bug fix - intorduced with coverity changes

Adding include to include path

parent index -1
Eulogio Serradilla Rodriguez

Adding EMCAL
(RongRong)

F. coverity

AliESDCosmic.cxx  - pointer check
AliTPCClusterParam.cxx - snprintf
AliTPCMonitor.cxx - pointer check
AliTPCFast.cxx   - pointer check
AliTPCTempMap.cxx - memory leak
AliTPCkalmanFit.cxx - memory leak

Adding functionality for sparse drawing

Coverity fixes

coverity

correct compilation warning

added some QA to flow track cuts and event cuts, trackID fix, better redoFinish and maybe some renaming of output slots for clarity

Covarity fixes

coverity

coverity

Fixing shadowing

access to centrality in analysis, Renzhuo

coverity+coding violations, Rachid

coverity+coding violations, Rachid

adapted to part corr fw

Coverity fixes + improved label assignement

update to work with current trunk

Primaries must be counted before trigger cuts else they are not MC truth

isolation task/cuts modifs (N. Arbor)

Store correct chi2/ndf for tpc constraint tracks

Code clean-up in dN/deta calculation.
  - First properly calculate d2N/detadphi
  - Then project.
Removed Energy loss fitter from AOD tasks -
it just takes up memory and is largely useless
there.

adding planes

Bypass trigger class selection

Some fixes

removed ZDC-V0 outliers cleaning
A. Toia

function call optimization: passing structures by reference

fixing Coverity Defect 16202

Updates for AOD embedding
Gustavo Conesa

 Factorization of the different raw fitting algorithms in EMCAL (Per Thomas)

coverity fix

coverity fixes

Fixes for coverity

some corrections (Magali)

coverity 2

Fixed problem when drawing DQM histograms (F.Bellini)

passing argument by reference to support proper cleanup of the argument list

Fix some problems, and clean up code

Update (Chiara)

Updates and corrections.
Matus Kalisky

Updates
Ruben Shahoyan

Updates in SDD macros to plot QA results

o make task owner of the output lists

plotted delta pT for different cents

added all corrections for EMCAL for periods LHC10d and LHC10e

Coverity fixes

Coverty plus minE threshold

bug fix

Minimum clusters per track to 3, as in AliGRPRecoParam for pp

Adding AliMUONCDB::ShowFaultyBusPatches method to make tracking of misbehaving buspatches a bit easier

adding default configuration objects for PrimaryVertexer and V0Finder components

Updated analysis (Marian)

bugfix in the announcement of required OCDB objects, use configuration objects according to CF type

Replacing sprintf with snprintf
Coverity warnings

coverity changes

AliESDcosmic.cxx             - pointer check
AliTPCcalibTime.cxx          - proper pointer check
AliTPCcalibTracksGain.cxx    - removing obsolete functions and data members
AliTPCtrackerSector.cxx      - array initialization in cosntructor
AliTPCclustererKr.cxx        - check the pointer at the beginning of function
AliTPCkalmanAlign.cxx        - coverity warning
AliXRDPROOFtoolkit.cxx       - snprintf instead of sprintf

Whoops - forgot to delete some code

Renamed script to add Central AOD task from
AddTaskCentral.C to AddTaskCentralMult.C  - to be
consistent.

Fixes for the event normalisation calculations.  We
can now properly use beta in the formula

  N = 1/E_T (N_A + N_A/N_V (N_T - N_V - beta))

Note, that this requires that the physics selection
does not check the that the hw trigger class is a
collision trigger.

Fixes for the TrainSetup.C script.

MakeAOD.C and MakedNdeta.C will now use TrainSetup.C
if libRAliEn.so is available and working.

Run.sh likewise will use the TrainSetup.C, unless
libRAliEn.so is not available (checked) or an empty
name is passed via the option -N.

DrawdNdeta.C fixed upd a little.

Note, to check for a true collision, one now needs to
do

   AliAODForwardMult::IsTriggerBits(kB|kNSD)

for example - otherwise you also get A, C, AC, and E
triggers that are also NSD off-line triggers.   This
is done automatically in

   AliAODForwardMult::CheckEvent

Renamed

Renamed

o fix coerity warning

Coding rule violations corrected.

o Set proper default value for tof time 0

Coverty fixes

Coverty

removed TH3

coverity

Fixed all coding viols.

Fixing minor coding violations

adding cross checking utilities

adding cross checking utilities

Adding functions to facilitate cross checks with Monte Carlo

Fixing number of centrality bins

Adding setting for background and efficiency error, fixing number of centrality bins, adding function to calculate total systematic error, adding centrality dependent efficiencies

Fixed fRunChanged after last commit (Marco, Marek)

Bug fix in the track phi assignment.
Protection added in the clustering.
Added macros for full simulation and cluster checks

More fixes for running on the grid

SUMMARY by A.Maire:
7 TeV analyses,
step forward on the selections (binning, Xi rejection, ...)
+ multiplicity issues : new estimator EstimateMultiplicity from Ruben

---------------------------
1. CheckCascade :
* Coverity defect (10256) :
       Prior tables in combined PID now hold 10 values instead of 5.
* Editions :
       - in THX titles, #Omega^{+} become #bar{#Omega}^{+}
       - in THX titles, #Xi^{+} become #bar{#Xi}^{+}
* New set of topological cuts :
       - towards optimisation in pp data at 7 TeV (Extra Loose)
* Pile-up :
       - change from IsPileupFromSPD to IsPileupFromSPDInMultBins (pile-up rejection = f(nb tracklets)
* Multiplicity:
       Introduction of "nITSandTPCtracksAndSPDtracklets" as another Multiplicity observable (AliESDEvent::EstimateMultiplicity)
       + control TH1F fHistEstimateITSTPCMultiplicityForTrigEvt
* fCFContCascadePIDXiMinus, XIPlus, OmegaMinus, OmegaPlus
       - new binning for the inv mass dimensions
       - Omega containers filled only if the corresponding | M(Xi) - 1.3217 | > 0.008 MeV/c^2
            e.g. (TMath::Abs( lInvMassXiPlus-1.3217 ) > 0.008)
* fCFContCascadeCuts :
       - Multiplicity dim = now prim. tracks or EstimateMult.
       - new manual binning for prim. track dimension,
       - Omega steps filled only if the corresponding | M(Xi) - 1.3217 | > 0.008 MeV/c^2
* Angular correlation :
       - Omega THnSparse filled only if the corresponding | M(Xi) - 1.3217 | > 0.008 MeV/c^2

2. macros/AddTaskCheckCascade
   --> Nothing

3. CheckPerformance
* Coverity defect (10256) :
       Prior tables in combined PID now hold 10 values instead of 5.
* Editions :
       - in THX titles, #Omega^{+} become #bar{#Omega}^{+}
       - in THX titles, #Xi^{+} become #bar{#Xi}^{+}
* New set of topological cuts :
       - towards optimisation in pp data at 7 TeV (New Loose)
* Pile-up :
       - change from IsPileupFromSPD to IsPileupFromSPDInMultBins (pile-up rejection = f(nb tracklets)
* Multiplicity :
       Introduction of "nITSandTPCtracksAndSPDtracklets" as another Multiplicity observable (AliESDEvent::EstimateMultiplicity)
* TH2F Mult. observable Vs True MC multiplicity
       - f2dHistRecoPrimTrckMultVsMCMult,
       - f2dHistRecoEstimateMultVsMCMult
* TH2F Pt(baryon daughter) Vs Pt(Casc)
       - f2dHistAsMCPtProtonVsPtXiMinus
       - f2dHistAsMCPtAntiProtonVsPtXiPlus
       - f2dHistAsMCPtProtonVsPtOmegaMinus
       - f2dHistAsMCPtAntiProtonVsPtOmegaPlus
* fCFContCascadePIDAsXiMinus, XIPlus, OmegaMinus, OmegaPlus
       - new binning for the inv mass dimensions
* fCFContAsCascadeCuts :
       - Multiplicity dim = now prim. tracks or EstimateMult.
       - new manual binning for prim. track dimension
       - Omega steps filled only if the corresponding | M(Xi) - 1.3217 | > 0.008 MeV/c^2

4. macros/AddTaskCheckPerformanceCascade
   --> Nothing

memory management

- increase the number of files that can be chained to 200 (from 20)

MC Primaries should be recorded before trigger selection

mods in AliReconstruction and AliReconstructor for the upgrade (Annalisa)

a) Implemented energy threshold on cells to be assigned to clusters
   In order to be fully consistent (ie before this gets ported to the
   release) the rec param should be updated to be zero.
   (it is 10 GeV right now the code used a hard coded value of zero)

b) Implemented switch (default off) to also use the energy gradient
   to decide whether a cell is considered to be neighbor or not.
   At the moment I am only playing with this option so it is not
   interfaced with the rec param.

Coding rules (Fabio)

- removed ITS options
- added the centrality task for the case of Pb-Pb data
- modified the names of macros and scripts created while submitting a job to contain the name of the task
- updated ROOT and AliRoot versions for running on the GRID

Minor things

Fixed problem

Fixed problem

Some adds and removes

Mostly documentation changes.

Also added ability to choose dN/deta normalisation scheme

Possiblity to use MC primary vertex in IsSelected

Possiblity to use MC primary vertex in IsSelected

bug fix

Fixing Coding violations

o add parameter for MC

Add some more cuts

only access ocdb if really requested

Analysis classes to measure inclusive pi0 spectrum in pp collisions

fwd declaration