Missing initialisation of headers added,

Added an output file for average cross section and number of trials from pyxsec.root if available

CMake target for TENDER.

Tender wagon providing access to ESD event and CDB. The tender calls an arbitrary number of user algorithms that add or correct information in ESD based on CDB info that was not available during pass1 reconstruction. The base class for user-defined ESD additions and corrections is AliTenderSuppy. This has access to CDB and the current ESD event and has to implement the methods Init() (specific CDB storages, initialization) and ProcessEvent() (algorithm that adds to or modifies the current ESD event.

Initialize TRefArray with correct pid

Treatment of HC header corruption

FastJetHeaderV1 included.

Event by event vertex and header.

Minor corrections + small improvement of macro to study fake tracks
(Philippe P.)

Removing comment for "magic" lines to correctly read raw tag files.

Bug fix for the case of more than 30 timebins

In reconstruction:
Added protection in case the bending momentum of the track is so low that it turns around in the magnetic field.
--> Most of the time, stop the tracking of that track and remove it.
--> In any case, its chi2 is set to a maximum value (1.e10) so it can be easily detected and removed afterward.
(Philippe P.)

respecting start and end time arguments

Added possibility to process only charged particles (without smearing and TPC acceptance cuts)

Fixes to FastJetFinder (added c'tors) and added possibility to run FJ on Kinematics (no support for references yet, since fMomentumArray is used

Updatde configuration

Reduced default debug level

Putting non-implemented copy constructor and assignment operator as private.

update by Theodor
- Create separate offline components to outsource CDBManager actions
- Clean up code of ClusterHistoComponent

Fix on magnetic field sign used in error calculation (F. Prino)

Changed default value (no D*+ rejection) Andrea R

AliTPCcalibDB.cxx.diff                  Change magnetic field return value from kG to T
AliTPCCalibViewerGUItime.cxx.diff       Change from tree to chain. Allow wildcard in static AliTPCCalibViewerGUItime::ShowGUI("file*.root")
AliTPCCalibViewerGUItime.h.diff         Change from tree to chain. Allow wildcard in static AliTPCCalibViewerGUItime::ShowGUI("file*.root")
CalibEnv.C.diff                         Add Nan protection in noise calculations
TPCRAWda.cxx.diff                       Add network timeout as suggested by Sylvain

Changes in order to be sure that the raw-reader always detects the EOR events. In prinicple even this is not enough because it can happend that a detector is busy and the run ends w/o EOR events. Will have to put a SOR notifier based on DIM.

Run aliroot in batch mode for the moment.

Correct DIM service is DAQ_SOR_PHYSICS. In this case we get the trigger config from the logbook.

Pass event vertex to the cocktail entries.

Added the offline trigger functions for use with the first physics.

reference distribution for kRAW kCalib case

reference distribution for kRAW kCalib case

Added possibility to lock/unlock CDB manager. User is provided with a key everytime it locks. The key has to be used in the SetLock() method whenever the state of the lock need to be changed. (A.G.)

1. more than 30 timebin data reading is available now in the fast reader
2. rawstreamer provide the number of timebin information from HC header
and put it in a AliTRDdigitsParam, so later you can get this nubmer of
timebin information through digit manager like:
  digitsparam = (AliTRDdigitsParam *) digitsManager->GetDigitsParam();
  digitsparam->GetNTimeBins();
  so, Theodor also can use this function for HLT.
3. enable swapped optical fiber checking
4. bug fix in getting the chamber number directly through
rawreaderpointer->GetDet() fuction(based on Tom's bug report) but it
doens't give an effect in normal reconstruction.

new energy distributions for FMD

C++ compilation flag -D__PHOSUTIL__ is added for PWG4 analysis classes (G. Conesa Balbastre)

Remove protection against not initialization of MChandler in the Init, there the MChandler pointer is always 0

Add more AODPid information from tracking detectors when filtering ESDs

New calibration task for EMCAL with Pi0

Files necessary to create par files from EMCAL libraries

Clarify cluster loop. Add check for cluster being 0 (seen in online reco-viz).

Fix bug for cosThetaStar in case of like-sign (Carmelo)

New helper methods (Chiara)

Minor improvements

Possibility to extact time stamp from SDD calibration objects (useful to monitor stability of speed vs. time) - F. Prino

Fix the autosave of the HLT esd tree and writing of the raw-data header to the HLT esd tree (agreed with Matthias and Jochen)

Fixes for cmake

Fixes for cmake

bugfix (partially) #54670
replacing big static array with dynamically allocated array

bugfix (partially) #54670
removing the libAliHLTPHOS library from the HLT default libraries because of high static memory consumption
the developers are going to be informed

Adding EMCALUtils

dangling .f removed

small bug fix

Info about creating mixed AOD events (Antonio, Alessandro)

Splitting the configuration files for the proton analysis (Marek)

Adding the run macro for the feed-down analysis (Michal)

New LRC package from Andrey

Changing Error message in case Trigger scalers are not found in DCS FXS.
Another printout fixed.

Check the success of rotation

Changes for cosmics reconstruction

Changes for cosmics reconstruction

Remove deletion of s-digits manager

Initial version of online reco ready and tried at P2. Modifications include corrections in the start-up macro + update of the GRP preprocessor part that deals with the online access to GRP data in the logbook.

typo corrected (CKB)

Dependencies removed.

1) New library EMCALUtils with geometry and PID utils for the analysis: New classes AliEMCALGeoUtils, AliEMCALEMCGeometry, modifications in AliEMCALGeometry AliEMCALShishKebabTRD1 and AliEMCALPID

2) Geometry matrix with misalignments stored in ESDs: AliEMCALReconstructor

3) New class for cluster recalibration during the analysis: AliEMCALAodCluster

4) Store CaloCells in GeV units not in ADC units like in the Digits, needed for calibration in analysis: Changes in AliEMCALReconstructor and AliEMCALClusterizerv1

5) Use parameters defined in AliEMCALGeoParam.h: AliEMCALCalibData

Gustavo

Changing a default argument in the standard constructor (M. Van Leeuwen)

Mask the generated DAQ readout list according to the CTP trigger class.
This is a fix for a problem in the HLT-DAQ communication related to runs with
multiple trigger clusters and varying number of detectors in the clusters. The
fix is not complete for the moment, as some parts of the AliHLTReadoutList did
not work properly on the HLT cluster. Investigation ongoing.

temporary bugfix: the operator functions of the AliHLTReadoutList class did not work
correctly on the HLT online cluster. As temporary fix only the readout list of the
first matching CTP class is created.

bugfix: only increment CTP counters for data events, skip for SOD and EOD

sending empty ESDs in case no data blocks have been converted

adding member for the current event id extracted from the HLT header to the HLTOUT
adding printout of event ids from HLTOUT and RawReader to the processing function

Patch for the bug described in Savannah report 54788 (P. Hristov)

Removed not neccessry printf (Jens)

GerEvent implemented: gives back latest event.

EposEventHeader moved to libSTEERBase

more fit options for FQD, example how to use them added to the documentation
small update QC for particle weights

Improved parsing of survey files in DOS file-format (empty line was causing problems in that case) + minor improvements

Leak between file openings corrected.

mac->unix per pedis

Memory leak when passing from one input file to the next corrected.

Removed MV label shifting for second input event, index of input event stored in AOD.
Some coding violations corrected.

Default OCDB entries for TPC/Calib/QA and TPC/Calib/Raw

Bugs corrected thanks to C.Z. and some other changes

Updating the list of cosmic triggers (as received from F.Antinori)

Removing special characters accidentally put in the code.

Jens Wiechula modifications.

AliTPCCalibRaw.cxx.diff                 remove printf
AliTPCCalibViewerGUItime.cxx.diff       Add functionality: configuration file, calibration type selection, ...
AliTPCCalibViewerGUItime.h.diff         Add functionality: configuration file, calibration type selection, ...
AliTPCConfigParser.cxx.diff             Add functionality to retrieve parameters
AliTPCConfigParser.h.diff               Add functionality to retrieve parameters
CalibEnv.C.diff                         Add new calibration data written to the tree
calibVarDescription.txt                 Configuration file for AliTPCCalibViewerGUItime
TPCCEda.cxx.diff                        Remove obsolete data filling method
TPCPEDESTALda.cxx.diff                  Remove obsolete data filling method
TPCPULSERda.cxx.diff                    Remove obsolete data filling method
TPCQAda.cxx.diff                        Update meta data
TPCRAWda.cxx.diff                       Update meta data, remove obsolete delete

Fixed bug which was introduced when calibration was moved away from the RawDigiProducer.

Added to AliMagF the definition (const) of the polarities conventions.
The GRP manager will read the recorded current signs and reject the
combinations which do not satisfy to the convention used in AliMagF.
The convention flag is set to LHC convention:
L3    : pos. current -> negative Bz
Dipole: neg. current -> negative Bz

Minor fixes (Melinda)

Adding protection for a null pointer (Panos)

Introduce the digits parameter class which is supposed to store digits information for the raw data headers

Bool_t       FitDriftV(Float_t minFraction) - User specified minimal fraction of clusters
                                            - more robust
                                            - If not suffiecient mirrors identified - no calibration

(Marian)

Correct reader initialization to MCReader and remove line with setting PID

New RCU mapping

Adding Run number to the Krypton cluster
(Marian)

Test version of the shell script and macro for running the online reco @ P2.

Initial version of the ECS start-of-run trigger which will be used in order to start the online reco @ P2. Tested and validated locally with the test DIM suite. The code is compiled and runs only in case DATE (and DIM) is installed.

Some fixes for one PCB mapping

Missing parenthesis.

Pythia jets are written for kPyBeautyppMNRwmi

Correct error message in case the trigger cluster syntax is wrong (second field is not a number >= 1)

- add geometry initialization for translating the ITS clusters from local to global coordinates
- add detector origin for the data blocks pushed back in HLT