Root6-enabled version

Removing useless loading of libraries

Adding libGui needed by libCDB

-fix for new introduced stupid bug

Root6-enabled test

Adding using::cout and using::endl

fixed compile error

Trigger option for pp and pPB

Trigger option for pp and pPB

-sync with gsi repository

Patching NUA (Carlos)

changes in GammaConv linkers

changes in AddTask & Cutnumbers for eta

- Adding macros to run MC only (for performance tests)
- Adding macro to check particles mother-daugther relationship

Adding addTask macro for tracking uncertainty.

AddTask for higher order pid studies (Naghmeh)

Adding new tasks for tracking efficiency and its related uncertainties to the PWGPP library.

bug fix

Adding the addtask for the pid mh

update addtask macro for dptdpt correlations

PID updates from Markus Fasel.

updates from Emilia

small bug fixes and improvements.

Adding additional variables - difernt counter  of  tracks

From Andrea Dainese: protection in AliAODTrack::PropagateToDCA for usage in case of tracks which are not in the vicinity of the primary vertex.

Corrected define gueard

Changes for

#102898 Fixes for newer ROOT
HLT/TPCLib/comp/AliHLTTPCDataCompressionIDMap.h:
=====================================
Make AliIDMapEntry public since newer ROOT does not allow dictionary
generation for private sub-classes.
#102897 Fixes for newer ROOT
HLT/BASE/AliHLTComponentHandler.h:
=====================================
Make AliHLTLibHandle public - newer ROOT cannot make dictionaries for
private sub-classes.

HLT/BASE/HLTbaseLinkDef.h:
=====================================
Fix up schema evolution code for newer ROOT which does not give
privileged access to data members in the streamers.
#102893 Fixes for newer ROOT
STEER/ESDLinkDef.h:
=====================================
Fix up schema evolution code for newer ROOT which does not give
privileged access to data members in the streamers.

STEER/STEERBase/AliTRDPIDParams.h:
=====================================
Preprocessor guard for ROOT Cling transition, which does not allow
dictionary generation for private sub-classes.

STEER/STEERBaseLinkDef.h:
=====================================
Preprocessor guard for ROOT Cling transition, which does not allow
dictionary generation for private sub-classes.

EVGEN/AliGenParam.cxx:
=====================================
Preprocessor switch for newer ROOT which does not define

TF1::Integral(Double_t,Double_t,Double_t*,Double_t)

but

TF1::Integral(Double_t,Double_t,Double_t)
#102883 A patch for HLT code
HLT/BASE/AliHLTGlobalTriggerDecision.h:
=====================================
Make MarkInputObjectAsOwned public for schema evolution

HLT/BASE/AliHLTScalars.h:
=====================================
Make GetScalars public for schema evolution

HLT/trigger/AliHLTGlobalTriggerWrapper.cxx:
=====================================
Add preprocessor switches for newer ROOT that uses Cling
#102881 Patch for some code
EVGEN/AliGenEMCocktail.cxx:
=====================================
Add preprocessor switch in preparation for newer ROOT

STEER/STEERBase/AliMCEventHandler.cxx:
=====================================
In case a subsidary handler returns a null pointer for the MCEvent, do
not try to add that event to the parent event

Corrected define guard

Corrected define guard

Corrected define guard

Remove copy/paste line

Corrected define guard

Corrected EINCLUDE

Rename cons string to avoid interference with a string in EMCAL (Root6)

Rename members of enum to avoid interference with enum from AliHitMap.h (Root6)

Fix for ROOT Git transition
(according to the suggestion by  Ch. H. Christensen)

Minor mods to QA AddTask macro

Protection for conversion of AOD track to ESD track

Corrected EINCLUDE

Corrected EINCLUDE

Corrected EINCLUDE

Corrected EINCLUDE

Corrected EINCLUDE, compilation with Root6

Use pt_scheme by default

Handle calculation of the normalization factor for MSL and MSH (Diego)

Corrected EINCLUDE

Corrected EINCLUDE

Adding skeleton of a macro which extracts the sensitivity plots.

Corrected EINCLUDE

Corrected EINCLUDE, compilation with Root 6

Corrected EINCLUDE, compilation with Root6

added subevent options

Corrected EINCLUDE

Corrected EINCLUDE

Corrected EINCLUDE, compilation with Root6

W production with POWHEG

Compilation with Root6

Corrected EINCLUDE

Including STEER/STEERBase and STEER/AOD

Including CMAKE_SOURCE_DIR to be able to compile EVE dictionaries created by cling

Including STEER/ESD

Fixed compilation with Root6

Handling of root archive files changed.
https://savannah.cern.ch/bugs/?102934

Use -Wl,--as-needed also for gcc 4.8 and future versions (Dario)

Missing dollar sign

bugfix for multiplicty option in MC mode (the impact parameter range should not be set, otherwise the centrality option is used which leads to a mismatch in multiplicity cuts and event mixing container definition)

multTPC and multSPD added

cleanup

Use TArrayI

bugfix for multiplicity option (MW)

Changes to the AliFemtoCorrFctnDEtaDPhi so (dEta,dPhi) = (0,0) would be exactly in the center of the bin

K0s AddTask update (Matt Steinpreis)

fix bug from last commit - Marta V.

change of binning in PID monitor

V0A+C binning option

Qbins reduction, V0A+C binning option

Unneeded include in AliSimulation (from savannah ticket 102896, Christian)

patch from savannah 102896 (Christian), to mask the default -Wl,--as-needed with -Wl,--no-as-needed for the concerned gcc version (mainly Ubuntu 11.10 to 13.10 problem)

Updates from Marta

coverity fix

updated

Fix function name (Vardanush)

#102885: Patch for MUON code

MUON/AliMUONSt1GeometryBuilderV2.cxx:
=====================================
Add preprocessor switch to take care of GIT transition.

Christian H.

#102900: Fixes for newer ROOT

STEER/ESD/AliTriggerConfiguration.cxx:
=====================================
Remove unused inclussion of TCint.h

Christian H.

#102884: Patches for newer ROOT

EVE/EveBase/AliEveMacroExecutor.cxx:
=====================================
Add pre-processor switch for newer ROOT that uses Cling

RAW/AliRawCastorDB.cxx:
=====================================
Add pre-processer swith for new ROOT that does not have TFile::UseCache

RAW/AliRawRFIODB.cxx:
=====================================
Add pre-processer swith for new ROOT that does not have TFile::UseCache

RAW/AliRawRootdDB.cxx:
=====================================
Add pre-processer swith for new ROOT that does not have TFile::UseCache

Christian H.

#102886: Various fixes to the the code in EVE, STEER, PWGPP, cmake

ALIROOT/CMakebinaliroot.pkg:
=====================================
Add EOD marker

EVE/CMakebinalihlteve.pkg:
=====================================
Add -lVc to linker libraries

STEER/AODLinkDef.h: =====================================
Fix up schema evolution code for newer ROOT where we do not have
privileged access to data members.

STEER/STEER/AliReconstruction.cxx:
=====================================
Add preprocessor switches for ROOT git transition

STEER/STEER/AliRun.cxx:
=====================================
Remove unused TCint.h header inclussion

PWGPP/TPC/AliComparisonDraw.cxx:
=====================================
Remove unused TCint.h header inclussion

cmake/ALICE_CMake.cmake:
=====================================
Many fixes:

- Print flags passed by default by CMake
- Save the unexpanded EINCLUDE value in saveEINCLUDE for PAR generation
- Replace dots `.' in filenames with underscore `_' when generating dictionary
files, since rootcint may end up writing uncompilable code.
- Add progress reports
- If the used ROOT version is larger than ROOT6_ALPHA (5.99.1), then give
full paths to rootcint.
- Set CMAKE_EXE_LINKER_FLAGS to the value of PLDFLAGS for executables.
- Fix up sed commands when replacing `include $ROOTSYS/etc/Makefile.arch'
with `include Makefile.arch' in PAR make files.
- Use root-config to locate Makefile.arch
- Replace `EINCLUDE :=.*' with `EINCLUDE := ${saveEINCLUDE}' in PAR Makefiles

cmake/FindROOT.cmake:
=====================================
Do not require ROOTSYS to be set. We do make sure that rootcint and
root-config can be found in the PATH however.

cmake/GenerateLinkDef.sh:
=====================================
Put in guard for both _CINT_ and _CLING_

Christian H.

bug fix

coverity

Access to trigger info - Marta V.

Remove un-needed old files for alionlinemonitor

code debug flag (Ruediger)

HWClusterDecoder produces a descriptor block. It shows whether the clusters have been merged during decoding or not
The block is then read by DataCompressionComponent which sets corresponding "merged clusters" flag for the compressed clusters.

Bug fix in AddTaskPHOSPi0pPb.C. Remove redundant macro AddTaskPHOSPi0pPbv2.C.

Updates from Filip

including extra debugging message

Correction in TObjArray* AliTPythia8::ImportParticles(Option_t* /* option */)
index started at 1

Protection in case of fITune >= 0 in kPyJets

support for EGA triggers (Rachid)

Status line is created also in case of 1 entry.
Outlyer filtering is in that case not active.

Changes by Christian Holm
- Adopt for newer ROOT versions