Fix overrun index in array, coverity rep

Coverity fixes

correct initialisation of NCP NCT

AliAnalysisTaskPhiEffMc.cxx removed from AliRoot, no longer used

corrected initialisation of NCP, NCT

Installed macros in Rsn extra library

Coverity fixes

Merge branch 'master' of http://git.cern.ch/pub/AliRoot

Coverity CID 24404,24279,24278,24277,24276,24275,24274,24272

Coverity fix

Actually, there is nothing to fix.
I access elements of arrays with length 3 in loops
going from 0 to nTypes which can be either 1 or 3.
I try to set nTypes as const, and bind the array dimension to it,
hoping that coverity is happy.

Merge branch 'hotfix'

Fix initialization bug in constructor

Frame extensions added.

Merge branch 'master' of https://git.cern.ch/reps/AliRoot

coverity fix 22457

coverity fix 21821, 23153-55

coverity fix 24381, 24378-80

coverity fix 22113

covertity fix 24465,..66

covertity fix 22275

covertity fix 24879

covertity fix 24339,..40,..42,24454

covertity fix: 24455,24456

EMCAL/DCAL Trigger Mapping for Run 2

Coverity fix

Store only final-state muons

The protection is needed when analysing vector boson POWHEG simulations

Install scripts of PWG/muondep

Uniformize macros and scripts to official productions

CAVEAT: JDL and simrun.sh are modified so that it is still possible to
pass the number of events per job as an argument.
This is however not possible in official productions, where the number of events
is proportional to the default value in sim.C

Remove run.jdl from InputFile list

Set merged output as variable Indeed, it depends on the compact mode.

Use simrun.sh and AODtrainsim.C in job submission

Do not keep galice.root in grid

Coverity fix

Coverity fixes (24641, 24642)

Coverity fixes (24723,24336)

coverity fixes

Fix for coverity 24987

Replace c-string by stl string in order to fix coverity defects

Fixing coverity defect

Fixing resource leak

Silent coverity defects

coverity fixes

jt from beomkyu, add more histograms for background study

Fix Coverity 23899

Fix Coverity 24835

coverity fixes - v2 task

Coverity fix 24735

Coverity fixes 24248 / 24249

coverity fixes

Coverity fixes

Merge branch 'master' of https://git.cern.ch/reps/AliRoot

 coverity fixes

 coverity fixes (shut up coverity after alifatal)

Coverity fixes (1)

First version of the Lc to K0sP and Xic to XiPiPi classes from AOD tracks ( Y. Watanabe )

coverity fix (default c-tor added to nested struct)

coverity fix: initialize a member in ctor

o make tune on data default

Fix for coverity defects

Coverity delete arrays

ATO-98  - connect distortion trees - with custom description ()

Include ACORDE in the geometry.

See ALIROOT-5744.

o add MC parametrisations for deuterons and triton (Stefano Trogolo)

o fix problems in ITS pid when using probabilities (combined pid) - Benjamin, Stefano

revert 3e34df56a7527519f3183d2bd02c111a2580e0ad:
- Exclude only phi in MC mode "exclude resonances" (was only for testing)

Update Dpt Dpt corr: prabhat

V0A air volume at 325cm

Merge branch 'master' of https://git.cern.ch/reps/AliRoot

Conflicts:
T0/AliT0RawReader.cxx

Coverity fix: unchecked dynamic_cast

Coverity fix: copy-paste errors

to check kBoth

Move AliPHOSCpvRawDigiProduce from PHOSrec to PHOSbase

Integrate CPV to AliReconstruction

add missing headers

skip filler after TRM trailer

Merge branch 'feature-doxygen'

doxy: converted TPC/ main dir macros

doxy: converted TPC/ main dir

doxy: recognize C functions

doxy: treat macros/classes differently

Coverity fix 24810 (goran.simatovic@cern.ch)

Fix data member streaming (A.Alici)

Bugfix in drawing macro: TH2D -> TH1D

Coverity fixes

Substitued At with FindObject +
New year's cleanup and minor fixes to plotting style

Merge branch 'feature-doxygen'

doxy: helper script for converting

doxy: consider doxygen dir

doxy: removed group definitions

doxy: no HTML collapsable sections

doxy: mark the end of comment blocks properly

doxy: changed colors

doxy: support static member declarations

doxy: interpret other special ROOT comment flags

doxy: correctly pick parsed date from regexp

doxy: extract ROOT macros for picture generation

The Begin_Macro...End_Macro blocks are finally parsed, and output macro
files are created from there. Each macro will be in a subdirectory of
current source file's directory called "docimg", and it will be named
uniquely after a digest from its content.

doxy: do not strip <H1>, <H2>...

doxy: convert <pre> to Markdown ~~~

Doxygen understands <pre> correctly (as it supports HTML), but code
blocks rendered with ~~~ are rendered with a different style.

doxy: support multiline LaTeX

doxy: support inline LaTeX