- new definition of cluster to track residuals
- update pt plots

Error in ADCch2Phe called by Raw2SDigits method

set default back to real data with physics selection

Now the TPC clusterfinder produces a special compressed input for the CA tracker,
in order to reduce the network traffic.

changed inheritance to TaskSE

Minors

Added some new histograms, changed the BG calculation to z and multiplicity bin comparison, added new functionality to check v0s for mc info.

output of the slice tracker optimised

Protection added in the preprocessor

bsolete tracker output removed

Obsolete tracker output removed

Changed constness of the AliHLTCaloClusterDataStruct::GetTracksMatched function.

Merge branch 'trackMatcher'

* trackMatcher:
  -Tested and cleaned up
  -Added track matcher component
  Added AliHLTGlobalTrackMatcherComponent

Conflicts:
BASE/util/AliHLTCaloClusterDataStruct.h
BASE/util/AliHLTESDCaloClusterMaker.cxx
CALO/AliHLTCaloClusterAnalyser.cxx
PHOS/AliHLTPHOSGeometry.cxx

Events by default are selected.

Protections added in GetEvent method.

New task for D* efficiencies with CORRFW (Alessandro)

bug fixes

- adding EMCAL geometry class

- fixing compilation warnings

- changing format of matched tracks from TArrayI to Int_t in internal cluster struct.

- fixing bug in clusterisation
- proper handling of the data origin

- adding AliHLTEMCALDigitMakerComponent
- adding AliHLTEMCALClusterizerComponent to build system

- setting the data to be zero suppressed as default

- fixing small bug in the cluster analyser
- for now shipping local coordinates of the clusters

- fixes to the geometry classes

- adding matched tracks entry to internal calo cluster struct
- adding methods for accessing calo clusters to comply with the AliESDCaloClusters

Fixing bug of previous commit of the alignment object

changed configuration for TaskSE

Change to TaskSE

AliAnalysisManager::StartAnalysis return now a code:
   -1 = failure
   fSelector->GetStatus() when run via TSelector
   0 otherwise

Macro to create HMPID Alignment Object

Macro to find HMPID alignments based on AliAlignmentTrack Class.

Macro to find HMPID alignments with an alternative method to AliAlignmentTrack Class.

Obsolete macros. Class AliHMPIDMisaligners already implemented

Bug fix.

Alignment objects updated

Set include path to AliRoot/include before compiling par files.

raw ana t0 calc. updates

new performance plot for pt resolution @ DCA to monitor TRD performance as discussed in the PWG1
meeting from 17.02.10 in view of solving savannah 44264

add pt threshold for TRD updating Kalman as discussed in the PWG1
meeting from 17.02.10 in view of solving savannah 44264

Projection managers in detail-views were not properly initialized.

Updates in macro to monitor SDD drift speed values

Add protection for anomalous drift speed values

Fix bug in creation of SDD SDigits from raws

updated ocdb path settings and adding printouts for differences in ocdb files (A. Mastroserio)

Updates.
(M. Gheata)

header with version number 3

remove header with version number 4 ( 3 was skipped)

remove overlaping calibration file

new calibration parameters stored in AliTOFcalibPar.root

Reco Param with Latency and Vertex shift

Added protection and print in case the geoManager is called (EMCAL PHOS geometry methods) and it is not initialized.

Production file corrected in case of real data analysis

Fix for bug 62546 - when lock is on, getting an entry via AliCDBId checks whether the set run (fRun) is
inside the run range of the AliCDBId itself, not only if fRun is equal to the lower limit of
the run range. Same for the case when the cache is active.

Corrected position of the second resistor chain

kNoDecayBeauty added.

Syntax for AliDebug fixed..

Removing non-working HP for the GRP configuration for the test setup.

Avoiding generating errors due to missing non-working Data points - following discussion with Peter Chochula.

Simplifications, now that pedestal subprocessor is taking care of deciding whether or not the configuration changed

I committed changes in setting of the magnetic field
in geant4_vmc a few days ago.
While before there were hardwired the default Geant4
stepper, type of equation of motion and all tunable
parameters, user has now a possibility to change these
from a macro.
Also now the Geant4 field is created only if
user has set the field to gMC before calling gMC->Init().
In this way we avoid creating the field for applications
with no field.
This last change requires to swap the calls in AliSimulation:
  gAlice->GetMCApp()->Init();
  gMC->SetMagField(TGeoGlobalMagField::Instance()->GetField());
to:
  gMC->SetMagField(TGeoGlobalMagField::Instance()->GetField());
  gAlice->GetMCApp()->Init();

Ivana Hrivnacova <Ivana.Hrivnacova@cern.ch>

Updating dcs server for the tests, and some aliases for PMD (schema_prod), TPC, TRD, TOF (schema).

Add dielectron framework to PWG3

Adder resistor chains for guard rings, IFC

Cut on either of the SPD layers - better implemented

Fix in printing the missing DCS DPs.

Patch to decide to use or not use the mc information, only if option simulation is true

Added the inner field cage segmentation

Patch in MCUtils to avoid unnecesary print, in case the default generator PYTHIA, is not the one used to generate the data

In case of keeping the new aod branches in the standard AOD, correct the filling of the input AOD branch for the task

Bugfix

Changing once more (hopefully we get it correct this time...) the logic to trig the upload of tracker configuration) : the shuttle preprocessor is now in charge of deciding whether there was a change or not. It is the only process able to do this correctly anyway

Adding method to generate default (complete) tracker configuration OCDB entry

Adding missing object (now required to exist due to change in AliCDBStorage::Get method (in rev 38594))

Fixing bug in generating error messages, where the wrong DDL was being indicated.

(Artur)

Making AliLog true instanton (Jimmy)

Reconstruction update to fill two new short AliESDtrack variables with additional time corrections

NeuralNet updates from Paola

Ped and Gain DAs update.

MUONTRKPEDda.ccx : messages coming from event decoding  written in DA_PED log file
MUONTRKGAINda.cxx : List of the 11 runs needed to validate calib. DA (OnLine) displayed in the header source file
AliMUONTrackerIO.cxx : bug correction
READMAmchda.txt : README update of the DAs

(Jean-Luc Charvet)

updated vertex selection

bug fix

additional user-friendly functions.

Warnings removed when setting event handlers to the manager.

Bug corrected in preprocessor

VME scaler mapping corrected

If no debugging, set AliLog level to kError

disable tranformation which is not yet in the OCDB

Marian.

Xrootd verbosity switched on for AliAnalysisManager debug level >2

Calibration object updated to take into account the new mapping

final version of unit test for the AliHLTDataBuffer
- allowing buffer size bigger than default page size
- implementing the SetSize for the AliHLTDataBuffer test case

Important change in the AliHLTSystem memory handling, activating memory pager
- final corrections in memory pager
- dynamic page size according to requested size
- replacing current buffer handling with memory pager

This reduces the size of allocated memory for the default HLT chain by a factor of 10 and
avoids explosion of memory consumption for more advanced chains.

File of noisy channel map added in OCDB (new entry /HMPID/Calib/NoiseMap)

File of Masked channel map added in OCDB (new entry /HMPID/Calib/Masked)

EMD DA updated

bugfix: correcting sequence of DataBuffer cleanup in order to first release all consumers and then delete the memory

Change to prevent from uncorrect reading of pedestal data by the DAs

adding tool macro to adjust OCDB entry properties

maintenace of the extract-ddlraw macro
- new parameter added to specify max number of events
- connect to Grid if input is a remote file
- use one single publisher for all links
- skipping of CTP initialization in the HLTReconstructor in order to avoid CDB access

adding AliHLTReconstructor option 'ignore-ctp' which allows to skip the initialization of the CTP trigger string

update HLT of TRD macros (Ttheo)
- read custom parameters from CDB entry first, in order to not hard code
strings that should be read from OCDB
- use standard parameters as default