Added n sigma-to-vertex histogram and theoretical function (gaus)

Adding comments

Coding conventions corrections: class description on 5 lines

Coding convention corrections: implementation of GetNtracks() in .cxx
(was too long)

Several protections for nprim = 0 added. In this case Edep() should return
0.

Common blocks to access material properties and
ionisation model parameters added.

Coding conventions

Putting back the second argument (title) in the standard constructor
- to follow AliRoot standards

Adding a couple of setters for the different BF terms - to be used while merging results from a splitted batch job. Adding a copy sonstructor.

remove file with old-fashioned zero misalignment objects

fixed coding conventions violations

changes to be compliant with Eff C++ rules

Added MuonRec.SetLoadAlignData("MUON") to get rid off warnings from
not included detectors in testReco.out
(following Raffaele' suggestion)

Allow to draw a motifType (Laurent)

- Added shuttle category
- Reordered catagories following their dependencies

Modified comments for Doxygen

Redirecting cout debug messages in AliDebug (Laurent)

Corrested data members initialization in ctor

small bugfix in Notify

Corrected comment (Laurent)

Set include path to allow AClic compilation (Laurent)

Count instances (for debug) (Laurent)

Correct signature of Print method (Laurent)

Adding GetNofDEInChamber method (Laurent)

Remove ununsed (s)digitizers (Laurent)

Adding AliMpManuList class (Laurent)

Adding loading MUON libraries (Laurent)

New list of libraries including MUONshuttle (Laurent)

Removing AliMUONTransientDigit and adding AliMUONObjectPair class (Laurent)

- Splitting the creation of ped, gains and deadchannels containers which used to be
  in the same function.
- Added a diff function to compute the difference of calibration between 2 runs
(Laurent)

New InvalidFloatValue() method (Laurent)

Added CloneEmpty method (Laurent)

Added Print method (Laurent)

Remove now unused method DigitResponse (and usage of TransientDigit) (Laurent)

Change due to change in AliMUONDigit Signal type (int to float) (Laurent)

Change charges from Int_t to Float_t as they should be (Laurent)

Remove old Add(S)Digit prototypes (Laurent)

Correct 2nd paramater of ctor and the default filling (Laurent)

Correct default filling in ctor (Laurent)

Correct a memory leak (due to usage of TPair -> replaced with AliMUONObjectPair (Laurent)

Pre-allocate right amount of memory when used for de,manu storage (Laurent)

Updating comments

Remove options for digitizers and segmentation factory

Remove usage of old (s)digitizers (Laurent, Ivana)

Removing old digitizers (Laurent)

New class - to be integrated in segmentation (Laurent)

New classes for shuttle (Laurent)

Adding new classes to the library PWG3base

Interface class for quarkonia efficiencies (Zaida)

Removing warning if MUON hit branch is not present as required by Federico (Gines)

o) Adding time out to the execution of the preprocessors: The Shuttle forks and the parent process monitors the child
o) Merging Collect, CollectAll, CollectNew function
o) Removing implementation of empty copy constructors (declaration still there!)

AliFatal added in SetAlignable

A macro for testing AliVertexerTracks (A.Dainese)

Possibility to reconstruct the vertex with the TPC stand-alone, and to store the indices of the tracks used for the reconstruction (A.Dainese)

Adding the indices of the tracks used for the vertex reconstruction (A.Dainese)

changes to be compliant with Eff C++ rules

New set of alignment objects with symbolic name (Raffaele)

 New set of Zero Misalignment objects (with symnames)

PrimaryElectronIndex corrected.

NEVENTS set back to 100

Updated list of classes

AliInfo printing moved to AliDebug

hardcoded detector position; bug in alignment pth fixed

Included new data member to change patch size in calorimeters trigger (Gustavo)

Dummy return

- Misc. modifications to take into account that moduleId != chamberId
- Supressed old segmentations (not based on mapping) - defined via options
  FactoryV2 and FactoryV3
- CreateDESegmentation(), CreateModuleSegmentation moved to private

Removed class, using AliMpExMap instead

Added method GetObject(Int_t index) which makes possible
to loop over map as over an array

Modifications to take into account that moduleId != chamberId:
IsValidModuleId,GetModuleId functions replaced with:
IsValidChamberId/GeomModuleId and GetChamberId/GeomModuleId

Modifications to take into account that moduleId != chamberId:
Renaming data member fModuleId to fChamberId to reflect that iterator
operates over detection elements in a chamber which may include more geometry
modules

- Adding fgkNofGeomModules static data member and its getter
- Renaming fgkNCh to fgkNofChambers and its getter accordingly

Removed class AliMUONGeometryStore

Regenerated files with new slat geometry

- Function GetChamberId(volId) replaced with GetGeomModuleId(volId)
- In StepManager: if sensitive volume not found in the first found
  geometry module try also the next module (as in slat chambers the same
  vol Id can be present in both half chambers)

- Changed constructor - now passing the first geometry module Id and the number
  of modules
- Added private function GetModuleId(envName)
- Using AliMpDEManager for detElemId -> moduleId

- GetModuleSegmentation(moduleId) moved to private to prevent from
  potentional errors due to passing chamberId instead of mofuleId
  (as they are now different)
- Using AliMpDEManager for detElemId -> moduleId

- Misc. modifications to take into account that moduleId != chamberId
- Supressed old segmentations (not based on mapping) - defined via options
  FactoryV2 and FactoryV3
- CreateDESegmentation(), CreateModuleSegmentation moved to private

- Removed old constructors and replaced them with their new version
  using detElemId
- Removed fIsDetElemId data member (now obsolete)

- Updated for replacement of AliMUONGeometryStore with AliMpExMap
- Using AliMpDEManager for detElemId -> moduleId
- Hardwired strings in ASCII IO replaced with those defined in module
  transformer and det element classes
- Checking size (and expanding if need) when adding new elements

Removing unused forward declaration

Removing unused include

AliMUONGeometryStore replaced with AliMpExMap (used as the type
of fDESegmentations, fDENames data members)

- AliMUONGeometryStore replaced with AliMpExMap (used as the type
  of fDetElements data member)
- Added static method GetModuleNamePrefix();

AliMUONGeometryStore replaced with AliMpExMap (used as the type
of fDetElements data member)

Added static method GetDENamePrefix();

In CreateGeometry..() - added check for consistency of detElemId and moduleId
(as this relation is now hardwired in AliMpDEManager)

Removed old AddHit function and replaced it with the new one
called AddHit2

Added number of geometry modules and its getter

- Updated for new numbering of geometry modules:
  the moduleIds for trigger chambers are now: 16, 17, 18, 19
- Updated for changes in the base class constructor
  (now passing the first geometry module Id and number of modules)

Taking into account half-chambers as alignable modules
- Now defines 12 geometry modules
- Half-chambers mother volumes defined as virtual modules
  (TGeo asssemblies) with names:
  SCXXI - inside the LHC ring, x>0 right; SCXXO - outside, x<0 left
- Removing unused variables
(Gines, Ivana)

Updated for changes in the base class constructor
(now passing the first geometry module Id and number of modules)

- Updated for changes in AliMUONSegmentation
  (now only GetModuleSegmentationByDEId available)
- Using AliMpDEIterator for looping over detection elements

Using AliMpDEManager for detElemId -> moduleId

Using AliMpDEManager for detElemId -> chamberId

Updated for changes in AliMUONSegmentation
(now only GetModuleSegmentationByDEId available)

Updated for replacement of AliMUONGeometryStore with AliMpExMap

Protection against large number of primary electrons added. (A. Ferrari)

changes to be compliant with Eff C++ rules

method AddAlignableVolumes added

method Raw2SDigits added