After the initialization the TGeo geometry is exported in file (geometry.root)

Error message instead of assert

Adding decription of AlirootRun_MUONlongtest.sh script
(Christophe)

- Adding possibility to handle Jpsi  (default is Upsilon) in  efficiency
  calculations,
- Small corrections, improving variables names.
(Christophe)

- MUONefficiency.C run in compiled mode;
- Adding comments how to handle Jpsi  (default is Upsilon)
(Christophe)

Check the chambers by assert only in case of signal

Correcting a bug (found by Sasha) that was leading to a pad being  picked up twice when iterating over non-bending plane (that was a  precision problem).

Typo corrected

First implementation of calibration scheme by Jan Fiete

Do not delete the geometry, it doesn't belong to the object

Dos2Unix

Removing non-implemented method Reset. Dos2Unix

Flag interrupted track in EMSTK instead of TRACKR.

kNewTest removed.

kNewTest reomoved (sneeked in by accident)

Using only the first 6 characters of the common block name

Correction of some parameter values

Calibration class added

Data calibration header

Data calibration class

TFileInfo.h included (P.Christakoglou)

Modified ApplyDisplacements method (R.Grosso).

New TOF geometry description (V5) -G. Cara Romeo and A. De Caro

Normalized positive PID weights (conditional probabilities)

Initialization of data members

One more correction multi-event handling.

Fixing virtual destructor problem.

Removing warnibgs (M.Ivanov)

New (short) test procedure for checking MUON code

Short test script is replaced by AlirootRun_MUONtest.sh (Christophe)

Correction needed for multi-event/run.

Generates the number of buspatches and DDL's per detection element (Christian)

Add variable numbers of DSP's/buspatches and DDL (Christian)

Bug fix for some class of tracks (thanks to Raphael Tieulent) (Sacha)

Algorithm fix for some cluster topologies (Sacha)

AliDebug instead of AliInfo in BuildGeometry

Containers removed and replaced by Assemblies

Added total charge histogram, allresiduals histogram and graphs for the residuals of one track.

- particle below transport threshold is attached to mother (same id)
- Correction for py,pz of secondary.

12-dec-2005 NvE Track selection by name introduced in AliJet.

Geometry defined by TGeoModeler

Fixed some coding style violations.

Added track lenght through medum to AliFMDHit.  Also added flag
fStop for stopped tracks (IsTrackStop || IsTrackDisappeared).

Updated DrawHits, DrawXsection.
Added GetMedia.C to track where tracks corresponding to hits come
from.  Useful for background studies.  Added DrawHitsDigits, to compare
the energy loss from hits to the ADC counts from digitisation.

Updated Config.C to properly deal with TFluka.

Compiler warnings fixes.

Use of appropriate sensor depending response objects in SPD simulation

update version number

Fixes and removals

New macro for checking new misaligner class.
(Bruce)

New macro to compare/plot the Ntuple stored in MUONefficiency.root,
the result from MUONefficiency.C macro
(Christoph)

Upgraded version of MUONmassPlot_ESD.C
(Christoph)

New test script: simulation of 10000 events with standard Config.C,
resconstruction + efficiency.
(Christoph)

Updated test script AlirootRun_MUONtest.script:
- the outputs are redirected in files;
- all produced files are put in a new test_out directory

Adding a paragraph on checking overlaps.

Adding AliMUONGeometryMisAligner
(Bruce)

Updated comments about alignment.

New class for misalignment
(Bruce)

Adding data members for transformations file and svmaps file names
+ its default values and updating Read/Write methods accordingly.

In SetAlign() - adding the fileName argument
(the transformations can be read from other than default file)

Added new library libFMDutil.   This library contains utility classes that
are mainly used for FMD specific tasks, such as reading in FMD data, and so
forth.   Therefor, it's  put in a separate library to not crowd the normal
libraries and binaries with extra code.   See the file AliFMDInput.cxx
for more info.   Updated some of the scripts to use this interface.

Added some docs to some scripts.

Added script to get X-sections, energy loss, and ranges for a given
medium for a given particle type from TGeant3TGeo.

Added a script that compiles and loads other scripts :-)

Fixed some errors reported by Federico

AliITSsimulation::fDetType correctly set in case of multiple events

Update with modifs in St1V2 geometry

06-dec-2005 NvE Memberfunction GetDistance() introduced in AliTrack to determine the
                distance between a track and a certain position.

Bugfix (C.Cheshkov)

Proper Reset of TObjArray fSegmentation

Fixed a compilation warning.

Please note, that the previous commit might entail that
AliFMDGeometryBuilder and derived is moved from libFMDsim to libFMDbase,
as AliFMDGeometry depends on it.

Added the class AliFMDGeometryBuilder (and derived
AliFMDGeometryBuilderSimple) that defines the geometry.  AliFMDGeometry
uses that class.   AliFMDGeometry can also get crucial information from
a predefined class (but more needs to be extracted from the TGeoManager).
The code has been changed to reflect this.  In particular, the class
AliFMDSimulator is largely obsolete.   I've kept it for a while, as I'd
like to test what penalty  one endure from such a class.   I believe
it is negligible, but Federico thinks it's not.

The AliFMDG3Simulator and derived can essentially disappear.

Fixed some compilation warnings in AliFMDReconstructor.

warning about AddDigit(Int_t*, Int_t*) fixed as Federico asked

AliHLTTPCSpacePointData:
 new variable Bool_t fUsed  // only needed in AliHLTGUI

AliHLTTPCClusterFinder:
  set variable fUsed = KFALSE // only needed in AliHLTGUI

AliHLTTPCDisplay:
Rename and Merge of functions
Complete new arrangement in order to use the AliHLTGUI
 - 3D Geometry
   - display padrows, cluster, tracks
   - select single Tracks
   - select used / unused cluster
 - Histogram
   - display padrows
   - display pads in padrows

Adding GetNofModuleTransformers() method

Library split

New version of St2 detailed geometry with corrected overlaps
(Inra, Sanjoy, Sukalyan)

New method of Aliimulation to apply detector misalignment (R.Grosso)

Implementation of a new GetTrackPoint method (const) to add ITS space points into the alignment framework (C. Cheshkov)

Small corrections to fix compilation errors

Put GetTrackPoint as a const method (C.Cheshkov)

Adding an invalid layer ID (C.Cheshkov)

Updated for changing the way reference position is handled by AliMpSlat
class used also in trigger mapping
(Laurent)

Removed unnecessary forward declarations.

Corrected converting of DE local transformations
in the new ALIC frame (if performed).

In ReadTransformations() - added setting of global transformations to
detection elements.

Removing FillGlobalTransformations() private method
- global transformations of DEs are now filled immediately after
setting local ones.

Constructing AliMAG geometry in the same way with TGeant3, TFluka, and TGeant3TGeo

Fix warning from gcc4
(Laurent)

Fixing bug in the Kalman update of the covariance matrix (M.Ivanov)

Removing misleading protection

Protection in case of irrealistic estimation of the expected energy loss (M.Ivanov)

Making AZ cluster finder and Kalman tracking the default methods (see README how to go back to old defaults (VS clustering and Original tracking)) (Sacha)

Alignment framework (C.Cheshkov). More information is available in http://agenda.cern.ch/askArchive.php?base=agenda&categ=a057717&id=a057717s1t6/transparencies

Removing debug information

Modifications needed for the combined cluster / track finder (Sacha)

Improving cluster visualization (Sacha)

changed to c++ like include files

added first version of data buffer handler, not yet functional

added comments and documentation

Commiting before moving code from `AliFMDSimulator' to `AliFMD' (and
sub-classes), as `requested' by Federico.   The definition of materials,
and the like will move to `AliFMD' directly - cluttering up the class
even more than it is already (sigh!).    The step-management will go
in `AliFMDv1' (and relevant sub-classes).  The geometry definition will
go in the new class `AliFMDGeometryBuilder' (and sub-classes), to at least
keep that out of the `AliFMD' and to make it easier to make changes to
the geometry (via inheritance).

Federico also complains about the size of the digits.   I'm not sure that
I understand his complaint, but we'll see.

The `AliFMDG3Simulator' (and sub-classes) will disappear completely.  That
means, that the VMC _must_ support a geometry based on the ROOT `TGeo'
classes - rather than via calls to the GEANT 3.21-like member function
calls.   This commit will be tagged.

I've temporarily added the class `AliFMDAlla' which is Alla's old
implementation of the FMD geometry.   This class will disappear.

Split libraries

Reducing the max distance in the MUON arm (10km should be enough)

Additional protection

Protection in case of irrealistic estimation of the expected energy loss (M.Ivanov)

Adding fDetElemId data member and its setter/getter,
needed for the alignment procedure.
(Bruce)

Correct overloading of the methods from AliReconstructor