Update Long range correlations (Christoph Mayer)

Add event selection depending on high energy clusters existance in EMCal to speed up PbPb analysis

Added macro for systematics study for K* (S.Singha) + update lego_train macro (mvala)

Change "undefined" value of the time stamp from 0 to kMaxUInt, while 0 could be a valid value for MC events.

changes from fzhou

Rejection of corrupted chunks based on comparison of TPC und ITS-TPC track number

Possibility to not create RecPoints tree, using clusters directly in the reco.

#80516: AliFatal due to hardcoded run number in AliCaloRawAnalyzerPeakFinder

Correct filling of histograms in array

including track mult to the tree

reviewing typos, re-writting parts -- Cath

Adding Jet Shape User task (M. Poghosyan)

MB only task

reviewing typos -- Cath

reviewing typos -- Cath

TPC PID update:
o Add possibility to correct for the eta dependence of the TPC signal when calculating nSigma
o Add Eta correction maps
o Updated TPC splines: optimised for eta corrected signal, better performance at low p
o Currently supported periods 10b,c,d,e pass2 11a pass1,2
(Benjamin Hess, Jens Wiechula)

The ReportTrips method now builds an object that can be viewed in mchview (when launched within a mchview session)

reviewing typos -- Cath

add histogram for event statistics, add flag which can switch on/off three particle correlation loop

changes in AliLeadingV0Correlation (Jayarathna Sandun Y <sypahula@Central.UH.EDU>) + protection for floating point exception

fix for valgrind reports, mem leak and invalid read

updated

Fix Compilation

Forgot tp update the class index

update Ante

update from ante

removing rosi

small mods, minjetpt and AliEmcalJetTask return

Mods for running with different Z-vertex cuts

Added switch in recoparam for HLTPreSeeding
 - also in TrackerMi - default = OFF
Added switch for IonTain removal
  - default = OFF

Reorganising the TPC transformation in HLT:

- Global instance of AliHLTTPCFastTransform removed. Instead, a private static member is put to the transformation component.

- All the calculations, incl. alignment are moved from AliHLTTPCClusterTransformation to AliHLTTPCFastTransform.
Now the AliHLTTPCClusterTransformation class only initialises the HLT environment - data base, geometry, TPCRecoParam

- During off-line reprocessing, the Time Stamp is reset in the first event, when the event time stamp differs significantly from the initialisation time.

- Extra checks and eror messages added.

remove duplicated histogram creation

increase histogram array size

Add pile-up related histograms for different selection criteria

Add pile up selection via EMCal cluster multiplicity, add or update pile-up control histograms, add methods to check pile-up for different combinations of EMCal and SPD selection

some rewritting and layout changes --Cath

update macros

Update of forward flow tasks to include the option of using an etagap. Macros updated to reflect recent changes to the forward train macros.

Memory leaks fixed (R. Tieulent)

Updated treatment of TOF information + new plots for TOF start time (Pietro, Francesco)

Corrected (w.r.t. r59510) DPs for MCH: current values, will get added to MUON/Calib/HV

Adding lines to compile new classes

Corrected (w.r.t. r59504) DPs for MCH: current values, will get added to MUON/Calib/HV

Completed transfer of AODTrack information to ESDTrack in the AliESDtrack::AliESDtrack(const AliVTrack *track)
https://savannah.cern.ch/bugs/?98703

Fix in inline methods declarations

Add protection against division by zero in AliMUONVTrackReconstruct::TriggerToTrack

additional DPs for MCH: current values, will get added to MUON/Calib/HV

update

-updates on user addtasks

-add variables HasCocktailMother,HasCocktailGrandMother to indentify/cut on enhanced MC signals
-add Print function to EventCuts

"attached you can find a fix in AliTPCcalibDB which I sent around a few days ago already.
Currently AliTPCcalibDB::GetDCSSensorValue returns wrong values in case the timestamp is outside the time range of the sensor.

The patch should fix it."

(Jens)

new task for higher moments efficiency and contamination (Nirbhay Kumar Behera <nirbhay.kumar.behera@cern.ch>)

Updates for jet core task

fzhou's changes

Modified macros for lego train (M.Vala+M.Venaruzzo)

option to remove duplicates

mergeMakeOCDB.byComponent.sh:
  updated merge by component code, the script works for alien and local,
  supports a number of file access methods (alien_cp, TFile::Cp(), \
  direct access over the network or local).

mergeByComponent.C:
  possibility to set limits to merging of the memory hungry TPC components

add protection

M    dNdPt/macros/AddTaskdNdPt.C

 - binning modified to include all centrality classes

2011 cuts for global tracks

Added new class AliITSUClusterPix. Clusters are stored in local frame,
but sorted in tracking one.

Made some methods virtual so that the detector (upgrade) code may define its own behaviour

Analysis code updated

Test script updated

Adding HV currents to the MUON/Calib/OCDB object

Fix the problems reported in
https://savannah.cern.ch/task/?34890
Jens Wiechula

control histogram for resonance removal
option to remove weak decays from MC

adding MC EP (Francesco)

M    dNdPt/AlidNdPtAnalysisPbPb2011.h
M    dNdPt/macros/AddTaskdNdPt.C
M    dNdPt/AlidNdPtAnalysisPbPb2011.cxx

 - modified for better usage in lego trains
 - added few debug messages
 - removed warning from narrowing conversion between double and int

std::cout std::endl declarations added

Made access to matrices virtual

add EMC8 configuration

add option to reject or not event with non reconstructed vertex

New config for the train

changing macro for mass production (first step towards summary results)

finite bin correction
eff correction for trigger particle

including histo to check tracks inside the cone

changing macro for mass production (first step towards summary results)

add getters to facilitate configuration out of the AddTask

Changes from Martin: prepare new options field for handling big output in PROOF. Changes from Christian: introduced plugin->SetDropToShell(false) to disable dropping to an aliensh shell after submitting jobs.

First version of Long Range Correlations in the Correlations DeltaEtaDeltaPhi Style (Christoph Mayer <christoph.mayer@cern.ch>)

The segmentations are made data member of the AliITSUGeomTGeo, will be loaded
at initialization. Code using independend segmentations loading is changed
to obtain it from AliITSUGeomTGeo

Thresholds initialzed at SOR

Consolidation of AliMUONTrackerHV class

Updates

Moved MC option to Helper - as common option.  TrainSetup does
not define this option, so that we only specify it once.

Execute AliAnalysis::SetDropToShell(false) in interpreter - until
patch is applied.

Renamed some member functions for more logical names

  Init            -> SetupForData
  DefineOutput    -> CreateOutputObjects
  Output          -> CreateOutputObjects
  InitializeSubs  -> SetupForData
  ScaleHistograms -> Terminate

since these better reflect when they are executed.

Output of AliForward{,MC}MultiplicityTask is split into
two - one for sums and one for Terminate results.  This
is for Grid where the output containers are not opened
read/write while parameter containers are.

Added a script that partially automatize the dN/deta
analysis on the Grid.  A similar script for CAF (or
Proof) should come soon.

-rm duplicate of cross rows variable

First version of ion tail cancellation on the cluster level
Only cluster loop implemented
(Marian)

fix output type

Adding the 2d fit for the correlation function

Macro to calculate track matching efficiency

Moving EMCAL track matching functionality to selection class.

Added missing include <algorithm> + updates for trip identification

Fixing memory leak.

Adding selection on cluster type

Moving some functionality to selection base class.

Adding construction of selection class for EMCAL. Moving the intilisation
of the PHOS selection to the init method.

Changing method names to be more intuitive

ync gsi and aliroot trunk