The present commit corresponds to an important change in the way the
[u/mrichter/AliRoot.git] / TRD / AliTRD.cxx
index 12c4551..9b2adbe 100644 (file)
  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  **************************************************************************/
 
-/*
-$Log$
-Revision 1.20  2000/06/08 18:32:57  cblume
-Make code compliant to coding conventions
-
-Revision 1.19  2000/06/07 16:25:37  cblume
-Try to remove compiler warnings on Sun and HP
-
-Revision 1.18  2000/05/08 16:17:27  cblume
-Merge TRD-develop
-
-Revision 1.17.2.1  2000/05/08 14:28:59  cblume
-Introduced SetPHOShole() and SetRICHhole(). AliTRDrecPoint container is now a TObjArray
-
-Revision 1.17  2000/02/28 19:10:26  cblume
-Include the new TRD classes
-
-Revision 1.16.2.2  2000/02/28 17:53:24  cblume
-Introduce TRD geometry classes
-
-Revision 1.16.2.1  2000/02/28 17:04:19  cblume
-Include functions and data members for AliTRDrecPoint
-
-Revision 1.16  2000/01/19 17:17:35  fca
-Introducing a list of lists of hits -- more hits allowed for detector now
-
-Revision 1.15  1999/11/02 17:04:25  fca
-Small syntax change for HP compiler
-
-Revision 1.14  1999/11/02 16:57:02  fca
-Avoid non ansi warnings on HP compilers
-
-Revision 1.13  1999/11/02 16:35:56  fca
-New version of TRD introduced
-
-Revision 1.12  1999/11/01 20:41:51  fca
-Added protections against using the wrong version of FRAME
-
-Revision 1.11  1999/09/29 09:24:34  fca
-Introduction of the Copyright and cvs Log
-
-*/
+/* $Id$ */
 
 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
 //                                                                           //
@@ -64,205 +23,272 @@ Introduction of the Copyright and cvs Log
 //                                                                           //
 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
 
-#include <stdlib.h>
-
-#include <TMath.h>
-#include <TNode.h>
-#include <TPGON.h> 
+#include <TGeoGlobalMagField.h>
+#include <TVirtualMC.h>
+#include "AliMC.h"
+#include "AliMagF.h"
+#include "AliRun.h"
 
 #include "AliTRD.h"
-#include "AliRun.h"
-#include "AliConst.h"
 #include "AliTRDdigitizer.h"
-#include "AliTRDclusterizer.h"
-#include "AliTRDgeometryHole.h"
-#include "AliTRDgeometryFull.h"
-#include "AliTRDrecPoint.h"
+#include "AliTRDdigitsManager.h"
+#include "AliTRDgeometry.h"
+#include "AliTRDhit.h"
+#include "AliTRDrawData.h"
+#include "AliTRDSimParam.h"
+
 ClassImp(AliTRD)
  
 //_____________________________________________________________________________
 AliTRD::AliTRD()
+  :AliDetector()
+  ,fGeometry(0)
+  ,fGasDensity(0)
+  ,fFoilDensity(0)
+  ,fGasNobleFraction(0)
 {
   //
   // Default constructor
   //
-
-  fIshunt      = 0;
-  fGasMix      = 0;
-  fHits        = 0;
-  fDigits      = 0;
-
-  fRecPoints   = 0;
-  fNRecPoints  = 0;
-
-  fGeometry    = 0;
-
 }
  
 //_____________________________________________________________________________
 AliTRD::AliTRD(const char *name, const char *title)
-       : AliDetector(name,title)
+  :AliDetector(name,title)
+  ,fGeometry(0)
+  ,fGasDensity(0)
+  ,fFoilDensity(0)
+  ,fGasNobleFraction(0)
 {
   //
   // Standard constructor for the TRD
   //
 
-  // Check that FRAME is there otherwise we have no place where to
-  // put TRD
-  AliModule* frame = gAlice->GetModule("FRAME");
+  // Check that FRAME is there otherwise we have no place where to put TRD
+  AliModule *frame = gAlice->GetModule("FRAME");
   if (!frame) {
-    Error("Ctor","TRD needs FRAME to be present\n");
+    AliError("TRD needs FRAME to be present\n");
     exit(1);
   } 
 
-  // Define the TRD geometry according to the FRAME geometry
-  if      (frame->IsVersion() == 0) {
-    // Geometry with hole
-    fGeometry = new AliTRDgeometryHole();
-  }
-  else if (frame->IsVersion() == 1) {
-    // Geometry without hole
-    fGeometry = new AliTRDgeometryFull();
+  // Define the TRD geometry
+  if ((frame->IsVersion() == 0) ||
+      (frame->IsVersion() == 1)) {
+    fGeometry = new AliTRDgeometry();
   }
   else {
-    Error("Ctor","Could not find valid FRAME version\n");
+    AliError("Could not find valid FRAME version\n");
     exit(1);
   }
 
   // Allocate the hit array
-  fHits       = new TClonesArray("AliTRDhit"     ,405);
-  gAlice->AddHitList(fHits);
-
-  // Allocate the digits array
-  fDigits     = 0;
-
-  // Allocate the rec point array
-  fRecPoints  = new TObjArray(400);
-  fNRecPoints = 0;
-   
-  fIshunt = 0;
-  fGasMix = 0;
-
-  SetMarkerColor(kWhite);   
+  fHits = new TClonesArray("AliTRDhit",405);
+  gAlice->GetMCApp()->AddHitList(fHits);
 
 }
 
 //_____________________________________________________________________________
-AliTRD::AliTRD(const AliTRD &trd)
+AliTRD::~AliTRD()
 {
   //
-  // Copy constructor
+  // TRD destructor
   //
 
-  ((AliTRD &) trd).Copy(*this);
+  if (fGeometry) {
+    delete fGeometry;
+    fGeometry = 0;
+  }
+
+  if (fHits) {
+    delete fHits;
+    fHits     = 0;
+  }
 
 }
 
 //_____________________________________________________________________________
-AliTRD::~AliTRD()
+void AliTRD::Hits2Digits()
 {
   //
-  // TRD destructor
+  // Create digits
   //
 
-  fIshunt = 0;
+  AliTRDdigitizer digitizer("TRDdigitizer","TRD digitizer class");
+  AliLog::SetClassDebugLevel("TRDdigitizer",AliDebugLevel());
 
-  delete fGeometry;
-  delete fHits;
-  delete fRecPoints;
+  // Initialization
+  digitizer.InitDetector();
+    
+  if (!fLoader->TreeH()) {
+    fLoader->LoadHits("read");
+  }
+  fLoader->LoadDigits("recreate");
+
+  AliRunLoader *runLoader = fLoader->GetRunLoader(); 
+
+  for (Int_t iEvent = 0; iEvent < runLoader->GetNumberOfEvents(); iEvent++) {
+    runLoader->GetEvent(iEvent);
+    digitizer.Open(runLoader,iEvent);
+    digitizer.MakeDigits();
+    digitizer.WriteDigits();
+  }
+
+  fLoader->UnloadHits();
+  fLoader->UnloadDigits();
 
 }
 
 //_____________________________________________________________________________
-void AliTRD::AddRecPoint(Float_t *pos, Int_t *digits, Int_t det, Float_t amp)
+void AliTRD::Hits2SDigits()
 {
   //
-  // Add a reconstructed point for the TRD
+  // Create summable digits
   //
-  
-  AliTRDrecPoint *recPoint = new AliTRDrecPoint();
-  TVector3        posVec(pos[0],pos[1],pos[2]);
-  recPoint->SetLocalPosition(posVec);
-  recPoint->SetDetector(det);
-  recPoint->SetEnergy(amp);
-  for (Int_t iDigit = 0; iDigit < 3; iDigit++) {
-    recPoint->AddDigit(digits[iDigit]);
+
+  AliTRDdigitizer digitizer("TRDdigitizer","TRD digitizer class");
+  // For the summable digits
+  digitizer.SetSDigits(kTRUE);
+  AliLog::SetClassDebugLevel("TRDdigitizer",AliDebugLevel());
+
+  // Initialization
+  digitizer.InitDetector();
+    
+  if (!fLoader->TreeH()) {
+    fLoader->LoadHits("read");
   }
+  fLoader->LoadSDigits("recreate");
 
-  fRecPoints->Add(recPoint);
+  AliRunLoader *runLoader = fLoader->GetRunLoader(); 
+
+  for (Int_t iEvent = 0; iEvent < runLoader->GetNumberOfEvents(); iEvent++) {
+    runLoader->GetEvent(iEvent);
+    digitizer.Open(runLoader,iEvent);
+    digitizer.MakeDigits();
+    digitizer.WriteDigits();
+  }
 
+  fLoader->UnloadHits();
+  fLoader->UnloadSDigits();
+  
 }
 
 //_____________________________________________________________________________
-void AliTRD::AddDigit(Int_t *digits, Int_t *amp)
+AliDigitizer *AliTRD::CreateDigitizer(AliRunDigitizer *manager) const
 {
   //
-  // Add a digit for the TRD
+  // Creates a new digitizer object
   //
 
-  TClonesArray &ldigits = *fDigits;
-  new(ldigits[fNdigits++]) AliTRDdigit(kFALSE,digits,amp);
+  return new AliTRDdigitizer(manager);
 
 }
 
 //_____________________________________________________________________________
-void AliTRD::AddHit(Int_t track, Int_t *det, Float_t *hits)
+void AliTRD::SDigits2Digits()
 {
   //
-  // Add a hit for the TRD
+  // Create final digits from summable digits
   //
 
-  TClonesArray &lhits = *fHits;
-  new(lhits[fNhits++]) AliTRDhit(fIshunt,track,det,hits);
+  // Create the TRD digitizer
+  AliTRDdigitizer digitizer("TRDdigitizer","TRD digitizer class");  
+  AliLog::SetClassDebugLevel("TRDdigitizer",AliDebugLevel());
+
+  // Set the parameter
+  digitizer.SetEvent(gAlice->GetEvNumber());
+
+  // Initialization
+  digitizer.InitDetector();
+
+  // Read the s-digits via digits manager
+  AliTRDdigitsManager sdigitsManager;
+  AliLog::SetClassDebugLevel("TRDdigitisManager",AliDebugLevel());
+  sdigitsManager.SetSDigits(kTRUE);
+  sdigitsManager.CreateArrays();
+  
+  if (!fLoader->TreeS()) { 
+    if (fLoader->LoadSDigits("read")) {
+      return;
+    }
+  }
+  if (!fLoader->TreeS()) {
+    AliError(Form("Error while reading SDigits for event %d",gAlice->GetEvNumber()));
+    return;
+  }
+  
+  sdigitsManager.ReadDigits(fLoader->TreeS());
+
+  // Add the s-digits to the input list 
+  digitizer.AddSDigitsManager(&sdigitsManager);
+
+  // Convert the s-digits to normal digits
+  digitizer.SDigits2Digits();
+
+  // Store the digits
+  if (!fLoader->TreeD()) {
+    fLoader->MakeTree("D");
+  }
+  if (digitizer.MakeBranch(fLoader->TreeD())){
+    digitizer.WriteDigits();
+  }
 
 }
 
 //_____________________________________________________________________________
-void AliTRD::BuildGeometry()
+void AliTRD::Digits2Raw() 
 {
   //
-  // Create the ROOT TNode geometry for the TRD
+  // Convert digits of the current event to raw data
   //
 
-  TNode *node, *top;
-  TPGON *pgon;
-  const Int_t kColorTRD = 46;
-  
-  // Find the top node alice
-  top = gAlice->GetGeometry()->GetNode("alice");
-  
-  pgon = new TPGON("S_TRD","TRD","void",0,360,kNsect,4);
-  Float_t ff    = TMath::Cos(kDegrad * 180 / kNsect);
-  Float_t rrmin = kRmin / ff;
-  Float_t rrmax = kRmax / ff;
-  pgon->DefineSection(0,-kZmax1,rrmax,rrmax);
-  pgon->DefineSection(1,-kZmax2,rrmin,rrmax);
-  pgon->DefineSection(2, kZmax2,rrmin,rrmax);
-  pgon->DefineSection(3, kZmax1,rrmax,rrmax);
-  top->cd();
-  node = new TNode("TRD","TRD","S_TRD",0,0,0,"");
-  node->SetLineColor(kColorTRD);
-  fNodes->Add(node);
+  fLoader->LoadDigits();
+  TTree *digits = fLoader->TreeD();
+  if (!digits) {
+    AliError("No digits tree");
+    return;
+  }
+
+  AliTRDrawData rawWriter;
+  if (!rawWriter.Digits2Raw(digits)) {
+    AliError("The raw writer could not load the digits tree");
+  }
+
+  fLoader->UnloadDigits();
 
 }
+
 //_____________________________________________________________________________
-void AliTRD::Copy(TObject &trd)
+void AliTRD::AddHit(Int_t track, Int_t det, Float_t *hits, Int_t q
+                  , Float_t time, Bool_t inDrift)
 {
   //
-  // Copy function
-  //
+  // Add a hit for the TRD
+  // 
 
-  ((AliTRD &) trd).fGasMix     = fGasMix;
-  ((AliTRD &) trd).fGeometry   = fGeometry;
-  ((AliTRD &) trd).fRecPoints  = fRecPoints;
-  ((AliTRD &) trd).fNRecPoints = fNRecPoints;
+  TClonesArray &lhits = *fHits;
+  AliTRDhit *hit = new(lhits[fNhits++]) AliTRDhit(fIshunt
+                                                 ,track
+                                                 ,det
+                                                 ,hits
+                                                 ,q
+                                                 ,time);
+
+  if (inDrift) {
+    hit->SetDrift();
+  }
+  else {
+    hit->SetAmplification();
+  }
 
-  //AliDetector::Copy(trd);
+  if (q < 0) {
+    hit->SetTRphoton();
+  }
 
 }
-
 //_____________________________________________________________________________
 void AliTRD::CreateGeometry()
 {
@@ -271,239 +297,219 @@ void AliTRD::CreateGeometry()
   //
 
   // Check that FRAME is there otherwise we have no place where to put the TRD
-  AliModule* frame = gAlice->GetModule("FRAME");
+  AliModule *frame = gAlice->GetModule("FRAME");
   if (!frame) {
-    printf(" The TRD needs the FRAME to be defined first\n");
-    return;
+    AliFatal("The TRD needs the FRAME to be defined first");
   }
 
   fGeometry->CreateGeometry(fIdtmed->GetArray() - 1299);
 
 }
+
 //_____________________________________________________________________________
 void AliTRD::CreateMaterials()
 {
   //
   // Create the materials for the TRD
-  // Origin Y.Foka
   //
 
-  Int_t   isxfld = gAlice->Field()->Integ();
-  Float_t sxmgmx = gAlice->Field()->Max();
+  Int_t   isxfld = ((AliMagF*)TGeoGlobalMagField::Instance()->GetField())->Integ();
+  Float_t sxmgmx = ((AliMagF*)TGeoGlobalMagField::Instance()->GetField())->Max();
   
   // For polyethilene (CH2) 
-  Float_t ape[2] = { 12., 1. };
-  Float_t zpe[2] = {  6., 1. };
-  Float_t wpe[2] = {  1., 2. };
-  Float_t dpe    = 0.95;
-
-  // For mylar (C5H4O2) 
-  Float_t amy[3] = { 12., 1., 16. };
-  Float_t zmy[3] = {  6., 1.,  8. };
-  Float_t wmy[3] = {  5., 4.,  2. };
-  Float_t dmy    = 1.39;
+  Float_t ape[2]    = { 12.011 ,  1.0079 };
+  Float_t zpe[2]    = {  6.0   ,  1.0    };
+  Float_t wpe[2]    = {  1.0   ,  2.0    };
+  Float_t dpe       = 0.95;
 
   // For CO2 
-  Float_t aco[2] = { 12., 16. };
-  Float_t zco[2] = {  6.,  8. };
-  Float_t wco[2] = {  1.,  2. };
-  Float_t dco    = 0.001977;
+  Float_t aco[2]    = { 12.011 , 15.9994 };
+  Float_t zco[2]    = {  6.0   ,  8.0    };
+  Float_t wco[2]    = {  1.0   ,  2.0    };
+  Float_t dco       = 0.00186; // at 20C
 
   // For water
-  Float_t awa[2] = {  1., 16. };
-  Float_t zwa[2] = {  1.,  8. };
-  Float_t wwa[2] = {  2.,  1. };
-  Float_t dwa    = 1.0;
-
-  // For isobutane (C4H10)
-  Float_t ais[2] = { 12.,  1. };
-  Float_t zis[2] = {  6.,  1. };
-  Float_t wis[2] = {  4., 10. };
-  Float_t dis    = 0.00267;
+  Float_t awa[2]    = {  1.0079, 15.9994 };
+  Float_t zwa[2]    = {  1.0   ,  8.0    };
+  Float_t wwa[2]    = {  2.0   ,  1.0    };
+  Float_t dwa       = 1.0;
+
+  // For plexiglas (C5H8O2)
+  Float_t apg[3]    = { 12.011 ,  1.0079, 15.9994 };
+  Float_t zpg[3]    = {  6.0   ,  1.0   ,  8.0    };
+  Float_t wpg[3]    = {  5.0   ,  8.0   ,  2.0    };
+  Float_t dpg       = 1.18; 
+  
+  // For epoxy (C18H19O3)
+  Float_t aEpoxy[3] = { 15.9994,  1.0079, 12.011  }; 
+  Float_t zEpoxy[3] = {  8.0   ,  1.0   ,  6.0    }; 
+  Float_t wEpoxy[3] = {  3.0   , 19.0   , 18.0    }; 
+  Float_t dEpoxy    = 1.8 ; 
+
+  // For Araldite, low density epoxy (C18H19O3)
+  Float_t aAral[3]  = { 15.9994,  1.0079, 12.011  }; 
+  Float_t zAral[3]  = {  8.0   ,  1.0   ,  6.0    }; 
+  Float_t wAral[3]  = {  3.0   , 19.0   , 18.0    }; 
+  Float_t dAral     = 1.05; 
+
+  // For air  
+  Float_t aAir[4]   = { 12.011   , 14.0     , 15.9994  , 36.0      };
+  Float_t zAir[4]   = {  6.0     ,  7.0     ,  8.0     , 18.0      };
+  Float_t wAir[4]   = {  0.000124,  0.755267,  0.231781,  0.012827 };
+  Float_t dAir      = 1.20479e-03;
+
+  // For G10
+  Float_t aG10[4]   = {  1.0079  , 12.011   , 15.9994  , 28.086    };
+  Float_t zG10[4]   = {  1.0     ,  6.0     ,  8.0     , 14.0      };
+  Float_t wG10[4]   = {  0.15201 ,  0.10641 ,  0.49444 ,  0.24714  };
+  Float_t dG10      = 1.7;
 
   // For Xe/CO2-gas-mixture 
-  // Xe-content of the Xe/CO2-mixture (90% / 10%) 
-  Float_t fxc    = .90;
-  // Xe-content of the Xe/Isobutane-mixture (97% / 3%) 
-  Float_t fxi    = .97;
-  Float_t dxe    = .005858;
+  Float_t aXeCO2[3] = { 131.29   ,  12.0107 ,  15.9994  };
+  Float_t zXeCO2[3] = {  54.0    ,   6.0    ,   8.0     };
+  Float_t wXeCO2[3] = {   8.5    ,   1.5    ,   3.0     }; 
+  // Xe-content of the Xe/CO2-mixture (85% / 15%) 
+  Float_t fxc       = 0.85;
+  Float_t dxe       = 0.00549; // at 20C
+  Float_t dgmXe     = fxc * dxe + (1.0 - fxc) * dco;
+
+  // For Ar/CO2-gas-mixture
+  Float_t aArCO2[3] = {  39.948  ,  12.0107 ,  15.9994  };
+  Float_t zArCO2[3] = {  18.0    ,   6.0    ,   8.0     };
+  Float_t wArCO2[3] = {   8.2    ,   1.8    ,   3.6     }; 
+  // Ar-content of the Ar/CO2-mixture (82% / 18%) 
+  Float_t fac       = 0.82;
+  Float_t dar       = 0.00166; // at 20C
+  Float_t dgmAr     = fac * dar + (1.0 - fac) * dco;
   
   // General tracking parameter
-  Float_t tmaxfd = -10.;
-  Float_t stemax = -1e10;
-  Float_t deemax = -0.1;
-  Float_t epsil  =  1e-4;
-  Float_t stmin  = -0.001;
-  
-  Float_t absl, radl, d, buf[1];
-  Float_t agm[2], dgm, zgm[2], wgm[2];
-  Int_t   nbuf;
+  Float_t tmaxfd    = -10.0;
+  Float_t stemax    = -1.0e10;
+  Float_t deemax    = -0.1;
+  Float_t epsil     =  1.0e-4;
+  Float_t stmin     = -0.001;
   
   //////////////////////////////////////////////////////////////////////////
   //     Define Materials 
   //////////////////////////////////////////////////////////////////////////
 
-  AliMaterial( 1, "Al $",  26.98, 13.0, 2.7     ,     8.9 ,    37.2);
-  AliMaterial( 2, "Air$",  14.61,  7.3, 0.001205, 30420.0 , 67500.0);
-  AliMaterial( 4, "Xe $", 131.29, 54.0, dxe     ,  1447.59,     0.0);
-  AliMaterial( 5, "Cu $",  63.54, 29.0, 8.96    ,     1.43,    14.8);
-  AliMaterial( 6, "C  $",  12.01,  6.0, 2.265   ,    18.8 ,    74.4);
-  AliMaterial(12, "G10$",  20.00, 10.0, 1.7     ,    19.4 ,   999.0);
+  AliMaterial( 1, "Al"   ,  26.98, 13.0, 2.7     ,     8.9 ,    37.2);
+  AliMaterial( 4, "Xe"   , 131.29, 54.0, dxe     ,  1546.16,     0.0);
+  AliMaterial( 5, "Cu"   ,  63.54, 29.0, 8.96    ,     1.43,    14.8);
+  AliMaterial( 6, "C"    ,  12.01,  6.0, 2.265   ,    18.8 ,    74.4);
+  AliMaterial(15, "Sn"   , 118.71, 50.0, 7.31    ,     1.21,    14.8);
+  AliMaterial(16, "Si"   ,  28.09, 14.0, 2.33    ,     9.36,    37.2);
+  AliMaterial(18, "Fe"   ,  55.85, 26.0, 7.87    ,     1.76,    14.8);
 
   // Mixtures 
-  AliMixture(3, "Polyethilene$",   ape, zpe, dpe, -2, wpe);
-  AliMixture(7, "Mylar$",          amy, zmy, dmy, -3, wmy);
-  AliMixture(8, "CO2$",            aco, zco, dco, -2, wco);
-  AliMixture(9, "Isobutane$",      ais, zis, dis, -2, wis);
-  AliMixture(13,"Water$",          awa, zwa, dwa, -2, wwa);
-
-  // Gas mixtures
-  Char_t namate[21];
-  // Xe/CO2-mixture
-  // Get properties of Xe 
-  gMC->Gfmate((*fIdmate)[4], namate, agm[0], zgm[0], d, radl, absl, buf, nbuf);
-  // Get properties of CO2 
-  gMC->Gfmate((*fIdmate)[8], namate, agm[1], zgm[1], d, radl, absl, buf, nbuf);
-  // Create gas mixture 
-  wgm[0] = fxc;
-  wgm[1] = 1. - fxc;
-  dgm    = wgm[0] * dxe + wgm[1] * dco;
-  AliMixture(10, "Gas mixture 1$", agm, zgm, dgm,  2, wgm);
-  // Xe/Isobutane-mixture
-  // Get properties of Xe 
-  gMC->Gfmate((*fIdmate)[4], namate, agm[0], zgm[0], d, radl, absl, buf, nbuf);
-  // Get properties of Isobutane
-  gMC->Gfmate((*fIdmate)[9], namate, agm[1], zgm[1], d, radl, absl, buf, nbuf);
-  // Create gas mixture 
-  wgm[0] = fxi;
-  wgm[1] = 1. - fxi;
-  dgm    = wgm[0] * dxe + wgm[1] * dis;
-  AliMixture(11, "Gas mixture 2$", agm, zgm, dgm,  2, wgm);
+  AliMixture(2, "Air"         , aAir,   zAir,   dAir,    4, wAir  );
+  AliMixture(3, "Polyethilene", ape,    zpe,    dpe,    -2, wpe   );
+  AliMixture(8, "CO2",          aco,    zco,    dco,    -2, wco   );
+  if      (AliTRDSimParam::Instance()->IsXenon()) {
+    AliMixture(10,"XeCO2",        aXeCO2, zXeCO2, dgmXe,  -3, wXeCO2);
+  }
+  else if (AliTRDSimParam::Instance()->IsArgon()) {
+    AliInfo("Gas mixture: Ar C02 (80/20)");
+    AliMixture(10,"ArCO2",        aArCO2, zArCO2, dgmAr,  -3, wArCO2);
+  }
+  else {
+    AliFatal("Wrong gas mixture");
+    exit(1);
+  }
+  AliMixture(12,"G10",          aG10,   zG10,   dG10,    4, wG10  );
+  AliMixture(13,"Water",        awa,    zwa,    dwa,    -2, wwa   );
+  AliMixture(14,"Plexiglas",    apg,    zpg,    dpg,    -3, wpg   );
+  AliMixture(17,"Epoxy",        aEpoxy, zEpoxy, dEpoxy, -3, wEpoxy);
+  AliMixture(19,"Araldite",     aAral,  zAral,  dAral,  -3, wAral );
+
   //////////////////////////////////////////////////////////////////////////
   //     Tracking Media Parameters 
   //////////////////////////////////////////////////////////////////////////
 
   // Al Frame 
-  AliMedium(1, "Al Frame$",   1, 0, isxfld, sxmgmx
-                , tmaxfd, stemax, deemax, epsil, stmin);
+  AliMedium( 1,"Al Frame"   , 1,0,isxfld,sxmgmx
+              ,tmaxfd,stemax,deemax,epsil,stmin);
   // Air 
-  AliMedium(2, "Air$",        2, 0, isxfld, sxmgmx
-                , tmaxfd, stemax, deemax, epsil, stmin);
-  // Polyethilene 
-  AliMedium(3, "Radiator$",   3, 0, isxfld, sxmgmx
-                , tmaxfd, stemax, deemax, epsil, stmin);
-  // Xe 
-  AliMedium(4, "Xe$",         4, 1, isxfld, sxmgmx
-                , tmaxfd, stemax, deemax, epsil, stmin);
+  AliMedium( 2,"Air"        , 2,0,isxfld,sxmgmx
+              ,tmaxfd,stemax,deemax,epsil,stmin);
+  // Wires
+  AliMedium( 3,"Wires"      , 5,0,isxfld,sxmgmx
+              ,tmaxfd,stemax,deemax,epsil,stmin);
+  // All other ROB materials (caps, etc.)
+  AliMedium( 4,"ROB Other"  , 5,0,isxfld,sxmgmx
+              ,tmaxfd,stemax,deemax,epsil,stmin);
   // Cu pads 
-  AliMedium(5, "Padplane$",   5, 1, isxfld, sxmgmx
-                , tmaxfd, stemax, deemax, epsil, stmin);
+  AliMedium( 5,"Padplane"   , 5,1,isxfld,sxmgmx
+              ,tmaxfd,stemax,deemax,epsil,stmin);
   // Fee + cables 
-  AliMedium(6, "Readout$",    1, 0, isxfld, sxmgmx
-                , tmaxfd, stemax, deemax, epsil, stmin);
+  AliMedium( 6,"Readout"    , 5,0,isxfld,sxmgmx
+              ,tmaxfd,stemax,deemax,epsil,stmin);
   // C frame 
-  AliMedium(7, "C Frame$",    6, 0, isxfld, sxmgmx
-                , tmaxfd, stemax, deemax, epsil, stmin);
-  // Mylar foils 
-  AliMedium(8, "Mylar$",      7, 0, isxfld, sxmgmx
-                , tmaxfd, stemax, deemax, epsil, stmin);
-  if (fGasMix == 1) {
-    // Gas-mixture (Xe/CO2) 
-    AliMedium(9, "Gas-mix$",   10, 1, isxfld, sxmgmx
-                  , tmaxfd, stemax, deemax, epsil, stmin);
-  }
-  else {
-    // Gas-mixture (Xe/Isobutane) 
-    AliMedium(9, "Gas-mix$",   11, 1, isxfld, sxmgmx
-                  , tmaxfd, stemax, deemax, epsil, stmin);
-  }
-  // Nomex-honeycomb (use carbon for the time being) 
-  AliMedium(10, "Nomex$",      6, 0, isxfld, sxmgmx
-                , tmaxfd, stemax, deemax, epsil, stmin);
-  // Kapton foils (use Mylar for the time being) 
-  AliMedium(11, "Kapton$",     7, 0, isxfld, sxmgmx
-                , tmaxfd, stemax, deemax, epsil, stmin);
-  // Gas-filling of the radiator 
-  AliMedium(12, "CO2$",        8, 0, isxfld, sxmgmx
-                , tmaxfd, stemax, deemax, epsil, stmin);
+  AliMedium( 7,"C Frame"    , 6,0,isxfld,sxmgmx
+              ,tmaxfd,stemax,deemax,epsil,stmin);
+  // INOX of cooling bus bars
+  AliMedium( 8,"Cooling bus",18,0,isxfld,sxmgmx
+              ,tmaxfd,stemax,deemax,epsil,stmin);
+  // Gas-mixture (Xe/CO2) 
+  AliMedium( 9,"Gas-mix"    ,10,1,isxfld,sxmgmx
+              ,tmaxfd,stemax,deemax,epsil,stmin);
+  // Nomex-honeycomb
+  AliMedium(10,"Nomex"      ,12,0,isxfld,sxmgmx
+              ,tmaxfd,stemax,deemax,epsil,stmin);
+  // Araldite glue
+  AliMedium(11,"Glue"       ,19,0,isxfld,sxmgmx
+              ,tmaxfd,stemax,deemax,epsil,stmin);
   // G10-plates
-  AliMedium(13, "G10-plates$",12, 0, isxfld, sxmgmx
-                , tmaxfd, stemax, deemax, epsil, stmin);
+  AliMedium(13,"G10-plates" ,12,0,isxfld,sxmgmx
+              ,tmaxfd,stemax,deemax,epsil,stmin);
   // Cooling water
-  AliMedium(14, "Water$",     13, 0, isxfld, sxmgmx
-                , tmaxfd, stemax, deemax, epsil, stmin);
-
-}
-
-//_____________________________________________________________________________
-void AliTRD::DrawModule()
-{
-  //
-  // Draw a shaded view of the Transition Radiation Detector version 0
-  //
-
-  // Set everything unseen
-  gMC->Gsatt("*"   ,"SEEN",-1);
-  
-  // Set ALIC mother transparent
-  gMC->Gsatt("ALIC","SEEN", 0);
-  
-  // Set the volumes visible
-  if (fGeometry->IsVersion() == 0) {
-    gMC->Gsatt("B071","SEEN", 0);
-    gMC->Gsatt("B074","SEEN", 0);
-    gMC->Gsatt("B075","SEEN", 0);
-    gMC->Gsatt("B077","SEEN", 0);
-    gMC->Gsatt("BTR1","SEEN", 0);
-    gMC->Gsatt("BTR2","SEEN", 0);
-    gMC->Gsatt("BTR3","SEEN", 0);
-    gMC->Gsatt("TRD1","SEEN", 0);
-    gMC->Gsatt("TRD2","SEEN", 0);
-    gMC->Gsatt("TRD3","SEEN", 0);
+  AliMedium(14,"Water"      ,13,0,isxfld,sxmgmx
+              ,tmaxfd,stemax,deemax,epsil,stmin);
+  // Rohacell (plexiglas) for the radiator
+  AliMedium(15,"Rohacell"   ,14,0,isxfld,sxmgmx
+              ,tmaxfd,stemax,deemax,epsil,stmin);
+  // Al layer in MCMs
+  AliMedium(16,"MCM-Al"     , 1,0,isxfld,sxmgmx
+              ,tmaxfd,stemax,deemax,epsil,stmin);
+  // Sn layer in MCMs
+  AliMedium(17,"MCM-Sn"     ,15,0,isxfld,sxmgmx
+              ,tmaxfd,stemax,deemax,epsil,stmin);
+  // Cu layer in MCMs
+  AliMedium(18,"MCM-Cu"     , 5,0,isxfld,sxmgmx
+              ,tmaxfd,stemax,deemax,epsil,stmin);
+  // G10 layer in MCMs
+  AliMedium(19,"MCM-G10"    ,12,0,isxfld,sxmgmx
+              ,tmaxfd,stemax,deemax,epsil,stmin);
+  // Si in readout chips
+  AliMedium(20,"Chip-Si"    ,16,0,isxfld,sxmgmx
+              ,tmaxfd,stemax,deemax,epsil,stmin);
+  // Epoxy in readout chips
+  AliMedium(21,"Chip-Ep"    ,17,0,isxfld,sxmgmx
+              ,tmaxfd,stemax,deemax,epsil,stmin);
+  // PE in connectors
+  AliMedium(22,"Conn-PE"    , 3,0,isxfld,sxmgmx
+              ,tmaxfd,stemax,deemax,epsil,stmin);
+  // Cu in connectors
+  AliMedium(23,"Chip-Cu"    , 5,0,isxfld,sxmgmx
+              ,tmaxfd,stemax,deemax,epsil,stmin);
+  // Al of cooling pipes
+  AliMedium(24,"Cooling"    , 1,0,isxfld,sxmgmx
+              ,tmaxfd,stemax,deemax,epsil,stmin);
+  // Cu in services
+  AliMedium(25,"Serv-Cu"    , 5,0,isxfld,sxmgmx
+              ,tmaxfd,stemax,deemax,epsil,stmin);
+
+  // Save the density values for the TRD absorbtion
+  Float_t dmy  = 1.39;
+  fFoilDensity = dmy;
+  if      (AliTRDSimParam::Instance()->IsXenon()) {
+    fGasDensity       = dgmXe;
+    fGasNobleFraction = fxc;
   }
-  else {
-    gMC->Gsatt("B071","SEEN", 0);
-    gMC->Gsatt("B074","SEEN", 0);
-    gMC->Gsatt("B075","SEEN", 0);
-    gMC->Gsatt("B077","SEEN", 0);
-    gMC->Gsatt("BTR1","SEEN", 0);
-    gMC->Gsatt("BTR2","SEEN", 0);
-    gMC->Gsatt("BTR3","SEEN", 0);
-    gMC->Gsatt("TRD1","SEEN", 0);
-    if (fGeometry->GetPHOShole())
-      gMC->Gsatt("TRD2","SEEN", 0);
-    if (fGeometry->GetRICHhole())
-      gMC->Gsatt("TRD3","SEEN", 0);
+  else if (AliTRDSimParam::Instance()->IsArgon()) {
+    fGasDensity       = dgmAr;
+    fGasNobleFraction = fac;
   }
-  gMC->Gsatt("UCII","SEEN", 0);
-  gMC->Gsatt("UCIM","SEEN", 0);
-  gMC->Gsatt("UCIO","SEEN", 0);
-  gMC->Gsatt("UL02","SEEN", 1);
-  gMC->Gsatt("UL05","SEEN", 1);
-  gMC->Gsatt("UL06","SEEN", 1);
-  
-  gMC->Gdopt("hide", "on");
-  gMC->Gdopt("shad", "on");
-  gMC->Gsatt("*", "fill", 7);
-  gMC->SetClipBox(".");
-  gMC->SetClipBox("*", 0, 2000, -2000, 2000, -2000, 2000);
-  gMC->DefaultRange();
-  gMC->Gdraw("alic", 40, 30, 0, 12, 9.4, .021, .021);
-  gMC->Gdhead(1111, "Transition Radiation Detector");
-  gMC->Gdman(18, 4, "MAN");
-
-}
-
-//_____________________________________________________________________________
-Int_t AliTRD::DistancetoPrimitive(Int_t , Int_t )
-{
-  //
-  // Distance between the mouse and the TRD detector on the screen
-  // Dummy routine
-  
-  return 9999;
 
 }
  
@@ -514,110 +520,95 @@ void AliTRD::Init()
   // Initialize the TRD detector after the geometry has been created
   //
 
-  Int_t i;
-
-  printf("\n");
-  for (i = 0; i < 35; i++) printf("*");
-  printf(" TRD_INIT ");
-  for (i = 0; i < 35; i++) printf("*");
-  printf("\n");
-  printf("\n");
+  AliDebug(1,"++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++");
 
-  if      (fGeometry->IsVersion() == 0) {
-    printf("          Geometry for spaceframe with holes initialized.\n\n");
-  }
-  else if (fGeometry->IsVersion() == 1) {
-    printf("          Geometry for spaceframe without holes initialized.\n");
-    if (fGeometry->GetPHOShole())
-      printf("          Leave space in front of PHOS free.\n");
-    if (fGeometry->GetRICHhole())
-      printf("          Leave space in front of RICH free.\n");
-    printf("\n");
+  if (fGeometry->IsVersion() != 1) {
+    AliError("Not a valid geometry");
   }
 
-  if (fGasMix == 1)
-    printf("          Gas Mixture: 90%% Xe + 10%% CO2\n\n");
-  else
-    printf("          Gas Mixture: 97%% Xe + 3%% Isobutane\n\n");
+  // Special tracking options for charged particles for XeCO2
+  gMC->Gstpar((* fIdtmed)[9],"DRAY"    , 1.0);
+  gMC->Gstpar((* fIdtmed)[9],"STRA"    , 1.0); 
+  gMC->Gstpar((* fIdtmed)[9],"LOSS"    ,13.0);      // Specific energy loss
+  gMC->Gstpar((* fIdtmed)[9],"PRIMIO_E",23.53);     // 1st ionisation potential
+  gMC->Gstpar((* fIdtmed)[9],"PRIMIO_N",19.344431); // Number of primaries
 
 }
 
 //_____________________________________________________________________________
-void AliTRD::MakeBranch(Option_t* option)
+void AliTRD::ResetDigits()
 {
   //
-  // Create Tree branches for the TRD digits and cluster.
+  // Reset number of digits and the digits array for this detector
   //
 
-  Int_t  buffersize = 4000;
-  Char_t branchname[15];
-
-  AliDetector::MakeBranch(option);
+  fNdigits = 0;
 
-  Char_t *r = strstr(option,"R");
-  sprintf(branchname,"%srecPoints",GetName());
-  if (fRecPoints && gAlice->TreeR() && r) {
-    gAlice->TreeR()->Branch(branchname,fRecPoints->IsA()->GetName()
-                           ,&fRecPoints,buffersize,0);
-    printf("* AliTRD::MakeBranch * Making Branch %s for points in TreeR\n",branchname);
+  if (fDigits) {
+    fDigits->Clear();
   }
 
 }
 
 //_____________________________________________________________________________
-void AliTRD::ResetRecPoints()
+void AliTRD::SetTreeAddress()
 {
   //
-  // Reset number of reconstructed points and the point array
+  // Set the branch addresses for the trees.
   //
 
-  fNRecPoints = 0;
-  if (fRecPoints) fRecPoints->Delete();
+  if (fLoader->TreeH() && 
+      (fHits == 0x0)) {
+    fHits = new TClonesArray("AliTRDhit",405);
+  }
+  AliDetector::SetTreeAddress();
 
 }
 
 //_____________________________________________________________________________
-void AliTRD::SetTreeAddress()
+Bool_t AliTRD::Raw2SDigits(AliRawReader *rawReader)
 {
   //
-  // Set the branch addresses for the trees.
+  // Converts RAW data to SDigits
   //
 
-  Char_t branchname[15];
-
-  AliDetector::SetTreeAddress();
-
-  TBranch *branch;
-  TTree   *treeR = gAlice->TreeR();
+  AliLoader *loader = fRunLoader->GetLoader("TRDLoader");
+  if (!loader) {
+    AliError("Can not get TRD loader from Run Loader");
+    return kFALSE;
+  }
+    
+  TTree *tree = 0;
+  tree = loader->TreeS();
+  if (!tree) {
+    loader->MakeTree("S");
+    tree = loader->TreeS();
+  }
 
-  if (treeR) {
-    sprintf(branchname,"%srecPoints",GetName());
-    if (fRecPoints) {
-      branch = treeR->GetBranch(branchname);
-      if (branch) {
-        branch->SetAddress(&fRecPoints);
-      }
-    }
+  AliTRDrawData       *rawdata        = new AliTRDrawData();
+  AliTRDdigitsManager *sdigitsManager = rawdata->Raw2Digits(rawReader);
+  if (sdigitsManager) {
+    sdigitsManager->SetSDigits(kTRUE);
+    sdigitsManager->MakeBranch(tree);
+    sdigitsManager->WriteDigits();
+    return kTRUE;
+  } 
+  else {
+    return kFALSE;
   }
 
 }
 
 //_____________________________________________________________________________
-void AliTRD::SetGasMix(Int_t imix)
+AliLoader* AliTRD::MakeLoader(const char* topfoldername)
 {
-  //
-  // Defines the gas mixture (imix=0:  Xe/Isobutane imix=1: Xe/CO2)
-  //
-  
-  if ((imix < 0) || (imix > 1)) {
-    printf("Wrong input value: %d\n",imix);
-    printf("Use standard setting\n");
-    fGasMix = 0;
-    return;
-  }
+ fLoader = new AliLoader(GetName(),topfoldername);
 
-  fGasMix = imix;
+ AliInfo("Adding Tracklets-loader");
+ AliDataLoader *dl = new AliDataLoader("TRD.Tracklets.root","tracklets", "tracklets");
+ fLoader->AddDataLoader(dl);
 
+ return fLoader;
 }
 
 //_____________________________________________________________________________
@@ -627,7 +618,10 @@ AliTRD &AliTRD::operator=(const AliTRD &trd)
   // Assignment operator
   //
 
-  if (this != &trd) ((AliTRD &) trd).Copy(*this);
+  if (this != &trd) {
+    ((AliTRD &) trd).Copy(*this);
+  }
+
   return *this;
 
 }