Update of PID class (Rossella)

Overwrite Charge() to patch a bug in AliAnalysisVertexingHF (now fixed) (Francesco, Giacomo)

from Indra: Muon display changes

Added additional histogram for the good esd tracks when vertex is reconstructed

Fixes from cholm to enable reading of geometry from a file

removing unnecessary include file

removing unnecessary include file

removing unnecessary include file

removing deprecated trigger component. The HLT ReadoutList is going to be handled exclusively by the
AliHLTReadoutList class which supports Root schema evolution. The trigger framework now provides base classes
for trigger components.

Another try to get the last commit working...

removing unnecessary include file

removing unnecessary include file

removing unnecessary include file

correcting propgation of MC labels. labels can be different for the TPC and ITS tracks,
tracks are now updated from the ITS label if available, otherwise TPC label is kept
remove warning on different TPC and ITS labels

setting up the kinematics tree in the RunLoader, needed for correct propagation of MC labels in the ITS clusterfinder (Gaute)

Added resolution functionality and plots (Friederike)

First version of a class to compute the number of collisions corresponding to a data sample
(AliCollisionNormalization) and of a corresponding analysis task, demonstrating usage
(AliCollisionNormalizationTask). Macros to run the task are also provided.

Minor modification fo AliPhysiscsSelection: the enum of stat table is now public.

take the QAsym AddTask macro from PilotTrain

Write standard to standard branch in case of JF UA1 and R = 0.4

New cuts for cosmics, updates to spectra

New plot with fraction of good channels per layer

Updates by Constantin Loizides.

Setting of PtHardMin and PtHardMax added.

Updates for parfile creation.
Jens Wiechula

 SDigits tree to sutisfy Savannha bug

removing unnecessary include file

removing unnecessary include file

removing unnecessary include file

removing unnecessary include file

Updates of the DA for the TRD to export data to AMORE (Raphaelle)

Bug fix (charge of 3-prong was swapped ! thanks Francesco)

QA: use RCU trailer info to determine if ZeroSuppression was on

Fix logic for local masks when regional boards are out of order; fix also for rev. 39352

Update of calibration code (Raphaelle)

change analysis debug flag to -1 to avoid prints, change analysis macro to not call the grid handler for jobs on the grid

the current version

Added bunch crossing number in ntuple for luminous region (Davide)

Fix for report #67958: Fortrans open call should open explicitly for read-only

First version of the TenderSupplies for TPC/TOF/TRD
Jens Wiechula

use par files for the two flow libs on the grid

adding some setters for multiplicity range

Added new scheme for the analysis cuts

moved cut selection up in the config file

Fix bug in histogram visualization during Terminate phase (Diego).

Putting the ADC samples + track labels in the digit object. Some addtional clean-up. Next step is to repair the trigger simulation and then raw->(s)digits methods.

Use consistently
r     instead of  x
rphi  instead of  y

Marian

Cleanup of obsolete method.

Correction to the previous commit

Correct initialization in the constructor

Removal of obsolete code

added CALIBRATION_EVENT counter printout

Fixing warnings

- Avoid troubles with directory structures when loading efficiency maps from analysis task output file.
(Diego)

Now overwrite mode (plugin->SetOverwriteMode(Bool_t flag)) is active by default and will not only delete existing generated collections (local and grid) but also previous merged results from a previous session.

New functions to set the acceptance of parts of the chambers. Minors.

New functions to set the acceptance of parts of the chambers. Minors.

Minor updates in macros used to plot SDD calib. quantities vs. time

New functions to set the acceptance of parts of the chambers. Minors.

Changes for report #68168: Request for committing bug fix to trunk/STEER (Markus)

Return label  -1 in case of 0 accepted clusters
(Marian)

Protection again divison by 0
Short tracks, with 0 accepted clusters

Marian

Adding class for effective ExB correction.

Marian

follow-up re. Savannah item 68069 - missing EMCAL Trigger OCDB object: now added (from Rachid)

follow-up re. Savannah item 68069 - missing EMCAL Trigger OCDB object: now added (from Rachid)

Changed class inheritance: from TObject to TTask

Changed class inheritance (TObject->TTask) and fixed bug

excepting also empty directory for merging

Additional protection, for the Savannah ticket #68145 (M. Ivanov)

Fluka Primary ionisation for TPC

fixed typo and added printout

Fixing memory leaks

Updated for MC running and fixes to memory leaks

Updated for MC running and fixes to memory leaks

Adding some features for DQM shifter histos

Add offline preprocessor for pass0 calibration (Raphaelle)

- 2D Pulse height spectrum as new reference plot
- Switch of chi2 plot due to crashing on real data
- Definition of undefined symbol (AliTRDeventCuts)
- Use Clusters outside the chamber for Monitoring plots

Medium cuts moved to galice.cuts

Coding conventions (Mikolaj)

- created the option to use the converted output blocks of the CATracker, in order to fill a separate
  file with tracklet information. The TPCCATrackerOutputConverter is used for the tracklet block conversion.
- updated macro documentation

Add the connected pad info to the simulation (Raphaelle)

modification(by Levente) to solve the problem in the QA mentioned in the bug report #66689

added file with new alignemnt objects

Update for p-p 2010 reco param: disable SDD cluster unfolding

New task for cut optimisation (Giacomo, Renu, Francesco, Chiara)

New task for cut optimisation (Giacomo, Renu, Francesco, Chiara)

move macros to macros/

move macros to macros/

move macros to macros/

removed obsolete macros

Update (Chiara)

remove PWG2AOD

Updated version (Marek)

gstpar calls removed, settings moved to galice.cuts

changed setting, correct warnings

Added extra histograms for cosmics identification

Debug level set to 0

Add a protection against division by 0 (which may occur when a track exit from the area covered by the magnetic field map during the extrapolation) and stop the tracking of the problematic track. (Philippe Pillot)

changed binning for QA task, require 2 contributors for the vertex to exclude cosmics

new settings, larger binning for QA, p_T threshold for spectrum, number of processed events for local train

Fixes for running on MC for JetChem, lower limit for p_T of jets in spectrum and for corellation