Plane Efficiency framework upgrade: possibility to create histograms with residuals, etc. (G. Bruno)

Possibility to use alien or xrd zipped files
(Marian)

Using proper file IDs in DAs

1. Adding comments to the header:
svn diff *da* | grep fileId
+fileId:   CE
+fileId:   pedestals
+fileId:   pulser

2. Using the fileID in correspondence the Preprocesor
svn diff *da* | grep FILE_ID
+#define FILE_ID "CE"
+  status=daqDA_FES_storeFile(RESULT_FILE,FILE_ID);
+#define FILE_ID "pedestals"
+   status=daqDA_FES_storeFile(RESULT_FILE,FILE_ID);
+#define FILE_ID "pulser"
+  status=daqDA_FES_storeFile(RESULT_FILE,FILE_ID);

3. Suppress error messages

Suppress error messages (Marian)

Redundant include file removal

TObject hierarcy removal

Added possibility to visualize TOF raw data with both decoder

Added possibility to visualize TOF raw data with both decoder

Updating FileId in TOF DAs

Adding an example of CDB location on alien.

An example macro for running data analysis on AOD directly

Minor fixes - Mihaela

configuration handling for solenoid B field (Gaute)

Possibility to trigger on the "bottom scintillator" (A. Dainese)

Additional protection (from v4-10-Release)

Making AliDCSValue sortable (Vladimir)

Removing hardwired scaling factors, corresponding corrections in the calibration (Chiara)

- Correction in AliAnalysisManager::PackOutput()  (M.Vala) The special files are
now written before being closed.

Compilation on win32gcc: AliGenBeamGasNew moved to THijing to avoid circular dependence

Compilation on win32gcc

Compilation on win32gcc: AliGRPPreprocessor moved to STEER to resolve circular dependence

Explicit dependences between the libraries (win32gcc)

New target: compilation on Windows with Cygwin gcc

Dont put energy to zero for overflowed samples

remove bad modules BEFORE cleaning digits

random entry in primary list removed

Additional protection (Christian)

Possibility to getthe data from zip file

Added protection against storing null objects

Filter out tag files (Marian)

Add messages - action.sh
Disable loading of libraries, not needed at GSI machines anymore - rec.C
Adding the function AliTPCjobs - AliTPCjobs.cxx
(Marian)

TPC reconstruction macro - according Marco Meoni

Temporary fix  - because of noisy pads (Marian)
Working only for low flux environment
Should also automatically take care about the data acummulated without zero suppression

  //
  // Temporary fix for data production - !!!! MARIAN
  // The noise calibration should take mean and RMS - currently the Gaussian fit used
  // In case of double peak  - the pad should be rejected
  //
  // Fix - If more than given digits over threshold - make a noise calculation
  // and pedestal substration

Adding additional sum check (Jens)

Removing error message  in SetFastCluster (Marian)

various fixes in the HLTOUT treatment

bugfixes for HOMER reader working on data buffer; minor changes in documentation

minor change, making helper methods globally available

Set validity range for EMC calibration object from 0 to infinity.

Adding rec.C for test TPC data

Marian

Making SetMaxReg() method private to avoid its mis-using
(Christian)

Add macro for pedestal calibration (Jens)

Adding new type of jobs (Marian)

bug fixed (Valerie)

Updated ldap configuration files for TOF and schema

Coding convention: GC2 violation -> suppression

AliROOT classes are at least TObject objects

Coding convention: RN17 and RS2 violations -> suppression

Coding convention: RC16 violation -> suppression

Added more functionalities on TOF data visualization via strips

Compilation warning suppression

A new bunch of Global QA histogramms

Additional protections agains empty sources and bad source files

Proton analysis for AODs - analysis train

Adding tpc offline user manual (Marian)

Adding the TPC offline manual for TPC users.

Using XNet.ReadAheadSize: 1000000

Correct detection of CDH mismatch (Cvetan, Roberto)

AOD analysis for protons - analysis train

- Implementing the possibility to histogram the raw adc values when reading
  raw data.
- General speed improvement
- Corrected a bug (using a 2DMap where a 1DMap was needed) that lead to very
  poor data reading performance.
- Added new class AliMUONSparseHisto to hold adc values in the most compact
  way possible (used later on by AliMUONTrackerData to generate TH1 histograms)
- Moved generation of calibrated data to its own class
  AliMUONTrackerCalibratedDataMaker, in order not to slow
  down the plain raw data reading (made in AliMUONTrackerRawDataMaker)
(Laurent)

added ZeroSuppressionComponent to build

work on zero suppression; added ZeroSuppressionComponent (Kennth)

check for corrupt data and invalid row/pad no (Kennth)

make clean-modules removes the temporary compilation files (Matthias)

added key substition

Bug Fix   (Yves)

added sample macros to tutorial

Plane Efficiency framework upgrade: possibility to create histograms with residuals (Guiseppe)

Adding FMD. Typo fixed

New PropagateToX method (Alex)

Bug fix (Marek)

Compatibility for modifications in other classes.

Creation of AliAlignObjParam with equivalent transformation for sensitive volumes

Adding job handler (Marian)

Adding the tools for analyzing test TPC data

Code clean up

Explicit casts to resolve ambiguity (Solaris x86)

Fix for copy/paste error

Fix for copy/paste error

Fix in the initialization (Solaris x86)

Using TMath::Log instead of log

Bug fix: provide return value

Include strings.h needed on Solaris x86

Bug fix: provide return value

Bug fix: uncomment argument that is used in the method

Utility to display the pedestal and error files from DA.

The test macro takes the timestamps as arguments

whoops

Added missing pragma's

Better error monitoring. Pedestal structure updated. Set the sigma cut from a file on the LDC. Possible to switch on single pad monitoring. Minors.

Added QA code from Hans Hjersing Dalsgaard <canute@nbi.dk>
Please bug him (Cc'ed to me) in case of problems :-)

Fixed raw reading and writing.   Problem was, that Cvetan had
put the default to read raw data with 8x32bit common data
header and the variable size RCU trailer.   However, none
of the RCU firmware that we have available to us does this,
so all raw data that we would write could not be read by
AliAltroRawStreamer!

From Cvetans comments it seems that the TPC has some
RCU firmware that does write an 8x32bit common data
header and the RCU trailers - I guess someone is not
telling us the full story here - or the TPC is in
fact using some other piece of code to read the
data with!

In any case, I implemented code in AliFMDParameters to
set and get the mode for the raw reading.   Since
AliAltroBuffer _always_ writes the newer format (CDH of
8x32bit and RCU trailer) one should leave the defaults in
AliFMDParameters when reading simulated raw data.
However, when reading raw data from the real detectors, one
need to use the old format (7x32bit CDH and no RCU trailer),
which is done by doing

   AliFMDParameters* p = AliFMDParameters::Instance();
   p->UseRcuTrailer(false);
   p->UseCompleteHeader(false);

Also implemented code in AliFMDRawReader to correctly
skip the first 19 timebins (14 before the trigger, and
5 "extra" timebins from some funny stuff in the ALTROs).
Similarly, the AliFMDRawWriter will start the data in
timebin 19 (counting from 0).

Nothing

Clean-up compile-time warnings

Clean-up compile-time warnings

Adding the mapping file - equivalent of DAQ mapping file.
(Marian)

In case of test setup use configuration data from the $DAQDA_TEST_DIR
It is done automatically (if variable defined).
Manual intervention removed (Marian)

For test purposes check the presence of the configuration data in the $DAQDA_TEST_DIR
as first
Only if not existing - get the data from DAQdb

Adding protection for corrupted data - check the pad and row number if reasonable
Disabling Altro warnings - Not working yet

(Marian)

Added classes for Kr cluster finder handling