avoid crash as described by https://savannah.cern.ch/bugs/?78827

Fixed a memory leak, adding publishing period option, fixing unit conversion of published values and publishing SPD vertex instead.

Removed useless function from AliMixInputEventHandler

Fixed output directory if the input collection is custom

- fill the centrality and vertexZ in the track properties THnSparse
- set ownership of output list

Preliminary work to get centrality in

coverity fix

Adding SetOwner to the output list

 Phys DA , works on DAQ tst machine

Minor fix in the ITS-TPC spectra analysis (Marek)

error message if partition number exceeds allowed range

NULL pointer protection added

- update documentation

Corrections for par file compilation (A. Shabetai)

Updated fragmentation model

fix <PH> plot

Making code secure - sprintf replaced with snprintf.

removing unused classes: 1st prototype of TPC vertexer

new non linearity function from beam test

cleaning up HAVE_NOT_ALTRORAWSTREAMV3 preprocessor define

fix saving dEdx on ESD tracks (Markus)

removing deprecated digit readers for AltroRawStream and AliAltroDecoder, TPC raw data is accessed via DigitReader32Bit and AliAltroRawStreamV3 since 33672 Jul 9 2009

removing unused components, TPC always delivers zero suppressed data

ownership

protection agains wrong centrality bin

coverity fixes (C. Zampolli)

- update aliroot and root versions

removing unused KryptonCF component

- call PostData in UserCreateOutputObjects
- include STEER libraries for compiling AliCentrality in the task

removing DigitReaderPacked and DigitReaderDecoder, all raw data processing goes via DigitReader32Bit and the AliAltroRawStreamV3

removing DigitReaderDecoder, and moving to DigitReader32Bit which can access the 40bit RCU format through the AliAltroRawStream class

PWG2rsnextra:
- used astyle to restyle all the code
- removed the useless AliRsnAnalysisPhi7TeVNoPID, since now the other phi analysis class contains the flags
  to exclude the PID, and then duplicate code is always a bad choice

AliRsnAnalysisManager:
- merged the processing methods: now there is only one with an argument used
  to tell if the analysis is done on a reconstructed sample (ESD/AOD) or a "pure" MC (using MC particles)
- moved the fill of monitor functions in the external loop in the pair processing method, instead of having it
  in another method which essentially replicated the code
- added a flag to switch on/off the possibility to store an additional histogram for each pair which counts
  how many events were really used to fill it.

AliRsnDaughter:
- introduced a new enumeration to extend the few possibilities allowed by AliPID object,
  and take into account also all possible types of candidate daughter among V0s and cascades,
  which can eventually access the PDG database to retrieve masses and charges
- renamed the methods to get the charge as a short or as a character, in order to uniformize this
  in all classes which contain such a method

AliRsnDaughterDef:
- added matching checks for each single definition (PID, type, charge)
- added matching checks for abstract particle species from PDG code
- adapt the charge methods which return short and char

AliRsnEvent:
- added a method to set a daugher using its absolute index directly
- added the possibility to get the MC multiplicity
- added the inverse of the method "ConvertAbsoluteIndex()"

AliRsnPairDef:
- propagation of the adaptments for charge methods
- propagation of the new particle type enum in AliRsnDaughter (backward compatible)

AliRsnValue:
- defined a static function to retrieve the expected target type for each computed value
  which is used in the constructors
- added some values (PID signals, MC multiplicity), which can require new support objects

Some classes are unchanged except for some comments.

Coverity fix + unused method removed.

put in default object which covers the full run range

Supressed warning when a data slot is not connected to a container

fix warnings during train running

updates in centrality dependence for DET monitoring task (Markus)

Update to adapt CF to D* case (Alessandro)

Update for PbPb (Chiara)

Changes to fast embedding and jetresponse: QA plot for delta AOD, Jet eta phi selection. PostData in UserCreateOutputObjects(), embedding of jet tracks only, flagging of tracks from deltaAOD, general clean-up (B. Bathen)

 1st draft for pass0

 1st draft for pass0

warnings fixed

warnings fixed

 the same cuts for raw and digits reconstruction

Helper function to match jets based on the track content, return maximum energy fraction for user cut (B. Bathen)

 forgotten prinout remove

correct the energy smearing function

Coverity 15168
Initialisation fixed.

Coverity 15923
Protection added.

Coverity 16125, 16126
Fixed.

Coverity 16142
Initialisation corrected

fixed a warning

Coverity 16183
V0 vs ZDC cleaning was off.

Coverity Fix 16220

fOfflineTriggerMask added to member initialization list in AliMixInputEventHandler

macros to extract SSD gains from QA train output and to update the OCDB (M. Chojnacki)

removing the digit readers for the 40bit RCU format from the component input options

removing obsolete classes, concept of event and run summary was not put into production

removing obsolete classes, concept of event and run summary was not put into production, corrected commit 47843

reverting r47843: inconsistent mix committed by accident

removing obsolete classes, concept of event and run summary was not put into production

Fixes

Fixes

Fix to skip AliESDfriends

Fix (ChiaraZ)

Coverity fix.

Coverity fixes.

Access to EMCAL Local2Master matrices via OADB
Marco Bregant <Marco.Bregant@subatech.in2p3.fr>, Magali Estienne <Magali.Estienne@subatech.in2p3.fr>

Improved Mixing Info task

Fixing Savannah 77628

coverity defects fixed

Adding monitoring on the chip level
Marek Chojnacki <Marek.Chojnacki@cern.ch>

addapt array of histograms for different SM combinations to new EMCAL SM

coverity defect, wrong initialization loop of array, too large

Coverity fix

Fix for MixInfo Histogram to show correctly values in first bin.

executable removed

Added Physiscs selection support to Event Mixing

Checking in new histograms implemented by Marcelo with coding violation fixes by Christine

Updating macros for running on the grid

Updates in the charge fluctuation task

Adding centrality to hadEt driving macro

Updates in the spectra task (Marek)

Patches by Mikolaj

Adding default cuts for 2010 ITS standalone tracks

bug fix

ALICE_INSTALL should not point to build dir

Setter for fDecay

Fix aliroot includes (Giacomo)

added for tracking

added classes for tracking

update calibration task with new histograms for new SM

new tracking for PbPb and pp (Alex)
new 1D PID (Markus)
new tail cancellation (Ionut)

Coverity fixes by Ivana (again, thanks so much!!) implemented
by Raphaelle, MinJung, Markus and Matus

Updated version needed for the new TRD tracking (Alex)

Fixing coverity warnings (Matthieu)

Fill histograms with origin of pi0 or eta in event, correct coverity warning, remove event print

added method for fine tuning of TOF in Monte Carlo simulation

Coverity