]> git.uio.no Git - u/mrichter/AliRoot.git/blobdiff - TRD/AliTRDdigitizer.cxx
gAlice now only read by AliRunDigitizer. Therefore it is just deleted in AliTRDmerge.C
[u/mrichter/AliRoot.git] / TRD / AliTRDdigitizer.cxx
index c0c022359a98d7d5df4d23b80c1f32395512185d..9c6c06b250d3f98556a6393df89eb87f5ac8999c 100644 (file)
 
 /*
 $Log$
+Revision 1.37  2002/04/29 11:50:47  cblume
+Change initialization of gAlice in the merging case
+
+Revision 1.36  2002/04/12 12:13:23  cblume
+Add Jiris changes
+
+Revision 1.35  2002/03/28 14:59:07  cblume
+Coding conventions
+
+Revision 1.34  2002/03/25 20:00:44  cblume
+Introduce parameter class and regions of interest for merging
+
+Revision 1.33  2002/02/12 17:32:03  cblume
+Rearrange the deleting of the list of sdigitsmanager
+
+Revision 1.32  2002/02/12 16:07:21  cblume
+Add new constructor
+
+Revision 1.31  2002/02/11 14:27:11  cblume
+New pad plane design, new TRF+PRF, tail cancelation, cross talk
+
+Revision 1.30  2001/11/19 08:44:08  cblume
+Fix bugs reported by Rene
+
+Revision 1.29  2001/11/14 19:44:25  hristov
+Numeric const casted (Alpha)
+
+Revision 1.28  2001/11/14 16:35:58  cblume
+Inherits now from AliDetector
+
+Revision 1.27  2001/11/14 10:50:45  cblume
+Changes in digits IO. Add merging of summable digits
+
+Revision 1.26  2001/11/06 17:19:41  cblume
+Add detailed geometry and simple simulator
+
+Revision 1.25  2001/06/27 09:54:44  cblume
+Moved fField initialization to InitDetector()
+
+Revision 1.24  2001/05/21 16:45:47  hristov
+Last minute changes (C.Blume)
+
+Revision 1.23  2001/05/07 08:04:48  cblume
+New TRF and PRF. Speedup of the code. Digits from amplification region included
+
+Revision 1.22  2001/03/30 14:40:14  cblume
+Update of the digitization parameter
+
+Revision 1.21  2001/03/13 09:30:35  cblume
+Update of digitization. Moved digit branch definition to AliTRD
+
+Revision 1.20  2001/02/25 20:19:00  hristov
+Minor correction: loop variable declared only once for HP, Sun
+
 Revision 1.19  2001/02/14 18:22:26  cblume
 Change in the geometry of the padplane
 
@@ -98,12 +152,14 @@ Add new TRD classes
 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
 //                                                                           //
 //  Creates and handles digits from TRD hits                                 //
+//  Author: C. Blume (C.Blume@gsi.de)                                        //
 //                                                                           //
 //  The following effects are included:                                      //
 //      - Diffusion                                                          //
 //      - ExB effects                                                        //
 //      - Gas gain including fluctuations                                    //
 //      - Pad-response (simple Gaussian approximation)                       //
+//      - Time-response                                                      //
 //      - Electronics noise                                                  //
 //      - Electronics gain                                                   //
 //      - Digitization                                                       //
@@ -111,8 +167,11 @@ Add new TRD classes
 //  The corresponding parameter can be adjusted via the various              //
 //  Set-functions. If these parameters are not explicitly set, default       //
 //  values are used (see Init-function).                                     //
-//  To produce digits from a root-file with TRD-hits use the                 //
-//  slowDigitsCreate.C macro.                                                //
+//  As an example on how to use this class to produce digits from hits       //
+//  have a look at the macro hits2digits.C                                   //
+//  The production of summable digits is demonstrated in hits2sdigits.C      //
+//  and the subsequent conversion of the s-digits into normal digits is      //
+//  explained in sdigits2digits.C.                                           //
 //                                                                           //
 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
 
@@ -125,8 +184,12 @@ Add new TRD classes
 #include <TTree.h>
 #include <TFile.h>
 #include <TF1.h>
+#include <TList.h>
+#include <TTask.h>
 
 #include "AliRun.h"
+#include "AliMagF.h"
+#include "AliRunDigitizer.h"
 
 #include "AliTRD.h"
 #include "AliTRDhit.h"
@@ -136,81 +199,113 @@ Add new TRD classes
 #include "AliTRDsegmentArray.h"
 #include "AliTRDdigitsManager.h"
 #include "AliTRDgeometry.h"
+#include "AliTRDparameter.h"
 
 ClassImp(AliTRDdigitizer)
 
 //_____________________________________________________________________________
-AliTRDdigitizer::AliTRDdigitizer():TNamed()
+AliTRDdigitizer::AliTRDdigitizer()
 {
   //
   // AliTRDdigitizer default constructor
   //
 
-  fInputFile     = NULL;
-  fDigits        = NULL;
-  fTRD           = NULL;
-  fGeo           = NULL;
-  fPRF           = NULL;
-  fPRFsmp        = NULL;
-  fTRF           = NULL;
-  fTRFint        = NULL;
-
-  fEvent         = 0;
-  fGasGain       = 0.0;
-  fNoise         = 0.0;
-  fChipGain      = 0.0;
-  fADCoutRange   = 0.0;
-  fADCinRange    = 0.0;
-  fADCthreshold  = 0;
-  fDiffusionOn   = 0;
-  fDiffusionT    = 0.0;
-  fDiffusionL    = 0.0;
-  fElAttachOn    = 0;
-  fElAttachProp  = 0.0;
-  fExBOn         = 0;
-  fOmegaTau      = 0.0;
-  fPRFOn         = 0;
-  fTRFOn         = 0;
-  fDriftVelocity = 0.0;
-
-  fPRFbin        = 0;
-  fPRFlo         = 0.0;
-  fPRFhi         = 0.0;
-  fPRFwid        = 0.0;
-  fPRFpad        = 0;
-  fTRFbin        = 0;
-  fTRFlo         = 0.0;
-  fTRFhi         = 0.0;
-  fTRFwid        = 0.0;
-
-  fCompress      = kTRUE;
-  fVerbose       = 1;
+  fInputFile          = 0;
+  fDigitsManager      = 0;
+  fSDigitsManagerList = 0;
+  fSDigitsManager     = 0;
+  fTRD                = 0;
+  fGeo                = 0;
+  fPar                = 0;
+  fMasks              = 0;
+  fEvent              = 0;
+  fCompress           = kTRUE;
+  fDebug              = 0;
+  fSDigits            = kFALSE;
+  fSDigitsScale       = 0.0;
+  fMergeSignalOnly    = kFALSE;
 
 }
 
 //_____________________________________________________________________________
 AliTRDdigitizer::AliTRDdigitizer(const Text_t *name, const Text_t *title)
-                :TNamed(name,title)
+                :AliDigitizer(name,title)
 {
   //
-  // AliTRDdigitizer default constructor
+  // AliTRDdigitizer constructor
   //
 
-  fInputFile     = NULL;
-  fDigits        = NULL;
-  fTRD           = NULL;
-  fGeo           = NULL;
-  fPRF           = NULL;
-  fPRFsmp        = NULL;
-  fTRF           = NULL;
-  fTRFint        = NULL;
+  fInputFile          = 0;
+  fDigitsManager      = 0;
+  fSDigitsManagerList = 0;
+  fSDigitsManager     = 0;
+  fTRD                = 0;
+  fGeo                = 0;
+  fPar                = 0;
+  fMasks              = 0;
+  fEvent              = 0;
+  fCompress           = kTRUE;
+  fDebug              = 0;
+  fSDigits            = kFALSE;
+  fMergeSignalOnly    = kFALSE;
+
+  // For the summable digits
+  fSDigitsScale       = 100.;
 
-  fEvent         = 0;
+}
 
-  fCompress      = kTRUE;
-  fVerbose       = 1;
+//_____________________________________________________________________________
+AliTRDdigitizer::AliTRDdigitizer(AliRunDigitizer *manager
+                                , const Text_t *name, const Text_t *title)
+                :AliDigitizer(manager,name,title)
+{
+  //
+  // AliTRDdigitizer constructor
+  //
 
-  Init();
+  fInputFile          = 0;
+  fDigitsManager      = 0;
+  fSDigitsManagerList = 0;
+  fSDigitsManager     = 0;
+  fTRD                = 0;
+  fGeo                = 0;
+  fPar                = 0;
+  fMasks              = 0;
+  fEvent              = 0;
+  fCompress           = kTRUE;
+  fDebug              = 0;
+  fSDigits            = kFALSE;
+  fMergeSignalOnly    = kFALSE;
+
+  // For the summable digits
+  fSDigitsScale       = 100.;
+
+}
+
+//_____________________________________________________________________________
+AliTRDdigitizer::AliTRDdigitizer(AliRunDigitizer *manager)
+                :AliDigitizer(manager,"AliTRDdigitizer","TRD digitizer")
+{
+  //
+  // AliTRDdigitizer constructor
+  //
+
+  fInputFile          = 0;
+  fDigitsManager      = 0;
+  fSDigitsManagerList = 0;
+  fSDigitsManager     = 0;
+  fTRD                = 0;
+  fGeo                = 0;
+  fPar                = 0;
+  fMasks              = 0;
+  fEvent              = 0;
+  fCompress           = kTRUE;
+  fDebug              = 0;
+  fSDigits            = kFALSE;
+  fMergeSignalOnly    = kFALSE;
+
+  // For the summable digits
+  fSDigitsScale       = 100.;
 
 }
 
@@ -235,14 +330,28 @@ AliTRDdigitizer::~AliTRDdigitizer()
   if (fInputFile) {
     fInputFile->Close();
     delete fInputFile;
+    fInputFile = 0;
   }
 
-  if (fDigits) {
-    delete fDigits;
+  if (fDigitsManager) {
+    delete fDigitsManager;
+    fDigitsManager = 0;
   }
 
-  if (fPRF) delete fPRF;
-  if (fTRF) delete fTRF;
+  if (fSDigitsManager) {
+    delete fSDigitsManager;
+    fSDigitsManager = 0;
+  }
+
+  if (fSDigitsManagerList) {
+    delete fSDigitsManagerList;
+    fSDigitsManagerList = 0;
+  }
+
+  if (fMasks) {
+    delete [] fMasks;
+    fMasks = 0;
+  }
 
 }
 
@@ -265,261 +374,146 @@ void AliTRDdigitizer::Copy(TObject &d)
   // Copy function
   //
 
-  Int_t iBin;
-
-  ((AliTRDdigitizer &) d).fInputFile     = NULL;
-  ((AliTRDdigitizer &) d).fDigits        = NULL;
-  ((AliTRDdigitizer &) d).fTRD           = NULL;
-  ((AliTRDdigitizer &) d).fGeo           = NULL;
-
-  ((AliTRDdigitizer &) d).fEvent         = 0;
-
-  ((AliTRDdigitizer &) d).fGasGain       = fGasGain;
-  ((AliTRDdigitizer &) d).fNoise         = fNoise;
-  ((AliTRDdigitizer &) d).fChipGain      = fChipGain;
-  ((AliTRDdigitizer &) d).fADCoutRange   = fADCoutRange;
-  ((AliTRDdigitizer &) d).fADCinRange    = fADCinRange;
-  ((AliTRDdigitizer &) d).fADCthreshold  = fADCthreshold;
-  ((AliTRDdigitizer &) d).fDiffusionOn   = fDiffusionOn; 
-  ((AliTRDdigitizer &) d).fDiffusionT    = fDiffusionT;
-  ((AliTRDdigitizer &) d).fDiffusionL    = fDiffusionL;
-  ((AliTRDdigitizer &) d).fElAttachOn    = fElAttachOn;
-  ((AliTRDdigitizer &) d).fElAttachProp  = fElAttachProp;
-  ((AliTRDdigitizer &) d).fExBOn         = fExBOn;
-  ((AliTRDdigitizer &) d).fOmegaTau      = fOmegaTau;
-  ((AliTRDdigitizer &) d).fLorentzFactor = fLorentzFactor;
-  ((AliTRDdigitizer &) d).fPRFOn         = fPRFOn;
-  ((AliTRDdigitizer &) d).fTRFOn         = fTRFOn;
-
-  ((AliTRDdigitizer &) d).fCompress      = fCompress;
-  ((AliTRDdigitizer &) d).fVerbose       = fVerbose;
-
-  fPRF->Copy(*((AliTRDdigitizer &) d).fPRF);
-  fTRF->Copy(*((AliTRDdigitizer &) d).fTRF);
-
-  ((AliTRDdigitizer &) d).fPRFbin        = fPRFbin;
-  ((AliTRDdigitizer &) d).fPRFlo         = fPRFlo;
-  ((AliTRDdigitizer &) d).fPRFhi         = fPRFhi;
-  ((AliTRDdigitizer &) d).fPRFwid        = fPRFwid;
-  ((AliTRDdigitizer &) d).fPRFpad        = fPRFpad;
-  if (((AliTRDdigitizer &) d).fPRFsmp) delete ((AliTRDdigitizer &) d).fPRFsmp;
-  ((AliTRDdigitizer &) d).fPRFsmp = new Float_t[fPRFbin];
-  for (iBin = 0; iBin < fPRFbin; iBin++) {
-    ((AliTRDdigitizer &) d).fPRFsmp[iBin] = fPRFsmp[iBin];
-  }                                                                             
-  ((AliTRDdigitizer &) d).fTRFbin        = fTRFbin;
-  ((AliTRDdigitizer &) d).fTRFlo         = fTRFlo;
-  ((AliTRDdigitizer &) d).fTRFhi         = fTRFhi;
-  ((AliTRDdigitizer &) d).fTRFwid        = fTRFwid;
-  if (((AliTRDdigitizer &) d).fTRFint) delete ((AliTRDdigitizer &) d).fTRFint;
-  ((AliTRDdigitizer &) d).fTRFint = new Float_t[fTRFbin];
-  for (iBin = 0; iBin < fTRFbin; iBin++) {
-    ((AliTRDdigitizer &) d).fTRFint[iBin] = fTRFint[iBin];
-  }                                                                             
-
+  ((AliTRDdigitizer &) d).fInputFile          = 0;
+  ((AliTRDdigitizer &) d).fSDigitsManagerList = 0;
+  ((AliTRDdigitizer &) d).fSDigitsManager     = 0;
+  ((AliTRDdigitizer &) d).fDigitsManager      = 0;
+  ((AliTRDdigitizer &) d).fTRD                = 0;
+  ((AliTRDdigitizer &) d).fGeo                = 0;
+  ((AliTRDdigitizer &) d).fMasks              = 0;
+  ((AliTRDdigitizer &) d).fEvent              = 0;
+  ((AliTRDdigitizer &) d).fPar                = 0;
+  ((AliTRDdigitizer &) d).fCompress           = fCompress;
+  ((AliTRDdigitizer &) d).fDebug              = fDebug  ;
+  ((AliTRDdigitizer &) d).fSDigits            = fSDigits;
+  ((AliTRDdigitizer &) d).fSDigitsScale       = fSDigitsScale;
+  ((AliTRDdigitizer &) d).fMergeSignalOnly    = fMergeSignalOnly;
+                                      
 }
 
 //_____________________________________________________________________________
-Int_t AliTRDdigitizer::Diffusion(Float_t driftlength, Float_t *xyz)
+void AliTRDdigitizer::Exec(Option_t* option)
 {
   //
-  // Applies the diffusion smearing to the position of a single electron
+  // Executes the merging
   //
 
-  Float_t driftSqrt = TMath::Sqrt(driftlength);
-  Float_t sigmaT = driftSqrt * fDiffusionT;
-  Float_t sigmaL = driftSqrt * fDiffusionL;
-  xyz[0] = gRandom->Gaus(xyz[0], sigmaL * fLorentzFactor);
-  xyz[1] = gRandom->Gaus(xyz[1], sigmaT * fLorentzFactor);
-  xyz[2] = gRandom->Gaus(xyz[2], sigmaT);
+  Int_t iInput;
 
-  return 1;
+  AliTRDdigitsManager *sdigitsManager;
 
-}
-
-//_____________________________________________________________________________
-Int_t AliTRDdigitizer::ExB(Float_t driftlength, Float_t *xyz)
-{
-  //
-  // Applies E x B effects to the position of a single electron
-  //
-
-  xyz[0] = xyz[0];
-  xyz[1] = xyz[1] + fOmegaTau * driftlength;
-  xyz[2] = xyz[2];
-
-  return 1;
-
-}
-
-//_____________________________________________________________________________
-Int_t AliTRDdigitizer::PadResponse(Float_t signal, Float_t dist, Float_t *pad)
-{
-  //
-  // Applies the pad response
-  //
-
-  Int_t iBin =  ((Int_t) (( - dist - fPRFlo) / fPRFwid));
-
-  Int_t iBin0 = iBin - fPRFpad;
-  Int_t iBin1 = iBin;
-  Int_t iBin2 = iBin + fPRFpad;
-
-  if ((iBin0 >= 0) && (iBin2 < fPRFbin)) {
-
-    pad[0] = signal * fPRFsmp[iBin0];
-    pad[1] = signal * fPRFsmp[iBin1];
-    pad[2] = signal * fPRFsmp[iBin2];
-
-    return 1;
+  TString optionString = option;
+  if (optionString.Contains("deb")) {
+    fDebug = 1;
+    if (optionString.Contains("2")) {
+      fDebug = 2;
+    }
+    printf("<AliTRDdigitizer::Exec> ");
+    printf("Called with debug option %d\n",fDebug);
+  }
 
+  // The AliRoot file is already connected by the manager
+  if (gAlice) {
+    if (fDebug > 0) {
+      printf("<AliTRDdigitizer::Exec> ");
+      printf("AliRun object found on file.\n");
+    }
   }
   else {
-
-    return 0;
-
+    printf("<AliTRDdigitizer::Exec> ");
+    printf("Could not find AliRun object.\n");
+    return;
   }
-
-}
-
-//_____________________________________________________________________________
-Float_t AliTRDdigitizer::TimeResponse(Float_t time)
-{
-  //
-  // Applies the preamp shaper time response
-  //
-
-  Int_t iBin = ((Int_t) ((time - fTRFlo) / fTRFwid)); 
-  if ((iBin >= 0) && (iBin < fTRFbin)) {
-    return fTRFint[iBin];
+                                                                           
+  Int_t nInput = fManager->GetNinputs();
+  fMasks = new Int_t[nInput];
+  for (iInput = 0; iInput < nInput; iInput++) {
+    fMasks[iInput] = fManager->GetMask(iInput);
   }
-  else {
-    return 0.0;
-  }    
 
-}
+  // Initialization
+  InitDetector();
 
-//_____________________________________________________________________________
-void AliTRDdigitizer::Init()
-{
-  //
-  // Initializes the digitization procedure with standard values
-  //
+  for (iInput = 0; iInput < nInput; iInput++) {
 
-  // The default parameter for the digitization
-  fGasGain       = 8.0E3;
-  fNoise         = 3000.;
-  fChipGain      = 10.;
-  fADCoutRange   = 255.;
-  fADCinRange    = 2000.;
-  fADCthreshold  = 1;
-
-  // Transverse and longitudinal diffusion coefficients (Xe/Isobutane)
-  fDiffusionOn   = 1;
-  fDiffusionT    = 0.060;
-  fDiffusionL    = 0.017;
-
-  // Propability for electron attachment
-  fElAttachOn    = 0;
-  fElAttachProp  = 0.0;
-
-  // E x B effects
-  fExBOn         = 0;
-  // omega * tau. (tau ~ 12 * 10^-12, B = 0.2T)
-  fOmegaTau      = 17.6 * 12.0 * 0.2 * 0.01;
-
-  // The pad response function
-  fPRFOn         =  1;
-  fPRFlo         = -3.0;
-  fPRFhi         =  3.0;
-  fPRFbin        = 1200;
-  fPRFwid        = (fPRFhi - fPRFlo) / ((Float_t) fPRFbin);
-  fPRFpad        = ((Int_t) (1.0 / fPRFwid));
-  fPRF           = new TF1("PRF","[0]*([1]+exp(-x*x/(2.0*[2])))",fPRFlo,fPRFhi);
-  fPRF->SetParameter(0, 0.8872);
-  fPRF->SetParameter(1,-0.00573);
-  fPRF->SetParameter(2, 0.454 * 0.454);
-
-  // The drift velocity (cm / mus)
-  fDriftVelocity = 1.0;
-
-  // The time response function
-  fTRFOn         = 1;
-  Float_t loTRF  = -200.0;
-  Float_t hiTRF  = 1000.0;
-  fTRF           = new TF1("TRF",TRFlandau,loTRF,hiTRF,3);
-  fTRF->SetParameter(0,  1.0 / 24.24249);
-  fTRF->SetParameter(1,  0.0);
-  fTRF->SetParameter(2, 25.0);
-  fTRFbin        = 1200;
-  fTRFlo         = loTRF * fDriftVelocity / 1000.0;
-  fTRFhi         = hiTRF * fDriftVelocity / 1000.0;
-  fTRFwid        = (fTRFhi - fTRFlo) / ((Float_t) fTRFbin);
+    if (fDebug > 0) {
+      printf("<AliTRDdigitizer::Exec> ");
+      printf("Add input stream %d\n",iInput);
+    }
 
-}
+    // check if the input tree exists
+    if (!fManager->GetInputTreeTRDS(iInput)) {
+      printf("<AliTRDdigitizer::Exec> ");
+      printf("Input stream %d does not exist\n",iInput);
+      return;
+    } 
 
-//_____________________________________________________________________________
-void AliTRDdigitizer::IntegrateTRF()
-{
-  //
-  // Integrates the time response function over the time bin size
-  //
+    // Read the s-digits via digits manager
+    sdigitsManager = new AliTRDdigitsManager();
+    sdigitsManager->SetDebug(fDebug);
+    sdigitsManager->SetSDigits(kTRUE);
+    sdigitsManager->ReadDigits(fManager->GetInputTreeTRDS(iInput));
 
-  if (fTRFint) delete fTRFint;
-  fTRFint = new Float_t[fTRFbin];
-  Float_t hiTRF   = fTRFhi                 / fDriftVelocity * 1000.0;
-  Float_t loTRF   = fTRFlo                 / fDriftVelocity * 1000.0;
-  Float_t timeBin = fGeo->GetTimeBinSize() / fDriftVelocity * 1000.0;
-  Float_t binWidth = (hiTRF - loTRF) / ((Float_t) fTRFbin);
-  for (Int_t iBin = 0; iBin < fTRFbin; iBin++) {
-    Float_t bin = iBin * binWidth + loTRF - 0.5 * timeBin;
-    fTRFint[iBin] = fTRF->Integral(bin,bin + timeBin);
-  }
+    // Add the s-digits to the input list 
+    AddSDigitsManager(sdigitsManager);
 
-}
+  }
 
-//_____________________________________________________________________________
-void AliTRDdigitizer::SamplePRF()
-{
-  //
-  // Samples the pad response function
-  //
+  // Convert the s-digits to normal digits
+  if (fDebug > 0) {
+    printf("<AliTRDdigitizer::Exec> ");
+    printf("Do the conversion\n");
+  }
+  SDigits2Digits();
 
-  if (fPRFsmp) delete fPRFsmp;
-  fPRFsmp = new Float_t[fPRFbin];
-  for (Int_t iBin = 0; iBin < fPRFbin; iBin++) {
-    Float_t bin = (((Float_t ) iBin) + 0.5) * fPRFwid + fPRFlo;
-    fPRFsmp[iBin] = TMath::Max(fPRF->Eval(bin),0.0);
+  // Store the digits
+  if (fDebug > 0) {
+    printf("<AliTRDdigitizer::Exec> ");
+    printf("Write the digits\n");
   }
+  fDigitsManager->MakeBranch(fManager->GetTreeDTRD());
+  fDigitsManager->WriteDigits();
+  if (fDebug > 0) {
+    printf("<AliTRDdigitizer::Exec> ");
+    printf("Done\n");
+  }
+
+  DeleteSDigitsManager();
 
 }
 
 //_____________________________________________________________________________
-Bool_t AliTRDdigitizer::Open(const Char_t *name, Int_t nEvent)
+Bool_t AliTRDdigitizer::Open(const Char_t *file, Int_t nEvent)
 {
   //
   // Opens a ROOT-file with TRD-hits and reads in the hit-tree
   //
 
   // Connect the AliRoot file containing Geometry, Kine, and Hits
-  fInputFile = (TFile*) gROOT->GetListOfFiles()->FindObject(name);
+  fInputFile = (TFile *) gROOT->GetListOfFiles()->FindObject(file);
   if (!fInputFile) {
-    printf("AliTRDdigitizer::Open -- ");
-    printf("Open the ALIROOT-file %s.\n",name);
-    fInputFile = new TFile(name,"UPDATE");
+    if (fDebug > 0) {
+      printf("<AliTRDdigitizer::Open> ");
+      printf("Open the AliROOT-file %s.\n",file);
+    }
+    fInputFile = new TFile(file,"UPDATE");
   }
   else {
-    printf("AliTRDdigitizer::Open -- ");
-    printf("%s is already open.\n",name);
+    if (fDebug > 0) {
+      printf("<AliTRDdigitizer::Open> ");
+      printf("%s is already open.\n",file);
+    }
   }
 
-  gAlice = (AliRun*) fInputFile->Get("gAlice");
+  gAlice = (AliRun *) fInputFile->Get("gAlice");
   if (gAlice) {
-    printf("AliTRDdigitizer::Open -- ");
-    printf("AliRun object found on file.\n");
+    if (fDebug > 0) {
+      printf("<AliTRDdigitizer::Open> ");
+      printf("AliRun object found on file.\n");
+    }
   }
   else {
-    printf("AliTRDdigitizer::Open -- ");
+    printf("<AliTRDdigitizer::Open> ");
     printf("Could not find AliRun object.\n");
     return kFALSE;
   }
@@ -529,12 +523,17 @@ Bool_t AliTRDdigitizer::Open(const Char_t *name, Int_t nEvent)
   // Import the Trees for the event nEvent in the file
   Int_t nparticles = gAlice->GetEvent(fEvent);
   if (nparticles <= 0) {
-    printf("AliTRDdigitizer::Open -- ");
+    printf("<AliTRDdigitizer::Open> ");
     printf("No entries in the trees for event %d.\n",fEvent);
     return kFALSE;
   }
 
-  return InitDetector();
+  if (InitDetector()) {
+    return MakeBranch();
+  }
+  else {
+    return kFALSE;
+  }
 
 }
 
@@ -546,27 +545,55 @@ Bool_t AliTRDdigitizer::InitDetector()
   //
 
   // Get the pointer to the detector class and check for version 1
-  fTRD = (AliTRD*) gAlice->GetDetector("TRD");
+  fTRD = (AliTRD *) gAlice->GetDetector("TRD");
+  if (!fTRD) {
+    printf("<AliTRDdigitizer::InitDetector> ");
+    printf("No TRD module found\n");
+    exit(1);
+  }
   if (fTRD->IsVersion() != 1) {
-    printf("AliTRDdigitizer::Open -- ");
+    printf("<AliTRDdigitizer::InitDetector> ");
     printf("TRD must be version 1 (slow simulator).\n");
     exit(1);
   }
 
   // Get the geometry
   fGeo = fTRD->GetGeometry();
-  printf("AliTRDdigitizer::Open -- ");
-  printf("Geometry version %d\n",fGeo->IsVersion());
+  if (fDebug > 0) {
+    printf("<AliTRDdigitizer::InitDetector> ");
+    printf("Geometry version %d\n",fGeo->IsVersion());
+  }
+
+  // Create a digits manager
+  fDigitsManager = new AliTRDdigitsManager();
+  fDigitsManager->SetSDigits(fSDigits);
+  fDigitsManager->CreateArrays();
+  fDigitsManager->SetEvent(fEvent);
+  fDigitsManager->SetDebug(fDebug);
+
+  // The list for the input s-digits manager to be merged
+  fSDigitsManagerList = new TList();
 
   return kTRUE;
 
 }
 
+//_____________________________________________________________________________
+Bool_t AliTRDdigitizer::MakeBranch(const Char_t *file) const
+{
+  // 
+  // Create the branches for the digits array
+  //
+
+  return fDigitsManager->MakeBranch(file);
+
+}
+
 //_____________________________________________________________________________
 Bool_t AliTRDdigitizer::MakeDigits()
 {
   //
-  // Loops through the TRD-hits and creates the digits.
+  // Creates digits.
   //
 
   ///////////////////////////////////////////////////////////////
@@ -574,7 +601,7 @@ Bool_t AliTRDdigitizer::MakeDigits()
   ///////////////////////////////////////////////////////////////
 
   // Converts number of electrons to fC
-  const Float_t kEl2fC  = 1.602E-19 * 1.0E15; 
+  const Double_t kEl2fC  = 1.602E-19 * 1.0E15; 
 
   ///////////////////////////////////////////////////////////////
 
@@ -584,6 +611,9 @@ Bool_t AliTRDdigitizer::MakeDigits()
   // Number of track dictionary arrays
   const Int_t kNDict = AliTRDdigitsManager::kNDict;
 
+  // Half the width of the amplification region
+  const Float_t kAmWidth = AliTRDgeometry::AmThick() / 2.;
+
   Int_t   iRow, iCol, iTime, iPad;
   Int_t   iDict  = 0;
   Int_t   nBytes = 0;
@@ -593,49 +623,63 @@ Bool_t AliTRDdigitizer::MakeDigits()
   Int_t   totalSizeDict1  = 0;
   Int_t   totalSizeDict2  = 0;
 
+  Int_t   timeTRDbeg = 0;
+  Int_t   timeTRDend = 1;
+
+  Float_t pos[3];
+  Float_t rot[3];
+  Float_t xyz[3];
+  Float_t padSignal[kNpad];
+  Float_t signalOld[kNpad];
+
   AliTRDdataArrayF *signals = 0;
   AliTRDdataArrayI *digits  = 0;
   AliTRDdataArrayI *dictionary[kNDict];
 
-  // Create a digits manager
-  fDigits = new AliTRDdigitsManager();
+  // Create a default parameter class if none is defined
+  if (!fPar) {
+    fPar = new AliTRDparameter("TRDparameter","Standard TRD parameter");
+    if (fDebug > 0) {
+      printf("<AliTRDdigitizer::MakeDigits> ");
+      printf("Create the default parameter object\n");
+    }
+  }
 
   // Create a container for the amplitudes
   AliTRDsegmentArray *signalsArray 
-                     = new AliTRDsegmentArray("AliTRDdataArrayF",AliTRDgeometry::Ndet());
+                     = new AliTRDsegmentArray("AliTRDdataArrayF"
+                                             ,AliTRDgeometry::Ndet());
+
+  if (fPar->TRFOn()) {
+    timeTRDbeg = ((Int_t) (-fPar->GetTRFlo() / fPar->GetTimeBinSize())) - 1;
+    timeTRDend = ((Int_t) ( fPar->GetTRFhi() / fPar->GetTimeBinSize())) - 1;
+    if (fDebug > 0) {
+      printf("<AliTRDdigitizer::MakeDigits> ");
+      printf("Sample the TRF between -%d and %d\n",timeTRDbeg,timeTRDend);
+    }
+  }
+
+  Float_t elAttachProp = fPar->GetElAttachProp() / 100.; 
 
   if (!fGeo) {
-    printf("AliTRDdigitizer::MakeDigits -- ");
+    printf("<AliTRDdigitizer::MakeDigits> ");
     printf("No geometry defined\n");
     return kFALSE;
   }
 
-  printf("AliTRDdigitizer::MakeDigits -- ");
-  printf("Start creating digits.\n");
-  if (fVerbose > 0) this->Dump();
-
-  // The Lorentz factor
-  if (fExBOn) {
-    fLorentzFactor = 1.0 / (1.0 + fOmegaTau*fOmegaTau);
-  }
-  else {
-    fLorentzFactor = 1.0;
+  if (fDebug > 0) {
+    printf("<AliTRDdigitizer::MakeDigits> ");
+    printf("Start creating digits.\n");
   }
 
-  // Create the sampled PRF
-  SamplePRF();
-
-  // Create the integrated TRF
-  IntegrateTRF();
-
   // Get the pointer to the hit tree
-  TTree *HitTree = gAlice->TreeH();
+  TTree *hitTree = gAlice->TreeH();
 
   // Get the number of entries in the hit tree
   // (Number of primary particles creating a hit somewhere)
-  Int_t nTrack = (Int_t) HitTree->GetEntries();
-  if (fVerbose > 0) {
-    printf("AliTRDdigitizer::MakeDigits -- ");
+  Int_t nTrack = (Int_t) hitTree->GetEntries();
+  if (fDebug > 0) {
+    printf("<AliTRDdigitizer::MakeDigits> ");
     printf("Found %d primary particles\n",nTrack);
   } 
 
@@ -646,45 +690,42 @@ Bool_t AliTRDdigitizer::MakeDigits()
   for (Int_t iTrack = 0; iTrack < nTrack; iTrack++) {
 
     gAlice->ResetHits();
-    nBytes += HitTree->GetEvent(iTrack);
-
-    // Get the number of hits in the TRD created by this particle
-    Int_t nHit = fTRD->Hits()->GetEntriesFast();
-    if (fVerbose > 0) {
-      printf("AliTRDdigitizer::MakeDigits -- ");
-      printf("Found %d hits for primary particle %d\n",nHit,iTrack);
-    }
-
-    // Loop through the TRD hits  
-    for (Int_t iHit = 0; iHit < nHit; iHit++) {
+    nBytes += hitTree->GetEvent(iTrack);
 
+    // Loop through the TRD hits
+    Int_t iHit = 0;
+    AliTRDhit *hit = (AliTRDhit *) fTRD->FirstHit(-1);
+    while (hit) {
       countHits++;
-
-      AliTRDhit *hit = (AliTRDhit *) fTRD->Hits()->UncheckedAt(iHit);
-      Float_t pos[3];
-              pos[0]   = hit->X();
-              pos[1]   = hit->Y();
-              pos[2]   = hit->Z();
-      Float_t q        = hit->GetCharge();
-      Int_t   track    = hit->Track();
-      Int_t   detector = hit->GetDetector();
-      Int_t   plane    = fGeo->GetPlane(detector);
-      Int_t   sector   = fGeo->GetSector(detector);
-      Int_t   chamber  = fGeo->GetChamber(detector);
-
-      if (!(CheckDetector(plane,chamber,sector))) continue;
-
-      Int_t   nRowMax     = fGeo->GetRowMax(plane,chamber,sector);
-      Int_t   nColMax     = fGeo->GetColMax(plane);
-      Int_t   nTimeMax    = fGeo->GetTimeMax();
-      Float_t row0        = fGeo->GetRow0(plane,chamber,sector);
-      Float_t col0        = fGeo->GetCol0(plane);
-      Float_t time0       = fGeo->GetTime0(plane);
-      Float_t rowPadSize  = fGeo->GetRowPadSize(plane,chamber,sector);
-      Float_t colPadSize  = fGeo->GetColPadSize(plane);
-      Float_t timeBinSize = fGeo->GetTimeBinSize();
-
-      if (fVerbose > 1) {
+      iHit++;
+
+              pos[0]      = hit->X();
+              pos[1]      = hit->Y();
+              pos[2]      = hit->Z();
+      Float_t q           = hit->GetCharge();
+      Int_t   track       = hit->Track();
+      Int_t   detector    = hit->GetDetector();
+      Int_t   plane       = fGeo->GetPlane(detector);
+      Int_t   sector      = fGeo->GetSector(detector);
+      Int_t   chamber     = fGeo->GetChamber(detector);
+      Int_t   nRowMax     = fPar->GetRowMax(plane,chamber,sector);
+      Int_t   nColMax     = fPar->GetColMax(plane);
+      Int_t   nTimeMax    = fPar->GetTimeMax();
+      Int_t   nTimeBefore = fPar->GetTimeBefore();
+      Int_t   nTimeAfter  = fPar->GetTimeAfter();
+      Int_t   nTimeTotal  = fPar->GetTimeTotal();
+      Float_t row0        = fPar->GetRow0(plane,chamber,sector);
+      Float_t col0        = fPar->GetCol0(plane);
+      Float_t time0       = fPar->GetTime0(plane);
+      Float_t rowPadSize  = fPar->GetRowPadSize(plane,chamber,sector);
+      Float_t colPadSize  = fPar->GetColPadSize(plane);
+      Float_t timeBinSize = fPar->GetTimeBinSize();
+      Float_t divideRow   = 1.0 / rowPadSize;
+      Float_t divideCol   = 1.0 / colPadSize;
+      Float_t divideTime  = 1.0 / timeBinSize;
+
+      if (fDebug > 1) {
         printf("Analyze hit no. %d ",iHit);
         printf("-----------------------------------------------------------\n");
         hit->Dump();
@@ -692,268 +733,275 @@ Bool_t AliTRDdigitizer::MakeDigits()
               ,plane,sector,chamber);
         printf("nRowMax = %d, nColMax = %d, nTimeMax = %d\n" 
               ,nRowMax,nColMax,nTimeMax);
+        printf("nTimeBefore = %d, nTimeAfter = %d, nTimeTotal = %d\n"
+             ,nTimeBefore,nTimeAfter,nTimeTotal);
         printf("row0 = %f, col0 = %f, time0 = %f\n"
               ,row0,col0,time0);
         printf("rowPadSize = %f, colPadSize = %f, timeBinSize = %f\n"
               ,rowPadSize,colPadSize,timeBinSize); 
       }
        
-      // Don't analyze test hits with amplitude 0.
-      if (((Int_t) q) == 0) continue;
+      // Don't analyze test hits and switched off detectors
+      if ((CheckDetector(plane,chamber,sector)) &&
+          (((Int_t) q) != 0)) {
 
-      if (detector != detectorOld) {
+        if (detector != detectorOld) {
 
-        if (fVerbose > 1) {
-          printf("AliTRDdigitizer::MakeDigits -- ");
-          printf("Get new container. New det = %d, Old det = %d\n"
-                ,detector,detectorOld);
-       }
-        // Compress the old one if enabled
-        if ((fCompress) && (detectorOld > -1)) {
-          if (fVerbose > 1) {
-            printf("AliTRDdigitizer::MakeDigits -- ");
-            printf("Compress the old container ...");
-         }
-          signals->Compress(1,0);
-          for (iDict = 0; iDict < kNDict; iDict++) {
-            dictionary[iDict]->Compress(1,0);
-         }
-          if (fVerbose > 1) printf("done\n");
-       }
-       // Get the new container
-        signals = (AliTRDdataArrayF *) signalsArray->At(detector);
-        if (signals->GetNtime() == 0) {
-          // Allocate a new one if not yet existing
-          if (fVerbose > 1) {
-            printf("AliTRDdigitizer::MakeDigits -- ");
-            printf("Allocate a new container ... ");
+          if (fDebug > 1) {
+            printf("<AliTRDdigitizer::MakeDigits> ");
+            printf("Get new container. New det = %d, Old det = %d\n"
+                  ,detector,detectorOld);
          }
-          signals->Allocate(nRowMax,nColMax,nTimeMax);
-       }
-        else {
-         // Expand an existing one
-          if (fCompress) {
-            if (fVerbose > 1) {
-              printf("AliTRDdigitizer::MakeDigits -- ");
-              printf("Expand an existing container ... ");
+          // Compress the old one if enabled
+          if ((fCompress) && (detectorOld > -1)) {
+            if (fDebug > 1) {
+              printf("<AliTRDdigitizer::MakeDigits> ");
+              printf("Compress the old container ...");
+           }
+            signals->Compress(1,0);
+            for (iDict = 0; iDict < kNDict; iDict++) {
+              dictionary[iDict]->Compress(1,0);
            }
-            signals->Expand();
+            if (fDebug > 1) printf("done\n");
          }
-       }
-       // The same for the dictionary
-        for (iDict = 0; iDict < kNDict; iDict++) {       
-          dictionary[iDict] = fDigits->GetDictionary(detector,iDict);
-          if (dictionary[iDict]->GetNtime() == 0) {
-            dictionary[iDict]->Allocate(nRowMax,nColMax,nTimeMax);
+         // Get the new container
+          signals = (AliTRDdataArrayF *) signalsArray->At(detector);
+          if (signals->GetNtime() == 0) {
+            // Allocate a new one if not yet existing
+            if (fDebug > 1) {
+              printf("<AliTRDdigitizer::MakeDigits> ");
+              printf("Allocate a new container ... ");
+           }
+            signals->Allocate(nRowMax,nColMax,nTimeTotal);
          }
           else {
-            if (fCompress) dictionary[iDict]->Expand();
+           // Expand an existing one
+            if (fCompress) {
+              if (fDebug > 1) {
+                printf("<AliTRDdigitizer::MakeDigits> ");
+                printf("Expand an existing container ... ");
+             }
+              signals->Expand();
+           }
          }
-        }      
-        if (fVerbose > 1) printf("done\n");
-        detectorOld = detector;
-      }
-
-      // Rotate the sectors on top of each other
-      Float_t rot[3];
-      fGeo->Rotate(detector,pos,rot);
-
-      // The driftlength
-      Float_t driftlength = time0 - rot[0];
-      if ((driftlength < 0) || 
-          (driftlength > AliTRDgeometry::DrThick())) continue;
-      Float_t driftlengthL = driftlength;
-      if (fExBOn) driftlengthL /= TMath::Sqrt(fLorentzFactor);
-
-      // The hit position in pad coordinates (center pad)
-      // The pad row (z-direction)
-      Int_t  rowH = (Int_t) ((rot[2] -  row0) /  rowPadSize);
-      // The pad column (rphi-direction)  
-      Int_t  colH = (Int_t) ((rot[1] -  col0) /  colPadSize);
-      // The time bucket
-      Int_t timeH = (Int_t) (driftlength      / timeBinSize);
-      if (fVerbose > 1) {
-        printf("rowH = %d, colH = %d, timeH = %d\n"
-              ,rowH,colH,timeH);
-      }
-
-      // Loop over all electrons of this hit
-      // TR photons produce hits with negative charge
-      Int_t nEl = ((Int_t) TMath::Abs(q));
-      for (Int_t iEl = 0; iEl < nEl; iEl++) {
-
-        Float_t xyz[3];
-        xyz[0] = rot[0];
-        xyz[1] = rot[1];
-        xyz[2] = rot[2];
-
-        // Electron attachment
-        if (fElAttachOn) {
-          if (gRandom->Rndm() < (driftlengthL * fElAttachProp / 100.)) 
-            continue;
+         // The same for the dictionary
+          for (iDict = 0; iDict < kNDict; iDict++) {       
+            dictionary[iDict] = fDigitsManager->GetDictionary(detector,iDict);
+            if (dictionary[iDict]->GetNtime() == 0) {
+              dictionary[iDict]->Allocate(nRowMax,nColMax,nTimeTotal);
+           }
+            else {
+              if (fCompress) dictionary[iDict]->Expand();
+           }
+          }      
+          if (fDebug > 1) printf("done\n");
+          detectorOld = detector;
         }
 
-        // Apply the diffusion smearing
-        if (fDiffusionOn) {
-          if (!(Diffusion(driftlengthL,xyz))) continue;
-       }
-
-        // Apply E x B effects
-        if (fExBOn) { 
-          if (!(ExB(driftlength,xyz))) continue;   
-       }
-
-        // The electron position 
-        // The pad row (z-direction)
-        Int_t  rowE = (Int_t) ((xyz[2] -  row0) /  rowPadSize);
-        // The pad column (rphi-direction)
-        Int_t  colE = (Int_t) ((xyz[1] -  col0) /  colPadSize);
-        // The time bucket
-        Int_t timeE = (Int_t) ((time0 - xyz[0]) / timeBinSize);
-
-        if (( rowE < 0) || ( rowE >=  nRowMax)) continue;
-        if (( colE < 0) || ( colE >=  nColMax)) continue;
-        if ((timeE < 0) || (timeE >= nTimeMax)) continue;
-
-        // Apply the gas gain including fluctuations
-        Float_t ggRndm = 0.0;
-        do {
-          ggRndm = gRandom->Rndm();
-       } while (ggRndm <= 0);
-        Int_t signal = (Int_t) (-fGasGain * TMath::Log(ggRndm));
-
-        if (fVerbose > 2) {
-          printf("  electron no. %d, signal = %d\n",iEl,signal);
-          printf("  rowE = %d, colE = %d, timeE = %d\n"
-               ,rowE,colE,timeE);
-       }
+        // Rotate the sectors on top of each other
+        fGeo->Rotate(detector,pos,rot);
+
+        // The driftlength. It is negative if the hit is in the 
+        // amplification region.
+        Float_t driftlength = time0 - rot[0];
+
+        // Take also the drift in the amplification region into account
+        // The drift length is at the moment still the same, regardless of
+        // the position relativ to the wire. This non-isochronity needs still
+        // to be implemented.
+        Float_t driftlengthL = TMath::Abs(driftlength + kAmWidth);
+        if (fPar->ExBOn()) driftlengthL /= TMath::Sqrt(fPar->GetLorentzFactor());
+
+        // Loop over all electrons of this hit
+        // TR photons produce hits with negative charge
+        Int_t nEl = ((Int_t) TMath::Abs(q));
+        for (Int_t iEl = 0; iEl < nEl; iEl++) {
+
+          xyz[0] = rot[0];
+          xyz[1] = rot[1];
+          xyz[2] = rot[2];
+
+          // Electron attachment
+          if (fPar->ElAttachOn()) {
+            if (gRandom->Rndm() < (driftlengthL * elAttachProp)) 
+              continue;
+          }
 
-        // Apply the pad response 
-        Float_t padSignal[kNpad];
-        if (fPRFOn) {
-         // The distance of the electron to the center of the pad 
-         // in units of pad width
-          Float_t dist = (xyz[1] - col0 - (colE + 0.5) * colPadSize) 
-                       / colPadSize;
-          if (!(PadResponse(signal,dist,padSignal))) continue;
-       }
-       else {
-          padSignal[0] = 0.0;
-          padSignal[1] = signal;
-          padSignal[2] = 0.0;
-       }
+          // Apply the diffusion smearing
+          if (fPar->DiffusionOn()) {
+            if (!(fPar->Diffusion(driftlengthL,xyz))) continue;
+         }
 
-        // The distance of the position to the beginning of the timebin
-        Float_t timeOffset = (time0 - timeE * timeBinSize) - xyz[0];
-        Int_t timeTRDbeg = 0;
-        Int_t timeTRDend = 1;
-        if (fTRFOn) {
-          timeTRDbeg =  2;
-          timeTRDend = 11;
-       }
-        for (Int_t iTimeBin = TMath::Max(timeE - timeTRDbeg,       0)
-                ; iTimeBin < TMath::Min(timeE + timeTRDend,nTimeMax) 
-                ; iTimeBin++) {
-
-         // Apply the time response
-          Float_t timeResponse = 1.0;
-          if (fTRFOn) {
-            Float_t time = (iTimeBin - timeE) * timeBinSize + timeOffset;
-            timeResponse = TimeResponse(time);
+          // Apply E x B effects (depends on drift direction)
+          if (fPar->ExBOn()) { 
+            if (!(fPar->ExB(driftlength+kAmWidth,xyz))) continue;   
          }
 
-          // Add the signals
-          Float_t signalOld[kNpad] = { 0.0, 0.0, 0.0 };
-          for (iPad = 0; iPad < kNpad; iPad++) {
-            Int_t colPos = colE + iPad - 1;
-            if (colPos <        0) continue;
-            if (colPos >= nColMax) break;
-            signalOld[iPad]  = signals->GetData(rowE,colPos,iTimeBin);
-            signalOld[iPad] += padSignal[iPad] * timeResponse;
-            signals->SetData(rowE,colPos,iTimeBin,signalOld[iPad]);
+          // The electron position after diffusion and ExB in pad coordinates 
+          // The pad row (z-direction)
+          Float_t rowDist   = xyz[2] - row0;
+          Int_t   rowE      = ((Int_t) (rowDist * divideRow));
+          if ((rowE < 0) || (rowE >= nRowMax)) continue;   
+          Float_t rowOffset = ((((Float_t) rowE) + 0.5) * rowPadSize) - rowDist;
+
+          // The pad column (rphi-direction)
+          Float_t col0tilt  = fPar->Col0Tilted(col0,rowOffset,plane);
+          Float_t colDist   = xyz[1] - col0tilt;
+          Int_t   colE      = ((Int_t) (colDist * divideCol));
+          if ((colE < 0) || (colE >= nColMax)) continue;   
+          Float_t colOffset = ((((Float_t) colE) + 0.5) * colPadSize) - colDist;    
+
+          // The time bin (negative for hits in the amplification region)
+         // In the amplification region the electrons drift from both sides
+         // to the middle (anode wire plane)
+          Float_t timeDist   = time0 - xyz[0];
+          Float_t timeOffset = 0;
+          Int_t   timeE      = 0;
+          if (timeDist > 0) {
+           // The time bin
+            timeE      = ((Int_t) (timeDist * divideTime));
+            // The distance of the position to the middle of the timebin
+            timeOffset = ((((Float_t) timeE) + 0.5) * timeBinSize) - timeDist;
+         }
+          else {
+           // Difference between half of the amplification gap width and
+           // the distance to the anode wire
+            Float_t anodeDist = kAmWidth - TMath::Abs(timeDist + kAmWidth);
+            // The time bin
+            timeE      = -1 * (((Int_t ) (anodeDist * divideTime)) + 1);
+            // The distance of the position to the middle of the timebin
+            timeOffset = ((((Float_t) timeE) + 0.5) * timeBinSize) + anodeDist;
+         }
+          // Apply the gas gain including fluctuations
+          Float_t ggRndm = 0.0;
+          do {
+            ggRndm = gRandom->Rndm();
+         } while (ggRndm <= 0);
+          Int_t signal = (Int_t) (-fPar->GetGasGain() * TMath::Log(ggRndm));
+
+          // Apply the pad response 
+          if (fPar->PRFOn()) {
+           // The distance of the electron to the center of the pad 
+           // in units of pad width
+            Float_t dist = - colOffset * divideCol;
+            if (!(fPar->PadResponse(signal,dist,plane,padSignal))) continue;
          }
-          if (fVerbose > 3) {
-            printf("    iTimeBin = %d, timeResponse = %f\n"
-                  ,iTimeBin,timeResponse);
-            printf("    pad-signal = %f, %f, %f\n"
-                  ,signalOld[0],signalOld[1],signalOld[2]);
+         else {
+            padSignal[0] = 0.0;
+            padSignal[1] = signal;
+            padSignal[2] = 0.0;
          }
 
-          // Store the track index in the dictionary
-          // Note: We store index+1 in order to allow the array to be compressed
-          //for (iDict = 0; iDict < kNDict; iDict++) {
-          //  Int_t oldTrack = dictionary[iDict]->GetData(rowE,colE,timeE);
-          //  if (oldTrack == track+1) break;
-          //  //if (oldTrack ==      -1) break;
-          //  if (oldTrack ==       0) {
-          //    dictionary[iDict]->SetData(rowE,colE,timeE,track+1);
-          //    if (fVerbose > 3) {
-          //      printf("    track index = %d\n",track); 
-         //    }
-          //    break;
-          //  }
-          //}
-          for (iPad = 0; iPad < kNpad; iPad++) {
-            Int_t colPos = colE + iPad - 1;
-            if (colPos <        0) continue;
-            if (colPos >= nColMax) break;
-            if (signals->GetData(rowE,colPos,iTimeBin) > 0) {
-              for (iDict = 0; iDict < kNDict; iDict++) {
-                Int_t oldTrack = dictionary[iDict]->GetData(rowE,colPos,iTimeBin);
-                if (oldTrack == track+1) break;
-                //if (oldTrack ==      -1) break;
-                if (oldTrack ==       0) {
-                  dictionary[iDict]->SetData(rowE,colPos,iTimeBin,track+1);
-                  if (fVerbose > 3) {
-                    printf("    track index = %d\n",track); 
+         // Sample the time response inside the drift region
+         // + additional time bins before and after.
+          // The sampling is done always in the middle of the time bin
+          for (Int_t iTimeBin = TMath::Max(timeE-timeTRDbeg,        -nTimeBefore) 
+                   ;iTimeBin < TMath::Min(timeE+timeTRDend,nTimeMax+nTimeAfter ) 
+                   ;iTimeBin++) {
+
+           // Apply the time response
+            Float_t timeResponse = 1.0;
+            Float_t crossTalk    = 0.0;
+            Float_t time         = (iTimeBin - timeE) * timeBinSize + timeOffset;
+            if (fPar->TRFOn()) {
+              timeResponse = fPar->TimeResponse(time);
+           }
+            if (fPar->CTOn()) {
+              crossTalk    = fPar->CrossTalk(time);
+            }
+
+            signalOld[0] = 0.0;
+            signalOld[1] = 0.0;
+            signalOld[2] = 0.0;
+
+            for (iPad = 0; iPad < kNpad; iPad++) {
+
+              Int_t colPos = colE + iPad - 1;
+              if (colPos <        0) continue;
+              if (colPos >= nColMax) break;
+
+              // Add the signals
+              // Note: The time bin number is shifted by nTimeBefore to avoid negative
+              // time bins. This has to be subtracted later.
+              Int_t iCurrentTimeBin = iTimeBin + nTimeBefore;
+              signalOld[iPad]  = signals->GetDataUnchecked(rowE,colPos,iCurrentTimeBin);
+              if( colPos != colE ) {
+                signalOld[iPad] += padSignal[iPad] * (timeResponse + crossTalk);
+              } 
+              else {
+                signalOld[iPad] += padSignal[iPad] * timeResponse;
+              }
+              signals->SetDataUnchecked(rowE,colPos,iCurrentTimeBin,signalOld[iPad]);
+
+              // Store the track index in the dictionary
+              // Note: We store index+1 in order to allow the array to be compressed
+              if (signalOld[iPad] > 0) {
+                for (iDict = 0; iDict < kNDict; iDict++) {
+                  Int_t oldTrack = dictionary[iDict]->GetDataUnchecked(rowE
+                                                                      ,colPos
+                                                                      ,iCurrentTimeBin);
+                  if (oldTrack == track+1) break;
+                  if (oldTrack ==       0) {
+                    dictionary[iDict]->SetDataUnchecked(rowE,colPos,iCurrentTimeBin,track+1);
+                    break;
                   }
-                  break;
                 }
               }
-            }
-          }
-          if ((fVerbose > 1) && (iDict == kNDict)) {
-            printf("AliTRDdigitizer::MakeDigits -- ");
-            printf("More than three tracks for one digit!\n");
-          }
 
-       }
+           } // Loop: pads
 
-      }
+         } // Loop: time bins
 
-    }
+        } // Loop: electrons of a single hit
+
+      } // If: detector and test hit
+
+      hit = (AliTRDhit *) fTRD->NextHit();   
+
+    } // Loop: hits of one primary track
+
+  } // Loop: primary tracks
 
-  } // All hits finished
+  if (fDebug > 0) {
+    printf("<AliTRDdigitizer::MakeDigits> ");
+    printf("Finished analyzing %d hits\n",countHits);
+  }
 
-  printf("AliTRDdigitizer::MakeDigits -- ");
-  printf("Finished analyzing %d hits\n",countHits);
+  // The total conversion factor
+  Float_t convert = kEl2fC * fPar->GetPadCoupling() 
+                           * fPar->GetTimeCoupling() 
+                           * fPar->GetChipGain();
 
   // Loop through all chambers to finalize the digits
   for (Int_t iDet = 0; iDet < AliTRDgeometry::Ndet(); iDet++) {
 
-    Int_t plane    = fGeo->GetPlane(iDet);
-    Int_t sector   = fGeo->GetSector(iDet);
-    Int_t chamber  = fGeo->GetChamber(iDet);
-    Int_t nRowMax  = fGeo->GetRowMax(plane,chamber,sector);
-    Int_t nColMax  = fGeo->GetColMax(plane);
-    Int_t nTimeMax = fGeo->GetTimeMax();
+    Int_t plane       = fGeo->GetPlane(iDet);
+    Int_t sector      = fGeo->GetSector(iDet);
+    Int_t chamber     = fGeo->GetChamber(iDet);
+    Int_t nRowMax     = fPar->GetRowMax(plane,chamber,sector);
+    Int_t nColMax     = fPar->GetColMax(plane);
+    Int_t nTimeMax    = fPar->GetTimeMax();
+    Int_t nTimeTotal  = fPar->GetTimeTotal();
+
+    Double_t *inADC  = new Double_t[nTimeTotal];
+    Double_t *outADC = new Double_t[nTimeTotal];
 
-    //if (!(CheckDetector(plane,chamber,sector))) continue;
-    if (fVerbose > 0) {
-      printf("AliTRDdigitizer::MakeDigits -- ");
+    if (fDebug > 0) {
+      printf("<AliTRDdigitizer::MakeDigits> ");
       printf("Digitization for chamber %d\n",iDet);
     }
 
     // Add a container for the digits of this detector
-    digits = fDigits->GetDigits(iDet);        
+    digits = fDigitsManager->GetDigits(iDet);        
     // Allocate memory space for the digits buffer
-    digits->Allocate(nRowMax,nColMax,nTimeMax);
+    digits->Allocate(nRowMax,nColMax,nTimeTotal);
 
     // Get the signal container
     signals = (AliTRDdataArrayF *) signalsArray->At(iDet);
     if (signals->GetNtime() == 0) {
       // Create missing containers
-      signals->Allocate(nRowMax,nColMax,nTimeMax);      
+      signals->Allocate(nRowMax,nColMax,nTimeTotal);      
     }
     else {
       // Expand the container if neccessary
@@ -961,50 +1009,79 @@ Bool_t AliTRDdigitizer::MakeDigits()
     }
     // Create the missing dictionary containers
     for (iDict = 0; iDict < kNDict; iDict++) {       
-      dictionary[iDict] = fDigits->GetDictionary(iDet,iDict);
+      dictionary[iDict] = fDigitsManager->GetDictionary(iDet,iDict);
       if (dictionary[iDict]->GetNtime() == 0) {
-        dictionary[iDict]->Allocate(nRowMax,nColMax,nTimeMax);
+        dictionary[iDict]->Allocate(nRowMax,nColMax,nTimeTotal);
       }
     }
 
     Int_t nDigits = 0;
 
-    // Create the digits for this chamber
-    for (iRow  = 0; iRow  <  nRowMax; iRow++ ) {
-      for (iCol  = 0; iCol  <  nColMax; iCol++ ) {
-        for (iTime = 0; iTime < nTimeMax; iTime++) {         
+    // Don't create noise in detectors that are switched off
+    if (CheckDetector(plane,chamber,sector)) {
 
-          Float_t signalAmp = signals->GetData(iRow,iCol,iTime);
+      // Create the digits for this chamber
+      for (iRow  = 0; iRow  <  nRowMax;   iRow++ ) {
+        for (iCol  = 0; iCol  <  nColMax;   iCol++ ) {
+
+         // Create summable digits
+          if (fSDigits) {
+
+            for (iTime = 0; iTime < nTimeTotal; iTime++) {         
+              Float_t signalAmp = signals->GetDataUnchecked(iRow,iCol,iTime);
+              signalAmp *= fSDigitsScale;
+              signalAmp  = TMath::Min(signalAmp,(Float_t) 1.0e9);
+              Int_t adc  = (Int_t) signalAmp;
+              if (adc > 0) nDigits++;
+              digits->SetDataUnchecked(iRow,iCol,iTime,adc);
+           }
 
-          // Add the noise
-          signalAmp  = TMath::Max((Double_t) gRandom->Gaus(signalAmp,fNoise),0.0);
-         // Convert to fC
-          signalAmp *= kEl2fC;
-          // Convert to mV
-          signalAmp *= fChipGain;
-         // Convert to ADC counts. Set the overflow-bit fADCoutRange if the 
-         // signal is larger than fADCinRange
-          Int_t adc  = 0;
-          if (signalAmp >= fADCinRange) {
-            adc = ((Int_t) fADCoutRange);
          }
+         // Create normal digits
           else {
-            adc = ((Int_t) (signalAmp * (fADCoutRange / fADCinRange)));
-         }
 
-          // Store the amplitude of the digit if above threshold
-          if (adc > fADCthreshold) {
-            if (fVerbose > 2) {
-              printf("  iRow = %d, iCol = %d, iTime = %d\n"
-                    ,iRow,iCol,iTime);
-              printf("  signal = %f, adc = %d\n",signalAmp,adc);
+            for (iTime = 0; iTime < nTimeTotal; iTime++) {         
+              Float_t signalAmp = signals->GetDataUnchecked(iRow,iCol,iTime);
+              // Add the noise
+              signalAmp  = TMath::Max((Double_t) gRandom->Gaus(signalAmp,fPar->GetNoise()),0.0);
+              // Convert to mV
+              signalAmp *= convert;
+             // Convert to ADC counts. Set the overflow-bit fADCoutRange if the 
+             // signal is larger than fADCinRange
+              Int_t adc  = 0;
+              if (signalAmp >= fPar->GetADCinRange()) {
+                adc = ((Int_t) fPar->GetADCoutRange());
+             }
+              else {
+                adc = ((Int_t) (signalAmp * (fPar->GetADCoutRange() 
+                                           / fPar->GetADCinRange())));
+             }
+              inADC[iTime]  = adc;
+              outADC[iTime] = adc;
            }
-            nDigits++;
-            digits->SetData(iRow,iCol,iTime,adc);
+
+           // Apply the tail cancelation via the digital filter
+            if (fPar->TCOn()) {
+              DeConvExp(inADC,outADC,nTimeTotal,fPar->GetTCnexp());
+           }
+
+            for (iTime = 0; iTime < nTimeTotal; iTime++) {   
+              // Store the amplitude of the digit if above threshold
+              if (outADC[iTime] > fPar->GetADCthreshold()) {
+                if (fDebug > 2) {
+                  printf("  iRow = %d, iCol = %d, iTime = %d, adc = %f\n"
+                        ,iRow,iCol,iTime,outADC[iTime]);
+               }
+                nDigits++;
+                digits->SetDataUnchecked(iRow,iCol,iTime,outADC[iTime]);
+             }
+           }
+
          }
 
-       }
+        }
       }
+
     }
 
     // Compress the arrays
@@ -1019,28 +1096,342 @@ Bool_t AliTRDdigitizer::MakeDigits()
     totalSizeDict2  += dictionary[2]->GetSize();
 
     Float_t nPixel = nRowMax * nColMax * nTimeMax;
-    printf("AliTRDdigitizer::MakeDigits -- ");
-    printf("Found %d digits in detector %d (%3.0f).\n"
-          ,nDigits,iDet
-          ,100.0 * ((Float_t) nDigits) / nPixel);
+    if (fDebug > 0) {
+      printf("<AliTRDdigitizer::MakeDigits> ");
+      printf("Found %d digits in detector %d (%3.0f).\n"
+            ,nDigits,iDet
+            ,100.0 * ((Float_t) nDigits) / nPixel);
+    } 
+
     if (fCompress) signals->Compress(1,0);
 
+    delete [] inADC;
+    delete [] outADC;
+
+  }
+
+  if (fDebug > 0) {
+    printf("<AliTRDdigitizer::MakeDigits> ");
+    printf("Total number of analyzed hits = %d\n",countHits);
+    printf("<AliTRDdigitizer::MakeDigits> ");
+    printf("Total digits data size = %d, %d, %d, %d\n",totalSizeDigits
+                                                      ,totalSizeDict0
+                                                      ,totalSizeDict1
+                                                      ,totalSizeDict2);        
+  }
+
+  return kTRUE;
+
+}
+
+//_____________________________________________________________________________
+void AliTRDdigitizer::AddSDigitsManager(AliTRDdigitsManager *man)
+{
+  //
+  // Add a digits manager for s-digits to the input list.
+  //
+
+  fSDigitsManagerList->Add(man);
+
+}
+
+//_____________________________________________________________________________
+void AliTRDdigitizer::DeleteSDigitsManager()
+{
+  //
+  // Removes digits manager from the input list.
+  //
+
+  fSDigitsManagerList->Delete();
+
+}
+
+//_____________________________________________________________________________
+Bool_t AliTRDdigitizer::ConvertSDigits()
+{
+  //
+  // Converts s-digits to normal digits
+  //
+
+  // Number of track dictionary arrays
+  const Int_t    kNDict = AliTRDdigitsManager::kNDict;
+
+  // Converts number of electrons to fC
+  const Double_t kEl2fC = 1.602E-19 * 1.0E15; 
+
+  Int_t iDict = 0;
+  Int_t iRow;
+  Int_t iCol;
+  Int_t iTime;
+
+  if (!fPar) {    
+    fPar = new AliTRDparameter("TRDparameter","Standard parameter");
+    if (fDebug > 0) {
+      printf("<AliTRDdigitizer::ConvertSDigits> ");
+      printf("Create the default parameter object\n");
+    }
+  }
+
+  Double_t sDigitsScale = 1.0 / GetSDigitsScale();
+  Double_t noise        = fPar->GetNoise();
+  Double_t padCoupling  = fPar->GetPadCoupling();
+  Double_t timeCoupling = fPar->GetTimeCoupling();
+  Double_t chipGain     = fPar->GetChipGain();
+  Double_t convert      = kEl2fC * padCoupling * timeCoupling * chipGain;;
+  Double_t adcInRange   = fPar->GetADCinRange();
+  Double_t adcOutRange  = fPar->GetADCoutRange();
+  Int_t    adcThreshold = fPar->GetADCthreshold();
+
+  AliTRDdataArrayI *digitsIn;
+  AliTRDdataArrayI *digitsOut;
+  AliTRDdataArrayI *dictionaryIn[kNDict];
+  AliTRDdataArrayI *dictionaryOut[kNDict];
+
+  // Loop through the detectors
+  for (Int_t iDet = 0; iDet < AliTRDgeometry::Ndet(); iDet++) {
+
+    if (fDebug > 0) {
+      printf("<AliTRDdigitizer::ConvertSDigits> ");
+      printf("Convert detector %d to digits.\n",iDet);
+    }
+
+    Int_t plane      = fGeo->GetPlane(iDet);
+    Int_t sector     = fGeo->GetSector(iDet);
+    Int_t chamber    = fGeo->GetChamber(iDet);
+    Int_t nRowMax    = fPar->GetRowMax(plane,chamber,sector);
+    Int_t nColMax    = fPar->GetColMax(plane);
+    Int_t nTimeTotal = fPar->GetTimeTotal();
+
+    Double_t *inADC  = new Double_t[nTimeTotal];
+    Double_t *outADC = new Double_t[nTimeTotal];
+
+    digitsIn  = fSDigitsManager->GetDigits(iDet);
+    digitsIn->Expand();
+    digitsOut = fDigitsManager->GetDigits(iDet);
+    digitsOut->Allocate(nRowMax,nColMax,nTimeTotal);
+    for (iDict = 0; iDict < kNDict; iDict++) {
+      dictionaryIn[iDict]  = fSDigitsManager->GetDictionary(iDet,iDict);
+      dictionaryIn[iDict]->Expand();
+      dictionaryOut[iDict] = fDigitsManager->GetDictionary(iDet,iDict);
+      dictionaryOut[iDict]->Allocate(nRowMax,nColMax,nTimeTotal);
+    }
+
+    for (iRow  = 0; iRow  <  nRowMax;   iRow++ ) {
+      for (iCol  = 0; iCol  <  nColMax;   iCol++ ) {
+
+        for (iTime = 0; iTime < nTimeTotal; iTime++) {         
+          Double_t signal = (Double_t) digitsIn->GetDataUnchecked(iRow,iCol,iTime);
+          signal *= sDigitsScale;
+          // Add the noise
+          signal  = TMath::Max((Double_t) gRandom->Gaus(signal,noise),0.0);
+          // Convert to mV
+          signal *= convert;
+         // Convert to ADC counts. Set the overflow-bit adcOutRange if the 
+         // signal is larger than adcInRange
+          Int_t adc  = 0;
+          if (signal >= adcInRange) {
+            adc = ((Int_t) adcOutRange);
+         }
+          else {
+            adc = ((Int_t) (signal * (adcOutRange / adcInRange)));
+         }
+          inADC[iTime]  = adc;
+          outADC[iTime] = adc;
+       }
+
+       // Apply the tail cancelation via the digital filter
+        if (fPar->TCOn()) {
+          DeConvExp(inADC,outADC,nTimeTotal,fPar->GetTCnexp());
+       }
+
+        for (iTime = 0; iTime < nTimeTotal; iTime++) {   
+          // Store the amplitude of the digit if above threshold
+          if (outADC[iTime] > adcThreshold) {
+            digitsOut->SetDataUnchecked(iRow,iCol,iTime,outADC[iTime]);
+           // Copy the dictionary
+            for (iDict = 0; iDict < kNDict; iDict++) { 
+              Int_t track = dictionaryIn[iDict]->GetDataUnchecked(iRow,iCol,iTime);
+              dictionaryOut[iDict]->SetDataUnchecked(iRow,iCol,iTime,track);
+           }
+         }
+       }
+
+      }
+    }
+
+    if (fCompress) {
+      digitsIn->Compress(1,0);
+      digitsOut->Compress(1,0);
+      for (iDict = 0; iDict < kNDict; iDict++) {
+        dictionaryIn[iDict]->Compress(1,0);
+        dictionaryOut[iDict]->Compress(1,0);
+      }
+    }
+
+    delete [] inADC;
+    delete [] outADC;
+
+  }    
+
+  return kTRUE;
+
+}
+
+//_____________________________________________________________________________
+Bool_t AliTRDdigitizer::MergeSDigits()
+{
+  //
+  // Merges the input s-digits:
+  //   - The amplitude of the different inputs are summed up.
+  //   - Of the track IDs from the input dictionaries only one is
+  //     kept for each input. This works for maximal 3 different merged inputs.
+  //
+
+  // Number of track dictionary arrays
+  const Int_t kNDict = AliTRDdigitsManager::kNDict;
+
+  if (!fPar) {
+    fPar = new AliTRDparameter("TRDparameter","Standard parameter");
+    if (fDebug > 0) {
+      printf("<AliTRDdigitizer::MergeSDigits> ");
+      printf("Create the default parameter object\n");
+    }
   }
 
-  printf("AliTRDdigitizer::MakeDigits -- ");
-  printf("Total number of analyzed hits = %d\n",countHits);
+  Int_t iDict = 0;
+  Int_t jDict = 0;
+
+  AliTRDdataArrayI *digitsA;
+  AliTRDdataArrayI *digitsB;
+  AliTRDdataArrayI *dictionaryA[kNDict];
+  AliTRDdataArrayI *dictionaryB[kNDict];
+
+  // Get the first s-digits
+  fSDigitsManager = (AliTRDdigitsManager *) fSDigitsManagerList->First();
+  if (!fSDigitsManager) return kFALSE;
 
-  printf("AliTRDdigitizer::MakeDigits -- ");
-  printf("Total digits data size = %d, %d, %d, %d\n",totalSizeDigits
-                                                    ,totalSizeDict0
-                                                    ,totalSizeDict1
-                                                    ,totalSizeDict2);        
+  // Loop through the other sets of s-digits
+  AliTRDdigitsManager *mergeSDigitsManager;
+  mergeSDigitsManager = (AliTRDdigitsManager *) 
+                        fSDigitsManagerList->After(fSDigitsManager);
+
+  if (fDebug > 0) {
+    if (mergeSDigitsManager) {
+      printf("<AliTRDdigitizer::MergeSDigits> ");
+      printf("Merge %d input files.\n",fSDigitsManagerList->GetSize());
+    }
+    else {
+      printf("<AliTRDdigitizer::MergeSDigits> ");
+      printf("Only one input file.\n");
+    }
+  }
+
+  Int_t iMerge = 0;
+  while (mergeSDigitsManager) {
+
+    iMerge++;
+
+    // Loop through the detectors
+    for (Int_t iDet = 0; iDet < AliTRDgeometry::Ndet(); iDet++) {
+
+      Int_t plane      = fGeo->GetPlane(iDet);
+      Int_t sector     = fGeo->GetSector(iDet);
+      Int_t chamber    = fGeo->GetChamber(iDet);
+      Int_t nRowMax    = fPar->GetRowMax(plane,chamber,sector);
+      Int_t nColMax    = fPar->GetColMax(plane);
+      Int_t nTimeTotal = fPar->GetTimeTotal();
+
+      // Loop through the pixels of one detector and add the signals
+      digitsA = fSDigitsManager->GetDigits(iDet);
+      digitsB = mergeSDigitsManager->GetDigits(iDet);
+      digitsA->Expand();
+      digitsB->Expand();
+      for (iDict = 0; iDict < kNDict; iDict++) {
+        dictionaryA[iDict] = fSDigitsManager->GetDictionary(iDet,iDict);
+        dictionaryB[iDict] = mergeSDigitsManager->GetDictionary(iDet,iDict);
+        dictionaryA[iDict]->Expand();
+        dictionaryB[iDict]->Expand();
+      }
+
+      // Merge only detectors that contain a signal
+      Bool_t doMerge = kTRUE;
+      if (fMergeSignalOnly) {
+        if (digitsA->GetOverThreshold(0) == 0) {
+          doMerge = kFALSE;
+       }
+      }
+
+      if (doMerge) {
+
+        if (fDebug > 0) {
+          printf("<AliTRDdigitizer::MergeSDigits> ");
+          printf("Merge detector %d of input no.%d\n",iDet,iMerge+1);
+        }
+
+        for (Int_t iRow  = 0; iRow  <  nRowMax;   iRow++ ) {
+          for (Int_t iCol  = 0; iCol  <  nColMax;   iCol++ ) {
+            for (Int_t iTime = 0; iTime < nTimeTotal; iTime++) {         
+
+             // Add the amplitudes of the summable digits 
+              Int_t ampA = digitsA->GetDataUnchecked(iRow,iCol,iTime);
+              Int_t ampB = digitsB->GetDataUnchecked(iRow,iCol,iTime);
+              ampA += ampB;
+              digitsA->SetDataUnchecked(iRow,iCol,iTime,ampA);
+
+            // Add the mask to the track id if defined.
+              for (iDict = 0; iDict < kNDict; iDict++) {
+                Int_t trackB = dictionaryB[iDict]->GetDataUnchecked(iRow,iCol,iTime);
+                if ((fMasks) && (trackB > 0)) {
+                  for (jDict = 0; jDict < kNDict; jDict++) { 
+                    Int_t trackA = dictionaryA[iDict]->GetDataUnchecked(iRow,iCol,iTime);
+                    if (trackA == 0) {
+                      trackA = trackB + fMasks[iMerge];
+                      dictionaryA[iDict]->SetDataUnchecked(iRow,iCol,iTime,trackA);
+                   }
+                 }
+               }
+             }
+
+           }
+         }
+        }
+
+      }
+
+      if (fCompress) {
+        digitsA->Compress(1,0);
+        digitsB->Compress(1,0);
+        for (iDict = 0; iDict < kNDict; iDict++) {
+          dictionaryA[iDict]->Compress(1,0);
+          dictionaryB[iDict]->Compress(1,0);
+        }
+      }
+
+    }    
+
+    // The next set of s-digits
+    mergeSDigitsManager = (AliTRDdigitsManager *) 
+                          fSDigitsManagerList->After(mergeSDigitsManager);
+
+  }
 
   return kTRUE;
 
 }
 
+//_____________________________________________________________________________
+Bool_t AliTRDdigitizer::SDigits2Digits()
+{
+  //
+  // Merges the input s-digits and converts them to normal digits
+  //
+
+  if (!MergeSDigits()) return kFALSE;
+
+  return ConvertSDigits();
+
+}
+
 //_____________________________________________________________________________
 Bool_t AliTRDdigitizer::CheckDetector(Int_t plane, Int_t chamber, Int_t sector)
 {
@@ -1070,63 +1461,82 @@ Bool_t AliTRDdigitizer::CheckDetector(Int_t plane, Int_t chamber, Int_t sector)
 }
 
 //_____________________________________________________________________________
-Bool_t AliTRDdigitizer::WriteDigits()
+Bool_t AliTRDdigitizer::WriteDigits() const
 {
   //
   // Writes out the TRD-digits and the dictionaries
   //
 
-  // Create the branches
-  if (!(gAlice->TreeD()->GetBranch("TRDdigits"))) { 
-    if (!fDigits->MakeBranch()) return kFALSE;
-  }
-
   // Store the digits and the dictionary in the tree
-  fDigits->WriteDigits();
-
-  // Write the new tree into the input file (use overwrite option)
-  Char_t treeName[15];
-  sprintf(treeName,"TreeD%d",fEvent);
-  printf("AliTRDdigitizer::WriteDigits -- ");
-  printf("Write the digits tree %s for event %d.\n"
-        ,treeName,fEvent);
-  gAlice->TreeD()->Write(treeName,TObject::kOverwrite);
-  return kTRUE;
+  return fDigitsManager->WriteDigits();
 
 }
 
 //_____________________________________________________________________________
-void AliTRDdigitizer::SetPRF(TF1 *prf)
+void AliTRDdigitizer::DeConvExp(Double_t *source, Double_t *target
+                              , Int_t n, Int_t nexp) 
 {
   //
-  // Defines a new pad response function
+  // Does the deconvolution by the digital filter.
+  //
+  // Author:        Marcus Gutfleisch, KIP Heidelberg
+  // Optimized for: New TRF from Venelin Angelov, simulated with CADENCE
+  //                Pad-ground capacitance = 25 pF
+  //                Pad-pad cross talk capacitance = 6 pF
+  //                For 10 MHz digitization, corresponding to 20 time bins
+  //                in the drift region
   //
 
-  if (fPRF) delete fPRF;
-  fPRF = prf;     
+  Double_t rates[2];
+  Double_t coefficients[2];
 
+  /* initialize (coefficient = alpha, rates = lambda) */
+  
+  if( nexp == 1 ) {
+    rates[0] = 0.466998;
+    /* no rescaling */
+    coefficients[0] = 1.0;
+  }
+  if( nexp == 2 ) {
+    rates[0] = 0.8988162;
+    coefficients[0] = 0.11392069;
+    rates[1] = 0.3745688;
+    coefficients[1] = 0.8860793;
+    /* no rescaling */
+    Float_t sumc = coefficients[0]+coefficients[1];
+    coefficients[0] /= sumc;
+    coefficients[1] /= sumc;
+  }
+      
+  Int_t i, k;
+  Double_t reminder[2];
+  Double_t correction, result;
+
+  /* attention: computation order is important */
+  correction=0.0;
+  for ( k = 0; k < nexp; k++ ) reminder[k]=0.0;
+    
+  for ( i = 0; i < n; i++ ) {
+    result = ( source[i] - correction );    /* no rescaling */
+    target[i] = result;
+    
+    for ( k = 0; k < nexp; k++ ) reminder[k] = rates[k] 
+                             * ( reminder[k] + coefficients[k] * result);
+      
+    correction=0.0;
+    for ( k = 0; k < nexp; k++ ) correction += reminder[k];
+  }
+  
 }
 
 //_____________________________________________________________________________
-void AliTRDdigitizer::SetTRF(TF1 *trf)
+void AliTRDdigitizer::InitOutput(TFile *file, Int_t iEvent)
 {
   //
-  // Defines a new time response function
+  // Initializes the output branches
   //
 
-  if (fTRF) delete fTRF;
-  fTRF = trf;     
-
-}
-
-//_____________________________________________________________________________
-Double_t TRFlandau(Double_t *x, Double_t *par)
-{
-
-  Double_t xx = x[0];
-  Double_t landau = par[0] * TMath::Landau(xx,par[1],par[2]);
-
-  return landau;
+  fEvent = iEvent;
+  fDigitsManager->MakeTreeAndBranches(file,iEvent);
 
 }