]> git.uio.no Git - u/mrichter/AliRoot.git/blobdiff - TPC/AliTPC.cxx
Corrected raw->sdigits method. Using default altro raw-data reader class. Avoid alloc...
[u/mrichter/AliRoot.git] / TPC / AliTPC.cxx
index 97a429703ed3b98a8814935c9b9c11ebeb229db7..af8bc32128b5d6871e480467dcd9767601026f5c 100644 (file)
 #include <Riostream.h>
 #include <stdlib.h>
 
+#include <TF2.h>
 #include <TFile.h>  
-#include <TGeometry.h>
+#include <TGeoGlobalMagField.h>
 #include <TInterpreter.h>
 #include <TMath.h>
-#include <TMatrix.h>
-#include <TNode.h>
+#include <TMatrixF.h>
 #include <TObjectTable.h>
 #include <TParticle.h>
 #include <TROOT.h>
 #include <TRandom.h>
+#include <TStopwatch.h>
+#include <TString.h>
 #include <TSystem.h>     
-#include <TTUBS.h>
 #include <TTree.h>
 #include <TVector.h>
 #include <TVirtualMC.h>
+#include <TParameter.h>
 
-#include "AliArrayBranch.h"
-#include "AliClusters.h"
-#include "AliComplexCluster.h"
 #include "AliDigits.h"
 #include "AliMagF.h"
-#include "AliPoints.h"
 #include "AliRun.h"
 #include "AliRunLoader.h"
 #include "AliSimDigits.h"
 #include "AliTPC.h"
 #include "AliTPC.h"
-#include "AliTPCClustersArray.h"
-#include "AliTPCClustersRow.h"
 #include "AliTPCDigitsArray.h"
 #include "AliTPCLoader.h"
 #include "AliTPCPRF2D.h"
 #include "AliTPCParamSR.h"
 #include "AliTPCRF1D.h"
-#include "AliTPCTrackHits.h"
 #include "AliTPCTrackHitsV2.h"
-#include "AliTPCcluster.h"
 #include "AliTrackReference.h"
 #include "AliMC.h"
+#include "AliStack.h"
 #include "AliTPCDigitizer.h"
-
+#include "AliTPCBuffer.h"
+#include "AliTPCDDLRawData.h"
+#include "AliLog.h"
+#include "AliTPCcalibDB.h"
+#include "AliTPCCalPad.h"
+#include "AliTPCCalROC.h"
+#include "AliTPCExB.h"
+#include "AliRawReader.h"
+#include "AliTPCRawStreamV3.h"
+#include "TTreeStream.h"
 
 ClassImp(AliTPC) 
-
 //_____________________________________________________________________________
-// helper class for fast matrix and vector manipulation - no range checking
-// origin - Marian Ivanov
-
-class AliTPCFastMatrix : public TMatrix {
-public :
-  AliTPCFastMatrix(Int_t row_lwb, Int_t row_upb, Int_t col_lwb, Int_t col_upb);
-  inline Float_t & UncheckedAt(Int_t rown, Int_t coln) const  {return  (fIndex[coln])[rown];} //fast acces   
-  inline Float_t   UncheckedAtFast(Int_t rown, Int_t coln) const  {return  (fIndex[coln])[rown];} //fast acces   
-};
-
-AliTPCFastMatrix::AliTPCFastMatrix(Int_t row_lwb, Int_t row_upb, Int_t col_lwb, Int_t col_upb):
-  TMatrix(row_lwb, row_upb,col_lwb,col_upb)
-   {
-   };
-//_____________________________________________________________________________
-class AliTPCFastVector : public TVector {
-public :
-  AliTPCFastVector(Int_t size);
-  virtual ~AliTPCFastVector(){;}
-  inline Float_t & UncheckedAt(Int_t index) const  {return  fElements[index];} //fast acces  
-  
-};
+  AliTPC::AliTPC():AliDetector(),
+                  fDefaults(0),
+                  fSens(0),
+                  fNsectors(0),
+                  fDigitsArray(0),
+                  fTPCParam(0),
+                  fTrackHits(0),
+                  fHitType(0),
+                  fDigitsSwitch(0),
+                  fSide(0),
+                   fPrimaryIonisation(0),
+                  fNoiseDepth(0),
+                  fNoiseTable(0),
+                  fCurrentNoise(0),
+                  fActiveSectors(0),
+                   fGainFactor(1.),
+                   fDebugStreamer(0),
+                   fLHCclockPhaseSw(0)
 
-AliTPCFastVector::AliTPCFastVector(Int_t size):TVector(size){
-};
-
-//_____________________________________________________________________________
-AliTPC::AliTPC()
 {
   //
   // Default constructor
   //
   fIshunt   = 0;
-  fHits     = 0;
-  fDigits   = 0;
-  fNsectors = 0;
-  fDigitsArray = 0;
-  fClustersArray = 0;
-  fDefaults = 0;
-  fTrackHits = 0; 
-  fTrackHitsOld = 0;   
-  fHitType = 2; //default CONTAINERS - based on ROOT structure 
-  fTPCParam = 0;    
-  fNoiseTable = 0;
-  fActiveSectors =0;
-
+  //  fTrackHitsOld = 0;   
+#if ROOT_VERSION_CODE >= ROOT_VERSION(4,0,1)
+  fHitType = 4; // ROOT containers
+#else
+  fHitType = 2; //default CONTAINERS - based on ROOT structure
+#endif 
 }
  
 //_____________________________________________________________________________
 AliTPC::AliTPC(const char *name, const char *title)
-      : AliDetector(name,title)
+  : AliDetector(name,title),
+                   fDefaults(0),
+                  fSens(0),
+                  fNsectors(0),
+                  fDigitsArray(0),
+                  fTPCParam(0),
+                  fTrackHits(0),
+                  fHitType(0),
+                  fDigitsSwitch(0),
+                  fSide(0),
+                   fPrimaryIonisation(0),
+                  fNoiseDepth(0),
+                  fNoiseTable(0),
+                  fCurrentNoise(0),
+                   fActiveSectors(0),
+                   fGainFactor(1.),
+                   fDebugStreamer(0),
+                   fLHCclockPhaseSw(0)
+                  
 {
   //
   // Standard constructor
@@ -141,33 +147,31 @@ AliTPC::AliTPC(const char *name, const char *title)
   // Initialise arrays of hits and digits 
   fHits     = new TClonesArray("AliTPChit",  176);
   gAlice->GetMCApp()->AddHitList(fHits); 
-  fDigitsArray = 0;
-  fClustersArray= 0;
-  fDefaults = 0;
   //
   fTrackHits = new AliTPCTrackHitsV2;  
   fTrackHits->SetHitPrecision(0.002);
   fTrackHits->SetStepPrecision(0.003);  
   fTrackHits->SetMaxDistance(100);
 
-  fTrackHitsOld = new AliTPCTrackHits;  //MI - 13.09.2000
-  fTrackHitsOld->SetHitPrecision(0.002);
-  fTrackHitsOld->SetStepPrecision(0.003);  
-  fTrackHitsOld->SetMaxDistance(100); 
+  //fTrackHitsOld = new AliTPCTrackHits;  //MI - 13.09.2000
+  //fTrackHitsOld->SetHitPrecision(0.002);
+  //fTrackHitsOld->SetStepPrecision(0.003);  
+  //fTrackHitsOld->SetMaxDistance(100); 
 
-  fNoiseTable =0;
 
+#if ROOT_VERSION_CODE >= ROOT_VERSION(4,0,1)
+  fHitType = 4; // ROOT containers
+#else
   fHitType = 2;
-  fActiveSectors = 0;
-  //
-  // Initialise counters
-  fNsectors = 0;
+#endif
+
+
 
   //
   fIshunt     =  0;
   //
   // Initialise color attributes
-  SetMarkerColor(kYellow);
+  //PH SetMarkerColor(kYellow);
 
   //
   //  Set TPC parameters
@@ -175,14 +179,20 @@ AliTPC::AliTPC(const char *name, const char *title)
 
 
   if (!strcmp(title,"Default")) {       
-    fTPCParam = new AliTPCParamSR;
+    //fTPCParam = new AliTPCParamSR;
+    fTPCParam = AliTPCcalibDB::Instance()->GetParameters();
   } else {
-    cerr<<"AliTPC warning: in Config.C you must set non-default parameters\n";
+    AliWarning("In Config.C you must set non-default parameters.");
     fTPCParam=0;
   }
 
 }
-
+void AliTPC::CreateDebugStremer(){
+  //
+  // Create Debug streamer to check simulation
+  // 
+  fDebugStreamer = new TTreeSRedirector("TPCSimdebug.root");
+}
 //_____________________________________________________________________________
 AliTPC::~AliTPC()
 {
@@ -193,11 +203,14 @@ AliTPC::~AliTPC()
   fIshunt   = 0;
   delete fHits;
   delete fDigits;
-  delete fTPCParam;
+  //delete fTPCParam;
   delete fTrackHits; //MI 15.09.2000
-  delete fTrackHitsOld; //MI 10.12.2001
-  if (fNoiseTable) delete [] fNoiseTable;
-
+  //  delete fTrackHitsOld; //MI 10.12.2001
+  
+  fDigitsArray = 0x0;
+  delete [] fNoiseTable;
+  delete [] fActiveSectors;
+  if (fDebugStreamer) delete fDebugStreamer;
 }
 
 //_____________________________________________________________________________
@@ -206,120 +219,14 @@ void AliTPC::AddHit(Int_t track, Int_t *vol, Float_t *hits)
   //
   // Add a hit to the list
   //
-  //  TClonesArray &lhits = *fHits;
-  //  new(lhits[fNhits++]) AliTPChit(fIshunt,track,vol,hits);
   if (fHitType&1){
     TClonesArray &lhits = *fHits;
     new(lhits[fNhits++]) AliTPChit(fIshunt,track,vol,hits);
   }
   if (fHitType>1)
-   AddHit2(track,vol,hits);
+    AddHit2(track,vol,hits);
 }
 
-//_____________________________________________________________________________
-void AliTPC::BuildGeometry()
-{
-
-  //
-  // Build TPC ROOT TNode geometry for the event display
-  //
-  TNode *nNode, *nTop;
-  TTUBS *tubs;
-  Int_t i;
-  const int kColorTPC=19;
-  char name[5], title[25];
-  const Double_t kDegrad=TMath::Pi()/180;
-  const Double_t kRaddeg=180./TMath::Pi();
-
-
-  Float_t innerOpenAngle = fTPCParam->GetInnerAngle();
-  Float_t outerOpenAngle = fTPCParam->GetOuterAngle();
-
-  Float_t innerAngleShift = fTPCParam->GetInnerAngleShift();
-  Float_t outerAngleShift = fTPCParam->GetOuterAngleShift();
-
-  Int_t nLo = fTPCParam->GetNInnerSector()/2;
-  Int_t nHi = fTPCParam->GetNOuterSector()/2;  
-
-  const Double_t kloAng = (Double_t)TMath::Nint(innerOpenAngle*kRaddeg);
-  const Double_t khiAng = (Double_t)TMath::Nint(outerOpenAngle*kRaddeg);
-  const Double_t kloAngSh = (Double_t)TMath::Nint(innerAngleShift*kRaddeg);
-  const Double_t khiAngSh = (Double_t)TMath::Nint(outerAngleShift*kRaddeg);  
-
-
-  const Double_t kloCorr = 1/TMath::Cos(0.5*kloAng*kDegrad);
-  const Double_t khiCorr = 1/TMath::Cos(0.5*khiAng*kDegrad);
-
-  Double_t rl,ru;
-  
-
-  //
-  // Get ALICE top node
-  //
-
-  nTop=gAlice->GetGeometry()->GetNode("alice");
-
-  //  inner sectors
-
-  rl = fTPCParam->GetInnerRadiusLow();
-  ru = fTPCParam->GetInnerRadiusUp();
-
-  for(i=0;i<nLo;i++) {
-    sprintf(name,"LS%2.2d",i);
-    name[4]='\0';
-    sprintf(title,"TPC low sector %3d",i);
-    title[24]='\0';
-    
-    tubs = new TTUBS(name,title,"void",rl*kloCorr,ru*kloCorr,250.,
-                     kloAng*(i-0.5)+kloAngSh,kloAng*(i+0.5)+kloAngSh);
-    tubs->SetNumberOfDivisions(1);
-    nTop->cd();
-    nNode = new TNode(name,title,name,0,0,0,"");
-    nNode->SetLineColor(kColorTPC);
-    fNodes->Add(nNode);
-  }
-
-  // Outer sectors
-
-  rl = fTPCParam->GetOuterRadiusLow();
-  ru = fTPCParam->GetOuterRadiusUp();
-
-  for(i=0;i<nHi;i++) {
-    sprintf(name,"US%2.2d",i);
-    name[4]='\0';
-    sprintf(title,"TPC upper sector %d",i);
-    title[24]='\0';
-    tubs = new TTUBS(name,title,"void",rl*khiCorr,ru*khiCorr,250,
-                     khiAng*(i-0.5)+khiAngSh,khiAng*(i+0.5)+khiAngSh);
-    tubs->SetNumberOfDivisions(1);
-    nTop->cd();
-    nNode = new TNode(name,title,name,0,0,0,"");
-    nNode->SetLineColor(kColorTPC);
-    fNodes->Add(nNode);
-  }
-
-}    
-
-//_____________________________________________________________________________
-Int_t AliTPC::DistancetoPrimitive(Int_t , Int_t )
-{
-  //
-  // Calculate distance from TPC to mouse on the display
-  // Dummy procedure
-  //
-  return 9999;
-}
-
-void AliTPC::Clusters2Tracks() 
- {
-  //-----------------------------------------------------------------
-  // This is a track finder.
-  //-----------------------------------------------------------------
-  Error("Clusters2Tracks",
-  "Dummy function !  Call AliTPCtracker::Clusters2Tracks(...) instead !");
- }
-
 //_____________________________________________________________________________
 void AliTPC::CreateMaterials()
 {
@@ -331,51 +238,24 @@ void AliTPC::CreateMaterials()
   // Origin: Marek Kowalski  IFJ, Krakow, Marek.Kowalski@ifj.edu.pl
   //-----------------------------------------------------------------
 
-  Int_t iSXFLD=gAlice->Field()->Integ();
-  Float_t sXMGMX=gAlice->Field()->Max();
+   Int_t iSXFLD=((AliMagF*)TGeoGlobalMagField::Instance()->GetField())->Integ();
+  Float_t sXMGMX=((AliMagF*)TGeoGlobalMagField::Instance()->GetField())->Max();
 
   Float_t amat[5]; // atomic numbers
   Float_t zmat[5]; // z
   Float_t wmat[5]; // proportions
 
   Float_t density;
-  Float_t apure[2];
-
-
-  //***************** Gases *************************
-  
-  //-------------------------------------------------
-  // pure gases
-  //-------------------------------------------------
-
-  // Neon
-
-
-  amat[0]= 20.18;
-  zmat[0]= 10.;  
-  density = 0.0009;
  
-  apure[0]=amat[0];
-
-  AliMaterial(20,"Ne",amat[0],zmat[0],density,999.,999.);
-
-  // Argon
 
-  amat[0]= 39.948;
-  zmat[0]= 18.;  
-  density = 0.001782;  
 
-  apure[1]=amat[0];
+  //***************** Gases *************************
 
-  AliMaterial(21,"Ar",amat[0],zmat[0],density,999.,999.);
  
-
   //--------------------------------------------------------------
-  // gases - compounds
+  // gases - air and CO2
   //--------------------------------------------------------------
 
-  Float_t amol[3];
-
   // CO2
 
   amat[0]=12.011;
@@ -384,106 +264,59 @@ void AliTPC::CreateMaterials()
   zmat[0]=6.;
   zmat[1]=8.;
 
-  wmat[0]=1.;
-  wmat[1]=2.;
-
-  density=0.001977;
-
-  amol[0] = amat[0]*wmat[0]+amat[1]*wmat[1];
-
-  AliMixture(10,"CO2",amat,zmat,density,-2,wmat);
-  
-  // CF4
-
-  amat[0]=12.011;
-  amat[1]=18.998;
-
-  zmat[0]=6.;
-  zmat[1]=9.;
-  wmat[0]=1.;
-  wmat[1]=4.;
-  density=0.003034;
-
-  amol[1] = amat[0]*wmat[0]+amat[1]*wmat[1];
-
-  AliMixture(11,"CF4",amat,zmat,density,-2,wmat); 
-
+  wmat[0]=0.2729;
+  wmat[1]=0.7271;
 
-  // CH4
+  density=0.001754609;
 
-  amat[0]=12.011;
-  amat[1]=1.;
 
-  zmat[0]=6.;
-  zmat[1]=1.;
-
-  wmat[0]=1.;
-  wmat[1]=4.;
-
-  density=0.000717;
-
-  amol[2] = amat[0]*wmat[0]+amat[1]*wmat[1];
-
-  AliMixture(12,"CH4",amat,zmat,density,-2,wmat);
+  AliMixture(10,"CO2",amat,zmat,density,2,wmat);
+  //
+  // Air
+  //
+  amat[0]=15.9994;
+  amat[1]=14.007;
+  //
+  zmat[0]=8.;
+  zmat[1]=7.;
+  //
+  wmat[0]=0.233;
+  wmat[1]=0.767;
+  //
+  density=0.001205;
 
+  AliMixture(11,"Air",amat,zmat,density,2,wmat);
+  
   //----------------------------------------------------------------
-  // gases - mixtures, ID >= 20 pure gases, <= 10 ID < 20 -compounds
+  // drift gases 
   //----------------------------------------------------------------
 
-  char namate[21]=""; 
-  density = 0.;
-  Float_t am=0;
-  Int_t nc;
-  Float_t rho,absl,X0,buf[1];
-  Int_t nbuf;
-  Float_t a,z;
-
-  for(nc = 0;nc<fNoComp;nc++)
-    {
-    
-      // retrive material constants
-      
-      gMC->Gfmate((*fIdmate)[fMixtComp[nc]],namate,a,z,rho,X0,absl,buf,nbuf);
-
-      amat[nc] = a;
-      zmat[nc] = z;
-
-      Int_t nnc = (fMixtComp[nc]>=20) ? fMixtComp[nc]%20 : fMixtComp[nc]%10;
-      am += fMixtProp[nc]*((fMixtComp[nc]>=20) ? apure[nnc] : amol[nnc]); 
-      density += fMixtProp[nc]*rho;  // density of the mixture
-      
-    }
-
-  // mixture proportions by weight!
-
-  for(nc = 0;nc<fNoComp;nc++)
-    {
-
-      Int_t nnc = (fMixtComp[nc]>=20) ? fMixtComp[nc]%20 : fMixtComp[nc]%10;
-
-      wmat[nc] = fMixtProp[nc]*((fMixtComp[nc]>=20) ? 
-                 apure[nnc] : amol[nnc])/am;
-
-    } 
-
+  //
   // Drift gases 1 - nonsensitive, 2 - sensitive
+  // Ne-CO2-N2 (90-10-5) (volume) values at 20deg and 1 atm.
+  // rho(Ne) = 0.839 g/cm^3, rho(CO2) = 1.842 g/cm^3, rho(N2) = 1.165 g/cm^3
+  // for the calculation - everything is normalized to 1
 
-  AliMixture(31,"Drift gas 1",amat,zmat,density,fNoComp,wmat);
-  AliMixture(32,"Drift gas 2",amat,zmat,density,fNoComp,wmat);
-
-
-  // Air
-
-  amat[0] = 14.61;
-  zmat[0] = 7.3;
-  density = 0.001205;
+  amat[0]= 20.18;
+  amat[1]=12.011;
+  amat[2]=15.9994;
+  amat[3]=14.007;
 
-  AliMaterial(24,"Air",amat[0],zmat[0],density,999.,999.); 
+  zmat[0]= 10.; 
+  zmat[1]=6.;
+  zmat[2]=8.;
+  zmat[3]=7.;
 
+  wmat[0]=0.756992632;
+  wmat[1]=0.056235789;
+  wmat[2]=0.128469474;
+  wmat[3]=0.058395789;
+  density=0.000904929;
 
+  AliMixture(12,"Ne-CO2-N-1",amat,zmat,density,4,wmat);
+  AliMixture(13,"Ne-CO2-N-2",amat,zmat,density,4,wmat);
+  AliMixture(30,"Ne-CO2-N-3",amat,zmat,density,4,wmat);
   //----------------------------------------------------------------------
   //               solid materials
   //----------------------------------------------------------------------
@@ -508,7 +341,7 @@ void AliTPC::CreateMaterials()
 
   density = 1.45;
 
-  AliMixture(34,"Kevlar",amat,zmat,density,-4,wmat);  
+  AliMixture(14,"Kevlar",amat,zmat,density,-4,wmat);  
 
   // NOMEX
 
@@ -527,10 +360,9 @@ void AliTPC::CreateMaterials()
   wmat[2] = 2.;
   wmat[3] = 2.;
 
-  density = 0.03;
-
-  
-  AliMixture(35,"NOMEX",amat,zmat,density,-4,wmat);
+  density = 0.029;
+  AliMixture(15,"NOMEX",amat,zmat,density,-4,wmat);
 
   // Makrolon C16H18O3
 
@@ -548,7 +380,25 @@ void AliTPC::CreateMaterials()
   
   density = 1.2;
 
-  AliMixture(36,"Makrolon",amat,zmat,density,-3,wmat);
+  AliMixture(16,"Makrolon",amat,zmat,density,-3,wmat);
+
+  // Tedlar C2H3F
+
+  amat[0] = 12.011;
+  amat[1] = 1.;
+  amat[2] = 18.998;
+
+  zmat[0] = 6.;
+  zmat[1] = 1.;
+  zmat[2] = 9.;
+
+  wmat[0] = 2.;
+  wmat[1] = 3.; 
+  wmat[2] = 1.;
+
+  density = 1.71;
+
+  AliMixture(17, "Tedlar",amat,zmat,density,-3,wmat);  
   
   // Mylar C5H4O2
 
@@ -566,22 +416,91 @@ void AliTPC::CreateMaterials()
 
   density = 1.39;
   
-  AliMixture(37, "Mylar",amat,zmat,density,-3,wmat); 
+  AliMixture(18, "Mylar",amat,zmat,density,-3,wmat); 
+  // material for "prepregs"
+  // Epoxy - C14 H20 O3
+  // Quartz SiO2
+  // Carbon C
+  // prepreg1 60% C-fiber, 40% epoxy (vol)
+  amat[0]=12.011;
+  amat[1]=1.;
+  amat[2]=15.994;
 
-  // SiO2 - used later for the glass fiber
+  zmat[0]=6.;
+  zmat[1]=1.;
+  zmat[2]=8.;
 
-  amat[0]=28.086;
-  amat[1]=15.9994;
+  wmat[0]=0.923;
+  wmat[1]=0.023;
+  wmat[2]=0.054;
 
-  zmat[0]=14.;
-  zmat[1]=8.;
+  density=1.859;
+
+  AliMixture(19, "Prepreg1",amat,zmat,density,3,wmat);
+
+  //prepreg2 60% glass-fiber, 40% epoxy
+
+  amat[0]=12.01;
+  amat[1]=1.;
+  amat[2]=15.994;
+  amat[3]=28.086;
+
+  zmat[0]=6.;
+  zmat[1]=1.;
+  zmat[2]=8.;
+  zmat[3]=14.;
+
+  wmat[0]=0.194;
+  wmat[1]=0.023;
+  wmat[2]=0.443;
+  wmat[3]=0.34;
+
+  density=1.82;
+
+  AliMixture(20, "Prepreg2",amat,zmat,density,4,wmat);
+
+  //prepreg3 50% glass-fiber, 50% epoxy
+
+  amat[0]=12.01;
+  amat[1]=1.;
+  amat[2]=15.994;
+  amat[3]=28.086;
+
+  zmat[0]=6.;
+  zmat[1]=1.;
+  zmat[2]=8.;
+  zmat[3]=14.;
 
-  wmat[0]=1.;
-  wmat[1]=2.;
+  wmat[0]=0.257;
+  wmat[1]=0.03;
+  wmat[2]=0.412;
+  wmat[3]=0.3;
 
+  density=1.725;
 
-  AliMixture(38,"SiO2",amat,zmat,2.2,-2,wmat); //SiO2 - quartz (rho=2.2)
+  AliMixture(21, "Prepreg3",amat,zmat,density,4,wmat);
 
+  // G10 60% SiO2 40% epoxy
+
+  amat[0]=12.01;
+  amat[1]=1.;
+  amat[2]=15.994;
+  amat[3]=28.086;
+
+  zmat[0]=6.;
+  zmat[1]=1.;
+  zmat[2]=8.;
+  zmat[3]=14.;
+
+  wmat[0]=0.194;
+  wmat[1]=0.023;
+  wmat[2]=0.443;
+  wmat[3]=0.340;
+
+  density=1.7;
+
+  AliMixture(22, "G10",amat,zmat,density,4,wmat);
   // Al
 
   amat[0] = 26.98;
@@ -589,16 +508,16 @@ void AliTPC::CreateMaterials()
 
   density = 2.7;
 
-  AliMaterial(40,"Al",amat[0],zmat[0],density,999.,999.);
+  AliMaterial(23,"Al",amat[0],zmat[0],density,999.,999.);
 
-  // Si
+  // Si (for electronics
 
   amat[0] = 28.086;
   zmat[0] = 14.;
 
   density = 2.33;
 
-  AliMaterial(41,"Si",amat[0],zmat[0],density,999.,999.);
+  AliMaterial(24,"Si",amat[0],zmat[0],density,999.,999.);
 
   // Cu
 
@@ -607,48 +526,68 @@ void AliTPC::CreateMaterials()
 
   density = 8.96;
 
-  AliMaterial(42,"Cu",amat[0],zmat[0],density,999.,999.);
+  AliMaterial(25,"Cu",amat[0],zmat[0],density,999.,999.);
 
-  // Tedlar C2H3F
+  // brass
 
-  amat[0] = 12.011;
-  amat[1] = 1.;
-  amat[2] = 18.998;
-
-  zmat[0] = 6.;
-  zmat[1] = 1.;
-  zmat[2] = 9.;
-
-  wmat[0] = 2.;
-  wmat[1] = 3.; 
-  wmat[2] = 1.;
+  amat[0] = 63.546;
+  zmat[0] = 29.;
+  //
+  amat[1]= 65.409;
+  zmat[1]= 30.;
+  //
+  wmat[0]= 0.6;
+  wmat[1]= 0.4;
 
-  density = 1.71;
+  //
+  density = 8.23;
+  
+  //
+  AliMixture(33,"Brass",amat,zmat,density,2,wmat);
+  
+  // Epoxy - C14 H20 O3
+  amat[0]=12.011;
+  amat[1]=1.;
+  amat[2]=15.9994;
 
-  AliMixture(43, "Tedlar",amat,zmat,density,-3,wmat);  
+  zmat[0]=6.;
+  zmat[1]=1.;
+  zmat[2]=8.;
 
+  wmat[0]=14.;
+  wmat[1]=20.;
+  wmat[2]=3.;
 
-  // Plexiglas  C5H8O2
+  density=1.25;
 
-  amat[0]=12.011;
+  AliMixture(26,"Epoxy",amat,zmat,density,-3,wmat);
+  //
+  // epoxy film - 90% epoxy, 10% glass fiber 
+  //
+  amat[0]=12.01;
   amat[1]=1.;
-  amat[2]=15.9994;
+  amat[2]=15.994;
+  amat[3]=28.086;
 
   zmat[0]=6.;
   zmat[1]=1.;
   zmat[2]=8.;
+  zmat[3]=14.;
 
-  wmat[0]=5.;
-  wmat[1]=8.;
-  wmat[2]=2.;
+  wmat[0]=0.596;
+  wmat[1]=0.071;
+  wmat[2]=0.257;
+  wmat[3]=0.076;
 
-  density=1.18;
 
-  AliMixture(44,"Plexiglas",amat,zmat,density,-3,wmat);
+  density=1.345;
 
-  // Epoxy - C14 H20 O3
+  AliMixture(34, "Epoxy-film",amat,zmat,density,4,wmat);
+
+  // Plexiglas  C5H8O2
 
-  
   amat[0]=12.011;
   amat[1]=1.;
   amat[2]=15.9994;
@@ -657,13 +596,13 @@ void AliTPC::CreateMaterials()
   zmat[1]=1.;
   zmat[2]=8.;
 
-  wmat[0]=14.;
-  wmat[1]=20.;
-  wmat[2]=3.;
+  wmat[0]=5.;
+  wmat[1]=8.;
+  wmat[2]=2.;
 
-  density=1.25;
+  density=1.18;
 
-  AliMixture(45,"Epoxy",amat,zmat,density,-3,wmat);
+  AliMixture(27,"Plexiglas",amat,zmat,density,-3,wmat);
 
   // Carbon
 
@@ -671,61 +610,105 @@ void AliTPC::CreateMaterials()
   zmat[0]=6.;
   density= 2.265;
 
-  AliMaterial(46,"C",amat[0],zmat[0],density,999.,999.);
+  AliMaterial(28,"C",amat[0],zmat[0],density,999.,999.);
 
-  // get epoxy
+  // Fe (steel for the inner heat screen)
+  amat[0]=55.845;
+
+  zmat[0]=26.;
 
-  gMC->Gfmate((*fIdmate)[45],namate,amat[1],zmat[1],rho,X0,absl,buf,nbuf);
+  density=7.87;
 
-  // Carbon fiber
+  AliMaterial(29,"Fe",amat[0],zmat[0],density,999.,999.);
+  //
+  // Peek - (C6H4-O-OC6H4-O-C6H4-CO)n
+  amat[0]=12.011;
+  amat[1]=1.;
+  amat[2]=15.9994;
+
+  zmat[0]=6.;
+  zmat[1]=1.;
+  zmat[2]=8.;
 
-  wmat[0]=0.644; // by weight!
-  wmat[1]=0.356;
+  wmat[0]=19.;
+  wmat[1]=12.;
+  wmat[2]=3.;
+  //
+  density=1.3;
+  //
+  AliMixture(30,"Peek",amat,zmat,density,-3,wmat);  
+  //
+  //  Ceramics - Al2O3
+  //
+  amat[0] = 26.98;
+  amat[1]= 15.9994;
 
-  density=0.5*(1.25+2.265);
+  zmat[0] = 13.;
+  zmat[1]=8.;
+  wmat[0]=2.;
+  wmat[1]=3.;
+  density = 3.97;
 
-  AliMixture(47,"Cfiber",amat,zmat,density,2,wmat);
+  AliMixture(31,"Alumina",amat,zmat,density,-2,wmat);   
 
-  // get SiO2
+  //
+  // liquids
+  //
 
-  gMC->Gfmate((*fIdmate)[38],namate,amat[0],zmat[0],rho,X0,absl,buf,nbuf); 
+  // water
 
-  wmat[0]=0.725; // by weight!
-  wmat[1]=0.275;
+  amat[0]=1.;
+  amat[1]=15.9994;
 
-  density=1.7;
+  zmat[0]=1.;
+  zmat[1]=8.;
 
-  AliMixture(39,"G10",amat,zmat,density,2,wmat);
+  wmat[0]=2.;
+  wmat[1]=1.;
 
+  density=1.;
 
+  AliMixture(32,"Water",amat,zmat,density,-2,wmat);  
 
   //----------------------------------------------------------
   // tracking media for gases
   //----------------------------------------------------------
 
-  AliMedium(0, "Air", 24, 0, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999., .1, .01, .1);
-  AliMedium(1, "Drift gas 1", 31, 0, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999.,.1,.001, .001);
-  AliMedium(2, "Drift gas 2", 32, 1, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999.,.1,.001, .001);
+  AliMedium(0, "Air", 11, 0, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999., .1, .01, .1);
+  AliMedium(1, "Ne-CO2-N-1", 12, 0, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999.,.1,.001, .001);
+  AliMedium(2, "Ne-CO2-N-2", 13, 1, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999.,.1,.001, .001);
   AliMedium(3,"CO2",10,0, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999.,.1, .001, .001); 
-
+  AliMedium(20, "Ne-CO2-N-3", 30, 1, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999.,.1,.001, .001);
   //-----------------------------------------------------------  
   // tracking media for solids
   //-----------------------------------------------------------
   
-  AliMedium(4,"Al",40,0, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999., .1, .0005, .001);
-  AliMedium(5,"Kevlar",34,0, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999., .1, .0005, .001);
-  AliMedium(6,"Nomex",35,0, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999., .1, .001, .001);
-  AliMedium(7,"Makrolon",36,0, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999., .1, .001, .001);
-  AliMedium(8,"Mylar",37,0, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999., .1, .0005, .001);
-  AliMedium(9,"Tedlar",43,0, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999., .1, .0005, .001);
-  AliMedium(10,"Cu",42,0, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999., .1, .001, .001);
-  AliMedium(11,"Si",41,0, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999., .1, .001, .001);
-  AliMedium(12,"G10",39,0, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999., .1, .001, .001);
-  AliMedium(13,"Plexiglas",44,0, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999., .1, .001, .001);
-  AliMedium(14,"Epoxy",45,0, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999., .1, .0005, .001);
-  AliMedium(15,"Cfiber",47,0, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999., .1, .001, .001);
-    
+  AliMedium(4,"Al",23,0, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999., .1, .0005, .001);
+  AliMedium(5,"Kevlar",14,0, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999., .1, .0005, .001);
+  AliMedium(6,"Nomex",15,0, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999., .1, .001, .001);
+  AliMedium(7,"Makrolon",16,0, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999., .1, .001, .001);
+  AliMedium(8,"Mylar",18,0, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999., .1, .0005, .001);
+  AliMedium(9,"Tedlar",17,0, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999., .1, .0005, .001);
+  //
+  AliMedium(10,"Prepreg1",19,0, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999., .1, .0005, .001);
+  AliMedium(11,"Prepreg2",20,0, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999., .1, .0005, .001);
+  AliMedium(12,"Prepreg3",21,0, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999., .1, .0005, .001);
+  AliMedium(13,"Epoxy",26,0, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999., .1, .0005, .001);
+
+  AliMedium(14,"Cu",25,0, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999., .1, .001, .001);
+  AliMedium(15,"Si",24,0, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999., .1, .001, .001);
+  AliMedium(16,"G10",22,0, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999., .1, .001, .001);
+  AliMedium(17,"Plexiglas",27,0, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999., .1, .001, .001);
+  AliMedium(18,"Steel",29,0, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999., .1, .001, .001); 
+  AliMedium(19,"Peek",30,0, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999., .1, .001, .001);
+  AliMedium(21,"Alumina",31,0, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999., .1, .001, .001);    
+  AliMedium(22,"Water",32,0, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999., .1, .001, .001);
+  AliMedium(23,"Brass",33,0, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999., .1, .001, .001);
+  AliMedium(24,"Epoxyfm",34,0, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999., .1, .0005, .001);  
 }
 
 void AliTPC::GenerNoise(Int_t tablesize)
@@ -758,7 +741,7 @@ Float_t AliTPC::GetNoise()
 }
 
 
-Bool_t  AliTPC::IsSectorActive(Int_t sec)
+Bool_t  AliTPC::IsSectorActive(Int_t sec) const
 {
   //
   // check if the sector is active
@@ -770,8 +753,7 @@ void    AliTPC::SetActiveSectors(Int_t * sectors, Int_t n)
 {
   // activate interesting sectors
   SetTreeAddress();//just for security
-  if (fActiveSectors) delete [] fActiveSectors;
-  fActiveSectors = new Bool_t[fTPCParam->GetNSector()];
+  if (!fActiveSectors) fActiveSectors = new Bool_t[fTPCParam->GetNSector()];
   for (Int_t i=0;i<fTPCParam->GetNSector();i++) fActiveSectors[i]=kFALSE;
   for (Int_t i=0;i<n;i++) 
     if ((sectors[i]>=0) && sectors[i]<fTPCParam->GetNSector())  fActiveSectors[sectors[i]]=kTRUE;
@@ -785,451 +767,311 @@ void    AliTPC::SetActiveSectors(Int_t flag)
   //loop over tracks
   SetTreeAddress();//just for security
   if (fHitType==0) return;  // if Clones hit - not short volume ID information
-  if (fActiveSectors) delete [] fActiveSectors;
-  fActiveSectors = new Bool_t[fTPCParam->GetNSector()];
+  if (!fActiveSectors) fActiveSectors = new Bool_t[fTPCParam->GetNSector()];
   if (flag) {
     for (Int_t i=0;i<fTPCParam->GetNSector();i++) fActiveSectors[i]=kTRUE;
     return;
   }
   for (Int_t i=0;i<fTPCParam->GetNSector();i++) fActiveSectors[i]=kFALSE;
   TBranch * branch=0;
-  if (TreeH() == 0x0)
+  if (fLoader->TreeH() == 0x0)
    {
-     Fatal("SetActiveSectors","Can not find TreeH in folder");
+     AliFatal("Can not find TreeH in folder");
      return;
    }
-  if (fHitType>1) branch = TreeH()->GetBranch("TPC2");
-  else branch = TreeH()->GetBranch("TPC");
-  Stat_t ntracks = TreeH()->GetEntries();
+  if (fHitType>1) branch = fLoader->TreeH()->GetBranch("TPC2");
+  else branch = fLoader->TreeH()->GetBranch("TPC");
+  Stat_t ntracks = fLoader->TreeH()->GetEntries();
   // loop over all hits
-  cout<<"\nAliTPC::SetActiveSectors():  Got "<<ntracks<<" tracks\n";
+  AliDebug(1,Form("Got %d tracks", (Int_t) ntracks));
   
-  for(Int_t track=0;track<ntracks;track++)
-   {
+  for(Int_t track=0;track<ntracks;track++) {
     ResetHits();
     //
     if (fTrackHits && fHitType&4) {
-      TBranch * br1 = TreeH()->GetBranch("fVolumes");
-      TBranch * br2 = TreeH()->GetBranch("fNVolumes");
+      TBranch * br1 = fLoader->TreeH()->GetBranch("fVolumes");
+      TBranch * br2 = fLoader->TreeH()->GetBranch("fNVolumes");
       br1->GetEvent(track);
       br2->GetEvent(track);
       Int_t *volumes = fTrackHits->GetVolumes();
-      for (Int_t j=0;j<fTrackHits->GetNVolumes(); j++)
-       fActiveSectors[volumes[j]]=kTRUE;
+      for (Int_t j=0;j<fTrackHits->GetNVolumes(); j++) {
+       if (volumes[j]>-1 && volumes[j]<fTPCParam->GetNSector()) {
+         fActiveSectors[volumes[j]]=kTRUE;
+       }
+       else {
+           AliError(Form("Volume %d -> sector number %d is outside (0..%d)",
+                         j,
+                         volumes[j],
+                         fTPCParam->GetNSector()));
+       }
+      }
     }
     
     //
-    if (fTrackHitsOld && fHitType&2) {
-      TBranch * br = TreeH()->GetBranch("fTrackHitsInfo");
-      br->GetEvent(track);
-      AliObjectArray * ar = fTrackHitsOld->fTrackHitsInfo;
-      for (UInt_t j=0;j<ar->GetSize();j++){
-       fActiveSectors[((AliTrackHitsInfo*)ar->At(j))->fVolumeID] =kTRUE;
-      } 
-    }    
+//     if (fTrackHitsOld && fHitType&2) {
+//       TBranch * br = fLoader->TreeH()->GetBranch("fTrackHitsInfo");
+//       br->GetEvent(track);
+//       AliObjectArray * ar = fTrackHitsOld->fTrackHitsInfo;
+//       for (UInt_t j=0;j<ar->GetSize();j++){
+//     fActiveSectors[((AliTrackHitsInfo*)ar->At(j))->fVolumeID] =kTRUE;
+//       } 
+//     }    
   }
-  
 }  
 
 
 
 
-void AliTPC::Digits2Clusters(Int_t /*eventnumber*/)
-{
-  //-----------------------------------------------------------------
-  // This is a simple cluster finder.
-  //-----------------------------------------------------------------
-  Error("Digits2Clusters",
-  "Dummy function !  Call AliTPCclusterer::Digits2Clusters(...) instead !");
-}
-
-extern Double_t SigmaY2(Double_t, Double_t, Double_t);
-extern Double_t SigmaZ2(Double_t, Double_t);
 //_____________________________________________________________________________
-void AliTPC::Hits2Clusters(Int_t /*eventn*/)
+void AliTPC::Digits2Raw()
 {
-  //--------------------------------------------------------
-  // TPC simple cluster generator from hits
-  // obtained from the TPC Fast Simulator
-  // The point errors are taken from the parametrization
-  //--------------------------------------------------------
-
-  //-----------------------------------------------------------------
-  // Origin: Marek Kowalski  IFJ, Krakow, Marek.Kowalski@ifj.edu.pl
-  //-----------------------------------------------------------------
-  // Adopted to Marian's cluster data structure by I.Belikov, CERN,
-  // Jouri.Belikov@cern.ch
-  //----------------------------------------------------------------
-  
-  /////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
-  //
-  //---------------------------------------------------------------------
-  //   ALICE TPC Cluster Parameters
-  //--------------------------------------------------------------------
-       
-  
-
-  // Cluster width in rphi
-  const Float_t kACrphi=0.18322;
-  const Float_t kBCrphi=0.59551e-3;
-  const Float_t kCCrphi=0.60952e-1;
-  // Cluster width in z
-  const Float_t kACz=0.19081;
-  const Float_t kBCz=0.55938e-3;
-  const Float_t kCCz=0.30428;
+// convert digits of the current event to raw data
 
+  static const Int_t kThreshold = 0;
 
-  if (!fLoader) {
-     cerr<<"AliTPC::Hits2Clusters(): output file not open !\n";
-     return;
-  }
-
-  //if(fDefaults == 0) SetDefaults();
-
-  Float_t sigmaRphi,sigmaZ,clRphi,clZ;
-  //
-  TParticle *particle; // pointer to a given particle
-  AliTPChit *tpcHit; // pointer to a sigle TPC hit
-  Int_t sector;
-  Int_t ipart;
-  Float_t xyz[5];
-  Float_t pl,pt,tanth,rpad,ratio;
-  Float_t cph,sph;
-  
-  //---------------------------------------------------------------
-  //  Get the access to the tracks 
-  //---------------------------------------------------------------
-  
-  TTree *tH = TreeH();
-  if (tH == 0x0)
-   {
-     Fatal("Hits2Clusters","Can not find TreeH in folder");
-     return;
-   }
-  SetTreeAddress();
-  
-  Stat_t ntracks = tH->GetEntries();
+  fLoader->LoadDigits();
+  TTree* digits = fLoader->TreeD();
+  if (!digits) {
+    AliError("No digits tree");
+    return;
+  }
 
-  //Switch to the output file
-  
-  if (fLoader->TreeR() == 0x0) fLoader->MakeTree("R");
-  
-  cout<<"fTPCParam->GetTitle() = "<<fTPCParam->GetTitle()<<endl;
-  
-  AliRunLoader* rl = (AliRunLoader*)fLoader->GetEventFolder()->FindObject(AliRunLoader::fgkRunLoaderName);
-  rl->CdGAFile();
-  //fTPCParam->Write(fTPCParam->GetTitle());
+  AliSimDigits digarr;
+  AliSimDigits* digrow = &digarr;
+  digits->GetBranch("Segment")->SetAddress(&digrow);
+
+  const char* fileName = "AliTPCDDL.dat";
+  AliTPCBuffer* buffer  = new AliTPCBuffer(fileName);
+  //Verbose level
+  // 0: Silent
+  // 1: cout messages
+  // 2: txt files with digits 
+  //BE CAREFUL, verbose level 2 MUST be used only for debugging and
+  //it is highly suggested to use this mode only for debugging digits files
+  //reasonably small, because otherwise the size of the txt files can reach
+  //quickly several MB wasting time and disk space.
+  buffer->SetVerbose(0);
+
+  Int_t nEntries = Int_t(digits->GetEntries());
+  Int_t previousSector = -1;
+  Int_t subSector = 0;
+  for (Int_t i = 0; i < nEntries; i++) {
+    digits->GetEntry(i);
+    Int_t sector, row;
+    fTPCParam->AdjustSectorRow(digarr.GetID(), sector, row);
+    if(previousSector != sector) {
+      subSector = 0;
+      previousSector = sector;
+    }
 
-  AliTPCClustersArray carray;
-  carray.Setup(fTPCParam);
-  carray.SetClusterType("AliTPCcluster");
-  carray.MakeTree(fLoader->TreeR());
+    if (sector < 36) { //inner sector [0;35]
+      if (row != 30) {
+       //the whole row is written into the output file
+       buffer->WriteRowBinary(kThreshold, digrow, 0, 0, 0, 
+                              sector, subSector, row);
+      } else {
+       //only the pads in the range [37;48] are written into the output file
+       buffer->WriteRowBinary(kThreshold, digrow, 37, 48, 1, 
+                              sector, subSector, row);
+       subSector = 1;
+       //only the pads outside the range [37;48] are written into the output file
+       buffer->WriteRowBinary(kThreshold, digrow, 37, 48, 2, 
+                              sector, subSector, row);
+      }//end else
+
+    } else { //outer sector [36;71]
+      if (row == 54) subSector = 2;
+      if ((row != 27) && (row != 76)) {
+       buffer->WriteRowBinary(kThreshold, digrow, 0, 0, 0,
+                              sector, subSector, row);
+      } else if (row == 27) {
+       //only the pads outside the range [43;46] are written into the output file
+       buffer->WriteRowBinary(kThreshold, digrow, 43, 46, 2,
+                                sector, subSector, row);
+       subSector = 1;
+       //only the pads in the range [43;46] are written into the output file
+       buffer->WriteRowBinary(kThreshold, digrow, 43, 46, 1,
+                                sector, subSector, row);
+      } else if (row == 76) {
+       //only the pads outside the range [33;88] are written into the output file
+       buffer->WriteRowBinary(kThreshold, digrow, 33, 88, 2,
+                              sector, subSector, row);
+       subSector = 3;
+       //only the pads in the range [33;88] are written into the output file
+       buffer->WriteRowBinary(kThreshold, digrow, 33, 88, 1,
+                                sector, subSector, row);
+      }
+    }//end else
+  }//end for
 
-  Int_t nclusters=0; //cluster counter
-  
-  //------------------------------------------------------------
-  // Loop over all sectors (72 sectors for 20 deg
-  // segmentation for both lower and upper sectors)
-  // Sectors 0-35 are lower sectors, 0-17 z>0, 17-35 z<0
-  // Sectors 36-71 are upper sectors, 36-53 z>0, 54-71 z<0
-  //
-  // First cluster for sector 0 starts at "0"
-  //------------------------------------------------------------
-   
-  for(Int_t isec=0;isec<fTPCParam->GetNSector();isec++){
-    //MI change
-    fTPCParam->AdjustCosSin(isec,cph,sph);
-    
-    //------------------------------------------------------------
-    // Loop over tracks
-    //------------------------------------------------------------
-    
-    for(Int_t track=0;track<ntracks;track++){
-      ResetHits();
-      tH->GetEvent(track);
-      //
-      //  Get number of the TPC hits
-      //     
-       tpcHit = (AliTPChit*)FirstHit(-1);
+  delete buffer;
+  fLoader->UnloadDigits();
 
-      // Loop over hits
-      //
-       while(tpcHit){
-        if (tpcHit->fQ == 0.) {
-           tpcHit = (AliTPChit*) NextHit();
-           continue; //information about track (I.Belikov)
-        }
-       sector=tpcHit->fSector; // sector number
-
-       if(sector != isec){
-        tpcHit = (AliTPChit*) NextHit();
-        continue; 
-       }
-       ipart=tpcHit->Track();
-       particle=gAlice->GetMCApp()->Particle(ipart);
-       pl=particle->Pz();
-       pt=particle->Pt();
-       if(pt < 1.e-9) pt=1.e-9;
-       tanth=pl/pt;
-       tanth = TMath::Abs(tanth);
-       rpad=TMath::Sqrt(tpcHit->X()*tpcHit->X() + tpcHit->Y()*tpcHit->Y());
-       ratio=0.001*rpad/pt; // pt must be in MeV/c - historical reason
-
-       //   space-point resolutions
-       
-       sigmaRphi=SigmaY2(rpad,tanth,pt);
-       sigmaZ   =SigmaZ2(rpad,tanth   );
-       
-       //   cluster widths
-       
-       clRphi=kACrphi-kBCrphi*rpad*tanth+kCCrphi*ratio*ratio;
-       clZ=kACz-kBCz*rpad*tanth+kCCz*tanth*tanth;
-       
-       // temporary protection
-       
-       if(sigmaRphi < 0.) sigmaRphi=0.4e-3;
-       if(sigmaZ < 0.) sigmaZ=0.4e-3;
-       if(clRphi < 0.) clRphi=2.5e-3;
-       if(clZ < 0.) clZ=2.5e-5;
-       
-       //
-       
-       //
-       // smearing --> rotate to the 1 (13) or to the 25 (49) sector,
-       // then the inaccuracy in a X-Y plane is only along Y (pad row)!
-       //
-        Float_t xprim= tpcHit->X()*cph + tpcHit->Y()*sph;
-       Float_t yprim=-tpcHit->X()*sph + tpcHit->Y()*cph;
-       xyz[0]=gRandom->Gaus(yprim,TMath::Sqrt(sigmaRphi));   // y
-          Float_t alpha=(isec < fTPCParam->GetNInnerSector()) ?
-         fTPCParam->GetInnerAngle() : fTPCParam->GetOuterAngle();
-          Float_t ymax=xprim*TMath::Tan(0.5*alpha);
-          if (TMath::Abs(xyz[0])>ymax) xyz[0]=yprim; 
-       xyz[1]=gRandom->Gaus(tpcHit->Z(),TMath::Sqrt(sigmaZ)); // z
-          if (TMath::Abs(xyz[1])>fTPCParam->GetZLength()) xyz[1]=tpcHit->Z(); 
-       xyz[2]=sigmaRphi;                                     // fSigmaY2
-       xyz[3]=sigmaZ;                                        // fSigmaZ2
-       xyz[4]=tpcHit->fQ;                                    // q
-
-        AliTPCClustersRow *clrow=carray.GetRow(sector,tpcHit->fPadRow);
-        if (!clrow) clrow=carray.CreateRow(sector,tpcHit->fPadRow);    
-
-        Int_t tracks[3]={tpcHit->Track(), -1, -1};
-       AliTPCcluster cluster(tracks,xyz);
-
-        clrow->InsertCluster(&cluster); nclusters++;
-
-        tpcHit = (AliTPChit*)NextHit();
-        
+  AliTPCDDLRawData rawWriter;
+  rawWriter.SetVerbose(0);
+
+  rawWriter.RawData(fileName);
+  gSystem->Unlink(fileName);
 
-      } // end of loop over hits
+}
 
-    }   // end of loop over tracks
 
-    Int_t nrows=fTPCParam->GetNRow(isec);
-    for (Int_t irow=0; irow<nrows; irow++) {
-        AliTPCClustersRow *clrow=carray.GetRow(isec,irow);
-        if (!clrow) continue;
-        carray.StoreRow(isec,irow);
-        carray.ClearRow(isec,irow);
-    }
+//_____________________________________________________________________________
+Bool_t AliTPC::Raw2SDigits(AliRawReader* rawReader){
+  // Converts the TPC raw data into summable digits
+  // The method is used for merging simulated and
+  // real data events
+  if (fLoader->TreeS() == 0x0 ) {
+    fLoader->MakeTree("S");
+  }
 
-  } // end of loop over sectors  
+  if(fDefaults == 0) SetDefaults();  // check if the parameters are set
 
-  cerr<<"Number of made clusters : "<<nclusters<<"                        \n";
-  fLoader->WriteRecPoints("OVERWRITE");
-  
-  
-} // end of function
+  //setup TPCDigitsArray 
+  if(GetDigitsArray()) delete GetDigitsArray();
 
-//_________________________________________________________________
-void AliTPC::Hits2ExactClustersSector(Int_t isec)
-{
-  //--------------------------------------------------------
-  //calculate exact cross point of track and given pad row
-  //resulting values are expressed in "digit" coordinata
-  //--------------------------------------------------------
+  AliTPCDigitsArray *arr = new AliTPCDigitsArray; 
+  arr->SetClass("AliSimDigits");
+  arr->Setup(fTPCParam);
+  arr->MakeTree(fLoader->TreeS());
 
-  //-----------------------------------------------------------------
-  // Origin: Marian Ivanov  GSI Darmstadt, m.ivanov@gsi.de
-  //-----------------------------------------------------------------
-  //
-  if (fClustersArray==0){    
-    return;
+  SetDigitsArray(arr);
+
+  // set zero suppression to "0"
+  fTPCParam->SetZeroSup(0);
+
+  // Loop over sectors
+  const Int_t kmaxTime = fTPCParam->GetMaxTBin();
+  const Int_t kNIS = fTPCParam->GetNInnerSector();
+  const Int_t kNOS = fTPCParam->GetNOuterSector();
+  const Int_t kNS = kNIS + kNOS;
+
+  // Setup storage
+  AliTPCROC * roc = AliTPCROC::Instance();
+  Int_t nRowsMax = roc->GetNRows(roc->GetNSector()-1);
+  Int_t nPadsMax = roc->GetNPads(roc->GetNSector()-1,nRowsMax-1);
+  Short_t** allBins = new Short_t*[nRowsMax];
+  for (Int_t iRow = 0; iRow < nRowsMax; iRow++) {
+    Int_t maxBin = kmaxTime*nPadsMax;
+    allBins[iRow] = new Short_t[maxBin];
+    memset(allBins[iRow],0,sizeof(Short_t)*maxBin);
   }
-  //
-  TParticle *particle; // pointer to a given particle
-  AliTPChit *tpcHit; // pointer to a sigle TPC hit
-  //  Int_t sector,nhits;
-  Int_t ipart;
-  const Int_t kcmaxhits=30000;
-  AliTPCFastVector * xxxx = new AliTPCFastVector(kcmaxhits*4);
-  AliTPCFastVector & xxx = *xxxx;
-  Int_t maxhits = kcmaxhits;
-  //construct array for each padrow
-  for (Int_t i=0; i<fTPCParam->GetNRow(isec);i++) 
-    fClustersArray->CreateRow(isec,i);
-  
-  //---------------------------------------------------------------
-  //  Get the access to the tracks 
-  //---------------------------------------------------------------
-  
-  TTree *tH = TreeH();
-  if (tH == 0x0)
-   {
-     Fatal("Hits2Clusters","Can not find TreeH in folder");
-     return;
-   }
-  SetTreeAddress();
 
-  Stat_t ntracks = tH->GetEntries();
-  Int_t npart = gAlice->GetMCApp()->GetNtrack();
-  //MI change
-  TBranch * branch=0;
-  if (fHitType>1) branch = tH->GetBranch("TPC2");
-  else branch = tH->GetBranch("TPC");
+  for(Int_t iSector = 0; iSector < kNS; iSector++) {
+    
+    Int_t nRows = fTPCParam->GetNRow(iSector);
+    Int_t nDDLs = 0, indexDDL = 0;
+    if (iSector < kNIS) {
+      nDDLs = 2;
+      indexDDL = iSector * 2;
+    }
+    else {
+      nDDLs = 4;
+      indexDDL = (iSector-kNIS) * 4 + kNIS * 2;
+    }
 
-  //------------------------------------------------------------
-  // Loop over tracks
-  //------------------------------------------------------------
+    // Load the raw data for corresponding DDLs
+    rawReader->Reset();
 
-  for(Int_t track=0;track<ntracks;track++){ 
-    Bool_t isInSector=kTRUE;
-    ResetHits();
-     isInSector = TrackInVolume(isec,track);
-    if (!isInSector) continue;
-    //MI change
-    branch->GetEntry(track); // get next track
-    //
-    //  Get number of the TPC hits and a pointer
-    //  to the particles
-    // Loop over hits
-    //
-    Int_t currentIndex=0;
-    Int_t lastrow=-1;  //last writen row
+    AliTPCAltroMapping** mapping =AliTPCcalibDB::Instance()->GetMapping();
+    AliTPCRawStreamV3 input(rawReader,(AliAltroMapping**)mapping);
+    rawReader->Select("TPC",indexDDL,indexDDL+nDDLs-1);
 
-    //M.I. changes
+    // Clean storage
+    for (Int_t iRow = 0; iRow < nRowsMax; iRow++) {
+      Int_t maxBin = kmaxTime*nPadsMax;
+      memset(allBins[iRow],0,sizeof(Short_t)*maxBin);
+    }
 
-    tpcHit = (AliTPChit*)FirstHit(-1);
-    while(tpcHit){
-      
-      Int_t sector=tpcHit->fSector; // sector number
-      if(sector != isec){
-       tpcHit = (AliTPChit*) NextHit();
-       continue; 
-      }
+    // Begin loop over altro data
+    while (input.NextDDL()) {
+
+      if (input.GetSector() != iSector)
+       AliFatal(Form("Sector index mismatch ! Expected (%d), but got (%d) !",iSector,input.GetSector()));
+
+      //loop over pads
+      while ( input.NextChannel() ) {
+
+        Int_t iRow = input.GetRow();
+        if (iRow < 0 || iRow >= nRows)
+          AliFatal(Form("Pad-row index (%d) outside the range (%d -> %d) !",
+                        iRow, 0, nRows -1));
+        Int_t iPad = input.GetPad();
+
+        Int_t maxPad = fTPCParam->GetNPads(iSector,iRow);
+
+        if (iPad < 0 || iPad >= maxPad)
+          AliFatal(Form("Pad index (%d) outside the range (%d -> %d) !",
+                        iPad, 0, maxPad -1));
+
+        //loop over bunches
+        while ( input.NextBunch() ){
+          Int_t  startTbin    = (Int_t)input.GetStartTimeBin();
+          Int_t  bunchlength  = (Int_t)input.GetBunchLength();
+          const UShort_t *sig = input.GetSignals();
+          for (Int_t iTime = 0; iTime<bunchlength; iTime++){
+            Int_t iTimeBin=startTbin-iTime;
+            if ( iTimeBin < 0 || iTimeBin >= kmaxTime) {
+              continue;
+              //AliFatal(Form("Timebin index (%d) outside the range (%d -> %d) !",
+              //               iTimeBin, 0, kmaxTime -1));
+            }
+
+            Int_t maxBin = kmaxTime*maxPad;
+            if (((iPad*kmaxTime+iTimeBin) >= maxBin) ||
+                ((iPad*kmaxTime+iTimeBin) < 0))
+              AliFatal(Form("Index outside the allowed range"
+                            " Sector=%d Row=%d Pad=%d Timebin=%d"
+                            " (Max.index=%d)",iSector,iRow,iPad,iTimeBin,maxBin));
+            allBins[iRow][iPad*kmaxTime+iTimeBin] = sig[iTime];
+          }
+        }
+      } // End loop over altro data
+    }
 
-      ipart=tpcHit->Track();
-      if (ipart<npart) particle=gAlice->GetMCApp()->Particle(ipart);
-      
-      //find row number
-
-      Float_t  x[3]={tpcHit->X(),tpcHit->Y(),tpcHit->Z()};
-      Int_t    index[3]={1,isec,0};
-      Int_t    currentrow = fTPCParam->GetPadRow(x,index) ;    
-      if (currentrow<0) {tpcHit = (AliTPChit*)NextHit(); continue;}
-      if (lastrow<0) lastrow=currentrow;
-      if (currentrow==lastrow){
-       if ( currentIndex>=maxhits){
-         maxhits+=kcmaxhits;
-         xxx.ResizeTo(4*maxhits);
-       }     
-       xxx(currentIndex*4)=x[0];
-       xxx(currentIndex*4+1)=x[1];
-       xxx(currentIndex*4+2)=x[2];     
-       xxx(currentIndex*4+3)=tpcHit->fQ;
-       currentIndex++; 
+    // Now fill the digits array
+    if (fDigitsArray->GetTree()==0) {
+      AliFatal("Tree not set in fDigitsArray");
+    }
+
+    for (Int_t iRow = 0; iRow < nRows; iRow++) {
+      AliDigits * dig = fDigitsArray->CreateRow(iSector,iRow);
+      Int_t maxPad = fTPCParam->GetNPads(iSector,iRow);
+      for(Int_t iPad = 0; iPad < maxPad; iPad++) {
+       for(Int_t iTimeBin = 0; iTimeBin < kmaxTime; iTimeBin++) {
+         Short_t q = allBins[iRow][iPad*kmaxTime + iTimeBin];
+         if (q <= 0) continue;
+         q *= 16;
+         dig->SetDigitFast((Short_t)q,iTimeBin,iPad);
+       }
       }
-      else 
-       if (currentIndex>2){
-         Float_t sumx=0;
-         Float_t sumx2=0;
-         Float_t sumx3=0;
-         Float_t sumx4=0;
-         Float_t sumy=0;
-         Float_t sumxy=0;
-         Float_t sumx2y=0;
-         Float_t sumz=0;
-         Float_t sumxz=0;
-         Float_t sumx2z=0;
-         Float_t sumq=0;
-         for (Int_t index=0;index<currentIndex;index++){
-           Float_t x,x2,x3,x4;
-           x=x2=x3=x4=xxx(index*4);
-           x2*=x;
-           x3*=x2;
-           x4*=x3;
-           sumx+=x;
-           sumx2+=x2;
-           sumx3+=x3;
-           sumx4+=x4;
-           sumy+=xxx(index*4+1);
-           sumxy+=xxx(index*4+1)*x;
-           sumx2y+=xxx(index*4+1)*x2;
-           sumz+=xxx(index*4+2);
-           sumxz+=xxx(index*4+2)*x;
-           sumx2z+=xxx(index*4+2)*x2;   
-           sumq+=xxx(index*4+3);
-         }
-         Float_t centralPad = (fTPCParam->GetNPads(isec,lastrow)-1)/2;
-         Float_t det=currentIndex*(sumx2*sumx4-sumx3*sumx3)-sumx*(sumx*sumx4-sumx2*sumx3)+
-           sumx2*(sumx*sumx3-sumx2*sumx2);
-         
-         Float_t detay=sumy*(sumx2*sumx4-sumx3*sumx3)-sumx*(sumxy*sumx4-sumx2y*sumx3)+
-           sumx2*(sumxy*sumx3-sumx2y*sumx2);
-         Float_t detaz=sumz*(sumx2*sumx4-sumx3*sumx3)-sumx*(sumxz*sumx4-sumx2z*sumx3)+
-           sumx2*(sumxz*sumx3-sumx2z*sumx2);
-         
-         Float_t detby=currentIndex*(sumxy*sumx4-sumx2y*sumx3)-sumy*(sumx*sumx4-sumx2*sumx3)+
-           sumx2*(sumx*sumx2y-sumx2*sumxy);
-         Float_t detbz=currentIndex*(sumxz*sumx4-sumx2z*sumx3)-sumz*(sumx*sumx4-sumx2*sumx3)+
-           sumx2*(sumx*sumx2z-sumx2*sumxz);
-         
-         if (TMath::Abs(det)<0.00001){
-            tpcHit = (AliTPChit*)NextHit();
-           continue;
-         }
-       
-         Float_t y=detay/det+centralPad;
-         Float_t z=detaz/det;  
-         Float_t by=detby/det; //y angle
-         Float_t bz=detbz/det; //z angle
-         sumy/=Float_t(currentIndex);
-         sumz/=Float_t(currentIndex);
-
-         AliTPCClustersRow * row = (fClustersArray->GetRow(isec,lastrow));
-         if (row!=0) {
-           AliComplexCluster* cl = new((AliComplexCluster*)row->Append()) AliComplexCluster ;
-           //    AliComplexCluster cl;
-           cl->fX=z;
-           cl->fY=y;
-           cl->fQ=sumq;
-           cl->fSigmaX2=bz;
-           cl->fSigmaY2=by;
-           cl->fTracks[0]=ipart;
-         }
-         currentIndex=0;
-         lastrow=currentrow;
-       } //end of calculating cluster for given row
-       
+      fDigitsArray->StoreRow(iSector,iRow);
+      Int_t ndig = dig->GetDigitSize(); 
        
-      tpcHit = (AliTPChit*)NextHit();
-    } // end of loop over hits
-  }   // end of loop over tracks 
-  //write padrows to tree 
-  for (Int_t ii=0; ii<fTPCParam->GetNRow(isec);ii++) {
-    fClustersArray->StoreRow(isec,ii);    
-    fClustersArray->ClearRow(isec,ii);        
+      AliDebug(10,
+              Form("*** Sector, row, compressed digits %d %d %d ***\n",
+                   iSector,iRow,ndig));        
+       
+      fDigitsArray->ClearRow(iSector,iRow);  
+
+    } // end of the sector digitization
   }
-  xxxx->Delete();
-}
 
+  fLoader->WriteSDigits("OVERWRITE");
 
+  if(GetDigitsArray()) delete GetDigitsArray();
+  SetDigitsArray(0x0);
+
+  // cleanup storage
+  for (Int_t iRow = 0; iRow < nRowsMax; iRow++)
+    delete [] allBins[iRow];
+  delete [] allBins;
+
+  return kTRUE;
+}
 
 //______________________________________________________________________
-AliDigitizer* AliTPC::CreateDigitizer(AliRunDigitizer* manager)
+AliDigitizer* AliTPC::CreateDigitizer(AliRunDigitizer* manager) const
 {
   return new AliTPCDigitizer(manager);
 }
@@ -1242,26 +1084,23 @@ void AliTPC::SDigits2Digits2(Int_t /*eventnumber*/)
   //conect tree with sSDigits
   TTree *t = fLoader->TreeS();
 
-  if (t == 0x0) 
-   {
-     fLoader->LoadSDigits("READ");
-     t = fLoader->TreeS();
-     if (t == 0x0)
-      {
-        Error("SDigits2Digits2","Can not get input TreeS");
-        return;
-      }
-   }
+  if (t == 0x0) {
+    fLoader->LoadSDigits("READ");
+    t = fLoader->TreeS();
+    if (t == 0x0) {
+      AliError("Can not get input TreeS");
+      return;
+    }
+  }
   
   if (fLoader->TreeD() == 0x0) fLoader->MakeTree("D");
   
   AliSimDigits digarr, *dummy=&digarr;
   TBranch* sdb = t->GetBranch("Segment");
-  if (sdb == 0x0)
-   {
-     Error("SDigits2Digits2","Can not find branch with segments in TreeS.");
-     return;
-   }  
+  if (sdb == 0x0) {
+    AliError("Can not find branch with segments in TreeS.");
+    return;
+  }  
 
   sdb->SetAddress(&dummy);
       
@@ -1290,18 +1129,11 @@ void AliTPC::SDigits2Digits2(Int_t /*eventnumber*/)
     t->GetEvent(n);
     Int_t sec, row;
     if (!par->AdjustSectorRow(digarr.GetID(),sec,row)) {
-      cerr<<"AliTPC warning: invalid segment ID ! "<<digarr.GetID()<<endl;
+      AliWarning(Form("Invalid segment ID ! %d",digarr.GetID()));
       continue;
     }
-    if (!IsSectorActive(sec)) 
-     {
-//       cout<<n<<" NOT Active \n";
-       continue;
-     }
-    else
-     {
-//       cout<<n<<" Active \n";
-     }
+    if (!IsSectorActive(sec)) continue;
+    
     AliSimDigits * digrow =(AliSimDigits*) arr->CreateRow(sec,row);
     Int_t nrows = digrow->GetNRows();
     Int_t ncols = digrow->GetNCols();
@@ -1317,23 +1149,16 @@ void AliTPC::SDigits2Digits2(Int_t /*eventnumber*/)
     Short_t * pamp1 = digrow->GetDigits();
     Int_t   * ptracks1 = digrow->GetTracks();
     Int_t  nelems =nrows*ncols;
-    Int_t saturation = fTPCParam->GetADCSat();
+    Int_t saturation = fTPCParam->GetADCSat() - 1;
     //use internal structure of the AliDigits - for speed reason
     //if you cahnge implementation
     //of the Alidigits - it must be rewriten -
     for (Int_t i= 0; i<nelems; i++){
-      //      Float_t q = *pamp0;
-      //q/=16.;  //conversion faktor
-      //Float_t noise= GetNoise(); 
-      //q+=noise;      
-      //q= TMath::Nint(q);
       Float_t q = TMath::Nint(Float_t(*pamp0)/16.+GetNoise());
       if (q>zerosup){
        if (q>saturation) q=saturation;      
        *pamp1=(Short_t)q;
-       //if (ptracks0[0]==0)
-       //  ptracks1[0]=1;
-       //else
+
        ptracks1[0]=ptracks0[0];        
        ptracks1[nelems]=ptracks0[nelems];
        ptracks1[2*nelems]=ptracks0[2*nelems];
@@ -1346,7 +1171,6 @@ void AliTPC::SDigits2Digits2(Int_t /*eventnumber*/)
 
     arr->StoreRow(sec,row);
     arr->ClearRow(sec,row);   
-    // cerr<<sec<<"\t"<<row<<"\n";   
   }  
 
     
@@ -1357,47 +1181,79 @@ void AliTPC::SDigits2Digits2(Int_t /*eventnumber*/)
 }
 //__________________________________________________________________
 void AliTPC::SetDefaults(){
-
+  //
+  // setting the defaults
+  //
    
-   cerr<<"Setting default parameters...\n";
-
   // Set response functions
 
   //
-  AliRunLoader* rl = (AliRunLoader*)fLoader->GetEventFolder()->FindObject(AliRunLoader::fgkRunLoaderName);
+  AliRunLoader* rl = (AliRunLoader*)fLoader->GetEventFolder()->FindObject(AliRunLoader::GetRunLoaderName());
   rl->CdGAFile();
   AliTPCParamSR *param=(AliTPCParamSR*)gDirectory->Get("75x40_100x60");
-  if(param){
-    printf("You are using 2 pad-length geom hits with 3 pad-lenght geom digits...\n");
-    delete param;
-    param = new AliTPCParamSR();
-  }
-  else {
-    param=(AliTPCParamSR*)gDirectory->Get("75x40_100x60_150x60");
-  }
+  // if(param){
+//     AliInfo("You are using 2 pad-length geom hits with 3 pad-lenght geom digits...");
+//     delete param;
+//     param = new AliTPCParamSR();
+//   }
+//   else {
+//     param=(AliTPCParamSR*)gDirectory->Get("75x40_100x60_150x60");
+//   }
+  param = (AliTPCParamSR*)AliTPCcalibDB::Instance()->GetParameters();
+  if (!param->IsGeoRead()){
+      //
+      // read transformation matrices for gGeoManager
+      //
+      param->ReadGeoMatrices();
+    }
   if(!param){
-    printf("No TPC parameters found\n");
-    exit(4);
+    AliFatal("No TPC parameters found");
   }
 
 
   AliTPCPRF2D    * prfinner   = new AliTPCPRF2D;
   AliTPCPRF2D    * prfouter1   = new AliTPCPRF2D;
   AliTPCPRF2D    * prfouter2   = new AliTPCPRF2D;  
-  AliTPCRF1D     * rf    = new AliTPCRF1D(kTRUE);
-  rf->SetGauss(param->GetZSigma(),param->GetZWidth(),1.);
-  rf->SetOffset(3*param->GetZSigma());
-  rf->Update();
+
+  
+  //AliTPCRF1D     * rf    = new AliTPCRF1D(kTRUE);
+  //rf->SetGauss(param->GetZSigma(),param->GetZWidth(),1.);
+  //rf->SetOffset(3*param->GetZSigma());
+  //rf->Update();
+  //
+  // Use gamma 4
+  //
+  char  strgamma4[1000];
+  sprintf(strgamma4,"AliTPCRF1D::Gamma4((x-0.135+%f)*%f,55,160)",3*param->GetZSigma(), 1000000000*param->GetTSample()/param->GetZWidth());
   
+  TF1 * fgamma4 = new TF1("fgamma4",strgamma4, -1,1);
+  AliTPCRF1D     * rf    = new AliTPCRF1D(kTRUE,1000);
+  rf->SetParam(fgamma4,param->GetZWidth(), 1,0.2);
+  rf->SetOffset(3*param->GetZSigma()); 
+  rf->Update();
+
   TDirectory *savedir=gDirectory;
   TFile *f=TFile::Open("$ALICE_ROOT/TPC/AliTPCprf2d.root");
-  if (!f->IsOpen()) 
-    cerr<<"Can't open $ALICE_ROOT/TPC/AliTPCprf2d.root !\n" ;
-     exit(3);
-  }
+  if (!f->IsOpen()) 
+    AliFatal("Can't open $ALICE_ROOT/TPC/AliTPCprf2d.root !");
+
+  TString s;
   prfinner->Read("prf_07504_Gati_056068_d02");
+  //PH Set different names
+  s=prfinner->GetGRF()->GetName();
+  s+="in";
+  prfinner->GetGRF()->SetName(s.Data());
+
   prfouter1->Read("prf_10006_Gati_047051_d03");
+  s=prfouter1->GetGRF()->GetName();
+  s+="out1";
+  prfouter1->GetGRF()->SetName(s.Data());
+
   prfouter2->Read("prf_15006_Gati_047051_d03");  
+  s=prfouter2->GetGRF()->GetName();
+  s+="out2";
+  prfouter2->GetGRF()->SetName(s.Data());
+
   f->Close();
   savedir->cd();
 
@@ -1417,13 +1273,22 @@ void AliTPC::SetDefaults(){
 //__________________________________________________________________  
 void AliTPC::Hits2Digits()  
 {
+  //
+  // creates digits from hits
+  //
+  if (!fTPCParam->IsGeoRead()){
+    //
+    // read transformation matrices for gGeoManager
+    //
+    fTPCParam->ReadGeoMatrices();
+  }
+
   fLoader->LoadHits("read");
   fLoader->LoadDigits("recreate");
   AliRunLoader* runLoader = fLoader->GetRunLoader(); 
 
   for (Int_t iEvent = 0; iEvent < runLoader->GetNumberOfEvents(); iEvent++) {
-    runLoader->GetEvent(iEvent);
-    SetActiveSectors();   
+    //PH    runLoader->GetEvent(iEvent);
     Hits2Digits(iEvent);
   }
 
@@ -1436,26 +1301,23 @@ void AliTPC::Hits2Digits(Int_t eventnumber)
  //----------------------------------------------------
  // Loop over all sectors for a single event
  //----------------------------------------------------
-  AliRunLoader* rl = (AliRunLoader*)fLoader->GetEventFolder()->FindObject(AliRunLoader::fgkRunLoaderName);
+  AliRunLoader* rl = (AliRunLoader*)fLoader->GetEventFolder()->FindObject(AliRunLoader::GetRunLoaderName());
   rl->GetEvent(eventnumber);
-  if (fLoader->TreeH() == 0x0)
-   {
-     if(fLoader->LoadHits())
-      {
-        Error("Hits2Digits","Can not load hits.");
-      }
-   }
+  SetActiveSectors();   
+  if (fLoader->TreeH() == 0x0) {
+    if(fLoader->LoadHits()) {
+      AliError("Can not load hits.");
+    }
+  }
   SetTreeAddress();
   
-  if (fLoader->TreeD() == 0x0 ) 
-   {
-     fLoader->MakeTree("D");
-     if (fLoader->TreeD() == 0x0 ) 
-      {
-       Error("Hits2Digits","Can not get TreeD");
-       return;
-      }
-   }
+  if (fLoader->TreeD() == 0x0 ) {
+    fLoader->MakeTree("D");
+    if (fLoader->TreeD() == 0x0 ) {
+      AliError("Can not get TreeD");
+      return;
+    }
+  }
 
   if(fDefaults == 0) SetDefaults();  // check if the parameters are set
   GenerNoise(500000); //create teble with noise
@@ -1463,7 +1325,7 @@ void AliTPC::Hits2Digits(Int_t eventnumber)
   //setup TPCDigitsArray 
 
   if(GetDigitsArray()) delete GetDigitsArray();
-
+  
   AliTPCDigitsArray *arr = new AliTPCDigitsArray; 
   arr->SetClass("AliSimDigits");
   arr->Setup(fTPCParam);
@@ -1472,28 +1334,42 @@ void AliTPC::Hits2Digits(Int_t eventnumber)
   SetDigitsArray(arr);
 
   fDigitsSwitch=0; // standard digits
-
-  cerr<<"Digitizing TPC -- normal digits...\n";
-
- for(Int_t isec=0;isec<fTPCParam->GetNSector();isec++) 
-  if (IsSectorActive(isec)) 
-   {
-    if (fDebug) Info("Hits2Digits","Sector %d is active.",isec);
-    Hits2DigitsSector(isec);
-   }
-  else
-   {
-    if (fDebug) Info("Hits2Digits","Sector %d is NOT active.",isec);
-   }
-
+  // here LHC clock phase
+  Float_t lhcph = 0.;
+  switch (fLHCclockPhaseSw){
+  case 0: 
+    // no phase
+    lhcph=0.;
+    break;
+  case 1:
+    // random phase
+    lhcph = (Int_t)(gRandom->Rndm()/0.25);    
+    break;
+  case 2:
+    lhcph=0.;
+    // not implemented yet
+    break;
+  }
+  // adding phase to the TreeD user info 
+  fLoader->TreeD()->GetUserInfo()->Add(new TParameter<float>("lhcphase0",lhcph));
+  //
+  for(Int_t isec=0;isec<fTPCParam->GetNSector();isec++) 
+    if (IsSectorActive(isec)) {
+      AliDebug(1,Form("Hits2Digits: Sector %d is active.",isec));
+      Hits2DigitsSector(isec);
+    }
+    else {
+      AliDebug(1,Form("Hits2Digits: Sector %d is NOT active.",isec));
+    }
+  
   fLoader->WriteDigits("OVERWRITE"); 
   
 //this line prevents the crash in the similar one
 //on the beginning of this method
 //destructor attempts to reset the tree, which is deleted by the loader
 //need to be redesign
- if(GetDigitsArray()) delete GetDigitsArray();
- SetDigitsArray(0x0);
 if(GetDigitsArray()) delete GetDigitsArray();
 SetDigitsArray(0x0);
   
 }
 
@@ -1505,29 +1381,25 @@ void AliTPC::Hits2SDigits2(Int_t eventnumber)
   //   summable digits - 16 bit "ADC", no noise, no saturation
   //-----------------------------------------------------------
 
- //----------------------------------------------------
- // Loop over all sectors for a single event
- //----------------------------------------------------
-//  AliRunLoader* rl = (AliRunLoader*)fLoader->GetEventFolder()->FindObject(AliRunLoader::fgkRunLoaderName);
+  //----------------------------------------------------
+  // Loop over all sectors for a single event
+  //----------------------------------------------------
 
   AliRunLoader* rl = fLoader->GetRunLoader();
 
   rl->GetEvent(eventnumber);
-  if (fLoader->TreeH() == 0x0)
-   {
-     if(fLoader->LoadHits())
-      {
-        Error("Hits2Digits","Can not load hits.");
-        return;
-      }
-   }
+  if (fLoader->TreeH() == 0x0) {
+    if(fLoader->LoadHits()) {
+      AliError("Can not load hits.");
+      return;
+    }
+  }
   SetTreeAddress();
 
 
-  if (fLoader->TreeS() == 0x0 ) 
-   {
-     fLoader->MakeTree("S");
-   }
+  if (fLoader->TreeS() == 0x0 ) {
+    fLoader->MakeTree("S");
+  }
   
   if(fDefaults == 0) SetDefaults();
   
@@ -1544,29 +1416,44 @@ void AliTPC::Hits2SDigits2(Int_t eventnumber)
 
   SetDigitsArray(arr);
 
-  cerr<<"Digitizing TPC -- summable digits...\n"; 
-
   fDigitsSwitch=1; // summable digits
   
     // set zero suppression to "0"
+  // here LHC clock phase
+  Float_t lhcph = 0.;
+  switch (fLHCclockPhaseSw){
+  case 0: 
+    // no phase
+    lhcph=0.;
+    break;
+  case 1:
+    // random phase
+    lhcph = (Int_t)(gRandom->Rndm()/0.25);    
+    break;
+  case 2:
+    lhcph=0.;
+    // not implemented yet
+    break;
+  }
+  // adding phase to the TreeS user info 
+  
+  fLoader->TreeS()->GetUserInfo()->Add(new TParameter<float>("lhcphase0",lhcph));
 
   fTPCParam->SetZeroSup(0);
 
- for(Int_t isec=0;isec<fTPCParam->GetNSector();isec++) 
-  if (IsSectorActive(isec)) 
-   {
-//    cout<<"Sector "<<isec<<" is active\n";
-    Hits2DigitsSector(isec);
-   }
+  for(Int_t isec=0;isec<fTPCParam->GetNSector();isec++) 
+    if (IsSectorActive(isec)) {
+      Hits2DigitsSector(isec);
+    }
 
- fLoader->WriteSDigits("OVERWRITE");
 fLoader->WriteSDigits("OVERWRITE");
 
 //this line prevents the crash in the similar one
 //on the beginning of this method
 //destructor attempts to reset the tree, which is deleted by the loader
 //need to be redesign
- if(GetDigitsArray()) delete GetDigitsArray();
- SetDigitsArray(0x0);
 if(GetDigitsArray()) delete GetDigitsArray();
 SetDigitsArray(0x0);
 }
 //__________________________________________________________________
 
@@ -1577,6 +1464,13 @@ void AliTPC::Hits2SDigits()
   //   summable digits - 16 bit "ADC", no noise, no saturation
   //-----------------------------------------------------------
 
+  if (!fTPCParam->IsGeoRead()){
+    //
+    // read transformation matrices for gGeoManager
+    //
+    fTPCParam->ReadGeoMatrices();
+  }
+  
   fLoader->LoadHits("read");
   fLoader->LoadSDigits("recreate");
   AliRunLoader* runLoader = fLoader->GetRunLoader(); 
@@ -1587,9 +1481,13 @@ void AliTPC::Hits2SDigits()
     SetActiveSectors();
     Hits2SDigits2(iEvent);
   }
-
+  
   fLoader->UnloadHits();
   fLoader->UnloadSDigits();
+  if (fDebugStreamer) {
+    delete fDebugStreamer;
+    fDebugStreamer=0;
+  }    
 }
 //_____________________________________________________________________________
 
@@ -1612,71 +1510,63 @@ void AliTPC::Hits2DigitsSector(Int_t isec)
 
   if(fDefaults == 0) SetDefaults();
 
-  TTree *tH = TreeH(); // pointer to the hits tree
-  if (tH == 0x0)
-   {
-     Fatal("Hits2DigitsSector","Can not find TreeH in folder");
-     return;
-   }
+  TTree *tH = fLoader->TreeH(); // pointer to the hits tree
+  if (tH == 0x0) {
+    AliFatal("Can not find TreeH in folder");
+    return;
+  }
 
   Stat_t ntracks = tH->GetEntries();
 
-  if( ntracks > 0){
 
-  //------------------------------------------- 
-  //  Only if there are any tracks...
-  //-------------------------------------------
 
     TObjArray **row;
     
-    //printf("*** Processing sector number %d ***\n",isec);
-
-      Int_t nrows =fTPCParam->GetNRow(isec);
+    Int_t nrows =fTPCParam->GetNRow(isec);
 
-      row= new TObjArray* [nrows+2]; // 2 extra rows for cross talk
+    row= new TObjArray* [nrows+2]; // 2 extra rows for cross talk
     
-      MakeSector(isec,nrows,tH,ntracks,row);
+    MakeSector(isec,nrows,tH,ntracks,row);
 
-      //--------------------------------------------------------
-      //   Digitize this sector, row by row
-      //   row[i] is the pointer to the TObjArray of AliTPCFastVectors,
-      //   each one containing electrons accepted on this
-      //   row, assigned into tracks
-      //--------------------------------------------------------
+    //--------------------------------------------------------
+    //   Digitize this sector, row by row
+    //   row[i] is the pointer to the TObjArray of TVectors,
+    //   each one containing electrons accepted on this
+    //   row, assigned into tracks
+    //--------------------------------------------------------
 
-      Int_t i;
+    Int_t i;
 
-      if (fDigitsArray->GetTree()==0) 
-       {
-         Fatal("Hits2DigitsSector","Tree not set in fDigitsArray");
-       }
-
-      for (i=0;i<nrows;i++){
+    if (fDigitsArray->GetTree()==0) {
+      AliFatal("Tree not set in fDigitsArray");
+    }
 
-       AliDigits * dig = fDigitsArray->CreateRow(isec,i); 
+    for (i=0;i<nrows;i++){
+      
+      AliDigits * dig = fDigitsArray->CreateRow(isec,i); 
 
-       DigitizeRow(i,isec,row);
+      DigitizeRow(i,isec,row);
 
-       fDigitsArray->StoreRow(isec,i);
+      fDigitsArray->StoreRow(isec,i);
 
-       Int_t ndig = dig->GetDigitSize(); 
+      Int_t ndig = dig->GetDigitSize(); 
        
-       if (gDebug > 10) 
-       printf("*** Sector, row, compressed digits %d %d %d ***\n",isec,i,ndig);        
+      AliDebug(10,
+              Form("*** Sector, row, compressed digits %d %d %d ***\n",
+                   isec,i,ndig));        
        
-        fDigitsArray->ClearRow(isec,i);  
+      fDigitsArray->ClearRow(isec,i);  
 
    
-       } // end of the sector digitization
+    } // end of the sector digitization
 
-      for(i=0;i<nrows+2;i++){
-        row[i]->Delete();  
-        delete row[i];   
-      }
+    for(i=0;i<nrows+2;i++){
+      row[i]->Delete();  
+      delete row[i];   
+    }
       
-       delete [] row; // delete the array of pointers to TObjArray-s
+    delete [] row; // delete the array of pointers to TObjArray-s
         
-  } // ntracks >0
 
 } // end of Hits2DigitsSector
 
@@ -1694,9 +1584,13 @@ void AliTPC::DigitizeRow(Int_t irow,Int_t isec,TObjArray **rows)
   // Modified: Marian Ivanov GSI Darmstadt, m.ivanov@gsi.de
   //-----------------------------------------------------------------
  
-
   Float_t zerosup = fTPCParam->GetZeroSup();
-  //  Int_t nrows =fTPCParam->GetNRow(isec);
+  AliTPCCalPad * gainTPC = AliTPCcalibDB::Instance()->GetDedxGainFactor(); 
+  AliTPCCalPad * noiseTPC = AliTPCcalibDB::Instance()->GetPadNoise(); 
+  AliTPCCalROC * gainROC = gainTPC->GetCalROC(isec);  // pad gains per given sector
+  AliTPCCalROC * noiseROC = noiseTPC->GetCalROC(isec);  // noise per given sector
+
+
   fCurrentIndex[1]= isec;
   
 
@@ -1708,10 +1602,10 @@ void AliTPC::DigitizeRow(Int_t irow,Int_t isec,TObjArray **rows)
   //  and a single track signal
   //    
 
-  AliTPCFastMatrix *m1 = new AliTPCFastMatrix(0,nofPads,0,nofTbins); // integrated
-  AliTPCFastMatrix *m2 = new AliTPCFastMatrix(0,nofPads,0,nofTbins); // single
+  TMatrixF *m1 = new TMatrixF(0,nofPads,0,nofTbins); // integrated
+  TMatrixF *m2 = new TMatrixF(0,nofPads,0,nofTbins); // single
   //
-  AliTPCFastMatrix &total  = *m1;
+  TMatrixF &total  = *m1;
 
   //  Array of pointers to the label-signal list
 
@@ -1724,8 +1618,6 @@ void AliTPC::DigitizeRow(Int_t irow,Int_t isec,TObjArray **rows)
   //
   //calculate signal 
   //
-  //Int_t row1 = TMath::Max(irow-fTPCParam->GetNCrossRows(),0);
-  //Int_t row2 = TMath::Min(irow+fTPCParam->GetNCrossRows(),nrows-1);
   Int_t row1=irow;
   Int_t row2=irow+2; 
   for (Int_t row= row1;row<=row2;row++){
@@ -1748,24 +1640,26 @@ void AliTPC::DigitizeRow(Int_t irow,Int_t isec,TObjArray **rows)
   Int_t gi=-1;
   Float_t fzerosup = zerosup+0.5;
   for(Int_t it=0;it<nofTbins;it++){
-    Float_t *pq = &(total.UncheckedAt(0,it));
     for(Int_t ip=0;ip<nofPads;ip++){
       gi++;
-      Float_t q=*pq;      
-      pq++;
-      if(fDigitsSwitch == 0){
-       q+=GetNoise();
+      Float_t q=total(ip,it);      
+      if(fDigitsSwitch == 0){  
+       Float_t gain = gainROC->GetValue(irow,ip);  // get gain for given - pad-row pad 
+       Float_t noisePad = noiseROC->GetValue(irow,ip); 
+       //
+       q*=gain;
+       q+=GetNoise()*noisePad;
         if(q <=fzerosup) continue; // do not fill zeros
         q = TMath::Nint(q);
-        if(q > fTPCParam->GetADCSat()) q = fTPCParam->GetADCSat();  // saturation
+        if(q >= fTPCParam->GetADCSat()) q = fTPCParam->GetADCSat() - 1;  // saturation
 
       }
 
       else {
-       if(q <= 0.) continue; // do not fill zeros
-       if(q>2000.) q=2000.;
-       q *= 16.;
-       q = TMath::Nint(q);
+       if(q <= 0.) continue; // do not fill zeros
+       if(q>2000.) q=2000.;
+       q *= 16.;
+       q = TMath::Nint(q);
       }
 
       //
@@ -1783,17 +1677,22 @@ void AliTPC::DigitizeRow(Int_t irow,Int_t isec,TObjArray **rows)
 */
 //End_Html
       dig->SetDigitFast((Short_t)q,it,ip);
-      if (fDigitsArray->IsSimulated())
-       {
-        ((AliSimDigits*)dig)->SetTrackIDFast(tracks[0],it,ip,0);
-        ((AliSimDigits*)dig)->SetTrackIDFast(tracks[1],it,ip,1);
-        ((AliSimDigits*)dig)->SetTrackIDFast(tracks[2],it,ip,2);
-       }
-     
+      if (fDigitsArray->IsSimulated()) {
+       ((AliSimDigits*)dig)->SetTrackIDFast(tracks[0],it,ip,0);
+       ((AliSimDigits*)dig)->SetTrackIDFast(tracks[1],it,ip,1);
+       ((AliSimDigits*)dig)->SetTrackIDFast(tracks[2],it,ip,2);
+      }
     
     } // end of loop over time buckets
   }  // end of lop over pads 
+  //
+  // test
+  //
+  //
 
+  // glitch filters if normal simulated digits
+  //
+  if(!fDigitsSwitch) ((AliSimDigits*)dig)->GlitchFilter();
   //
   //  This row has been digitized, delete nonused stuff
   //
@@ -1806,14 +1705,13 @@ void AliTPC::DigitizeRow(Int_t irow,Int_t isec,TObjArray **rows)
 
   delete m1;
   delete m2;
-  //  delete m3;
 
 } // end of DigitizeRow
 
 //_____________________________________________________________________________
 
 Float_t AliTPC::GetSignal(TObjArray *p1, Int_t ntr, 
-             AliTPCFastMatrix *m1, AliTPCFastMatrix *m2,Int_t *indexRange)
+             TMatrixF *m1, TMatrixF *m2,Int_t *indexRange)
 {
 
   //---------------------------------------------------------------
@@ -1827,53 +1725,63 @@ Float_t AliTPC::GetSignal(TObjArray *p1, Int_t ntr,
   // Modified: Marian Ivanov 
   //-----------------------------------------------------------------
 
-  AliTPCFastVector *tv;
+  TVector *tv;
 
-  tv = (AliTPCFastVector*)p1->At(ntr); // pointer to a track
-  AliTPCFastVector &v = *tv;
+  tv = (TVector*)p1->At(ntr); // pointer to a track
+  TVector &v = *tv;
   
   Float_t label = v(0);
-  Int_t centralPad = (fTPCParam->GetNPads(fCurrentIndex[1],fCurrentIndex[3]-1)-1)/2;
+  Int_t centralPad = (fTPCParam->GetNPads(fCurrentIndex[1],fCurrentIndex[3]-1))/2;
 
-  Int_t nElectrons = (tv->GetNrows()-1)/4;
+  Int_t nElectrons = (tv->GetNrows()-1)/5;
   indexRange[0]=9999; // min pad
   indexRange[1]=-1; // max pad
   indexRange[2]=9999; //min time
   indexRange[3]=-1; // max time
 
-  AliTPCFastMatrix &signal = *m1;
-  AliTPCFastMatrix &total = *m2;
+  TMatrixF &signal = *m1;
+  TMatrixF &total = *m2;
+  //
+  // Get LHC clock phase
   //
+  TParameter<float> *ph;
+  if(fDigitsSwitch){// s-digits
+    ph = (TParameter<float>*)fLoader->TreeS()->GetUserInfo()->FindObject("lhcphase0");  
+  }
+  else{ // normal digits
+    ph = (TParameter<float>*)fLoader->TreeD()->GetUserInfo()->FindObject("lhcphase0");
+  } 
   //  Loop over all electrons
   //
   for(Int_t nel=0; nel<nElectrons; nel++){
-    Int_t idx=nel*4;
+    Int_t idx=nel*5;
     Float_t aval =  v(idx+4);
     Float_t eltoadcfac=aval*fTPCParam->GetTotalNormFac(); 
-    Float_t xyz[3]={v(idx+1),v(idx+2),v(idx+3)};
-    Int_t n = ((AliTPCParamSR*)fTPCParam)->CalcResponseFast(xyz,fCurrentIndex,fCurrentIndex[3]);
+    Float_t xyz[4]={v(idx+1),v(idx+2),v(idx+3),v(idx+5)};
+    Int_t n = ((AliTPCParamSR*)fTPCParam)->CalcResponseFast(xyz,fCurrentIndex,
+                                                           fCurrentIndex[3],ph->GetVal());
 
     Int_t *index = fTPCParam->GetResBin(0);  
     Float_t *weight = & (fTPCParam->GetResWeight(0));
 
     if (n>0) for (Int_t i =0; i<n; i++){       
-       Int_t pad=index[1]+centralPad;  //in digit coordinates central pad has coordinate 0
-
-         if (pad>=0){
-        Int_t time=index[2];    
-         Float_t qweight = *(weight)*eltoadcfac;
-        
-        if (m1!=0) signal.UncheckedAt(pad,time)+=qweight;
-         total.UncheckedAt(pad,time)+=qweight;
-        if (indexRange[0]>pad) indexRange[0]=pad;
-        if (indexRange[1]<pad) indexRange[1]=pad;
-        if (indexRange[2]>time) indexRange[2]=time;
-        if (indexRange[3]<time) indexRange[3]=time;
-
-        index+=3;
-        weight++;      
-
-       }        
+      Int_t pad=index[1]+centralPad;  //in digit coordinates central pad has coordinate 0
+
+      if (pad>=0){
+       Int_t time=index[2];     
+       Float_t qweight = *(weight)*eltoadcfac;
+       
+       if (m1!=0) signal(pad,time)+=qweight;
+       total(pad,time)+=qweight;
+       if (indexRange[0]>pad) indexRange[0]=pad;
+       if (indexRange[1]<pad) indexRange[1]=pad;
+       if (indexRange[2]>time) indexRange[2]=time;
+       if (indexRange[3]<time) indexRange[3]=time;
+       
+       index+=3;
+       weight++;       
+
+      }         
     }
   } // end of loop over electrons
   
@@ -1881,7 +1789,7 @@ Float_t AliTPC::GetSignal(TObjArray *p1, Int_t ntr,
 }
 
 //_____________________________________________________________________________
-void AliTPC::GetList(Float_t label,Int_t np,AliTPCFastMatrix *m,
+void AliTPC::GetList(Float_t label,Int_t np,TMatrixF *m,
                      Int_t *indexRange, Float_t **pList)
 {
   //----------------------------------------------------------------------
@@ -1892,7 +1800,7 @@ void AliTPC::GetList(Float_t label,Int_t np,AliTPCFastMatrix *m,
   // Origin: Marek Kowalski  IFJ, Krakow, Marek.Kowalski@ifj.edu.pl
   //-----------------------------------------------------------------
 
-  AliTPCFastMatrix &signal = *m;
+  TMatrixF &signal = *m;
 
   // lop over nonzero digits
 
@@ -1900,77 +1808,73 @@ void AliTPC::GetList(Float_t label,Int_t np,AliTPCFastMatrix *m,
     for(Int_t ip=indexRange[0];ip<indexRange[1]+1;ip++){
 
 
-        // accept only the contribution larger than 500 electrons (1/2 s_noise)
-
-        if(signal(ip,it)<0.5) continue; 
+      // accept only the contribution larger than 500 electrons (1/2 s_noise)
 
+      if(signal(ip,it)<0.5) continue; 
 
-        Int_t globalIndex = it*np+ip; // globalIndex starts from 0!
+      Int_t globalIndex = it*np+ip; // globalIndex starts from 0!
         
-        if(!pList[globalIndex]){
+      if(!pList[globalIndex]){
         
-          // 
-         // Create new list (6 elements - 3 signals and 3 labels),
-         //
-
-          pList[globalIndex] = new Float_t [6];
-
-         // set list to -1 
-
-          *pList[globalIndex] = -1.;
-          *(pList[globalIndex]+1) = -1.;
-          *(pList[globalIndex]+2) = -1.;
-          *(pList[globalIndex]+3) = -1.;
-          *(pList[globalIndex]+4) = -1.;
-          *(pList[globalIndex]+5) = -1.;
-
-
-          *pList[globalIndex] = label;
-          *(pList[globalIndex]+3) = signal(ip,it);
-        }
-        else{
-
-         // check the signal magnitude
-
-          Float_t highest = *(pList[globalIndex]+3);
-          Float_t middle = *(pList[globalIndex]+4);
-          Float_t lowest = *(pList[globalIndex]+5);
-
-         //
-         //  compare the new signal with already existing list
-         //
+       // 
+       // Create new list (6 elements - 3 signals and 3 labels),
+       //
 
-          if(signal(ip,it)<lowest) continue; // neglect this track
+       pList[globalIndex] = new Float_t [6];
 
-         //
+       // set list to -1 
+       
+       *pList[globalIndex] = -1.;
+       *(pList[globalIndex]+1) = -1.;
+       *(pList[globalIndex]+2) = -1.;
+       *(pList[globalIndex]+3) = -1.;
+       *(pList[globalIndex]+4) = -1.;
+       *(pList[globalIndex]+5) = -1.;
+
+       *pList[globalIndex] = label;
+       *(pList[globalIndex]+3) = signal(ip,it);
+      }
+      else {
 
-          if (signal(ip,it)>highest){
-            *(pList[globalIndex]+5) = middle;
-            *(pList[globalIndex]+4) = highest;
-            *(pList[globalIndex]+3) = signal(ip,it);
+       // check the signal magnitude
 
-            *(pList[globalIndex]+2) = *(pList[globalIndex]+1);
-            *(pList[globalIndex]+1) = *pList[globalIndex];
-            *pList[globalIndex] = label;
-         }
-          else if (signal(ip,it)>middle){
-            *(pList[globalIndex]+5) = middle;
-            *(pList[globalIndex]+4) = signal(ip,it);
+       Float_t highest = *(pList[globalIndex]+3);
+       Float_t middle = *(pList[globalIndex]+4);
+       Float_t lowest = *(pList[globalIndex]+5);
+       
+       //
+       //  compare the new signal with already existing list
+       //
+       
+       if(signal(ip,it)<lowest) continue; // neglect this track
 
-            *(pList[globalIndex]+2) = *(pList[globalIndex]+1);
-            *(pList[globalIndex]+1) = label;
-         }
-          else{
-            *(pList[globalIndex]+5) = signal(ip,it);
-            *(pList[globalIndex]+2) = label;
-         }
-        }
+       //
 
+       if (signal(ip,it)>highest){
+         *(pList[globalIndex]+5) = middle;
+         *(pList[globalIndex]+4) = highest;
+         *(pList[globalIndex]+3) = signal(ip,it);
+         
+         *(pList[globalIndex]+2) = *(pList[globalIndex]+1);
+         *(pList[globalIndex]+1) = *pList[globalIndex];
+         *pList[globalIndex] = label;
+       }
+       else if (signal(ip,it)>middle){
+         *(pList[globalIndex]+5) = middle;
+         *(pList[globalIndex]+4) = signal(ip,it);
+         
+         *(pList[globalIndex]+2) = *(pList[globalIndex]+1);
+         *(pList[globalIndex]+1) = label;
+       }
+       else{
+         *(pList[globalIndex]+5) = signal(ip,it);
+         *(pList[globalIndex]+2) = label;
+       }
+      }
+      
     } // end of loop over pads
   } // end of loop over time bins
 
-
-
 }//end of GetList
 //___________________________________________________________________
 void AliTPC::MakeSector(Int_t isec,Int_t nrows,TTree *TH,
@@ -1983,13 +1887,48 @@ void AliTPC::MakeSector(Int_t isec,Int_t nrows,TTree *TH,
   // contains the track label and the position of electrons.
   //-----------------------------------------------------------------
 
+  // 
+  // The trasport of the electrons through TPC drift volume
+  //    Drift (drift velocity + velocity map(not yet implemented)))
+  //    Application of the random processes (diffusion, gas gain)
+  //    Systematic effects (ExB effect in drift volume + ROCs)  
+  //
+  // Algorithm:
+  // Loop over primary electrons:
+  //    Creation of the secondary electrons
+  //    Loop over electrons (primary+ secondaries)
+  //        Global coordinate frame:
+  //          1. Skip electrons if attached  
+  //          2. ExB effect in drift volume
+  //             a.) Simulation   calib->GetExB()->CorrectInverse(dxyz0,dxyz1);
+  //             b.) Reconstruction -  calib->GetExB()->CorrectInverse(dxyz0,dxyz1);
+  //          3. Generation of gas gain (Random - Exponential distribution) 
+  //          4. TransportElectron function (diffusion)
+  //
+  //        5. Conversion to the local coordinate frame  pad-row, pad, timebin
+  //        6. Apply Time0 shift - AliTPCCalPad class 
+  //            a.) Plus sign in simulation
+  //            b.) Minus sign in reconstruction 
+  // end of loop          
+  //
   //-----------------------------------------------------------------
   // Origin: Marek Kowalski  IFJ, Krakow, Marek.Kowalski@ifj.edu.pl
+  // Origin: Marian Ivanov,  marian.ivanov@cern.ch
   //-----------------------------------------------------------------
+  AliTPCcalibDB* const calib=AliTPCcalibDB::Instance();
+  if (gAlice){ // Set correctly the magnetic field in the ExB calculation
+    if (!calib->GetExB()){
+      AliMagF * field = ((AliMagF*)TGeoGlobalMagField::Instance()->GetField()); 
+      if (field) {
+       calib->SetExBField(field);
+      }
+    }
+  }
 
   Float_t gasgain = fTPCParam->GetGasGain();
+  gasgain = gasgain/fGainFactor;
   Int_t i;
-  Float_t xyz[4]; 
+  Float_t xyz[5]; 
 
   AliTPChit *tpcHit; // pointer to a sigle TPC hit    
   //MI change
@@ -2000,12 +1939,12 @@ void AliTPC::MakeSector(Int_t isec,Int_t nrows,TTree *TH,
  
   //----------------------------------------------
   // Create TObjArray-s, one for each row,
-  // each TObjArray will store the AliTPCFastVectors
-  // of electrons, one AliTPCFastVectors per each track.
+  // each TObjArray will store the TVectors
+  // of electrons, one TVectors per each track.
   //---------------------------------------------- 
     
   Int_t *nofElectrons = new Int_t [nrows+2]; // electron counter for each row
-  AliTPCFastVector **tracks = new AliTPCFastVector* [nrows+2]; //pointers to the track vectors
+  TVector **tracks = new TVector* [nrows+2]; //pointers to the track vectors
 
   for(i=0; i<nrows+2; i++){
     row[i] = new TObjArray;
@@ -2018,7 +1957,7 @@ void AliTPC::MakeSector(Int_t isec,Int_t nrows,TTree *TH,
   //--------------------------------------------------------------------
   //  Loop over tracks, the "track" contains the full history
   //--------------------------------------------------------------------
-
+  
   Int_t previousTrack,currentTrack;
   previousTrack = -1; // nothing to store so far!
 
@@ -2029,7 +1968,7 @@ void AliTPC::MakeSector(Int_t isec,Int_t nrows,TTree *TH,
     if (!isInSector) continue;
     //MI change
     branch->GetEntry(track); // get next track
-
+    
     //M.I. changes
 
     tpcHit = (AliTPChit*)FirstHit(-1);
@@ -2047,133 +1986,193 @@ void AliTPC::MakeSector(Int_t isec,Int_t nrows,TTree *TH,
        continue; 
       }
 
-       currentTrack = tpcHit->Track(); // track number
+      // Remove hits which arrive before the TPC opening gate signal
+      if(((fTPCParam->GetZLength(isec)-TMath::Abs(tpcHit->Z()))
+         /fTPCParam->GetDriftV()+tpcHit->Time())<fTPCParam->GetGateDelay()) {
+       tpcHit = (AliTPChit*) NextHit();
+       continue;
+      }
 
+      currentTrack = tpcHit->Track(); // track number
 
-        if(currentTrack != previousTrack){
+      if(currentTrack != previousTrack){
                           
-           // store already filled fTrack
+       // store already filled fTrack
               
-          for(i=0;i<nrows+2;i++){
-             if(previousTrack != -1){
-              if(nofElectrons[i]>0){
-                 AliTPCFastVector &v = *tracks[i];
-                v(0) = previousTrack;
-                 tracks[i]->ResizeTo(4*nofElectrons[i]+1); // shrink if necessary
-                row[i]->Add(tracks[i]);                     
-              }
-               else{
-                 delete tracks[i]; // delete empty AliTPCFastVector
-                 tracks[i]=0;
-              }
-            }
-
-             nofElectrons[i]=0;
-             tracks[i] = new AliTPCFastVector(481); // AliTPCFastVectors for the next fTrack
-
-          } // end of loop over rows
+       for(i=0;i<nrows+2;i++){
+         if(previousTrack != -1){
+           if(nofElectrons[i]>0){
+             TVector &v = *tracks[i];
+             v(0) = previousTrack;
+             tracks[i]->ResizeTo(5*nofElectrons[i]+1); // shrink if necessary
+             row[i]->Add(tracks[i]);                     
+           }
+           else {
+             delete tracks[i]; // delete empty TVector
+             tracks[i]=0;
+           }
+         }
+
+         nofElectrons[i]=0;
+         tracks[i] = new TVector(601); // TVectors for the next fTrack
+
+       } // end of loop over rows
               
-           previousTrack=currentTrack; // update track label 
-       }
+       previousTrack=currentTrack; // update track label 
+      }
           
-       Int_t qI = (Int_t) (tpcHit->fQ); // energy loss (number of electrons)
+      Int_t qI = (Int_t) (tpcHit->fQ); // energy loss (number of electrons)
 
-       //---------------------------------------------------
-       //  Calculate the electron attachment probability
-       //---------------------------------------------------
+      //---------------------------------------------------
+      //  Calculate the electron attachment probability
+      //---------------------------------------------------
 
 
-        Float_t time = 1.e6*(fTPCParam->GetZLength()-TMath::Abs(tpcHit->Z()))
-                                                        /fTPCParam->GetDriftV(); 
-       // in microseconds!     
-       Float_t attProb = fTPCParam->GetAttCoef()*
-         fTPCParam->GetOxyCont()*time; //  fraction! 
+      Float_t time = 1.e6*(fTPCParam->GetZLength(isec)-TMath::Abs(tpcHit->Z()))
+       /fTPCParam->GetDriftV(); 
+      // in microseconds!      
+      Float_t attProb = fTPCParam->GetAttCoef()*
+       fTPCParam->GetOxyCont()*time; //  fraction! 
    
-       //-----------------------------------------------
-       //  Loop over electrons
-       //-----------------------------------------------
-       Int_t index[3];
-       index[1]=isec;
-        for(Int_t nel=0;nel<qI;nel++){
-          // skip if electron lost due to the attachment
-          if((gRandom->Rndm(0)) < attProb) continue; // electron lost!
-         xyz[0]=tpcHit->X();
-         xyz[1]=tpcHit->Y();
-         xyz[2]=tpcHit->Z();   
-         //
-         // protection for the nonphysical avalanche size (10**6 maximum)
-         //  
-          Double_t rn=TMath::Max(gRandom->Rndm(0),1.93e-22);
-         xyz[3]= (Float_t) (-gasgain*TMath::Log(rn)); 
-         index[0]=1;
+      //-----------------------------------------------
+      //  Loop over electrons
+      //-----------------------------------------------
+      Int_t index[3];
+      index[1]=isec;
+      for(Int_t nel=0;nel<qI;nel++){
+       // skip if electron lost due to the attachment
+       if((gRandom->Rndm(0)) < attProb) continue; // electron lost!
+       
+       //
+       // ExB effect
+       //
+       Double_t dxyz0[3],dxyz1[3];
+       dxyz0[0]=tpcHit->X();
+       dxyz0[1]=tpcHit->Y();
+       dxyz0[2]=tpcHit->Z();   
+       if (calib->GetExB()){
+         calib->GetExB()->CorrectInverse(dxyz0,dxyz1);
+       }else{
+         AliError("Not valid ExB calibration");
+         dxyz1[0]=tpcHit->X();
+         dxyz1[1]=tpcHit->Y();
+         dxyz1[2]=tpcHit->Z();         
+       }
+       xyz[0]=dxyz1[0];
+       xyz[1]=dxyz1[1];
+       xyz[2]=dxyz1[2];        
+       //
+       //
+       //
+       // protection for the nonphysical avalanche size (10**6 maximum)
+       //  
+       Double_t rn=TMath::Max(gRandom->Rndm(0),1.93e-22);
+       xyz[3]= (Float_t) (-gasgain*TMath::Log(rn)); 
+       index[0]=1;
          
-         TransportElectron(xyz,index);    
-         Int_t rowNumber;
-         fTPCParam->GetPadRow(xyz,index); 
-         // row 0 - cross talk from the innermost row
-         // row fNRow+1 cross talk from the outermost row
-         rowNumber = index[2]+1; 
-         //transform position to local digit coordinates
-         //relative to nearest pad row 
-         if ((rowNumber<0)||rowNumber>fTPCParam->GetNRow(isec)+1) continue;
-          Float_t x1,y1;
-         if (isec <fTPCParam->GetNInnerSector()) {
-           x1 = xyz[1]*fTPCParam->GetInnerPadPitchWidth();
-           y1 = fTPCParam->GetYInner(rowNumber);
-         }
-         else{
-           x1=xyz[1]*fTPCParam->GetOuterPadPitchWidth();
-           y1 = fTPCParam->GetYOuter(rowNumber);
+       TransportElectron(xyz,index);    
+       Int_t rowNumber;
+       Int_t padrow = fTPCParam->GetPadRow(xyz,index); 
+       //
+       // Add Time0 correction due unisochronity
+       // xyz[0] - pad row coordinate 
+       // xyz[1] - pad coordinate
+       // xyz[2] - is in now time bin coordinate system
+       Float_t correction =0;
+       if (calib->GetPadTime0()){
+         if (!calib->GetPadTime0()->GetCalROC(isec)) continue;   
+         Int_t npads = fTPCParam->GetNPads(isec,padrow);
+         //      Int_t pad  = TMath::Nint(xyz[1]+fTPCParam->GetNPads(isec,TMath::Nint(xyz[0]))*0.5);
+         // pad numbering from -npads/2 .. npads/2-1
+         Int_t pad  = TMath::Nint(xyz[1]+npads/2);
+         if (pad<0) pad=0;
+         if (pad>=npads) pad=npads-1;
+         correction = calib->GetPadTime0()->GetCalROC(isec)->GetValue(padrow,pad);
+         //      printf("%d\t%d\t%d\t%f\n",isec,padrow,pad,correction);
+         if (fDebugStreamer){
+           (*fDebugStreamer)<<"Time0"<<
+             "isec="<<isec<<
+             "padrow="<<padrow<<
+             "pad="<<pad<<
+             "x0="<<xyz[0]<<
+             "x1="<<xyz[1]<<
+             "x2="<<xyz[2]<<
+             "hit.="<<tpcHit<<
+             "cor="<<correction<<
+             "\n";
          }
-         // gain inefficiency at the wires edges - linear
-         x1=TMath::Abs(x1);
-         y1-=1.;
-          if(x1>y1) xyz[3]*=TMath::Max(1.e-6,(y1-x1+1.));      
-       
-         nofElectrons[rowNumber]++;      
-         //----------------------------------
-         // Expand vector if necessary
-         //----------------------------------
-         if(nofElectrons[rowNumber]>120){
-           Int_t range = tracks[rowNumber]->GetNrows();
-           if((nofElectrons[rowNumber])>(range-1)/4){
-        
-             tracks[rowNumber]->ResizeTo(range+400); // Add 100 electrons
-           }
+       }
+       xyz[2]+=correction;
+       xyz[2]+=fTPCParam->GetNTBinsL1();    // adding Level 1 time bin offset
+       //
+       // Electron track time (for pileup simulation)
+       xyz[2]+=tpcHit->Time()/fTPCParam->GetTSample(); // adding time of flight
+       xyz[4] =0;
+
+       //
+       // row 0 - cross talk from the innermost row
+       // row fNRow+1 cross talk from the outermost row
+       rowNumber = index[2]+1; 
+       //transform position to local digit coordinates
+       //relative to nearest pad row 
+       if ((rowNumber<0)||rowNumber>fTPCParam->GetNRow(isec)+1) continue;
+       /*      Float_t x1,y1;
+       if (isec <fTPCParam->GetNInnerSector()) {
+         x1 = xyz[1]*fTPCParam->GetInnerPadPitchWidth();
+         y1 = fTPCParam->GetYInner(rowNumber);
+       }
+       else{
+         x1=xyz[1]*fTPCParam->GetOuterPadPitchWidth();
+         y1 = fTPCParam->GetYOuter(rowNumber);
+       }
+       // gain inefficiency at the wires edges - linear
+       x1=TMath::Abs(x1);
+       y1-=1.;
+       if(x1>y1) xyz[3]*=TMath::Max(1.e-6,(y1-x1+1.)); */
+       
+       nofElectrons[rowNumber]++;        
+       //----------------------------------
+       // Expand vector if necessary
+       //----------------------------------
+       if(nofElectrons[rowNumber]>120){
+         Int_t range = tracks[rowNumber]->GetNrows();
+         if((nofElectrons[rowNumber])>(range-1)/5){
+           
+           tracks[rowNumber]->ResizeTo(range+500); // Add 100 electrons
          }
-         
-          AliTPCFastVector &v = *tracks[rowNumber];
-         Int_t idx = 4*nofElectrons[rowNumber]-3;
-         Real_t * position = &(((AliTPCFastVector&)v).UncheckedAt(idx)); //make code faster
-         memcpy(position,xyz,4*sizeof(Float_t));
-       } // end of loop over electrons
+       }
+       
+       TVector &v = *tracks[rowNumber];
+       Int_t idx = 5*nofElectrons[rowNumber]-4;
+       Real_t * position = &(((TVector&)v)(idx)); //make code faster
+       memcpy(position,xyz,5*sizeof(Float_t));
+       
+      } // end of loop over electrons
 
-        tpcHit = (AliTPChit*)NextHit();
-        
-      } // end of loop over hits
-    } // end of loop over tracks
+      tpcHit = (AliTPChit*)NextHit();
+      
+    } // end of loop over hits
+  } // end of loop over tracks
 
     //
     //   store remaining track (the last one) if not empty
     //
-
-     for(i=0;i<nrows+2;i++){
-       if(nofElectrons[i]>0){
-          AliTPCFastVector &v = *tracks[i];
-         v(0) = previousTrack;
-          tracks[i]->ResizeTo(4*nofElectrons[i]+1); // shrink if necessary
-         row[i]->Add(tracks[i]);  
-       }
-       else{
-          delete tracks[i];
-          tracks[i]=0;
-       }  
-      }  
-
-          delete [] tracks;
-          delete [] nofElectrons;
+  
+  for(i=0;i<nrows+2;i++){
+    if(nofElectrons[i]>0){
+      TVector &v = *tracks[i];
+      v(0) = previousTrack;
+      tracks[i]->ResizeTo(5*nofElectrons[i]+1); // shrink if necessary
+      row[i]->Add(tracks[i]);  
+    }
+    else{
+      delete tracks[i];
+      tracks[i]=0;
+    }  
+  }  
+  
+  delete [] tracks;
+  delete [] nofElectrons;
 
 } // end of MakeSector
 
@@ -2184,47 +2183,9 @@ void AliTPC::Init()
   //
   // Initialise TPC detector after definition of geometry
   //
-  Int_t i;
-  //
-  if(fDebug) {
-    printf("\n%s: ",ClassName());
-    for(i=0;i<35;i++) printf("*");
-    printf(" TPC_INIT ");
-    for(i=0;i<35;i++) printf("*");
-    printf("\n%s: ",ClassName());
-    //
-    for(i=0;i<80;i++) printf("*");
-    printf("\n");
-  }
+  AliDebug(1,"*********************************************");
 }
 
-//_____________________________________________________________________________
-void AliTPC::MakeBranch(Option_t* option)
-{
-  //
-  // Create Tree branches for the TPC.
-  //
-  if(GetDebug()) Info("MakeBranch","");
-  Int_t buffersize = 4000;
-  char branchname[10];
-  sprintf(branchname,"%s",GetName());
-  
-  const char *h = strstr(option,"H");
-
-  if ( h && (fHitType<=1) && (fHits == 0x0)) fHits = new TClonesArray("AliTPChit", 176);//skowron 20.06.03
-  
-  AliDetector::MakeBranch(option);
-
-  const char *d = strstr(option,"D");
-  if (fDigits   && fLoader->TreeD() && d) 
-   {
-      MakeBranchInTree(gAlice->TreeD(), branchname, &fDigits, buffersize, 0);
-   }   
-
-  if (fHitType>1) MakeBranch2(option,0); // MI change 14.09.2000
-}
 //_____________________________________________________________________________
 void AliTPC::ResetDigits()
 {
@@ -2235,77 +2196,7 @@ void AliTPC::ResetDigits()
   if (fDigits)   fDigits->Clear();
 }
 
-//_____________________________________________________________________________
-void AliTPC::SetSecAL(Int_t sec)
-{
-  //---------------------------------------------------
-  // Activate/deactivate selection for lower sectors
-  //---------------------------------------------------
-
-  //-----------------------------------------------------------------
-  // Origin: Marek Kowalski  IFJ, Krakow, Marek.Kowalski@ifj.edu.pl
-  //-----------------------------------------------------------------
-  fSecAL = sec;
-}
-
-//_____________________________________________________________________________
-void AliTPC::SetSecAU(Int_t sec)
-{
-  //----------------------------------------------------
-  // Activate/deactivate selection for upper sectors
-  //---------------------------------------------------
-
-  //-----------------------------------------------------------------
-  // Origin: Marek Kowalski  IFJ, Krakow, Marek.Kowalski@ifj.edu.pl
-  //-----------------------------------------------------------------
-  fSecAU = sec;
-}
-
-//_____________________________________________________________________________
-void AliTPC::SetSecLows(Int_t s1,Int_t s2,Int_t s3,Int_t s4,Int_t s5, Int_t s6)
-{
-  //----------------------------------------
-  // Select active lower sectors
-  //----------------------------------------
-
-  //-----------------------------------------------------------------
-  // Origin: Marek Kowalski  IFJ, Krakow, Marek.Kowalski@ifj.edu.pl
-  //-----------------------------------------------------------------
-
-  fSecLows[0] = s1;
-  fSecLows[1] = s2;
-  fSecLows[2] = s3;
-  fSecLows[3] = s4;
-  fSecLows[4] = s5;
-  fSecLows[5] = s6;
-}
-
-//_____________________________________________________________________________
-void AliTPC::SetSecUps(Int_t s1,Int_t s2,Int_t s3,Int_t s4,Int_t s5, Int_t s6,
-                       Int_t s7, Int_t s8 ,Int_t s9 ,Int_t s10, 
-                       Int_t s11 , Int_t s12)
-{
-  //--------------------------------
-  // Select active upper sectors
-  //--------------------------------
-
-  //-----------------------------------------------------------------
-  // Origin: Marek Kowalski  IFJ, Krakow, Marek.Kowalski@ifj.edu.pl
-  //-----------------------------------------------------------------
 
-  fSecUps[0] = s1;
-  fSecUps[1] = s2;
-  fSecUps[2] = s3;
-  fSecUps[3] = s4;
-  fSecUps[4] = s5;
-  fSecUps[5] = s6;
-  fSecUps[6] = s7;
-  fSecUps[7] = s8;
-  fSecUps[8] = s9;
-  fSecUps[9] = s10;
-  fSecUps[10] = s11;
-  fSecUps[11] = s12;
-}
 
 //_____________________________________________________________________________
 void AliTPC::SetSens(Int_t sens)
@@ -2330,25 +2221,6 @@ void AliTPC::SetSide(Float_t side=0.)
 
   fSide = side;
  
-}
-//____________________________________________________________________________
-void AliTPC::SetGasMixt(Int_t nc,Int_t c1,Int_t c2,Int_t c3,Float_t p1,
-                           Float_t p2,Float_t p3)
-{
-
-  // gax mixture definition
-
- fNoComp = nc;
- fMixtComp[0]=c1;
- fMixtComp[1]=c2;
- fMixtComp[2]=c3;
-
- fMixtProp[0]=p1;
- fMixtProp[1]=p2;
- fMixtProp[2]=p3; 
 }
 //_____________________________________________________________________________
 
@@ -2363,7 +2235,7 @@ void AliTPC::TransportElectron(Float_t *xyz, Int_t *index)
   // xyz and index must be already transformed to system 1
   //
 
-  fTPCParam->Transform1to2(xyz,index);
+  fTPCParam->Transform1to2(xyz,index);  // mis-alignment applied in this step
   
   //add diffusion
   Float_t driftl=xyz[2];
@@ -2381,31 +2253,32 @@ void AliTPC::TransportElectron(Float_t *xyz, Int_t *index)
     Float_t dx = fTPCParam->Transform2to2NearestWire(xyz,index);
     xyz[1]+=dx*(fTPCParam->GetOmegaTau());
   }
-  //add nonisochronity (not implemented yet)  
+  //add nonisochronity (not implemented yet) 
+  
 }
   
-ClassImp(AliTPCdigit)
-//_____________________________________________________________________________
-AliTPCdigit::AliTPCdigit(Int_t *tracks, Int_t *digits):
-  AliDigit(tracks)
+ClassImp(AliTPChit)
+  //______________________________________________________________________
+  AliTPChit::AliTPChit()
+            :AliHit(),
+            fSector(0),
+            fPadRow(0),
+            fQ(0),
+            fTime(0)
 {
   //
-  // Creates a TPC digit object
+  // default
   //
-  fSector     = digits[0];
-  fPadRow     = digits[1];
-  fPad        = digits[2];
-  fTime       = digits[3];
-  fSignal     = digits[4];
-}
 
-ClassImp(AliTPChit)
+}
 //_____________________________________________________________________________
-AliTPChit::AliTPChit(Int_t shunt, Int_t track, Int_t *vol, Float_t *hits):
-AliHit(shunt,track)
+AliTPChit::AliTPChit(Int_t shunt, Int_t track, Int_t *vol, Float_t *hits)
+          :AliHit(shunt,track),
+            fSector(0),
+            fPadRow(0),
+            fQ(0),
+            fTime(0)
 {
   //
   // Creates a TPC hit object
@@ -2416,18 +2289,19 @@ AliHit(shunt,track)
   fY          = hits[1];
   fZ          = hits[2];
   fQ          = hits[3];
+  fTime       = hits[4];
 }
  
 //________________________________________________________________________
 // Additional code because of the AliTPCTrackHitsV2
 
-void AliTPC::MakeBranch2(Option_t *option,const char */*file*/)
+void AliTPC::MakeBranch(Option_t *option)
 {
   //
   // Create a new branch in the current Root Tree
   // The branch of fHits is automatically split
   // MI change 14.09.2000
-  if(GetDebug()) Info("MakeBranch2","");
+  AliDebug(1,"");
   if (fHitType<2) return;
   char branchname[10];
   sprintf(branchname,"%s2",GetName());  
@@ -2435,29 +2309,26 @@ void AliTPC::MakeBranch2(Option_t *option,const char */*file*/)
   // Get the pointer to the header
   const char *cH = strstr(option,"H");
   //
-  if (fTrackHits   && TreeH() && cH && fHitType&4) 
-   {
-    if(GetDebug()) Info("MakeBranch2","Making branch for Type 4 Hits");
-    TreeH()->Branch(branchname,"AliTPCTrackHitsV2",&fTrackHits,fBufferSize,99);
-   }   
-
-  if (fTrackHitsOld   && TreeH() && cH && fHitType&2) 
-   {    
-    if(GetDebug()) Info("MakeBranch2","Making branch for Type 2 Hits");
-    AliObjectBranch * branch = new AliObjectBranch(branchname,"AliTPCTrackHits",&fTrackHitsOld, 
-                                                   TreeH(),fBufferSize,99);
-    TreeH()->GetListOfBranches()->Add(branch);
-   }   
+  if (fTrackHits   && fLoader->TreeH() && cH && fHitType&4) {
+    AliDebug(1,"Making branch for Type 4 Hits");
+    fLoader->TreeH()->Branch(branchname,"AliTPCTrackHitsV2",&fTrackHits,fBufferSize,99);
+  }
+
+//   if (fTrackHitsOld   && fLoader->TreeH() && cH && fHitType&2) {    
+//     AliDebug(1,"Making branch for Type 2 Hits");
+//     AliObjectBranch * branch = new AliObjectBranch(branchname,"AliTPCTrackHits",&fTrackHitsOld, 
+//                                                    fLoader->TreeH(),fBufferSize,99);
+//     fLoader->TreeH()->GetListOfBranches()->Add(branch);
+//   } 
 }
 
 void AliTPC::SetTreeAddress()
 {
-//Sets tree address for hits  
-  if (fHitType<=1)
-   {
-     if (fHits == 0x0 ) fHits = new TClonesArray("AliTPChit", 176);//skowron 20.06.03
-     AliDetector::SetTreeAddress();
-   }
+  //Sets tree address for hits  
+  if (fHitType<=1) {
+    if (fHits == 0x0 ) fHits = new TClonesArray("AliTPChit", 176);//skowron 20.06.03
+    AliDetector::SetTreeAddress();
+  }
   if (fHitType>1) SetTreeAddress2();
 }
 
@@ -2466,56 +2337,47 @@ void AliTPC::SetTreeAddress2()
   //
   // Set branch address for the TrackHits Tree
   // 
-  if(GetDebug()) Info("SetTreeAddress2","");
+  AliDebug(1,"");
   
   TBranch *branch;
   char branchname[20];
   sprintf(branchname,"%s2",GetName());
   //
   // Branch address for hit tree
-  TTree *treeH = TreeH();
+  TTree *treeH = fLoader->TreeH();
   if ((treeH)&&(fHitType&4)) {
     branch = treeH->GetBranch(branchname);
-    if (branch) 
-     {
-       branch->SetAddress(&fTrackHits);
-       if (GetDebug()) Info("SetTreeAddress2","fHitType&4 Setting");
-     }
+    if (branch) {
+      branch->SetAddress(&fTrackHits);
+      AliDebug(1,"fHitType&4 Setting");
+    }
     else 
-    if (GetDebug()) Info("SetTreeAddress2","fHitType&4 Failed (can not find branch)");
+      AliDebug(1,"fHitType&4 Failed (can not find branch)");
     
   }
-  if ((treeH)&&(fHitType&2)) {
-    branch = treeH->GetBranch(branchname);
-    if (branch) 
-     {
-       branch->SetAddress(&fTrackHitsOld);
-       if (GetDebug()) Info("SetTreeAddress2","fHitType&2 Setting");
-     }
-    else if (GetDebug()) 
-      Info("SetTreeAddress2","fHitType&2 Failed (can not find branch)");
-  }
-  //set address to TREETR
-
-  TTree *treeTR = TreeTR();
-  if (treeTR && fTrackReferences) {
-    branch = treeTR->GetBranch(GetName());
-    if (branch) branch->SetAddress(&fTrackReferences);
-  }
-
+ //  if ((treeH)&&(fHitType&2)) {
+//     branch = treeH->GetBranch(branchname);
+//     if (branch) {
+//       branch->SetAddress(&fTrackHitsOld);
+//       AliDebug(1,"fHitType&2 Setting");
+//     }
+//     else
+//       AliDebug(1,"fHitType&2 Failed (can not find branch)");
+//   }
 }
 
 void AliTPC::FinishPrimary()
 {
   if (fTrackHits &&fHitType&4)      fTrackHits->FlushHitStack();  
-  if (fTrackHitsOld && fHitType&2)  fTrackHitsOld->FlushHitStack();  
+  //  if (fTrackHitsOld && fHitType&2)  fTrackHitsOld->FlushHitStack();  
 }
 
 
 void AliTPC::AddHit2(Int_t track, Int_t *vol, Float_t *hits)
 { 
   //
-  // add hit to the list  
+  // add hit to the list
+
   Int_t rtrack;
   if (fIshunt) {
     int primary = gAlice->GetMCApp()->GetPrimary(track);
@@ -2525,15 +2387,12 @@ void AliTPC::AddHit2(Int_t track, Int_t *vol, Float_t *hits)
     rtrack=track;
     gAlice->GetMCApp()->FlagTrack(track);
   }  
-  //AliTPChit *hit = (AliTPChit*)fHits->UncheckedAt(fNhits-1);
-  //if (hit->fTrack!=rtrack)
-  //  cout<<"bad track number\n";
   if (fTrackHits && fHitType&4) 
     fTrackHits->AddHitKartez(vol[0],rtrack, hits[0],
-                             hits[1],hits[2],(Int_t)hits[3]);
-  if (fTrackHitsOld &&fHitType&2 ) 
-    fTrackHitsOld->AddHitKartez(vol[0],rtrack, hits[0],
-                                hits[1],hits[2],(Int_t)hits[3]);
+                             hits[1],hits[2],(Int_t)hits[3],hits[4]);
//  if (fTrackHitsOld &&fHitType&2 ) 
+//     fTrackHitsOld->AddHitKartez(vol[0],rtrack, hits[0],
+//                                 hits[1],hits[2],(Int_t)hits[3]);
   
 }
 
@@ -2548,7 +2407,7 @@ void AliTPC::ResetHits2()
   //
   //reset hits
   if (fTrackHits && fHitType&4) fTrackHits->Clear();
-  if (fTrackHitsOld && fHitType&2) fTrackHitsOld->Clear();
+  // if (fTrackHitsOld && fHitType&2) fTrackHitsOld->Clear();
 
 }   
 
@@ -2559,6 +2418,9 @@ AliHit* AliTPC::FirstHit(Int_t track)
 }
 AliHit* AliTPC::NextHit()
 {
+  //
+  // gets next hit
+  //
   if (fHitType>1) return NextHit2();
   
   return AliDetector::NextHit();
@@ -2574,18 +2436,18 @@ AliHit* AliTPC::FirstHit2(Int_t track)
   // track is returned
   // 
   if(track>=0) {
-    gAlice->ResetHits();
-    TreeH()->GetEvent(track);
+    gAlice->GetMCApp()->ResetHits();
+    fLoader->TreeH()->GetEvent(track);
   }
   //
   if (fTrackHits && fHitType&4) {
     fTrackHits->First();
     return fTrackHits->GetHit();
   }
-  if (fTrackHitsOld && fHitType&2) {
-    fTrackHitsOld->First();
-    return fTrackHitsOld->GetHit();
-  }
//  if (fTrackHitsOld && fHitType&2) {
+//     fTrackHitsOld->First();
+//     return fTrackHitsOld->GetHit();
+//   }
 
   else return 0;
 }
@@ -2596,10 +2458,10 @@ AliHit* AliTPC::NextHit2()
   //Return the next hit for the current track
 
 
-  if (fTrackHitsOld && fHitType&2) {
-    fTrackHitsOld->Next();
-    return fTrackHitsOld->GetHit();
-  }
+//   if (fTrackHitsOld && fHitType&2) {
+//     fTrackHitsOld->Next();
+//     return fTrackHitsOld->GetHit();
+//   }
   if (fTrackHits) {
     fTrackHits->Next();
     return fTrackHits->GetHit();
@@ -2608,37 +2470,26 @@ AliHit* AliTPC::NextHit2()
     return 0;
 }
 
-void AliTPC::LoadPoints(Int_t)
-{
-  //
-  Int_t a = 0;
-  /*  if(fHitType==1) return AliDetector::LoadPoints(a);
-  LoadPoints2(a);
-  */
-  if(fHitType==1) AliDetector::LoadPoints(a);
-  else LoadPoints2(a);
-   
-  // LoadPoints3(a);
-
-}
-
-
 void AliTPC::RemapTrackHitIDs(Int_t *map)
 {
+  //
+  // remapping
+  //
   if (!fTrackHits) return;
   
-  if (fTrackHitsOld && fHitType&2){
-    AliObjectArray * arr = fTrackHitsOld->fTrackHitsInfo;
-    for (UInt_t i=0;i<arr->GetSize();i++){
-      AliTrackHitsInfo * info = (AliTrackHitsInfo *)(arr->At(i));
-      info->fTrackID = map[info->fTrackID];
-    }
-  }
-  if (fTrackHitsOld && fHitType&4){
+//   if (fTrackHitsOld && fHitType&2){
+//     AliObjectArray * arr = fTrackHitsOld->fTrackHitsInfo;
+//     for (UInt_t i=0;i<arr->GetSize();i++){
+//       AliTrackHitsInfo * info = (AliTrackHitsInfo *)(arr->At(i));
+//       info->fTrackID = map[info->fTrackID];
+//     }
+//   }
+//  if (fTrackHitsOld && fHitType&4){
+  if (fTrackHits && fHitType&4){
     TClonesArray * arr = fTrackHits->GetArray();;
     for (Int_t i=0;i<arr->GetEntriesFast();i++){
       AliTrackHitsParamV2 * info = (AliTrackHitsParamV2 *)(arr->At(i));
-      info->fTrackID = map[info->fTrackID];
+      info->SetTrackID(map[info->GetTrackID()]);
     }
   }
 }
@@ -2650,24 +2501,24 @@ Bool_t   AliTPC::TrackInVolume(Int_t id,Int_t track)
   //return true if current track is in volume
   //
   //  return kTRUE;
-  if (fTrackHitsOld && fHitType&2) {
-    TBranch * br = TreeH()->GetBranch("fTrackHitsInfo");
-    br->GetEvent(track);
-    AliObjectArray * ar = fTrackHitsOld->fTrackHitsInfo;
-    for (UInt_t j=0;j<ar->GetSize();j++){
-      if (  ((AliTrackHitsInfo*)ar->At(j))->fVolumeID==id) return kTRUE;
-    } 
-  }
//  if (fTrackHitsOld && fHitType&2) {
+//     TBranch * br = fLoader->TreeH()->GetBranch("fTrackHitsInfo");
+//     br->GetEvent(track);
+//     AliObjectArray * ar = fTrackHitsOld->fTrackHitsInfo;
+//     for (UInt_t j=0;j<ar->GetSize();j++){
+//       if (  ((AliTrackHitsInfo*)ar->At(j))->fVolumeID==id) return kTRUE;
+//     } 
+//   }
 
   if (fTrackHits && fHitType&4) {
-    TBranch * br1 = TreeH()->GetBranch("fVolumes");
-    TBranch * br2 = TreeH()->GetBranch("fNVolumes");    
+    TBranch * br1 = fLoader->TreeH()->GetBranch("fVolumes");
+    TBranch * br2 = fLoader->TreeH()->GetBranch("fNVolumes");    
     br2->GetEvent(track);
     br1->GetEvent(track);    
     Int_t *volumes = fTrackHits->GetVolumes();
     Int_t nvolumes = fTrackHits->GetNVolumes();
     if (!volumes && nvolumes>0) {
-      printf("Problematic track\t%d\t%d",track,nvolumes);
+      AliWarning(Form("Problematic track\t%d\t%d",track,nvolumes));
       return kFALSE;
     }
     for (Int_t j=0;j<nvolumes; j++)
@@ -2675,7 +2526,7 @@ Bool_t   AliTPC::TrackInVolume(Int_t id,Int_t track)
   }
 
   if (fHitType&1) {
-    TBranch * br = TreeH()->GetBranch("fSector");
+    TBranch * br = fLoader->TreeH()->GetBranch("fSector");
     br->GetEvent(track);
     for (Int_t j=0;j<fHits->GetEntriesFast();j++){
       if (  ((AliTPChit*)fHits->At(j))->fSector==id) return kTRUE;
@@ -2685,348 +2536,12 @@ Bool_t   AliTPC::TrackInVolume(Int_t id,Int_t track)
 
 }
 
-//_____________________________________________________________________________
-void AliTPC::LoadPoints2(Int_t)
-{
-  //
-  // Store x, y, z of all hits in memory
-  //
-  if (fTrackHits == 0 && fTrackHitsOld==0) return;
-  //
-  Int_t nhits =0;
-  if (fHitType&4) nhits = fTrackHits->GetEntriesFast();
-  if (fHitType&2) nhits = fTrackHitsOld->GetEntriesFast();
-  
-  if (nhits == 0) return;
-  Int_t tracks = gAlice->GetMCApp()->GetNtrack();
-  if (fPoints == 0) fPoints = new TObjArray(tracks);
-  AliHit *ahit;
-  //
-  Int_t *ntrk=new Int_t[tracks];
-  Int_t *limi=new Int_t[tracks];
-  Float_t **coor=new Float_t*[tracks];
-  for(Int_t i=0;i<tracks;i++) {
-    ntrk[i]=0;
-    coor[i]=0;
-    limi[i]=0;
-  }
-  //
-  AliPoints *points = 0;
-  Float_t *fp=0;
-  Int_t trk;
-  Int_t chunk=nhits/4+1;
-  //
-  // Loop over all the hits and store their position
-  //
-  ahit = FirstHit2(-1);
-  while (ahit){
-    trk=ahit->GetTrack();
-    if(ntrk[trk]==limi[trk]) {
-      //
-      // Initialise a new track
-      fp=new Float_t[3*(limi[trk]+chunk)];
-      if(coor[trk]) {
-       memcpy(fp,coor[trk],sizeof(Float_t)*3*limi[trk]);
-       delete [] coor[trk];
-      }
-      limi[trk]+=chunk;
-      coor[trk] = fp;
-    } else {
-      fp = coor[trk];
-    }
-    fp[3*ntrk[trk]  ] = ahit->X();
-    fp[3*ntrk[trk]+1] = ahit->Y();
-    fp[3*ntrk[trk]+2] = ahit->Z();
-    ntrk[trk]++;
-    ahit = NextHit2();
-  }
-
-
-
-  //
-  for(trk=0; trk<tracks; ++trk) {
-    if(ntrk[trk]) {
-      points = new AliPoints();
-      points->SetMarkerColor(GetMarkerColor());
-      points->SetMarkerSize(GetMarkerSize());
-      points->SetDetector(this);
-      points->SetParticle(trk);
-      points->SetPolyMarker(ntrk[trk],coor[trk],GetMarkerStyle());
-      fPoints->AddAt(points,trk);
-      delete [] coor[trk];
-      coor[trk]=0;
-    }
-  }
-  delete [] coor;
-  delete [] ntrk;
-  delete [] limi;
-}
-
-
-//_____________________________________________________________________________
-void AliTPC::LoadPoints3(Int_t)
-{
-  //
-  // Store x, y, z of all hits in memory
-  // - only intersection point with pad row
-  if (fTrackHits == 0) return;
-  //
-  Int_t nhits = fTrackHits->GetEntriesFast();
-  if (nhits == 0) return;
-  Int_t tracks = gAlice->GetMCApp()->GetNtrack();
-  if (fPoints == 0) fPoints = new TObjArray(2*tracks);
-  fPoints->Expand(2*tracks);
-  AliHit *ahit;
-  //
-  Int_t *ntrk=new Int_t[tracks];
-  Int_t *limi=new Int_t[tracks];
-  Float_t **coor=new Float_t*[tracks];
-  for(Int_t i=0;i<tracks;i++) {
-    ntrk[i]=0;
-    coor[i]=0;
-    limi[i]=0;
-  }
-  //
-  AliPoints *points = 0;
-  Float_t *fp=0;
-  Int_t trk;
-  Int_t chunk=nhits/4+1;
-  //
-  // Loop over all the hits and store their position
-  //
-  ahit = FirstHit2(-1);
-  //for (Int_t hit=0;hit<nhits;hit++) {
-
-  Int_t lastrow = -1;
-  while (ahit){
-    //    ahit = (AliHit*)fHits->UncheckedAt(hit);
-    trk=ahit->GetTrack(); 
-    Float_t  x[3]={ahit->X(),ahit->Y(),ahit->Z()};
-    Int_t    index[3]={1,((AliTPChit*)ahit)->fSector,0};
-    Int_t    currentrow = fTPCParam->GetPadRow(x,index) ;
-    if (currentrow!=lastrow){
-      lastrow = currentrow;
-      //later calculate intersection point           
-      if(ntrk[trk]==limi[trk]) {
-       //
-       // Initialise a new track
-       fp=new Float_t[3*(limi[trk]+chunk)];
-       if(coor[trk]) {
-         memcpy(fp,coor[trk],sizeof(Float_t)*3*limi[trk]);
-         delete [] coor[trk];
-       }
-       limi[trk]+=chunk;
-       coor[trk] = fp;
-      } else {
-       fp = coor[trk];
-      }
-      fp[3*ntrk[trk]  ] = ahit->X();
-      fp[3*ntrk[trk]+1] = ahit->Y();
-      fp[3*ntrk[trk]+2] = ahit->Z();
-      ntrk[trk]++;
-    }
-    ahit = NextHit2();
-  }
-  
-  //
-  for(trk=0; trk<tracks; ++trk) {
-    if(ntrk[trk]) {
-      points = new AliPoints();
-      points->SetMarkerColor(GetMarkerColor()+1);
-      points->SetMarkerStyle(5);
-      points->SetMarkerSize(0.2);
-      points->SetDetector(this);
-      points->SetParticle(trk);
-      //      points->SetPolyMarker(ntrk[trk],coor[trk],GetMarkerStyle()20);
-      points->SetPolyMarker(ntrk[trk],coor[trk],30);
-      fPoints->AddAt(points,tracks+trk);
-      delete [] coor[trk];
-      coor[trk]=0;
-    }
-  }
-  delete [] coor;
-  delete [] ntrk;
-  delete [] limi;
-}
-
-
-
-void AliTPC::FindTrackHitsIntersection(TClonesArray * /*arr*/)
-{
-
-  //
-  //fill clones array with intersection of current point with the
-  //middle of the row
-  Int_t sector;
-  Int_t ipart;
-  
-  const Int_t kcmaxhits=30000;
-  AliTPCFastVector * xxxx = new AliTPCFastVector(kcmaxhits*4);
-  AliTPCFastVector & xxx = *xxxx;
-  Int_t maxhits = kcmaxhits;
-      
-  //
-  AliTPChit * tpcHit=0;
-  tpcHit = (AliTPChit*)FirstHit2(-1);
-  Int_t currentIndex=0;
-  Int_t lastrow=-1;  //last writen row
-
-  while (tpcHit){
-    if (tpcHit==0) continue;
-    sector=tpcHit->fSector; // sector number
-    ipart=tpcHit->Track();
-    
-    //find row number
-    
-    Float_t  x[3]={tpcHit->X(),tpcHit->Y(),tpcHit->Z()};
-    Int_t    index[3]={1,sector,0};
-    Int_t    currentrow = fTPCParam->GetPadRow(x,index) ;      
-    if (currentrow<0) continue;
-    if (lastrow<0) lastrow=currentrow;
-    if (currentrow==lastrow){
-      if ( currentIndex>=maxhits){
-       maxhits+=kcmaxhits;
-       xxx.ResizeTo(4*maxhits);
-      }     
-      xxx(currentIndex*4)=x[0];
-      xxx(currentIndex*4+1)=x[1];
-      xxx(currentIndex*4+2)=x[2];      
-      xxx(currentIndex*4+3)=tpcHit->fQ;
-      currentIndex++;  
-    }
-    else 
-      if (currentIndex>2){
-       Float_t sumx=0;
-       Float_t sumx2=0;
-       Float_t sumx3=0;
-       Float_t sumx4=0;
-       Float_t sumy=0;
-       Float_t sumxy=0;
-       Float_t sumx2y=0;
-       Float_t sumz=0;
-       Float_t sumxz=0;
-       Float_t sumx2z=0;
-       Float_t sumq=0;
-       for (Int_t index=0;index<currentIndex;index++){
-         Float_t x,x2,x3,x4;
-         x=x2=x3=x4=xxx(index*4);
-         x2*=x;
-         x3*=x2;
-         x4*=x3;
-         sumx+=x;
-         sumx2+=x2;
-         sumx3+=x3;
-         sumx4+=x4;
-         sumy+=xxx(index*4+1);
-         sumxy+=xxx(index*4+1)*x;
-         sumx2y+=xxx(index*4+1)*x2;
-         sumz+=xxx(index*4+2);
-         sumxz+=xxx(index*4+2)*x;
-         sumx2z+=xxx(index*4+2)*x2;     
-         sumq+=xxx(index*4+3);
-       }
-       Float_t centralPad = (fTPCParam->GetNPads(sector,lastrow)-1)/2;
-       Float_t det=currentIndex*(sumx2*sumx4-sumx3*sumx3)-sumx*(sumx*sumx4-sumx2*sumx3)+
-         sumx2*(sumx*sumx3-sumx2*sumx2);
-       
-       Float_t detay=sumy*(sumx2*sumx4-sumx3*sumx3)-sumx*(sumxy*sumx4-sumx2y*sumx3)+
-         sumx2*(sumxy*sumx3-sumx2y*sumx2);
-       Float_t detaz=sumz*(sumx2*sumx4-sumx3*sumx3)-sumx*(sumxz*sumx4-sumx2z*sumx3)+
-         sumx2*(sumxz*sumx3-sumx2z*sumx2);
-       
-       Float_t detby=currentIndex*(sumxy*sumx4-sumx2y*sumx3)-sumy*(sumx*sumx4-sumx2*sumx3)+
-         sumx2*(sumx*sumx2y-sumx2*sumxy);
-       Float_t detbz=currentIndex*(sumxz*sumx4-sumx2z*sumx3)-sumz*(sumx*sumx4-sumx2*sumx3)+
-         sumx2*(sumx*sumx2z-sumx2*sumxz);
-       
-       Float_t y=detay/det+centralPad;
-       Float_t z=detaz/det;    
-       Float_t by=detby/det; //y angle
-       Float_t bz=detbz/det; //z angle
-       sumy/=Float_t(currentIndex);
-       sumz/=Float_t(currentIndex);
-       
-       AliComplexCluster cl;
-       cl.fX=z;
-       cl.fY=y;
-       cl.fQ=sumq;
-       cl.fSigmaX2=bz;
-       cl.fSigmaY2=by;
-       cl.fTracks[0]=ipart;
-       
-       AliTPCClustersRow * row = (fClustersArray->GetRow(sector,lastrow));
-       if (row!=0) row->InsertCluster(&cl);
-       currentIndex=0;
-       lastrow=currentrow;
-      } //end of calculating cluster for given row
-               
-  } // end of loop over hits
-  xxxx->Delete();
-
-}
-//_______________________________________________________________________________
-void AliTPC::Digits2Reco(Int_t firstevent,Int_t lastevent)
-{
-  // produces rec points from digits and writes them on the root file
-  // AliTPCclusters.root
-
-  TDirectory *cwd = gDirectory;
-
-
-  AliTPCParamSR *dig=(AliTPCParamSR *)gDirectory->Get("75x40_100x60");
-  if(dig){
-    printf("You are running 2 pad-length geom hits with 3 pad-length geom digits\n");
-    delete dig;
-    dig = new AliTPCParamSR();
-  }
-  else
-  {
-   dig=(AliTPCParamSR *)gDirectory->Get("75x40_100x60_150x60"); 
-  }
-  if(!dig){
-   printf("No TPC parameters found\n");
-   exit(3);
-  }
-   
-  SetParam(dig);
-  cout<<"AliTPC::Digits2Reco: TPC parameteres have been set"<<endl; 
-  TFile *out;
-  if(!gSystem->Getenv("CONFIG_FILE")){
-    out=TFile::Open("AliTPCclusters.root","recreate");
-  }
-  else {
-    const char *tmp1;
-    const char *tmp2;
-    char tmp3[80];
-    tmp1=gSystem->Getenv("CONFIG_FILE_PREFIX");
-    tmp2=gSystem->Getenv("CONFIG_OUTDIR");
-    sprintf(tmp3,"%s%s/AliTPCclusters.root",tmp1,tmp2);
-    out=TFile::Open(tmp3,"recreate");
-  }
-
-  TStopwatch timer;
-  cout<<"AliTPC::Digits2Reco - determination of rec points begins"<<endl;
-  timer.Start();
-  cwd->cd();
-  for(Int_t iev=firstevent;iev<lastevent+1;iev++){
-
-    printf("Processing event %d\n",iev);
-    Digits2Clusters(iev);
-  }
-  cout<<"AliTPC::Digits2Reco - determination of rec points ended"<<endl;
-  timer.Stop();
-  timer.Print();
-  out->Close();
-  cwd->cd(); 
-
-
-}
 
 AliLoader* AliTPC::MakeLoader(const char* topfoldername)
 {
-//Makes TPC loader
- fLoader = new AliTPCLoader(GetName(),topfoldername);
- return fLoader;
+  //Makes TPC loader
 fLoader = new AliTPCLoader(GetName(),topfoldername);
 return fLoader;
 }
 
 ////////////////////////////////////////////////////////////////////////
@@ -3041,11 +2556,18 @@ AliTPCParam* AliTPC::LoadTPCParam(TFile *file) {
   sprintf(paramName,"75x40_100x60_150x60");
   AliTPCParam *paramTPC=(AliTPCParam*)file->Get(paramName);
   if (paramTPC) {
-    cout<<"TPC parameters "<<paramName<<" found."<<endl;
+    AliDebugClass(1,Form("TPC parameters %s found.",paramName));
   } else {
-    cerr<<"TPC parameters not found. Create new (they may be incorrect)."
-       <<endl;    
-    paramTPC = new AliTPCParamSR;
+    AliWarningClass("TPC parameters not found. Create new (they may be incorrect)");
+    //paramTPC = new AliTPCParamSR;
+    paramTPC = AliTPCcalibDB::Instance()->GetParameters();
+    if (!paramTPC->IsGeoRead()){
+      //
+      // read transformation matrices for gGeoManager
+      //
+      paramTPC->ReadGeoMatrices();
+    }
+  
   }
   return paramTPC;
 
@@ -3076,46 +2598,3 @@ AliTPCParam* AliTPC::LoadTPCParam(TFile *file) {
 }
 
 
-//____________________________________________________________________________
-Double_t SigmaY2(Double_t r, Double_t tgl, Double_t pt)
-{
-  //
-  // Parametrised error of the cluster reconstruction (pad direction)
-  //
-  // Sigma rphi
-  const Float_t kArphi=0.41818e-2;
-  const Float_t kBrphi=0.17460e-4;
-  const Float_t kCrphi=0.30993e-2;
-  const Float_t kDrphi=0.41061e-3;
-
-  pt=TMath::Abs(pt)*1000.;
-  Double_t x=r/pt;
-  tgl=TMath::Abs(tgl);
-  Double_t s=kArphi - kBrphi*r*tgl + kCrphi*x*x + kDrphi*x;
-  if (s<0.4e-3) s=0.4e-3;
-  s*=1.3; //Iouri Belikov
-
-  return s;
-}
-
-
-//____________________________________________________________________________
-Double_t SigmaZ2(Double_t r, Double_t tgl)
-{
-  //
-  // Parametrised error of the cluster reconstruction (drift direction)
-  //
-  // Sigma z
-  const Float_t kAz=0.39614e-2;
-  const Float_t kBz=0.22443e-4;
-  const Float_t kCz=0.51504e-1;
-
-
-  tgl=TMath::Abs(tgl);
-  Double_t s=kAz - kBz*r*tgl + kCz*tgl*tgl;
-  if (s<0.4e-3) s=0.4e-3;
-  s*=1.3; //Iouri Belikov
-
-  return s;
-}
-