-
-//_____________________________________________________________________________
-static Double_t SigmaZ2(Double_t r, Double_t tgl) 
-{
-  //
-  // Calculate spread in Z
-  //
-  tgl=TMath::Abs(tgl);
-  Double_t s=a_z - b_z*r*tgl + c_z*tgl*tgl;
-  if (s<0.4e-3) s=0.4e-3;
-  return s;
-}
-
-//_____________________________________________________________________________
-inline Double_t f1(Double_t x1,Double_t y1,   //C
-                   Double_t x2,Double_t y2,
-                   Double_t x3,Double_t y3) 
-{
-  //
-  // Function f1
-  //
-  Double_t d=(x2-x1)*(y3-y2)-(x3-x2)*(y2-y1);
-  Double_t a=0.5*((y3-y2)*(y2*y2-y1*y1+x2*x2-x1*x1)-
-                  (y2-y1)*(y3*y3-y2*y2+x3*x3-x2*x2));
-  Double_t b=0.5*((x2-x1)*(y3*y3-y2*y2+x3*x3-x2*x2)-
-                  (x3-x2)*(y2*y2-y1*y1+x2*x2-x1*x1));
-
-  Double_t xr=TMath::Abs(d/(d*x1-a)), yr=d/(d*y1-b);
-
-  return -xr*yr/sqrt(xr*xr+yr*yr); 
-}
-
-
-//_____________________________________________________________________________
-inline Double_t f2(Double_t x1,Double_t y1,  //eta=C*x0
-                   Double_t x2,Double_t y2,
-                   Double_t x3,Double_t y3) 
-{
-  //
-  // Function f2
-  //
-  Double_t d=(x2-x1)*(y3-y2)-(x3-x2)*(y2-y1);
-  Double_t a=0.5*((y3-y2)*(y2*y2-y1*y1+x2*x2-x1*x1)-
-                  (y2-y1)*(y3*y3-y2*y2+x3*x3-x2*x2));
-  Double_t b=0.5*((x2-x1)*(y3*y3-y2*y2+x3*x3-x2*x2)-
-                  (x3-x2)*(y2*y2-y1*y1+x2*x2-x1*x1));
-
-  Double_t xr=TMath::Abs(d/(d*x1-a)), yr=d/(d*y1-b);
-  
-  return -a/(d*y1-b)*xr/sqrt(xr*xr+yr*yr);
-}
-
-//_____________________________________________________________________________
-inline Double_t f3(Double_t x1,Double_t y1,  //tgl
-                   Double_t x2,Double_t y2,
-                   Double_t z1,Double_t z2) 
-{
-  //
-  // Function f3
-  //
-  return (z1 - z2)/sqrt((x1-x2)*(x1-x2)+(y1-y2)*(y1-y2));
-}
-
-//_____________________________________________________________________________
-static int FindProlongation(AliTPCtrack& t, const AliTPCSector *sec, 
-                           int s, int ri, int rf=0) 
-{
-  //
-  // Propagate track
-  //
-  int try_again=ROWS_TO_SKIP;
-  Double_t alpha=sec->GetAlpha();
-  int ns=int(2*TMath::Pi()/alpha)+1;
-
-  for (int nr=ri; nr>=rf; nr--) {
-    Double_t x=sec[s].GetX(nr), ymax=sec[s].GetMaxY(nr);
-    if (!t.PropagateTo(x)) return -1;
-
-    const AliTPCcluster *cl=0;
-    Double_t max_chi2=MAX_CHI2;
-    const AliTPCRow& row=sec[s][nr];
-    Double_t sy2=SigmaY2(t.GetX(),t.GetTgl(),t.GetPt());
-    Double_t sz2=SigmaZ2(t.GetX(),t.GetTgl());
-    Double_t road=3.*sqrt(t.GetSigmaY2() + 4*sy2), y=t.GetY(), z=t.GetZ();
-
-    if (road>30) {
-      if (t>3) cerr<<t<<" AliTPCtrack warning: Too broad road !\n"; 
-      return -1;
-    }
-
-    if (row) {
-      for (int i=row.Find(y-road); i<row; i++) {
-       AliTPCcluster* c=(AliTPCcluster*)(row[i]);
-       if (c->fY > y+road) break;
-       if (c->IsUsed()) continue;
-       if ((c->fZ - z)*(c->fZ - z) > 9.*(t.GetSigmaZ2() + 4*sz2)) continue;
-       Double_t chi2=t.GetPredictedChi2(c);
-       if (chi2 > max_chi2) continue;
-       max_chi2=chi2;
-       cl=c;       
-      }
-    }
-    if (cl) {
-      t.Update(cl,max_chi2);
-      try_again=ROWS_TO_SKIP;
-    } else {
-      if (try_again==0) break;
-      if (y > ymax) {
-         s = (s+1) % ns;
-         if (!t.Rotate(alpha)) return -1;
-      } else if (y <-ymax) {
-           s = (s-1+ns) % ns;
-           if (!t.Rotate(-alpha)) return -1;
-      }
-      try_again--;
-    }
-  }
-
-  return s;
-}
-
-
-//_____________________________________________________________________________
-static void MakeSeeds(TObjArray& seeds,const AliTPCSector* sec,int i1,int i2,
-const AliTPCParam *p)
-{
-  //
-  // Find seed for tracking
-  //
-  TMatrix C(5,5); TVector x(5);
-  int max_sec=L_MAXSEC/2;
-  for (int ns=0; ns<max_sec; ns++) {
-    int nl=sec[(ns-1+max_sec)%max_sec][i2];
-    int nm=sec[ns][i2];
-    int nu=sec[(ns+1)%max_sec][i2];
-    Double_t alpha=sec[ns].GetAlpha();
-    const AliTPCRow& r1=sec[ns][i1];
-    for (int is=0; is < r1; is++) {
-      Double_t x1=sec[ns].GetX(i1), y1=r1[is]->fY, z1=r1[is]->fZ;
-      for (int js=0; js < nl+nm+nu; js++) {
-       const AliTPCcluster *cl;
-       Double_t cs,sn;
-       int ks;
-       
-       if (js<nl) {
-         ks=(ns-1+max_sec)%max_sec;
-         const AliTPCRow& r2=sec[(ns-1+max_sec)%max_sec][i2];
-         cl=r2[js];
-         cs=cos(alpha); sn=sin(alpha);
-       } else 
-         if (js<nl+nm) {
-           ks=ns;
-           const AliTPCRow& r2=sec[ns][i2];
-           cl=r2[js-nl];
-           cs=1; sn=0.;
-         } else {
-           ks=(ns+1)%max_sec;
-           const AliTPCRow& r2=sec[(ns+1)%max_sec][i2];
-           cl=r2[js-nl-nm];
-           cs=cos(alpha); sn=-sin(alpha);
-         }
-       Double_t x2=sec[ns].GetX(i2), y2=cl->fY, z2=cl->fZ;
-       //if (z1*z2 < 0) continue;
-       //if (TMath::Abs(z1) < TMath::Abs(z2)) continue;
-       
-       Double_t tmp= x2*cs+y2*sn;
-       y2 =-x2*sn+y2*cs;
-       x2=tmp;     
-       
-       x(0)=y1;
-       x(1)=z1;
-       x(2)=f1(x1,y1,x2,y2,0.,0.);
-       x(3)=f2(x1,y1,x2,y2,0.,0.);
-       x(4)=f3(x1,y1,x2,y2,z1,z2);
-       
-       if (TMath::Abs(x(2)*x1-x(3)) >= 0.999) continue;
-       
-       if (TMath::Abs(x(4)) > 1.2) continue;
-
-       Double_t a=asin(x(3));
-       Double_t zv=z1 - x(4)/x(2)*(a+asin(x(2)*x1-x(3)));
-       if (TMath::Abs(zv)>33.) continue; 
-
-       TMatrix X(6,6); X=0.; 
-       X(0,0)=r1[is]->fSigmaY2; X(1,1)=r1[is]->fSigmaZ2;
-       X(2,2)=cl->fSigmaY2;     X(3,3)=cl->fSigmaZ2;
-       X(4,4)=3./12.; X(5,5)=3./12.;
-       TMatrix F(5,6); F.UnitMatrix();
-       Double_t sy=sqrt(X(0,0)), sz=sqrt(X(1,1));
-       F(2,0)=(f1(x1,y1+sy,x2,y2,0.,0.)-x(2))/sy;
-       F(2,2)=(f1(x1,y1,x2,y2+sy,0.,0.)-x(2))/sy;
-       F(2,4)=(f1(x1,y1,x2,y2,0.,0.+sy)-x(2))/sy;
-       F(3,0)=(f2(x1,y1+sy,x2,y2,0.,0.)-x(3))/sy;
-       F(3,2)=(f2(x1,y1,x2,y2+sy,0.,0.)-x(3))/sy;
-       F(3,4)=(f2(x1,y1,x2,y2,0.,0.+sy)-x(3))/sy;
-       F(4,0)=(f3(x1,y1+sy,x2,y2,z1,z2)-x(4))/sy;
-       F(4,1)=(f3(x1,y1,x2,y2,z1+sz,z2)-x(4))/sz;
-       F(4,2)=(f3(x1,y1,x2,y2+sy,z1,z2)-x(4))/sy;
-       F(4,3)=(f3(x1,y1,x2,y2,z1,z2+sz)-x(4))/sz;
-       F(4,4)=0;
-       F(3,3)=0;
-       
-       TMatrix t(F,TMatrix::kMult,X);
-       C.Mult(t,TMatrix(TMatrix::kTransposed,F));
-
-       TrackSeed *track=new TrackSeed(*(r1[is]),x,C,p);
-       int rc=FindProlongation(*track,sec,ns,i1-1,i2);
-        if (rc<0 || *track<(i1-i2)/2) delete track;
-        else seeds.AddLast(track); 
-      }
-    }
-  }
-}
-
-//_____________________________________________________________________________
-void AliTPC::Clusters2Tracks()
-{
-  //
-  // TPC Track finder from clusters.
-  //
-  if (!fClusters) return;
-
-  AliTPCParam *p=&fDigParam->GetParam();
-  Int_t nrow_low=p->GetNRowLow();
-  Int_t nrow_up=p->GetNRowUp();
-
-  AliTPCSSector ssec[S_MAXSEC/2];
-  for (int i=0; i<S_MAXSEC/2; i++) ssec[i].SetUp(p);
-
-  AliTPCLSector lsec[L_MAXSEC/2];
-  for (int j=0; j<L_MAXSEC/2; j++) lsec[j].SetUp(p);
-
-  int ncl=fClusters->GetEntriesFast();
-  while (ncl--) {
-    AliTPCcluster *c=(AliTPCcluster*)fClusters->UncheckedAt(ncl);
-
-    int sec=int(c->fSector)-1, row=int(c->fPadRow)-1;
-    
-    if (sec<24) {
-      if (row<0 || row>nrow_low) {cerr<<"low !!!"<<row<<endl; continue;}
-      ssec[sec%12][row].InsertCluster(c);
-    } else {
-      if (row<0 || row>nrow_up ) {cerr<<"up  !!!"<<row<<endl; continue;}
-      sec -= 24;
-      lsec[sec%24][row].InsertCluster(c);
-    }
-  }
-  
-  
-  TObjArray seeds(20000);
-  MakeSeeds(seeds,lsec,nrow_up-1,nrow_up-1-8,p);
-  MakeSeeds(seeds,lsec,nrow_up-1-4,nrow_up-1-4-8,p);
-    
-  seeds.Sort();
-  
-  int found=0;
-  int nseed=seeds.GetEntriesFast();
-  
-  for (int s=0; s<nseed; s++) {
-    AliTPCtrack& t=*((AliTPCtrack*)seeds.UncheckedAt(s));
-    Double_t alpha=t.GetAlpha();
-    if (alpha > 2.*TMath::Pi()) alpha -= 2.*TMath::Pi();  
-    if (alpha < 0.            ) alpha += 2.*TMath::Pi();  
-    int ns=int(alpha/lsec->GetAlpha() + 0.5);
-    
-    Double_t x=t.GetX();
-    int nr;
-    if (x<p->GetPadRowRadiiUp(nrow_up-1-4-7)) nr=nrow_up-1-4-8;
-    else if (x<p->GetPadRowRadiiUp(nrow_up-1-7)) nr=nrow_up-1-8;
-    else {cerr<<x<<" =x !!!\n"; continue;}
-
-    int ls=FindProlongation(t,lsec,ns,nr-1);
-    if (ls<0) continue;
-    x=t.GetX(); alpha=lsec[ls].GetAlpha();          //
-    Double_t phi=ls*alpha + atan(t.GetY()/x);       // Find S-sector
-    int ss=int(0.5*(phi/alpha+1));                  //
-    alpha *= 2*(ss-0.5*ls);                         // and rotation angle
-    if (!t.Rotate(alpha)) continue;                 //
-    ss %= (S_MAXSEC/2);                             //
-    
-    if (FindProlongation(t,ssec,ss,nrow_low-1)<0) continue;
-    if (t < 30) continue;
-    
-    AddTrack(t);
-    t.UseClusters();
-    cerr<<found++<<'\r';
-  }  
+void AliTPC::Clusters2Tracks(TFile *of) {
+  //-----------------------------------------------------------------
+  // This is a track finder.
+  //-----------------------------------------------------------------
+  AliTPCtracker tracker(fTPCParam);
+  tracker.Clusters2Tracks(gFile,of);
 }
 
 //_____________________________________________________________________________
 void AliTPC::CreateMaterials()
 {
   //-----------------------------------------------
-  // Create Materials for for TPC
+  // Create Materials for for TPC simulations
   //-----------------------------------------------
 
   //-----------------------------------------------------------------
   // Origin: Marek Kowalski  IFJ, Krakow, Marek.Kowalski@ifj.edu.pl
   //-----------------------------------------------------------------
 
-  Int_t ISXFLD=gAlice->Field()->Integ();
-  Float_t SXMGMX=gAlice->Field()->Max();
+  Int_t iSXFLD=gAlice->Field()->Integ();
+  Float_t sXMGMX=gAlice->Field()->Max();
 
   Float_t amat[5]; // atomic numbers
   Float_t zmat[5]; // z
   Float_t wmat[5]; // proportions
 
   Float_t density;
+  Float_t apure[2];
 
-  //  ********************* Gases *******************
 
-  //--------------------------------------------------------------
+  //***************** Gases *************************
+  
+  //-------------------------------------------------
   // pure gases
-  //--------------------------------------------------------------
+  //-------------------------------------------------
 
-  // Ne
+  // Neon
 
 
-  Float_t a_ne = 20.18;
-  Float_t z_ne = 10.;
-  
+  amat[0]= 20.18;
+  zmat[0]= 10.;  
   density = 0.0009;
+  apure[0]=amat[0];
 
-  AliMaterial(20,"Ne",a_ne,z_ne,density,999.,999.);
+  AliMaterial(20,"Ne",amat[0],zmat[0],density,999.,999.);
 
-  // Ar
+  // Argon
 
-  Float_t a_ar = 39.948;
-  Float_t z_ar = 18.;
+  amat[0]= 39.948;
+  zmat[0]= 18.;  
+  density = 0.001782;  
 
-  density = 0.001782;
-  AliMaterial(21,"Ar",a_ar,z_ar,density,999.,999.);
+  apure[1]=amat[0];
 
-  Float_t a_pure[2];
-  
-  a_pure[0] = a_ne;
-  a_pure[1] = a_ar;
-  
+  AliMaterial(21,"Ar",amat[0],zmat[0],density,999.,999.);
 
   //--------------------------------------------------------------
   // gases - compounds
@@ -634,7 +423,7 @@ void AliTPC::CreateMaterials()
 
   Float_t amol[3];
 
-  //  CO2
+  // CO2
 
   amat[0]=12.011;
   amat[1]=15.9994;
@@ -650,7 +439,7 @@ void AliTPC::CreateMaterials()
   amol[0] = amat[0]*wmat[0]+amat[1]*wmat[1];
 
   AliMixture(10,"CO2",amat,zmat,density,-2,wmat);
-
+  
   // CF4
 
   amat[0]=12.011;
@@ -668,6 +457,7 @@ void AliTPC::CreateMaterials()
 
   AliMixture(11,"CF4",amat,zmat,density,-2,wmat); 
 
+
   // CH4
 
   amat[0]=12.011;
@@ -688,15 +478,14 @@ void AliTPC::CreateMaterials()
   //----------------------------------------------------------------
   // gases - mixtures, ID >= 20 pure gases, <= 10 ID < 20 -compounds
   //----------------------------------------------------------------
-  char namate[21];
+
+  char namate[21]; 
   density = 0.;
   Float_t am=0;
   Int_t nc;
-
-  Float_t a,z,rho,absl,X0,buf[1];
+  Float_t rho,absl,X0,buf[1];
   Int_t nbuf;
+  Float_t a,z;
 
   for(nc = 0;nc<fNoComp;nc++)
     {
@@ -710,7 +499,7 @@ void AliTPC::CreateMaterials()
 
       Int_t nnc = (fMixtComp[nc]>=20) ? fMixtComp[nc]%20 : fMixtComp[nc]%10;
  
-      am += fMixtProp[nc]*((fMixtComp[nc]>=20) ? a_pure[nnc] : amol[nnc]); 
+      am += fMixtProp[nc]*((fMixtComp[nc]>=20) ? apure[nnc] : amol[nnc]); 
       density += fMixtProp[nc]*rho;  // density of the mixture
       
     }
@@ -722,41 +511,92 @@ void AliTPC::CreateMaterials()
 
       Int_t nnc = (fMixtComp[nc]>=20) ? fMixtComp[nc]%20 : fMixtComp[nc]%10;
 
-      wmat[nc] = fMixtProp[nc]*((fMixtComp[nc]>=20) ? a_pure[nnc] : amol[nnc])/am;
+      wmat[nc] = fMixtProp[nc]*((fMixtComp[nc]>=20) ? 
+                 apure[nnc] : amol[nnc])/am;
+
+    } 
+
+  // Drift gases 1 - nonsensitive, 2 - sensitive
 
-    }  
-  
   AliMixture(31,"Drift gas 1",amat,zmat,density,fNoComp,wmat);
   AliMixture(32,"Drift gas 2",amat,zmat,density,fNoComp,wmat);
-  AliMixture(33,"Drift gas 3",amat,zmat,density,fNoComp,wmat); 
 
-  AliMedium(2, "Drift gas 1", 31, 0, ISXFLD, SXMGMX, 10., 999.,.1, .001, .001);
-  AliMedium(3, "Drift gas 2", 32, 0, ISXFLD, SXMGMX, 10., 999.,.1, .001, .001);
-  AliMedium(4, "Drift gas 3", 33, 1, ISXFLD, SXMGMX, 10., 999.,.1, .001, .001);
 
-  // Air 
+  // Air
+
+  amat[0] = 14.61;
+  zmat[0] = 7.3;
+  density = 0.001205;
 
-  AliMaterial(24, "Air", 14.61, 7.3, .001205, 30420., 67500.);
+  AliMaterial(24,"Air",amat[0],zmat[0],density,999.,999.); 
 
-  AliMedium(24, "Air", 24, 0, ISXFLD, SXMGMX, 10., .1, .1, .1, .1);
 
   //----------------------------------------------------------------------
   //               solid materials
   //----------------------------------------------------------------------
 
-  // Al
 
-  AliMaterial(30, "Al", 26.98, 13., 2.7, 8.9, 37.2);
+  // Kevlar C14H22O2N2
 
-  AliMedium(0, "Al",30, 0, ISXFLD, SXMGMX, 10., .1, .1, .1,   .1);
+  amat[0] = 12.011;
+  amat[1] = 1.;
+  amat[2] = 15.999;
+  amat[3] = 14.006;
 
-  // Si
+  zmat[0] = 6.;
+  zmat[1] = 1.;
+  zmat[2] = 8.;
+  zmat[3] = 7.;
+
+  wmat[0] = 14.;
+  wmat[1] = 22.;
+  wmat[2] = 2.;
+  wmat[3] = 2.;
+
+  density = 1.45;
 
-  AliMaterial(31, "Si", 28.086, 14.,2.33, 9.36, 999.);
+  AliMixture(34,"Kevlar",amat,zmat,density,-4,wmat);  
 
-  AliMedium(7, "Al",31, 0, ISXFLD, SXMGMX, 10., .1, .1, .1,   .1);
+  // NOMEX
+
+  amat[0] = 12.011;
+  amat[1] = 1.;
+  amat[2] = 15.999;
+  amat[3] = 14.006;
+
+  zmat[0] = 6.;
+  zmat[1] = 1.;
+  zmat[2] = 8.;
+  zmat[3] = 7.;
+
+  wmat[0] = 14.;
+  wmat[1] = 22.;
+  wmat[2] = 2.;
+  wmat[3] = 2.;
+
+  density = 0.03;
+
+  
+  AliMixture(35,"NOMEX",amat,zmat,density,-4,wmat);
+
+  // Makrolon C16H18O3
+
+  amat[0] = 12.011;
+  amat[1] = 1.;
+  amat[2] = 15.999;
+
+  zmat[0] = 6.;
+  zmat[1] = 1.;
+  zmat[2] = 8.;
+
+  wmat[0] = 16.;
+  wmat[1] = 18.;
+  wmat[2] = 3.;
   
+  density = 1.2;
 
+  AliMixture(36,"Makrolon",amat,zmat,density,-3,wmat);
+  
   // Mylar C5H4O2
 
   amat[0]=12.011;
@@ -773,23 +613,9 @@ void AliTPC::CreateMaterials()
 
   density = 1.39;
   
-  AliMixture(32, "Mylar",amat,zmat,density,-3,wmat);
-
-  AliMedium(5, "Mylar",32, 0, ISXFLD, SXMGMX, 10., .1, .1, .001, .01);
-
-
-
-
-  // Carbon (normal)
+  AliMixture(37, "Mylar",amat,zmat,density,-3,wmat); 
 
-  AliMaterial(33,"C normal",12.011,6.,2.265,18.8,999.);
-
-  AliMedium(6,"C normal",33,0, ISXFLD, SXMGMX, 10., .1, .1, .001, .01);
-
-  // G10 for inner and outr field cage
-  // G10 is 60% SiO2 + 40% epoxy, right now I use A and Z for SiO2
-
-  Float_t rhoFactor;
+  // SiO2 - used later for the glass fiber
 
   amat[0]=28.086;
   amat[1]=15.9994;
@@ -800,304 +626,168 @@ void AliTPC::CreateMaterials()
   wmat[0]=1.;
   wmat[1]=2.;
 
-  density = 1.7;
-  
 
-  AliMixture(34,"G10 aux.",amat,zmat,density,-2,wmat);
+  AliMixture(38,"SiO2",amat,zmat,2.2,-2,wmat); //SiO2 - quartz (rho=2.2)
 
+  // Al
 
-  gMC->Gfmate((*fIdmate)[34],namate,a,z,rho,X0,absl,buf,nbuf);
+  amat[0] = 26.98;
+  zmat[0] = 13.;
 
-  Float_t thickX0 = 0.0052; // field cage in X0 units
-  
-  Float_t thick = 2.; // in cm
+  density = 2.7;
 
-  X0=19.4; // G10 
+  AliMaterial(40,"Al",amat[0],zmat[0],density,999.,999.);
 
-  rhoFactor = X0*thickX0/thick;
-  density = rho*rhoFactor;
+  // Si
 
-  AliMaterial(35,"G10-fc",a,z,density,999.,999.);
+  amat[0] = 28.086;
+  zmat[0] = 14.;
 
-  AliMedium(8,"G10-fc",35,0, ISXFLD, SXMGMX, 10., .1, .1, .001, .01);
+  density = 2.33;
 
-  thickX0 = 0.0027; // inner vessel (eta <0.9)
-  thick=0.5;
-  rhoFactor = X0*thickX0/thick;
-  density = rho*rhoFactor;
+  AliMaterial(41,"Si",amat[0],zmat[0],density,999.,999.);
 
-  AliMaterial(36,"G10-iv",a,z,density,999.,999.);  
+  // Cu
 
-  AliMedium(9,"G10-iv",36,0, ISXFLD, SXMGMX, 10., .1, .1, .001, .01);
+  amat[0] = 63.546;
+  zmat[0] = 29.;
 
-  //  Carbon fibre  
-  
-  gMC->Gfmate((*fIdmate)[33],namate,a,z,rho,X0,absl,buf,nbuf);
+  density = 8.96;
 
-  thickX0 = 0.0133; // outer vessel
-  thick=3.0;
-  rhoFactor = X0*thickX0/thick;
-  density = rho*rhoFactor;
+  AliMaterial(42,"Cu",amat[0],zmat[0],density,999.,999.);
 
+  // Tedlar C2H3F
 
-  AliMaterial(37,"C-ov",a,z,density,999.,999.);
+  amat[0] = 12.011;
+  amat[1] = 1.;
+  amat[2] = 18.998;
 
-  AliMedium(10,"C-ov",37,0, ISXFLD, SXMGMX, 10., .1, .1, .001, .01);  
+  zmat[0] = 6.;
+  zmat[1] = 1.;
+  zmat[2] = 9.;
 
-  thickX0=0.015; // inner vessel (cone, eta > 0.9)
-  thick=1.5;
-  rhoFactor = X0*thickX0/thick;
-  density = rho*rhoFactor;
+  wmat[0] = 2.;
+  wmat[1] = 3.; 
+  wmat[2] = 1.;
 
-  AliMaterial(38,"C-ivc",a,z,density,999.,999.);
+  density = 1.71;
 
-  AliMedium(11,"C-ivc",38,0, ISXFLD, SXMGMX, 10., .1, .1, .001, .01);
+  AliMixture(43, "Tedlar",amat,zmat,density,-3,wmat);  
 
-  //
 
-  AliMedium(12,"CO2",10,0, ISXFLD, SXMGMX, 10., 999.,.1, .001, .001);
-    
+  // Plexiglas  C5H8O2
 
+  amat[0]=12.011;
+  amat[1]=1.;
+  amat[2]=15.9994;
 
-}
+  zmat[0]=6.;
+  zmat[1]=1.;
+  zmat[2]=8.;
 
-//_____________________________________________________________________________
-struct Bin {
-   const AliTPCdigit *dig;
-   int idx;
-   Bin() {dig=0; idx=-1;}
-};
-
-struct PreCluster : public AliTPCcluster {
-   const AliTPCdigit* summit;
-   int idx;
-   int cut;
-   int npeaks;
-   PreCluster();
-};
-PreCluster::PreCluster() : AliTPCcluster() {cut=npeaks=0;}
+  wmat[0]=5.;
+  wmat[1]=8.;
+  wmat[2]=2.;
 
+  density=1.18;
 
-//_____________________________________________________________________________
-static void FindCluster(int i, int j, Bin bins[][MAXTPCTBK+2], PreCluster &c) 
-{
-  //
-  // Find clusters
-  //
-  Bin& b=bins[i][j];
-  double q=double(b.dig->fSignal);
+  AliMixture(44,"Plexiglas",amat,zmat,density,-3,wmat);
 
-  if (q<0) { // digit is at the edge of the pad row
-    q=-q;
-    c.cut=1;
-  } 
-  if (b.idx >= 0 && b.idx != c.idx) {
-    c.idx=b.idx;
-    c.npeaks++;
-  }
-  
-  if (q > TMath::Abs(c.summit->fSignal)) c.summit=b.dig;
-  
-  c.fY += i*q;
-  c.fZ += j*q;
-  c.fSigmaY2 += i*i*q;
-  c.fSigmaZ2 += j*j*q;
-  c.fQ += q;
+  // Epoxy - C14 H20 O3
 
-  b.dig = 0;  b.idx = c.idx;
-  
-  if (bins[i-1][j].dig) FindCluster(i-1,j,bins,c);
-  if (bins[i][j-1].dig) FindCluster(i,j-1,bins,c);
-  if (bins[i+1][j].dig) FindCluster(i+1,j,bins,c);
-  if (bins[i][j+1].dig) FindCluster(i,j+1,bins,c);
   
-}
+  amat[0]=12.011;
+  amat[1]=1.;
+  amat[2]=15.9994;
 
-//_____________________________________________________________________________
-void AliTPC::Digits2Clusters()
-{
-  //
-  // simple TPC cluster finder from digits.
-  //
-  //
-  AliTPCParam * fTPCParam = &(fDigParam->GetParam());
-  
-  const Int_t MAX_PAD=200+2, MAX_BUCKET=MAXTPCTBK+2;
-  const Int_t Q_min=60;
-  const Int_t THRESHOLD=20;
-  
-  TTree *t=(TTree*)gDirectory->Get("TreeD0_Param1");
-  t->GetBranch("Digits")->SetAddress(&fDigits);
-  Int_t sectors_by_rows=(Int_t)t->GetEntries();
-  
-  int ncls=0;
-  
-  for (Int_t n=0; n<sectors_by_rows; n++) {
-    if (!t->GetEvent(n)) continue;
-    Bin bins[MAX_PAD][MAX_BUCKET];
-    AliTPCdigit *dig=(AliTPCdigit*)fDigits->UncheckedAt(0);
-    Int_t nsec=dig->fSector, nrow=dig->fPadRow;
-    Int_t ndigits=fDigits->GetEntriesFast();
-    
-    int npads;  int sign_z;
-    if (nsec<25) {
-      sign_z=(nsec<13) ? 1 : -1;
-      npads=fTPCParam->GetNPadsLow(nrow-1);
-    } else {
-      sign_z=(nsec<49) ? 1 : -1;
-      npads=fTPCParam->GetNPadsUp(nrow-1);
-    }
-    
-    int ndig;
-    for (ndig=0; ndig<ndigits; ndig++) {
-      dig=(AliTPCdigit*)fDigits->UncheckedAt(ndig);
-      int i=dig->fPad, j=dig->fTime;
-      if (dig->fSignal >= THRESHOLD) bins[i][j].dig=dig;
-      if (i==1 || i==npads || j==1 || j==MAXTPCTBK) dig->fSignal*=-1;
-    }
-    
-    int ncl=0;
-    int i,j;
-    
-    for (i=1; i<MAX_PAD-1; i++) {
-      for (j=1; j<MAX_BUCKET-1; j++) {
-       if (bins[i][j].dig == 0) continue;
-       PreCluster c; c.summit=bins[i][j].dig; c.idx=ncls;
-       FindCluster(i, j, bins, c);
-       c.fY /= c.fQ;
-       c.fZ /= c.fQ;
-
-        double s2 = c.fSigmaY2/c.fQ - c.fY*c.fY;
-        c.fSigmaY2 = s2 + 1./12.;
-        c.fSigmaY2 *= fTPCParam->GetPadPitchWidth()*
-                      fTPCParam->GetPadPitchWidth();
-        if (s2 != 0.) c.fSigmaY2 *= 0.022*8*4;
-
-        s2 = c.fSigmaZ2/c.fQ - c.fZ*c.fZ;
-        c.fSigmaZ2 = s2 + 1./12.;
-        c.fSigmaZ2 *= fTPCParam->GetZWidth()*fTPCParam->GetZWidth();
-        if (s2 != 0.) c.fSigmaZ2 *= 0.068*4*4;
-
-       c.fY = (c.fY - 0.5 - 0.5*npads)*fTPCParam->GetPadPitchWidth();
-       c.fZ = fTPCParam->GetZWidth()*(c.fZ+1); 
-       c.fZ -= 3.*fTPCParam->GetZSigma(); // PASA delay 
-       c.fZ = sign_z*(z_end - c.fZ);
-       //c.fZ += 0.023;
-       c.fSector=nsec;
-       c.fPadRow=nrow;
-       c.fTracks[0]=c.summit->fTracks[0];
-       c.fTracks[1]=c.summit->fTracks[1];
-       c.fTracks[2]=c.summit->fTracks[2];
-
-       if (c.cut) {
-         c.fSigmaY2 *= 25.;
-         c.fSigmaZ2 *= 4.;
-       }
-       
-       AddCluster(c); ncls++; ncl++;
-      }
-    }
-    
-    for (ndig=0; ndig<ndigits; ndig++) {
-      dig=(AliTPCdigit*)fDigits->UncheckedAt(ndig);
-      if (TMath::Abs(dig->fSignal) >= 0) 
-       bins[dig->fPad][dig->fTime].dig=dig;
-    }
-    
-    for (i=1; i<MAX_PAD-1; i++) {
-      for (j=1; j<MAX_BUCKET-1; j++) {
-       if (bins[i][j].dig == 0) continue;
-       PreCluster c; c.summit=bins[i][j].dig; c.idx=ncls;
-       FindCluster(i, j, bins, c);
-       if (c.fQ <= Q_min) continue; //noise cluster
-        if (c.npeaks>1) continue;    //overlapped cluster
-       c.fY /= c.fQ;
-       c.fZ /= c.fQ;
-
-        double s2 = c.fSigmaY2/c.fQ - c.fY*c.fY;
-        c.fSigmaY2 = s2 + 1./12.;
-        c.fSigmaY2 *= fTPCParam->GetPadPitchWidth()*
-                      fTPCParam->GetPadPitchWidth();
-        if (s2 != 0.) c.fSigmaY2 *= 0.022*4*0.6*4;
-
-        s2 = c.fSigmaZ2/c.fQ - c.fZ*c.fZ;
-        c.fSigmaZ2 = s2 + 1./12.;
-        c.fSigmaZ2 *= fTPCParam->GetZWidth()*fTPCParam->GetZWidth();
-        if (s2 != 0.) c.fSigmaZ2 *= 0.068*4*0.4;
-
-       c.fY = (c.fY - 0.5 - 0.5*npads)*fTPCParam->GetPadPitchWidth();
-       c.fZ = fTPCParam->GetZWidth()*(c.fZ+1); 
-       c.fZ -= 3.*fTPCParam->GetZSigma(); // PASA delay 
-       c.fZ = sign_z*(z_end - c.fZ);
-       //c.fZ += 0.023;
-       c.fSector=nsec;
-       c.fPadRow=nrow;
-       c.fTracks[0]=c.summit->fTracks[0];
-       c.fTracks[1]=c.summit->fTracks[1];
-       c.fTracks[2]=c.summit->fTracks[2];
-       
-       if (c.cut) {
-         c.fSigmaY2 *= 25.;
-         c.fSigmaZ2 *= 4.;
-       }
-       
-       if (c.npeaks==0) {AddCluster(c); ncls++; ncl++;}
-       else {
-         new ((*fClusters)[c.idx]) AliTPCcluster(c);
-       }
-      }
-    }
-    
-    cerr<<"sector, row, digits, clusters: "
-       <<nsec<<' '<<nrow<<' '<<ndigits<<' '<<ncl<<"                  \r";
-    
-    fDigits->Clear();
-    
-  }
-}
+  zmat[0]=6.;
+  zmat[1]=1.;
+  zmat[2]=8.;
 
-//_____________________________________________________________________________
-void AliTPC::ElDiff(Float_t *xyz)
-{
-  //--------------------------------------------------
-  // calculates the diffusion of a single electron
-  //--------------------------------------------------
+  wmat[0]=14.;
+  wmat[1]=20.;
+  wmat[2]=3.;
 
-  //-----------------------------------------------------------------
-  // Origin: Marek Kowalski  IFJ, Krakow, Marek.Kowalski@ifj.edu.pl
-  //-----------------------------------------------------------------
-  AliTPCParam * fTPCParam = &(fDigParam->GetParam());
-  Float_t driftl;
-  
-  Float_t z0=xyz[2];
+  density=1.25;
 
-  driftl=z_end-TMath::Abs(xyz[2]);
+  AliMixture(45,"Epoxy",amat,zmat,density,-3,wmat);
 
-  if(driftl<0.01) driftl=0.01;
+  // Carbon
 
-  // check the attachment
+  amat[0]=12.011;
+  zmat[0]=6.;
+  density= 2.265;
 
-  driftl=TMath::Sqrt(driftl);
+  AliMaterial(46,"C",amat[0],zmat[0],density,999.,999.);
+
+  // get epoxy
+
+  gMC->Gfmate((*fIdmate)[45],namate,amat[1],zmat[1],rho,X0,absl,buf,nbuf);
+
+  // Carbon fiber
+
+  wmat[0]=0.644; // by weight!
+  wmat[1]=0.356;
+
+  density=0.5*(1.25+2.265);
+
+  AliMixture(47,"Cfiber",amat,zmat,density,2,wmat);
+
+  // get SiO2
+
+  gMC->Gfmate((*fIdmate)[38],namate,amat[0],zmat[0],rho,X0,absl,buf,nbuf); 
 
-  //  Float_t sig_t = driftl*diff_t;
-  //Float_t sig_l = driftl*diff_l;
-  Float_t sig_t = driftl*fTPCParam->GetDiffT();
-  Float_t sig_l = driftl*fTPCParam->GetDiffL();
-  xyz[0]=gRandom->Gaus(xyz[0],sig_t);
-  xyz[1]=gRandom->Gaus(xyz[1],sig_t);
-  xyz[2]=gRandom->Gaus(xyz[2],sig_l);
+  wmat[0]=0.725; // by weight!
+  wmat[1]=0.275;
+
+  density=1.7;
+
+  AliMixture(39,"G10",amat,zmat,density,2,wmat);
+
+
+
+  //----------------------------------------------------------
+  // tracking media for gases
+  //----------------------------------------------------------
+
+  AliMedium(0, "Air", 24, 0, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999., .1, .01, .1);
+  AliMedium(1, "Drift gas 1", 31, 0, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999.,.1,.001, .001);
+  AliMedium(2, "Drift gas 2", 32, 1, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999.,.1,.001, .001);
+  AliMedium(3,"CO2",10,0, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999.,.1, .001, .001); 
+
+  //-----------------------------------------------------------  
+  // tracking media for solids
+  //-----------------------------------------------------------
   
-  if (TMath::Abs(xyz[2])>z_end){
-    xyz[2]=TMath::Sign(z_end,z0);
-  }
-  if(xyz[2]*z0 < 0.){
-    Float_t eps = 0.0001;
-    xyz[2]=TMath::Sign(eps,z0);
-  } 
+  AliMedium(4,"Al",40,0, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999., .1, .0005, .001);
+  AliMedium(5,"Kevlar",34,0, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999., .1, .0005, .001);
+  AliMedium(6,"Nomex",35,0, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999., .1, .001, .001);
+  AliMedium(7,"Makrolon",36,0, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999., .1, .001, .001);
+  AliMedium(8,"Mylar",37,0, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999., .1, .0005, .001);
+  AliMedium(9,"Tedlar",43,0, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999., .1, .0005, .001);
+  AliMedium(10,"Cu",42,0, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999., .1, .001, .001);
+  AliMedium(11,"Si",41,0, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999., .1, .001, .001);
+  AliMedium(12,"G10",39,0, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999., .1, .001, .001);
+  AliMedium(13,"Plexiglas",44,0, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999., .1, .001, .001);
+  AliMedium(14,"Epoxy",45,0, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999., .1, .0005, .001);
+  AliMedium(15,"Cfiber",47,0, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999., .1, .001, .001);
+    
 }
 
+
+void AliTPC::Digits2Clusters(TFile *of)
+{
+  //-----------------------------------------------------------------
+  // This is a simple cluster finder.
+  //-----------------------------------------------------------------
+  AliTPCclusterer::Digits2Clusters(fTPCParam,of);
+}
+
+extern Double_t SigmaY2(Double_t, Double_t, Double_t);
+extern Double_t SigmaZ2(Double_t, Double_t);
 //_____________________________________________________________________________
-void AliTPC::Hits2Clusters()
+void AliTPC::Hits2Clusters(TFile *of)
 {
   //--------------------------------------------------------
   // TPC simple cluster generator from hits
@@ -1108,13 +798,44 @@ void AliTPC::Hits2Clusters()
   //-----------------------------------------------------------------
   // Origin: Marek Kowalski  IFJ, Krakow, Marek.Kowalski@ifj.edu.pl
   //-----------------------------------------------------------------
-  AliTPCParam * fTPCParam = &(fDigParam->GetParam());
-  Float_t sigma_rphi,sigma_z,cl_rphi,cl_z;
+  // Adopted to Marian's cluster data structure by I.Belikov, CERN,
+  // Jouri.Belikov@cern.ch
+  //----------------------------------------------------------------
+  
+  /////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
+  //
+  //---------------------------------------------------------------------
+  //   ALICE TPC Cluster Parameters
+  //--------------------------------------------------------------------
+       
+  
+
+  // Cluster width in rphi
+  const Float_t kACrphi=0.18322;
+  const Float_t kBCrphi=0.59551e-3;
+  const Float_t kCCrphi=0.60952e-1;
+  // Cluster width in z
+  const Float_t kACz=0.19081;
+  const Float_t kBCz=0.55938e-3;
+  const Float_t kCCz=0.30428;
+
+  TDirectory *savedir=gDirectory; 
+
+  if (!of->IsOpen()) {
+     cerr<<"AliTPC::Hits2Clusters(): output file not open !\n";
+     return;
+  }
+
+   if(fTPCParam == 0){
+     printf("AliTPCParam MUST be created firstly\n");
+     return;
+   }
+
+  Float_t sigmaRphi,sigmaZ,clRphi,clZ;
   //
   TParticle *particle; // pointer to a given particle
   AliTPChit *tpcHit; // pointer to a sigle TPC hit
-  TClonesArray *Particles; //pointer to the particle list
-  Int_t sector,nhits;
+  Int_t sector;
   Int_t ipart;
   Float_t xyz[5];
   Float_t pl,pt,tanth,rpad,ratio;
@@ -1124,24 +845,32 @@ void AliTPC::Hits2Clusters()
   //  Get the access to the tracks 
   //---------------------------------------------------------------
   
-  TTree *TH = gAlice->TreeH();
-  Stat_t ntracks = TH->GetEntries();
+  TTree *tH = gAlice->TreeH();
+  Stat_t ntracks = tH->GetEntries();
+
+  //Switch to the output file
+  of->cd();
+
+  fTPCParam->Write(fTPCParam->GetTitle());
+  AliTPCClustersArray carray;
+  carray.Setup(fTPCParam);
+  carray.SetClusterType("AliTPCcluster");
+  carray.MakeTree();
+
+  Int_t nclusters=0; //cluster counter
   
   //------------------------------------------------------------
-  // Loop over all sectors (72 sectors)
-  // Sectors 1-24 are lower sectors, 1-12 z>0, 13-24 z<0
-  // Sectors 25-72 are upper sectors, 25-48 z>0, 49-72 z<0
+  // Loop over all sectors (72 sectors for 20 deg
+  // segmentation for both lower and upper sectors)
+  // Sectors 0-35 are lower sectors, 0-17 z>0, 17-35 z<0
+  // Sectors 36-71 are upper sectors, 36-53 z>0, 54-71 z<0
   //
-  // First cluster for sector 1 starts at "0"
+  // First cluster for sector 0 starts at "0"
   //------------------------------------------------------------
-  
-  
-  fClustersIndex[0] = 0;
-  
-  //
-  for(Int_t isec=1;isec<fNsectors+1;isec++){
+   
+  for(Int_t isec=0;isec<fTPCParam->GetNSector();isec++){
     //MI change
-    fTPCParam->AdjustAngles(isec,cph,sph);
+    fTPCParam->AdjustCosSin(isec,cph,sph);
     
     //------------------------------------------------------------
     // Loop over tracks
@@ -1149,46 +878,61 @@ void AliTPC::Hits2Clusters()
     
     for(Int_t track=0;track<ntracks;track++){
       ResetHits();
-      TH->GetEvent(track);
+      tH->GetEvent(track);
       //
-      //  Get number of the TPC hits and a pointer
-      //  to the particles
+      //  Get number of the TPC hits
       //
-      nhits=fHits->GetEntriesFast();
-      Particles=gAlice->Particles();
+      // nhits=fHits->GetEntriesFast();
       //
+     
+       tpcHit = (AliTPChit*)FirstHit(-1);
+
       // Loop over hits
       //
-      for(Int_t hit=0;hit<nhits;hit++){
-       tpcHit=(AliTPChit*)fHits->UncheckedAt(hit);
+       //   for(Int_t hit=0;hit<nhits;hit++){
+       //tpcHit=(AliTPChit*)fHits->UncheckedAt(hit);
+
+       while(tpcHit){
+        if (tpcHit->fQ == 0.) {
+           tpcHit = (AliTPChit*) NextHit();
+           continue; //information about track (I.Belikov)
+        }
        sector=tpcHit->fSector; // sector number
-       if(sector != isec) continue; //terminate iteration
-       ipart=tpcHit->fTrack;
-       particle=(TParticle*)Particles->UncheckedAt(ipart);
+
+
+       //      if(sector != isec) continue; //terminate iteration
+
+       if(sector != isec){
+        tpcHit = (AliTPChit*) NextHit();
+        continue; 
+       }
+       ipart=tpcHit->Track();
+       particle=gAlice->Particle(ipart);
        pl=particle->Pz();
        pt=particle->Pt();
        if(pt < 1.e-9) pt=1.e-9;
        tanth=pl/pt;
        tanth = TMath::Abs(tanth);
-       rpad=TMath::Sqrt(tpcHit->fX*tpcHit->fX + tpcHit->fY*tpcHit->fY);
+       rpad=TMath::Sqrt(tpcHit->X()*tpcHit->X() + tpcHit->Y()*tpcHit->Y());
        ratio=0.001*rpad/pt; // pt must be in MeV/c - historical reason
-       
+
        //   space-point resolutions
        
-       sigma_rphi=SigmaY2(rpad,tanth,pt);
-       sigma_z   =SigmaZ2(rpad,tanth   );
+       sigmaRphi=SigmaY2(rpad,tanth,pt);
+       sigmaZ   =SigmaZ2(rpad,tanth   );
        
        //   cluster widths
        
-       cl_rphi=ac_rphi-bc_rphi*rpad*tanth+cc_rphi*ratio*ratio;
-       cl_z=ac_z-bc_z*rpad*tanth+cc_z*tanth*tanth;
+       clRphi=kACrphi-kBCrphi*rpad*tanth+kCCrphi*ratio*ratio;
+       clZ=kACz-kBCz*rpad*tanth+kCCz*tanth*tanth;
        
        // temporary protection
        
-       if(sigma_rphi < 0.) sigma_rphi=0.4e-3;
-       if(sigma_z < 0.) sigma_z=0.4e-3;
-       if(cl_rphi < 0.) cl_rphi=2.5e-3;
-       if(cl_z < 0.) cl_z=2.5e-5;
+       if(sigmaRphi < 0.) sigmaRphi=0.4e-3;
+       if(sigmaZ < 0.) sigmaZ=0.4e-3;
+       if(clRphi < 0.) clRphi=2.5e-3;
+       if(clZ < 0.) clZ=2.5e-5;
        
        //
        
@@ -1196,44 +940,311 @@ void AliTPC::Hits2Clusters()
        // smearing --> rotate to the 1 (13) or to the 25 (49) sector,
        // then the inaccuracy in a X-Y plane is only along Y (pad row)!
        //
-       Float_t xprim= tpcHit->fX*cph + tpcHit->fY*sph;
-       Float_t yprim=-tpcHit->fX*sph + tpcHit->fY*cph;
-       xyz[0]=gRandom->Gaus(yprim,TMath::Sqrt(sigma_rphi));   // y
-        Double_t alpha=(sector<25) ? alpha_low : alpha_up;
-       if (TMath::Abs(xyz[0]/xprim) > TMath::Tan(0.5*alpha)) xyz[0]=yprim;
-       xyz[1]=gRandom->Gaus(tpcHit->fZ,TMath::Sqrt(sigma_z)); // z 
-        if (TMath::Abs(xyz[1]) > 250) xyz[1]=tpcHit->fZ;
-       xyz[2]=tpcHit->fQ;                                     // q
-       xyz[3]=sigma_rphi;                                     // fSigmaY2
-       xyz[4]=sigma_z;                                        // fSigmaZ2
-               
-       // and finally add the cluster
-       Int_t tracks[5]={tpcHit->fTrack, -1, -1, sector, tpcHit->fPadRow};
-       AddCluster(xyz,tracks);
-       
+        Float_t xprim= tpcHit->X()*cph + tpcHit->Y()*sph;
+       Float_t yprim=-tpcHit->X()*sph + tpcHit->Y()*cph;
+       xyz[0]=gRandom->Gaus(yprim,TMath::Sqrt(sigmaRphi));   // y
+          Float_t alpha=(isec < fTPCParam->GetNInnerSector()) ?
+         fTPCParam->GetInnerAngle() : fTPCParam->GetOuterAngle();
+          Float_t ymax=xprim*TMath::Tan(0.5*alpha);
+          if (TMath::Abs(xyz[0])>ymax) xyz[0]=yprim; 
+       xyz[1]=gRandom->Gaus(tpcHit->Z(),TMath::Sqrt(sigmaZ)); // z
+          if (TMath::Abs(xyz[1])>fTPCParam->GetZLength()) xyz[1]=tpcHit->Z(); 
+       xyz[2]=sigmaRphi;                                     // fSigmaY2
+       xyz[3]=sigmaZ;                                        // fSigmaZ2
+       xyz[4]=tpcHit->fQ;                                    // q
+
+        AliTPCClustersRow *clrow=carray.GetRow(sector,tpcHit->fPadRow);
+        if (!clrow) clrow=carray.CreateRow(sector,tpcHit->fPadRow);    
+
+        Int_t tracks[3]={tpcHit->Track(), -1, -1};
+       AliTPCcluster cluster(tracks,xyz);
+
+        clrow->InsertCluster(&cluster); nclusters++;
+
+        tpcHit = (AliTPChit*)NextHit();
+        
+
       } // end of loop over hits
-    }   // end of loop over tracks 
-    
-    fClustersIndex[isec] = fNclusters; // update clusters index
-    
-  } // end of loop over sectors
+
+    }   // end of loop over tracks
+
+    Int_t nrows=fTPCParam->GetNRow(isec);
+    for (Int_t irow=0; irow<nrows; irow++) {
+        AliTPCClustersRow *clrow=carray.GetRow(isec,irow);
+        if (!clrow) continue;
+        carray.StoreRow(isec,irow);
+        carray.ClearRow(isec,irow);
+    }
+
+  } // end of loop over sectors  
+
+  cerr<<"Number of made clusters : "<<nclusters<<"                        \n";
+
+  carray.GetTree()->Write();
+
+  savedir->cd(); //switch back to the input file
   
-  fClustersIndex[fNsectors]--; // set end of the clusters buffer
+} // end of function
+
+//_________________________________________________________________
+void AliTPC::Hits2ExactClustersSector(Int_t isec)
+{
+  //--------------------------------------------------------
+  //calculate exact cross point of track and given pad row
+  //resulting values are expressed in "digit" coordinata
+  //--------------------------------------------------------
+
+  //-----------------------------------------------------------------
+  // Origin: Marian Ivanov  GSI Darmstadt, m.ivanov@gsi.de
+  //-----------------------------------------------------------------
+  //
+  if (fClustersArray==0){    
+    return;
+  }
+  //
+  TParticle *particle; // pointer to a given particle
+  AliTPChit *tpcHit; // pointer to a sigle TPC hit
+  Int_t sector,nhits;
+  Int_t ipart;
+  const Int_t kcmaxhits=30000;
+  TVector * xxxx = new TVector(kcmaxhits*4);
+  TVector & xxx = *xxxx;
+  Int_t maxhits = kcmaxhits;
+  //construct array for each padrow
+  for (Int_t i=0; i<fTPCParam->GetNRow(isec);i++) 
+    fClustersArray->CreateRow(isec,i);
+  
+  //---------------------------------------------------------------
+  //  Get the access to the tracks 
+  //---------------------------------------------------------------
   
+  TTree *tH = gAlice->TreeH();
+  Stat_t ntracks = tH->GetEntries();
+  Int_t npart = gAlice->GetNtrack();
+    
+  //------------------------------------------------------------
+  // Loop over tracks
+  //------------------------------------------------------------
+  
+  for(Int_t track=0;track<ntracks;track++){
+    ResetHits();
+    tH->GetEvent(track);
+    //
+    //  Get number of the TPC hits and a pointer
+    //  to the particles
+    //
+    nhits=fHits->GetEntriesFast();
+    //
+    // Loop over hits
+    //
+    Int_t currentIndex=0;
+    Int_t lastrow=-1;  //last writen row
+    for(Int_t hit=0;hit<nhits;hit++){
+      tpcHit=(AliTPChit*)fHits->UncheckedAt(hit);
+      if (tpcHit==0) continue;
+      sector=tpcHit->fSector; // sector number
+      if(sector != isec) continue; 
+      ipart=tpcHit->Track();
+      if (ipart<npart) particle=gAlice->Particle(ipart);
+      
+      //find row number
+
+      Float_t  x[3]={tpcHit->X(),tpcHit->Y(),tpcHit->Z()};
+      Int_t    index[3]={1,isec,0};
+      Int_t    currentrow = fTPCParam->GetPadRow(x,index) ;    
+      if (currentrow<0) continue;
+      if (lastrow<0) lastrow=currentrow;
+      if (currentrow==lastrow){
+       if ( currentIndex>=maxhits){
+         maxhits+=kcmaxhits;
+         xxx.ResizeTo(4*maxhits);
+       }     
+       xxx(currentIndex*4)=x[0];
+       xxx(currentIndex*4+1)=x[1];
+       xxx(currentIndex*4+2)=x[2];     
+       xxx(currentIndex*4+3)=tpcHit->fQ;
+       currentIndex++; 
+      }
+      else 
+       if (currentIndex>2){
+         Float_t sumx=0;
+         Float_t sumx2=0;
+         Float_t sumx3=0;
+         Float_t sumx4=0;
+         Float_t sumy=0;
+         Float_t sumxy=0;
+         Float_t sumx2y=0;
+         Float_t sumz=0;
+         Float_t sumxz=0;
+         Float_t sumx2z=0;
+         Float_t sumq=0;
+         for (Int_t index=0;index<currentIndex;index++){
+           Float_t x,x2,x3,x4;
+           x=x2=x3=x4=xxx(index*4);
+           x2*=x;
+           x3*=x2;
+           x4*=x3;
+           sumx+=x;
+           sumx2+=x2;
+           sumx3+=x3;
+           sumx4+=x4;
+           sumy+=xxx(index*4+1);
+           sumxy+=xxx(index*4+1)*x;
+           sumx2y+=xxx(index*4+1)*x2;
+           sumz+=xxx(index*4+2);
+           sumxz+=xxx(index*4+2)*x;
+           sumx2z+=xxx(index*4+2)*x2;   
+           sumq+=xxx(index*4+3);
+         }
+         Float_t centralPad = (fTPCParam->GetNPads(isec,lastrow)-1)/2;
+         Float_t det=currentIndex*(sumx2*sumx4-sumx3*sumx3)-sumx*(sumx*sumx4-sumx2*sumx3)+
+           sumx2*(sumx*sumx3-sumx2*sumx2);
+         
+         Float_t detay=sumy*(sumx2*sumx4-sumx3*sumx3)-sumx*(sumxy*sumx4-sumx2y*sumx3)+
+           sumx2*(sumxy*sumx3-sumx2y*sumx2);
+         Float_t detaz=sumz*(sumx2*sumx4-sumx3*sumx3)-sumx*(sumxz*sumx4-sumx2z*sumx3)+
+           sumx2*(sumxz*sumx3-sumx2z*sumx2);
+         
+         Float_t detby=currentIndex*(sumxy*sumx4-sumx2y*sumx3)-sumy*(sumx*sumx4-sumx2*sumx3)+
+           sumx2*(sumx*sumx2y-sumx2*sumxy);
+         Float_t detbz=currentIndex*(sumxz*sumx4-sumx2z*sumx3)-sumz*(sumx*sumx4-sumx2*sumx3)+
+           sumx2*(sumx*sumx2z-sumx2*sumxz);
+         
+         Float_t y=detay/det+centralPad;
+         Float_t z=detaz/det;  
+         Float_t by=detby/det; //y angle
+         Float_t bz=detbz/det; //z angle
+         sumy/=Float_t(currentIndex);
+         sumz/=Float_t(currentIndex);
+         AliComplexCluster cl;
+         cl.fX=z;
+         cl.fY=y;
+         cl.fQ=sumq;
+         cl.fSigmaX2=bz;
+         cl.fSigmaY2=by;
+         cl.fTracks[0]=ipart;
+         
+         AliTPCClustersRow * row = (fClustersArray->GetRow(isec,lastrow));
+         if (row!=0) row->InsertCluster(&cl);
+         currentIndex=0;
+         lastrow=currentrow;
+       } //end of calculating cluster for given row
+       
+       
+       
+    } // end of loop over hits
+  }   // end of loop over tracks 
+  //write padrows to tree 
+  for (Int_t ii=0; ii<fTPCParam->GetNRow(isec);ii++) {
+    fClustersArray->StoreRow(isec,ii);    
+    fClustersArray->ClearRow(isec,ii);        
+  }
+  xxxx->Delete();
 }
+//___________________________________________
+void AliTPC::SDigits2Digits()
+{
+  AliTPCParamSR *param=(AliTPCParamSR*)gDirectory->Get("75x40_100x60");
+  AliTPCPRF2D    * prfinner   = new AliTPCPRF2D;
+  AliTPCPRF2D    * prfouter   = new AliTPCPRF2D;
+  AliTPCRF1D     * rf    = new AliTPCRF1D(kTRUE);
+
+  TDirectory *cwd = gDirectory;
+  rf->SetGauss(param->GetZSigma(),param->GetZWidth(),1.);
+  rf->SetOffset(3*param->GetZSigma());
+  rf->Update();
+  TFile *f=TFile::Open("$ALICE_ROOT/TPC/AliTPCprf2d.root");
+  if (!f->IsOpen()) { 
+     cerr<<"Can't open $ALICE_ROOT/TPC/AliTPCprf2d.root !\n";
+     exit(3);
+  }
+  prfinner->Read("prf_07504_Gati_056068_d02");
+  prfouter->Read("prf_10006_Gati_047051_d03");
+  f->Close();
+  cwd->cd();
+  
+  param->SetInnerPRF(prfinner);
+  param->SetOuterPRF(prfouter); 
+  param->SetTimeRF(rf);
 
+  SetParam(param);
 
+  cerr<<"Digitizing TPC...\n";
+
+  //setup TPCDigitsArray 
+  AliTPCDigitsArray *arr = new AliTPCDigitsArray; 
+  arr->SetClass("AliSimDigits");
+  arr->Setup(param);
+  SetParam(param);
+  arr->MakeTree(fDigitsFile);
+
+  SetDigitsArray(arr);
+
+  Hits2Digits();
+   
+  // Hits2DigitsSector(1);         
+  // Hits2DigitsSector(2);             
+  // Hits2DigitsSector(3);             
+  // Hits2DigitsSector(1+18);             
+  // Hits2DigitsSector(2+18);             
+  // Hits2DigitsSector(3+18);             
+
+  // Hits2DigitsSector(36+1);             
+  // Hits2DigitsSector(36+2);             
+  // Hits2DigitsSector(36+3);             
+  // Hits2DigitsSector(36+1+18);             
+  // Hits2DigitsSector(36+2+18);             
+  // Hits2DigitsSector(36+3+18); 
+     
+  //write results
+
+  char treeName[100];
+  sprintf(treeName,"TreeD_%s",param->GetTitle());
+  GetDigitsArray()->GetTree()->Write(treeName,TObject::kOverwrite);
+}
+
+//__________________________________________________________________  
 void AliTPC::Hits2Digits()  
 { 
-
  //----------------------------------------------------
-  // Loop over all sectors (72 sectors)
-  // Sectors 1-24 are lower sectors, 1-12 z>0, 13-24 z<0
-  // Sectors 25-72 are upper sectors, 25-48 z>0, 49-72 z<0
-  //----
-  for(Int_t isec=0;isec<fNsectors;isec++)  Hits2DigitsSector(isec);
+ // Loop over all sectors
+ //----------------------------------------------------
+
+  if(fTPCParam == 0){
+    printf("AliTPCParam MUST be created firstly\n");
+    return;
+  } 
+  
+  fDigitsSwitch=0;
+
+ for(Int_t isec=0;isec<fTPCParam->GetNSector();isec++) Hits2DigitsSector(isec);
+
 }
 
+//__________________________________________________________________
+void AliTPC::Hits2SDigits()  
+{ 
+
+  //-----------------------------------------------------------
+  //   summable digits - 16 bit "ADC", no noise, no saturation
+  //-----------------------------------------------------------
+
+ //----------------------------------------------------
+ // Loop over all sectors
+ //----------------------------------------------------
+
+  if(fTPCParam == 0){
+    printf("AliTPCParam MUST be created firstly\n");
+    return;
+  } 
+  
+  fDigitsSwitch=1;
+
+ for(Int_t isec=0;isec<fTPCParam->GetNSector();isec++) Hits2DigitsSector(isec);
+
+}
 
 //_____________________________________________________________________________
 void AliTPC::Hits2DigitsSector(Int_t isec)
@@ -1250,9 +1261,9 @@ void AliTPC::Hits2DigitsSector(Int_t isec)
   //  Get the access to the track hits
   //-------------------------------------------------------
 
-  AliTPCParam * fTPCParam = &(fDigParam->GetParam());
-  TTree *TH = gAlice->TreeH(); // pointer to the hits tree
-  Stat_t ntracks = TH->GetEntries();
+
+  TTree *tH = gAlice->TreeH(); // pointer to the hits tree
+  Stat_t ntracks = tH->GetEntries();
 
   if( ntracks > 0){
 
@@ -1260,28 +1271,15 @@ void AliTPC::Hits2DigitsSector(Int_t isec)
   //  Only if there are any tracks...
   //-------------------------------------------
 
-    
-    // TObjArrays for three neighouring pad-rows
-
-    TObjArray **rowTriplet = new TObjArray* [3]; 
-    
-    // TObjArray-s for each pad-row
-
     TObjArray **row;
-      
-    for (Int_t trip=0;trip<3;trip++){  
-      rowTriplet[trip]=new TObjArray;
-    }
-
-
     
-      printf("*** Processing sector number %d ***\n",isec);
+    //printf("*** Processing sector number %d ***\n",isec);
 
       Int_t nrows =fTPCParam->GetNRow(isec);
 
       row= new TObjArray* [nrows];
     
-      MakeSector(isec,nrows,TH,ntracks,row);
+      MakeSector(isec,nrows,tH,ntracks,row);
 
       //--------------------------------------------------------
       //   Digitize this sector, row by row
@@ -1292,203 +1290,40 @@ void AliTPC::Hits2DigitsSector(Int_t isec)
 
       Int_t i;
 
-      for (i=0;i<nrows;i++){
-
-       // Triplets for i = 0 and i=1 are identical!
-       // The same for i = nrows-1 and nrows!
+      if (fDigitsArray->GetTree()==0) fDigitsArray->MakeTree(fDigitsFile);
 
-        if(i != 1 && i != nrows-1){
-          MakeTriplet(i,rowTriplet,row);
-        }
+      for (i=0;i<nrows;i++){
 
-           DigitizeRow(i,isec,rowTriplet);
+               AliDigits * dig = fDigitsArray->CreateRow(isec,i); 
 
-           fDigParam->Fill();
+       DigitizeRow(i,isec,row);
 
-            Int_t ndig=fDigParam->GetArray()->GetEntriesFast();
+       fDigitsArray->StoreRow(isec,i);
 
-            printf("*** Sector, row, digits %d %d %d ***\n",isec,i,ndig);
+               Int_t ndig = dig->GetDigitSize(); 
+        
+       //printf("*** Sector, row, compressed digits %d %d %d ***\n",isec,i,ndig);
+       
+        fDigitsArray->ClearRow(isec,i);  
 
-           ResetDigits(); // reset digits for this row after storing them
-             
+   
        } // end of the sector digitization
-     
-       // delete the last triplet
 
-       for (i=0;i<3;i++) rowTriplet[i]->Delete();
-          
+      for(i=0;i<nrows;i++){
+        row[i]->Delete();  
+        delete row[i];   
+      }
+      
        delete [] row; // delete the array of pointers to TObjArray-s
         
   } // ntracks >0
-} // end of Hits2Digits
-//_____________________________________________________________________________
-void AliTPC::MakeTriplet(Int_t row,
-                         TObjArray **rowTriplet, TObjArray **prow)
-{
-  //------------------------------------------------------------------
-  //  Makes the "triplet" of the neighbouring pad-row for the
-  //  digitization including the cross-talk between the pad-rows
-  //------------------------------------------------------------------
 
-  //-----------------------------------------------------------------
-  // Origin: Marek Kowalski  IFJ, Krakow, Marek.Kowalski@ifj.edu.pl
-  //-----------------------------------------------------------------
-
-  AliTPCParam * fTPCParam = &(fDigParam->GetParam());
-  Float_t gasgain = fTPCParam->GetGasGain();
-  Int_t nTracks[3];
-
-  Int_t nElements,nElectrons;
-
-  TVector *pv;
-  TVector *tv;
-
-  //-------------------------------------------------------------------
-  // pv is an "old" track, i.e. label + triplets of (x,y,z) 
-  // for each electron
-  //
-  //-------------------------------------------------------------------
-
-
-  Int_t i1,i2;
-  Int_t nel,nt;
-
-  if(row == 0 || row == 1){
-
-  // create entire triplet for the first AND the second row
-
-    nTracks[0] = prow[0]->GetEntries();
-    nTracks[1] = prow[1]->GetEntries();
-    nTracks[2] = prow[2]->GetEntries();
-
-    for(i1=0;i1<3;i1++){
-      nt = nTracks[i1]; // number of tracks for this row
-
-      for(i2=0;i2<nt;i2++){
-        pv = (TVector*)prow[i1]->At(i2);
-        TVector &v1 = *pv;
-        nElements = pv->GetNrows(); 
-        nElectrons = (nElements-1)/3;
-
-        tv = new TVector(4*nElectrons+1); // create TVector for a modified track
-        TVector &v2 = *tv;
-        v2(0)=v1(0); //track label
-
-        for(nel=0;nel<nElectrons;nel++){        
-          Int_t idx1 = nel*3;
-          Int_t idx2 = nel*4;
-                 // Avalanche, including fluctuations
-          Int_t aval = (Int_t) (-gasgain*TMath::Log(gRandom->Rndm()));
-          v2(idx2+1)= v1(idx1+1);
-          v2(idx2+2)= v1(idx1+2);
-          v2(idx2+3)= v1(idx1+3);
-          v2(idx2+4)= (Float_t)aval; // in number of electrons!        
-       } // end of loop over electrons
-       //
-       //  Add this track to a row 
-       //
-
-        rowTriplet[i1]->Add(tv); 
+} // end of Hits2DigitsSector
 
 
-      } // end of loop over tracks for this row
-
-      prow[i1]->Delete(); // remove "old" tracks
-      delete prow[i1]; // delete  TObjArray for this row
-      prow[i1]=0; // set pointer to NULL
-
-    } // end of loop over row triplets
-
-
-  }
-  else{
-   
-    rowTriplet[0]->Delete(); // remove old lower row
-
-    nTracks[0]=rowTriplet[1]->GetEntries(); // previous middle row
-    nTracks[1]=rowTriplet[2]->GetEntries(); // previous upper row
-    nTracks[2]=prow[row+1]->GetEntries(); // next row
-    
-
-    //------------------------------------------- 
-    //  shift new tracks downwards
-    //-------------------------------------------
-
-    for(i1=0;i1<nTracks[0];i1++){
-      pv=(TVector*)rowTriplet[1]->At(i1);
-      rowTriplet[0]->Add(pv); 
-    }       
-
-    rowTriplet[1]->Clear(); // leave tracks on the heap!!!
-
-    for(i1=0;i1<nTracks[1];i1++){
-      pv=(TVector*)rowTriplet[2]->At(i1);
-      rowTriplet[1]->Add(pv);
-    }
-
-    rowTriplet[2]->Clear(); // leave tracks on the heap!!!
-
-    //---------------------------------------------
-    //  Create new upper row
-    //---------------------------------------------
-
-    
-
-    for(i1=0;i1<nTracks[2];i1++){
-        pv = (TVector*)prow[row+1]->At(i1);
-        TVector &v1 = *pv;
-        nElements = pv->GetNrows();
-        nElectrons = (nElements-1)/3;
-
-        tv = new TVector(4*nElectrons+1); // create TVector for a modified track
-        TVector &v2 = *tv;
-        v2(0)=v1(0); //track label
-
-        for(nel=0;nel<nElectrons;nel++){
-        
-          Int_t idx1 = nel*3;
-          Int_t idx2 = nel*4;
-         // Avalanche, including fluctuations
-          Int_t aval = (Int_t) 
-           (-gasgain*TMath::Log(gRandom->Rndm()));
-          
-          v2(idx2+1)= v1(idx1+1); 
-          v2(idx2+2)= v1(idx1+2);
-          v2(idx2+3)= v1(idx1+3);
-          v2(idx2+4)= (Float_t)aval; // in number of electrons!        
-       } // end of loop over electrons
-
-          rowTriplet[2]->Add(tv);
-     
-    } // end of loop over tracks
-         
-    prow[row+1]->Delete(); // delete tracks for this row
-    delete prow[row+1];  // delete TObjArray for this row
-    prow[row+1]=0; // set a pointer to NULL
-
-  }
-
-}  // end of MakeTriplet
-//_____________________________________________________________________________
-void AliTPC::ExB(Float_t *xyz)
-{
-  //------------------------------------------------
-  //  ExB at the wires and wire number calulation
-  //------------------------------------------------
-  
-  //-----------------------------------------------------------------
-  // Origin: Marek Kowalski  IFJ, Krakow, Marek.Kowalski@ifj.edu.pl
-  //-----------------------------------------------------------------
-   AliTPCParam * fTPCParam = &(fDigParam->GetParam());
-
-   Float_t x1=xyz[0];
-   fTPCParam->GetWire(x1);        //calculate nearest wire position
-   Float_t dx=xyz[0]-x1;
-   xyz[1]+=dx*fTPCParam->GetOmegaTau();
-
-} // end of ExB
 //_____________________________________________________________________________
-void AliTPC::DigitizeRow(Int_t irow,Int_t isec,TObjArray **rowTriplet)
+void AliTPC::DigitizeRow(Int_t irow,Int_t isec,TObjArray **rows)
 {
   //-----------------------------------------------------------
   // Single row digitization, coupling from the neighbouring
@@ -1497,139 +1332,79 @@ void AliTPC::DigitizeRow(Int_t irow,Int_t isec,TObjArray **rowTriplet)
 
   //-----------------------------------------------------------------
   // Origin: Marek Kowalski  IFJ, Krakow, Marek.Kowalski@ifj.edu.pl
+  // Modified: Marian Ivanov GSI Darmstadt, m.ivanov@gsi.de
   //-----------------------------------------------------------------
  
 
-  AliTPCParam * fTPCParam = &(fDigParam->GetParam());
-  Float_t chipgain= fTPCParam->GetChipGain();
   Float_t zerosup = fTPCParam->GetZeroSup();
   Int_t nrows =fTPCParam->GetNRow(isec);
+  fCurrentIndex[1]= isec;
   
-  Int_t nTracks[3];
-  Int_t n_of_pads[3];
-  Int_t IndexRange[4];
-  Int_t i1;
-  Int_t iFlag; 
 
-  //
-  // iFlag = 0 -> inner row, iFlag = 1 -> the middle one, iFlag = 2 -> the outer one
-  //
-
-  nTracks[0]=rowTriplet[0]->GetEntries(); // lower row
-  nTracks[1]=rowTriplet[1]->GetEntries(); // middle row
-  nTracks[2]=rowTriplet[2]->GetEntries(); // upper row
-
-    
-  if(irow == 0){
-    iFlag=0;
-    n_of_pads[0]=fTPCParam->GetNPads(isec,0);
-    n_of_pads[1]=fTPCParam->GetNPads(isec,1);
-  }
-  else if(irow == nrows-1){
-     iFlag=2;
-     n_of_pads[1]=fTPCParam->GetNPads(isec,irow-1);
-     n_of_pads[2]=fTPCParam->GetNPads(isec,irow);
-  }
-  else {
-    iFlag=1;
-    for(i1=0;i1<3;i1++){
-       n_of_pads[i1]=fTPCParam->GetNPads(isec,irow-1+i1);
-    }
-  }
+  Int_t nofPads = fTPCParam->GetNPads(isec,irow);
+  Int_t nofTbins = fTPCParam->GetMaxTBin();
+  Int_t indexRange[4];
   //
   //  Integrated signal for this row
   //  and a single track signal
-  // 
-   
-  TMatrix *m1   = new TMatrix(0,n_of_pads[iFlag]-1,0,MAXTPCTBK-1); // integrated
-  TMatrix *m2   = new TMatrix(0,n_of_pads[iFlag]-1,0,MAXTPCTBK-1); // single
-
+  //    
+  TMatrix *m1   = new TMatrix(0,nofPads,0,nofTbins); // integrated
+  TMatrix *m2   = new TMatrix(0,nofPads,0,nofTbins); // single
   //
-
-  TMatrix &Total  = *m1;
+  TMatrix &total  = *m1;
 
   //  Array of pointers to the label-signal list
 
-  Int_t NofDigits = n_of_pads[iFlag]*MAXTPCTBK; // number of digits for this row
-
-  Float_t  **pList = new Float_t* [NofDigits]; 
+  Int_t nofDigits = nofPads*nofTbins; // number of digits for this row
+  Float_t  **pList = new Float_t* [nofDigits]; 
 
   Int_t lp;
-
-  for(lp=0;lp<NofDigits;lp++)pList[lp]=0; // set all pointers to NULL
-
-  //
-  //  Straight signal and cross-talk, cross-talk is integrated over all
-  //  tracks and added to the signal at the very end
-  //
-   
-
-  for (i1=0;i1<nTracks[iFlag];i1++){
-
-    m2->Zero(); // clear single track signal matrix
-  
-    Float_t TrackLabel = 
-      GetSignal(rowTriplet[iFlag],i1,n_of_pads[iFlag],m2,m1,IndexRange); 
-
-    GetList(TrackLabel,n_of_pads[iFlag],m2,IndexRange,pList);
-
-  }
-
-  // 
-  //  Cross talk from the neighbouring pad-rows
-  //
-
-  TMatrix *m3 =  new TMatrix(0,n_of_pads[iFlag]-1,0,MAXTPCTBK-1); // cross-talk
-
-  TMatrix &Cross = *m3;
-
-  if(iFlag == 0){
-
-    // cross-talk from the outer row only (first pad row)
-
-    GetCrossTalk(0,rowTriplet[1],nTracks[1],n_of_pads,m3);
-
-  }
-  else if(iFlag == 2){
-
-    // cross-talk from the inner row only (last pad row)
-
-    GetCrossTalk(2,rowTriplet[1],nTracks[1],n_of_pads,m3);
-
+  Int_t i1;   
+  for(lp=0;lp<nofDigits;lp++)pList[lp]=0; // set all pointers to NULL
+  //
+  //calculate signal 
+  //
+  Int_t row1 = TMath::Max(irow-fTPCParam->GetNCrossRows(),0);
+  Int_t row2 = TMath::Min(irow+fTPCParam->GetNCrossRows(),nrows-1);
+  for (Int_t row= row1;row<=row2;row++){
+    Int_t nTracks= rows[row]->GetEntries();
+    for (i1=0;i1<nTracks;i1++){
+      fCurrentIndex[2]= row;
+      fCurrentIndex[3]=irow;
+      if (row==irow){
+       m2->Zero();  // clear single track signal matrix
+       Float_t trackLabel = GetSignal(rows[row],i1,m2,m1,indexRange); 
+       GetList(trackLabel,nofPads,m2,indexRange,pList);
+      }
+      else   GetSignal(rows[row],i1,0,m1,indexRange);
+    }
   }
-  else{
+         
+  Int_t tracks[3];
 
-    // cross-talk from both inner and outer rows
+  AliDigits *dig = fDigitsArray->GetRow(isec,irow);
+  for(Int_t ip=0;ip<nofPads;ip++){
+    for(Int_t it=0;it<nofTbins;it++){
 
-    GetCrossTalk(3,rowTriplet[0],nTracks[0],n_of_pads,m3); // inner
-    GetCrossTalk(4,rowTriplet[2],nTracks[2],n_of_pads,m3); //outer
-  }
+      Float_t q = total(ip,it);
 
-  Total += Cross; // add the cross-talk
-
-  //
-  //  Convert analog signal to ADC counts
-  //
-   
-  Int_t tracks[3];
-  Int_t digits[5];
+      Int_t gi =it*nofPads+ip; // global index
 
+      if(fDigitsSwitch == 0){
 
-  for(Int_t ip=0;ip<n_of_pads[iFlag];ip++){
-    for(Int_t it=0;it<MAXTPCTBK;it++){
+        q = gRandom->Gaus(q,fTPCParam->GetNoise()*fTPCParam->GetNoiseNormFac()); 
 
-      Float_t q = Total(ip,it);
+        q = (Int_t)q;
 
-      Int_t gi =it*n_of_pads[iFlag]+ip; // global index
+        if(q <=zerosup) continue; // do not fill zeros
+        if(q > fTPCParam->GetADCSat()) q = fTPCParam->GetADCSat();  // saturation
 
-      q = gRandom->Gaus(q,fTPCParam->GetNoise()); // apply noise
-      q *= (q_el*1.e15); // convert to fC
-      q *= chipgain; // convert to mV   
-      q *= (adc_sat/dyn_range); // convert to ADC counts  
+      }
 
-      if(q <zerosup) continue; // do not fill zeros
-      if(q > adc_sat) q = adc_sat;  // saturation
+      else {
+       q *= 16.;
+       q = (Int_t)q;
+      }
 
       //
       //  "real" signal or electronic noise (list = -1)?
@@ -1639,15 +1414,20 @@ void AliTPC::DigitizeRow(Int_t irow,Int_t isec,TObjArray **rowTriplet)
         tracks[j1] = (pList[gi]) ?(Int_t)(*(pList[gi]+j1)) : -1;
       }
 
-      digits[0]=isec;
-      digits[1]=irow;
-      digits[2]=ip;
-      digits[3]=it;
-      digits[4]= (Int_t)q;
-
-      //  Add this digit
-
-      AddDigit(tracks,digits);
+//Begin_Html
+/*
+  <A NAME="AliDigits"></A>
+  using of AliDigits object
+*/
+//End_Html
+      dig->SetDigitFast((Short_t)q,it,ip);
+      if (fDigitsArray->IsSimulated())
+       {
+        ((AliSimDigits*)dig)->SetTrackIDFast(tracks[0],it,ip,0);
+        ((AliSimDigits*)dig)->SetTrackIDFast(tracks[1],it,ip,1);
+        ((AliSimDigits*)dig)->SetTrackIDFast(tracks[2],it,ip,2);
+       }
+     
     
     } // end of loop over time buckets
   }  // end of lop over pads 
@@ -1656,7 +1436,7 @@ void AliTPC::DigitizeRow(Int_t irow,Int_t isec,TObjArray **rowTriplet)
   //  This row has been digitized, delete nonused stuff
   //
 
-  for(lp=0;lp<NofDigits;lp++){
+  for(lp=0;lp<nofDigits;lp++){
     if(pList[lp]) delete [] pList[lp];
   }
   
@@ -1664,12 +1444,14 @@ void AliTPC::DigitizeRow(Int_t irow,Int_t isec,TObjArray **rowTriplet)
 
   delete m1;
   delete m2;
-  delete m3;
+  //  delete m3;
 
 } // end of DigitizeRow
+
 //_____________________________________________________________________________
-Float_t AliTPC::GetSignal(TObjArray *p1, Int_t ntr, Int_t np, TMatrix *m1, TMatrix *m2,
-                          Int_t *IndexRange)
+
+Float_t AliTPC::GetSignal(TObjArray *p1, Int_t ntr, TMatrix *m1, TMatrix *m2,
+                          Int_t *indexRange)
 {
 
   //---------------------------------------------------------------
@@ -1680,113 +1462,60 @@ Float_t AliTPC::GetSignal(TObjArray *p1, Int_t ntr, Int_t np, TMatrix *m1, TMatr
 
   //-----------------------------------------------------------------
   // Origin: Marek Kowalski  IFJ, Krakow, Marek.Kowalski@ifj.edu.pl
+  // Modified: Marian Ivanov 
   //-----------------------------------------------------------------
 
   TVector *tv;
-  AliTPCParam * fTPCParam = &(fDigParam->GetParam());
-  AliTPCPRF2D * fPRF2D = &(fDigParam->GetPRF2D());
-  AliTPCRF1D  * fRF    = &(fDigParam->GetRF()); 
  
-  //to make the code faster we put parameters  to the stack
-
-  Float_t zwidth  = fTPCParam->GetZWidth();
-  Float_t zwidthm1  =1./zwidth;
-
   tv = (TVector*)p1->At(ntr); // pointer to a track
   TVector &v = *tv;
   
   Float_t label = v(0);
+  Int_t centralPad = (fTPCParam->GetNPads(fCurrentIndex[1],fCurrentIndex[3])-1)/2;
 
-  Int_t CentralPad = (np-1)/2;
-  Int_t PadNumber;
   Int_t nElectrons = (tv->GetNrows()-1)/4;
-  Float_t range=((np-1)/2 + 0.5)*fTPCParam->GetPadPitchWidth(); // pad range
-
-  range -= 0.5; // dead zone, 5mm from the edge, according to H.G. Fischer
-  
-  Float_t IneffFactor = 0.5; // inefficiency in the gain close to the edge, as above
+  indexRange[0]=9999; // min pad
+  indexRange[1]=-1; // max pad
+  indexRange[2]=9999; //min time
+  indexRange[3]=-1; // max time
 
-
-  Float_t PadSignal[7]; // signal from a single electron
+  //  Float_t IneffFactor = 0.5; // inefficiency in the gain close to the edge, as above
 
   TMatrix &signal = *m1;
-  TMatrix &total = *m2;
-
-
-  IndexRange[0]=9999; // min pad
-  IndexRange[1]=-1; // max pad
-  IndexRange[2]=9999; //min time
-  IndexRange[3]=-1; // max time
-
+  TMatrix &total = *m2;
   //
   //  Loop over all electrons
   //
-
   for(Int_t nel=0; nel<nElectrons; nel++){
-   Int_t idx=nel*4;
-   Float_t xwire = v(idx+1);
-   Float_t y = v(idx+2);
-   Float_t z = v(idx+3);
-
-
-   Float_t absy=TMath::Abs(y);
-   
-   if(absy < 0.5*fTPCParam->GetPadPitchWidth()){
-     PadNumber=CentralPad;
-   }
-   else if (absy < range){
-     PadNumber=(Int_t) ((absy-0.5*fTPCParam->GetPadPitchWidth())/fTPCParam->GetPadPitchWidth()+1.);
-     PadNumber=(Int_t) (TMath::Sign((Float_t)PadNumber, y)+CentralPad);
-   }
-   else continue; // electron out of pad-range , lost at the sector edge
+    Int_t idx=nel*4;
+    Float_t aval =  v(idx+4);
+    Float_t eltoadcfac=aval*fTPCParam->GetTotalNormFac(); 
+    Float_t xyz[3]={v(idx+1),v(idx+2),v(idx+3)};
+    Int_t n = fTPCParam->CalcResponse(xyz,fCurrentIndex,fCurrentIndex[3]);
     
-   Float_t aval = (absy<range-0.5) ? v(idx+4):v(idx+4)*IneffFactor;
-   
-
-   Float_t dist = y - (Float_t)(PadNumber-CentralPad)*fTPCParam->GetPadPitchWidth();
-   for (Int_t i=0;i<7;i++){
-     PadSignal[i]=fPRF2D->GetPRF(dist+(i-3)*fTPCParam->GetPadPitchWidth(),xwire)*aval;
-     PadSignal[i] *= fTPCParam->GetPadCoupling();
-   }
-
-   Int_t  LeftPad = TMath::Max(0,PadNumber-3);
-   Int_t  RightPad = TMath::Min(np-1,PadNumber+3);
-
-   Int_t pmin=LeftPad-PadNumber+3; // lower index of the pad_signal vector
-   Int_t pmax=RightPad-PadNumber+3; // upper index     
-   
-   Float_t z_drift = z*zwidthm1;
-   Float_t z_offset = z_drift-(Int_t)z_drift;
-  //distance to the centre of nearest time bin (in time bin units)
-   Int_t FirstBucket = (Int_t)z_drift; 
-
-
-   // loop over time bins (4 bins is enough - 3 sigma truncated Gaussian)
-   for (Int_t i2=0;i2<4;i2++){          
-     Int_t TrueTime = FirstBucket+i2; // current time bucket
-     Float_t dz   = (Float_t(i2)+z_offset)*zwidth; 
-     Float_t ampl = fRF->GetRF(dz); 
-     if( (TrueTime>MAXTPCTBK-1) ) break; // beyond the time range
-     
-     IndexRange[2]=TMath::Min(IndexRange[2],TrueTime); // min time
-     IndexRange[3]=TMath::Max(IndexRange[3],TrueTime); // max time
-
-     // loop over pads, from pmin to pmax
-     for(Int_t i3=pmin;i3<=pmax;i3++){
-       Int_t TruePad = LeftPad+i3-pmin;
-       IndexRange[0]=TMath::Min(IndexRange[0],TruePad); // min pad
-       IndexRange[1]=TMath::Max(IndexRange[1],TruePad); // max pad
-       signal(TruePad,TrueTime)+=(PadSignal[i3]*ampl); // not converted to charge!!!
-       total(TruePad,TrueTime)+=(PadSignal[i3]*ampl); // not converted to charge!!!
-     } // end of pads loop
-   }  // end of time loop
+    if (n>0) for (Int_t i =0; i<n; i++){
+       Int_t *index = fTPCParam->GetResBin(i);        
+       Int_t pad=index[1]+centralPad;  //in digit coordinates central pad has coordinate 0
+       if ( ( pad<(fTPCParam->GetNPads(fCurrentIndex[1],fCurrentIndex[3]))) && (pad>0)) {
+        Int_t time=index[2];    
+        Float_t weight = fTPCParam->GetResWeight(i); //we normalise response to ADC channel
+        weight *= eltoadcfac;
+        
+        if (m1!=0) signal(pad,time)+=weight; 
+        total(pad,time)+=weight;
+        indexRange[0]=TMath::Min(indexRange[0],pad);
+        indexRange[1]=TMath::Max(indexRange[1],pad);
+        indexRange[2]=TMath::Min(indexRange[2],time);
+        indexRange[3]=TMath::Max(indexRange[3],time); 
+       }        
+    }
   } // end of loop over electrons
-
+  
   return label; // returns track label when finished
 }
 
 //_____________________________________________________________________________
-void AliTPC::GetList(Float_t label,Int_t np,TMatrix *m,Int_t *IndexRange,
+void AliTPC::GetList(Float_t label,Int_t np,TMatrix *m,Int_t *indexRange,
                      Float_t **pList)
 {
   //----------------------------------------------------------------------
@@ -1801,43 +1530,45 @@ void AliTPC::GetList(Float_t label,Int_t np,TMatrix *m,Int_t *IndexRange,
 
   // lop over nonzero digits
 
-  for(Int_t it=IndexRange[2];it<IndexRange[3]+1;it++){
-    for(Int_t ip=IndexRange[0];ip<IndexRange[1]+1;ip++){
+  for(Int_t it=indexRange[2];it<indexRange[3]+1;it++){
+    for(Int_t ip=indexRange[0];ip<indexRange[1]+1;ip++){
+
+
+        // accept only the contribution larger than 500 electrons (1/2 s_noise)
+
+        if(signal(ip,it)<0.5) continue; 
 
 
-        Int_t GlobalIndex = it*np+ip; // GlobalIndex starts from 0!
+        Int_t globalIndex = it*np+ip; // globalIndex starts from 0!
         
-        if(!pList[GlobalIndex]){
+        if(!pList[globalIndex]){
         
           // 
          // Create new list (6 elements - 3 signals and 3 labels),
-         // but only if the signal is > 0. 
          //
 
-          if(signal(ip,it)>0.){
-
-          pList[GlobalIndex] = new Float_t [6];
+          pList[globalIndex] = new Float_t [6];
 
          // set list to -1 
 
-          *pList[GlobalIndex] = -1.;
-          *(pList[GlobalIndex]+1) = -1.;
-          *(pList[GlobalIndex]+2) = -1.;
-          *(pList[GlobalIndex]+3) = -1.;
-          *(pList[GlobalIndex]+4) = -1.;
-          *(pList[GlobalIndex]+5) = -1.;
+          *pList[globalIndex] = -1.;
+          *(pList[globalIndex]+1) = -1.;
+          *(pList[globalIndex]+2) = -1.;
+          *(pList[globalIndex]+3) = -1.;
+          *(pList[globalIndex]+4) = -1.;
+          *(pList[globalIndex]+5) = -1.;
 
 
-          *pList[GlobalIndex] = label;
-          *(pList[GlobalIndex]+3) = signal(ip,it);}
+          *pList[globalIndex] = label;
+          *(pList[globalIndex]+3) = signal(ip,it);
         }
         else{
 
          // check the signal magnitude
 
-          Float_t highest = *(pList[GlobalIndex]+3);
-          Float_t middle = *(pList[GlobalIndex]+4);
-          Float_t lowest = *(pList[GlobalIndex]+5);
+          Float_t highest = *(pList[globalIndex]+3);
+          Float_t middle = *(pList[globalIndex]+4);
+          Float_t lowest = *(pList[globalIndex]+5);
 
          //
          //  compare the new signal with already existing list
@@ -1848,24 +1579,24 @@ void AliTPC::GetList(Float_t label,Int_t np,TMatrix *m,Int_t *IndexRange,
          //
 
           if (signal(ip,it)>highest){
-            *(pList[GlobalIndex]+5) = middle;
-            *(pList[GlobalIndex]+4) = highest;
-            *(pList[GlobalIndex]+3) = signal(ip,it);
+            *(pList[globalIndex]+5) = middle;
+            *(pList[globalIndex]+4) = highest;
+            *(pList[globalIndex]+3) = signal(ip,it);
 
-            *(pList[GlobalIndex]+2) = *(pList[GlobalIndex]+1);
-            *(pList[GlobalIndex]+1) = *pList[GlobalIndex];
-            *pList[GlobalIndex] = label;
+            *(pList[globalIndex]+2) = *(pList[globalIndex]+1);
+            *(pList[globalIndex]+1) = *pList[globalIndex];
+            *pList[globalIndex] = label;
          }
           else if (signal(ip,it)>middle){
-            *(pList[GlobalIndex]+5) = middle;
-            *(pList[GlobalIndex]+4) = signal(ip,it);
+            *(pList[globalIndex]+5) = middle;
+            *(pList[globalIndex]+4) = signal(ip,it);
 
-            *(pList[GlobalIndex]+2) = *(pList[GlobalIndex]+1);
-            *(pList[GlobalIndex]+1) = label;
+            *(pList[globalIndex]+2) = *(pList[globalIndex]+1);
+            *(pList[globalIndex]+1) = label;
          }
           else{
-            *(pList[GlobalIndex]+5) = signal(ip,it);
-            *(pList[GlobalIndex]+2) = label;
+            *(pList[globalIndex]+5) = signal(ip,it);
+            *(pList[globalIndex]+2) = label;
          }
         }
 
@@ -1874,7 +1605,6 @@ void AliTPC::GetList(Float_t label,Int_t np,TMatrix *m,Int_t *IndexRange,
 
 
 
-
 }//end of GetList
 //___________________________________________________________________
 void AliTPC::MakeSector(Int_t isec,Int_t nrows,TTree *TH,
@@ -1891,11 +1621,16 @@ void AliTPC::MakeSector(Int_t isec,Int_t nrows,TTree *TH,
   // Origin: Marek Kowalski  IFJ, Krakow, Marek.Kowalski@ifj.edu.pl
   //-----------------------------------------------------------------
 
-  AliTPCParam * fTPCParam = &(fDigParam->GetParam());
+  Float_t gasgain = fTPCParam->GetGasGain();
   Int_t i;
-  Float_t xyz[3]; 
+  Float_t xyz[4]; 
 
   AliTPChit *tpcHit; // pointer to a sigle TPC hit    
+  //MI change
+  TBranch * branch=0;
+  if (fHitType&2) branch = TH->GetBranch("TPC2");
+  else branch = TH->GetBranch("TPC");
+
  
   //----------------------------------------------
   // Create TObjArray-s, one for each row,
@@ -1903,11 +1638,15 @@ void AliTPC::MakeSector(Int_t isec,Int_t nrows,TTree *TH,
   // of electrons, one TVector per each track.
   //---------------------------------------------- 
     
+  Int_t *nofElectrons = new Int_t [nrows]; // electron counter for each row
+  TVector **tracks = new TVector* [nrows]; //pointers to the track vectors
   for(i=0; i<nrows; i++){
     row[i] = new TObjArray;
+    nofElectrons[i]=0;
+    tracks[i]=0;
   }
-  Int_t *n_of_electrons = new Int_t [nrows]; // electron counter for each row
-  TVector **tr = new TVector* [nrows]; //pointers to the track vectors
+
 
   //--------------------------------------------------------------------
   //  Loop over tracks, the "track" contains the full history
@@ -1917,102 +1656,129 @@ void AliTPC::MakeSector(Int_t isec,Int_t nrows,TTree *TH,
   previousTrack = -1; // nothing to store so far!
 
   for(Int_t track=0;track<ntracks;track++){
-
+    Bool_t isInSector=kTRUE;
     ResetHits();
 
-    TH->GetEvent(track); // get next track
-    Int_t nhits = fHits->GetEntriesFast(); // get number of hits for this track
+    if (fHitType&2) {
+      isInSector=kFALSE;
+      TBranch * br = TH->GetBranch("fTrackHitsInfo");
+      br->GetEvent(track);
+      AliObjectArray * ar = fTrackHits->fTrackHitsInfo;
+      for (UInt_t j=0;j<ar->GetSize();j++){
+       if (  ((AliTrackHitsInfo*)ar->At(j))->fVolumeID==isec) isInSector=kTRUE;
+      }
+    }
+    if (!isInSector) continue;
+    //MI change
+    branch->GetEntry(track); // get next track
+
+    //M.I. changes
 
-    if(nhits == 0) continue; // no hits in the TPC for this track
+    tpcHit = (AliTPChit*)FirstHit(-1);
 
     //--------------------------------------------------------------
     //  Loop over hits
     //--------------------------------------------------------------
 
-    for(Int_t hit=0;hit<nhits;hit++){
 
-      tpcHit = (AliTPChit*)fHits->UncheckedAt(hit); // get a pointer to a hit
+    while(tpcHit){
       
       Int_t sector=tpcHit->fSector; // sector number
-      if(sector != isec) continue; //terminate iteration
+      //      if(sector != isec) continue; 
+      if(sector != isec){
+       tpcHit = (AliTPChit*) NextHit();
+       continue; 
+      }
+
+       currentTrack = tpcHit->Track(); // track number
+
 
-       currentTrack = tpcHit->fTrack; // track number
         if(currentTrack != previousTrack){
                           
            // store already filled fTrack
               
           for(i=0;i<nrows;i++){
              if(previousTrack != -1){
-              if(n_of_electrons[i]>0){
-                TVector &v = *tr[i];
+              if(nofElectrons[i]>0){
+                TVector &v = *tracks[i];
                 v(0) = previousTrack;
-                 tr[i]->ResizeTo(3*n_of_electrons[i]+1); // shrink if necessary
-                row[i]->Add(tr[i]);                     
+                 tracks[i]->ResizeTo(4*nofElectrons[i]+1); // shrink if necessary
+                row[i]->Add(tracks[i]);                     
               }
                else{
-                 delete tr[i]; // delete empty TVector
-                 tr[i]=0;
+                 delete tracks[i]; // delete empty TVector
+                 tracks[i]=0;
               }
             }
 
-             n_of_electrons[i]=0;
-             tr[i] = new TVector(361); // TVectors for the next fTrack
+             nofElectrons[i]=0;
+             tracks[i] = new TVector(481); // TVectors for the next fTrack
 
           } // end of loop over rows
               
            previousTrack=currentTrack; // update track label 
        }
           
-       Int_t QI = (Int_t) (tpcHit->fQ); // energy loss (number of electrons)
+       Int_t qI = (Int_t) (tpcHit->fQ); // energy loss (number of electrons)
 
        //---------------------------------------------------
        //  Calculate the electron attachment probability
        //---------------------------------------------------
 
-        Float_t time = 1.e6*(z_end-TMath::Abs(tpcHit->fZ))/fTPCParam->GetDriftV(); 
+
+        Float_t time = 1.e6*(fTPCParam->GetZLength()-TMath::Abs(tpcHit->Z()))
+                                                        /fTPCParam->GetDriftV(); 
        // in microseconds!     
-       Float_t AttProb = fTPCParam->GetAttCoef()*
+       Float_t attProb = fTPCParam->GetAttCoef()*
          fTPCParam->GetOxyCont()*time; //  fraction! 
    
        //-----------------------------------------------
        //  Loop over electrons
        //-----------------------------------------------
-
-        for(Int_t nel=0;nel<QI;nel++){
+       Int_t index[3];
+       index[1]=isec;
+        for(Int_t nel=0;nel<qI;nel++){
           // skip if electron lost due to the attachment
-          if((gRandom->Rndm(0)) < AttProb) continue; // electron lost!
-         xyz[0]=tpcHit->fX;
-         xyz[1]=tpcHit->fY;
-         xyz[2]=tpcHit->fZ;
-         ElDiff(xyz); // Appply the diffusion
-         Int_t row_number;
-         fTPCParam->XYZtoCRXYZ(xyz,isec,row_number,3);
-
-         //transform position to local coordinates
-         //option 3 means that we calculate x position relative to 
-         //nearest pad row 
-
-         if ((row_number<0)||row_number>=fTPCParam->GetNRow(isec)) continue;
-         ExB(xyz); // ExB effect at the sense wires
-         n_of_electrons[row_number]++;   
+          if((gRandom->Rndm(0)) < attProb) continue; // electron lost!
+         xyz[0]=tpcHit->X();
+         xyz[1]=tpcHit->Y();
+         xyz[2]=tpcHit->Z();   
+         //
+         // protection for the nonphysical avalanche size (10**6 maximum)
+         //  
+          Double_t rn=TMath::Max(gRandom->Rndm(0),1.93e-22);
+         xyz[3]= (Float_t) (-gasgain*TMath::Log(rn)); 
+         index[0]=1;
+         
+         TransportElectron(xyz,index); //MI change -august       
+         Int_t rowNumber;
+         fTPCParam->GetPadRow(xyz,index); //MI change august
+         rowNumber = index[2];
+         //transform position to local digit coordinates
+         //relative to nearest pad row 
+         if ((rowNumber<0)||rowNumber>=fTPCParam->GetNRow(isec)) continue;       
+         nofElectrons[rowNumber]++;      
          //----------------------------------
          // Expand vector if necessary
          //----------------------------------
-         if(n_of_electrons[row_number]>120){
-           Int_t range = tr[row_number]->GetNrows();
-           if(n_of_electrons[row_number] > (range-1)/3){
-             tr[row_number]->ResizeTo(range+150); // Add 50 electrons
+         if(nofElectrons[rowNumber]>120){
+           Int_t range = tracks[rowNumber]->GetNrows();
+           if((nofElectrons[rowNumber])>(range-1)/4){
+        
+             tracks[rowNumber]->ResizeTo(range+400); // Add 100 electrons
            }
          }
          
-         TVector &v = *tr[row_number];
-         Int_t idx = 3*n_of_electrons[row_number]-2;
+         TVector &v = *tracks[rowNumber];
+         Int_t idx = 4*nofElectrons[rowNumber]-3;
 
-         v(idx)=  xyz[0];   // X
-         v(idx+1)=xyz[1];   // Y (along the pad-row)
-          v(idx+2)=xyz[2];   // Z
-           
+         v(idx)=  xyz[0];   // X - pad row coordinate
+         v(idx+1)=xyz[1];   // Y - pad coordinate (along the pad-row)
+          v(idx+2)=xyz[2];   // Z - time bin coordinate
+         v(idx+3)=xyz[3];   // avalanche size  
        } // end of loop over electrons
+
+        tpcHit = (AliTPChit*)NextHit();
         
       } // end of loop over hits
     } // end of loop over tracks
@@ -2022,171 +1788,23 @@ void AliTPC::MakeSector(Int_t isec,Int_t nrows,TTree *TH,
     //
 
      for(i=0;i<nrows;i++){
-       if(n_of_electrons[i]>0){
-          TVector &v = *tr[i];
+       if(nofElectrons[i]>0){
+          TVector &v = *tracks[i];
          v(0) = previousTrack;
-          tr[i]->ResizeTo(3*n_of_electrons[i]+1); // shrink if necessary
-         row[i]->Add(tr[i]);  
+          tracks[i]->ResizeTo(4*nofElectrons[i]+1); // shrink if necessary
+         row[i]->Add(tracks[i]);  
        }
        else{
-          delete tr[i];
-          tr[i]=0;
+          delete tracks[i];
+          tracks[i]=0;
        }  
       }  
 
-          delete [] tr;
-          delete [] n_of_electrons; 
-
-} // end of MakeSector
-//_____________________________________________________________________________
-void AliTPC::GetCrossTalk (Int_t iFlag,TObjArray *p,Int_t ntracks,Int_t *npads,
-                           TMatrix *m)
-{
-
-  //-------------------------------------------------------------
-  // Calculates the cross-talk from one row (inner or outer)
-  //-------------------------------------------------------------
-
-  //-----------------------------------------------------------------
-  // Origin: Marek Kowalski  IFJ, Krakow, Marek.Kowalski@ifj.edu.pl
-  //-----------------------------------------------------------------
-
-  //
-  // iFlag=2 & 3 --> cross-talk from the inner row
-  // iFlag=0 & 4 --> cross-talk from the outer row
-  //
-  AliTPCParam * fTPCParam = &(fDigParam->GetParam());
-  AliTPCPRF2D * fPRF2D = &(fDigParam->GetPRF2D());
-  AliTPCRF1D  * fRF    = &(fDigParam->GetRF()); 
+          delete [] tracks;
+          delete [] nofElectrons;
  
-  //to make code faster
-
-  Float_t zwidth  = fTPCParam->GetZWidth();
-  Float_t zwidthm1  =1/fTPCParam->GetZWidth();
-
- Int_t PadNumber;
- Float_t xwire;
-
- Int_t nPadsSignal; // for this pads the signal is calculated
- Float_t range;     // sense wire range
- Int_t nPadsDiff;
-
- Float_t IneffFactor=0.5; // gain inefficiency close to the edges
-
- if(iFlag == 0){   
-   // 1-->0
-   nPadsSignal = npads[1];
-   range = ((npads[1]-1)/2 + 0.5)*fTPCParam->GetPadPitchWidth();  
-   nPadsDiff = (npads[1]-npads[0])/2;
- }  
- else if (iFlag == 2){
-   // 1-->2
-   nPadsSignal = npads[2];
-   range = ((npads[1]-1)/2 + 0.5)*fTPCParam->GetPadPitchWidth();
-   nPadsDiff = 0;
- }
- else if (iFlag == 3){
-   // 0-->1
-   nPadsSignal = npads[1];
-   range = ((npads[0]-1)/2 + 0.5)*fTPCParam->GetPadPitchWidth();
-   nPadsDiff = 0;
- }
- else{
-   // 2-->1
-   nPadsSignal = npads[2];
-   range = ((npads[2]-1)/2 + 0.5)*fTPCParam->GetPadPitchWidth();
-   nPadsDiff = (npads[2]-npads[1])/2;
- }
-
- range-=0.5; // dead zone close to the edges
-
- TVector *tv; 
- TMatrix &signal = *m;
-
- Int_t CentralPad = (nPadsSignal-1)/2;
- Float_t PadSignal[7]; // signal from a single electron
- // Loop over tracks
- for(Int_t nt=0;nt<ntracks;nt++){
-   tv=(TVector*)p->At(nt); // pointer to a track
-   TVector &v = *tv;
-   Int_t nElectrons = (tv->GetNrows()-1)/4;
-   // Loop over electrons
-   for(Int_t nel=0; nel<nElectrons; nel++){
-     Int_t idx=nel*4;
-     xwire=v(idx+1);
-     if (iFlag==0) xwire+=fTPCParam->GetPadPitchLength();
-     if (iFlag==2)  xwire-=fTPCParam->GetPadPitchLength();
-     if (iFlag==3)  xwire-=fTPCParam->GetPadPitchLength();
-     if (iFlag==4)  xwire+=fTPCParam->GetPadPitchLength();  
-   
-     //  electron acceptance for the cross-talk (only the closest wire)  
-
-     Float_t dxMax = fTPCParam->GetPadPitchLength()*0.5+fTPCParam->GetWWPitch();
-     if(TMath::Abs(xwire)>dxMax) continue;
-
-     Float_t y = v(idx+2);
-     Float_t z = v(idx+3);
-     Float_t absy=TMath::Abs(y);
-
-     if(absy < 0.5*fTPCParam->GetPadPitchWidth()){
-       PadNumber=CentralPad;
-     }
-     else if (absy < range){
-       PadNumber=(Int_t) ((absy-0.5*fTPCParam->GetPadPitchWidth())/fTPCParam->GetPadPitchWidth() +1.);
-       PadNumber=(Int_t) (TMath::Sign((Float_t)PadNumber, y)+CentralPad);
-     }
-     else continue; // electron out of sense wire range, lost at the sector edge
-
-     Float_t aval = (absy<range-0.5) ? v(idx+4):v(idx+4)*IneffFactor;
-
-     Float_t dist = y - (Float_t)(PadNumber-CentralPad)*fTPCParam->GetPadPitchWidth();
-       
-     for (Int_t i=0;i<7;i++){
-       PadSignal[i]=fPRF2D->GetPRF(dist+(3-i)*fTPCParam->GetPadPitchWidth(),xwire)*aval;
-
-       PadSignal[i] *= fTPCParam->GetPadCoupling();
-     }
-     // real pad range
-
-     Int_t  LeftPad = TMath::Max(0,PadNumber-3);
-     Int_t  RightPad = TMath::Min(nPadsSignal-1,PadNumber+3);
-
-     Int_t pmin=LeftPad-PadNumber+3; // lower index of the pad_signal vector
-     Int_t pmax=RightPad-PadNumber+3; // upper index  
-
-
-     Float_t z_drift = z*zwidthm1;
-     Float_t z_offset = z_drift-(Int_t)z_drift;
-     //distance to the centre of nearest time bin (in time bin units)
-     Int_t FirstBucket = (Int_t)z_drift; 
-     // MI check it --time offset
-     for (Int_t i2=0;i2<4;i2++){     
-       Int_t TrueTime = FirstBucket+i2; // current time bucket
-       Float_t dz   = (Float_t(i2)+z_offset)*zwidth; 
-       Float_t ampl = fRF->GetRF(dz); 
-       if((TrueTime>MAXTPCTBK-1)) break; // beyond the time range
-
-
-       // loop over pads, from pmin to pmax
-
-       for(Int_t i3=pmin;i3<pmax+1;i3++){
-         Int_t TruePad = LeftPad+i3-pmin;
-
-         if(TruePad<nPadsDiff || TruePad > nPadsSignal-nPadsDiff-1) continue;
-
-         TruePad -= nPadsDiff;
-         signal(TruePad,TrueTime)+=(PadSignal[i3]*ampl); // not converted to charge!
-
-       } // end of loop over pads
-     } // end of loop over time bins
-
-   } // end of loop over electrons 
-
- } // end of loop over tracks
-
-} // end of GetCrossTalk
 
+} // end of MakeSector
 
 
 //_____________________________________________________________________________
@@ -2197,18 +1815,20 @@ void AliTPC::Init()
   //
   Int_t i;
   //
-  printf("\n");
-  for(i=0;i<35;i++) printf("*");
-  printf(" TPC_INIT ");
-  for(i=0;i<35;i++) printf("*");
-  printf("\n");
-  //
-  for(i=0;i<80;i++) printf("*");
-  printf("\n");
+  if(fDebug) {
+    printf("\n%s: ",ClassName());
+    for(i=0;i<35;i++) printf("*");
+    printf(" TPC_INIT ");
+    for(i=0;i<35;i++) printf("*");
+    printf("\n%s: ",ClassName());
+    //
+    for(i=0;i<80;i++) printf("*");
+    printf("\n");
+  }
 }
 
 //_____________________________________________________________________________
-void AliTPC::MakeBranch(Option_t* option)
+void AliTPC::MakeBranch(Option_t* option, const char *file)
 {
   //
   // Create Tree branches for the TPC.
@@ -2217,21 +1837,16 @@ void AliTPC::MakeBranch(Option_t* option)
   char branchname[10];
   sprintf(branchname,"%s",GetName());
 
-  AliDetector::MakeBranch(option);
+  AliDetector::MakeBranch(option,file);
 
-  char *D = strstr(option,"D");
+  const char *d = strstr(option,"D");
 
-  if (fDigits   && gAlice->TreeD() && D) {
-    gAlice->TreeD()->Branch(branchname,&fDigits, buffersize);
-    printf("Making Branch %s for digits\n",branchname);
+  if (fDigits   && gAlice->TreeD() && d) {
+      MakeBranchInTree(gAlice->TreeD(), 
+                       branchname, &fDigits, buffersize, file);
   }    
 
-  char *R = strstr(option,"R");
-
-  if (fClusters && gAlice->TreeR() && R) {
-    gAlice->TreeR()->Branch(branchname,&fClusters, buffersize);
-    printf("Making Branch %s for Clusters\n",branchname);
-  }    
+  if (fHitType&2) MakeBranch2(option,file); // MI change 14.09.2000
 }
  
 //_____________________________________________________________________________
@@ -2239,13 +1854,9 @@ void AliTPC::ResetDigits()
 {
   //
   // Reset number of digits and the digits array for this detector
-  // reset clusters
   //
   fNdigits   = 0;
-  //  if (fDigits)   fDigits->Clear();
-  if (fDigParam->GetArray()!=0)  fDigParam->GetArray()->Clear();
-  fNclusters = 0;
-  if (fClusters) fClusters->Clear();
+  if (fDigits)   fDigits->Clear();
 }
 
 //_____________________________________________________________________________
@@ -2337,9 +1948,12 @@ void AliTPC::SetSens(Int_t sens)
 
   fSens = sens;
 }
+
  
-void AliTPC::SetSide(Float_t side)
+void AliTPC::SetSide(Float_t side=0.)
 {
+  // choice of the TPC side
+
   fSide = side;
  
 }
@@ -2348,6 +1962,8 @@ void AliTPC::SetGasMixt(Int_t nc,Int_t c1,Int_t c2,Int_t c3,Float_t p1,
                            Float_t p2,Float_t p3)
 {
 
+  // gax mixture definition
+
  fNoComp = nc;
  
  fMixtComp[0]=c1;
@@ -2361,81 +1977,42 @@ void AliTPC::SetGasMixt(Int_t nc,Int_t c1,Int_t c2,Int_t c3,Float_t p1,
  
 }
 //_____________________________________________________________________________
-void AliTPC::Streamer(TBuffer &R__b)
-{
-  //
-  // Stream an object of class AliTPC.
-  //
-   if (R__b.IsReading()) {
-      Version_t R__v = R__b.ReadVersion(); if (R__v) { }
-      AliDetector::Streamer(R__b);
-      if (R__v < 2) return;
-      R__b >> fNsectors;
-      R__b >> fNclusters;
-      R__b >> fNtracks;
-      fClustersIndex = new Int_t[fNsectors+1];
-      fDigitsIndex   = new Int_t[fNsectors+1];
-   } else {
-      R__b.WriteVersion(AliTPC::IsA());
-      AliDetector::Streamer(R__b);
-      R__b << fNsectors;
-      R__b << fNclusters;
-      R__b << fNtracks;
-   }
-}
-  
-ClassImp(AliTPCcluster)
-//_____________________________________________________________________________
-AliTPCcluster::AliTPCcluster(Float_t *hits, Int_t *lab)
-{
-  //
-  // Creates a simulated cluster for the TPC
-  //
-  fTracks[0]  = lab[0];
-  fTracks[1]  = lab[1];
-  fTracks[2]  = lab[2];
-  fSector     = lab[3];
-  fPadRow     = lab[4];
-  fY          = hits[0];
-  fZ          = hits[1];
-  fQ          = hits[2];
-  fSigmaY2    = hits[3];
-  fSigmaZ2    = hits[4];
-}
-//_____________________________________________________________________________
-void AliTPCcluster::GetXYZ(Float_t *x, const AliTPCParam *par) const 
+
+void AliTPC::TransportElectron(Float_t *xyz, Int_t *index)
 {
   //
-  // Transformation from local to global coordinate system
+  // electron transport taking into account:
+  // 1. diffusion, 
+  // 2.ExB at the wires
+  // 3. nonisochronity
   //
-  x[0]=par->GetPadRowRadii(fSector,fPadRow-1);
-  x[1]=fY;
-  x[2]=fZ;
-  par->CRXYZtoXYZ(x,fSector,fPadRow-1,1);
-}
-//_____________________________________________________________________________
-Int_t AliTPCcluster::Compare(TObject * o)
-{
+  // xyz and index must be already transformed to system 1
   //
-  // compare two clusters according y coordinata
-  AliTPCcluster *cl= (AliTPCcluster *)o;
-  if (fY<cl->fY) return -1;
-  if (fY==cl->fY) return 0;
-  return 1;  
-}
 
-Bool_t AliTPCcluster::IsSortable() const
-{
-  //
-  //make AliTPCcluster sortabale
-  return kTRUE; 
+  fTPCParam->Transform1to2(xyz,index);
+  
+  //add diffusion
+  Float_t driftl=xyz[2];
+  if(driftl<0.01) driftl=0.01;
+  driftl=TMath::Sqrt(driftl);
+  Float_t sigT = driftl*(fTPCParam->GetDiffT());
+  Float_t sigL = driftl*(fTPCParam->GetDiffL());
+  xyz[0]=gRandom->Gaus(xyz[0],sigT);
+  xyz[1]=gRandom->Gaus(xyz[1],sigT);
+  xyz[2]=gRandom->Gaus(xyz[2],sigL);
+
+  // ExB
+  
+  if (fTPCParam->GetMWPCReadout()==kTRUE){
+    Float_t x1=xyz[0];
+    fTPCParam->Transform2to2NearestWire(xyz,index);
+    Float_t dx=xyz[0]-x1;
+    xyz[1]+=dx*(fTPCParam->GetOmegaTau());
+  }
+  //add nonisochronity (not implemented yet)
+  
 }
-
-
-
+  
 ClassImp(AliTPCdigit)
  
 //_____________________________________________________________________________
@@ -2470,389 +2047,457 @@ AliHit(shunt,track)
   fQ          = hits[3];
 }
  
-ClassImp(AliTPCtrack)
-//_____________________________________________________________________________
-AliTPCtrack::AliTPCtrack(Float_t *hits)
+
+//________________________________________________________________________
+// Additional code because of the AliTPCTrackHits
+
+void AliTPC::MakeBranch2(Option_t *option,const char *file)
 {
   //
-  // Default creator for a TPC reconstructed track object
-  //
-  ref=hits[0]; // This is dummy code !
+  // Create a new branch in the current Root Tree
+  // The branch of fHits is automatically split
+  // MI change 14.09.2000
+  if (fHitType&2==0) return;
+  char branchname[10];
+  sprintf(branchname,"%s2",GetName());  
+  //
+  // Get the pointer to the header
+  const char *cH = strstr(option,"H");
+  //
+  if (fTrackHits   && gAlice->TreeH() && cH) {    
+    AliObjectBranch * branch = new AliObjectBranch(branchname,"AliTPCTrackHits",&fTrackHits, 
+                                                  gAlice->TreeH(),fBufferSize,1);
+    gAlice->TreeH()->GetListOfBranches()->Add(branch);
+    if (GetDebug()>1) 
+      printf("* AliDetector::MakeBranch * Making Branch %s for trackhits\n",branchname);
+    const char folder [] = "RunMC/Event/Data";
+    if (GetDebug())
+      printf("%15s: Publishing %s to %s\n",ClassName(),branchname,folder);
+    Publish(folder,&fTrackHits,branchname);
+    if (file) {
+        TBranch *b = gAlice->TreeH()->GetBranch(branchname);
+        TDirectory *wd = gDirectory;
+        b->SetFile(file);
+        TIter next( b->GetListOfBranches());
+        while ((b=(TBranch*)next())) {
+         b->SetFile(file);
+        }
+        wd->cd(); 
+        if (GetDebug()>1) 
+             cout << "Diverting branch " << branchname << " to file " << file << endl;  
+    }
+  }    
 }
 
-AliTPCtrack::AliTPCtrack(const AliTPCcluster& c,const TVector& xx,
-                        const TMatrix& CC, const AliTPCParam *p):
-  x(xx),C(CC),clusters(MAX_CLUSTER)
+void AliTPC::SetTreeAddress()
 {
-  //
-  // Standard creator for a TPC reconstructed track object
-  //
-  chi2=0.;
-  int sec=c.fSector-1, row=c.fPadRow-1;
-  ref=p->GetPadRowRadii(sec+1,row);
+  if (fHitType&1) AliDetector::SetTreeAddress();
+  if (fHitType&2) SetTreeAddress2();
+}
 
-  if (sec<24) { 
-    fAlpha=(sec%12)*alpha_low;
-  } else { 
-    fAlpha=(sec%24)*alpha_up;
+void AliTPC::SetTreeAddress2()
+{
+  //
+  // Set branch address for the TrackHits Tree
+  // 
+  TBranch *branch;
+  char branchname[20];
+  sprintf(branchname,"%s2",GetName());
+  //
+  // Branch address for hit tree
+  TTree *treeH = gAlice->TreeH();
+  if (treeH) {
+    branch = treeH->GetBranch(branchname);
+    if (branch) branch->SetAddress(&fTrackHits);
   }
-  clusters.AddLast((AliTPCcluster*)(&c));
 }
 
-//_____________________________________________________________________________
-AliTPCtrack::AliTPCtrack(const AliTPCtrack& t) : x(t.x), C(t.C),
-  clusters(t.clusters.GetEntriesFast()) 
+void AliTPC::FinishPrimary()
 {
+  if (fTrackHits) fTrackHits->FlushHitStack();  
+}
+
+
+void AliTPC::AddHit2(Int_t track, Int_t *vol, Float_t *hits)
+{ 
   //
-  // Copy creator for a TPC reconstructed track
-  //
-  ref=t.ref;
-  chi2=t.chi2;
-  fAlpha=t.fAlpha;
-  int n=t.clusters.GetEntriesFast();
-  for (int i=0; i<n; i++) clusters.AddLast(t.clusters.UncheckedAt(i));
+  // add hit to the list  
+  Int_t rtrack;
+  if (fIshunt) {
+    int primary = gAlice->GetPrimary(track);
+    gAlice->Particle(primary)->SetBit(kKeepBit);
+    rtrack=primary;
+  } else {
+    rtrack=track;
+    gAlice->FlagTrack(track);
+  }  
+  //AliTPChit *hit = (AliTPChit*)fHits->UncheckedAt(fNhits-1);
+  //if (hit->fTrack!=rtrack)
+  //  cout<<"bad track number\n";
+  if (fTrackHits) 
+    fTrackHits->AddHitKartez(vol[0],rtrack, hits[0],
+                            hits[1],hits[2],(Int_t)hits[3]);
 }
 
-//_____________________________________________________________________________
-Double_t AliTPCtrack::GetY(Double_t xk) const 
+void AliTPC::ResetHits()
 {
-  //
-  //
-  //
-  Double_t c2=x(2)*xk - x(3);
-  if (TMath::Abs(c2) >= 0.999) {
-    if (*this>10) cerr<<*this<<" AliTPCtrack warning: No y for this x !\n";
-    return 0.;
-  }
-  Double_t c1=x(2)*ref - x(3);
-  Double_t r1=sqrt(1.-c1*c1), r2=sqrt(1.-c2*c2);
-  Double_t dx=xk-ref;
-  return x(0) + dx*(c1+c2)/(r1+r2);
+  if (fHitType&1) AliDetector::ResetHits();
+  if (fHitType&2) ResetHits2();
 }
 
-//_____________________________________________________________________________
-int AliTPCtrack::PropagateTo(Double_t xk,Double_t x0,Double_t rho,Double_t pm)
+void AliTPC::ResetHits2()
 {
   //
-  // Propagate a TPC reconstructed track
-  //
-  if (TMath::Abs(x(2)*xk - x(3)) >= 0.999) {
-    if (*this>3) cerr<<*this<<" AliTPCtrack warning: Propagation failed !\n";
-    return 0;
-  }
+  //reset hits
+  if (fTrackHits) fTrackHits->Clear();
+}   
 
-  Double_t x1=ref, x2=x1+0.5*(xk-x1), dx=x2-x1, y1=x(0), z1=x(1);
-  Double_t c1=x(2)*x1 - x(3), r1=sqrt(1.- c1*c1);
-  Double_t c2=x(2)*x2 - x(3), r2=sqrt(1.- c2*c2);
-  
-  x(0) += dx*(c1+c2)/(r1+r2);
-  x(1) += dx*(c1+c2)/(c1*r2 + c2*r1)*x(4);
-
-  TMatrix F(5,5); F.UnitMatrix();
-  Double_t rr=r1+r2, cc=c1+c2, xx=x1+x2;
-  F(0,2)= dx*(rr*xx + cc*(c1*x1/r1+c2*x2/r2))/(rr*rr);
-  F(0,3)=-dx*(2*rr + cc*(c1/r1 + c2/r2))/(rr*rr);
-  Double_t cr=c1*r2+c2*r1;
-  F(1,2)= dx*x(4)*(cr*xx-cc*(r1*x2-c2*c1*x1/r1+r2*x1-c1*c2*x2/r2))/(cr*cr);
-  F(1,3)=-dx*x(4)*(2*cr + cc*(c2*c1/r1-r1 + c1*c2/r2-r2))/(cr*cr);
-  F(1,4)= dx*cc/cr; 
-  TMatrix tmp(F,TMatrix::kMult,C);
-  C.Mult(tmp,TMatrix(TMatrix::kTransposed,F));
-  
-  ref=x2;
-  
-  //Multiple scattering******************
-  Double_t ey=x(2)*ref - x(3);
-  Double_t ex=sqrt(1-ey*ey);
-  Double_t ez=x(4);
-  TMatrix Q(5,5); Q=0.;
-  Q(2,2)=ez*ez+ey*ey;   Q(2,3)=-ex*ey;       Q(2,4)=-ex*ez;
-  Q(3,2)=Q(2,3);        Q(3,3)= ez*ez+ex*ex; Q(3,4)=-ey*ez;
-  Q(4,2)=Q(2,4);        Q(4,3)= Q(3,4);      Q(4,4)=1.;
-  
-  F=0;
-  F(2,2)=-x(2)*ex;          F(2,3)=-x(2)*ey;
-  F(3,2)=-ex*(x(2)*ref-ey); F(3,3)=-(1.+ x(2)*ref*ey - ey*ey);
-  F(4,2)=-ez*ex;            F(4,3)=-ez*ey;           F(4,4)=1.;
-  
-  tmp.Mult(F,Q);
-  Q.Mult(tmp,TMatrix(TMatrix::kTransposed,F));
-  
-  Double_t p2=GetPt()*GetPt()*(1.+x(4)*x(4));
-  Double_t beta2=p2/(p2 + pm*pm);
-  Double_t d=sqrt((x1-ref)*(x1-ref)+(y1-x(0))*(y1-x(0))+(z1-x(1))*(z1-x(1)));
-  d*=2.;
-  Double_t theta2=14.1*14.1/(beta2*p2*1e6)*d/x0*rho;
-  Q*=theta2;
-  C+=Q;
-  
-  //Energy losses************************
-  Double_t dE=0.153e-3/beta2*(log(5940*beta2/(1-beta2)) - beta2)*d*rho;
-  if (x1 < x2) dE=-dE;
-  x(2)*=(1.- sqrt(p2+pm*pm)/p2*dE);
-  //x(3)*=(1.- sqrt(p2+pm*pm)/p2*dE);
-  
-  x1=ref; x2=xk; y1=x(0); z1=x(1);
-  c1=x(2)*x1 - x(3); r1=sqrt(1.- c1*c1);
-  c2=x(2)*x2 - x(3); r2=sqrt(1.- c2*c2);
-  
-  x(0) += dx*(c1+c2)/(r1+r2);
-  x(1) += dx*(c1+c2)/(c1*r2 + c2*r1)*x(4);
-  
-  F.UnitMatrix();
-  rr=r1+r2; cc=c1+c2; xx=x1+x2;
-  F(0,2)= dx*(rr*xx + cc*(c1*x1/r1+c2*x2/r2))/(rr*rr);
-  F(0,3)=-dx*(2*rr + cc*(c1/r1 + c2/r2))/(rr*rr);
-  cr=c1*r2+c2*r1;
-  F(1,2)= dx*x(4)*(cr*xx-cc*(r1*x2-c2*c1*x1/r1+r2*x1-c1*c2*x2/r2))/(cr*cr);
-  F(1,3)=-dx*x(4)*(2*cr + cc*(c2*c1/r1-r1 + c1*c2/r2-r2))/(cr*cr);
-  F(1,4)= dx*cc/cr; 
-  tmp.Mult(F,C);
-  C.Mult(tmp,TMatrix(TMatrix::kTransposed,F));
-  
-  ref=x2;
-  
-  return 1;
+AliHit* AliTPC::FirstHit(Int_t track)
+{
+  if (fHitType&2) return FirstHit2(track);
+  return AliDetector::FirstHit(track);
 }
-
-//_____________________________________________________________________________
-void AliTPCtrack::PropagateToVertex(Double_t x0,Double_t rho,Double_t pm) 
+AliHit* AliTPC::NextHit()
 {
-  //
-  // Propagate a reconstructed track from the vertex
-  //
-  Double_t c=x(2)*ref - x(3);
-  Double_t tgf=-x(3)/(x(2)*x(0) + sqrt(1-c*c));
-  Double_t snf=tgf/sqrt(1.+ tgf*tgf);
-  Double_t xv=(x(3)+snf)/x(2);
-  PropagateTo(xv,x0,rho,pm);
+  if (fHitType&2) return NextHit2();
+  return AliDetector::NextHit();
 }
 
-//_____________________________________________________________________________
-void AliTPCtrack::Update(const AliTPCcluster *c, Double_t chisq)
+AliHit* AliTPC::FirstHit2(Int_t track)
 {
   //
-  // Update statistics for a reconstructed TPC track
+  // Initialise the hit iterator
+  // Return the address of the first hit for track
+  // If track>=0 the track is read from disk
+  // while if track<0 the first hit of the current
+  // track is returned
+  // 
+  if(track>=0) {
+    gAlice->ResetHits();
+    gAlice->TreeH()->GetEvent(track);
+  }
   //
-  TMatrix H(2,5); H.UnitMatrix();
-  TMatrix Ht(TMatrix::kTransposed,H);
-  TVector m(2);   m(0)=c->fY; m(1)=c->fZ; 
-  TMatrix V(2,2); V(0,0)=c->fSigmaY2; V(0,1)=0.; V(1,0)=0.; V(1,1)=c->fSigmaZ2;
-
-  TMatrix tmp(H,TMatrix::kMult,C);
-  TMatrix R(tmp,TMatrix::kMult,Ht); R+=V;
-  
-  Double_t det=(Double_t)R(0,0)*R(1,1) - (Double_t)R(0,1)*R(1,0);
-  R(0,1)=R(0,0); R(0,0)=R(1,1); R(1,1)=R(0,1); 
-  R(1,0)*=-1; R(0,1)=R(1,0);
-  R*=1./det;
-  
-  //R.Invert();
-  
-  TMatrix K(C,TMatrix::kMult,Ht); K*=R;
-  
-  TVector savex=x;
-  x*=H; x-=m; x*=-1; x*=K; x+=savex;
-  if (TMath::Abs(x(2)*ref-x(3)) >= 0.999) {
-    if (*this>3) cerr<<*this<<" AliTPCtrack warning: Filtering failed !\n";
-    x=savex;
-    return;
+  if (fTrackHits) {
+    fTrackHits->First();
+    return fTrackHits->GetHit();
   }
-  
-  TMatrix saveC=C;
-  C.Mult(K,tmp); C-=saveC; C*=-1;
-  
-  clusters.AddLast((AliTPCcluster*)c);
-  chi2 += chisq;
+  else return 0;
 }
 
-//_____________________________________________________________________________
-int AliTPCtrack::Rotate(Double_t alpha)
+AliHit* AliTPC::NextHit2()
 {
   //
-  // Rotate a reconstructed TPC track
-  //
-  fAlpha += alpha;
-  
-  Double_t x1=ref, y1=x(0);
-  Double_t ca=cos(alpha), sa=sin(alpha);
-  Double_t r1=x(2)*ref - x(3);
-  
-  ref = x1*ca + y1*sa;
-  x(0)=-x1*sa + y1*ca;
-  x(3)=x(3)*ca + (x(2)*y1 + sqrt(1.- r1*r1))*sa;
-  
-  Double_t r2=x(2)*ref - x(3);
-  if (TMath::Abs(r2) >= 0.999) {
-    if (*this>3) cerr<<*this<<" AliTPCtrack warning: Rotation failed !\n";
-    return 0;
+  //Return the next hit for the current track
+
+  if (fTrackHits) {
+    fTrackHits->Next();
+    return fTrackHits->GetHit();
   }
-  
-  Double_t y0=x(0) + sqrt(1.- r2*r2)/x(2);
-  if ((x(0)-y0)*x(2) >= 0.) {
-    if (*this>3) cerr<<*this<<" AliTPCtrack warning: Rotation failed !!!\n";
+  else 
     return 0;
-  }
-  
-  TMatrix F(5,5); F.UnitMatrix();
-  F(0,0)=ca;
-  F(3,0)=x(2)*sa; 
-  F(3,2)=(y1 - r1*x1/sqrt(1.- r1*r1))*sa; 
-  F(3,3)= ca + sa*r1/sqrt(1.- r1*r1);
-  TMatrix tmp(F,TMatrix::kMult,C); 
-  // Double_t dy2=C(0,0);
-  C.Mult(tmp,TMatrix(TMatrix::kTransposed,F));
-  // C(0,0)+=dy2*sa*sa*r1*r1/(1.- r1*r1);
-  // C(1,1)+=dy2*sa*sa*x(4)*x(4)/(1.- r1*r1);
-  
-  return 1;
 }
 
-//_____________________________________________________________________________
-void AliTPCtrack::UseClusters() const 
+void AliTPC::LoadPoints(Int_t)
 {
   //
-  //
-  //
-  int num_of_clusters=clusters.GetEntriesFast();
-  for (int i=0; i<num_of_clusters; i++) {
-    //if (i<=14) continue;
-    AliTPCcluster *c=(AliTPCcluster*)clusters.UncheckedAt(i);
-    c->Use();   
-  }
+  Int_t a = 0;
+  /*  if(fHitType==1) return AliDetector::LoadPoints(a);
+  LoadPoints2(a);
+  */
+  if(fHitType==1) AliDetector::LoadPoints(a);
+  else LoadPoints2(a);
+   
+  // LoadPoints3(a);
+
 }
 
-//_____________________________________________________________________________
-Double_t AliTPCtrack::GetPredictedChi2(const AliTPCcluster *c) const 
+
+void AliTPC::RemapTrackHitIDs(Int_t *map)
 {
-  //
-  // Calculate chi2 for a reconstructed TPC track
-  //
-  TMatrix H(2,5); H.UnitMatrix();
-  TVector m(2);   m(0)=c->fY; m(1)=c->fZ; 
-  TMatrix V(2,2); V(0,0)=c->fSigmaY2; V(0,1)=0.; V(1,0)=0.; V(1,1)=c->fSigmaZ2;
-  TVector res=x;  res*=H; res-=m; //res*=-1; 
-  TMatrix tmp(H,TMatrix::kMult,C);
-  TMatrix R(tmp,TMatrix::kMult,TMatrix(TMatrix::kTransposed,H)); R+=V;
-  
-  Double_t det=(Double_t)R(0,0)*R(1,1) - (Double_t)R(0,1)*R(1,0);
-  if (TMath::Abs(det) < 1.e-10) {
-    if (*this>3) cerr<<*this<<" AliTPCtrack warning: Singular matrix !\n";
-    return 1e10;
+  if (!fTrackHits) return;
+  AliObjectArray * arr = fTrackHits->fTrackHitsInfo;
+  for (UInt_t i=0;i<arr->GetSize();i++){
+    AliTrackHitsInfo * info = (AliTrackHitsInfo *)(arr->At(i));
+    info->fTrackID = map[info->fTrackID];
   }
-  R(0,1)=R(0,0); R(0,0)=R(1,1); R(1,1)=R(0,1); 
-  R(1,0)*=-1; R(0,1)=R(1,0);
-  R*=1./det;
   
-  //R.Invert();
-  
-  TVector r=res;
-  res*=R;
-  return r*res;
 }
 
+
 //_____________________________________________________________________________
-int AliTPCtrack::GetLab() const 
+void AliTPC::LoadPoints2(Int_t)
 {
   //
+  // Store x, y, z of all hits in memory
   //
+  if (fTrackHits == 0) return;
   //
-  int lab=123456789;
-  struct {
-    int lab;
-    int max;
-  } s[MAX_CLUSTER]={{0,0}};
-  
-  int i;
-  int num_of_clusters=clusters.GetEntriesFast();
-  for (i=0; i<num_of_clusters; i++) {
-    AliTPCcluster *c=(AliTPCcluster*)clusters.UncheckedAt(i);
-    lab=TMath::Abs(c->fTracks[0]);
-    int j;
-    for (j=0; j<MAX_CLUSTER; j++)
-      if (s[j].lab==lab || s[j].max==0) break;
-    s[j].lab=lab;
-    s[j].max++;
-  }
-  
-  int max=0;
-  for (i=0; i<num_of_clusters; i++) 
-    if (s[i].max>max) {max=s[i].max; lab=s[i].lab;}
-
-  for (i=0; i<num_of_clusters; i++) {
-    AliTPCcluster *c=(AliTPCcluster*)clusters.UncheckedAt(i);
-    if (TMath::Abs(c->fTracks[1]) == lab ||
-        TMath::Abs(c->fTracks[2]) == lab ) max++;
+  Int_t nhits = fTrackHits->GetEntriesFast();
+  if (nhits == 0) return;
+  Int_t tracks = gAlice->GetNtrack();
+  if (fPoints == 0) fPoints = new TObjArray(tracks);
+  AliHit *ahit;
+  //
+  Int_t *ntrk=new Int_t[tracks];
+  Int_t *limi=new Int_t[tracks];
+  Float_t **coor=new Float_t*[tracks];
+  for(Int_t i=0;i<tracks;i++) {
+    ntrk[i]=0;
+    coor[i]=0;
+    limi[i]=0;
   }
-  
-  if (1.-float(max)/num_of_clusters > 0.10) return -lab;
-  
-  if (num_of_clusters < 6) return lab;
-  
-  max=0;
-  for (i=1; i<=6; i++) {
-    AliTPCcluster *c=(AliTPCcluster*)clusters.UncheckedAt(num_of_clusters-i);
-    if (lab == TMath::Abs(c->fTracks[0]) ||
-        lab == TMath::Abs(c->fTracks[1]) ||
-        lab == TMath::Abs(c->fTracks[2])) max++;
+  //
+  AliPoints *points = 0;
+  Float_t *fp=0;
+  Int_t trk;
+  Int_t chunk=nhits/4+1;
+  //
+  // Loop over all the hits and store their position
+  //
+  ahit = FirstHit2(-1);
+  //for (Int_t hit=0;hit<nhits;hit++) {
+  while (ahit){
+    //    ahit = (AliHit*)fHits->UncheckedAt(hit);
+    trk=ahit->GetTrack();
+    if(ntrk[trk]==limi[trk]) {
+      //
+      // Initialise a new track
+      fp=new Float_t[3*(limi[trk]+chunk)];
+      if(coor[trk]) {
+       memcpy(fp,coor[trk],sizeof(Float_t)*3*limi[trk]);
+       delete [] coor[trk];
+      }
+      limi[trk]+=chunk;
+      coor[trk] = fp;
+    } else {
+      fp = coor[trk];
+    }
+    fp[3*ntrk[trk]  ] = ahit->X();
+    fp[3*ntrk[trk]+1] = ahit->Y();
+    fp[3*ntrk[trk]+2] = ahit->Z();
+    ntrk[trk]++;
+    ahit = NextHit2();
   }
-  if (max<3) return -lab;
-  
-  return lab;
-}
-
-//_____________________________________________________________________________
-void AliTPCtrack::GetPxPyPz(Double_t& px, Double_t& py, Double_t& pz) const 
-{
   //
-  // Get reconstructed TPC track momentum
-  //
-  Double_t pt=0.3*FIELD/TMath::Abs(x(2))/100; // GeV/c
-  Double_t r=x(2)*ref-x(3);
-  Double_t y0=x(0) + sqrt(1.- r*r)/x(2);
-  px=-pt*(x(0)-y0)*x(2);    //cos(phi);
-  py=-pt*(x(3)-ref*x(2));   //sin(phi);
-  pz=pt*x(4);
-  Double_t tmp=px*TMath::Cos(fAlpha) - py*TMath::Sin(fAlpha);
-  py=px*TMath::Sin(fAlpha) + py*TMath::Cos(fAlpha);
-  px=tmp;  
+  for(trk=0; trk<tracks; ++trk) {
+    if(ntrk[trk]) {
+      points = new AliPoints();
+      points->SetMarkerColor(GetMarkerColor());
+      points->SetMarkerSize(GetMarkerSize());
+      points->SetDetector(this);
+      points->SetParticle(trk);
+      points->SetPolyMarker(ntrk[trk],coor[trk],GetMarkerStyle());
+      fPoints->AddAt(points,trk);
+      delete [] coor[trk];
+      coor[trk]=0;
+    }
+  }
+  delete [] coor;
+  delete [] ntrk;
+  delete [] limi;
 }
 
-//_____________________________________________________________________________
-//
-//     Classes for internal tracking use
-//
 
 //_____________________________________________________________________________
-void AliTPCRow::InsertCluster(const AliTPCcluster* c) 
+void AliTPC::LoadPoints3(Int_t)
 {
   //
-  // Insert a cluster in the list
+  // Store x, y, z of all hits in memory
+  // - only intersection point with pad row
+  if (fTrackHits == 0) return;
+  //
+  Int_t nhits = fTrackHits->GetEntriesFast();
+  if (nhits == 0) return;
+  Int_t tracks = gAlice->GetNtrack();
+  if (fPoints == 0) fPoints = new TObjArray(2*tracks);
+  fPoints->Expand(2*tracks);
+  AliHit *ahit;
+  //
+  Int_t *ntrk=new Int_t[tracks];
+  Int_t *limi=new Int_t[tracks];
+  Float_t **coor=new Float_t*[tracks];
+  for(Int_t i=0;i<tracks;i++) {
+    ntrk[i]=0;
+    coor[i]=0;
+    limi[i]=0;
+  }
+  //
+  AliPoints *points = 0;
+  Float_t *fp=0;
+  Int_t trk;
+  Int_t chunk=nhits/4+1;
+  //
+  // Loop over all the hits and store their position
+  //
+  ahit = FirstHit2(-1);
+  //for (Int_t hit=0;hit<nhits;hit++) {
+
+  Int_t lastrow = -1;
+  while (ahit){
+    //    ahit = (AliHit*)fHits->UncheckedAt(hit);
+    trk=ahit->GetTrack(); 
+    Float_t  x[3]={ahit->X(),ahit->Y(),ahit->Z()};
+    Int_t    index[3]={1,((AliTPChit*)ahit)->fSector,0};
+    Int_t    currentrow = fTPCParam->GetPadRow(x,index) ;
+    if (currentrow!=lastrow){
+      lastrow = currentrow;
+      //later calculate intersection point           
+      if(ntrk[trk]==limi[trk]) {
+       //
+       // Initialise a new track
+       fp=new Float_t[3*(limi[trk]+chunk)];
+       if(coor[trk]) {
+         memcpy(fp,coor[trk],sizeof(Float_t)*3*limi[trk]);
+         delete [] coor[trk];
+       }
+       limi[trk]+=chunk;
+       coor[trk] = fp;
+      } else {
+       fp = coor[trk];
+      }
+      fp[3*ntrk[trk]  ] = ahit->X();
+      fp[3*ntrk[trk]+1] = ahit->Y();
+      fp[3*ntrk[trk]+2] = ahit->Z();
+      ntrk[trk]++;
+    }
+    ahit = NextHit2();
+  }
+  
   //
-  if (num_of_clusters==MAX_CLUSTER_PER_ROW) {
-    cerr<<"AliTPCRow::InsertCluster(): Too many clusters !\n"; return;
+  for(trk=0; trk<tracks; ++trk) {
+    if(ntrk[trk]) {
+      points = new AliPoints();
+      points->SetMarkerColor(GetMarkerColor()+1);
+      points->SetMarkerStyle(5);
+      points->SetMarkerSize(0.2);
+      points->SetDetector(this);
+      points->SetParticle(trk);
+      //      points->SetPolyMarker(ntrk[trk],coor[trk],GetMarkerStyle()20);
+      points->SetPolyMarker(ntrk[trk],coor[trk],30);
+      fPoints->AddAt(points,tracks+trk);
+      delete [] coor[trk];
+      coor[trk]=0;
+    }
   }
-  if (num_of_clusters==0) {clusters[num_of_clusters++]=c; return;}
-  int i=Find(c->fY);
-  memmove(clusters+i+1 ,clusters+i,(num_of_clusters-i)*sizeof(AliTPCcluster*));
-  clusters[i]=c; num_of_clusters++;
+  delete [] coor;
+  delete [] ntrk;
+  delete [] limi;
 }
 
-//_____________________________________________________________________________
-int AliTPCRow::Find(Double_t y) const 
+
+
+void AliTPC::FindTrackHitsIntersection(TClonesArray * arr)
 {
+
   //
+  //fill clones array with intersection of current point with the
+  //middle of the row
+  Int_t sector;
+  Int_t ipart;
+  
+  const Int_t kcmaxhits=30000;
+  TVector * xxxx = new TVector(kcmaxhits*4);
+  TVector & xxx = *xxxx;
+  Int_t maxhits = kcmaxhits;
+      
   //
-  //
-  if (y <= clusters[0]->fY) return 0;
-  if (y > clusters[num_of_clusters-1]->fY) return num_of_clusters;
-  int b=0, e=num_of_clusters-1, m=(b+e)/2;
-  for (; b<e; m=(b+e)/2) {
-    if (y > clusters[m]->fY) b=m+1;
-    else e=m; 
-  }
-  return m;
-}
+  AliTPChit * tpcHit=0;
+  tpcHit = (AliTPChit*)FirstHit2(-1);
+  Int_t currentIndex=0;
+  Int_t lastrow=-1;  //last writen row
+
+  while (tpcHit){
+    if (tpcHit==0) continue;
+    sector=tpcHit->fSector; // sector number
+    ipart=tpcHit->Track();
+    
+    //find row number
+    
+    Float_t  x[3]={tpcHit->X(),tpcHit->Y(),tpcHit->Z()};
+    Int_t    index[3]={1,sector,0};
+    Int_t    currentrow = fTPCParam->GetPadRow(x,index) ;      
+    if (currentrow<0) continue;
+    if (lastrow<0) lastrow=currentrow;
+    if (currentrow==lastrow){
+      if ( currentIndex>=maxhits){
+       maxhits+=kcmaxhits;
+       xxx.ResizeTo(4*maxhits);
+      }     
+      xxx(currentIndex*4)=x[0];
+      xxx(currentIndex*4+1)=x[1];
+      xxx(currentIndex*4+2)=x[2];      
+      xxx(currentIndex*4+3)=tpcHit->fQ;
+      currentIndex++;  
+    }
+    else 
+      if (currentIndex>2){
+       Float_t sumx=0;
+       Float_t sumx2=0;
+       Float_t sumx3=0;
+       Float_t sumx4=0;
+       Float_t sumy=0;
+       Float_t sumxy=0;
+       Float_t sumx2y=0;
+       Float_t sumz=0;
+       Float_t sumxz=0;
+       Float_t sumx2z=0;
+       Float_t sumq=0;
+       for (Int_t index=0;index<currentIndex;index++){
+         Float_t x,x2,x3,x4;
+         x=x2=x3=x4=xxx(index*4);
+         x2*=x;
+         x3*=x2;
+         x4*=x3;
+         sumx+=x;
+         sumx2+=x2;
+         sumx3+=x3;
+         sumx4+=x4;
+         sumy+=xxx(index*4+1);
+         sumxy+=xxx(index*4+1)*x;
+         sumx2y+=xxx(index*4+1)*x2;
+         sumz+=xxx(index*4+2);
+         sumxz+=xxx(index*4+2)*x;
+         sumx2z+=xxx(index*4+2)*x2;     
+         sumq+=xxx(index*4+3);
+       }
+       Float_t centralPad = (fTPCParam->GetNPads(sector,lastrow)-1)/2;
+       Float_t det=currentIndex*(sumx2*sumx4-sumx3*sumx3)-sumx*(sumx*sumx4-sumx2*sumx3)+
+         sumx2*(sumx*sumx3-sumx2*sumx2);
+       
+       Float_t detay=sumy*(sumx2*sumx4-sumx3*sumx3)-sumx*(sumxy*sumx4-sumx2y*sumx3)+
+         sumx2*(sumxy*sumx3-sumx2y*sumx2);
+       Float_t detaz=sumz*(sumx2*sumx4-sumx3*sumx3)-sumx*(sumxz*sumx4-sumx2z*sumx3)+
+         sumx2*(sumxz*sumx3-sumx2z*sumx2);
+       
+       Float_t detby=currentIndex*(sumxy*sumx4-sumx2y*sumx3)-sumy*(sumx*sumx4-sumx2*sumx3)+
+         sumx2*(sumx*sumx2y-sumx2*sumxy);
+       Float_t detbz=currentIndex*(sumxz*sumx4-sumx2z*sumx3)-sumz*(sumx*sumx4-sumx2*sumx3)+
+         sumx2*(sumx*sumx2z-sumx2*sumxz);
+       
+       Float_t y=detay/det+centralPad;
+       Float_t z=detaz/det;    
+       Float_t by=detby/det; //y angle
+       Float_t bz=detbz/det; //z angle
+       sumy/=Float_t(currentIndex);
+       sumz/=Float_t(currentIndex);
+       
+       AliComplexCluster cl;
+       cl.fX=z;
+       cl.fY=y;
+       cl.fQ=sumq;
+       cl.fSigmaX2=bz;
+       cl.fSigmaY2=by;
+       cl.fTracks[0]=ipart;
+       
+       AliTPCClustersRow * row = (fClustersArray->GetRow(sector,lastrow));
+       if (row!=0) row->InsertCluster(&cl);
+       currentIndex=0;
+       lastrow=currentrow;
+      } //end of calculating cluster for given row
+               
+  } // end of loop over hits
+  xxxx->Delete();
 
+
+}