changed the order of call of endofcycle so that images are produced

enable option - in detector list for QA

call of endofcycle common to detectors and global

Fix for Savannah bug report 59287

changing cuts to reflect real data

- added protection for slice and partition values out of range
- remove variables related to the creation of the specification of the output

From Matevz: implement virtual Print() from TObject. This is used when a cluster is alt-clicked on in AliEve.

- added protection for slice and partition values out of range (referring to the ones calculated from the cluster indices)
- cleanup of unnecessary variables

Fix for bug #58023. Reco stops on the first error and does not try to continue the processing.

changing output name

Added contact information

Calculate the line cut slope rather than hardcode it, changed debuglevel to 0, set background flag to false

From Bogdan: Trigger chambers are tilted for a small angle now.

Additional fix to bug #59368.

Coding convention (data member comments after the data member definition)

AliAODEvent: corrected copy constructor and assignment operator. This do not work properly if the user objects in the AOD events do not implement correctly the method Copy()
AliAODHandler: corrected destructors taking into account that ownership to AOD event and tree is lost after file closing. Corrections in the extensions to AOD's
AddTaskESDFilter.C : Added creation of the muon AOD as parameter of the macro.
AliAnalysisManager : Disabled object stats registration during the analysis manager session.

Bug fix. Savannah bug number 59616

Technical fix for bug #55111: possible memory corruption in AliConfig.cxx

Fixing a bug in the computation of the errors (Matthieu)

SingleMu :modification introduced to retrieve output histograms in proof, MuonDistributions.cxx -> implementation of output destructor and some graphical changes to the histograms (Roberta, Enrico)

Elimination of -new AliMagF-, not call the GRP to get the field

Allow for NTimeBins not being multiples of 3

skip the calculation in AliTRDCluster::GetYloc for HLT

Increase class version (forgotten in the previous commit)

In AliMUONESDInterface:
Minor bug fix in adding an object to the trigger store
(Philippe P.)

Cleaup the situation NTimeBin in simulation

Fix for bug #59368

Sergey: bug fix with storing cluster id's

- move tracklet index stored in track from UShort_t to Int_t - follow the
same convention as for the other detectors
- remove TLinearFitters from tracklets as we have moved to private/fast
  linear fitter

Adding the absorption correction task

Fix for
#59596  AliAnalisysManager crashes when looping over a TChain of local MC files

change default reco params to kLowMult, change kLowMult clustering threshold to 0.1 GeV and not 0.2 GeV

Protection added until code in STEER won't be updated

adding macro for TRD HLT (Theodor)

Update by Theodor
- some needed changes in TrackV1 and Definitions for upcoming changes in the TRDEsdWriter
- TrackerV1: correct output data size
- cleanup for the offline mode

Bug #56211: Storing the reco event specie in the ESD.

Fixing (again) bug #59345

important bugfix for the internal TRD tracklet structure, members had been copied in wrong order from the TRDTracklet,
minor extension and rearrangement of members in order to save space. This change is not backward compatible, but as data
has not been stored in this format, no other protection is implemented. Only used for HLT TRD internal. (Theodor)

added more options to run D0 finder from offline or online data (Gaute)

Remove useless cast... (B.Hippolyte)

Common primary vertex access for ESD and AOD (B.HIPPOLYTE)

adding support for the new AliESDHLTDecision class which will allow to store
the HLT decision also in the ESD. The code is not activated yet. Finishing the
necessary changes in STEER now

Removal of memory leaks (Laurent)

Removal of memory leaks (Laurent)

Removal of memory small leaks.

Fixing documentation

Fixing bugs

* show_scan_results.C
  Add vertex histograms.

* vzero_dump.C
  New macro to dump vzero info to the terminal.

* visscan_init.C
  Include vzero_dump.C (not on by default).

vertex histograms X axis in cm

overwrite the image after each cycle

The check for save file was blocking the route to the checker

remove Global QA task: moved to PWG1 (Yu.Belikov)

make GLOBAL always an active "detectors"

Adding a task for running the GlobalQA over the ESD files.

Files that I have prepared for the Muon AOD creation when doing ESD filtering.
They are AliAnalysisTaskESDMuonFilter.h/cxx (to be committed in PWG3/muon) and AddTaskESDFilter.C (to be committed in ANALYSIS).
The tasks contain the code needed to write the Muon AOD, based on the updates in the AOD handler by Andrei.
The macro contains the setting of a flag to enable/disable Muon AOD creation (default to kFALSE, i.e. disable)
(E. Scomparin)

enable making of image for QA

Call PostData() for each event.

Setting the class name meta-data field in the constructor

 - Implementation of trigger response re-calculation with a 4/4 coincidence or after removing one chamber (useful for trigger chamber efficiency calculations): the result is stored in unused bits of the trigger word in AliESDMuonTrack (NO extra data members required).
 - Speed-up of the trigger response calculation (factor of about 4 in cosmic runs, resulting in a factor of 2 for the Trigger QA MakeRaws).
(Diego)

Implementation of trigger response re-calculation with a 4/4 coincidence or after removing one chamber (useful for trigger chamber efficiency calculations): t
he result is stored in unused bits of the trigger word in AliESDMuonTrack (NO extra data members required).
 - Speed-up of the trigger response calculation (factor of about 4 in cosmic runs, resulting in a factor of 2 for the Trigger QA MakeRaws).
(Diego)

removed left over commented out lines

Updated geometry. It includes in particular the changes in MUON related to ticket 59041, ported at rev 37237

Fixing segfault

Bug fix, enabling connection to dumps from dev cluster

Vertex not deleted but updated.

add track status in debug stream

Keep the leading time and width even in case of missing ADC (related to the problem with the inconsistent data from the first collisions).

remove unwanted AliCodeTimerxxx to stay compatible with release

Implementing the skeleton for HLT QA for type kESDs (reconstruction)
Adding a cutomized Exec function to HLTQADataMakerRec, AliReconstructions
needs to be patched to send both ESD and HLT ESD.

Adding skeleton for AliHLTQAChecker

Updating transform.dat for the geometry update:
Rotate MUON trigger chambers around the x-axis with 0.794 degrees (r37036)

Fixing bug #59470

small correction

Fix of the memory leak from L.Aphecetche

improve print-out

added trigger correlation hardware to offline

move setting OCDB and GRP from default to user responsibility. Default
for local MC

Print() implemented.

Fixes to run the MUON alignment on the grid
(Javier)

Fixing bug #59311

add verbosity

Recent first physics productions.

Fixes to run the MUON alignment on the grid (Javier)

 AliMCEvent::GetPrimaryVertex() implemented
 Fix for #59375  AliMCEvent::GetPrimaryVertex always returns 0

uncomment debug streaming in cluster2track residuals

MBCalib object added to OCDB

Correction from Enrico.

Updates to MillePede2 + MillePede2 fitter (Ruben)

Switch to vertexerZ if the number of clusters on either layer 1 or layer 2 exceeds a threshold currently set to 500. The threshold can be set via SetMaxNumOfClusters method

Use SpecialOutput for the CF container (Chiara Z)

Adding the histograms for the TPC-only track impact parameters.

move macro to macro dir

move macro to macro dir

Remove obsolete macros

range of histograms which are needed for set time window with 1st data

correction needed to include HLT in QA

CalibEnv.C calibVarDescription.txt guiAlias.C
CalibEnv.C.diff Add NaN counter
calibVarDescription.txt.diff Add NaN counter
guiAlias.C.diff change name of main function to guiAlias
Jens

AliTPCcalibDButil.cxx.diff Add NaN counter
AliTPCcalibDButil.h.diff Add NaN counter
AliTPCCalibViewerGUItime.cxx.diff Sort entries for timestamp
AliTPCCalibViewerGUItime.h.diff Sort entries for timestamp

Jens

Replace the NextEvent button in the GED version with Dump Event Info. This appends the event-info text into event_info.txt file in current directory.

Reverting changes from AliZDCQADataMakerRec.cxx

Calibration for centrality determination in A-A implemented see Savannah bug 56253