remove header with version number 4 ( 3 was skipped)

remove overlaping calibration file

new calibration parameters stored in AliTOFcalibPar.root

Reco Param with Latency and Vertex shift

Added protection and print in case the geoManager is called (EMCAL PHOS geometry methods) and it is not initialized.

Production file corrected in case of real data analysis

Fix for bug 62546 - when lock is on, getting an entry via AliCDBId checks whether the set run (fRun) is
inside the run range of the AliCDBId itself, not only if fRun is equal to the lower limit of
the run range. Same for the case when the cache is active.

Corrected position of the second resistor chain

kNoDecayBeauty added.

Syntax for AliDebug fixed..

Removing non-working HP for the GRP configuration for the test setup.

Avoiding generating errors due to missing non-working Data points - following discussion with Peter Chochula.

Simplifications, now that pedestal subprocessor is taking care of deciding whether or not the configuration changed

I committed changes in setting of the magnetic field
in geant4_vmc a few days ago.
While before there were hardwired the default Geant4
stepper, type of equation of motion and all tunable
parameters, user has now a possibility to change these
from a macro.
Also now the Geant4 field is created only if
user has set the field to gMC before calling gMC->Init().
In this way we avoid creating the field for applications
with no field.
This last change requires to swap the calls in AliSimulation:
  gAlice->GetMCApp()->Init();
  gMC->SetMagField(TGeoGlobalMagField::Instance()->GetField());
to:
  gMC->SetMagField(TGeoGlobalMagField::Instance()->GetField());
  gAlice->GetMCApp()->Init();

Ivana Hrivnacova <Ivana.Hrivnacova@cern.ch>

Updating dcs server for the tests, and some aliases for PMD (schema_prod), TPC, TRD, TOF (schema).

Add dielectron framework to PWG3

Adder resistor chains for guard rings, IFC

Cut on either of the SPD layers - better implemented

Fix in printing the missing DCS DPs.

Patch to decide to use or not use the mc information, only if option simulation is true

Added the inner field cage segmentation

Patch in MCUtils to avoid unnecesary print, in case the default generator PYTHIA, is not the one used to generate the data

In case of keeping the new aod branches in the standard AOD, correct the filling of the input AOD branch for the task

Bugfix

Changing once more (hopefully we get it correct this time...) the logic to trig the upload of tracker configuration) : the shuttle preprocessor is now in charge of deciding whether there was a change or not. It is the only process able to do this correctly anyway

Adding method to generate default (complete) tracker configuration OCDB entry

Adding missing object (now required to exist due to change in AliCDBStorage::Get method (in rev 38594))

Fixing bug in generating error messages, where the wrong DDL was being indicated.

(Artur)

Making AliLog true instanton (Jimmy)

Reconstruction update to fill two new short AliESDtrack variables with additional time corrections

NeuralNet updates from Paola

Ped and Gain DAs update.

MUONTRKPEDda.ccx : messages coming from event decoding  written in DA_PED log file
MUONTRKGAINda.cxx : List of the 11 runs needed to validate calib. DA (OnLine) displayed in the header source file
AliMUONTrackerIO.cxx : bug correction
READMAmchda.txt : README update of the DAs

(Jean-Luc Charvet)

updated vertex selection

bug fix

additional user-friendly functions.

Warnings removed when setting event handlers to the manager.

Bug corrected in preprocessor

VME scaler mapping corrected

If no debugging, set AliLog level to kError

disable tranformation which is not yet in the OCDB

Marian.

Xrootd verbosity switched on for AliAnalysisManager debug level >2

Calibration object updated to take into account the new mapping

final version of unit test for the AliHLTDataBuffer
- allowing buffer size bigger than default page size
- implementing the SetSize for the AliHLTDataBuffer test case

Important change in the AliHLTSystem memory handling, activating memory pager
- final corrections in memory pager
- dynamic page size according to requested size
- replacing current buffer handling with memory pager

This reduces the size of allocated memory for the default HLT chain by a factor of 10 and
avoids explosion of memory consumption for more advanced chains.

File of noisy channel map added in OCDB (new entry /HMPID/Calib/NoiseMap)

File of Masked channel map added in OCDB (new entry /HMPID/Calib/Masked)

EMD DA updated

bugfix: correcting sequence of DataBuffer cleanup in order to first release all consumers and then delete the memory

Change to prevent from uncorrect reading of pedestal data by the DAs

adding tool macro to adjust OCDB entry properties

maintenace of the extract-ddlraw macro
- new parameter added to specify max number of events
- connect to Grid if input is a remote file
- use one single publisher for all links
- skipping of CTP initialization in the HLTReconstructor in order to avoid CDB access

adding AliHLTReconstructor option 'ignore-ctp' which allows to skip the initialization of the CTP trigger string

update HLT of TRD macros (Ttheo)
- read custom parameters from CDB entry first, in order to not hard code
strings that should be read from OCDB
- use standard parameters as default

update of HLTTRDClusterFinder configuration object: unify system of the input multiplier for clusterizer and tracker and
decrease the input multiplier of the clusterizer from 7 to 4 (Theo)

unify system of the input multiplier for clusterizer and tracker and
decrease the input multiplier of the clusterizer from 7 to 4 (Theo)

clustering done above the cell threshold

pile-up is taken into account in digitization

list of input datatypes updated

Making modifications so that the full tracker, ESD maker and decision components use the new track structure.

Correct warning for initialization orders (PerformanceStrange)

software update to include time corrections during reconstruction.
time corrections added are:

- DeltaBC (from raw data)
- L0L1Latency (from raw data)
- CTPLatency (from config stored OCDB)
- TDCLatencyWindow (from config stored in OCDB)
- T0Fill (from PreProcessor measurement stored in OCDB)

added files to local OCDB for simulation

- DeltaBCOffset (set to 0)
- CTPLatency (set to 0)
- T0Fill (set to 0)

modified local OCDB Status object to include TDCLatencyWindow (set to 0)

Adding a protection for retrieving the TList in the Terminate (CheckV0 and PerformanceStrange)

Adding the possibility to include/exclude the usage of the online & offline triggers

Add function geom_its_dets() that displays the branches containing sensitive volumes.

Event stats for QA

Event stats for QA

In AliEMCALCalibData::Print increase precision of float to be printed, add simple macro to print calibration coefficients in OCDB

Copy and assignment added.

output of the slice tracker is compressed in order to minimize the network traffic

Event stats in QA

Added possiblity to run without MC info (Alessandro)

Updates (Chiara)

Refining the kRatio PID mode

reduce size of data exchange struct by omitting the virtual destructor, 40 Bytes to 24 Bytes per cluster (Theodor)

speedup Tracker by not initializing AliESDEvent completely and thus speeding up the Reset (Theodor)

changing option -emulateHLTClusters/Tracks to -emulateHLToutput (Theodor)

Bugfixes in the Calo physics histo component

set output container slot to 1

Added AliKMeansResult to dictionary

Additional two Short_t's needed for better TOF calibration (A. De Caro).

HLT is excluded from the bad channels map construction in a LED run.

New Settings

- Chosing optimal number of clusters

list of required CDB entries added to documentation

Read NTimeBins directly from digitsParam (Theo)

-Moved PHOS Physics histogram producers to HLT/global/physics
-Reimplemented to use ESD input
-Added support for EMCAL

load libANALYSISalice

hange of the interfaces.

Now the GlobalVertexer can read tracks directly from the ITS/TPC trackers and can be called before the ESDConverter

The change is backward-compatible, the vertexer can be also called after the ESDConverter, as it was before.
The GlobalVertexerHisto component can read both the ESD and the GlobalVertexer output.

The reason for this change is very low speed of the packing/unpacking the AliESDEvent object.
The GlobalVertexer speeded up in >10 times after this change.

Introduce chamber wise NTimeBins and ADCbaseline to digitsParam

Access simulation parameters in digitizers via file in OCDB, simulation parameter file creation macros and OCDB file and directory added.

dca plots - updated version

A simple script to run analysis

Error in identifying ADD ADC channels corrected

missing from last commit. Sorry

Upgrade following the 900 GeV data. A lot of extra things added - histograms etc however core components are essentially unchanged. I have also tried to fix bug number 60424 in this update

Updated version of AliAnalysisTaskPerformanceStrange from H.Ricaud

Corrections for secondaries

Fixing compilation warnings

Modifying the PMD configuration.

Added test for OCDB objects in DoInit and updated documentation (Gaute)