add new classes for PID truncated mean (Xianguo)
authorabercuci <abercuci@f7af4fe6-9843-0410-8265-dc069ae4e863>
Mon, 26 Mar 2012 11:39:43 +0000 (11:39 +0000)
committerabercuci <abercuci@f7af4fe6-9843-0410-8265-dc069ae4e863>
Mon, 26 Mar 2012 11:39:43 +0000 (11:39 +0000)
TRD/AliTRDdEdxUtils.cxx [new file with mode: 0644]
TRD/AliTRDdEdxUtils.h [new file with mode: 0644]

diff --git a/TRD/AliTRDdEdxUtils.cxx b/TRD/AliTRDdEdxUtils.cxx
new file mode 100644 (file)
index 0000000..224d190
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,1693 @@
+/**************************************************************************
+ * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
+ *                                                                        *
+ * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
+ * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
+ *                                                                        *
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+ * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
+ **************************************************************************/
+
+//
+// class to calculate TRD dEdx
+// xx
+// xx
+// xx
+// xx
+//
+//  Xianguo Lu 
+//  lu@physi.uni-heidelberg.de
+//  Xianguo.Lu@cern.ch
+//  
+//
+
+
+#include "TF1.h"
+#include "TFile.h"
+#include "TH1D.h"
+#include "TH2D.h"
+#include "THnSparse.h"
+#include "TMath.h"
+#include "TMatrixD.h"
+#include "TMinuit.h"
+#include "TObjArray.h"
+#include "TRandom3.h"
+#include "TStopwatch.h"
+#include "TVectorD.h"
+
+#include "TTreeStream.h"
+
+#include "AliCDBId.h"
+#include "AliCDBMetaData.h"
+#include "AliCDBStorage.h"
+#include "AliESDEvent.h"
+#include "AliESDfriendTrack.h"
+#include "AliESDtrack.h"
+#include "AliTRDtrackV1.h"
+
+#include "AliTRDdEdxUtils.h"
+
+#define EPSILON 1e-12
+
+THnSparseD * AliTRDdEdxUtils::fgHistGain=0x0;
+THnSparseD * AliTRDdEdxUtils::fgHistT0=0x0;
+THnSparseD * AliTRDdEdxUtils::fgHistVd=0x0;
+TObjArray * AliTRDdEdxUtils::fgHistPHQ=new TObjArray(8);
+
+TString AliTRDdEdxUtils::fgCalibFile;
+TObjArray * AliTRDdEdxUtils::fgObjGain = 0x0;
+TObjArray * AliTRDdEdxUtils::fgObjT0 = 0x0;
+TObjArray * AliTRDdEdxUtils::fgObjVd = 0x0;
+TObjArray * AliTRDdEdxUtils::fgObjPHQ = 0x0;
+
+Int_t AliTRDdEdxUtils::fgNchamber = -999;
+Double_t AliTRDdEdxUtils::fgChamberQ[6];
+Double_t AliTRDdEdxUtils::fgChamberTmean[6];
+
+Double_t AliTRDdEdxUtils::fgTrackTmean = -999;
+
+//===================================================================================
+//                                   Math and Histogram
+//===================================================================================
+void AliTRDdEdxUtils::GetCDFCuts(const TH1D *hh, const Int_t ncut, Double_t cuts[], const Double_t cdfs[], const Double_t thres)
+{
+  //
+  //counts of hh is sorted
+  //
+
+  for(Int_t ii=0; ii<ncut; ii++){
+    cuts[ii] = -999;
+  }
+
+  Int_t nsel = 0; 
+  const Int_t nbin = hh->GetNbinsX();
+  Double_t datas[nbin];
+  for(Int_t ii=1; ii<=nbin; ii++){
+    const Double_t res = hh->GetBinContent(ii);
+    if(res<thres){
+      continue;
+    }
+
+    datas[nsel] = res;
+    nsel++;
+  }
+  if(!nsel)
+    return;
+
+  Int_t id[nsel];
+  TMath::Sort(nsel, datas, id, kFALSE);
+
+  for(Int_t ii=0; ii<ncut; ii++){
+    const Double_t icdf = cdfs[ii];
+    if(icdf<0 || icdf>1){
+      printf("AliTRDdEdxUtils::GetCDFCuts error cdfs[%d] %15f out of range!\n", ii, icdf); exit(1);
+    }
+    cuts[ii] = datas[id[Int_t(icdf*nsel)]];
+  }
+}
+
+Double_t AliTRDdEdxUtils::GetMeanRMS(const Double_t nn, const Double_t sum, const Double_t w2s, Double_t * grms, Double_t * gerr)
+{
+  //
+  //calculate mean (with error) and rms from sum, w2s, nn
+  //if nn=0, mean, error, and rms all = 0
+  //
+
+  Double_t tmean = 0, trms = 0, terr = 0;
+
+  if(nn>EPSILON){
+    tmean = sum/nn;
+
+    const Double_t arg = w2s/nn-tmean*tmean;
+    if(TMath::Abs(arg)<EPSILON){
+      trms = 0;
+    }
+    else{
+      if( arg <0 ){
+        printf("AliTRDdEdxUtils::GetMeanRMS error negative sqrt argument!! %e -- %e %e %f\n", arg, w2s, sum, nn); exit(1);
+      }
+      
+      trms = TMath::Sqrt(arg);
+    }
+
+    terr = trms/TMath::Sqrt(nn);
+  }
+
+  if(grms){
+    (*grms) = trms;
+  }
+
+  if(gerr){
+    (*gerr) = terr;
+  }
+
+  return tmean;
+}
+
+Double_t AliTRDdEdxUtils::TruncatedMean(const Int_t nx, const Double_t xdata[], const Double_t lowfrac, const Double_t highfrac, Double_t * grms, Double_t * gerr, Double_t *wws)
+{
+  //
+  //calculate truncated mean
+  //return <x*w>_{low-high according to x}
+  //
+
+  /*
+  //test->
+  for(Int_t ii=0; ii<nx; ii++){
+    printf("test %d/%d %f\n", ii, nx, xdata[ii]);
+  }
+  //<--test
+  */
+
+  Int_t index[nx];
+  TMath::Sort(nx, xdata, index, kFALSE);
+
+  Int_t nused = 0;
+  Double_t sum = 0;
+  Double_t w2s = 0;
+  const Int_t istart = Int_t (nx*lowfrac);
+  const Int_t istop  = Int_t (nx*highfrac);
+
+  //=,< correct, because when low=0, high=1 it is correct
+  for(Int_t ii=istart; ii<istop; ii++){
+    Double_t weight = 1;
+    if(wws){
+      weight = wws[index[ii]];
+    }
+    const Double_t sx = xdata[index[ii]]*weight;
+
+    sum += sx;
+    w2s += sx*sx;
+
+    nused++;
+    //printf("test in loop %d/%d %f %f %f\n", ii, nused, sx, sum, w2s);
+    
+  }
+
+  return GetMeanRMS(nused, sum, w2s, grms, gerr);
+}
+
+Double_t AliTRDdEdxUtils::TruncatedMean(const TH1 *hh, const Double_t lowfrac, const Double_t highfrac, Double_t * grms, Double_t * gerr)
+{
+  //
+  //do truncation on histogram
+  //
+  //if hh is scaled, be sure Sumw2 is called before scaling!! then mean, rms and err will all be correct
+  
+  //with under-/over-flow
+  Double_t npreTrunc = 0;
+  for(Int_t itmp=0; itmp<=hh->GetNbinsX()+1; itmp++){
+    const Double_t be = hh->GetBinError(itmp);
+    const Double_t bc = hh->GetBinContent(itmp);
+    if(be<EPSILON){
+      if(bc>EPSILON){
+        printf("AliTRDdEdxUtils::TruncatedMean (hist) error %e %e %d\n", bc, be, itmp); exit(1);
+      }
+      continue;
+    }
+    npreTrunc += bc*bc/be/be;
+  }
+
+  const Double_t nstart = npreTrunc*lowfrac;
+  const Double_t nstop = npreTrunc*highfrac;
+
+  //with Double_t this should also handle normalized hist
+  Double_t ntot = 0;
+  Double_t nused = 0;
+  Double_t sum = 0;
+  Double_t w2s = 0;
+  for(Int_t itmp=0; itmp<=hh->GetNbinsX()+1; itmp++){
+    const Double_t be = hh->GetBinError(itmp);
+    const Double_t bc = hh->GetBinContent(itmp);
+    if(be<EPSILON){
+      if(bc>EPSILON){
+        printf("AliTRDdEdxUtils::TruncatedMean (hist) error %e %e %d\n", bc, be, itmp); exit(1);
+      }
+      continue;
+    }
+    const Double_t weight = bc*bc/be/be;
+    ntot+=weight;
+    //<= correct, because when high=1, nstop has to be included
+    if(ntot>nstart && ntot<=nstop){
+
+      const Double_t val = hh->GetBinCenter(itmp);
+      sum += weight*val;
+      w2s += weight*val*val;
+    
+      nused += weight;
+
+      //printf("test %d %f %f --- %f %f -- %f %f\n", itmp, weight, val, sum, w2s, nused, nsample);
+    }
+    else if(ntot>nstop){
+      if(itmp>=hh->GetNbinsX()){
+        printf("AliTRDdEdxUtils::TruncatedMean warning hist range too small %s %f %f %d %d, %15f %15f %15f; nused w2s sum set to 0\n", hh->GetName(), hh->GetBinLowEdge(1), hh->GetBinLowEdge(itmp), itmp, hh->GetNbinsX(), hh->GetBinContent(hh->GetNbinsX())/hh->Integral(0,hh->GetNbinsX()+1), hh->GetBinContent(hh->GetNbinsX()), hh->Integral(0,hh->GetNbinsX()+1)); //exit(1);
+        nused = 0;
+        w2s = sum = 0;
+      }
+      break;
+    }
+  }
+
+  return GetMeanRMS(nused, sum, w2s, grms, gerr);
+}
+
+void AliTRDdEdxUtils::FitSlicesY(const TH2D *hh, TH1D *&hnor, TH1D *&hmpv, TH1D *&hwid, TH1D *&hres, const Double_t thres, const Double_t lowfrac, const Double_t highfrac)
+{
+  //
+  //fit slices of hh using truncation
+  //
+
+  const Int_t x0 = hh->GetXaxis()->GetFirst();
+  const Int_t x1 = hh->GetXaxis()->GetLast();
+  const Int_t y0 = hh->GetYaxis()->GetFirst();
+  const Int_t y1 = hh->GetYaxis()->GetLast();
+
+  const Int_t nx = hh->GetNbinsX();
+  const Int_t ny = hh->GetNbinsY();
+  const Double_t xmin = hh->GetXaxis()->GetXmin();
+  const Double_t xmax = hh->GetXaxis()->GetXmax();
+  const Double_t ymin = hh->GetYaxis()->GetXmin();
+  const Double_t ymax = hh->GetYaxis()->GetXmax();
+
+  hnor = new TH1D(Form("%s_amp",hh->GetName()), "", nx, xmin, xmax);
+  hmpv = new TH1D(Form("%s_mpv",hh->GetName()), "", nx, xmin, xmax);
+  hwid = new TH1D(Form("%s_wid",hh->GetName()), "", nx, xmin, xmax);
+  hres = new TH1D(Form("%s_res",hh->GetName()), "", nx, xmin, xmax);
+
+  for(Int_t ix=x0; ix<=x1; ix++){
+    //to speed up
+    const Double_t rawcount = hh->Integral(ix,ix,0, ny+1);
+    if(rawcount<EPSILON){
+      continue;
+    }
+
+    TH1D *htmp = new TH1D(Form("FitSlicesY_%s_%d", hh->GetName(), ix),"",ny, ymin, ymax);
+    Double_t ntot = 0;
+    for(Int_t iy=y0; iy<=y1; iy++){
+      const Double_t be = hh->GetBinError(ix,iy);
+      const Double_t bc = hh->GetBinContent(ix, iy);
+
+      if(be<EPSILON){
+        if(bc>EPSILON){
+          printf("AliTRDdEdxUtils::FitSlicesY error %d %d %e %e\n", ix, iy, be, bc); exit(1);
+        }
+        continue;
+      }
+
+      htmp->SetBinContent(iy, bc);
+      htmp->SetBinError(iy, be);
+
+      ntot += (bc/be)*(bc/be);
+
+      //if(be) printf("test %d %d : %f %f %f\n", ix, iy, bc, be, pow(bc/be,2));
+    }
+
+    hnor->SetBinContent(ix, ntot);
+    hnor->SetBinError(  ix, 0);
+    
+    if(ntot<thres || htmp->GetRMS()<EPSILON){
+      delete htmp;
+      continue;
+    }
+
+    //test htmp->Draw();
+    Double_t trms = -999, terr = -999;
+    const Double_t tmean = TruncatedMean(htmp, lowfrac, highfrac, &trms, &terr);
+
+    hmpv->SetBinContent(ix, tmean);
+    hmpv->SetBinError(  ix, terr);
+
+    hwid->SetBinContent(ix, trms);
+    hwid->SetBinError(  ix, 0);
+
+    hres->SetBinContent(ix, tmean>EPSILON ? trms/tmean:0);
+    hres->SetBinError(  ix, 0);
+
+    delete htmp;
+  }
+
+  TH1 *hhs[]={hnor, hmpv, hwid, hres};
+  const TString yt[]={"N", "MPV", "#sigma", "#sigma/MPV"};
+  const Int_t nh = sizeof(hhs)/sizeof(TH1*);
+  for(Int_t ii=0; ii<nh; ii++){
+    hhs[ii]->SetYTitle(Form("%s of %s", yt[ii].Data(), hh->GetYaxis()->GetTitle()));
+    hhs[ii]->SetXTitle(hh->GetXaxis()->GetTitle());
+    hhs[ii]->GetYaxis()->SetTitleOffset(hh->GetYaxis()->GetTitleOffset());
+    hhs[ii]->SetTitle(hh->GetTitle());
+  }
+}
+
+//===================================================================================
+//                                TRD Analysis Fast Tool
+//===================================================================================
+
+Int_t AliTRDdEdxUtils::GetNtracklet(const AliESDEvent *esd)
+{
+  //
+  //number of trd tracklet in one esd event
+  //
+  const Int_t ntrk0 = esd->GetNumberOfTracks();
+  Int_t ntrdv1=0;
+  for(Int_t ii=0; ii<ntrk0; ii++){
+    ntrdv1 += esd->GetTrack(ii)->GetTRDntracklets();
+  }
+  return ntrdv1;
+}
+
+AliTRDtrackV1 * AliTRDdEdxUtils::GetTRDtrackV1(const AliESDtrack * esdtrack)
+{
+  //
+  //Get TRD friend track
+  //
+
+  AliESDfriendTrack *  friendtrk = (AliESDfriendTrack *)esdtrack->GetFriendTrack();
+  if(!friendtrk){
+    //printf("xlulog AliAnalysisTaskCosmicTRD::GetTRDtrack no friend!!\n"); exit(1);
+    return 0x0;
+  }
+
+  TObject *calibObject=0x0;
+  AliTRDtrackV1 * trdtrack=0x0;
+  for(Int_t l=0; (calibObject=friendtrk->GetCalibObject(l)); l++) {
+    if( (trdtrack=dynamic_cast<AliTRDtrackV1*>(calibObject)) )
+      break;
+  }
+
+  return trdtrack;
+}
+
+Bool_t AliTRDdEdxUtils::IsInSameStack(const AliTRDtrackV1 *trdtrack)
+{
+  //
+  // to check if all tracklets are in the same stack, useful in cosmic
+  //
+
+  TVectorD secs(18), stks(5);
+
+  for(Int_t ilayer = 0; ilayer < 6; ilayer++){
+    AliTRDseedV1 *tracklet=trdtrack->GetTracklet(ilayer);
+    if(!tracklet)
+      continue;
+    
+    const Int_t det = tracklet->GetDetector();
+    const Int_t isector = AliTRDgeometry::GetSector(det);
+    const Int_t istack  = AliTRDgeometry::GetStack(det);
+
+    secs[isector] = 1;
+    stks[istack]  = 1;
+ }
+
+  if(secs.Sum()!=1 || stks.Sum()!=1){
+    return kFALSE;
+  }
+  else 
+    return kTRUE;
+}
+
+Bool_t AliTRDdEdxUtils::GetFirstSectorStackMomentum(const AliTRDtrackV1 *trdtrack, Int_t & isec, Int_t & istk, Double_t & mom)
+{
+  //
+  //as function name
+  //
+  isec = istk = -999;
+  mom = -999;
+
+  for(Int_t ilayer = 0; ilayer < 6; ilayer++){
+    AliTRDseedV1 *tracklet=trdtrack->GetTracklet(ilayer);
+    if(!tracklet)
+      continue;
+    
+    const Int_t det = tracklet->GetDetector();
+    isec = AliTRDgeometry::GetSector(det);
+    istk = AliTRDgeometry::GetStack(det);
+
+    mom = tracklet->GetMomentum();
+
+    break;
+  }
+
+  if(isec<0)
+    return kFALSE;
+  else 
+    return kTRUE;
+}
+
+//===================================================================================
+//                                Calibration
+//===================================================================================
+Double_t AliTRDdEdxUtils::GetCalibTPCscale(const Int_t tpcncls, const Double_t tpcsig)
+{
+  //
+  //the scale used in calibration
+  //
+
+  if(tpcncls < CalibTPCnclsCut())
+    return -999;
+
+  if(tpcsig<EPSILON)
+    return -999;
+
+  return tpcsig/120;
+
+}
+
+Int_t AliTRDdEdxUtils::GetPHQIterator(const Bool_t kinvq, const Double_t mag, const Int_t charge)
+{
+  //
+  //iterator for calib obj and hist
+  //
+  return kinvq*4 + (mag>0)*2 + (charge>0); 
+}
+
+TObjArray * AliTRDdEdxUtils::GetObjPHQ(const Bool_t kinvq, const Double_t mag, const Int_t charge)
+{
+  //
+  //return calib obj
+  //
+  if(!fgObjPHQ){
+    printf("AliTRDdEdxUtils::GetObjPHQ error fgObjPHQ null!!\n"); exit(1);
+  }
+
+  return (TObjArray*) fgObjPHQ->At(GetPHQIterator(kinvq, mag, charge));
+}
+
+THnSparseD * AliTRDdEdxUtils::GetHistPHQ(const Bool_t kinvq, const Double_t mag, const Int_t charge)
+{
+  //
+  //return calib hist
+  //
+  return (THnSparseD*) fgHistPHQ->At(GetPHQIterator(kinvq, mag, charge));
+}
+
+TString AliTRDdEdxUtils::GetPHQName(const Bool_t kobj, const Int_t iter)
+{
+  //
+  //get name of calib obj/hist of PHQ
+  //
+  return Form("TRDCalib%sPHQ%d", kobj?"Obj":"Hist", iter);
+}
+
+void AliTRDdEdxUtils::DeleteCalibObj()
+{
+  //
+  //delete calib obj
+  //
+  delete fgObjGain;
+  delete fgObjT0;
+  delete fgObjVd;
+  
+  fgObjGain = 0x0;
+  fgObjT0 = 0x0;
+  fgObjVd = 0x0;
+
+  if(fgObjPHQ){
+    fgObjPHQ->SetOwner();
+    delete fgObjPHQ;
+    fgObjPHQ = 0x0;
+  }
+}
+
+Bool_t AliTRDdEdxUtils::GenerateDefaultPHQOCDB(const TString path)
+{
+  //
+  //generate default OCDB object PHQ, do like
+  //AliTRDdEdxUtils::GenerateDefaultPHQOCDB("local://./")
+  //
+
+  TObjArray * arr8 = new TObjArray(8);
+  arr8->SetOwner();
+
+  for(Int_t ii=0; ii<8; ii++){
+    TObjArray * arr1 = new TObjArray(1);
+    arr1->SetOwner();
+    arr1->SetName(GetPHQName(1, ii));
+
+    const Int_t nbins = NTRDtimebin();
+    TVectorD * vec = new TVectorD(nbins);
+    for(Int_t jj=0; jj<nbins; jj++){
+      (*vec)[jj] = 1;
+    }
+    arr1->Add(vec);
+    arr8->Add(arr1);
+  }
+
+  AliCDBMetaData *metaData= new AliCDBMetaData();
+  metaData->SetObjectClassName("TObjArray");
+  metaData->SetResponsible("Raphaelle Bailhache and Xianguo Lu");
+
+  AliCDBId id1("TRD/Calib/PHQ", 0, 999999999);
+  AliCDBStorage * gStorage = AliCDBManager::Instance()->GetStorage(path);
+  gStorage->Put(arr8, id1, metaData);
+
+  delete metaData;
+  delete arr8;
+
+  return kTRUE;
+}
+
+void AliTRDdEdxUtils::IniCalibObj()
+{
+  //
+  //set CalibObj from file, clone to static calib obj
+  //
+
+  DeleteCalibObj();
+  
+  TFile *cfile=new TFile(fgCalibFile);
+  if(!cfile->IsOpen()){
+    printf("AliTRDdEdxUtils::IniCalibObj error fgCalibFile not open! %s\n", fgCalibFile.Data());exit(1);
+  }
+
+  printf("\nAliTRDdEdxUtils::IniCalibObj file: %s\n", fgCalibFile.Data());
+
+  //---
+  const TString objnames[] ={"TRDCalibObjGain", "TRDCalibObjT0", "TRDCalibObjVd"};
+  TObjArray ** gobjs[]={           &fgObjGain,        &fgObjT0,        &fgObjVd};
+
+  const Int_t nobj = sizeof(objnames)/sizeof(TString);
+  for(Int_t iobj=0; iobj<nobj; iobj++){
+    TObjArray *tmpo=0x0;
+    cfile->GetObject(objnames[iobj], tmpo);
+    if(!tmpo){
+      printf("AliTRDdEdxUtils::IniCalibObj error obj %s not found!\n", objnames[iobj].Data()); exit(1);
+    }
+
+    (*gobjs[iobj])=(TObjArray*)tmpo->Clone();
+    (*gobjs[iobj])->SetOwner();
+  }
+
+  fgObjPHQ = new TObjArray(8);
+  for(Int_t iter=0; iter<8; iter++){
+    const TString objn = GetPHQName(1, iter);
+    TObjArray *tmpo=0x0;
+    cfile->GetObject(objn, tmpo);
+    if(!tmpo){
+      printf("AliTRDdEdxUtils::IniCalibObj error obj %s not found!\n", objn.Data()); exit(1);
+    }
+
+    TObjArray *obji=(TObjArray*) tmpo->Clone();
+    obji->SetOwner();
+    fgObjPHQ->AddAt(obji, iter);
+  }
+
+  //---
+  
+  cfile->Close();
+  delete cfile;
+}
+
+void AliTRDdEdxUtils::DeleteCalibHist()
+{
+  //
+  //delete calib hist
+  //
+  delete fgHistGain;
+  delete fgHistT0;
+  delete fgHistVd;
+
+  fgHistGain = 0x0;
+  fgHistT0 = 0x0;
+  fgHistVd = 0x0;
+
+  //fgHistPHQ owns the hists
+  fgHistPHQ->SetOwner();
+  fgHistPHQ->Clear();
+}
+
+void AliTRDdEdxUtils::IniCalibHist(TList *list, const Bool_t kPHQonly)
+{
+  //
+  //initialize calib hist, list should not own the hist, or list->Clear/delete hist should not be called
+  //
+
+  DeleteCalibHist();
+
+  Int_t nbin[2];
+  const Double_t xmin[2]={0, 0};
+  Double_t xmax[2];
+
+  nbin[0]=NTRDtimebin(); nbin[1]= 11250; xmax[0]=nbin[0]; xmax[1]=20; 
+  for(Int_t iter=0; iter<8; iter++){
+    const TString hn = GetPHQName(0, iter);
+    THnSparseD *hi = new THnSparseD(hn, "", 2, nbin, xmin, xmax);
+    //fgHistPHQ owns the hists
+    fgHistPHQ->AddAt(hi, iter);
+    list->Add(hi);
+  }
+
+  if(kPHQonly)
+    return;
+
+  nbin[0]=NTRDchamber(); nbin[1]= 11250; xmax[0]=nbin[0]; xmax[1]=20;                 fgHistGain = new THnSparseD("TRDCalibHistGain", "", 2, nbin, xmin, xmax);
+  nbin[0]=NTRDchamber(); nbin[1]= 11250; xmax[0]=nbin[0]; xmax[1]=AliTRDseedV1::kNtb; fgHistT0   = new THnSparseD("TRDCalibHistT0",   "", 2, nbin, xmin, xmax);
+  nbin[0]=NTRDchamber(); nbin[1]= 11250; xmax[0]=nbin[0]; xmax[1]=AliTRDseedV1::kNtb; fgHistVd   = new THnSparseD("TRDCalibHistVd",   "", 2, nbin, xmin, xmax);
+
+  list->Add(fgHistGain);
+  list->Add(fgHistT0);
+  list->Add(fgHistVd);
+}
+
+Bool_t AliTRDdEdxUtils::ReadCalibHist(const TString filename, const TString listname)
+{
+  //
+  //used in AliTRDPreprocessorOffline
+  //read in calib hist from file, only for PHQ
+  //
+  DeleteCalibHist();
+
+  //maybe already open by others... don't close
+  TFile fcalib(filename);
+  
+  TObjArray * array = (TObjArray*)fcalib.Get(listname);
+
+  for(Int_t iter=0; iter<8; iter++){
+    const TString hn = GetPHQName(0, iter);
+    THnSparseD * tmph=0x0;
+    if(array){
+      tmph = (THnSparseD *) array->FindObject(hn);
+    }
+    else{
+      tmph = (THnSparseD *) fcalib.Get(hn);
+    }
+    if(!tmph){
+      printf("AliTRDdEdxUtils::ReadCalibHist warning calib hist not found! %s %s\n", filename.Data(), listname.Data());
+      fcalib.ls();
+      array->ls();
+      return kFALSE;
+    }
+    THnSparseD *hi = (THnSparseD*)tmph->Clone();
+    fgHistPHQ->AddAt(hi, iter);
+  }
+
+  return kTRUE;
+}
+
+void AliTRDdEdxUtils::FillCalibHist(const Int_t ncls, const TVectorD *arrayQ, const TVectorD *arrayX, THnSparseD * hcalib, const Double_t scale)
+{
+  //
+  //fill calibration hist
+  //
+  if(!hcalib){printf("AliTRDdEdxUtils::FillCalibHist errro hcalib null!!\n"); exit(1);}
+
+  for(Int_t ii=0; ii<ncls; ii++){
+    const Double_t dq = (*arrayQ)[ii];
+    const Double_t xx = (*arrayX)[ii];
+
+    const Double_t qmax = hcalib->GetAxis(1)->GetXmax() -0.5 * hcalib->GetAxis(1)->GetBinWidth(1);
+    const Double_t xmin = hcalib->GetAxis(0)->GetXmin();
+    const Double_t xmax = hcalib->GetAxis(0)->GetXmax();
+
+    if(xx>=xmax || xx<xmin){
+      printf("AliTRDdEdxUtils::FillCalibHist error x overflow or underflow! %s %15f %15f %15f\n", hcalib->GetName(),  xx, xmin, xmax); exit(1);
+    }
+
+    const Double_t var[]={xx, TMath::Min(dq, qmax)/scale};
+    hcalib->Fill(var);
+  }
+}
+
+void AliTRDdEdxUtils::FillCalibHist(const AliTRDtrackV1 *trdv1, const Bool_t kinvq, const Double_t mag, const Int_t charge, const Double_t scale) 
+{
+  //
+  //get cluster Q and fill calib hist, if kinvq = kTRUE, 1/Q is filled
+  //
+
+  THnSparseD * hcalib = AliTRDdEdxUtils::GetHistPHQ(kinvq, mag, charge);
+
+  TVectorD arrayQ(200), arrayX(200);
+  const Int_t ncls = AliTRDdEdxUtils::GetArrayClusterQ(kinvq, &arrayQ, &arrayX, trdv1);
+  FillCalibHist(ncls, &arrayQ, &arrayX, hcalib, kinvq ? 1/scale : scale);
+
+  static Int_t kprint = 100;
+  if(kprint<0){
+    printf("\nAliTRDdEdxUtils::FillCalibHist summary: \n");
+    printf("\nkinvq= %d;\n", kinvq);
+    for(Int_t iq=0; iq<ncls; iq++){
+      printf("arrayX[%3d] = %15.0f; arrayQ[%3d] =  %15f;\n", iq, arrayX[iq], iq, arrayQ[iq]);
+    }
+    printf("\n");
+  }
+  kprint++;
+}
+
+Int_t AliTRDdEdxUtils::ApplyCalib(const Int_t nc0, TVectorD *arrayQ, TVectorD *arrayX, const TObjArray *cobj)
+{
+  //
+  //apply calibration on arrayQ
+  //
+  if(!cobj){ printf("AliTRDdEdxUtils::ApplyCalib error gain array null!!\n"); exit(1);}
+
+  TVectorD tmpq(arrayQ->GetNrows());
+  TVectorD tmpx(arrayX->GetNrows());
+  Int_t ncls = 0;
+
+  const TVectorD * gain = (TVectorD*) cobj->At(0); 
+  for(Int_t ii=0; ii<nc0; ii++){
+    const Double_t dq = (*arrayQ)[ii];
+    const Int_t xx = (Int_t)(*arrayX)[ii];
+    const Double_t gg = (*gain)[xx];
+
+    if(gg<EPSILON){
+      continue;
+    }
+
+    tmpq[ncls] = dq*gg;
+    tmpx[ncls] = xx;
+    ncls++;
+  }
+
+  (*arrayQ)=tmpq;
+  (*arrayX)=tmpx;
+
+  return ncls;
+}
+
+void AliTRDdEdxUtils::GetPHCountMeanRMS(const TH1D *hnor, TH1D *&hmean)
+{
+  //
+  //calculate from the ph calib hist the (mean-3sigma) ph-count in the chamber, save in the TH1D output
+  //
+  const Int_t ndet = 540;
+  TObjArray *obj=new TObjArray(ndet);
+  obj->SetOwner();
+  for(Int_t ii=0; ii<ndet; ii++){
+    obj->Add(new TVectorD(AliTRDseedV1::kNtb));
+  }
+
+  //ibin = binlowedge of bin(ibin+1) = the number fills this bin
+  for(Int_t ibin=0; ibin<hnor->GetNbinsX(); ibin++){
+    const Double_t stat = hnor->GetBinContent(ibin+1);
+    if(stat<EPSILON){
+      continue;
+    }
+
+    const Int_t idet = ToDetector(ibin);
+    const Int_t itb  = ToTimeBin(ibin);
+    TVectorD *vec=(TVectorD *)obj->At(idet);
+    (*vec)[itb] = stat;
+  }
+
+  hmean = new TH1D(Form("%sdetmean", hnor->GetName()), "", hnor->GetNbinsX(), hnor->GetXaxis()->GetXmin(), hnor->GetXaxis()->GetXmax());
+  for(Int_t ibin=0; ibin<hnor->GetNbinsX(); ibin++){
+    const Int_t idet = ToDetector(ibin);
+    const TVectorD *vec=(TVectorD *)obj->At(idet);
+
+    Int_t nonzero = 0;
+    for(Int_t ii=0; ii<vec->GetNrows(); ii++){
+      if((*vec)[ii]>EPSILON){
+        nonzero++;
+      }
+    }
+
+    Double_t mean = 0;
+    const Double_t lowfrac = 0.6;
+    //if there are too many 0's, reject this chamber by settig mean=rms=0
+    if(nonzero> (AliTRDseedV1::kNtb*(1-lowfrac)) ){
+      //only highest (1-lowfrac)*31 timebins are used to estimate the mean and rms! important! otherwise the 0' will make rms very large!
+      mean = TruncatedMean(AliTRDseedV1::kNtb, vec->GetMatrixArray(), lowfrac, 1);
+    }
+
+    hmean->SetBinContent(ibin+1, mean);
+  }
+
+  delete obj;
+}
+
+void AliTRDdEdxUtils::CalibOutput(const TList *lin, Int_t run)
+{
+  //
+  //produce calibration objects
+  //
+
+  TString objnames("TRDCalibHistGain TRDCalibHistT0 TRDCalibHistVd ");
+  for(Int_t iter=0; iter<8; iter++){
+    objnames+= GetPHQName(0, iter)+" ";
+  }
+
+  TList * lout = new TList;
+  lout->SetOwner();
+
+  TTreeSRedirector *calibStream = new TTreeSRedirector(Form("TRDCalibStream_%010d.root", run));
+    
+  const Int_t nh=lin->GetEntries();
+  for(Int_t ii=0; ii<nh; ii++){
+    const THnSparseD *hh=(THnSparseD*)lin->At(ii);
+    const TString hname = hh->GetName();
+    if(!objnames.Contains(hname))
+      continue;
+
+    TObjArray * cobj0 = GetCalibObj(hh, run, lout, calibStream);
+    lout->Add(cobj0);
+  }
+
+  //lout->ls();
+
+  //=============================================================
+  //=============================================================
+  
+  TFile *fout=new TFile(Form("TRDCalibObj_%010d.root", run),"recreate");
+  fout->cd();
+  const Int_t nout=lout->GetEntries();
+  for(Int_t ii=0; ii<nout; ii++){
+    const TString oname = lout->At(ii)->GetName();
+    if(oname.Contains("Obj")){
+      TObjArray * cobj = (TObjArray*) lout->At(ii);
+      cobj->Write(oname, TObjArray::kSingleKey);
+    }
+  }
+  fout->Save();
+  fout->Close();
+  delete fout;
+
+  fout=new TFile(Form("TRDCalibList_%010d.root", run),"recreate");
+  fout->cd();
+  lin->Write();
+  lout->Write();
+  fout->Save();
+  fout->Close();
+  delete fout;
+  
+  delete calibStream;
+
+  /*
+    http://root.cern.ch/root/html/TH1.html
+    When an histogram is created, a reference to it is automatically added to the list of in-memory objects for the current file or directory. This default behaviour can be changed by:
+    
+    h->SetDirectory(0);          for the current histogram h
+    TH1::AddDirectory(kFALSE);   sets a global switch disabling the reference
+    
+    When the histogram is deleted, the reference to it is removed from the list of objects in memory. When a file is closed, all histograms in memory associated with this file are automatically deleted. 
+  */
+  delete lout;
+}
+
+TObjArray* AliTRDdEdxUtils::GetCalibObj(const THnSparseD *hh, Int_t run, TList *lout, TTreeSRedirector *calibStream)
+{
+  //
+  //produce calibration objects
+  //
+
+  const TString hname = hh->GetName();
+  const Bool_t kinvq = TString(hname(hname.First('Q')+1,1)).Atoi()&4;
+
+  //----------------------------------------
+  //               Define nbin, tag, cobj0
+  //----------------------------------------
+  Int_t nbin =-999;
+  if(hname.Contains("Gain") || hname.Contains("T0") || hname.Contains("Vd")){
+    nbin = NTRDchamber();
+  }
+  else if(hname.Contains("PHQ")){
+    nbin = NTRDtimebin();
+  }
+  else{
+    printf("AliTRDdEdxUtils::GetCalibObj error wrong hname!! %s\n", hname.Data()); exit(1);
+  }
+    
+  TString tag(hname);
+  tag.ReplaceAll("Hist","Obj");
+  
+  TObjArray * cobj0 = new TObjArray(1);
+  cobj0->SetOwner();
+  cobj0->SetName(tag);
+  cobj0->Add(new TVectorD(nbin));
+  
+  //----------------------------------------
+  //               Define lowFrac, highFrac
+  //----------------------------------------
+  Double_t lowFrac = -999, highFrac = -999;
+  if(hname.Contains("Gain") || (hname.Contains("PHQ") && !kinvq) ){
+    lowFrac = 0.01; highFrac = Q0Frac();
+  }
+  else if(hname.Contains("PHQ") && kinvq){
+    lowFrac = Q1Frac(); highFrac = 0.99;
+  }
+  else{
+    lowFrac = 0.01;
+    highFrac = 0.99;
+  }
+  
+  //----------------------------------------
+  //               Get analysis result
+  //----------------------------------------
+  TH1::AddDirectory(kFALSE);//important!
+  TH1D *hnor=0x0, *hmpv=0x0, *hres=0x0, *hwid=0x0, *htrdphmean = 0x0;//if(!lout), these have to be deleted
+  TH2D *hpj = hh->Projection(1,0);
+  FitSlicesY(hpj, hnor, hmpv, hwid, hres, 0, lowFrac, highFrac);
+  if(hname.Contains("PHQ")){
+    GetPHCountMeanRMS(hnor, htrdphmean);
+    if(lout){
+      lout->Add(htrdphmean);
+    }
+  }
+  delete hpj;
+  
+  if(lout){
+    lout->Add(hnor);
+    lout->Add(hmpv);
+    lout->Add(hwid);
+    lout->Add(hres);
+  }
+  
+  //----------------------------------------
+  //               Define Counter
+  //----------------------------------------
+  TVectorD *countDet=0x0;
+  TObjArray *countSSL=0x0;
+
+  if(hname.Contains("PHQ") && !kinvq){
+    countDet=new TVectorD(540);
+    countSSL=new TObjArray(90);//SectorStackLayer
+    countSSL->SetOwner();
+    for(Int_t ii=0; ii<90; ii++){
+      countSSL->Add(new TVectorD(6));
+    }
+  }
+
+  //----------------------------------------
+  //               Fill cobj0
+  //----------------------------------------
+
+  //ibin = binlowedge of bin(ibin+1) = the number fills this bin
+  for(Int_t ibin=0; ibin<nbin; ibin++){
+    Double_t gnor = hnor->GetBinContent(ibin+1);
+    Double_t gmpv = hmpv->GetBinContent(ibin+1);
+    Double_t gwid = hwid->GetBinContent(ibin+1);
+    Double_t gres = hres->GetBinContent(ibin+1);
+
+    //--- set additional cut by kpass
+    Bool_t kpass = kTRUE;
+    Double_t gtrdphmean = -999;
+    if(htrdphmean){
+      gtrdphmean = htrdphmean->GetBinContent(ibin+1);
+      //chamber no statistics (e.g. too many 0's), not usual, not seen in run 143237
+      if(gtrdphmean<EPSILON){
+        kpass = kFALSE;
+      }
+      if(gnor<TimeBinCountCut()*gtrdphmean){
+        kpass = kFALSE;
+      }
+    }
+    
+    //--- set calibration constant p0
+    Double_t p0= 0;
+    
+    //reason for gmpv=0:
+    //1)gnor<=3; truncation in hist: (0, 0.6*ntot=1.8 with ntot=3]={1}, in hist entries can pile up so that ntot=2, or 3, and (ntot>nstart && ntot<=nstop) is skipped;
+    //2)TruncatedMean(hist) out of range (only for Q0, not Q1).
+    
+    if(gmpv>EPSILON && kpass){ 
+      if(tag.Contains("T0")){
+        p0 = gmpv;
+      }
+      else{
+        p0 = 1/gmpv;
+      }
+      //printf("outcalibobj%s %d %15.6e\n", tag.Data(), ibin, p0);
+    }
+
+    (*( (TVectorD*)cobj0->At(0) ))[ibin] = p0;
+
+    //--- save optional record
+    if(p0>EPSILON && countDet && countSSL){
+      const Int_t idet = ToDetector(ibin);
+      (*countDet)[idet]=1;
+      
+      const Int_t isector = ToSector(ibin);
+      const Int_t istack = ToStack(ibin);
+      const Int_t ilayer = ToLayer(ibin);
+      TVectorD * vecsectorstack = (TVectorD*)countSSL->At(istack*18+isector);
+      (*vecsectorstack)[ilayer]=1;
+    }
+    
+    if(calibStream){
+      (*calibStream)<<tag<<
+        "run="<<run<<
+        "p0="<<p0<<
+        
+        "nor="<<gnor<<
+        "mpv="<<gmpv<<
+        "wid="<<gwid<<
+        "res="<<gres<<
+        "gtrdphmean="<<gtrdphmean<<
+        
+        "ibin="<<ibin<<
+        "\n";
+    }
+  }
+  
+  //----------------------------------------
+  //               Status Report
+  //----------------------------------------
+  if(countDet && countSSL){
+    TVectorD count2Dstack(90);
+    for(Int_t ii=0; ii<90; ii++){
+      TVectorD * vecsectorstack = (TVectorD*)countSSL->At(ii);
+      const Int_t nlayer = (Int_t)vecsectorstack->Sum();
+      if(nlayer==6){
+        count2Dstack[ii]=1;
+      }
+    }
+
+    printf("\nAliTRDdEdxUtils::GetCalibObj Summary run: %d name: %s entries: %.0f ndetector: %03.0f n2dstack %02.0f\n\n", run, hname.Data(), hh->GetEntries(), countDet->Sum(), count2Dstack.Sum());
+  }
+
+  //----------------------------------------
+  //               Clean Up
+  //----------------------------------------
+  
+  TH1D **hhs[]={&hnor, &hmpv, &hwid, &hres, &htrdphmean};
+  const Int_t nhh=sizeof(hhs)/sizeof(TH1D**);
+  for(Int_t ihh=0; ihh<nhh; ihh++){
+    if(!lout){
+      delete (*hhs[ihh]);
+    }
+  }
+  
+  delete countDet;
+  delete countSSL;
+
+  //----------------------------------------
+
+  return cobj0;
+}
+
+//===================================================================================
+//                                   dEdx calculation
+//===================================================================================
+Double_t AliTRDdEdxUtils::GetSignal(const Int_t nch, const Int_t ncls, const Double_t qq)
+{
+  //
+  //signal = nch*1e6 + ncls*1e3 + (qq>=1e3? 999 : qq)
+  //
+  if(ncls>1e3){
+    printf("AliTRDdEdxUtils::GetSignal error ncls>1e3! %d\n", ncls); exit(1);
+  }
+
+  return nch*1e6 + ncls*1e3 + (qq>=1e3? 999 : qq);
+}
+
+Int_t AliTRDdEdxUtils::GetNch(const Double_t signal)
+{
+  //
+  //signal = nch*1e6 + ncls*1e3 + (qq>=1e3? 999 : qq)
+  //
+  return Int_t(signal/1e6);
+
+}
+
+Int_t AliTRDdEdxUtils::GetNcls(const Double_t signal)
+{
+  //
+  //signal = Nch*1e6 + Ncls*1e3 + (Q>=1e3? 999 : Q)
+  //
+
+  return Int_t ( (signal-GetNch(signal)*1e6)/1e3 ); 
+}
+
+Double_t AliTRDdEdxUtils::GetQ(const Double_t signal)
+{
+  //
+  //signal = nch*1e6 + ncls*1e3 + (qq>=1e3? 999 : qq)
+  //
+
+  return signal-GetNch(signal)*1e6 - GetNcls(signal)*1e3;
+}
+
+Double_t AliTRDdEdxUtils::ToyCook(const Bool_t kinvq, Int_t &ncluster, TVectorD *arrayQ, TVectorD *arrayX, const TObjArray *cobj)
+{
+  //
+  //template for cookdedx
+  //
+  if(cobj){
+    if(arrayQ && arrayX){
+      ncluster = ApplyCalib(ncluster, arrayQ, arrayX, cobj);
+    }
+    else{
+      printf("AliTRDdEdxUtils::ToyCook arrayQ arrayX null, applycalib can not be applied!\n"); exit(1);
+    }
+  }
+
+  Double_t lowFrac =-999, highFrac = -999;
+  if(kinvq){
+    lowFrac = Q1Frac(); highFrac = 0.99;
+  }
+  else{
+    lowFrac = 0.01; highFrac = Q0Frac();
+  }
+
+  Double_t meanQ = TruncatedMean(ncluster, arrayQ->GetMatrixArray(), lowFrac, highFrac);
+  if(kinvq){
+    if(meanQ>EPSILON){
+      meanQ = 1/meanQ;
+    }
+  }
+
+  return meanQ;
+}
+
+Double_t AliTRDdEdxUtils::CombineddEdx(const Bool_t kinvq, Int_t &concls, TVectorD *coarrayQ, TVectorD *coarrayX, const Int_t tpcncls, const TVectorD *tpcarrayQ, const TVectorD *tpcarrayX, const Int_t trdncls, const TVectorD *trdarrayQ, const TVectorD *trdarrayX)
+{
+  //
+  //combine tpc and trd dedx
+  //
+
+  for(Int_t iq=0; iq<tpcncls; iq++){
+    (*coarrayQ)[iq]=(*tpcarrayQ)[iq];
+    if(tpcarrayX && trdarrayX && coarrayX){
+      (*coarrayX)[iq]=(*tpcarrayX)[iq];
+    }
+  }
+  for(Int_t iq=0; iq<trdncls; iq++){
+    (*coarrayQ)[tpcncls+iq]=(*trdarrayQ)[iq];
+    if(tpcarrayX && trdarrayX && coarrayX){
+      (*coarrayX)[tpcncls+iq]=159+(*trdarrayX)[iq];
+    }
+  }
+
+  concls=trdncls+tpcncls;
+
+  const Double_t coQ = ToyCook(kinvq, concls, coarrayQ, coarrayX);
+
+  return coQ;
+}
+
+
+//===================================================================================
+//                                   dEdx Getter and Setter
+//===================================================================================
+Double_t AliTRDdEdxUtils::GetAngularCorrection(const AliTRDseedV1 *seed)
+{
+  //
+  //return angular normalization factor
+  //
+
+  return TMath::Sqrt(1+seed->GetYref(1)*seed->GetYref(1)+seed->GetZref(1)*seed->GetZref(1));
+}
+
+Double_t AliTRDdEdxUtils::GetClusterQ(const Bool_t kinvq, const AliTRDseedV1 * seed, const Int_t itb)
+{
+  //
+  //get cluster charge
+  //
+  Double_t dq = 0;
+  const AliTRDcluster *cl = 0x0;
+      
+  cl = seed->GetClusters(itb);                    if(cl) dq+=cl->GetRawQ();
+  cl = seed->GetClusters(itb+AliTRDseedV1::kNtb); if(cl) dq+=cl->GetRawQ();
+
+  dq /= GetAngularCorrection(seed);
+  
+  dq /= 45.;
+      
+  if(kinvq){
+    if(dq>EPSILON){
+      dq = 1/dq;
+    }
+  }
+
+  return dq;
+}
+
+Int_t AliTRDdEdxUtils::GetArrayClusterQ(const Bool_t kinvq, TVectorD *arrayQ, TVectorD *arrayX, const AliTRDtrackV1 *trdtrack, Int_t timeBin0, Int_t timeBin1, Int_t tstep)
+{
+  //
+  //return nclustter
+  //(if kinvq, return 1/q array), size of array must be larger than 31*6
+  //
+  if(!arrayQ || arrayQ->GetNrows()< (AliTRDseedV1::kNtb*AliTRDtrackV1::kNplane)){
+    printf("AliTRDdEdxUtils::GetArrayClusterQ error arrayQ null or size too small! %d\n", arrayQ? arrayQ->GetNrows() : -999); exit(1);
+  }
+  if(!arrayX && arrayX->GetNrows()< (AliTRDseedV1::kNtb*AliTRDtrackV1::kNplane)){
+    printf("AliTRDdEdxUtils::GetArrayClusterQ error arrayX null or size too small! %d\n", arrayX? arrayX->GetNrows() : -999); exit(1);
+  }
+
+  const Int_t mintb = 0;
+  const Int_t maxtb = AliTRDseedV1::kNtb-1;
+  if(timeBin0<mintb) timeBin0=mintb;
+  if(timeBin1>maxtb) timeBin1=maxtb;
+  if(tstep<=0) tstep=1;
+
+  //============
+  Int_t tbN=0;
+  Double_t tbQ[200];
+  Int_t tbBin[200];
+    
+  for(Int_t ichamber=0; ichamber < AliTRDtrackV1::kNplane; ichamber++){
+    const AliTRDseedV1 * seed = trdtrack->GetTracklet(ichamber);
+    if(!seed)
+      continue;
+    
+    const Int_t det = seed->GetDetector();
+
+    for(Int_t itb=timeBin0; itb<=timeBin1; itb+=tstep){
+      const Double_t dq = GetClusterQ(kinvq, seed, itb);
+      if(dq<EPSILON)
+        continue;
+
+      const Int_t gtb = det * AliTRDseedV1::kNtb + itb;
+
+      tbQ[tbN]=dq;
+      tbBin[tbN]=gtb;
+      tbN++;
+    }
+  }
+
+  Int_t ncls = 0;
+  for(Int_t iq=0; iq<tbN; iq++){
+    if(tbQ[iq]<EPSILON)
+      continue;
+
+    (*arrayQ)[ncls] = tbQ[iq];
+    (*arrayX)[ncls] = tbBin[iq];
+
+    ncls++;
+  }
+
+  Int_t kprint = 100;
+  if(kprint<0){
+    printf("\nAliTRDdEdxUtils::GetArrayClusterQ raw cluster-Q\n");
+    for(Int_t iq=0; iq<ncls; iq++){
+      const Int_t ichamber =  ToLayer((*arrayX)[iq]);
+      const AliTRDseedV1 * seed = trdtrack->GetTracklet(ichamber);
+      if(!seed){
+        printf("error seed null!!\n"); exit(1);
+      }
+      const Double_t rawq =  (*arrayQ)[iq] * 45. * GetAngularCorrection(seed);
+      printf("esdid=%d; chamber=%d; timebin=%d; rawq= %.3f; myq[%d]= %e;\n", trdtrack->GetESDid(), ichamber, ToTimeBin((*arrayX)[iq]), rawq, iq, (*arrayQ)[iq]);
+    }
+    printf("\n");
+  }
+
+  return ncls;
+}
+
+Int_t AliTRDdEdxUtils::UpdateArrayX(const Int_t ncls, TVectorD* arrayX)
+{
+  //
+  //arrayX det*Ntb+itb -> itb
+  //
+
+  TVectorD countChamber(6);
+  for(Int_t ii = 0; ii<ncls; ii++){
+    const Int_t xx = (Int_t)(*arrayX)[ii];
+    const Int_t idet = ToDetector(xx);
+    
+    const Double_t ich = AliTRDgeometry::GetLayer(idet);
+    const Double_t itb = ToTimeBin(xx);
+    (*arrayX)[ii] = ich*AliTRDseedV1::kNtb+itb;
+
+    countChamber[ich] = 1;
+  }
+
+  const Double_t nch = countChamber.Sum();
+  return (Int_t) nch;
+}
+
+void AliTRDdEdxUtils::SetChamberQT(const AliTRDtrackV1 *trdtrack, const Int_t kcalib, THnSparseD * hgain, THnSparseD * ht0, THnSparseD * hvd)
+{
+  //
+  //CookdEdx at TRD track level, use chamber info, related calibrations: chamber-gain; T0, Vd based on raw PH distribution
+  //
+
+  static Int_t kprint = 100;
+
+  fgNchamber = 0;
+  for(Int_t ichamber=0; ichamber < AliTRDtrackV1::kNplane; ichamber++){
+    //initialize output, default values: 0, so that summation and weighting will automatically discard default quantities
+    fgChamberQ[ichamber] = fgChamberTmean[ichamber] = 0;
+
+    const AliTRDseedV1 *seed = trdtrack->GetTracklet(ichamber);
+    if (!seed) 
+      continue;
+
+    const Int_t idet = seed->GetDetector();
+
+    //-------------------------------------------------------------------------
+
+    Double_t qsum = 0, qtsum = 0, w2sum = 0;
+    for(Int_t itb=0; itb<AliTRDseedV1::kNtb; itb++){
+      const Double_t dq = GetClusterQ(0, seed, itb);
+      if(dq<EPSILON)
+        continue;
+
+      qsum += dq;
+      qtsum += dq*itb; 
+      w2sum += dq*itb*itb;
+    }
+    if(qsum<EPSILON)
+      continue;
+
+    //-------------------------------------------------------------------------
+
+    Double_t tbm, tbr = 0;
+    tbm = GetMeanRMS(qsum, qtsum, w2sum, &tbr);
+
+    qsum /= 1.25e3/45.;
+
+    if(hgain){ 
+      const Double_t var[]={idet, qsum};      
+      hgain->Fill(var);
+    }
+    if(ht0){
+      const Double_t var[]={idet, tbm};
+      ht0->Fill(var);
+    }
+    if(hvd){
+      const Double_t var[]={idet, tbr};
+      hvd->Fill(var);
+    }
+
+    Double_t gain = 1, t0 = 0, vd = 1;
+    if(kcalib){
+      if(!fgObjGain) {printf("AliTRDdEdxUtils::SetChamberQT error Gain array null!!\n"); exit(1);}
+      if(!  fgObjT0) {printf("AliTRDdEdxUtils::SetChamberQT error T0   array null!!\n"); exit(1);}
+      if(!  fgObjVd) {printf("AliTRDdEdxUtils::SetChamberQT error Vd   array null!!\n"); exit(1);}
+
+      const TVectorD * gainvec = (TVectorD*) fgObjGain->At(0); gain = (*gainvec)[idet];
+      const TVectorD *   t0vec = (TVectorD*)   fgObjT0->At(0);   t0 = (*  t0vec)[idet];
+      const TVectorD *   vdvec = (TVectorD*)   fgObjVd->At(0);   vd = (*  vdvec)[idet];
+    }
+    if(kprint<0){
+      printf("\nAliTRDdEdxUtils::CookdEdxV2\n");
+      printf("idet = %d;\n", idet);
+      printf("gain = %15f; t0 = %15f; vd = %15f;\n", gain, t0, vd);
+      printf("\n");
+    }
+
+    qsum *= gain;
+    tbm = (tbm-t0)*vd;
+
+    if(qsum<EPSILON)
+      continue;
+
+    //-------------------------------------------------------------------------
+
+    //should have non-zero value, initialized with default 0 (except for calibrated tbm, may be very close to 0)
+    fgChamberQ[ichamber]  = qsum;
+    fgChamberTmean[ichamber] = tbm;  
+    fgNchamber++;
+  }
+  
+  if(kprint<0){
+    printf("\nAliTRDdEdxUtils::CookdEdxV2 summary:\n");
+
+    printf("\nfgNchamber = %d\n", fgNchamber);
+    for(Int_t ich=0; ich<AliTRDtrackV1::kNplane; ich++){
+      printf("fgChamberTmean[%d] = %15f; fgChamberQ[%d] = %15f;\n", ich, fgChamberTmean[ich], ich, fgChamberQ[ich]);
+    }
+  }
+
+  fgTrackTmean = -999;
+  if(fgNchamber){
+    fgTrackTmean = 0;
+    for(Int_t ich=0; ich<AliTRDtrackV1::kNplane; ich++){
+      fgTrackTmean += fgChamberTmean[ich];
+    }
+    fgTrackTmean /= fgNchamber;
+  }
+
+  if(kprint<0){
+    printf("\nAliTRDdEdxUtils::CookdEdxV2\n");
+    printf("GetTrackTmean() %15f\n", GetTrackTmean());
+    printf("\n");
+  }
+  kprint++;
+
+  return;
+}
+
+
+//===================================================================================
+//                                 dEdx Parameterization
+//===================================================================================
+
+Double_t AliTRDdEdxUtils::Q0MeanTRDpp(const Double_t bg)
+{
+  //
+  //truncated Mean Q_{xx} in TRD
+  //
+  Double_t par[8];
+  //03132012161150
+  //opt: ppQ0
+par[0]=   2.397001e-01;
+par[1]=   1.334697e+00;
+par[2]=   6.967470e+00;
+par[3]=   9.055289e-02;
+par[4]=   9.388760e+00;
+par[5]=   9.452742e-04;
+par[6]=  -1.866091e+00;
+par[7]=   1.403545e+00;
+
+  ///u/xlu/.task/CommondEdx/myAnaData/Optimum/check11/Merged/LHC10e_plot/Separation/see2.log:hhtype2Q0b2c2 scale        0.428543 at ltbg        0.650000
+  return   0.428543*MeandEdxTR(&bg, par);
+}
+
+Double_t AliTRDdEdxUtils::Q0MeanTRDPbPb(const Double_t bg)
+{
+  //
+  //truncated Mean Q_{xx} in TRD
+  //
+  Double_t par[8];
+
+  //03132012161259
+  //opt: PbPbQ0
+par[0]=   1.844912e-01;
+par[1]=   2.509702e+00;
+par[2]=   6.744031e+00;
+par[3]=   7.355123e-02;
+par[4]=   1.166023e+01;
+par[5]=   1.736186e-04;
+par[6]=  -1.716063e+00;
+par[7]=   1.611366e+00;
+
+  ///u/xlu/.task/CommondEdx/myAnaData/Optimum/check11/Merged/LHC10e_plot/Separation/see4.log:hhtype4Q0b2c2 scale        0.460994 at ltbg        0.650000  
+  return   0.460994*MeandEdxTR(&bg, par);
+}
+
+Double_t AliTRDdEdxUtils::Q1MeanTRDpp(const Double_t bg)
+{
+  //
+  //truncated Mean 1/(1/Q)_{xx} in TRD
+  //
+  Double_t par[8];
+
+  //So 4. Mär 13:30:51 CET 2012
+  //opt: trdppQ1
+  par[0]=   2.434646e-01;
+  par[1]=   1.400211e+00;
+  par[2]=   6.937471e+00;
+  par[3]=   7.758118e-02;
+  par[4]=   1.097372e+01;
+  par[5]=   4.297518e-04;
+  par[6]=  -1.806266e+00;
+  par[7]=   1.543811e+00;
+
+  //hhtype2Q1b2c2 scale        0.418629 at ltbg        0.650000
+
+  return  0.418629*MeandEdxTR(&bg, par);
+}
+
+Double_t AliTRDdEdxUtils::Q1MeanTRDPbPb(const Double_t bg)
+{
+  //
+  //truncated Mean 1/(1/Q)_{xx} in TRD
+  //
+  Double_t par[8];
+
+  //So 4. Mär 13:30:52 CET 2012
+  //opt: trdPbPbQ1
+  par[0]=   2.193660e-01;
+  par[1]=   2.051864e+00;
+  par[2]=   6.825112e+00;
+  par[3]=   6.151693e-02;
+  par[4]=   1.390343e+01;
+  par[5]=   6.010032e-05;
+  par[6]=  -1.676324e+00;
+  par[7]=   1.838873e+00;
+
+  //hhtype4Q1b2c2 scale        0.457988 at ltbg        0.650000
+
+  return  0.457988*MeandEdxTR(&bg, par);
+}
+
+Double_t AliTRDdEdxUtils::QMeanTPC(const Double_t bg)
+{
+  //
+  //bethe bloch in TPC
+  //
+
+  Double_t par[5];
+  //Mi 15. Feb 14:48:05 CET 2012
+  //train_2012-02-13_1214.12001, tpcsig
+  par[0]=       4.401269;
+  par[1]=       9.725370;
+  par[2]=       0.000178;
+  par[3]=       1.904962;
+  par[4]=       1.426576;
+
+  return MeandEdx(&bg, par);
+}
+
+Double_t AliTRDdEdxUtils::MeandEdxTR(const Double_t * xx, const Double_t * pin)
+{
+  //
+  //ALEPH+LOGISTIC parametrization for dEdx+TR, in unit of MIP
+  //npar = 8 = 3+5
+  //
+  Double_t ptr[4]={0};
+  for(int ii=0; ii<3; ii++){
+    ptr[ii+1]=pin[ii];
+  }
+  return MeanTR(xx,ptr) + MeandEdx(xx,&(pin[3]));
+}
+
+Double_t AliTRDdEdxUtils::MeanTR(const Double_t * xx, const Double_t * par)
+{
+  //
+  //ALEPH+LOGISTIC parametrization for dEdx+TR, in unit of MIP
+  //npar = 4
+  //
+
+  const Double_t bg = xx[0];
+  const Double_t gamma = sqrt(1+bg*bg);
+
+  const Double_t p0 = TMath::Abs(par[1]);
+  const Double_t p1 = TMath::Abs(par[2]);
+  const Double_t p2 = TMath::Abs(par[3]);
+
+  const Double_t zz = TMath::Log(gamma);
+  const Double_t tryield = p0/( 1 + TMath::Exp(-p1*(zz-p2)) );
+
+  return par[0]+tryield;
+}
+
+Double_t AliTRDdEdxUtils::MeandEdx(const Double_t * xx, const Double_t * par)
+{
+  //
+  //ALEPH parametrization for dEdx
+  //npar = 5
+  //
+
+  const Double_t bg = xx[0];
+  const Double_t beta = bg/TMath::Sqrt(1.+ bg*bg);
+
+  const Double_t p0 = TMath::Abs(par[0]);
+  const Double_t p1 = TMath::Abs(par[1]);
+  const Double_t p2 = TMath::Abs(par[2]);
+  const Double_t p3 = TMath::Abs(par[3]);
+  const Double_t p4 = TMath::Abs(par[4]);
+
+  const Double_t aa = TMath::Power(beta, p3);
+  const Double_t bb = TMath::Log( p2 + TMath::Power(1./bg, p4) );
+
+  //printf("test----- %f %f -- %f %f %f %f %f --- %f %f %f\n", bg, beta, p0, p1, p2, p3, p4, p0/aa, aa, bb);
+
+  return (p1-aa-bb)*p0/aa;
+}
+
+Double_t AliTRDdEdxUtils::ToLogx(FFunc func, const Double_t * xx, const Double_t * par)
+{
+  //
+  //f(x)-> f(y) with y=log10(x)
+  //
+  const Double_t x2[]={TMath::Power(10, xx[0])};
+  return func(x2, par);
+}
+
+//===================================================================================
+//                                Detector, Data and Control Constant 
+//===================================================================================
+Int_t  AliTRDdEdxUtils::ToDetector(const Int_t gtb)
+{
+  //
+  //gtb = det*Ntb+itb
+  //
+  return gtb/AliTRDseedV1::kNtb;
+}
+
+Int_t  AliTRDdEdxUtils::ToTimeBin(const Int_t gtb)
+{ 
+  //
+  //gtb = det*Ntb+itb
+  //
+  return gtb%AliTRDseedV1::kNtb;
+}
+
+Int_t  AliTRDdEdxUtils::ToSector(const Int_t gtb)
+{
+  //
+  //return sector
+  //
+  return AliTRDgeometry::GetSector(ToDetector(gtb));
+}
+
+Int_t  AliTRDdEdxUtils::ToStack(const Int_t gtb)
+{
+  //
+  //return stack
+  //
+  return AliTRDgeometry::GetStack(ToDetector(gtb));
+}
+
+Int_t  AliTRDdEdxUtils::ToLayer(const Int_t gtb)
+{
+  //
+  //return layer
+  //
+  return AliTRDgeometry::GetLayer(ToDetector(gtb));
+}
+
+TString AliTRDdEdxUtils::GetRunType(const Int_t run)
+{
+  //
+  //return run type
+  //
+
+  TString type;
+  if(run>=121527 && run<= 126460)//LHC10d
+    type="pp2010LHC10d";
+  else if(run>=126461 && run<= 130930)//LHC10e
+    type="pp2010LHC10e";
+  else if(run>=136782 && run <= 139846)//LHC10h
+    type="PbPb2010LHC10h";
+  else if(run>= 143224 && run<= 143237)//2011Feb
+    type="cosmic2011Feb";
+  else if(run>= 150587 && run<= 154930){
+    type="cosmic2011MayJun";
+
+    TString runstr(Form("%d",run));
+    const TString listrun1kg("154601 154602 154629 154634 154636 154639 154643");
+    if(listrun1kg.Contains(runstr)){
+      type+="1kG";
+    }
+    else{
+      type+="5kG";
+    }      
+  }
+  else{
+    type="unknown";
+  }
+
+  type.ToUpper();
+  return type;
+}
+
+void AliTRDdEdxUtils::PrintControl()
+{
+  //
+  //print out control variable
+  //
+  printf("\nAliTRDdEdxUtils::PrintControl Q0Frac %.1f, Q1Frac %.1f, TimeBinCountCut %.2f, CalibTPCnclsCut %d, IsExBOn %d\n\n", Q0Frac(), Q1Frac(), TimeBinCountCut(), CalibTPCnclsCut(), IsExBOn());
+}
+//===================================================================================
+//===================================================================================
diff --git a/TRD/AliTRDdEdxUtils.h b/TRD/AliTRDdEdxUtils.h
new file mode 100644 (file)
index 0000000..34ced97
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,207 @@
+/**************************************************************************
+ * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
+ *                                                                        *
+ * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
+ * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
+ *                                                                        *
+ * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
+ * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
+ * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
+ * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
+ * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
+ * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
+ * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
+ **************************************************************************/
+//
+//
+//
+//  Xianguo Lu 
+//  lu@physi.uni-heidelberg.de
+//  Xianguo.Lu@cern.ch
+//
+/*
+grep " AliTRDdEdxUtils::" AliTRDdEdxUtils.cxx | grep "=" -v  | grep -v "[6]" | grep -v printf  |wc
+grep "(" AliTRDdEdxUtils.h | grep ";" | grep -v grep | grep -v ClassDef | grep -v "{" | grep -v typedef | wc
+*/
+
+
+#ifndef ALITRDDEDXUTILS_H
+#define ALITRDDEDXUTILS_H
+
+#ifndef TVECTORD_H
+#include "TVectorD.h"
+#endif
+
+#ifndef THNSPARSE_H
+#include "THnSparse.h"
+#endif
+
+#ifndef TTREESTREAM_H
+#include "TTreeStream.h"
+#endif 
+
+class TH1D;
+class TH2D;
+class TObjArray;
+
+class AliESDEvent;
+class AliESDtrack;
+class AliTRDcluster;
+class AliTRDtrackV1;
+class AliTRDseedV1;
+
+class AliTRDdEdxUtils
+{
+ public:
+
+  //===================================================================================
+  //                                   Math and Histogram
+  //===================================================================================
+  static void GetCDFCuts(const TH1D *hh, const Int_t ncut, Double_t cuts[], const Double_t cdfs[], const Double_t thres);
+  static Double_t GetMeanRMS(const Double_t nn, const Double_t sum, const Double_t w2s, Double_t * grms=0x0, Double_t * gerr=0x0);
+  static Double_t TruncatedMean(const Int_t nx, const Double_t xdata[], const Double_t lowfrac, const Double_t highfrac, Double_t * grms=0x0, Double_t * gerr=0x0, Double_t *wws=0x0);
+  static Double_t TruncatedMean(const TH1 *hh, const Double_t lowfrac, const Double_t highfrac, Double_t * grms=0x0, Double_t * gerr=0x0);
+  static void FitSlicesY(const TH2D *hh, TH1D *&hnor, TH1D *&hmpv, TH1D *&hwid, TH1D *&hres, const Double_t thres, const Double_t lowfrac, const Double_t highfrac);
+
+  //===================================================================================
+  //                                TRD Analysis Fast Tool
+  //===================================================================================
+  static Int_t GetNtracklet(const AliESDEvent *esd);
+  static AliTRDtrackV1 * GetTRDtrackV1(const AliESDtrack * esdtrack);
+  static Bool_t IsInSameStack(const AliTRDtrackV1 *trdtrack);
+  static Bool_t GetFirstSectorStackMomentum(const AliTRDtrackV1 *trdtrack, Int_t & isec, Int_t & istk, Double_t & mom);
+
+  //===================================================================================
+  //                                Calibration
+  //===================================================================================
+  static void SetCalibFile(const TString file){fgCalibFile = file;}
+  static void DeleteCalibObj();
+  static void IniCalibObj();
+
+  static void SetObjPHQ(TObjArray * obj){fgObjPHQ = obj;}
+  static Bool_t GenerateDefaultPHQOCDB(const TString path="local://./");
+
+  static Double_t GetCalibTPCscale(const Int_t tpcncls, const Double_t tpcsig);
+
+  static void DeleteCalibHist();
+  static void IniCalibHist(TList *list, const Bool_t kPHQonly=kFALSE);
+  static Bool_t ReadCalibHist(const TString filename, const TString listname);
+
+  static TObjArray * GetObjPHQ(){return fgObjPHQ;}
+  static TObjArray * GetHistPHQ(){return fgHistPHQ;}
+  static TObjArray * GetObjPHQ(const Bool_t kinvq, const Double_t mag, const Int_t charge);
+  static THnSparseD * GetHistPHQ(const Bool_t kinvq, const Double_t mag, const Int_t charge);
+
+  static void FillCalibHist(const Int_t ncls, const TVectorD *arrayQ, const TVectorD *arrayX, THnSparseD * hcalib, const Double_t scale);
+  static void FillCalibHist(const AliTRDtrackV1 *trdv1, const Bool_t kinvq, const Double_t mag, const Int_t charge, const Double_t scale);
+
+  static void CalibOutput(const TList *l0, Int_t run);
+  static TObjArray* GetCalibObj(const THnSparseD *hh, Int_t run=-999, TList *lout=0x0, TTreeSRedirector *calibStream=0x0);
+
+  static THnSparseD * GetHistGain(){return fgHistGain;}
+  static THnSparseD * GetHistT0(){return fgHistT0;}
+  static THnSparseD * GetHistVd(){return fgHistVd;}
+
+  //===================================================================================
+  //                                   dEdx calculation
+  //===================================================================================
+  static Double_t GetSignal(const Int_t nch, const Int_t ncls, const Double_t qq);
+  static Int_t GetNch(const Double_t signal);
+  static Int_t GetNcls(const Double_t signal);
+  static Double_t GetQ(const Double_t signal);
+
+  static Double_t ToyCook(const Bool_t kinvq, Int_t &ncluster, TVectorD *arrayQ, TVectorD *arrayX, const TObjArray *cobj=0x0);
+  static Double_t CombineddEdx(const Bool_t kinvq, Int_t &concls, TVectorD *coarrayQ, TVectorD *coarrayX, const Int_t tpcncls, const TVectorD *tpcarrayQ, const TVectorD *tpcarrayX, const Int_t trdncls, const TVectorD *trdarrayQ, const TVectorD *trdarrayX);
+
+  //===================================================================================
+  //                                   dEdx Getter and Setter
+  //===================================================================================
+  static Int_t GetArrayClusterQ(const Bool_t kinvq, TVectorD *arrayQ, TVectorD *arrayX, const AliTRDtrackV1 *trdtrack, Int_t timeBin0=-1, Int_t timeBin1=1000, Int_t tstep=1);
+  static Int_t UpdateArrayX(const Int_t ncls, TVectorD* arrayX);
+  static void SetChamberQT(const AliTRDtrackV1 *trdtrack, const Int_t kcalib, THnSparseD * hgain=0x0, THnSparseD * ht0=0x0, THnSparseD * hvd=0x0);
+
+  static Int_t GetNchamber() {return fgNchamber;}
+  static Double_t GetChamberQ(const Int_t ich)  {return fgChamberQ[ich];}
+  static Double_t GetChamberTmean(const Int_t ich) {return fgChamberTmean[ich];}
+  static Double_t GetTrackTmean() {return fgTrackTmean;}
+  
+  //===================================================================================
+  //                                 dEdx Parameterization
+  //===================================================================================
+  
+  static Double_t MeandEdx(const Double_t * xx, const Double_t * par);
+  static Double_t MeanTR(const Double_t * xx, const Double_t * par);
+  static Double_t MeandEdxTR(const Double_t * xx, const Double_t * par);
+
+  static Double_t QMeanTPC(const Double_t bg);
+  static Double_t Q0MeanTRDpp(const Double_t bg);
+  static Double_t Q1MeanTRDpp(const Double_t bg);
+  static Double_t Q0MeanTRDPbPb(const Double_t bg);
+  static Double_t Q1MeanTRDPbPb(const Double_t bg);
+
+  typedef Double_t (*FFunc)(const Double_t *xx, const Double_t *par);
+  
+  static Double_t MeandEdxLogx(const Double_t * xx, const Double_t * par){return ToLogx(MeandEdx, xx, par);}
+  static Double_t MeanTRLogx(const Double_t * xx, const Double_t * par){return ToLogx(MeanTR, xx, par);}
+  static Double_t MeandEdxTRLogx(const Double_t * xx, const Double_t * par){return ToLogx(MeandEdxTR, xx, par);}
+
+  //===================================================================================
+  //                                 Detector, Data and Control Constant
+  //===================================================================================
+  static Int_t NTRDchamber(){return 18*5*6;} //540
+  static Int_t NTRDtimebin(){return NTRDchamber()*31;} //16740
+  static Int_t ToDetector(const Int_t gtb);
+  static Int_t ToTimeBin(const Int_t gtb);
+  static Int_t ToSector(const Int_t gtb);
+  static Int_t ToStack(const Int_t gtb);
+  static Int_t ToLayer(const Int_t gtb);
+
+  static TString GetRunType(const Int_t run);
+
+  static Bool_t IsExBOn(){return kTRUE;}
+
+  static void PrintControl();
+  //===================================================================================
+  //===================================================================================
+
+  private:
+
+  //dEdx Getter and Setter
+  static Double_t GetAngularCorrection(const AliTRDseedV1 *seed);
+  static Double_t GetClusterQ(const Bool_t kinvq, const AliTRDseedV1 * seed, const Int_t itb);
+  
+  //dEdx Parameterization
+  static Double_t ToLogx(FFunc func, const Double_t * xx, const Double_t * par);
+
+  //Calibration
+  static Int_t ApplyCalib(const Int_t nc0, TVectorD *arrayQ, TVectorD *arrayX, const TObjArray *cobj);
+  static void GetPHCountMeanRMS(const TH1D *hnor, TH1D *&hmean);
+  static Int_t GetPHQIterator(const Bool_t kinvq, const Double_t mag, const Int_t charge);
+  static TString GetPHQName(const Bool_t kobj, const Int_t iter);
+
+  //Detector, Data and Control Constant
+  static Double_t Q0Frac(){return 0.3;}
+  static Double_t Q1Frac(){return 0.5;}
+  static Double_t TimeBinCountCut(){return 0.0;}
+  static Int_t CalibTPCnclsCut(){return 70;}
+
+  static THnSparseD *fgHistGain;//PH hist
+  static THnSparseD *fgHistT0;//PH hist
+  static THnSparseD *fgHistVd;//PH hist
+  static TObjArray * fgHistPHQ;//array containing 8 THnSparseD!
+
+  static TString fgCalibFile; //private path for calibration object
+
+  static TObjArray * fgObjGain;//chamber gain obj
+  static TObjArray * fgObjT0;//t0 obj
+  static TObjArray * fgObjVd;//Vd obj
+  static TObjArray * fgObjPHQ;//array containing 8 TObjArray!
+
+  static Int_t fgNchamber; //number of chamber used in cookdedx
+  static Double_t fgChamberQ[6];  //dqdl in chamber [i]
+  static Double_t fgChamberTmean[6]; //Q-weighted timebin \sum Q*T / \sum Q
+
+  static Double_t fgTrackTmean; //mean timebin over track
+};
+
+#endif