mergeCalibRun.sh              - merge result of calibration - over several runs
submitMerging.sh              - submit merging job for run in workspace

Marian

M      submitCalibJob.sh      - remove data from the /temp directory at the end
M      submitCalib.sh         - clean the run directory completelly
M      ReadmeTrain.txt        - Updated comment

Marian

Introducing the Azimuthal Isotropic Expansion analysis from C.Andrei (acristian@niham.nipne.ro)

fixed warning

Missing include

Important updates for Manso Tracker to use magnetic field integrals based on global field set in TGeoGlobalMagField or from GRP data.
Now also optionally generating and rootifying track candidates for debugging.
Some bug fixes for handling strip information in AliHLTMUONTriggerReconstructorComponent.
Adding default field integrals and generation macro CreateCDBFieldIntegrals.C.
Adding macro for displaying dHLT rootified output data DisplaydHLTData.C.

added Save function (X. Lopez)

Update in photon tagging class, EMCAL/PHOS geometry cosidered, macro to execute analysis added

Marian + Jens

M      AliTPCcalibDButil.h                     - Add usage of ITS-TPC calibration,fix compiler warning
M      AliTPCcalibLaser.h                      - Use mag field form OCDB - no parameter
M      AliTPCCalibQAChecker.h                  - Add representation histograms for number and hist case, improve draw funcionality, fix rep hist streaming
M      AliTPCCalibViewerGUIAlarms.h            - Add Reset of tree, add tree open
M      AliTPCLaserTrack.h                      - add comment
M      AliTPCcalibCosmic.cxx                   - disable obsolete histos
M      AliTPCcalibDB.cxx                       - Usage of ITS-TPC drift and T0 calibration, +Bug fix - Expand
M      AliTPCcalibDButil.cxx                   - Add usage of ITS-TPC calibration,fix compiler warning
M      AliTPCcalibLaser.cxx                    - Use mag field form OCDB - no parameter
M      AliTPCCalibQAChecker.cxx - Add representation histograms for number and hist case, improve draw funcionality, fix rep hist streaming
M      AliTPCCalibRaw.cxx        - store all occupancy info on ebye basis only in debug mode. By default store only occupancy in noise sensitive re
gions!
M      AliTPCcalibTime.cxx                     - Use cluster info to decide if tracks crossed CE (not z position)
M      AliTPCCalibViewerGUIAlarms.cxx          - Add Reset of tree, add tree open

Update data QA
(Pater Christiansen)

Change in order to reconstruct standalone runs with UNKNOWN beam type

Updates to correctly read VME scaler data

Tracks momentum value for PID taken from GetOuterHmpPxPyPz()

update wagon to produce histos in common file

Possibilty to assocate good PID flag to tracks not good for PID eliminated

Removed output on slot #0

Set global (static) memers to 0x0 in destructor so that multple instances don't get seg faults on delete

Changes from Svein Lindal
-Added asynchroneous readout,
-Added triggerdecision check,
-Added dump to file button
-Added Made HOMERreader TObject
-Updated macros

Track parameters update during the TOF-track matching procedure: REMOVED

iii) Add like-sign filter for on-the-fly V0 (B.Hippolyte)

specify DDL numbers to avoid reconstruction of STU

obsolette command removed

more fine binning for SPD

i) Add Armenteros-Podolanski at the QA level; ii) Update the QA displayed in Terminate (B.Hippolyte)

Compilation with CMake: corrected EINCLUDE

Using new ITS recpoints container class (M.Masera)

Do not allow prolongation without clusters of tracks with |tan lambda| > 1.1 (A. Dainese)

specify DDL numbers to avoid reconstruction of STU

Macro to create TimeGain OCDB entry from the calibration data
(Alexander)

- global track matcher depends on $ALICE_ROOT/PHOS

- CALO temporarily needs headers from $ALICE_ROOT/PHOS

- fixing compilation warnings

SOD enum updated to include logical combination of signals

Use SetMaxOrbs() instead of direct member access.

add function to extract the number of time bins

* AliEveEventManager
  Add support for automatically finding appropriate raw-data file when
  connecting to a centrally reconstructed run in alien.
  This is enabled by calling a static function:
    AliEveEventManager::SearchRawForCentralReconstruction();

* macros/visscan_raw_raw.C
  New wrapper macro -- enable SearchRawForCentralReconstruction().

One can now do:
  alieve visscan_raw_raw.C'("alien:///alice/data/2009/LHC09c/000101134/ESDs/pass1/09000101134018.10")'
and both reco and raw will be available.

added hChNoisy histogram

Macros to load TPC calib libraries
(Marian)

Adding defualt plots
(Marian)

forgot file in previous commit

factoring out AliTriggerAnalysis class
adapting all other code (dndeta, dndpt, multiplicity) to comply to that

moving dndpt code into PWG0dep because it depends on classes in steer

link for new mp2 tracker

added flag for decompostion done

New fitter for millipede2 + updates to AliITSAlignMille2 (Ruben)

Comparing lists of noisy SSD chips (Panos)

Removed debug printout in iterations

Keep the input block untouched.
It seems that the component memory increases when the input block is modified.

fixing a warning

Code verbosity containment: AliInfo/Warning->AliDebug(1)

Add plot with Z-Phi distribution of bad channels in the macro to monitor SDD calibrations

AliTPCTransform.cxx    - use L0L1 trigger delay if triggered by L0
(Marian, Jens)

Fix of ACORDE-QAChecker

Alignment macros by Dariusz

Some of the trigger base classes. Steering part not yet in.

Extensive Upgrade :
1. Bug Fix : proper place for re-initialisation of all the local variables (pb in case of several cascades present in a single event)
2. Terminate method : plotting 8 plots into 4 pads :
   2.1 Track Multiplicity,
   2.2 Cascade multiplicity
   2.3 Inv effective mass : Xi-, Xi+ and Omega-/Omega+
3. AliCFContainer : container to store any 3D histos with the different PID flavours,* 4 : for each cascade species          (fCFContCascadePIDOmegaMinus)
4. AliCFContainer - fCFContCascadeCuts : container meant to store all the relevant distributions corresponding to the cut variables
     (Towards the optimisation of topological selections)

A.Maire

esd_tracks.C
- Make esd_tracks_MI() use AliEveTrack, put them into TEveTrackList.

AliEveConfigManager
- Use getters now implemented in ROOT trunk (in ifdefed code).

reduced printout, put TH1::AddDirectory to histogram creation

update

AliEveConfigManager
- New class to handle management of AliEve configuration.

alieve_main
- Instantiate AliEveConfigManager.

its_hits.C
- Only use VizDB.

First physics production: requests #128-#131

added the possibility to have external parameters for the checking

From Pawel Debski: more modes for VizDB.

Fix for report #59228: Request to update OCDB/ITS/Calib/SPDDead

Fixes to trigger reconstruction component to handle real data better.
AliHLTMUONTriggerReconstructorComponent now also generates optional debug data blocks and AliHLTMUONRootifierComponent fills the data into the rootified objects.
Also fixed up some of the printing and documentation in the dHLT ROOT objects.

changes to run also on AOD MC

additional method for parameterizing particle production

Use z of hit instead of -zero- to make it work with inclined trigger chambers

Adding the proper n-sigma PID approach. It is assigned to the kSigma1 flag

added the possibility to have external parameters for the checking

additional cuts for AOD (Ingrid)

Bug fix - interpretation of the Trigger info
Warning removal
(Jens)

warnings removed

adding new QA tasks from Marta

Print commented

Problem in ch. mapping writing in the OCDB solved

Read all the coeff. from energy calib. object

Forgotten .h

correcting problem with undefined symbol in libAliHLTHOMER after the
cmake update in r36887

Macro to read output of CF task

Macros to plot output for D0Mass task (Chiara)

Added minuit contour plots (Chiara)

Added correlation histos

Adding export of calibration from vdrift calibration
using TPC-ITS/TPD-TRD/TPF-TOF matching of the tracks
(Marian)

Fixing compilation warnings

removed duplications in AlidNdPtHelper and AliPWG0Helper and small changes

M      AliTPCcalibCalib.cxx   - set after refitting also TPC out in friends
M      AliTPCcalibCosmic.cxx  - Example for debug stremear in commented  part
M      AliTPCcalibLaser.cxx   - Warning removal + Add min. number of clusters cut
M      AliTPCcalibTime.h
M      AliTPCcalibTime.cxx    - Adding the TPC-ITS, TPC-TOF, TPC-TRD vdrift/T0 calibration  and alignment

Marian

Fixed compilation warning (thanks Federico)

fProduceHistograms flag is set to 0 by default

VertexerHistoComponent added.
The component is written by Timur, it produces histograms with primary vertex, and with ITSSPD primary vertex.
The input is (optionally) ESD and (optionally) SPDVertex
The output is the set of histograms.

* AliEveVSDCreator
  Major cleanup and partial rewrite.

  Now (again) properly dumps in TEveVSDStructs:
  - Kinematics;
  - Hits for ITS, TPC, TRD and TOF (could easily add others);
  - Clusters -- same as above;
  - ESD tracks.

  Supports writing of several events into the same file.

  It should now be easy to display this data in ROOT only.

* macros/alieve_create_vsd.C
  Update for the new features.
  Support "min number of ESD tracks" cut.

* AliEveEventManager
  Add static CurrentEventId().

Correct memory leak in ExtractCE (double deletion of pressure sensors)

Use the time gain correction only of specified in the RecoParam
(Marian)

removing terminate overload and adding a warning for option requirement (B.Hippolyte)

Destructor implemented.

Leak corrected (Rossella Romita)

fixed warning

fixing coding viols

Rotate MUON trigger chambers around the x-axis with 0.794 degrees

Corrected calculation of tmin in FixParticleDecaytime()