Shuttle getters and setters for main OCDB/Reference, local OCDB/Reference, temp
and log folders moved to AliShuttleInterface

Raw2SDigits() implemented

bug fixed

Adding TestShuttle temp and log folder's getter and setter

Updated names of the environment variables (no dollar sign). Gaussian distribution in case of TPC (Raffaele)

method GetCellXY is added

method Order is removed

new definitions

Check md5sum of retrieved FXS file inside "retry loop"; clean temp folder after
run is processed.

Matrices to go from local RS of alignable volumes to Tracking Reference system (V2 system) - L. Gaudichet

Adding out-of-time ADC in digits and raw data

Adding return statement

Removed the initialiazation statement fFilename.assign(256,0)  wich is intended
to initialize the string fFilename in the
DoInit function of the AliHLTPHOSFileWriterComponent class as
it is not needed as long as the string is properly initialized in the
meber initialization list.
Also the statement fFilename.assign(256,0) is not understud by some compilers.

Bug fix: When moving from C style pointer based strings to the C++ string
class the memebr initialization list was not updated accordingly.
The member fDirectory and fFilename was initialized to zero wich
is fine for a C pointerbased string but when used to initialize a string
with the statement fDirctory(0) it is intepret as an attemt to initialize
a string object with a C character string starting at 0.
The error cuase a runtime error of aliroot, but is now fixed.

parity bit is introduced

method Ranmar is removed

carries cluster info in clustering class

Bug fix

incresed the LOG_BUFFER_SIZE from 100 to 512 bytes

examople of macro to do a correlation analysis

VertexerZ updated: no histograms for Z finding, new definition of errors

B?\008New version from Gustavo

Merged with changes from Panos

Simplified decalibration procedure, just say to the CBD where is the file

forgot to remove #include statement for file that was removed from cvs (AliHLTPHOSFileWriterDescriptorStruct.h)

Calibration data member fCalibData initialized in Init() calling to the AliEMCALLoader::CalibData() method, pedestals and gains always data recovered from CDB

New calibration data member with AliEMCALCalibData instance. Initialized in Init() calling to the AliEMCALLoader::CalibData() method, pedestals and gains always data recovered from CDB

added new files

CalibData() method returns AliEMCALCaliData instance filled with CDB calibration data

cosmetic changes

1st half supermodule was considered as a full supermodule

added copyright note

 = opreator and copy constructor made private

Coding convention & removal of some obsolete code

Added copyright notice

Abstract class to implement som functions common to all FileWriters.
The pure virtual function WriteFile must be implemnted in a derived class.

file moved to EMCAL/ShuttleInput

Reference calibration histogram file, one histogram per channel with accumulated amplitudes. This is a version for shuttle testing, moved from EMCAL/data to EMCAL/ShuttleInput

Correct the name of the storage directory from EMCAL/Calib/Gains_and_Pedestals to EMCAL/Calib/Data

HLT component to write data to files. The directory where to write the files
has to be specified as component argumet with the -directory <directory> option.
At least one data type has to be specified as component argumet with the
-datatype <datatype>. Any number of valid datatype can be specified.
Example of usage.

-componentargs "-directory /home/perthi/HLT/phos/data/  -datatype gkCellEnergyDataType  -datatype gkDDLPackedRawDataType"

The command abowe will write both celle energies and untouched raw RCU data to separate files in the
directory /home/perthi/HLT/phos/data/. Currently one file will be written per event.

Correct to agree with ALICE numbering scheme, change name of storage directory from EMCAL/Gains_and_Pedestals to EMCAL/Data

Class to write cell/crystal energies to file on a dedicated celle energies data format.

Class to write raw RCU data blocks directly to files untouched by the HLT

Class to write phos cell/crysta energies to files on a dedicated
celle energy data format.

Structure to hold header information for dat that should be written to file.

Bug fix:
1) The path to the peakfinder vector is now taken programatically from
the environment variable ALICE_ROOT, and  PF_VECTOR_DIR constant given in
AliHLTPHOSCommonDefs.h. The name of the file is constructed from the constants
 PF_DEFAULT_N_SAMPLE, PF_DEFAULT_STARTINDEX, DEFAULT_TAU,  DEFAULT_FS also
defined in ALIHLTPHOSCommonDefs.h .
The default PF vector found this way can be overiiden by the user (programtically).

2) Error messages are writen to the HLT
log file of the component rather than to stdout.

New definitions

Removing use of gAlice from reconstruction:
use AliRunLoader to get event number
(Sasha)

Removing use of gAlice from reconstruction;
the MUONSegmentation is now created via MUONSegFactory in
MUONReconstructor and passed to AliMUONEventRecoCombi and
AliMUONDetElement objects.

Reflecting DCS numbering change (Laurent)

Adding some shuttle log messages (Laurent)

Properly center primary-vertex error-box.

look for AliAnalysisSelector in ./ANALYSIS/ rather than in $ALICE_ROOT/ANALYSIS to avoid cint error

Add AliAnalysisSelector in ANALYSIS package

Fixing the call to the ctor of AliAnalysisManager

more work on coding conventions and effC++

Small change by MinJung: < instead of <=

The folder which should be used to store the guid files is added as an option to the alimdc API. In case that the option is empty, the guid files will be stored in the same folder as raw-data files.

- treating the closing of the popup window properly
- add an iterator (Next button) for DetElemId
- add more infos while drawing (pad size & motif size)
(Christian)

coding conventions

eff c++ warnings

corrected error in .include

Removing extra ; from the flow code

Updated version of the mutiplicity reconstruction with tracklets (Massimo)

changing binning
tf1 can be provided that is used as input distribution to test the method
enabling only needed branches in selector

added debug option

Minor cosmetic changes on the GUI

Implementation of DCS FXS interface. Common design of all FXS interface methods.

Implementation of DCS FXS interface. Common design of all FXS interface methods .

all code in the constructors commented out, It will be readded later
after some more testing.

Bug fix, path to peakfinder vectors was hardcoded into the code for debugging purphoses
but was not removed when the code was commited. the error message reads

AliHLTPHOSRawAnalyzerPeakFinderComponent, ERROR: could not  open PF vector file

and can be ignored unless one uses the PeakFinderComponent within the HLT framework.
The vectors can also be set with the SetAVector and SetTVector int AliHLTRawAnalyzerPeakFinder class.
The error message is commented out in the current version.

Fixes in tracking needed for new det-numbering of hits

documentation

correction in stand-alone build system (PHOS dict generation)

Bug fix (L.Gaudichet): SPD chip used instead of sensor. In the present configuration the chip is 150 um thick - it was 200 um - and the sensor is 200 um thick. This bug was seen as a bias in the reconstructed vertex position.

Updated PaintContour() method
(Christian)

Commenting out debug printing
(Christian)

New GUI class for drawing detection element segmentation
(Christian)

build system: configure checks added
- for version of AliExternalTrackParam needed by AliHLTTPCTrack conversion to ESD format
- for AliCaloRawStream.h needed by PHOS

Removing default implementation for CreateIterator();
now all segmentations have their own.

In CreateIterator(): return the AliMpSectorPadsIterator
instead of calling the base class method

Iterating over motif positions instead of rows, row segments
(this fixes a problem for non-bending plane where some pads
were iterated twice)

Adding functions for iterating over motif positions

Adding includes required by ROOT

Full set of updated misalignment macros (Raffaele)

macro for reading RAWDDL data

Removed unused variables

Corrected GetNeighbours() (Laurent)

Coding conventions

Correct initialization of optical properties needed by Geant4 (Andrei)

Adding includes required by ROOT

assert replacet with AliError (Laurent)

Removing DeadChannels and adding HV. Better protection in OnDemandXXX methods (Laurent)

Adding RAW to include path (Laurent)

Introducing HV handling and runType selection (Laurent)

Adding new classes (Laurent)

Removing DeadChannels handling, adding HV, tidying up (Laurent)

Implementing a clever Print method which allow to select which part of the store to print (Laurent)

Adding HV subprocessor and change the way we select which subprocessor must be ran (depending on runType, not the final name probably) (Laurent)

Direct the output to Log() method instead of AliInfo() (Laurent)