Compilation with gcc 3.2.3 (Artur)

Improving handling of TClonesArray objects - using Clear() instead of Delete()
for data members, and making static the TClonesArray objects.

Added option to reuse list in AliESDEvent, avoid delete/new whenever possible in FMD assignment

Implemented checker subdetector splitting with subdetector offsets. Checker enabled

Additional functionality added
in order to use OFFLINE tracking in HLT
components (Jacek)

Cleanup of documentation and code.
Splitting AliHLTMUONEvent from AliHLTMUONRootifierComponent.cxx file. The AliHLTMUONEvent class was a temporary solution, but it works so well we are making it permanent.
Adding the dHLT trigger decision component that actually calculates the dHLT trigger scalars from the reconstructed tracks.
Also added the corresponding ROOT AliHLTMUONDecision object for testing.
AliHLTMUONRootifierComponent now generates the AliHLTMUONDecision from raw dHLT internal data.

Changes to remove overlaps (M. Sitta)

examples for AliRsnReaderTask usage

Code upgraded;Added reader for AOD/MC;Added AnalysisTask

Changes in code and adding task

Changes in code and adding task

Changes in code and adding task

Fixed a problem in the geometry.  The sensors where added multiple times
to the virtual module volumes.  Fixed.

printf hidden by debug flag.

fFileA->ls(); removed.

Copy arrays in assignment instead of the pointer; avoid double delete.

0. Adding correction for edge effects
1. Adding debug stream for alignment visualization
(Marian)

Do not use mean vertex constraint (Andrea)

Additional protection

tpc_clusters.C - return null pointer if tree can be obtained from run-loader.

visscan_init.C - handle null pointers returned from xyz_clusters.C.

Memory leaks

Separate task for muon tracks added. (R. Arnaldi)

documentation

Switch off the QA

Put back the optimization

From v4-12-Release: updated beam size and PHOS simulation parameters

Bug fix: adding SHLIB to SYSLIBS (C.Holm)

A side LHC magnet fields. (Chiara Oppedisano)

Better discovery of optional ROOT components (C.Holm)

No need for TGLObject.h (C.Holm)

No need for libFTGL (C.Holm)

- changed: tree->SetAlias("memUSED", "pI.fMemVirtual"); for getting report on virtual memory

Include needed header files (C.Holm)

More flexible map flag than only for high and low gain (David)

finalization of the TPCNoiseMapComponent (Kelly)

Added misalignment of ITS w.r.t. TPC (A. Dainese) - Correct casting to TString added (R. Grosso)

Bad channel treatment in SSD simulation and reconstruction (E.Fragiacomo)

- disable use of SDD correction maps in calibration objects
- set an average value of drift speed for modules with bad injectors
F. Prino

new implementation of bad channel map (E. Fragiacomo)

Additional protection

Possibility to add SDD points to cosmic muons tracks (A. Dainese)

 additional alignable volume from Tomek

TMatrixF *fLocPosM is removed as unnecessary. Memory leak is fixed.

Adding the fitting for transformation with
9 and 6 parameters (Marian)

Removed Memory leak
Instead of TObjArray TIterator use simple loop
(Marian)

Memory leak problems (TLinearFitter)- way around
Using static function TF1 instead of
TLinearFitter formalas (Marian)

Using TClonesArray::Clean instead of deleting of the
arrays (Marian)

First step to reduce the memory fragmentation
Next step - AliTPCtrackerMI

Bug fix in assignment (Marian)

AliPHOSTrackSegmentMaker, AliPHOSPID, TClonesArray of EMC and CPV
recpoints are created once per run in corresponding constructors,
instead of creating them once per event. Memory leaks of
AliPHOSEmcRecPoint, AliPHOSCpvRecPoints, AliPHOSRecParticles are
fixed.

The type of fTRDnSlices should be Int_t

CPV alignment creation corrected

Fixing part of the Coding violation
Adding comments
Adding Getters for histograms (Marian)

Removing extra line, adding EINCLUDE

Exporting AliRawReaderRoot.h

AliESDCaloCluster.cxx,.h: Removed fM11 and related getter and setter,
added fTOF and related getter and setter, increased the class def to 8
AliAODCaloCluster.cxx,.h: Added fTOF and the related getters and
setters, increased the class def  5 . Added the method
GetMomentum(TLorentzVector, Double v) like the one in ESDCaloCluster

AliAODCluster.h: Added a Getter to return fLabels array

AliAODEvent.cxx.h: Added methods to get the list of aodCaloClusters of
PHOS or EMCAL separately, as it is done in AliESDEvent.

AliEMCALReconstructor.cxx, AliPHOSReconstructor.cxx: Removed  filling
of  M11 and added filling of TOF

AliAnalysisTaskESDfilter.cxx: Added TOF and track matching information
to CaloClusters.

AliHLTPHOSESDMaker.cxx: Remove setting of fM11 (the fTOF should be added)

Gustavo

Changes in the ACORDE libraries to compile on Windows/Cygwin

doing backward compatibility correctly

hunting memory leaks

code documentation

Signal propagation delay value: changed according to a measurement result (5.13 ns/m instead of 4.35 ns/m)

Changing fitting formula (Marian)

Loop over mc and aod possible. (A. Mastroserio)

New representation of the raw TRD PID signal in ESD (Alex, Yuri)

get rid of compilation warning

using the new ESD assignment operator to merge ESDs

Massive commit to flesh out the geometry in more details.
Most of the geometry is there.  Missing - if at all relevant are only

- Cooling pipes in FMD3
- Cooling fin in FMD2

Although all volumes are there, it should be noted that the
geometry should really be checked against CAD drawings and
installation/assembly notes.  This will, however, take some
time to do, and I need some information from the relevant
parties.

What has been added to the geometry is

- Support of FMD2 - barrel, covers, and flanges.
- Support of FMD1 - both the upper and lower saucers are there.
- Digitiser cards on all half-rings.
- Cooling plates on FMD3

What has been changed in the geometry is

- Sensors are now put into an assembly together with the hybrid
  cards and the stand-offs.  This is to make it easier to have
  enough clearance for alignment, and it is, after all, more likely
  that the mounting of a module (sensor+hybrid+stand-offs) to the
  honeycomb plates is less precise than the compound itself.
- The cone of FMD3 is now made as a composite shape of a cone minus
  the openings where the cooling plates sit.
- Computations done more robust - gone are a lot of stupid fudge
  parameters.

Other changes are for the display and alignement macros and similar.

Possibility to fix some of the parameters. New method to get the number of free parameters (Andrea)

added converter for offline cluster format; added histogram handler (Kelly)

Removed dependency on the PWG0
(Jacek)

Trivial error correction

Added a getter method for the private variable fGeom

Bug fix - Teminate - as virtula function

In alignment - use the hyperplanes fit

(Marian)

Updated macro for ACORDE raw-data visualisation. We use now the ACORDE sym.names and PN entries (Matevz + Cvetan)

Correct treatment of single and multi muon information (raw->digits and digits->raw fixed)

As agreed - we will keep the timing information in the digit (for future usage), but will not fill it in the digitizer

enable keyword substitution

test and bugfixes of HLT preprocessor and HLTCompModule preprocessor (Jenny)

Detecting endianess of platform at runtime and generating warning if not on a little endian machine.

Improving output format of the program.

First step towards reading of the new RCU firmware trailer. Thanks to Luciano we now have an opportunity to decide automatically whenever we get old or new (v2) firmware format. That is why all the SetOldRCUFormat methods have been removed from RAW, TPC, FMD, PHOS, EMCAL and HLT modules.

Alignable TOF sensitive volumes: new enumeration (R.Grosso)

reducing macro to minimum AliReconstruction functionality, disable QA and TriggerESD because of crashes

using persistent ESD object in order to reduce memory consumption

Use FlowVector

Implemented Copy() function for all esd objects to allow for assignment of AliESDEvents (based on the list of objects), fixed some assignment operators

For primary tracks, when mother-particle is defined, add label and
pdg-code of the mother to the tooltip.

Code clean up (F. Prino)

Fix import of track-references. Apparently they are now stored in a
single branch, one entry per particle (not primary). Also, the way how
decay in flight is tagged has changed.

silvermy@ornl.gov - basic interface to calibration info for testbeam (CERN 2007) data

Implementation of the ACORDE reconstructor and ACORDE ESD object. The ACORDE digits should be revised, because the information they contain does not fully correspond to the raw-data contents (Mario and Cvetan)

Some cleanup, corrections to the log messages and removal of possible leaks

New constructors and print method (Mario)

Update version number in order to avoid warnings from root

For some reason the plastics copy id is either 5 or 6 (instead of 1 and 2). Temporary fix in order to fill properly the digits. Should be corrected!

Updated digitzer code (Mario)

Corrected detector name (Mario)

Create the rec-point branch even in the case of no digits. Please review and fix if needed! (Cvetan & Jouri)

Geometry should not be read from gAlice. For the moment we keep it only for backward compatibilty. Please fix! (Jouri & Cvetan)

Bug fix

Minor changes