AliFatal -> AliError

Corrections for tracks which do not pass through the radiator

Corrections for tracks which do not pass through the radiator

Fix bug in cluster position

Bug fix (E. Cattaruzza)

Remove 4 internal overlaps between SPD extenders and patch panel SSD (M. Sitta)

Class for pi0 (two-photon invariant mass) analysis.
Yuri Kharlov <Yuri.Kharlov@cern.ch>, Boris Polishchuk <boris.polichtchouk@cern.ch>

Correctly the the doneBit.

Mev-adc conversion numbers are changed according to 1350V

Default High Voltages values added

Minor changes

Minor changes

MIP calculation added

MIP calculation added

new updates in MC usage inside the train

Fixes to test scripts.

Fixes for reading zero-suppressed data.   Also fixes to simulated raw
data making.  Cvetan, perhaps you want to take a look at the member
function AliFMDRawWriter::ZeroSuppress which correctly, I believe,
simulates the zero suppression circuit of the ALTRO chip.

Fix by Filimon to allow online monitoring of raw data.  Thanks Filimon

extend and fix tracklet fit procedure

Include stdint.h to declare uint8_t on SLC3

Obsolete.

Explicite loading of pythia library (> 6.2 to match with UA5 data)

Pythia 6.1 dependence removed.

Removed obsolete default chamber resolution parameters from AliMUONConstants (now parametrizable in AliMUONRecoParam) (Philippe P.)

add new calibration task

add calibration task(Raphaelle) and fix error ini steering macro (Markus)

Removed standard resetting of histograms and some info messages (Kelly)

Added protection (P. Hristov)

AliHLTTPCHistogramHandlerComponent: Added general funcionality to handle all histograms.
AliHLTTPCClusterFinder: Added some extra safety checks.
AliHLTTPCZeroSuppressionComponent: Some cleanup. Also added functionality to switch off pushing of the zerosuppressed data to the output(Needed for the active pad selection), and it no longer pushes the list of hardware addresses by default.(have to be switched on via argument)

added write expert option

removed geometry.root for raw rec

gain set to 1 for all ch

Reverted Peter's change, in order to break Windows compliation, but restore HLT compilation.

Problem in FindTemp fixed

New versions with QA shifter histograms added

Reference distributions for FMD reconstruction

Bugfix for handling DataOrigins coming from ITS detectors.
  They had been treated differently in the framework and in the analysis code.

Compilation on Windoiws/Cygwin

Adding expert QA mode (Yves)

Improved ALTRO mapping:  Now does the full conversion from

    <DDL>/<FEC>/<ALTRO>/<Channel>/<Timebin>
  ->
    FMD<detector><ring>[<sector>,<strip>]-<sample>

and the other way back. Changed all relevant code to use this conversion.
This ensures that the conversion is consistent over all the code. To do
this, I had to implement the AliFMDDigit::SetCount member function.
Not nice, but so be it.  Alternatively, AliFMDRawReader could be a friend
of AliFMDDigit - but that's not nice either.

Fixed up AliFMDPattern to display the modules correctly.

Simple scripts to run various steps.
RunSimpleChain.C will run all, some, or none of them in one go.
Note, that no steering code is used, and the hits produced are
truly fake hits.

remved the cycles from the Merging + correction in Save2OCDB

added a setter of the QA expert write flag

Dummy routine for stand-allone use of dpmjet added.

Make separate, specialized geometries for RPhi and RhoZ views.
In RPhi show borders of TPC sectors.
In RhoZ make TPC drift-volume brighter.

expert QA data are written on demand only. The cycles array has been extended to kNDET

Remove unused responseSPD and responseSSD objects from Calib

- AliITSQASPDDataMakerRec.cxx
all the SPD/ histos for Raw and RecPoints with the selection of few
of them for the QA shifter + some minor bug fixes

- AliITSQASPDDataMakerSim.cxx
similar mods as for Rec

- AliITSQASPDChecker.cxx
a few more comments in the log added by Giuseppe
+ drop of unuseful comments (one per each histo)

D. Elia

HLT mode retrieved from the OCDB and used to set SDD raw data format in simulation and reconstruction (F. Prino)

SPD Fast-OR bits decoding (H. Tydesjo)

Removed obsolete inclusion of AliITSresponse.h

SPDDead file contains:
- the 6488 pixels dead as from Construction DB
- the 8 fully dead half-staves
- a dead half-chip (half-stave 3C-3, chip 8, offline module 26)
Total of 665617 dead pixels (6.8% SPD).
There are no more simulation parameters inside it, from now.

SPDNoisy file: no noisy pixels for the moment. (D. Elia)

Modifications to eliminate the simulation parameters from
AliITSCalibrationSPD. As a consequence also AliITSresponseSPD can now be
eliminated as previuosly suggested by Francesco.
Henrik has modified the streamer in the AliITSCalibrationSPD in order to make
the code back-compatible with the old OCDB calibration files

- AliITSOnlineCalibrationSPDhandler.cxx
- AliITSOnlineCalibrationSPDhandler.h
here also some minor fixes and mods to eliminate writing of the sim params
in the OCDB files.  (D. Elia)
Obsolete methods removed from AliITSCalibrationSDD and SSD (M.M.)

Updated QA class for SDD (Melinda)

Expert/Shifter histograms

fix macro

New calibration object to store the HLT status to be used to define the SDD raw data format (F. Prino)

Expert flag adopted for some ESD QA histograms (A. Dainese)

SSD: updated segmentation class and cleanup of ClusterFinder (M. Van Leeuwen). Elimination of AliITSresponseSSD class. Use of AliITSSimuParam class (E. Fragiacomo)

misalignemt of geometry read from CDB  (G. Bruno)

Expert/shifter separation added, new raw histos added

Pedestal RMS calculation added

Checker for pp implemented

Modifications in order to allow mis-alignments in SSD (E. Cattaruzza)

Modifs to increase the speed of the SDD raw streamer (F.Prino)

New naming scheme of QA histograms (Panos)

new mev-adc conversion

putting bck all detectors

geometry for 2008 run

Protection against too high digit occupancy (>1500) is added

fix error in dEdx slice calculation for LQ method (Alex Wilk)

Adding basic checks for RecPoints and ESD. Splitting histograms into expert/shifter

Provide return value

extend the usage of the train also for measured data (Markus)

adding log line (no of dcs dps)

Updated version (Zubayer)

Now using new HP decoder.  Skip buspatches with parity errors. (Alberto, Jean-Luc C.)

Putting real capa values

Update by Sylwester

Update by Sylwester

Update by Sylwester

Update by Sylwester

Skip non existing data points w/o giving an error

 updates in the resolution task (clusters 2 tracklets residuals)

The  mirror correction moved to the AliTPCtransform (Marian)

Pseudo code to fill the AliTPCclusterParam
Gain and position correction (Marian)

Delted version

Adding pad type correction (Marian)

Adding dEdx correction for pad type  (Marian)

Modifs to speed-up the SDD raw data decoding (F. Prino)

Adding position correction to the dEdx (Marian)

Adding Position correction
on charge and on the position
(Marian)

Moving default resolution constants to HLT/MUON. Will look into using reco params down the line instead.

Adding charge and position corrections as a function of relative position to the cluster center in pad and time bin (Marian)

Use the Gain calibration form OCDB if not specified other (Marian)

Added class AliHLTITSCompressRawDataSDDComponent
 which encodes old Dataformat and encode new Dataformat in order to compress data

kine_tracks.C
-------------
Do not use AliStack::IsPhysicalPrimary() to decide whether to import a
particle and its daughters.
Instead loop over primary particles and check their status-code to be <= 1.

kine_print.C
------------
New macro - print basic information about kinematics.

Adding gain for the dEdx maesurement (Marian)

overwrite a bug fix by mistake. Sorry. Thank you Markus

fix bug showing up in debug stream in Clusters2TracksStack