fixed typo, added protection against numerical instability

Added CSV format

removing redundant checks for overlapping run-ranges

add centrality dependence (Markus)

Fix for bug #75588

New task to study fake tracks in simulation: need to access the recoParam used during the reconstruction; associate reco & MC tracks either by using MC labels or by comparing the position of the clusters (default); fill counters to get the detailed statistics of good tracks, fakes, events containing fakes, ... ; fill histograms to compare the chi2, number of associated clusters, pt, DCA, ... of good tracks and fakes (Philippe P.)

mods to use mfchebKGI_sym.root in online mode (AliMagF constructor) - Annalisa

container for season time shift

Correct copy and assignment operator (Jochen Klein)

bugs #75412, fixed typo in BondPaper material definition

Prepend . to the LD_LIBRARY_PATH in all generated scripts

new T0 Calib for adjust time exactly in 0

A task can now declare the list of input branches that are requested during analysis.
The way to do this is to add in the constructor where the output slots are defined:
fBranchNames = "ESD:bre1,bre2,...,breN AOD:bra1,bra2,...,braM";
The declared branches are currently not loaded automatically, the list being only used to make sure we don't combine in a train tasks that are using the branch loading feature with others that expect the full event.
A task using this should manually request loading of needed branches during UserExec - see example below.
This commit modifies the AliPhysicsSelectionTask to use this feature, gaining a factor of 2 in speed when run standalone.
//________________________________________________________________________
AliAnalysisTaskPt::AliAnalysisTaskPt(const char *name)
  : AliAnalysisTaskSE(name), fEvent(0), fOutputList(0), fHistPt(0)
{
  // Constructor

  // Define input and output slots here
  // Input slot #0 works with a TChain
  DefineInput(0, TChain::Class());
  // Output slot #0 id reserved by the base class for AOD
  // Output slot #1 writes into a TH1 container
  DefineOutput(1, TList::Class());
  fBranchNames = "ESD:AliESDRun.,AliESDHeader.,Tracks";
}
//________________________________________________________________________
void AliAnalysisTaskPt::UserExec(Option_t *)
{
  // Main loop
  // Called for each event

  // Post output data.
  fEvent = InputEvent();
  if (!fEvent) {
    printf("ERROR: Event not available\n");
    return;
  }

  AliAnalysisManager *am = AliAnalysisManager::GetAnalysisManager();
  am->LoadBranch("AliESDHeader.");
  am->LoadBranch("AliESDRun.");

  // Track loop to fill a pT spectrum.
  am->LoadBranch("Tracks");
  Int_t ntracks = fEvent->GetNumberOfTracks();
  printf("There are %d tracks in this event\n", ntracks);
  for (Int_t iTracks = 0; iTracks < ntracks; iTracks++) {
  ...
}

update for transporting event info along the TRD train

- Remove the holes in the lists of output histograms to make the merging working with the new root version. Add a new compiled macro (MuonResolution.C) to run the task. Add the possibility to fit the residuals to extract the resolution (now the default option instead of taking the RMS). Add the possibility to select events of a given trigger class (MUON, MB, …). Add the possibility to select tracks in the geometrical acceptance (passing Rabs and eta cuts). Add mchview objects to the output file to display DE resolution and systematic shifts (Philippe P.)

new background estimates/subtractions, changed from thnsparse to TH3F (Magali)

Submit missing classes to previous release

should fix one Valgrind output comment

Fixing some more coding violations, fix in reweighting of V0s, changed GetCorrections to use TPC+ITS tracks, changed AliAnalysisHadEtReconstructed to look at TPC+ITS tracks

Clean up

fix compilation warnings

AliAnaPi0: Change most of TH3 to TH2
Change fixed Vertex histogram dimension to smaller ones
SetOwner of mixing list to FALSE in AliAnaPi0 and AliAnaOmegaToPi0Gamma
AliCaloTrackReader: Add option for analysis of filtered data with calorimeter only information
Updated analysis configuration macros

Introduce smaller AliTRDCalDCSFEEv2 object (Frederick)

Update to analysis macros

Added check of pileup in event cuts

implementing realistic reweighting of V0s, fixing some minor coding violations, adding hadronic corrections to AliAnalysisEtReconstructed, config macros, and ITS only and ITSTPC track cuts to AliAnalysisTaskTotEt, now requires newer aliroot version because it uses default cuts for 2010

new classes for tracking efficiency

evaluate tracking efficiency

TPC-ITS tracking for Pb-Pb

Implementing LTU configuration retrieval from DAQ logbook (logbook_detectors table),
to be read from the GRP preprocessor, and stored in the OCDB in /GRP/CTP/LTUConfig.
The validity of the object is [current_run, current_run], even if the entry committed
in AliRoot has infinite validity.
Only runs taken in global partitions will now be considered to fill the entry (a dummy
entry should be implemented as for the other CTP entries).

train version for AddTaskCentrality for testing

changing ranges in PlotAll

Some clean up in addTask macros, added centrality selection and event classes to service task and jet spectrum task

Added some methods for testing purpose

temporary fix to make QA analysis work for AliRoot v4-21-06-AN

covariances back as default + support plotting single event flow

Centrality selection with SPDouter clusters

uncomment setting of background 2

Correct the setting of geometry matrices from ESDs
Fill cell position histograms only when needed.
Change information print in the copy of the Event Statistics histogram

Update TPCCEda to write output file in parts (to avoid too big files produced in lead runs)

Added an information histogram on *real* number of events contributing to fill each AliRsnPair set of histograms

Setting the magnetic field - needed by the clusterfinders

Few updates to make it work again on the Grid

Changed default settings

Added writing of random cones with same R as kT fastjet background calculation

Fixed minor mem leak in the d'tor and added protection

new bining and centrality selection Jacek Otwinowski and Jochen Thaeder

add histogram with event statistics to histogram list for AOD and ESD analysis

Getting rid of warning.

New centrality files. (Alberica)

Setting centrality in the AOD header

Corrections Ch. Kleinn-Boesing

Modifications from Jochen Thaeder

Update of package classes.
Introduced a common base class for cuts and values, which allows to generalize the evaluation methods, and select the target "a posteriori".
Generalized the AliRsnValue computation with the addition of a generic cut support object which can be any TObject (this copes with the need
to have an AliRsnPair in some cuts related to the mother, and AliESDtrackCuts for multiplicity computation.
In processInfo adjusted some indentation and adapted also to PROOF.
Adapted some header comments and removed some useless methods.

Added a protection in case the raw data signal (channel) has a read out error (neg. bunchlength).

start adding centrality to PWG1/TRD wagons (Markus)

Use Pythi 8.145 as default.

New pythia8 version

Obsolete version removed.

using option '-treename HLTesdTree' for EsdCollector, adding default parameter for OCDB Uri

adding option for setting a custom tree name

adding support for custom tree names: option '-treename=name'
effective for local storage of HLT ESD files

Cleaning up, and fix filling of one step (Marta)

Backward compatibility restored.
If no RecoParameters found, use default non-linear correction.

printfs removed

Added a new base class for common objects

Adding common base class for AliAnalysisEt and AliAnalysisHadEt so we are not repeating code, added config files and options to config had code, updating alien handlers and task driver macros to include base class

Added two Get methods to get counters in histograms without drawing them (Philippe P.)

More documentation

Bug fix (Francesco)

Added method to print cuts in a table format (ChiaraZ)

Added reflection of errors about 0 in Draw method

New TPC BetheBloch param for reco with 1-pad clusters (Rossella)

Update by Zaida

1) the systematics uncertainties class: I added a TGrapAsymmErrors to plot the global asymmetric uncertainties and had to re-order the plotting again

2) the correction class :
-- the theoretical spectrum will now always be rebinned
-- the acc x eff statistical uncertainties propagation are temporarily neglected (commented out) until we will decide if we want them in

Fix compilation error (Chiara, Giacomo)

Added new candles, helper methods and histos to count candidates vs multiplicity (Giacomo)

- fix an if condition (Hege)

make positive all mc labels from tracks

Adding the first version of the charge fluctuation analysis

updates to reuse the code for azimuthal correlation studies

Fixed problems reported by alexander hansen

New method for reading input files (taking fragmented files int account)

correct the way the clusterizer is initialized, depending on event type

Minor fixes

Fixes

correct compilation warnings

Add new geometry option EMCAL_COMPLETEV1, with 10 SM for 2011 runs.
Change sampling fraction for new geometry options with name containing V1.
Change X0 for depth calculation in accordance with defined material in geometry.

New PWG library

fill trigger information in ESDs

input for unfolding is virtual cells or clusters, commit 2

input for unfolding is virtual cells or clusters

change delete of arrays per event by clear, set default geometry to FIRSTYEARV1

- Fix of warnings which are not seen with the standard MakeFile
- AltroEmulator: change of standard location for temporary (date) files

Adding afterburner class for unfolding studies at the analysis level (Olga)

Suggestion given if the output object cannot be made available in Terminate

New runs. (A. Toia)

Implementing methods to retrieve the best Cavern Pressure sensor values
(Haavard Helstrup).

Fix mismatched delete

Adding options to count false decisions also.

formation time not added to vertex position