New class for deuteron generation
Eulogio Serradilla <eulogio.serradilla@ciemat.es>

updated with testbeam2010 data

Update for half chamber status (Julian)

In vmctest/production:
Updated macros to be able to run with AliRoot v4-18-Rev-22 (and 23)

Changes related to PID mode and parameters configuration (Rossella, Francesco)

fix typo

Moveing AliNeutralTrackParam to STEERBase to avoid dependence of libAOD on libESD

Fix for Savannah bug 69473

Removed HMPID from default geometry

add parameter path to the add task macros. (Markus)
(default value to $ALICE_ROOT/PWG1/TRD/macros).
Helpful when running the train on
some sample with a non-standard add macro configuration.

update of class documentation

updated class documentation

adding example macro for AliHLTOUTHandlerEsdBranch

adding example for the AliHLTOUTHandlerEsdBranch in the libAliHLTSample agent

allow merging of non-std objects which are not a collection

Adding base class of HLTOUT handler for TObjects to be merged into hltEsd.
Class can be used directly for single, streamed objects in the HLTOUT.

set of macros to create plots (Michael Knichel)

Do not skip events with EventType==0 (MC)

Fixed event counter

protect AliTRDtrackV1::GetMomentum() against missing tracklet in
PWG1/TRD usage context

pass the EMCAL transformation matrices only once and not all the vevents; remove non existing call to method in AliAnaBtag from the wagon macro

correct filling and initializaton of transformation matrices for ESD analysis (Dmitri)

remove ntuples

additional protection agains call with 0 pointers

FMD and ITS additions

In MUONTriggerChamberEfficiency.C:
- Do not destroy the efficiency histograms at exit
- Allow to store objects also on the grid
(Diego)

new analysis to part corr for electron finding and b tagging

offline calibration

Add missing newline

Fixed a segv when running with MC having several kinematics and track ref files per folder.

Added Protection and Error Message for missing Output Tree

Bug fix in the constructor. AliVTrack::XvYvZv() changed to AliVTrack::GetXYZ() (S.Gorbunov)

Bumping the version number

Do not use TH1 to calculate mean and rms, removed hard coded array size for jets: use global enum kMaxJets instead, added protection for number of jets, Limit use of dynamically allocated arrays, made histograms for background selection global to avoid event-by-event creation/deletion

Bug corrected in raw data QA

adding skeleton for a generic TTree data collection component
some details still to be implemented

Adding helper class for suppression of error message floods caused by error messages occurring rather frequently, e.g. for every event.
The class suppresses the printout after an adjustable number of occurences and prints an error summary when the instance gets out of scope.
Simple usage by predefined macro
 * if (nastyerror) {
 *   ALIHLTERRORGUARD(5, "nasty error, first occurence in event %d", event);
 * }

Update of AliAnalysisTaskChargedHadronSpectra by A.Kalweit

Bugfix: memory leak in the histogram class
Added extra cut on the qt in armateros plots
Added extra functionality to say how many events are used in bg calculations for mesons
Put back in again the code produced by Christian to account for warnings

Add option for fast jet background (AddTaskJets), adding new default packages, fixing patches for jdl and generated macros (AnalysisTrain)

Fixing coding violations

 Set Ownership to avoid mem leaking

added data members (L. Mendez)

Enable global deselection of AOD extensions

Add data members for jet background, enable filling (Leticia Mendez)

fix of some rule violations

Not-existing QA histogram call: bug fixed (F.Bellini)

Added protection agains null primary vertex pointer

- BX id filtering implemented for 7 TeV runs up to 122375
- The fraction of BX slots for the different trigger classes, needed to compute
  the residual BG after cuts, are now computed from the data (they were hardcoded
  in the previous version)

Switch to the new raw reader (Julian, Raphaelle)

Adding macros for ACORDE: sim&rec, read raw-data,esd & hits (*.C macros and AliAnalysisTask)

Deleting AcoReco.C macro

Now AliGenACORDE::SetNumberOfParticles is included

Fast simulation of vertex shift added
(Marian)

- removed the option to run over the first 500 events of the file, (committed by accident)

Use copy of GeoMatrix instead of pointer

The abj arrays with the histograms with bad channels need to be streamed

fixing coding violations

Minor changes

violations fixed

fixing warnings from FC

Fixing violations and warnings motivated by FC

LHC clock phase simulation added. Set to "0", waiting for the implementation in the reconstruction

Added step for the PID selection (Chiara Z)

adding member documentation

fixed warnings and coding conventions

Adding VZERO to the standard embedding test suite

Brand-new implementation of Raw->SDigits. One first reconstructs the signal from raw data. Then it is parametrized according to the mean signal shape. Finally, a SDigit is produced. The procedure is not exact, but it is the best one can do with the insufficient information in the raw-data stream. Anyway, it should be enough for any embedding-related exercises with vzero. The code was test with test/embedding suit of aliroot and gives no technical problems. Sim->Dig->Raw->SDigit->Dig sequence was checked by comparing the reconstructed ESD. Concering the validation of the whole embedding procedure would need some physics case where one can address the quality of the implemented procedure. All this is in discussion with Adam K.

use Terminate function for producing summary plots (Markus)

comment out query to AliTRDcalibDB which is not yet in place

code cleanup after r41831, more efficient conversion to output cluster format (Gaute)

compilation warnings fixed (r42022)

compilation warnings fixed (r42022)

reverting r42022, changes to be committed separately in order to disentangle backporting

TOT=0 check removed from TOF-T0 algorithm

CalorimeterUtils: Only if pointer with bad channels exist, access to its content
PartCorr Task: Post the TList with the parameters to the container and not its contents

new classes for TRD trending and alarm management

style modifications (Markus)

style modifications (Ionut)

Corrected memory leak

Removing some compilation warnings.

Fixing compilation error.

Bug fix (Rossella)

hits time information taken into account in the digitization

Modified to be usable on the grid, and added an initialization function (Matthieu)

Added method to set only covariance matrix

Warning removal - swaped initialization in constructor
(Marian)

Compilation warnings removal (Marian)

added a dummy object in QAref

added a dummy object in QAref

added a dummy object in QAref

added a dummy object in QAref

added a dummy object in QAref

- added configuration handler for TRAP configuration (Uwe)
  contains the parameter calculation of tracklet parameters
  as on the DCS board (e.g. deflection correction)
- bugfixes (catch unconfigured PID LUT, corrected array declaration)

Changes to use the mean vertexer DA

Use 1kHz sampling as default.

updates to produce summary plots on the grid (if our request will be approved). Markus

Correction for
 <http://savannah.cern.ch/bugs/?69400>

In AliMUONVPainter:
Fixing compiler warning introduced in previous commit.

Last fixes (hopefully) for the kParamContainer mode. Tested in "full", "terminate" and "test" modes.