Include the new TRD classes
[u/mrichter/AliRoot.git] / TRD / AliTRDv1.cxx
index 190137e..50b8035 100644 (file)
 
 /*
 $Log$
+Revision 1.16.4.1  2000/02/28 18:04:35  cblume
+Change to new hit version, introduce geometry class, and move digitization and clustering to AliTRDdigitizer/AliTRDclusterizerV1
+
+Revision 1.16  1999/11/05 22:50:28  fca
+Do not use Atan, removed from ROOT too
+
 Revision 1.15  1999/11/02 17:20:19  fca
 initialise nbytes before using it
 
@@ -52,12 +58,14 @@ Introduction of the Copyright and cvs Log
 #include <TVector.h>
 #include <TRandom.h>
 
-#include "AliTRDv1.h"
-#include "AliTRDmatrix.h"
 #include "AliRun.h"
 #include "AliMC.h"
 #include "AliConst.h"
 
+#include "AliTRDv1.h"
+#include "AliTRDmatrix.h"
+#include "AliTRDgeometry.h"
+
 ClassImp(AliTRDv1)
 
 //_____________________________________________________________________________
@@ -65,33 +73,19 @@ AliTRDv1::AliTRDv1(const char *name, const char *title)
          :AliTRD(name, title) 
 {
   //
-  // Standard constructor for Transition Radiation Detector version 2
+  // Standard constructor for Transition Radiation Detector version 1
   //
 
-  fIdSens        = 0;
-
-  fIdChamber1    = 0;
-  fIdChamber2    = 0;
-  fIdChamber3    = 0;
-
-  fSensSelect    = 0;
-  fSensPlane     = 0;
-  fSensChamber   = 0;
-  fSensSector    = 0;
+  fIdSens        =  0;
 
-  fGasGain       = 0;
-  fNoise         = 0;
-  fChipGain      = 0;
-  fADCoutRange   = 0;
-  fADCinRange    = 0;
-  fADCthreshold  = 0;
+  fIdChamber1    =  0;
+  fIdChamber2    =  0;
+  fIdChamber3    =  0;
 
-  fDiffusionT    = 0;
-  fDiffusionL    = 0;
-
-  fClusMaxThresh = 0;
-  fClusSigThresh = 0;
-  fClusMethod    = 0;
+  fSensSelect    =  0;
+  fSensPlane     = -1;
+  fSensChamber   = -1;
+  fSensSector    = -1;
 
   fDeltaE        = NULL;
 
@@ -111,7 +105,7 @@ AliTRDv1::~AliTRDv1()
 void AliTRDv1::CreateGeometry()
 {
   //
-  // Create the GEANT geometry for the Transition Radiation Detector - Version 2
+  // Create the GEANT geometry for the Transition Radiation Detector - Version 1
   // This version covers the full azimuth. 
   //
 
@@ -128,556 +122,32 @@ void AliTRDv1::CreateGeometry()
 void AliTRDv1::CreateMaterials()
 {
   //
-  // Create materials for the Transition Radiation Detector version 2
+  // Create materials for the Transition Radiation Detector version 1
   //
 
   AliTRD::CreateMaterials();
 
 }
 
-//_____________________________________________________________________________
-void AliTRDv1::Diffusion(Float_t driftlength, Float_t *xyz)
-{
-  //
-  // Applies the diffusion smearing to the position of a single electron
-  //
-
-  if ((driftlength >        0) && 
-      (driftlength < kDrThick)) {
-    Float_t driftSqrt = TMath::Sqrt(driftlength);
-    Float_t sigmaT = driftSqrt * fDiffusionT;
-    Float_t sigmaL = driftSqrt * fDiffusionL;
-    xyz[0] = gRandom->Gaus(xyz[0], sigmaL);
-    xyz[1] = gRandom->Gaus(xyz[1], sigmaT);
-    xyz[2] = gRandom->Gaus(xyz[2], sigmaT);
-  }
-  else {
-    xyz[0] = 0.0;
-    xyz[1] = 0.0;
-    xyz[2] = 0.0;
-  }
-
-}
-
-//_____________________________________________________________________________
-void AliTRDv1::Hits2Digits()
-{
-  //
-  // Creates TRD digits from hits. This procedure includes the following:
-  //      - Diffusion
-  //      - Gas gain including fluctuations
-  //      - Pad-response (simple Gaussian approximation)
-  //      - Electronics noise
-  //      - Electronics gain
-  //      - Digitization
-  //      - ADC threshold
-  // The corresponding parameter can be adjusted via the various Set-functions.
-  // If these parameters are not explicitly set, default values are used (see
-  // Init-function).
-  // To produce digits from a root-file with TRD-hits use the
-  // slowDigitsCreate.C macro.
-  //
-
-  printf("AliTRDv1::Hits2Digits -- Start creating digits\n");
-
-  ///////////////////////////////////////////////////////////////
-  // Parameter 
-  ///////////////////////////////////////////////////////////////
-
-  // Converts number of electrons to fC
-  const Float_t el2fC = 1.602E-19 * 1.0E15; 
-
-  ///////////////////////////////////////////////////////////////
-
-  Int_t nBytes = 0;
-
-  Int_t iRow;
-
-  AliTRDhit *TRDhit;
-
-  // Get the pointer to the hit tree
-  TTree *HitTree    = gAlice->TreeH();
-  // Get the pointer to the digits tree
-  TTree *DigitsTree = gAlice->TreeD();
-
-  // Get the number of entries in the hit tree
-  // (Number of primary particles creating a hit somewhere)
-  Int_t nTrack = (Int_t) HitTree->GetEntries();
-
-  Int_t chamBeg = 0;
-  Int_t chamEnd = kNcham;
-  if (fSensChamber) chamEnd = chamBeg = fSensChamber;
-  Int_t planBeg = 0;
-  Int_t planEnd = kNplan;
-  if (fSensPlane)   planEnd = planBeg = fSensPlane;
-  Int_t sectBeg = 0;
-  Int_t sectEnd = kNsect;
-  if (fSensSector)  sectEnd = sectBeg = fSensSector;
-
-  // Loop through all the chambers
-  for (Int_t icham = chamBeg; icham < chamEnd; icham++) {
-    for (Int_t iplan = planBeg; iplan < planEnd; iplan++) {
-      for (Int_t isect = sectBeg; isect < sectEnd; isect++) {
-
-        Int_t nDigits = 0;
-
-        printf("AliTRDv1::Hits2Digits -- Digitizing chamber %d, plane %d, sector %d\n"
-              ,icham+1,iplan+1,isect+1);
-
-        // Create a detector matrix to keep the signal and track numbers
-        AliTRDmatrix *matrix = new AliTRDmatrix(fRowMax[iplan][icham][isect]
-                                               ,fColMax[iplan]
-                                               ,fTimeMax
-                                               ,isect+1,icham+1,iplan+1);
-
-        // Loop through all entries in the tree
-        for (Int_t iTrack = 0; iTrack < nTrack; iTrack++) {
-
-          gAlice->ResetHits();
-          nBytes += HitTree->GetEvent(iTrack);
-
-          // Get the number of hits in the TRD created by this particle
-          Int_t nHit = fHits->GetEntriesFast();
-
-          // Loop through the TRD hits  
-          for (Int_t iHit = 0; iHit < nHit; iHit++) {
-
-            if (!(TRDhit = (AliTRDhit *) fHits->UncheckedAt(iHit))) 
-              continue;
-
-            Float_t x       = TRDhit->fX;
-            Float_t y       = TRDhit->fY;
-            Float_t z       = TRDhit->fZ;
-            Float_t q       = TRDhit->fQ;
-            Int_t   track   = TRDhit->fTrack;
-            Int_t   plane   = TRDhit->fPlane;
-            Int_t   sector  = TRDhit->fSector;
-            Int_t   chamber = TRDhit->fChamber;        
-
-            if ((sector  != isect+1) ||
-                (plane   != iplan+1) ||
-                (chamber != icham+1)) 
-              continue;
-
-            // Rotate the sectors on top of each other
-            Float_t phi  = 2.0 * kPI /  (Float_t) kNsect 
-                               * ((Float_t) sector - 0.5);
-            Float_t xRot = -x * TMath::Cos(phi) + y * TMath::Sin(phi);
-            Float_t yRot =  x * TMath::Sin(phi) + y * TMath::Cos(phi);
-            Float_t zRot =  z;
-
-            // The hit position in pad coordinates (center pad)
-            // The pad row (z-direction)
-            Int_t rowH  = (Int_t) ((zRot -  fRow0[iplan][icham][isect]) / fRowPadSize);
-            // The pad column (rphi-direction)  
-            Int_t colH  = (Int_t) ((yRot -  fCol0[iplan]              ) / fColPadSize);
-            // The time bucket
-            Int_t timeH = (Int_t) ((xRot - fTime0[iplan]              ) / fTimeBinSize);
-
-            // Array to sum up the signal in a box surrounding the
-            // hit postition
-            const Int_t timeBox = 5;
-            const Int_t  colBox = 7;
-            const Int_t  rowBox = 5;
-            Float_t signalSum[rowBox][colBox][timeBox];
-            for (iRow  = 0;  iRow <  rowBox; iRow++ ) {
-              for (Int_t iCol  = 0;  iCol <  colBox; iCol++ ) {
-                for (Int_t iTime = 0; iTime < timeBox; iTime++) {
-                  signalSum[iRow][iCol][iTime] = 0;
-               }
-             }
-           }
-
-            // Loop over all electrons of this hit
-            Int_t nEl = (Int_t) q;
-            for (Int_t iEl = 0; iEl < nEl; iEl++) {
-
-              // Apply the diffusion smearing
-              Float_t driftlength = xRot - fTime0[iplan];
-              Float_t xyz[3];
-              xyz[0] = xRot;
-              xyz[1] = yRot;
-              xyz[2] = zRot;
-              Diffusion(driftlength,xyz);
-
-              // At this point absorption effects that depend on the 
-             // driftlength could be taken into account.              
-
-              // The electron position and the distance to the hit position
-             // in pad units
-              // The pad row (z-direction)
-              Int_t  rowE = (Int_t) ((xyz[2] -  fRow0[iplan][icham][isect]) / fRowPadSize);
-              Int_t  rowD =  rowH -  rowE;
-              // The pad column (rphi-direction)
-              Int_t  colE = (Int_t) ((xyz[1] -  fCol0[iplan]              ) / fColPadSize);
-              Int_t  colD =  colH -  colE;
-              // The time bucket
-              Int_t timeE = (Int_t) ((xyz[0] - fTime0[iplan]              ) / fTimeBinSize);
-              Int_t timeD = timeH - timeE;
-
-              // Apply the gas gain including fluctuations
-              Int_t signal = (Int_t) (-fGasGain * TMath::Log(gRandom->Rndm()));
-
-             // The distance of the electron to the center of the pad 
-             // in units of pad width
-              Float_t dist = (xyz[1] - fCol0[iplan] - (colE + 0.5) * fColPadSize) 
-                           / fColPadSize;
-
-              // Sum up the signal in the different pixels
-              // and apply the pad response
-              Int_t  rowIdx =  rowD + (Int_t) ( rowBox / 2);
-              Int_t  colIdx =  colD + (Int_t) ( colBox / 2);
-              Int_t timeIdx = timeD + (Int_t) (timeBox / 2);
-              signalSum[rowIdx][colIdx-1][timeIdx] += PadResponse(dist-1.) * signal;
-              signalSum[rowIdx][colIdx  ][timeIdx] += PadResponse(dist   ) * signal;
-              signalSum[rowIdx][colIdx+1][timeIdx] += PadResponse(dist+1.) * signal;
-
-            }
-
-            // Add the padcluster to the detector matrix
-            for (iRow  = 0;  iRow <  rowBox; iRow++ ) {
-              for (Int_t iCol  = 0;  iCol <  colBox; iCol++ ) {
-                for (Int_t iTime = 0; iTime < timeBox; iTime++) {
-
-                  Int_t  rowB =  rowH + iRow  - (Int_t) ( rowBox / 2); 
-                  Int_t  colB =  colH + iCol  - (Int_t) ( colBox / 2);
-                  Int_t timeB = timeH + iTime - (Int_t) (timeBox / 2);
-
-                  Float_t signalB = signalSum[iRow][iCol][iTime];
-                  if (signalB > 0.0) {
-                    matrix->AddSignal(rowB,colB,timeB,signalB);
-                    if (!(matrix->AddTrack(rowB,colB,timeB,track))) 
-                      printf(" More than three tracks in a pixel!\n");
-                 }
-
-               }
-             }
-           }
-
-          }
-
-       }
-
-        // Create the hits for this chamber
-        for (Int_t iRow  = 0; iRow  <  fRowMax[iplan][icham][isect]; iRow++ ) {
-          for (Int_t iCol  = 0; iCol  <  fColMax[iplan]              ; iCol++ ) {
-            for (Int_t iTime = 0; iTime < fTimeMax                     ; iTime++) {         
-
-              Float_t signalAmp = matrix->GetSignal(iRow,iCol,iTime);
-
-              // Add the noise
-              signalAmp  = TMath::Max(gRandom->Gaus(signalAmp,fNoise),(Float_t) 0.0);
-             // Convert to fC
-              signalAmp *= el2fC;
-              // Convert to mV
-              signalAmp *= fChipGain;
-             // Convert to ADC counts
-              Int_t adc  = (Int_t) (signalAmp * (fADCoutRange / fADCinRange));
-
-             // Apply threshold on ADC value
-              if (adc > fADCthreshold) {
-
-                Int_t trackSave[3];
-                for (Int_t ii = 0; ii < 3; ii++) {
-                  trackSave[ii] = matrix->GetTrack(iRow,iCol,iTime,ii);
-               }
-
-                Int_t digits[7];
-                digits[0] = matrix->GetSector();
-                digits[1] = matrix->GetChamber();
-                digits[2] = matrix->GetPlane();
-                digits[3] = iRow;
-                digits[4] = iCol;
-                digits[5] = iTime;
-                digits[6] = adc;
-
-               // Add this digit to the TClonesArray
-                AddDigit(trackSave,digits);
-                nDigits++;
-
-             }
-
-           }
-         }
-       }
-
-        printf("AliTRDv1::Hits2Digits -- Number of digits found: %d\n",nDigits);
-
-       // Clean up
-        delete matrix;
-
-      }
-    }
-  }
-
-  // Fill the digits-tree
-  printf("AliTRDv1::Hits2Digits -- Fill the digits tree\n");
-  DigitsTree->Fill();
-
-}
-
-//_____________________________________________________________________________
-void AliTRDv1::Digits2Clusters()
-{
-
-  //
-  // Method to convert AliTRDdigits created by AliTRDv1::Hits2Digits()
-  // into AliTRDclusters
-  // To produce cluster from a root-file with TRD-digits use the
-  // slowClusterCreate.C macro.
-  //
-  
-  Int_t row;
-
-  printf("AliTRDv1::Digits2Clusters -- Start creating clusters\n");
-
-  AliTRDdigit  *TRDdigit;
-  TClonesArray *TRDDigits;
-
-  // Parameters
-  Float_t maxThresh        = fClusMaxThresh;   // threshold value for maximum
-  Float_t signalThresh     = fClusSigThresh;   // threshold value for digit signal
-  Int_t   clusteringMethod = fClusMethod;      // clustering method option (for testing)
-
-  const Float_t epsilon    = 0.01;             // iteration limit for unfolding procedure
-
-  // Get the pointer to the digits tree
-  TTree *DigitTree   = gAlice->TreeD();
-  // Get the pointer to the cluster tree
-  TTree *ClusterTree = gAlice->TreeD();
-
-  // Get the pointer to the digits container
-  TRDDigits = Digits();
-
-  Int_t chamBeg = 0;
-  Int_t chamEnd = kNcham;
-  if (fSensChamber) chamEnd = chamBeg = fSensChamber;
-  Int_t planBeg = 0;
-  Int_t planEnd = kNplan;
-  if (fSensPlane)   planEnd = planBeg = fSensPlane;
-  Int_t sectBeg = 0;
-  Int_t sectEnd = kNsect;
-  if (fSensSector)  sectEnd = sectBeg = fSensSector;
-
-  // Import the digit tree
-  gAlice->ResetDigits();
-  Int_t nbytes=0;
-  nbytes += DigitTree->GetEvent(1);
-
-  // Get the number of digits in the detector
-  Int_t nTRDDigits = TRDDigits->GetEntriesFast();
-
-  // *** Start clustering *** in every chamber
-  for (Int_t icham = chamBeg; icham < chamEnd; icham++) {
-    for (Int_t iplan = planBeg; iplan < planEnd; iplan++) {
-      for (Int_t isect = sectBeg; isect < sectEnd; isect++) {
-
-        Int_t nClusters = 0;
-        printf("AliTRDv1::Digits2Clusters -- Finding clusters in chamber %d, plane %d, sector %d\n"
-               ,icham+1,iplan+1,isect+1);
-
-        // Create a detector matrix to keep maxima
-        AliTRDmatrix *digitMatrix = new AliTRDmatrix(fRowMax[iplan][icham][isect]
-                                                     ,fColMax[iplan]
-                                                     ,fTimeMax,isect+1
-                                                     ,icham+1,iplan+1);
-        // Create a matrix to contain maximum flags
-        AliTRDmatrix *maximaMatrix = new AliTRDmatrix(fRowMax[iplan][icham][isect]
-                                                      ,fColMax[iplan]
-                                                      ,fTimeMax
-                                                      ,isect+1,icham+1,iplan+1);
-
-        // Loop through all TRD digits
-        for (Int_t iTRDDigits = 0; iTRDDigits < nTRDDigits; iTRDDigits++) {
-
-          // Get the information for this digit
-          TRDdigit = (AliTRDdigit*) TRDDigits->UncheckedAt(iTRDDigits);
-          Int_t   signal  = TRDdigit->fSignal;
-          Int_t   sector  = TRDdigit->fSector;
-          Int_t   chamber = TRDdigit->fChamber;
-          Int_t   plane   = TRDdigit->fPlane;
-          Int_t   row     = TRDdigit->fRow;
-          Int_t   col     = TRDdigit->fCol;
-          Int_t   time    = TRDdigit->fTime;
-
-          Int_t   track[3];
-          for (Int_t iTrack = 0; iTrack < 3; iTrack++) {
-            track[iTrack]  = TRDdigit->AliDigit::fTracks[iTrack];
-          }
-
-          if ((sector  != isect+1) ||
-              (plane   != iplan+1) ||
-              (chamber != icham+1))
-            continue;
-
-          // Fill the detector matrix
-          if (signal > signalThresh) {
-            digitMatrix->SetSignal(row,col,time,signal);
-            for (Int_t iTrack = 0; iTrack < 3; iTrack++) {
-              if (track[iTrack] > 0) {
-                digitMatrix->AddTrack(row,col,time,track[iTrack]);
-              }
-            }
-          }
-
-        }
-
-        // Loop chamber and find maxima in digitMatrix
-        for (row = 0;  row < fRowMax[iplan][icham][isect];  row++) {
-          for (Int_t  col = 1;  col < fColMax[iplan]              ;  col++) {
-            for (Int_t time = 0; time < fTimeMax                    ; time++) {
-
-              if (digitMatrix->GetSignal(row,col,time) 
-                  < digitMatrix->GetSignal(row,col - 1,time)) {
-                // really maximum?
-                if (col > 1) {
-                  if (digitMatrix->GetSignal(row,col - 2,time)
-                      < digitMatrix->GetSignal(row,col - 1,time)) {
-                    // yes, so set maximum flag
-                    maximaMatrix->SetSignal(row,col - 1,time,1);
-                  }
-                  else maximaMatrix->SetSignal(row,col - 1,time,0);
-                }
-              }
-
-            }   // time
-          }     // col
-        }       // row
-
-        // now check maxima and calculate cluster position
-        for (row = 0;  row < fRowMax[iplan][icham][isect];  row++) {
-          for (Int_t  col = 1;  col < fColMax[iplan]              ;  col++) {
-            for (Int_t time = 0; time < fTimeMax                    ; time++) {
-
-              if ((maximaMatrix->GetSignal(row,col,time) > 0)
-                  && (digitMatrix->GetSignal(row,col,time) > maxThresh)) {
-
-                Int_t   clusters[5]        = {0};   // cluster-object data
-
-                Float_t ratio              =  0;    // ratio resulting from unfolding
-                Float_t padSignal[5]       = {0};   // signals on max and neighbouring pads
-                Float_t clusterSignal[3]   = {0};   // signals from cluster
-                Float_t clusterPos[3]      = {0};   // cluster in ALICE refFrame coords
-                Float_t clusterPads[6]     = {0};   // cluster pad info
-
-                // setting values
-                clusters[0] = isect+1;    // = isect ????
-                clusters[1] = icham+1;    // = ichamber ????
-                clusters[2] = iplan+1;    // = iplane ????
-                clusters[3] = time;
-
-                clusterPads[0] = icham+1;
-                clusterPads[1] = isect+1;
-                clusterPads[2] = iplan+1;
-
-                for (Int_t iPad = 0; iPad < 3; iPad++) {
-                  clusterSignal[iPad] = digitMatrix->GetSignal(row,col-1+iPad,time);
-                }
-
-                // neighbouring maximum on right side?
-                if (col < fColMax[iplan] - 2) {
-                  if (maximaMatrix->GetSignal(row,col + 2,time) > 0) {
-                    for (Int_t iPad = 0; iPad < 5; iPad++) {
-                      padSignal[iPad] = digitMatrix->GetSignal(row,col-1+iPad,time);
-                    }
-
-                    // unfold:
-                    ratio = Unfold(epsilon, padSignal);
-
-                    // set signal on overlapping pad to ratio
-                    clusterSignal[2] *= ratio;
-                  }
-                }
-
-                switch (clusteringMethod) {
-                case 1:
-                  // method 1: simply center of mass
-                  clusterPads[3] = row + 0.5;
-                  clusterPads[4] = col - 0.5 + (clusterSignal[2] - clusterSignal[0]) /
-                                   (clusterSignal[1] + clusterSignal[2] + clusterSignal[3]);
-                  clusterPads[5] = time + 0.5;
-
-                  nClusters++;
-                  break;
-                case 2:
-                  // method 2: integral gauss fit on 3 pads
-                  TH1F *hPadCharges = new TH1F("hPadCharges", "Charges on center 3 pads"
-                                                           , 5, -1.5, 3.5);
-                  for (Int_t iCol = -1; iCol <= 3; iCol++) {
-                    if (clusterSignal[iCol] < 1) clusterSignal[iCol] = 1;
-                    hPadCharges->Fill(iCol, clusterSignal[iCol]);
-                  }
-                  hPadCharges->Fit("gaus", "IQ", "SAME", -0.5, 2.5);
-                  TF1     *fPadChargeFit = hPadCharges->GetFunction("gaus");
-                  Double_t  colMean = fPadChargeFit->GetParameter(1);
-
-                  clusterPads[3] = row + 0.5;
-                  clusterPads[4] = col - 1.5 + colMean;
-                  clusterPads[5] = time + 0.5;
-
-                  delete hPadCharges;
-
-                  nClusters++;
-                  break;
-                }
-
-                Float_t clusterCharge =   clusterSignal[0]
-                                        + clusterSignal[1]
-                                        + clusterSignal[2];
-                clusters[4] = (Int_t)clusterCharge;
-
-                Int_t trackSave[3];
-                for (Int_t iTrack = 0; iTrack < 3; iTrack++) {
-                  trackSave[iTrack] = digitMatrix->GetTrack(row,col,time,iTrack);
-                }
-
-                // Calculate cluster position in ALICE refFrame coords
-                // and set array clusterPos to calculated values
-                Pads2XYZ(clusterPads, clusterPos);
-
-                // Add cluster to reconstruction tree
-                AddCluster(trackSave,clusters,clusterPos);
-
-              }
-
-            }  // time
-          }    // col
-        }      // row
-
-        printf("AliTRDv1::Digits2Clusters -- Number of clusters found: %d\n",nClusters);
-
-        delete digitMatrix;
-        delete maximaMatrix;
-
-      }          // isect
-    }            // iplan
-  }              // icham
-
-  // Fill the cluster-tree
-  printf("AliTRDv1::Digits2Clusters -- Total number of clusters found: %d\n"
-        ,fClusters->GetEntries());
-  printf("AliTRDv1::Digits2Clusters -- Fill the cluster tree\n");
-  ClusterTree->Fill();
-
-}
-
 //_____________________________________________________________________________
 void AliTRDv1::Init() 
 {
   //
   // Initialise Transition Radiation Detector after geometry has been built.
-  // Includes the default settings of all parameter for the digitization.
   //
 
   AliTRD::Init();
 
-  printf("          Slow simulator\n");
-  if (fSensPlane)
-    printf("          Only plane %d is sensitive\n",fSensPlane);
-  if (fSensChamber)   
-    printf("          Only chamber %d is sensitive\n",fSensChamber);
-  if (fSensSector)
-    printf("          Only sector %d is sensitive\n",fSensSector);
+  printf("          Slow simulator\n\n");
+  if (fSensSelect) {
+    if (fSensPlane   >= 0)
+      printf("          Only plane %d is sensitive\n",fSensPlane);
+    if (fSensChamber >= 0)   
+      printf("          Only chamber %d is sensitive\n",fSensChamber);
+    if (fSensSector  >= 0)
+      printf("          Only sector %d is sensitive\n",fSensSector);
+  }
+  printf("\n");
 
   // First ionization potential (eV) for the gas mixture (90% Xe + 10% CO2)
   const Float_t kPoti = 12.1;
@@ -696,61 +166,23 @@ void AliTRDv1::Init()
   fIdChamber2 = gMC->VolId("UCIM");
   fIdChamber3 = gMC->VolId("UCII");
 
-  // The default parameter for the digitization
-  if (!(fGasGain))       fGasGain       = 2.0E3;
-  if (!(fNoise))         fNoise         = 3000.;
-  if (!(fChipGain))      fChipGain      = 10.;
-  if (!(fADCoutRange))   fADCoutRange   = 255.;
-  if (!(fADCinRange))    fADCinRange    = 2000.;
-  if (!(fADCthreshold))  fADCthreshold  = 1;
-
-  // Transverse and longitudinal diffusion coefficients (Xe/Isobutane)
-  if (!(fDiffusionT))    fDiffusionT    = 0.060;
-  if (!(fDiffusionL))    fDiffusionL    = 0.017;
-
-  // The default parameter for the clustering
-  if (!(fClusMaxThresh)) fClusMaxThresh = 5.0;
-  if (!(fClusSigThresh)) fClusSigThresh = 2.0;
-  if (!(fClusMethod))    fClusMethod    = 1;
-
   for (Int_t i = 0; i < 80; i++) printf("*");
   printf("\n");
 
 }
 
-//_____________________________________________________________________________
-Float_t AliTRDv1::PadResponse(Float_t x)
-{
-  //
-  // The pad response for the chevron pads. 
-  // We use a simple Gaussian approximation which should be good
-  // enough for our purpose.
-  //
-
-  // The parameters for the response function
-  const Float_t aa  =  0.8872;
-  const Float_t bb  = -0.00573;
-  const Float_t cc  =  0.454;
-  const Float_t cc2 =  cc*cc;
-
-  Float_t pr = aa * (bb + TMath::Exp(-x*x / (2. * cc2)));
-
-  return (pr);
-
-}
-
 //_____________________________________________________________________________
 void AliTRDv1::SetSensPlane(Int_t iplane)
 {
   //
-  // Defines the hit-sensitive plane (1-6)
+  // Defines the hit-sensitive plane (0-5)
   //
 
-  if ((iplane < 0) || (iplane > 6)) {
+  if ((iplane < 0) || (iplane > 5)) {
     printf("Wrong input value: %d\n",iplane);
     printf("Use standard setting\n");
-    fSensPlane  = 0;
-    fSensSelect = 0;
+    fSensPlane  = -1;
+    fSensSelect =  0;
     return;
   }
 
@@ -763,14 +195,14 @@ void AliTRDv1::SetSensPlane(Int_t iplane)
 void AliTRDv1::SetSensChamber(Int_t ichamber)
 {
   //
-  // Defines the hit-sensitive chamber (1-5)
+  // Defines the hit-sensitive chamber (0-4)
   //
 
-  if ((ichamber < 0) || (ichamber > 5)) {
+  if ((ichamber < 0) || (ichamber > 4)) {
     printf("Wrong input value: %d\n",ichamber);
     printf("Use standard setting\n");
-    fSensChamber = 0;
-    fSensSelect  = 0;
+    fSensChamber = -1;
+    fSensSelect  =  0;
     return;
   }
 
@@ -783,14 +215,14 @@ void AliTRDv1::SetSensChamber(Int_t ichamber)
 void AliTRDv1::SetSensSector(Int_t isector)
 {
   //
-  // Defines the hit-sensitive sector (1-18)
+  // Defines the hit-sensitive sector (0-17)
   //
 
-  if ((isector < 0) || (isector > 18)) {
+  if ((isector < 0) || (isector > 17)) {
     printf("Wrong input value: %d\n",isector);
     printf("Use standard setting\n");
-    fSensSector = 0;
-    fSensSelect = 0;
+    fSensSector = -1;
+    fSensSelect =  0;
     return;
   }
 
@@ -803,7 +235,6 @@ void AliTRDv1::SetSensSector(Int_t isector)
 void AliTRDv1::StepManager()
 {
   //
-  // Called at every step in the Transition Radiation Detector version 2.
   // Slow simulator. Every charged track produces electron cluster as hits 
   // along its path across the drift volume. The step size is set acording
   // to Bethe-Bloch. The energy distribution of the delta electrons follows
@@ -813,8 +244,10 @@ void AliTRDv1::StepManager()
   Int_t    iIdSens, icSens;
   Int_t    iIdSpace, icSpace;
   Int_t    iIdChamber, icChamber;
-  Int_t    vol[3]; 
-  Int_t    iPid;
+  Int_t    pla = 0;
+  Int_t    cha = 0;
+  Int_t    sec = 0;
+  Int_t    iPdg;
 
   Float_t  hits[4];
   Float_t  random[1];
@@ -829,21 +262,24 @@ void AliTRDv1::StepManager()
   TLorentzVector pos, mom;
   TClonesArray  &lhits = *fHits;
 
-  const Double_t kBig = 1.0E+12;
+  const Double_t kBig     = 1.0E+12;
 
   // Ionization energy
-  const Float_t kWion    = 22.04;
+  const Float_t  kWion    = 22.04;
   // Maximum energy for e+ e- g for the step-size calculation
-  const Float_t kPTotMax = 0.002;
+  const Float_t  kPTotMax = 0.002;
   // Plateau value of the energy-loss for electron in xenon
   // taken from: Allison + Comb, Ann. Rev. Nucl. Sci. (1980), 30, 253
   //const Double_t kPlateau = 1.70;
   // the averaged value (26/3/99)
-  const Float_t kPlateau = 1.55;
+  const Float_t  kPlateau = 1.55;
   // dN1/dx|min for the gas mixture (90% Xe + 10% CO2)
-  const Float_t kPrim    = 48.0;
+  const Float_t  kPrim    = 48.0;
   // First ionization potential (eV) for the gas mixture (90% Xe + 10% CO2)
-  const Float_t kPoti    = 12.1;
+  const Float_t  kPoti    = 12.1;
+
+  // PDG code electron
+  const Int_t    pdgElectron = 11;
 
   // Set the maximum step size to a very large number for all 
   // neutral particles and those outside the driftvolume
@@ -875,45 +311,54 @@ void AliTRDv1::StepManager()
       hits[2] = pos[2];
       hits[3] = qTot;
 
-      // The sector number
-      Float_t phi = pos[1] != 0 ? kRaddeg*TMath::ATan2(pos[0],pos[1]) : (pos[0] > 0 ? 180. : 0.);
-      vol[0] = ((Int_t) (phi / 20)) + 1;
+      // The sector number (0 - 17)
+      // The numbering goes clockwise and starts at y = 0
+      Float_t phi = kRaddeg*TMath::ATan2(pos[0],pos[1]);
+      if (phi < 90.) 
+        phi = phi + 270.;
+      else
+        phi = phi -  90.;
+      sec = ((Int_t) (phi / 20));
 
       // The chamber number 
-      //   1: outer left
-      //   2: middle left
-      //   3: inner
-      //   4: middle right
-      //   5: outer right
+      //   0: outer left
+      //   1: middle left
+      //   2: inner
+      //   3: middle right
+      //   4: outer right
       if      (iIdChamber == fIdChamber1)
-        vol[1] = (hits[2] < 0 ? 1 : 5);
+        cha = (hits[2] < 0 ? 0 : 4);
       else if (iIdChamber == fIdChamber2)       
-        vol[1] = (hits[2] < 0 ? 2 : 4);
+        cha = (hits[2] < 0 ? 1 : 3);
       else if (iIdChamber == fIdChamber3)       
-        vol[1] = 3;
+        cha = 2;
 
       // The plane number
-      vol[2] = icChamber - TMath::Nint((Float_t) (icChamber / 7)) * 6;
+      // The numbering starts at the innermost plane
+      pla = icChamber - TMath::Nint((Float_t) (icChamber / 7)) * 6 - 1;
 
       // Check on selected volumes
       Int_t addthishit = 1;
       if (fSensSelect) {
-        if ((fSensPlane)   && (vol[2] != fSensPlane  )) addthishit = 0;
-        if ((fSensChamber) && (vol[1] != fSensChamber)) addthishit = 0;
-        if ((fSensSector)  && (vol[0] != fSensSector )) addthishit = 0;
+        if ((fSensPlane)   && (pla != fSensPlane  )) addthishit = 0;
+        if ((fSensChamber) && (cha != fSensChamber)) addthishit = 0;
+        if ((fSensSector)  && (sec != fSensSector )) addthishit = 0;
       }
 
       // Add this hit
       if (addthishit) {
 
-        new(lhits[fNhits++]) AliTRDhit(fIshunt,gAlice->CurrentTrack(),vol,hits);
+        new(lhits[fNhits++]) AliTRDhit(fIshunt
+                                      ,gAlice->CurrentTrack()
+                                      ,fGeometry->GetDetector(pla,cha,sec)
+                                      ,hits);
 
         // The energy loss according to Bethe Bloch
         gMC->TrackMomentum(mom);
         pTot = mom.Rho();
-        iPid = gMC->TrackPid();
-        if ( (iPid >  3) ||
-           ((iPid <= 3) && (pTot < kPTotMax))) {
+        iPdg = TMath::Abs(gMC->TrackPid());
+        if ( (iPdg != pdgElectron) ||
+           ((iPdg == pdgElectron) && (pTot < kPTotMax))) {
           aMass     = gMC->TrackMass();
           betaGamma = pTot / aMass;
           pp        = kPrim * BetheBloch(betaGamma);
@@ -1032,98 +477,3 @@ Double_t Ermilova(Double_t *x, Double_t *)
   return dnde;
 
 }
-
-//_____________________________________________________________________________
-void AliTRDv1::Pads2XYZ(Float_t *pads, Float_t *pos)
-{
-  // Method to convert pad coordinates (row,col,time)
-  // into ALICE reference frame coordinates (x,y,z)
-
-  Int_t        chamber   = (Int_t) pads[0];     // chamber info (1-5)
-  Int_t        sector    = (Int_t) pads[1];     // sector info  (1-18)
-  Int_t        plane     = (Int_t) pads[2];     // plane info   (1-6)
-
-  Int_t        icham     = chamber - 1;         // chamber info (0-4)
-  Int_t        isect     = sector  - 1;         // sector info  (0-17)
-  Int_t        iplan     = plane   - 1;         // plane info   (0-5)
-
-  Float_t      padRow    = pads[3];             // Pad Row position
-  Float_t      padCol    = pads[4];             // Pad Column position
-  Float_t      timeSlice = pads[5];             // Time "position"
-
-  // calculate (x,y) position in rotated chamber
-  Float_t yRot = fCol0[iplan]               + padCol    * fColPadSize;
-  Float_t xRot = fTime0[iplan]              + timeSlice * fTimeBinSize;
-  // calculate z-position:
-  Float_t z    = fRow0[iplan][icham][isect] + padRow    * fRowPadSize;
-
-  /**
-    rotate chamber back to original position
-    1. mirror at y-axis, 2. rotate back to position (-phi)
-    / cos(phi) -sin(phi) \   / -1 0 \     / -cos(phi) -sin(phi) \
-    \ sin(phi)  cos(phi) / * \  0 1 /  =  \ -sin(phi)  cos(phi) /
-  **/
-  //Float_t phi = 2*kPI / kNsect * ((Float_t) sector - 0.5);
-  //Float_t x = -xRot * TMath::Cos(phi) - yRot * TMath::Sin(phi);
-  //Float_t y = -xRot * TMath::Sin(phi) + yRot * TMath::Cos(phi);
-  Float_t phi = 2*kPI / kNsect * ((Float_t) sector - 0.5);
-  Float_t x   = -xRot * TMath::Cos(phi) + yRot * TMath::Sin(phi);
-  Float_t y   =  xRot * TMath::Sin(phi) + yRot * TMath::Cos(phi);
-
-  // Setting values
-  pos[0] = x;
-  pos[1] = y;
-  pos[2] = z;
-
-}
-
-//_____________________________________________________________________________
-Float_t AliTRDv1::Unfold(Float_t eps, Float_t* padSignal)
-{
-  // Method to unfold neighbouring maxima.
-  // The charge ratio on the overlapping pad is calculated
-  // until there is no more change within the range given by eps.
-  // The resulting ratio is then returned to the calling method.
-
-  Int_t   itStep            = 0;      // count iteration steps
-
-  Float_t ratio             = 0.5;    // start value for ratio
-  Float_t prevRatio         = 0;      // store previous ratio
-
-  Float_t newLeftSignal[3]  = {0};    // array to store left cluster signal
-  Float_t newRightSignal[3] = {0};    // array to store right cluster signal
-
-  // start iteration:
-  while ((TMath::Abs(prevRatio - ratio) > eps) && (itStep < 10)) {
-
-    itStep++;
-    prevRatio = ratio;
-
-    // cluster position according to charge ratio
-    Float_t maxLeft  = (ratio*padSignal[2] - padSignal[0]) /
-                       (padSignal[0] + padSignal[1] + ratio*padSignal[2]);
-    Float_t maxRight = (padSignal[4] - (1-ratio)*padSignal[2]) /
-                       ((1-ratio)*padSignal[2] + padSignal[3] + padSignal[4]);
-
-    // set cluster charge ratio
-    Float_t ampLeft  = padSignal[1];
-    Float_t ampRight = padSignal[3];
-
-    // apply pad response to parameters
-    newLeftSignal[0] = ampLeft*PadResponse(-1 - maxLeft);
-    newLeftSignal[1] = ampLeft*PadResponse( 0 - maxLeft);
-    newLeftSignal[2] = ampLeft*PadResponse( 1 - maxLeft);
-
-    newRightSignal[0] = ampRight*PadResponse(-1 - maxRight);
-    newRightSignal[1] = ampRight*PadResponse( 0 - maxRight);
-    newRightSignal[2] = ampRight*PadResponse( 1 - maxRight);
-
-    // calculate new overlapping ratio
-    ratio = newLeftSignal[2]/(newLeftSignal[2] + newRightSignal[0]);
-
-  }
-
-  return ratio;
-
-}
-