Changes concerning the cocktail simulations used for heavy flavour v2 analyses.
The update does the following things:
PYTHIA6/AliDecayerPythia.cxx:
- enable J/Psi decays into electrons and gammas
EVGEN/*:
- use well defined pT and v2 spectra parametrizations for the pions
- implement KET scaling
- implement "forced decay" of gammas

Theodor Rascanu

Updated macros for L* analysis (Neelima)

add gamma triggers

- added new task for eta -> gamma pi+ pi- analysis with conversions
- changes by Pedro Gonzales for dalitz task

set charge pico track

update JetSample

 temporarily remove conflicting code

JETAN par file: rename directory for compilation

- Added threshold for sigma systematics - Changed pT labels

add PID low cut maps

update AddTask JetMass macros

constituent selector jet finder AddTaskEmcalJetTagger

set bit for tracks in 2nd merge branch

bookkeep pt hard info when generating on-the-fly pythia events

add task to merge to track branches

fix warning

Merge branch 'master' of http://git.cern.ch/pub/AliRoot

 changed centrality selection criteria to use floats instead of integers

 temporarily removed problematic code

Andrea's code

Merge branch 'master' of https://git.cern.ch/reps/AliRoot

fix in AliTOFtracker: TOF channel map

Updated macros for Lambda* analysis (Anders)

For backward compatibility changed the method AliVTrack::GetIntegratedTimes(double *v) to GetIntegratedTimes(double *v, int n=kSPECIES) + related modifications.
All framework calls of this method go with GetIntegratedTimes(v,kSPECIESC).
See https://savannah.cern.ch/bugs/?103666#comment19 for details

fPIDForTracking can be also e or mu. Their overriding to pion happens in the
GetMassForTracking method.

Merge branch 'master' of https://git.cern.ch/reps/AliRoot

add x-section info to pythia header

update nr of variables

Fix for common output file

add track eff map
    add track pt, trigger phi histograms
    add track map to track cuts class

modified:   PWGGA/GammaConv/AliAnalysisTaskdPhi.cxx
modified:   PWGGA/GammaConv/AliAnalysisTaskdPhi.h
modified:   PWGGA/GammaConv/AliConversionTrackCuts.cxx
modified:   PWGGA/GammaConv/AliConversionTrackCuts.h

 add possiblity for multiple sources of correlated systematics

modify way of averaging over different centrality and vertex bins (number of triggers --> number of events) when calculating the correlation function.

suppressing std-ouputs

Updates for PWGLF-QA

Updates for Identified High Pt macros

Fix to return the TOF cluster index (Francesco)

Fix to return the TOF cluster index (Francesco)

Merge branch 'MyGitDevelopment'

Fix for GetTOFCalChannel: return was missing (Francesco)

Adding task for the creation of nanoAOD for Nuclei-Exotica PAG

Merge branch 'master' of https://git.cern.ch/reps/AliRoot

Adding MUON/mapping to EINCLUDE

Add using std::

Using const_cast

histo for TOF mismatch added

updates for V0Cuts and HFhelper

Adding rule to read fTOFCalChannel from old ESDs

 change file permissions, expand systematic check and example macro, all on uncompiled code

including an old fix for EMCal matrices not applied to this code

Fixes after the changes in PID

Consistent use of enums

Merge branch 'master' of https://git.cern.ch/reps/AliRoot

Adding MFT (Antonio)

ESD and AOD tracks contain a transient pointer to the event to which they belong (if not detached). Event pointer gets connected automatically if using event handlers, otherwise the user has to call event->ConnectTracks() AFTER reading the tracks branch for the current event. Individual event setters per track will be overwritten when the track will be added to some event, so their direct usage is not reccommended. To get the event pointer use AliVTrack::GetEvent. The implementation followed the discussion on http://savannah.cern.ch/bugs/?93685

restore fCopyTracks logic

Added AliPHOSClusterSelectionTask implementation

Coverity fixes

Merge branch 'master' of http://git.cern.ch/pub/AliRoot

Coverity

bugfix of Remi's dielectron task

Removing useless files

Added macro for iterative computationn of priors

fix in pragma read rules

fix in ESDtrack version to apply pragma rule reading of prob. arrays

from Rongrong

Remove spurious file

Add standalone candidate thnsparse

Adapt to framework modifications

Updates..

Added Ncharged axis to event THn (Marco Tangaro)

updated for pPb analysis

add access method to setting of the trigger rejection and other

In case of checks of the triggered cluster, reduce created histograms if bad events where removed already

in case of mixing analysis, make sure that the trigger control histograms are filled for EMCal triggered events

Merge branch 'master' of https://git.cern.ch/reps/AliRoot

added nsigma analysis

updated

Implementet AliPHOSClusterSelection.cxx and fixed header.

always clear arrays in AliJetModelBase

add mass vs eta histos

change histo axis

ana update

adding local charge conservation model and efficiency calculation from correction files

Merge branch 'master' of https://git.cern.ch/reps/AliRoot

fix: initialization of TOF clusters

Update for 3-pion radii macros.  Used for paper draft v2.

Update for plotting macros including muon corrections

correct typo

103713: Change for AliPIDCombine(AliPIDResponse)

Andrea Dubla's update

Fix for user input file

Adding extra check for GPU_FORCE_64BIT_PTR env var

Adding CUDA and OpenCL support for HLT module

To enable GPU accelerated TPC tracking set

-DHLT_CUDA=ON

or

-DHLT_OPENCL=ON

This requires CUDA toolkit or AMD APP SDK installations, resp. In the
latter case, set $AMDAPPSDKROOT to the installation path.

cleaning up HLT defines

AddTaskLambdaOverK0sJets.C was modified to run in the train including the cuts for the systematic studies

It includes the histograms to obtain the efficiency for the systematics

add more automatic tender settings

add 2012 data sets and MC flag

add more automatic tender settings

load libCDFConesPlugin in example macro

cosmetics

change def to 0.005 ghost area

Add protection against ghostArea==0

Changed rapidity binning to fit y_CMS in pPb. Removed unused variables.