adding const to function declaration

using AliCDBConnect task in test train of TRD

fix constantness definition for all compilers

remove unused data member fTimeList

bugfix

sort digits and track match updates

sort digits

Korrektion for
https://savannah.cern.ch/bugs/?func=detailitem&item_id=87177
A. Mastroserio

reducing memory consumption in mixed event mode

Updating FXS base folder for DQM FXS.

Updating database name for DQM mySQL.

e THnSparse structure to store MC residuals

event mixing as parameter

remove the destruction of the image array (this is created by the ctor)

centrality task runs over all events (before only over kMB)
pass number configurable
file event_stat.root registered with manager in add phys sel macro

Take into account SetNtestFiles() in the generated test.

defining chain 'TPC-hltout-compressionmonitor' to run the TPCDataCompressorMonitor component directly on recorded data in HLTOUT; removing all command line arguments from the TPC-compression configuration, initialize from OCDB

implementing reading of uncompressed HLT TPC raw clusters

changing default to -deflater-mode 1

Fixing typo (clang)

Bug fix (G. Luparello)

Coverity fixes

fix compilation warning suggested by Federico

bug fix - update to track cuts by Rongrong

Typo

Fixes for root trunk

Some fixes for the QA train:

- Event inspector writes run number to histogram file
- ForwardQA task does a little debugging - if enabled
- Energy fitter now produces another histogram with number
  of available, empty, low statistics, candidate, and
  actually fitted energy loss spectra
- Script to add task sets up output container in "trending.root"
- Sharing filter has more information in the output
- MC event inspector updated to fit interface
- Clean-up in ForwardAODConfig.C
- (Shell) script to get output of QA train

Some extra tests

Coverity fixes

Updating DQM FXS configuration.

Fix in ImportWrappers that changes correctly the current directory to the file pointed by the current container to be imported

Coverity fix

Creating TDC calibration objects ONLY in PHYSICS run

Coverity fix.

adding protection for negative array index

bug fix VZERO Eventplane

Fix for daqDA-<det>.exe

Changes for #87282 Request for committing to trunk + port to v5-01 (TRD PID with AODs)

make iterattion to next cluster structure better suited for decoding

Protection against missing DPs. Recently we got some runs where the RDB manager got overloaded leading to missing DPs. From now on in these case the preprocessor will fail. To be ported to the release once the nightly test is passed.

Manager debug level for the generated test in sync with the current manager setting.

Fixed return value going out of scope (Jan-Fiete)

increasing mixed event buffer

removing obsolete tasks

removing obsolete tasks

Removing obsolete tasks (see the tasks in PWG2/SPECTRA/LambdaK0PbPb/ instead)

Cosmetic changes

An example of a c*tau analysis using ESDs

update (Chiara)

moving decoding of compressed TPC data to generic class

Using both CPHI7-I and CPHI7-B in LHC11d and as default

add possibility to plot Sigma besides Mean

- correction of error message

Implementing the possibility of loading the CDB as a snapshot in two ways:
1) you suppose you have it locally, in ./OCDB. That will be the case if you untar a CDB tarball.
2) you suppose you can find in some place in alien a root file containing both a map of the
   CDB entries and a list of the corresponding Ids (for the UserInfo)

1) is triggered by using:
cdb->SetDefaultStorage("snapshot://*) where one would put instead of "*" the original alien
location from where the tarball has been built.

2) is triggered by the call:
reco->SetFromCDBSnapshot(filename)
where filename is the name of the file containing the entries map and the ids
list.

1) is implemented in AliCDBLocal and AliCDBLocalParam changes
2) is implemented in AliReconstruction and AliCDBManager changes. For 2) also
the macro macros/MakeCDBSnapshot.C is added, as an example of how to produce
the snapshot file.

Additionally two coding conventions fixed in AliCDBManager (adding const to two parameters).

TPC BB parameterization added for LHC11a data

New class added.

New class for Lambda_c studies
Annalisa.Mastroserio@cern.ch

adding configuration TPC-compression-monitoring; removing mode parameter for TPC-compression-huffman-trainer to be more flexible in the generation of the huffman table

bugfix: clean monitoring container only after it has been archived; adding option -cluster-verification to switch verification mode of TPCDataCompressor; bugfix in capacity check for cluster id data block

Fix for generating the train from AliAnalysisTaskCfg. Fix for copying local datasets (Jan-Fiete)

adding an interface to fill different types of containers from the compressed cluster data; adding monitoring histograms; adding comparision with original HW cluster data

macros to add AOD and MC handler

Corrected initialisation of
fBCID(AliVTrack::kTOFBCNA)

...also histos are now correctly booked

Corrected DA

There are two modification:
-  [2011 OCDB-OADB synchronization]: it's the port of  a OCDB modification committed the past week so that survey11 collection corresponds to the OCDB content (as
it should)
- [new collection with GetObject_by_run access]: added the  new collection  'EmcalMatrices'. It's the general collection where all the official matrices are stored:
there is an object per year (as for OCDB), the validity ranges are the same as for OCDB. So, now the sets of matrices can be obtained "by run number" (getting the
official set for that run) or   "by collection name" (still there for back-compatibility, but also to  keep some  modified alignment sets used for test  and
systematics studies)

Marco Bregant

Adding Hans Beck to the list of responsibles.

update HLT cluster reading

Changes for #87331: Combined commit MUON+HLT

AliMUONDigitCalibrator

  Simplified the ctors interface (removed a default parameter)

AliMUONReconstructor

  Propagate AliMUONDigitCalibrator interface change
  Change order of delete calls in the destructors (to avoid access dead OCDB objects in dtor of calibrator)

AliMUONTrackerDataMaker

  Propagate AliMUONDigitCalibrator interface change

AliMUON

  Propagate changes in AliMUONDigitizerV3 (e.g. pass the recoparams when creating the digitizer)

AliMUONVDigit
AliMUONRealDigit
AliMUONDigit

All digits now have the ChargeInFC method defined

AliMUONDigitizerV3

  Now uses the RecoParams to know how to decalibrate.
  Now assumes that all digits to be decalibrated have their charge in fC, as it should be...

AliMUONSDigitizerV2
AliMUONResponseV0

  Simulated charges are now in fC.

runSimulation.C
runReconstruction.C
AlirootRun_MUONtest.sh

  One more step towards removal of specific OCDB storages for simulations : take
  MUON/Calib/Gains from raw OCDB.
  Added an option "-b anchorRunNumber" to AlirootRun_MUONtest.sh in order to test realistic simulations
  (i.e. using an anchor run). Note that this option references a couple of "private" OCDB files. This is
  only an interim solution...

Config.C

  Added a parameter to know when we're doing realistic simulations, in which case we must
  instantiante the ITS to get the correct propagation of the simulated vertex to the reconstruction.

AliMUONRecoParam.cxx

  Added eventspecie to Print()

Laurent

An example of a c*tau analysis using AODs

Changes to center ZDC TDC values around 0

add PROOF for par file compilation of EMCALraw if needed

Fixes for DQM to have TRU information displayed - Francesco Blanco

Fix to avoid deleting cached CDB objects - modified fix by Peter.

Commenting unused parameters (to avoid compilation warnings).

read track model data block

introducing a variable length array of global parameters for coordinate transformations

couple of protections for calculation of slice from angle; reading of track block and calculation of trackpoints; write sign bit after the pad and time residual values (easier decoding)

couple of protections for calculation of slice from angle; reading of track block and calculation of trackpoints; write sign bit after the pad and time residual values (easier decoding)

separate function to calculate track points from local settings

Updates D* cuts for peripheral PbPb events

Move per-run histogram initialization at the beginning of UserExec().
Replace Info, Error, Warning, Fatal by AliInfo, AliError, AliWarning, AliFatal.

- Update thresholds with online values
- Improve treatment of histograms with 0 entries
- Improve box display
(Diego)

- Disentangle masks effect from trigger chamber efficiency estimation.
  The resulting efficiency can be plugged in simulations together with RAW masks:
  no more specific storages needed in anchor runs simulations.
(Diego)

libANALYSIS must now be before libSTEER ... ?

AddTaskDplus adapted to central train (Zaida, Renu)

Possibility of using an eta gap between subevents + VZERO plane updates (Robert, Giacomo)

in cells analysis, apply time calibration if it was set and not if energy calibration was set

If input already calibrated and calibration or pedestal maps not passed, the time cut was not taken into account, now cut applied first thing and before any check

Added possibility of using * wildcard in histo names to clone (Diego)

enabling track references for Momentum array (M. Estienne)

adding ReverseAlignment function, calculation of adjugate rotation; deleting implementations of copy contructor and alignment operator which have been private anyhow

Removed TObject::SetObjectStat flag settings

From Christian: Install scripts when ALICE_ROOT does not point to sources

Changes for Pb-Pb DQM QA

added protection against division by zero for pp

Protection added against files from DQM were found in the DAQ FXS, but no raw tag data files were there.

First version of an analysis code for Spectra analysis on AODs. The code was developed in Summer 2011 by 2 summer students (Philip Versteeg, UU, Redmer Bertens, UU) under the supervision of Michele Floris. It can serve as a starting point for AOD analysis.

creating the AliHLTGlobalPreprocessor from the agent

adding AliHLTGlobalPreprocessor to build