Adding NSD analysis as well as new features and removing warnings

Add virtual destructor

Add AliTRDrawStreamError to linkdef file

Patch to fix seg fault on HLT

dd option to disable error logging for HLT use

Adding macro to dump global HLT output objects.

L1phase recalculated to PHOS units

fix memory leak

Input data block type is now declared with origin == MUON.

Bug fix in generated output data block types.

Remove/comment out the code related to signal plus bacround mixing, since it is available in general frame

Fixed access to MC-only analysis

Additional subdirectory

Missing include files (Johny)

Fixed errors in cmake build system

 less strong write condition

new trigger class name added (Markus)

Changed label in the fit results table

Fix bug in RefMaker. A memset of Int_ts was used for fPID instead of
Float_t.(Alex W.)

Update for D* task (Alessandro)

Macro to read the output of the task Significance (Chiara B)

Added IsSelectedPID (Francesco)

adjusted for renamed method SetCorrelatorInteger(1) -> SetHarmonic(1)

Cooling pipes displaced in order to avoid overlaps (M. Sitta)

protection against the mixing of tracklet-->track refs. for shared clusters (Ruben)

Revised protections (Raphael)

Excluding a class from compilation (temporary)

Fixes for event selection

 fixes for default axis ranges (Magali)

Limit printout

adding TPC dEdX component to ESD converter inputs

adding TPC dEdX component to the default configuration

Corrected declaration of track references array sizes for streamer in AliMultiplicity.
Moved RunMultFinder after the CleanESD to not account for the tracks to be suppressed.

Use CORRFW instead of THnSparse (makes it easier to perform corrections). Improve the determination of the muon mother in simulations. (Diego)

New function to get the list of keyWords of a given rubric (Philippe P.)

rebinning added

added rebinning

Adding track selection without SPD requirement, use PWG4 specific ESDFilter

updating input file and macro for task to run in train

First try to reduce the size of the QA wagon

Removed streamerinfo initialization from od.C

Updated the proxy handler to deal with updates on cluster

Adding method to print latex table from file as ascii

Added task for efficiency computation, aligned with revised code.
Added addTask macros for alternative analysis tasks

Removing the dependence on libESD (removed AliESDCaloClusters (Gustavo) see savannah #69974

Initialization of some variables (Mikolaj)

New hex-dump method + changed the warning messages (Stefan)

FitParticle.C: generic macro to fit a pt distribution with the Levy or other function

CombineSpectra.C: Adding help + Improving comparison to star

 addition to 42846

new version of the V0 stuff for the RefMaker (Alex W.)

A new member of AliTRDtrackInfo::AliESDinfo added which has the v0pid info.
One can access it via AliTRDtrackInfo::AliESDinfo::GetV0pid(). In
addition the structure of the infoGen had to be changed. Now the first loop
is over the v0s, the second over the ESDtrackss. In case an ESDtrack has
a valid v0pid it is set, otherwise the values stay at 0 for all species.

RefMaker only depends on ESDinfo and not on Friends. Also some
modifications for the RefMakerNN.

bug fixes:
1. TObjArrays like fTracksBarrel etc. are deleted now at the beginning
of the UserExec. Otherwise one gets v0pid values for tracks which do not
origin from a valid v0.

2. in the AliTRDv0info. Now there is a protection in case not both
tracks of a V0 are found (due to what reason ever).

fixing bug in the HLT TRD offline running mode due to parameter propagation in DoInit, skip cluster transformation; requires r42837 (Theo)

Changes for report #69974: Virtual class for calorimeter analysis objects

adding implementations to extract event type and time stamp from RawReader

adding helper methods to extract event type and time stamp from RawReader

correcting a typo

Added the possibility to define variable bins in output histograms.
Added an initial template for a histogram fitting class.

Changes from Constantin:

a) Makefile
The changes are: treatment of ROOT to be external/system
treatment for warnings (using -isystem)

b) Makefile
Since rootcint produces obsolete string code I propose
to add -Wno-write-strings to CXXFLAGSNO. I have talked
long time ago (6 months maybe or more) to Phillipe,
but I dont think he fixed cint.

c) Makefile
Different logic to implement whether date-config is there,
so that no annoying output from the stderr of which is
produced.

d) build/module.tpl
The changes in module.tpl use ${MUTE }to avoid the
printout of several lines when not requested with ALIVERBOSE=1.

e) JETAN
Patch for JETAN to treat FASTJET external like ROOT.

Changes from Marco:

Fix for bug #71073: Relative path for 'include' in dependency files

With help from Axel -- work around a CINT bug with destruction of string temporary.

- use static const arrays instead of const arrays to avoid the copying from static memory to the stack when entering the scope
- dentangle the usage of HLT mode and transformation skip in order to test the procedures individually

Operations for PROOF compatibility

-mcompilation warning

protect against reinitialization of magnetic field

explicit initializations

small fix to histo name

rename histos such to accomodate more cluster resolution tasks running in
parallel

explicit initializations

New Clusterizer that makes cluster grouping neighbour cells around highest energy tower, 1 to N towers away from this tower (Mateusz)

fix error in calculation of dEdx (Xiangou)

now latest version (E.Biolcati and F.Prino)

All formulas now work for any case of the overlap between POI1, POI2 and RP in the correlator cos[n(psi1+psi2-2phi3)] (remember that psi always labels azimuth of POI and phi azimuth of RP). Since this correlator (relevant for Strong Parity Violation study) is evaluated vs (pt1+pt2)/2 and |pt1-pt2| two nested loops are needed and by default this calculation is switched off.

updating task (E.Biolcati and F.Prino)

L1phase time correction added

adding ITS standalone macro (E.Biolcati)

Forgot to commit the changes to the package files.

Improved efficiency; use same signal shape for all channels

1) Added method SetRunMultFinder to allow swithing off the Mult.Finder
2) Added protection: if fRunMultFinder is TRUE but the ITS reconstruction is
not done, then the warning is printed (only once) and fRunMultFinder is set
to FALSE

1. Loading the LHC clock-phase in the reco. 2. Methods to get the mean phase B1 & B2 or the phase at given time-stamp. 3. Chnages in the VZERO code which use the phase from OCDB. For the moment we rely on the mean phase between the two beams.

fixes initialization

Adding simple check on the signals.

Removed AliRsnEvent data member from streaming in AliRsnPair - modified test macros

adding copy constructor

Adding first version of data checking component for TPC.

Updated docu

From Sara and Jan Fiete:
underlying event analysis w.r.t leading track
although there are some new classes a lot of the analysis code has been refactored from the
previous classes
new "in content" are the correction classes AliUEHist, AliUEHistograms

Bug fix for forwarding data blocks.

Fixing error propagation in AliBWTools::GetMean and GetMean2 + some cleanup

add variable range in dy

Define Clear for AliEMCALDigits to delete the owned arrays when the TClonesArray Clear is called. change the call to the TClonesArray::Clear to Clear("C") to call the clear of the digits.

added reder for test on other data

Added charge to the tracks

added macros for analysis

Additional histograms for vertex, missing ITS modules. Fixes of coding violations

fixed memory leak

T0Laserda with correct run type

Added extra cut selection values

fixing compilation error

Fix for bug 70975, code from Peter, tested by Annalisa

Cleaning up ClassDef. Should have version == 0 for classes that will never be streamed to file by ROOT.

fixing compilation bug