Coverity fix
[u/mrichter/AliRoot.git] / TPC / AliTPCtrackerMI.cxx
index 774149b..1a30123 100644 (file)
 #include <TFile.h>
 #include <TObjArray.h>
 #include <TTree.h>
+#include <TGraphErrors.h>
 #include "AliLog.h"
 #include "AliComplexCluster.h"
 #include "AliESDEvent.h"
 #include "AliTrackPointArray.h"
 #include "TRandom.h"
 #include "AliTPCcalibDB.h"
+#include "AliTPCcalibDButil.h"
 #include "AliTPCTransform.h"
 #include "AliTPCClusterParam.h"
 
@@ -202,6 +204,12 @@ AliTPCtrackerMI::AliTPCtrackerMI()
   //
   // default constructor
   //
+  for (Int_t irow=0; irow<200; irow++){
+    fXRow[irow]=0;
+    fYMax[irow]=0;
+    fPadLength[irow]=0;
+  }
+
 }
 //_____________________________________________________________________
 
@@ -297,7 +305,7 @@ Int_t AliTPCtrackerMI::AcceptCluster(AliTPCseed * seed, AliTPCclusterMI * cluste
   Double_t sdistancey2 = sy2+seed->GetSigmaY2();
   Double_t sdistancez2 = sz2+seed->GetSigmaZ2();
   Double_t dy=seed->GetCurrentCluster()->GetY()-yt;
-  Double_t dz=seed->GetCurrentCluster()->GetY()-zt;
+  Double_t dz=seed->GetCurrentCluster()->GetZ()-zt;
   Double_t rdistancey2 = (seed->GetCurrentCluster()->GetY()-yt)*
     (seed->GetCurrentCluster()->GetY()-yt)/sdistancey2;
   Double_t rdistancez2 = (seed->GetCurrentCluster()->GetZ()-zt)*
@@ -339,6 +347,10 @@ Int_t AliTPCtrackerMI::AcceptCluster(AliTPCseed * seed, AliTPCclusterMI * cluste
       "rmsz2p30="<<rmsz2p30<<  
       "rmsy2p30R="<<rmsy2p30R<<
       "rmsz2p30R="<<rmsz2p30R<<        
+      // normalize distance - 
+      "rdisty="<<rdistancey2<<
+      "rdistz="<<rdistancez2<<
+      "rdist="<<rdistance2<< //       
       "\n";
     }
   }
@@ -445,6 +457,12 @@ AliTPCtrackerMI::AliTPCtrackerMI(const AliTPCtrackerMI &t):
   // dummy copy constructor
   //------------------------------------------------------------------
   fOutput=t.fOutput;
+  for (Int_t irow=0; irow<200; irow++){
+    fXRow[irow]=0;
+    fYMax[irow]=0;
+    fPadLength[irow]=0;
+  }
+
 }
 AliTPCtrackerMI & AliTPCtrackerMI::operator=(const AliTPCtrackerMI& /*r*/)
 {
@@ -473,7 +491,8 @@ void AliTPCtrackerMI::FillESD(const TObjArray* arr)
   //
   //
   //fill esds using updated tracks
-  if (fEvent){
+  if (!fEvent) return;
+  
     // write tracks to the event
     // store index of the track
     Int_t nseed=arr->GetEntriesFast();
@@ -604,9 +623,9 @@ void AliTPCtrackerMI::FillESD(const TObjArray* arr)
        kink->SetIndex(it, knkId<0 ? 0:1); // update track index of the kink: mother at 0, daughter at 1
       }
     }
-    // << account for suppressed tracks in the kink indices (RS)
-  }
-  printf("Number of filled ESDs-\t%d\n",fEvent->GetNumberOfTracks());
+    // << account for suppressed tracks in the kink indices (RS)  
+    AliInfo(Form("Number of filled ESDs-\t%d\n",fEvent->GetNumberOfTracks()));
+  
 }
 
 
@@ -980,7 +999,7 @@ Double_t AliTPCtrackerMI::F1(Double_t x1,Double_t y1,
   y2 -=y1;
   //  
   Double_t det = x3*y2-x2*y3;
-  if (TMath::Abs(det)<1e-16){
+  if (TMath::Abs(det)<1e-10){
     return 100;
   }
   //
@@ -1006,7 +1025,7 @@ Double_t AliTPCtrackerMI::F2(Double_t x1,Double_t y1,
   y2 -=y1;
   //  
   Double_t det = x3*y2-x2*y3;
-  if (TMath::Abs(det)<1e-16) {
+  if (TMath::Abs(det)<1e-10) {
     return 100;
   }
   //
@@ -1123,7 +1142,7 @@ Int_t  AliTPCtrackerMI::LoadClusters(const TObjArray *arr)
 {
   //
   // load clusters to the memory
-  AliTPCClustersRow *clrow = 0x0; 
+  AliTPCClustersRow *clrow = new AliTPCClustersRow("AliTPCclusterMI");
   Int_t lower   = arr->LowerBound();
   Int_t entries = arr->GetEntriesFast();
   
@@ -1163,6 +1182,7 @@ Int_t  AliTPCtrackerMI::LoadClusters(const TObjArray *arr)
       for (Int_t j=0;j<tpcrow->GetN2();++j) 
        tpcrow->SetCluster2(j,*(AliTPCclusterMI*)(clrow->GetArray()->At(j)));
     }
+    clrow->GetArray()->Clear("C");
   }
   //
   delete clrow;
@@ -1233,10 +1253,7 @@ Int_t  AliTPCtrackerMI::LoadClusters()
 {
   //
   // load clusters to the memory
-  AliTPCClustersRow *clrow= new AliTPCClustersRow;
-  clrow->SetClass("AliTPCclusterMI");
-  clrow->SetArray(0);
-  clrow->GetArray()->ExpandCreateFast(10000);
+  AliTPCClustersRow *clrow= new AliTPCClustersRow("AliTPCclusterMI");
   //
   //  TTree * tree = fClustersArray.GetTree();
 
@@ -1345,9 +1362,11 @@ void   AliTPCtrackerMI::Transform(AliTPCclusterMI * cluster){
   //
   //
   //
-  AliTPCTransform *transform = AliTPCcalibDB::Instance()->GetTransform() ;
+  AliTPCcalibDB * calibDB = AliTPCcalibDB::Instance();
+  AliTPCTransform *transform = calibDB->GetTransform() ;
   if (!transform) {
     AliFatal("Tranformations not in calibDB");
+    return;
   }
   transform->SetCurrentRecoParam((AliTPCRecoParam*)AliTPCReconstructor::GetRecoParam());
   Double_t x[3]={cluster->GetRow(),cluster->GetPad(),cluster->GetTimeBin()};
@@ -1380,22 +1399,23 @@ void   AliTPCtrackerMI::Transform(AliTPCclusterMI * cluster){
   cluster->SetY(x[1]);
   cluster->SetZ(x[2]);
   // The old stuff:
-
   //
   // 
   //
   //if (!fkParam->IsGeoRead()) fkParam->ReadGeoMatrices();
-  TGeoHMatrix  *mat = fkParam->GetClusterMatrix(cluster->GetDetector());
-  //TGeoHMatrix  mat;
-  Double_t pos[3]= {cluster->GetX(),cluster->GetY(),cluster->GetZ()};
-  Double_t posC[3]={cluster->GetX(),cluster->GetY(),cluster->GetZ()};
-  if (mat) mat->LocalToMaster(pos,posC);
-  else{
-    // chack Loading of Geo matrices from GeoManager - TEMPORARY FIX
-  }
-  cluster->SetX(posC[0]);
-  cluster->SetY(posC[1]);
-  cluster->SetZ(posC[2]);
+  if (AliTPCReconstructor::GetRecoParam()->GetUseSectorAlignment() && (!calibDB->HasAlignmentOCDB())){
+    TGeoHMatrix  *mat = fkParam->GetClusterMatrix(cluster->GetDetector());
+    //TGeoHMatrix  mat;
+    Double_t pos[3]= {cluster->GetX(),cluster->GetY(),cluster->GetZ()};
+    Double_t posC[3]={cluster->GetX(),cluster->GetY(),cluster->GetZ()};
+    if (mat) mat->LocalToMaster(pos,posC);
+    else{
+      // chack Loading of Geo matrices from GeoManager - TEMPORARY FIX
+    }
+    cluster->SetX(posC[0]);
+    cluster->SetY(posC[1]);
+    cluster->SetZ(posC[2]);
+  }
 }
 
 //_____________________________________________________________________________
@@ -2146,7 +2166,7 @@ void  AliTPCtrackerMI::SignShared(TObjArray * arr)
   for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
     AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(i);    
     if (!pt) continue;
-    for (Int_t j=0;j<=12;j++){
+    for (Int_t j=0;j<12;j++){
       pt->SetOverlapLabel(j,0);
     }
   }
@@ -2237,13 +2257,8 @@ void AliTPCtrackerMI::RemoveUsed2(TObjArray * arr, Float_t factor1,  Float_t fac
     if (!pt) continue;
     //
     if (quality[trackindex]<0){
-      if (pt) {
        delete arr->RemoveAt(trackindex);
-      }
-      else{
-       arr->RemoveAt(trackindex);
-      }
-      continue;
+       continue;
     }
     //
     //
@@ -2310,6 +2325,88 @@ void AliTPCtrackerMI::RemoveUsed2(TObjArray * arr, Float_t factor1,  Float_t fac
   delete []indexes;
 }
 
+void AliTPCtrackerMI::DumpClusters(Int_t iter, TObjArray *trackArray) 
+{
+  //
+  // Dump clusters after reco
+  // signed and unsigned cluster can be visualized   
+  // 1. Unsign all cluster
+  // 2. Sign all used clusters
+  // 3. Dump clusters
+  UnsignClusters();
+  Int_t nseed = trackArray->GetEntries();
+  for (Int_t i=0; i<nseed; i++){
+    AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)trackArray->UncheckedAt(i);    
+    if (!pt) {
+      continue;
+    }    
+    Bool_t isKink=pt->GetKinkIndex(0)!=0;
+    for (Int_t j=0; j<160; ++j) {
+      Int_t index=pt->GetClusterIndex2(j);
+      if (index<0) continue;
+      AliTPCclusterMI *c= pt->GetClusterPointer(j);
+      if (!c) continue;
+      if (isKink) c->Use(100);   // kink
+      c->Use(10);                // by default usage 10
+    }
+  }
+  //
+
+  for (Int_t sec=0;sec<fkNIS;sec++){
+    for (Int_t row=0;row<fInnerSec->GetNRows();row++){
+      AliTPCclusterMI *cl = fInnerSec[sec][row].GetClusters1();
+      for (Int_t icl =0;icl< fInnerSec[sec][row].GetN1();icl++){    
+       Float_t gx[3];  cl[icl].GetGlobalXYZ(gx);
+       (*fDebugStreamer)<<"clDump"<< 
+         "iter="<<iter<<
+         "cl.="<<&cl[icl]<<      
+         "gx0="<<gx[0]<<
+         "gx1="<<gx[1]<<
+         "gx2="<<gx[2]<<
+         "\n";
+      }
+      cl = fInnerSec[sec][row].GetClusters2();
+      for (Int_t icl =0;icl< fInnerSec[sec][row].GetN2();icl++){
+       Float_t gx[3];  cl[icl].GetGlobalXYZ(gx);
+       (*fDebugStreamer)<<"clDump"<< 
+         "iter="<<iter<<
+         "cl.="<<&cl[icl]<<
+         "gx0="<<gx[0]<<
+         "gx1="<<gx[1]<<
+         "gx2="<<gx[2]<<
+         "\n";
+      }
+    }
+  }
+  
+  for (Int_t sec=0;sec<fkNOS;sec++){
+    for (Int_t row=0;row<fOuterSec->GetNRows();row++){
+      AliTPCclusterMI *cl = fOuterSec[sec][row].GetClusters1();
+      for (Int_t icl =0;icl< fOuterSec[sec][row].GetN1();icl++){
+       Float_t gx[3];  cl[icl].GetGlobalXYZ(gx);
+       (*fDebugStreamer)<<"clDump"<< 
+         "iter="<<iter<<
+         "cl.="<<&cl[icl]<<
+         "gx0="<<gx[0]<<
+         "gx1="<<gx[1]<<
+         "gx2="<<gx[2]<<
+         "\n";      
+      }
+      cl = fOuterSec[sec][row].GetClusters2();
+      for (Int_t icl =0;icl< fOuterSec[sec][row].GetN2();icl++){
+       Float_t gx[3];  cl[icl].GetGlobalXYZ(gx);
+       (*fDebugStreamer)<<"clDump"<< 
+         "iter="<<iter<<
+         "cl.="<<&cl[icl]<<
+         "gx0="<<gx[0]<<
+         "gx1="<<gx[1]<<
+         "gx2="<<gx[2]<<
+         "\n";      
+      }
+    }
+  }
+  
+}
 void AliTPCtrackerMI::UnsignClusters() 
 {
   //
@@ -2572,8 +2669,29 @@ Int_t AliTPCtrackerMI::RefitInward(AliESDEvent *event)
   // back propagation of ESD tracks
   //
   //return 0;
+  if (!event) return 0;
   const Int_t kMaxFriendTracks=2000;
   fEvent = event;
+  // extract correction object for multiplicity dependence of dEdx
+  TObjArray * gainCalibArray = AliTPCcalibDB::Instance()->GetTimeGainSplinesRun(event->GetRunNumber());
+
+  AliTPCTransform *transform = AliTPCcalibDB::Instance()->GetTransform() ;
+  if (!transform) {
+    AliFatal("Tranformations not in RefitInward");
+    return 0;
+  }
+  transform->SetCurrentRecoParam((AliTPCRecoParam*)AliTPCReconstructor::GetRecoParam());
+  const AliTPCRecoParam * recoParam = AliTPCcalibDB::Instance()->GetTransform()->GetCurrentRecoParam();
+
+  TGraphErrors * graphMultDependenceDeDx = 0x0;
+  if (recoParam && recoParam->GetUseMultiplicityCorrectionDedx() && gainCalibArray) {
+    if (recoParam->GetUseTotCharge()) {
+      graphMultDependenceDeDx = (TGraphErrors *) gainCalibArray->FindObject("TGRAPHERRORS_MEANQTOT_MULTIPLICITYDEPENDENCE_BEAM_ALL");
+    } else {
+      graphMultDependenceDeDx = (TGraphErrors *) gainCalibArray->FindObject("TGRAPHERRORS_MEANQMAX_MULTIPLICITYDEPENDENCE_BEAM_ALL");
+    }
+  }
+  //
   ReadSeeds(event,2);
   fIteration=2;
   //PrepareForProlongation(fSeeds,1);
@@ -2625,7 +2743,7 @@ Int_t AliTPCtrackerMI::RefitInward(AliESDEvent *event)
     esd->SetTPCClusterMap(seed->GetClusterMap());
     esd->SetTPCSharedMap(seed->GetSharedMap());
     //
-    if (AliTPCReconstructor::StreamLevel()>1 && seed!=0&&esd!=0) {
+    if (AliTPCReconstructor::StreamLevel()>1 && seed!=0) {
       TTreeSRedirector &cstream = *fDebugStreamer;
       cstream<<"Crefit"<<
        "Esd.="<<esd<<
@@ -2640,6 +2758,12 @@ Int_t AliTPCtrackerMI::RefitInward(AliESDEvent *event)
       Int_t   ndedx = seed->GetNCDEDX(0);
       Float_t sdedx = seed->GetSDEDX(0);
       Float_t dedx  = seed->GetdEdx();
+      // apply mutliplicity dependent dEdx correction if available
+      if (graphMultDependenceDeDx) {
+       Int_t nContribut  = event->GetPrimaryVertexTPC()->GetNContributors();
+       Double_t corrGain =  AliTPCcalibDButil::EvalGraphConst(graphMultDependenceDeDx, nContribut);
+       dedx /= corrGain;
+      }
       esd->SetTPCsignal(dedx, sdedx, ndedx);
       //
       // add seed to the esd track in Calib level
@@ -2656,6 +2780,7 @@ Int_t AliTPCtrackerMI::RefitInward(AliESDEvent *event)
     }
   }
   //FindKinks(fSeeds,event);
+  if (AliTPCReconstructor::StreamLevel()>3)  DumpClusters(2,fSeeds);
   Info("RefitInward","Number of refitted tracks %d",ntracks);
   return 0;
 }
@@ -2666,7 +2791,7 @@ Int_t AliTPCtrackerMI::PropagateBack(AliESDEvent *event)
   //
   // back propagation of ESD tracks
   //
-
+  if (!event) return 0;
   fEvent = event;
   fIteration = 1;
   ReadSeeds(event,1);
@@ -2726,6 +2851,7 @@ Int_t AliTPCtrackerMI::PropagateBack(AliESDEvent *event)
       }
     }
   }
+  if (AliTPCReconstructor::StreamLevel()>3)  DumpClusters(1,fSeeds);
   //FindKinks(fSeeds,event);
   Info("PropagateBack","Number of back propagated tracks %d",ntracks);
   fEvent =0;
@@ -3423,7 +3549,7 @@ void AliTPCtrackerMI::MakeSeeds5(TObjArray * arr, Int_t sec, Int_t i1, Int_t i2,
   }
   
   if (fDebug>3){
-    Info("MakeSeeds5","\nSeeding statiistic:\t%d\t%d\t%d\t%d\t%d\t%d",nin0,nin1,nin2,nin,nout1,nout2,nout3);
+    Info("MakeSeeds5","\nSeeding statiistic:\t%d\t%d\t%d\t%d\t%d\t%d\t%d",nin0,nin1,nin2,nin,nout1,nout2,nout3);
   }
   delete seed;
 }
@@ -3837,8 +3963,8 @@ AliTPCseed *AliTPCtrackerMI::ReSeed(const AliTPCseed *track, Float_t r0, Float_t
   ipos[2] = TMath::Min(int(r2*nclusters),nclusters-1);   // last point
   //
   //
-  Double_t  xyz[3][3];
-  Int_t     row[3],sec[3]={0,0,0};
+  Double_t  xyz[3][3]={{0}};
+  Int_t     row[3]={0},sec[3]={0,0,0};
   //
   // find track row position at given ratio of the length
   Int_t index=-1;
@@ -4257,6 +4383,8 @@ void  AliTPCtrackerMI::FindMultiMC(const TObjArray * array, AliESDEvent */*esd*/
   }    
   delete [] helixes;
   delete [] xm;
+  delete [] dz0;
+  delete [] dz1;
   if (AliTPCReconstructor::StreamLevel()>1) {
     AliInfo("Time for curling tracks removal DEBUGGING MC");
     timer.Print();
@@ -4295,6 +4423,7 @@ void  AliTPCtrackerMI::FindSplitted(TObjArray * array, AliESDEvent */*esd*/, Int
   //0.  Sort tracks according quality
   //1.  Propagate the ext. param to reference radius
   Int_t nseed = array->GetEntriesFast();  
+  if (nseed<=0) return;
   Float_t * quality = new Float_t[nseed];
   Int_t   * indexes = new Int_t[nseed];
   for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
@@ -4410,6 +4539,9 @@ void  AliTPCtrackerMI::FindSplitted(TObjArray * array, AliESDEvent */*esd*/, Int
   // 4. Delete temporary array
   //
   delete [] params; 
+  delete [] quality;
+  delete [] indexes;
+
 }
 
 
@@ -4475,7 +4607,8 @@ void  AliTPCtrackerMI::FindCurling(const TObjArray * array, AliESDEvent */*esd*/
   //
   TStopwatch timer;
   timer.Start();
-  Double_t phase[2][2],radius[2];
+  Double_t phase[2][2]={{0,0},{0,0}},radius[2]={0,0};
+
   //
   // Find tracks
   //
@@ -4687,7 +4820,7 @@ void  AliTPCtrackerMI::FindKinks(TObjArray * array, AliESDEvent *esd)
   Int_t ncandidates =0;
   Int_t nall =0;
   Int_t ntracks=0; 
-  Double_t phase[2][2],radius[2];
+  Double_t phase[2][2]={{0,0},{0,0}},radius[2]={0,0};
 
   //
   // Find circling track
@@ -5114,7 +5247,8 @@ void  AliTPCtrackerMI::FindKinks(TObjArray * array, AliESDEvent *esd)
     AliKink * kink0 = (AliKink*) kinks->At(indexes[ikink0]);
     if (!kink0) continue;
     //
-    for (Int_t ikink1=0;ikink1<ikink0;ikink1++){
+    for (Int_t ikink1=0;ikink1<ikink0;ikink1++){ 
+      kink0 = (AliKink*) kinks->At(indexes[ikink0]);
       if (!kink0) continue;
       AliKink * kink1 = (AliKink*) kinks->At(indexes[ikink1]);
       if (!kink1) continue;
@@ -5167,6 +5301,7 @@ void  AliTPCtrackerMI::FindKinks(TObjArray * array, AliESDEvent *esd)
          shared[kink0->GetIndex(0)]= kTRUE;
          shared[kink0->GetIndex(1)]= kTRUE;      
          delete kinks->RemoveAt(indexes[ikink0]);
+         break;
        }
        else{
          shared[kink1->GetIndex(0)]= kTRUE;
@@ -5327,367 +5462,10 @@ void  AliTPCtrackerMI::FindKinks(TObjArray * array, AliESDEvent *esd)
   kinks->Delete();
   delete kinks;
 
-  printf("Ncandidates=\t%d\t%d\t%d\t%d\n",esd->GetNumberOfKinks(),ncandidates,ntracks,nall);
+  AliInfo(Form("Ncandidates=\t%d\t%d\t%d\t%d\n",esd->GetNumberOfKinks(),ncandidates,ntracks,nall));
   timer.Print();
 }
 
-void  AliTPCtrackerMI::FindV0s(const TObjArray * array, AliESDEvent *const esd)
-{
-  //
-  //  find V0s
-  //
-  //
-  TObjArray *tpcv0s      = new TObjArray(100000);
-  Int_t     nentries     = array->GetEntriesFast();
-  AliHelix *helixes      = new AliHelix[nentries];
-  Int_t    *sign         = new Int_t[nentries];
-  Float_t  *alpha        = new Float_t[nentries];
-  Float_t  *z0           = new Float_t[nentries]; 
-  Float_t  *dca          = new Float_t[nentries];
-  Float_t  *sdcar        = new Float_t[nentries];
-  Float_t  *cdcar        = new Float_t[nentries];
-  Float_t  *pulldcar     = new Float_t[nentries];
-  Float_t  *pulldcaz     = new Float_t[nentries];
-  Float_t  *pulldca      = new Float_t[nentries];
-  Bool_t   *isPrim       = new Bool_t[nentries];  
-  const AliESDVertex * primvertex = esd->GetVertex();
-  Double_t             zvertex = primvertex->GetZv(); 
-  //
-  //  nentries = array->GetEntriesFast();
-  //
-  for (Int_t i=0;i<nentries;i++){
-    sign[i]=0;
-    isPrim[i]=0;
-    AliTPCseed* track = (AliTPCseed*)array->At(i);    
-    if (!track) continue;
-    track->GetV0Indexes()[0] = 0;  //rest v0 indexes
-    track->GetV0Indexes()[1] = 0;  //rest v0 indexes
-    track->GetV0Indexes()[2] = 0;  //rest v0 indexes
-    //
-    alpha[i] = track->GetAlpha();
-    new (&helixes[i]) AliHelix(*track);
-    Double_t xyz[3];
-    helixes[i].Evaluate(0,xyz);
-    sign[i] = (track->GetC()>0) ? -1:1;
-    Double_t x,y,z;
-    x=160;
-    z0[i]=1000;
-    if (track->GetProlongation(0,y,z))  z0[i] = z;
-    dca[i] = track->GetD(0,0);
-    // 
-    // dca error parrameterezation + pulls
-    //
-    sdcar[i]      = TMath::Sqrt(0.150*0.150+(100*track->GetC())*(100*track->GetC()));
-    if (TMath::Abs(track->GetTgl())>1) sdcar[i]*=2.5;
-    cdcar[i]      = TMath::Exp((TMath::Abs(track->GetC())-0.0106)*525.3);
-    pulldcar[i]   = (dca[i]-cdcar[i])/sdcar[i];
-    pulldcaz[i]   = (z0[i]-zvertex)/sdcar[i];
-    pulldca[i]    = TMath::Sqrt(pulldcar[i]*pulldcar[i]+pulldcaz[i]*pulldcaz[i]);
-    if (track->TPCrPID(1)+track->TPCrPID(2)+track->TPCrPID(3)>0.5) {
-      if (pulldca[i]<3.) isPrim[i]=kTRUE;  //pion, muon and Kaon  3 sigma cut
-    }
-    if (track->TPCrPID(4)>0.5) {
-      if (pulldca[i]<0.5) isPrim[i]=kTRUE;  //proton 0.5 sigma cut
-    }
-    if (track->TPCrPID(0)>0.4) {
-      isPrim[i]=kFALSE;  //electron no  sigma cut
-    }
-  }
-  //
-  //
-  TStopwatch timer;
-  timer.Start();
-  Int_t ncandidates =0;
-  Int_t nall =0;
-  Int_t ntracks=0; 
-  Double_t phase[2][2],radius[2];
-  //
-  //  Finf V0s loop
-  // 
-  //
-  // //  
-  Float_t fprimvertex[3]={GetX(),GetY(),GetZ()};
-  AliV0 vertex; 
-  Double_t cradius0 = 10*10;
-  Double_t cradius1 = 200*200;
-  Double_t cdist1=3.;
-  Double_t cdist2=4.;
-  Double_t cpointAngle = 0.95;
-  //
-  Double_t delta[2]={10000,10000};
-  for (Int_t i =0;i<nentries;i++){
-    if (sign[i]==0) continue;
-    AliTPCseed * track0 = (AliTPCseed*)array->At(i);
-    if (!track0) continue;
-    if (AliTPCReconstructor::StreamLevel()>1){
-      TTreeSRedirector &cstream = *fDebugStreamer;
-      cstream<<"Tracks"<<
-       "Tr0.="<<track0<<
-       "dca="<<dca[i]<<
-       "z0="<<z0[i]<<
-       "zvertex="<<zvertex<<
-       "sdcar0="<<sdcar[i]<<
-       "cdcar0="<<cdcar[i]<<
-       "pulldcar0="<<pulldcar[i]<<
-       "pulldcaz0="<<pulldcaz[i]<<
-       "pulldca0="<<pulldca[i]<<
-       "isPrim="<<isPrim[i]<<
-       "\n";
-    }
-    //
-    if (track0->GetSigned1Pt()<0) continue;
-    if (track0->GetKinkIndex(0)>0||isPrim[i]) continue;   //daughter kink
-    //
-    if (TMath::Abs(helixes[i].GetHelix(4))<0.000000001) continue;
-    ntracks++;
-    // debug output
-    
-    
-    for (Int_t j =0;j<nentries;j++){
-      AliTPCseed * track1 = (AliTPCseed*)array->At(j);
-      if (!track1) continue;
-      if (track1->GetKinkIndex(0)>0 || isPrim[j]) continue; //daughter kink
-      if (sign[j]*sign[i]>0) continue; 
-      if (TMath::Abs(helixes[j].GetHelix(4))<0.000001) continue;
-      if (track0->GetCircular()+track1->GetCircular()>1) continue;    //circling -returning track
-      nall++;
-      //
-      // DCA to prim vertex cut
-      //
-      //
-      delta[0]=10000;
-      delta[1]=10000;
-
-      Int_t npoints = helixes[i].GetRPHIintersections(helixes[j], phase, radius,cdist2);
-      if (npoints<1) continue;
-      Int_t iclosest=0;
-      // cuts on radius      
-      if (npoints==1){
-       if (radius[0]<cradius0||radius[0]>cradius1) continue;
-       helixes[i].LinearDCA(helixes[j],phase[0][0],phase[0][1],radius[0],delta[0]);
-       if (delta[0]>cdist1) continue;
-      }
-      else{
-       if (TMath::Max(radius[0],radius[1])<cradius0|| TMath::Min(radius[0],radius[1])>cradius1) continue;      
-       helixes[i].LinearDCA(helixes[j],phase[0][0],phase[0][1],radius[0],delta[0]);    
-       helixes[i].LinearDCA(helixes[j],phase[1][0],phase[1][1],radius[1],delta[1]);
-       if (delta[1]<delta[0]) iclosest=1;
-       if (delta[iclosest]>cdist1) continue;
-      }
-      helixes[i].ParabolicDCA(helixes[j],phase[iclosest][0],phase[iclosest][1],radius[iclosest],delta[iclosest]);
-      if (radius[iclosest]<cradius0 || radius[iclosest]>cradius1 || delta[iclosest]>cdist1) continue;
-      //
-      Double_t pointAngle = helixes[i].GetPointAngle(helixes[j],phase[iclosest],fprimvertex);
-      if (pointAngle<cpointAngle) continue;
-      //
-      Bool_t isGamma = kFALSE;
-      vertex.SetParamP(*track0); //track0 - plus
-      vertex.SetParamN(*track1); //track1 - minus
-      vertex.Update(fprimvertex);
-      if (track0->TPCrPID(0)>0.3&&track1->TPCrPID(0)>0.3&&vertex.GetAnglep()[2]<0.15) isGamma=kTRUE;              // gamma conversion candidate
-      Double_t pointAngle2 = vertex.GetV0CosineOfPointingAngle();
-      //continue;
-      if (vertex.GetV0CosineOfPointingAngle()<cpointAngle && (!isGamma)) continue;// point angle cut
-      //Bo:      if (vertex.GetDist2()>2&&(!isGamma)) continue;      // point angle cut
-      if (vertex.GetDcaV0Daughters()>2&&(!isGamma)) continue;//Bo:   // point angle cut
-      Float_t sigmae     = 0.15*0.15;
-      if (vertex.GetRr()<80) 
-       sigmae += (sdcar[i]*sdcar[i]+sdcar[j]*sdcar[j])*(1.-vertex.GetRr()/80.)*(1.-vertex.GetRr()/80.);
-      sigmae+= TMath::Sqrt(sigmae);
-      //Bo:      if (vertex.GetDist2()/sigmae>3.&&(!isGamma)) continue; 
-      if (vertex.GetDcaV0Daughters()/sigmae>3.&&(!isGamma)) continue; 
-      Float_t densb0=0,densb1=0,densa0=0,densa1=0;
-      Int_t row0 = GetRowNumber(vertex.GetRr());
-      if (row0>15){
-       //Bo:   if (vertex.GetDist2()>0.2) continue;             
-       if (vertex.GetDcaV0Daughters()>0.2) continue;             
-       densb0     = track0->Density2(0,row0-5);          
-       densb1     = track1->Density2(0,row0-5);         
-       if (densb0>0.3|| densb1>0.3) continue;            //clusters before vertex
-       densa0     = track0->Density2(row0+5,row0+40);    
-       densa1     = track1->Density2(row0+5,row0+40);    
-       if ((densa0<0.4|| densa1<0.4)&&(!isGamma)) continue;            //missing clusters after vertex
-      }
-      else{
-       densa0     = track0->Density2(0,40);  //cluster density
-       densa1     = track1->Density2(0,40);  //cluster density
-       if ((vertex.GetRr()<80&&densa0+densa1<1.)&&(!isGamma)) continue;
-      }
-//Bo:        vertex.SetLab(0,track0->GetLabel());
-//Bo:        vertex.SetLab(1,track1->GetLabel());
-      vertex.SetChi2After((densa0+densa1)*0.5);
-      vertex.SetChi2Before((densb0+densb1)*0.5);
-      vertex.SetIndex(0,i);
-      vertex.SetIndex(1,j);
-//Bo:      vertex.SetStatus(1); // TPC v0 candidate
-      vertex.SetOnFlyStatus(2);//Bo: // TPC v0 candidate
-//Bo:        vertex.SetRp(track0->TPCrPIDs());
-//Bo:        vertex.SetRm(track1->TPCrPIDs());
-      tpcv0s->AddLast(new AliESDv0(vertex));      
-      ncandidates++;
-      {
-       Int_t eventNr = esd->GetEventNumberInFile(); // This is most likely NOT the event number you'd like to use. It has nothing to do with the 'real' event number
-       Double_t radiusm= (delta[0]<delta[1])? TMath::Sqrt(radius[0]):TMath::Sqrt(radius[1]);  
-       Double_t deltam= (delta[0]<delta[1])? TMath::Sqrt(delta[0]):TMath::Sqrt(delta[1]);  
-       if (AliTPCReconstructor::StreamLevel()>1) {
-         Int_t lab0=track0->GetLabel();
-         Int_t lab1=track1->GetLabel();
-         Char_t c0=track0->GetCircular();
-         Char_t c1=track1->GetCircular();
-          TTreeSRedirector &cstream = *fDebugStreamer;
-         cstream<<"V0"<<
-         "Event="<<eventNr<<
-         "vertex.="<<&vertex<<
-         "Tr0.="<<track0<<
-         "lab0="<<lab0<<
-         "Helix0.="<<&helixes[i]<<     
-         "Tr1.="<<track1<<
-         "lab1="<<lab1<<
-         "Helix1.="<<&helixes[j]<<
-         "pointAngle="<<pointAngle<<
-         "pointAngle2="<<pointAngle2<<
-         "dca0="<<dca[i]<<
-         "dca1="<<dca[j]<<
-         "z0="<<z0[i]<<
-         "z1="<<z0[j]<<
-         "zvertex="<<zvertex<<
-         "circular0="<<c0<<
-         "circular1="<<c1<<
-         "npoints="<<npoints<<
-         "radius0="<<radius[0]<<
-         "delta0="<<delta[0]<<
-         "radius1="<<radius[1]<<
-         "delta1="<<delta[1]<<
-         "radiusm="<<radiusm<<
-         "deltam="<<deltam<<
-         "sdcar0="<<sdcar[i]<<
-         "sdcar1="<<sdcar[j]<<
-         "cdcar0="<<cdcar[i]<<
-         "cdcar1="<<cdcar[j]<<
-         "pulldcar0="<<pulldcar[i]<<
-         "pulldcar1="<<pulldcar[j]<<
-         "pulldcaz0="<<pulldcaz[i]<<
-         "pulldcaz1="<<pulldcaz[j]<<
-         "pulldca0="<<pulldca[i]<<
-         "pulldca1="<<pulldca[j]<<
-         "densb0="<<densb0<<
-         "densb1="<<densb1<<
-         "densa0="<<densa0<<
-         "densa1="<<densa1<<
-         "sigmae="<<sigmae<<
-           "\n";}
-      }
-    }
-  }    
-  Float_t *quality = new Float_t[ncandidates];
-  Int_t *indexes = new Int_t[ncandidates];
-  Int_t naccepted =0;
-  for (Int_t i=0;i<ncandidates;i++){
-    quality[i]     = 0; 
-    AliESDv0 *v0 = (AliESDv0*)tpcv0s->At(i);
-    quality[i]     = 1./(1.00001-v0->GetV0CosineOfPointingAngle());   //base point angle
-    // quality[i]    /= (0.5+v0->GetDist2());  
-    // quality[i]    *= v0->GetChi2After();               //density factor
-
-    Int_t index0 = v0->GetIndex(0);
-    Int_t index1 = v0->GetIndex(1);
-    //Bo:    Double_t minpulldca = TMath::Min(2.+pulldca[v0->GetIndex(0)],(2.+pulldca[v0->GetIndex(1)]) );     //pull
-    Double_t minpulldca = TMath::Min(2.+pulldca[index0],(2.+pulldca[index1]) );//Bo:
-
-
-
-    AliTPCseed * track0 = (AliTPCseed*)array->At(index0);
-    AliTPCseed * track1 = (AliTPCseed*)array->At(index1);
-    if (track0->TPCrPID(0)>0.3&&track1->TPCrPID(0)>0.3&&v0->GetAnglep()[2]<0.15) quality[i]+=1000000;              // gamma conversion candidate
-    if (track0->TPCrPID(4)>0.9||(track1->TPCrPID(4)>0.9&&minpulldca>4)) quality[i]*=10;    // lambda candidate candidate
-  }
-
-  TMath::Sort(ncandidates,quality,indexes,kTRUE);
-  //
-  //
-  for (Int_t i=0;i<ncandidates;i++){
-    AliESDv0 * v0 = (AliESDv0*)tpcv0s->At(indexes[i]);
-    if (!v0) continue;
-    Int_t index0 = v0->GetIndex(0);
-    Int_t index1 = v0->GetIndex(1);
-    AliTPCseed * track0 = (AliTPCseed*)array->At(index0);
-    AliTPCseed * track1 = (AliTPCseed*)array->At(index1);
-    if (!track0||!track1) {
-      printf("Bug\n");
-      continue;
-    }
-    Bool_t accept =kTRUE;  //default accept
-    Int_t *v0indexes0 = track0->GetV0Indexes();
-    Int_t *v0indexes1 = track1->GetV0Indexes();
-    //
-    Int_t order0 = (v0indexes0[0]!=0) ? 1:0;
-    Int_t order1 = (v0indexes1[0]!=0) ? 1:0;    
-    if (v0indexes0[1]!=0) order0 =2;
-    if (v0indexes1[1]!=0) order1 =2;      
-    //
-    if (v0indexes0[2]!=0) {order0=3; accept=kFALSE;}
-    if (v0indexes0[2]!=0) {order1=3; accept=kFALSE;}
-    //
-    AliESDv0 * v02 = v0;
-    if (accept){
-      //Bo:      v0->SetOrder(0,order0);
-      //Bo:      v0->SetOrder(1,order1);
-      //Bo:      v0->SetOrder(1,order0+order1);     
-      v0->SetOnFlyStatus(kTRUE);
-      Int_t index = esd->AddV0(v0);
-      v02 = esd->GetV0(index);
-      v0indexes0[order0]=index;
-      v0indexes1[order1]=index;
-      naccepted++;
-    }
-    {
-      Int_t eventNr = esd->GetEventNumberInFile(); // This is most likely NOT the event number you'd like to use. It has nothing to do with the 'real' event number
-      if (AliTPCReconstructor::StreamLevel()>1) {
-       Int_t lab0=track0->GetLabel();
-       Int_t lab1=track1->GetLabel();
-        TTreeSRedirector &cstream = *fDebugStreamer;
-       cstream<<"V02"<<
-       "Event="<<eventNr<<
-       "vertex.="<<v0<<        
-       "vertex2.="<<v02<<
-       "Tr0.="<<track0<<
-       "lab0="<<lab0<<
-       "Tr1.="<<track1<<
-       "lab1="<<lab1<<
-       "dca0="<<dca[index0]<<
-       "dca1="<<dca[index1]<<
-       "order0="<<order0<<
-       "order1="<<order1<<
-       "accept="<<accept<<
-       "quality="<<quality[i]<<
-       "pulldca0="<<pulldca[index0]<<
-       "pulldca1="<<pulldca[index1]<<
-       "index="<<i<<
-         "\n";}
-    }
-  }    
-
-
-  //
-  //
-  delete []quality;
-  delete []indexes;
-//
-  delete [] isPrim;
-  delete [] pulldca;
-  delete [] pulldcaz;
-  delete [] pulldcar;
-  delete [] cdcar;
-  delete [] sdcar;
-  delete [] dca;
-  //
-  delete[] z0;
-  delete[] alpha;
-  delete[] sign;
-  delete[] helixes;
-  printf("TPC V0 finder : naccepted\t%d\tncandidates\t%d\tntracks\t%d\tnall\t%d\n",naccepted,ncandidates,ntracks,nall);
-  timer.Print();
-}
 
 Int_t AliTPCtrackerMI::RefitKink(AliTPCseed &mother, AliTPCseed &daughter, const AliESDkink &knk)
 {
@@ -6085,11 +5863,13 @@ Int_t AliTPCtrackerMI::ReadSeeds(const TFile *inp) {
 Int_t AliTPCtrackerMI::Clusters2Tracks (AliESDEvent *const esd)
 {
   //
+  
   if (fSeeds) DeleteSeeds();
   fEvent = esd;
   Clusters2Tracks();
   if (!fSeeds) return 1;
   FillESD(fSeeds);
+  if (AliTPCReconstructor::StreamLevel()>3)  DumpClusters(0,fSeeds);
   return 0;
   //
 }
@@ -6305,6 +6085,9 @@ TObjArray * AliTPCtrackerMI::Tracking()
 
   TObjArray * seeds = new TObjArray;
   TObjArray * arr=0;
+  Int_t fLastSeedRowSec=AliTPCReconstructor::GetRecoParam()->GetLastSeedRowSec();
+  Int_t gapPrim = AliTPCReconstructor::GetRecoParam()->GetSeedGapPrim();
+  Int_t gapSec = AliTPCReconstructor::GetRecoParam()->GetSeedGapSec();
   
   Int_t gap =20;
   Float_t cuts[4];
@@ -6318,7 +6101,7 @@ TObjArray * AliTPCtrackerMI::Tracking()
   //  
   //find primaries  
   cuts[0]=0.0066;
-  for (Int_t delta = 0; delta<18; delta+=6){
+  for (Int_t delta = 0; delta<18; delta+=gapPrim){
     //
     cuts[0]=0.0070;
     cuts[1] = 1.5;
@@ -6343,7 +6126,7 @@ TObjArray * AliTPCtrackerMI::Tracking()
 
   //find primaries  
   cuts[0]=0.0077;
-  for (Int_t delta = 20; delta<120; delta+=10){
+  for (Int_t delta = 20; delta<120; delta+=gapPrim){
     //
     // seed high pt tracks
     cuts[0]=0.0060;
@@ -6396,9 +6179,22 @@ TObjArray * AliTPCtrackerMI::Tracking()
   SumTracks(seeds,arr);   
   SignClusters(seeds,fnumber,fdensity);   
   //
+  arr = Tracking(4,nup-5,nup-5-gap,cuts,-1);
+  SumTracks(seeds,arr);   
+  SignClusters(seeds,fnumber,fdensity);   
+  //
+  arr = Tracking(4,nup-7,nup-7-gap,cuts,-1);
+  SumTracks(seeds,arr);   
+  SignClusters(seeds,fnumber,fdensity);   
+  //
+  //
+  arr = Tracking(4,nup-9,nup-9-gap,cuts,-1);
+  SumTracks(seeds,arr);   
+  SignClusters(seeds,fnumber,fdensity);   
+  //
 
 
-  for (Int_t delta = 3; delta<30; delta+=5){
+  for (Int_t delta = 9; delta<30; delta+=gapSec){
     //
     cuts[0] = 0.3;
     cuts[1] = 1.5;
@@ -6421,10 +6217,9 @@ TObjArray * AliTPCtrackerMI::Tracking()
   fdensity = 2.;
   cuts[0]=0.0080;
 
-  Int_t fLastSeedRowSec=AliTPCReconstructor::GetRecoParam()->GetLastSeedRowSec();
 
   // find secondaries
-  for (Int_t delta = 30; delta<fLastSeedRowSec; delta+=10){
+  for (Int_t delta = 30; delta<fLastSeedRowSec; delta+=gapSec){
     //
     cuts[0] = 0.3;
     cuts[1] = 3.5;
@@ -6612,7 +6407,7 @@ void AliTPCtrackerMI::PrepareForBackProlongation(TObjArray *const arr,Float_t fa
       Float_t angle2 = pt->GetAlpha();
       
       if (TMath::Abs(angle1-angle2)>0.001){
-       pt->Rotate(angle1-angle2);
+       if (!pt->Rotate(angle1-angle2)) return;
        //angle2 = pt->GetAlpha();
        //pt->fRelativeSector = pt->GetAlpha()/fInnerSec->GetAlpha();
        //if (pt->GetAlpha()<0) 
@@ -6764,6 +6559,11 @@ void  AliTPCtrackerMI::GetShape(AliTPCseed * seed, Int_t row)
   Float_t zdrift = TMath::Abs((fkParam->GetZLength(0)-TMath::Abs(seed->GetZ())));
   Int_t type = (seed->GetSector() < fkParam->GetNSector()/2) ? 0: (row>126) ? 1:2;
   Double_t angulary  = seed->GetSnp();
+
+  if (TMath::Abs(angulary)>AliTPCReconstructor::GetMaxSnpTracker()) {
+    angulary = TMath::Sign(AliTPCReconstructor::GetMaxSnpTracker(),angulary);
+  }
+
   angulary = angulary*angulary/((1.-angulary)*(1.+angulary));
   Double_t angularz  = seed->GetTgl()*seed->GetTgl()*(1.+angulary);
   
@@ -6855,14 +6655,14 @@ void AliTPCtrackerMI::CookLabel(AliKalmanTrack *tk, Float_t wrong) const {
     if (TMath::Abs(c->GetLabel(1)) == lab ||
         TMath::Abs(c->GetLabel(2)) == lab ) max++;
   }
-
-  if ((1.- Float_t(max)/noc) > wrong) lab=-lab;
+  if (noc<=0) { lab=-1; return;}
+  if ((1.- Float_t(max)/(noc)) > wrong) lab=-lab;
 
   else {
      Int_t tail=Int_t(0.10*noc);
      max=0;
      Int_t ind=0;
-     for (i=1; i<=160&&ind<tail; i++) {
+     for (i=1; i<160&&ind<tail; i++) {
        //       AliTPCclusterMI *c=clusters[noc-i];
        AliTPCclusterMI *c=clusters[i];
        if (!c) continue;
@@ -6918,7 +6718,7 @@ Int_t AliTPCtrackerMI::CookLabel(AliTPCseed *const t, Float_t wrong,Int_t first,
      }
   }
   noc = current;
-  if (noc<5) return -1;
+  //if (noc<5) return -1;
   Int_t lab=123456789;
   for (i=0; i<noc; i++) {
     AliTPCclusterMI *c=clusters[i];
@@ -6939,14 +6739,14 @@ Int_t AliTPCtrackerMI::CookLabel(AliTPCseed *const t, Float_t wrong,Int_t first,
     if (TMath::Abs(c->GetLabel(1)) == lab ||
         TMath::Abs(c->GetLabel(2)) == lab ) max++;
   }
-
-  if ((1.- Float_t(max)/noc) > wrong) lab=-lab;
+  if (noc<=0) { lab=-1; return -1;}
+  if ((1.- Float_t(max)/(noc)) > wrong) lab=-lab;
 
   else {
      Int_t tail=Int_t(0.10*noc);
      max=0;
      Int_t ind=0;
-     for (i=1; i<=160&&ind<tail; i++) {
+     for (i=1; i<160&&ind<tail; i++) {
        //       AliTPCclusterMI *c=clusters[noc-i];
        AliTPCclusterMI *c=clusters[i];
        if (!c) continue;
@@ -7030,6 +6830,7 @@ void AliTPCtrackerMI::AddCovariance(AliTPCseed * seed){
   // !!!! the systematic error for element 4 is in 1/cm not in pt 
 
   const Double_t *param = AliTPCReconstructor::GetRecoParam()->GetSystematicError();
+  Double_t *covarIn= (Double_t*)seed->GetCovariance();
   Double_t covar[15];
   for (Int_t i=0;i<15;i++) covar[i]=0;
   // 0
@@ -7043,5 +6844,20 @@ void AliTPCtrackerMI::AddCovariance(AliTPCseed * seed){
   covar[9] = param[3]*param[3];
   Double_t facC =  AliTracker::GetBz()*kB2C;
   covar[14]= param[4]*param[4]*facC*facC;
+  //
+  covar[1]=TMath::Sqrt((covar[0]*covar[2]))*covarIn[1]/TMath::Sqrt((covarIn[0]*covarIn[2]));
+  //
+  covar[3]=TMath::Sqrt((covar[0]*covar[5]))*covarIn[3]/TMath::Sqrt((covarIn[0]*covarIn[5]));
+  covar[4]=TMath::Sqrt((covar[2]*covar[5]))*covarIn[4]/TMath::Sqrt((covarIn[2]*covarIn[5]));
+  //
+  covar[6]=TMath::Sqrt((covar[0]*covar[9]))*covarIn[6]/TMath::Sqrt((covarIn[0]*covarIn[9]));
+  covar[7]=TMath::Sqrt((covar[2]*covar[9]))*covarIn[7]/TMath::Sqrt((covarIn[2]*covarIn[9]));
+  covar[8]=TMath::Sqrt((covar[5]*covar[9]))*covarIn[8]/TMath::Sqrt((covarIn[5]*covarIn[9]));
+  //
+  covar[10]=TMath::Sqrt((covar[0]*covar[14]))*covarIn[10]/TMath::Sqrt((covarIn[0]*covarIn[14]));
+  covar[11]=TMath::Sqrt((covar[2]*covar[14]))*covarIn[11]/TMath::Sqrt((covarIn[2]*covarIn[14]));
+  covar[12]=TMath::Sqrt((covar[5]*covar[14]))*covarIn[12]/TMath::Sqrt((covarIn[5]*covarIn[14]));
+  covar[13]=TMath::Sqrt((covar[9]*covar[14]))*covarIn[13]/TMath::Sqrt((covarIn[9]*covarIn[14]));
+  //
   seed->AddCovariance(covar);
 }