Fix for compiler warning

Added protection in AliHMPIDReconHTA.cxx and setter methods for charge values in AliHMPIDCluster class (D. Di Bari)

Electronc noise switched-on in simulation. Default number of sigma for threshold calculation set to 4. Sigma values for each channel retrieved from OCDB. New setter and getter methods of threshold value and number of sigmas added in AliHMPIDParam

protection against null cluster pointer

Updates from Deepa

1. New function AliEMCALRecoUtils::GetRecoUtils() to get the pointer to AliEMCALRecoUtils.
2. Fixed the bug in removing clusters with hot channels from the cluster list.
3. Implemented hot channels for LHC11a/pass2 and LHC11c

coverty fix

More detailed geometry of ITS upgrade (cf. rev. 50841 (M. Sitta)

allowing also to measure sum pt

pad coordinate with respect to middle of the pad (0.5 shift); disable handling of transformed clusters (gives wrong coodinates anyhow)

fixing env var in par file creation (after directory relocation)

adding column for counting of pile up to stat histogram (Antonio O)

In alignment classes:
- Added the possibility to run the alignment in two steps
  * First step is to calculate the derivatives. The derivatives are stored in an AOD. It's fully parallelizable.
  * Second step reads back the derivatives from the AOD and performs the minimization.
  * The behaviour is handle in the AliMUONAlignmentTask setting the appropiate flags with the methods
    muonAlign->SetReadRecords();
    muonAlign->SetDoAlignment();
    muonAlign->SetWriteRecords();
- Improve running of alignment taks on the grid
- Correct handling of different OCDB used for input and output alignments
(Hugo, Javier)

In rootlogon.C:
Updated includes from STEER (now in subdirectories).

changed binning

fabs --> TMath::Abs (Marta V)

Add PairPt Cut

Extension of unfolding procedures (Marco vL, Marta V)
- new regularisations: a powerlaw with fixed power (5) and general powerlaw (linearity on a log-log scale)
- general powerlaw takes into account the efficiencies (if provided)
- interactive unfolder use

Fix compilation errors

Fixing wrong usage of bits

corrected initialization of ITS chi2's

dded ITS chi2 on all 3 steps of tracking

changing the ranges for gain calibration
Aexander

Gain calibration added to the HWCF emulation

Phi star version of the radial distance cut

Add PID code

Add PID code

Check of UniqueID temporarily disabled (Melinda)

Committ for the simulation a more detailed description of the ITS upgrade (Mario Sitta).
It contains :
- classes which simulate the geometry up to the volume hits.
- demo macros for the detector configuration

Note : CMake files to be committed soon.

increasing dphi axis range

correction in call of the offline cluster transformation

Include variable jet patch size handling in decoding

o be more tolerant with file name to determine the pass

Typo.

Memory leak fixed.

Remove gMC->Gstpar() calls from Init(). Now all is in galice.cuts

More Coverity fixes (M. Verweij)

fix for charge dependence

Adding straggling for TRD materials

coverty fixes

Electron dE/dx distributions added

Bug fix.

avoid leaks when filling cluster array, and label list

delete digits array in dtor to avoid leaks

Coverity fix

removed wrong declaration of virtal methods. moved copy constructor and assignment operator in the private section

Counter for multiplicity AMU-configuration fixed

Destroying some TLine objects of DQM-thresholds

Add EMCal calo trigger esd loop

new cuts to use combined basian pid without tender for pass 2

Better diagnostics when failing to copy to AliEn (Christian Holm Christiansen)

Removing unconditioanl print statements

Coverity fixes for dead code (M- Verweij)

Coverity fixes

ITS dE/dx samples in the AliAODPid
F. Prino

Coverity

Coverity

Coverity

Two new methods to get information about the origin of a particle.
M. Floris

correcting the z calculation of the crossing point, now it takes account for tracks crossing different slices

correcting a typo in r50799

adding conversion to space points

adding methods for memory allocation and conversion to space points; adding info messages filtered by verbosity parameter

Corrected the counter for accepted events

bug fix from Francesco Blanco after earlier QA update

o user status flags in AliVTrack
o change return to continue in track loop

renaming GetPDG()

update track selection QA (M. Verweij)

changed methods in AliAODPWG4Particle (G. Conesa)

patches

Class and macro to update the OCDB with the MeanVertex during pass0 (Davide)

Fix for coverity (R.Shahoyan)

Adjusting of the StepSize for the G4 simulation
(Ivana)

changed pragma directive and agent to include Emcal electron trigger. moved copy constructor and assigmnet operator in private area.

Update (Alessandro)

Possibility to handle PID from OADB (Chiara)

Fixes (Andrea)

Fix (Andrei)

Fixes for building of DA

coverity, old commented code removal

ttr study in pt region for iaa paper

fixes + detector mask in pid

Updating timestamps.

Cleaning the array containing the strings for the failed DPs at every new initialization for a new run.

Adding mode CMake

removing the argument -minTrackPt 0.0 from the TPC tracker, accidentally committed in r50158

delete not maintained classes

AliIsolationCut
 - Remove comented code lines
AliMCAnalysisUtils
  - Provide vertex of MC particles, for conversion photon studies
AliAnaPi0EbE
  - Cut on cluster pair time added
  - New histograms/code for shower shape studies added
  - Correct the loops maximum indeces
  - Cosmetics
AliAnaPi0
  - Cut on cluster pair time added
AliAnaPhoton
  - Conversion photon search, histograms with approx distance to conversion vetex
  - Shower Shape histograms, to swich on on demand

AliCaloPID
 - Remove extra semi colon in include
AliAnaPartCorrBaseClass
 - Open the pair time cut from 50 to 200 ns

AliCaloTrackReader:
 - Mask cell columns option added
 - Track filter bit mask selection option added
 - Commented code removal
 - Setter for energy cut changed to E instead of pt
 - Cosmetics
AliIsolationCut:
 - Make sure phi value of candidate to be isolated is not negative
AliCaloPID
 - Simple SS cut now takes into account threshold set in fDispCut
 - Put back weight formulas for PHOS pi0/photon discrimination, change way the formulas pointer is set
 - cosmetics
AliCalorimeterUtils
 - Added functionality to mask columns of the EMCAL calorimeter
 - Cosmetics
AliAnaPartCorrBaseClass
 - Add new cut for pair of cluster analysis, time cut
 - New method to set energy cut, same as pt cut, to avoid confusion
AliAnaNeutralMesonSelection
 - Add shift to minimum angle cut, to take into account detector resolution effects
 - Cosmetics

removed electron trigger from compilation until dependency fix

removed jet trigger from compilation until fix of emcal dependence from fastjet

add the R_AA cuts back in

coverity

added combined pid class

speed up of TPC alignment transformation

Updated LRC code (Andrey Ivanov): I'm sure that tomorrow I will receive a mail asking me to change the code, the only connection to which is that I commit it, significantly and then within the next 7 days if I don't do so I will be banned

Adding a new method calculating V0's impact parameter in 2D in XY plance

remove unnecessary dependency on obsolete trigger class

Fix for #84624: Problem in TPC cluster map

Fixes for #84564: Change in AliESDpid.cxx