correcting info messages on loaded GPU library (David)

bugfixes by Theodor and Raphaelle
- suppress empty histograms if no tracks were found (fix according to the current shuttle behavior)
- print the object size and not the pointer size
- correct value of min entries for vdrift calculation

* show_scan_results.C
  New macro - build tree from scan results on individual events.

* esd_spd_tracklets.C
  From Domenico - add cuts to mark "bad" tracklets at load time.

* AliEveTrackCounter
  Store scan results by writing ESD track container and AliMultiplicity
  into scan_results.root.
  Display the results by running show_scan_results.C and then
  calling TTree::Draw() commands on the created tree.
  Probably the drawing function should also be a macro.

Consolidation of the classes used to get the calibration data stores from OCDB and ASCII files/string.

This is particularly important for AmoreMCH.
Note that AliMUONTrackerIO has been improved as well (e.g. we no longer have multiple temporary TString objects)
While doing so, two bugs were corrected :

- Bug fix : corrected the interpretation of the HV switches (important both for QA and reco)

- Bug fix : corrected the display of the config in mchview which was wrong (again, important for AmoreMCH)

Removed the obsolete AliTOFv5T0 class from the to-be-compiled classes list

Possibility to use a rec.C file outside the aliroot distribution folder. To be used as soon as we switch to aliroot RPM installation at P2. In this way one allows changes to the reco macro without touching the aliroot installtion done by DAQ. The macro location and name are defined by ONLINERECO_MACRO env. In case the env is not there, the standard rec.C from MONITOR is used.

Completing the fix

Modifying status when pp goes in time out during DCS DPs retrieval.

Warnings

Adapting to CORRFW changes (Chiara)

Technical fix for #58138: VZERO breaks in AliVZEROTrending::~AliVZEROTrending()

Typo

Adding other par files

I have added Chic_1 and Chic_2 production in the muon cocktail.
Philippe Crochet <crochet@clermont.in2p3.fr>

Storing the analysis output histograms in folders of a common output (Roberta)

Improved algorithm for the extrapolation of the tracks in AliCheckMuonDetEltResponse. Adding efficiency computation per detection element. Adding special setting conditions for a cosmic runs. Adding histograms of Tracks detected and total as output of AliAnalysisTaskMuonTrackingEff (Matthieu)

quality check for the maximum Pt error removed. The Pt error depends on the magnetic field value and doesn't show the error of the reconstructed curvature.

Obsolete data files deleted.

match changes CORRFW

quick fix for bug https://savannah.cern.ch/bugs/?58247, futher
investigation ongoing

correcting compilation problem introduced in r36407
some functionality has to be conditional, depending on availability of FASTJET

Adding the drift velocity monitoring
Marian.

made the saving of the Corr TNtuples more robusr: Source of Seg. Fault

removed virtual from Run Method

new method to retrieve the QAbit set. Requested by AMORE.

Closing a file cause the unwanted delete of the Corr TNtuple. Changed the open/close/write of the QA result

Adapting to CORRFW changes (Markus)

Bug fixed.

Corrected ctor call.

detailed analysis of pad rows sets of clusters attached to tracklets
  - gapped rows
  - three pad rows
better handling of multiple clusters per time bin
better debug streaming and verbosity

1. Bug fix - double deletion, crash only in some fraction of cases
           - identified by valgrind
2. Adding goofie values filtering - not yet used in the reco.

(Marian)

* Added fast interface to fastjet
* Added more flexibility in the cone finder
* cleaned up code
* Added AnalysisTasks and test macros

In test:
Including HLT in the standard test (runSimulation.C, runReconstruction.C).
(Artur)

New Trigger object

New Calib object

Fix a bug at the prepocessor level for the calibration on HLT when there are absolutely no tracks

Compilation error fixed

Compilation error fixed

Time-related parameters needed in reconstruction moved from Trigger to Calib

setting the name for non-std file

The HLT ITS tracker has been reworked.

- A bug fixed in the track update procedure, now the resolutions are fine.

- A lot of optimisation: the tracker speed on pp events (with all the layers in) is now 1124 Hz

- Performance was verified by runing the tracker on HLT TPC tracks and off-line ITS clusters (since the off-line clusters contain mc info).
  The efficiency is 98%, pulls and resolutions are fine.

bugfix: removing not implemented function

New parameterisations for the generation of
HF hadrons and quarkonia states in p-p at 7 TeV, in p-Pb and
Pb-p at 8.8 TeV and in Pb-Pb at 3.94 TeV
Smbat Grigoryan

Background subraction disabled since not correct. (Elena Bruna)

Added branch with RespSDD OCDB path

pbar -> p

Fix due to change of method name in CORRFW

Read first entry of each tree to avoid crash.

New branches with run number and OCDB file ITS/Align/Data in spTree

Added missing forward declarations

changed way of setting event info in AliCFManager and cuts in order to reduce
log messages

Time spectrum for cosmic data: increased range to fit the used matching window, i.e. 2 microSeconds (G.Scioli request)

Obsolete code removed.

Move to the CommoonFileName output

track alpha angle normalized to [-Pi,+Pi]

checking if the QA data object inherits from TH1 rather than isA during Checking

Obsolete code removed.

Changing the name of the outputfile for the common output folders

Unregistering CINT callback in destructor for proper cleanup.

- data member was shadowed (fTree)
- avoiding crash in ReadFromTree when tree has been cleaned.

Move ITS-related tasks  to ITS dir

Move macro to ITS dir

protection for string length in container name

correct handling of status word (unset before set) and conversion form int to EventSpecie_t

Fixing problem with CINT callback routine.

small corrections

Correction coding violations from FC

LTM data payload change from 33 to 48 words propagated into decoder + coding conventions

LTM data payload change from 33 to 48 words propagated into decoder + coding conventions

Fixes given by Lizardo to include FEE boxes in V0A geometry

* esd_spd_tracklets
  Prepare hooks for Domenico.

* AliEveTracklet
  Add tracklet index to ctor args.

* AliEveTrack
  Add convenience functions GetESD/AODTrack().

* AliEveTrackCounter
  Use track/tracklet label for storing before/after scan status.

correcting compilation errors
some functions and members have been declared duplicated, probably to a malfunction of gid

correct wrong test in InitRaws

- protect against bug from stand alone tracker which reports tracklets
crossing pad row but no clusters attached to the second row defined
- add debug verbosity

Fix over the QA Histogram in AliACORDEQADataMaker::MakeRaws

- fixing compilation errors
- file included two times in build system

- adding the new histogram producer classes to the component

- fixing compilation errors

- changing the digit format to now come as a linked list instead of an array
  - will slow down digit maker, but give a significant speed up of the clusterizer at high multiplicities
  - also need to always ship the full list of digits, even after clusterisation, but
    this is anyway needed if one is to provide AliESDCaloCells in the ESDs
- now sorting the digits

Renaming histo production classes to introduce order,
added Cell histo class

Cosmetic updates

Updated documentation

-Added fTracksMatched array member in AliHLTCaloClusterDataStruct.h
-Modified AliHLTGlobalTrackMatcher to fill in this array.

Adding couple of histograms classes

- fixing compilation errors/warnings
- changing from AliCaloRawStream to AliAltroRawStream, causing a speed up of a factor ~100
- small bug fixes

Fleshed out the functionality of the class

- adding checking of sanity to raw analyzer

- starting implementing ocdb access

Moved AliHLTPHOSConstant.h back to original name AliHLTPHOSConstants.h
Changed by mistake in earlier commit.

Added the most important Calo files, changed dependent files. Compiles. Calo library loads fine

- fixing bug in digitmaker
- option to push raw data in raw analyzer
- protection in clusterizer

- fixing typo

- fixing compilation errors

- adding digit reader to build system

- adding digit readers to assist with the linked list of digits

- changing the digit format to now come as a linked list instead of an array
  - will slow down digit maker, but give a significant speed up of the clusterizer at high multiplicities
  - also need to always ship the full list of digits, even after clusterisation, but
    this is anyway needed if one is to provide AliESDCaloCells in the ESDs
- now sorting the digits

Renaming histo production classes to introduce order,
added Cell histo class

Cosmetic updates

Updated documentation

-Added fTracksMatched array member in AliHLTCaloClusterDataStruct.h
-Modified AliHLTGlobalTrackMatcher to fill in this array.