removing deprecated option to query specific (sub)version of OCDB entry

automatically added data sink components are now added directly to the internal instance of configuration handler (required for bug #83123); cleanup of TObjString usage without functional change

removing deprecated option to query specific (sub)version of OCDB entry; better usage of TObjString (no functional change)

Add filling of histograms missed in previous commit

Worng indexes fixed

New config file for special AODs with loose LambdaC cuts

SDD preprocessor updated to use new procedure to recover drift speed calibration for modules whose injectors were damaged during the beam loss event (Francesco, Gian Michele)

New object for SDD drift speed calibration in modules with injectors dameged by the beam loss (Gian Michele Innocenti)

Bug fix

 Possiblilty update or not update OCDB Time Delay entry for runs taken with new DA (depend on run number)

 correct T0 calculation for old data

Generated executable scripts return now a non-zero value if jobs are killed. (M.Vala)

DA with walk correction

protect against missing centrality class

Add histograms for L1G and L1J only cluster distribution, and add cluster histograms for the maximum energy cluster per trigger class

Fixes for DA

Fixes for ALI_AMORE

AliExternalTrackParam::Rotate, AliExternalTrackParam::PropagateTo methods: added controls on return values (according to Ruben hint)

- r weighted WS added
- some corrections

Added separate flag to mark that the LocalInit phase was done + method AliAnalysisManager::RunLocalInit

lookup table

Correction of Chi2 definition
F. Prino

AddTaskPartCorr.C : Add new analysis cases, move common histograms settings to a common method. Add setting of reco utils via execution of macro ConfigureEMCALRecoUtils.C

ana.C: Prepare configuration for LHC11d analysis EMCAL data

CaloCalib macros: fix some mistakes

AliAnaParticleHadronCorrelation: Remove not necessary requests for isolated AODs, change TH1 histograms array for different pt trigger bins to TH2 with pt of trigger in x axis and now array is for pt associated bins. And cosmetics

AliAnaChargedParticles: Remove TH3D histograms, transform into TH2F, remove Vertex TH3 histogram. Do not get the charge of the track but set it when filling the AODs in the AOD and get if from there when filling the histograms. And cosmetics

AliAnaPhoton: Produce track-cluster matching correlation histograms when the track matching rejection is requested and not when also the shower shape PID is on

Reader: Delete the AliESDtrackCuts pointer when it is going to be set externally

Remove depricated function,
which suppressed ~0.3% of the clusters

New trigger processing (towards an automatic procedure) and macro optimization (Cynthia)

new TPC QA,  DCA vs pT, DeltaPhi vs pT (Weilin Yu)

Macro to fix the 'HV ramping down before EOR' problem.

Add gain fluctuations in simulation (Evi)

Added optional track length update to AliTrackerBase::PropagateTrackTo... methods,
as well as optional automatic determination of energy and length change sign.

exit actually can give error in compilation, commenting it

removed aodcentralitymaker

In order to use the new TPC dEdx information within the common pid classes the new class AliTPCdEdxInfo is moved from
ESD to STEERBase, where it should have gone in the first place. In addition a new virtual function in AliVTrack was introduced.
Jens Wiechula

Geometry initialization is added to default constructor

Do not check if the soft pion from Dstar passes the TPC quality cuts

Adding the new Pb-Pb V0 QA task to the PWG1 library. Coding conv + one compiler warning fixed.

Next version of Pb-Pb VZERO QA task + add macro (Raphael)

Adding analysis task for the centrality trigger calibration.

implementing backward compatible reading for compressed clusters recorded with v5-01-Release in the online HLT. Those clusters need a 0.5 pad shift in the unpacking. Added furthermore checks and fatal errors if multiple cluster data blocks for the same partition are present. This helps to quickly identify probelmatic combinations of HLT options in the reconstruction

Add AliEMCALRecoUtils pointer to remove bad or exotic clusters for cluster histograms, correct name of L0 trigger repeated

New default parameter for MuonQA Task for PbPb and p-p run (Cynthia)

All triggers considered for the counters and Rabs cut modification (Cynthia)

Added histogram of pt vs. mass (Giacomo)

Fixes for #88468: Request to commit and include in the new tag the changes in AMPT

If reading from the CDB snapshot was not successful, AliReconstruction does not return but continues
with the usual LoadCDB.
Adding the possibility to make the snapshot file according to environment variables
OCDB_SNAPSHOT_CREATE (set to "kTRUE") and OCDB_SNAPSHOT_FILENAME.
AliReconstruction should just exit after saving to file, but this is still to be made effective.

Avoid doing multiple copies of the same file in AliEn if migration was requested in PROOF mode

Update to simulate pA interactions with slow nucleon tracking

update to cpass0 executable scripts. current implementation taken from AliEn dir /alice/cern.ch/user/a/alidaq/bin. changes wrt. to previuos svn version in runPass0.sh -> removed limit to no. of events to be reconstructed

removing the CTPData from the HLTGlobalTrigger decision because of bug #88431 until the issue is understood; correcting TObjString usage; cleanup of documentation

2 fixes:
1. Additional check  of the pointer in the destuctor of the class
2. Small fix in the tracking part - step size and the mass
   switched.

TRD updates

Commit DEtaDPhi macro

Update Proton macro

Add AOD setter

default ExB calibration object (Raphaelle)

Move digitizer to calibrated ExB

monitoring and calibration for PbPb 2011
- extended debug version of resolution task for monitoring
  alignment/calibration/tracking
- make roads out of checkTRK
- add libCORRFW to allow the ESD task to run
- add different monitoring for Bunches (Bunch Fill and TOFBC ID)

update TRD code for PbPb 2011
- use new alignment/roads in tracking (Johannes/Dariusz/Alex)
- use new ExB/v drift calibration in reconstruction (Raphaelle/Theo/Alex)
- use chamber status in tracking and save it in ESD track (Raphaelle/Alex)
- use same/opposite sign track selection in AttachClusters (Alex)
- remove updates of tracklet reference after track update by TRD (Alex)

Fixed error when copying output files coming from PROOF analysis in GRID

- add index to array of simulated tracklets during GTU simulation (Uwe)

Modifications in the filtering task: 1) add switch for 3 prong LS candidates; 2) replace track propagation from secondary to primary vertex with re-setting of the track parameters at the primary vertex stored in a dedicarted array

Add selection on track filter mask in D meson tasks

Protection added

Update AddTaskPartCorr.C, AddTaskEMCALClusterize.C and ana.C with most recent developments, try to simplify it if possible
New macro to configure AliEMCALRecoUtils accessing AODB information for AOD/ESD analysis, called by the clusterization task

patch from Ruben to fix crash in merging

Method HasBadDaughters() to check that all ITS+TPC daughters have BIT(4) (Francesco)

Added counters for the tracklets multiplicity (Zaida)

Updated the macro after the removal of the obsolete AliAnalysisTaskAODCentralityMaker

Macro to calculate the needed HV values as a function of the required MIP signal.

activate tpc golden cut only when primaries are requested

Updating calibration constants for channels 27 (light yields+pm gains) and channels 55,61 (only light yields).

Histo ranges increased
A. Toia

Fixing bug in enum for filter bits

Changes for #88417: Request to commit/port fixes to ANALYSIS/AliFileMerger

Removed depricted histograms ... cleanup

size of mixed event buffer as parameter

AliESDEvent: Filling transient pointer in AliESDEvent::GetTrack to AliESDEvent
Update to AliESDtrackCuts: Using the transient AliESDEvent pointer in AliESDtrack instead of
changing the AcceptTrack signature.
AliESDtrack: transient pointer changed to const, cascaded changes in a few other classes

Physics Selection configuration for Pb-Pb run 2011

Two functions with extended signature (Julian)

changes in one correction step

Speed up the OCDB trending (Julian)

possibility to switch between the flat structure and the TList

(Ruben)

new offline trigger bits for 2011 PbPb run
new tokens for V0 central and semicentral trigger (Cvetan)

Changing of the name of container
Davide

macros update (taken from current AliEn production) + added SDD calibration task"

In case of reclusterizing, allow if requested to redo the track matching at the analysis level plus some cosmetics

Patch for task#23160 + bug-fix from Ruben.

primary tracks selection modified for gain calibration (A.Kalweit)

Add train macros

exclude unnecessary cuts; remove cuts on ITS clusters as those remove all data points (Per Ivar)

update of AltroChannelSelector component by Jason: added monitoring histograms, make rms threshold a float variable

mising initialisation (Alexander and Jacek)

updated configuration of GlobalHisto component

configurable histogram titles added (Hege)

update of QA macros, cleanup and formatting (Hege)

bug fix by Alexander Kalweit

initializing equipment id offset from AliDAQ

avoid compilation warning on some architectures

Macro to check the calib OCDB object.

downgrade verbosity