Josh, Irakli, David: AliCaloCalibSignal update - replacing possible 10k+ TProfiles and TGraphs with 2 TTrees

Fixed memory leak in case of no V0 filter

Remove overlaps from detailed check

Adding particles to PDG DataBase in c'tor so we always have it when reading kinematics

Taking advantage of new overlap check funtionality of TGeoPhysicalNode::Align

Using recently commit fixes in cdb manager in order to properly load cdb entries on the proof slaves. Some new sys-log stamps added.

Possibility to instantiate CDB manager from prefetched cache. It is used on the proof slaves in order to use CDB entries loaded on the client side and send via the proof input list.

Added cast to Color_t - needed by GCC 4.3

Added cast to Color_t - needed by GCC 4.3

Add FMD

Fix for proper color type (Color_t cast)

Some fixes

 The line

   if (edep<=0) continue;

in AliFMDBaseDigitizer::DigitizeHits was introduced - wrongly - by
Peter Hristov.  It _will_ break the digitisation and the following
reconstruction.

The behviour of the digitisation models exactly the front-end as it
should (no matter what memory consumption it may entail).  The check
should be on zero suppression, since that's what models the front-end -
if zero suppression is turned on in the front-end, then we can suppress
empty digits - otherwise we shoud never do that.  Note, that the line
affects _both_ normal digitisation and digitisation for summable digits,
since the condition is on the energy deposition and not on the actual
number of counts.  If this line should go anywhere, it should be in
the possible overloaded AliFMDSDigitizer::AddDigit - not here.

Perhaps this change should be propogated to the release ASAP?

Adding the Time0 calibration from TPC

Results obtained using CE analysis

(Marian)

implemented copy constructor

Prototype for visualization-macro manager and gui.
See new macro anyscan_init.C.

Fix some cluster macros to use VizDB.

Do not consider TPCOnlyTracks from events with default (from CreateStdContent) TPC vertex in esd

Moving to the AliCFContainer classes as input containers for protons and antiprotons

Corrected zero-misalignment CDB entry. The old one had repetitions of the same alignobj several times. To be checked by the experts.

Update of pad status calculation (pad capacity dep. of noise, bridged pads)

Bug fix (Marian)

Macro to combine and fit input gain calibration
to the final one.

Adding macro to analyze the CE calibration data
Several fit models implemented
Results possible to visualize
(Marian)

Adding directory with calibration macros
(Marian)

Misalignment of the PHOS module #2 based on survey measurements.

New version that uses the DAQ libs for monitoring. Inspired by T0/TOF

New version to use the AliRawReaderDateOnline for monitoring

New monitoring DA versions

New monitoring DA versions

New version to comply with AMORE requirements

Different misalignment errors for Y and Z and for the 6 layers (A. Dainese)

Replacing very old (and deprecated) class with first version of a HLT trigger base class.

Consider nuclei as stable particles, add them to pdg table as well (only d,t 3He, and 4He)

Updated class for SSD survey (Panos)

Allow for make STEERBase-test, need to include ALICE_ROOT/include path

Updates.

Making changes so this macro works better in the ACR.

differentiate status that is set upon timeout (Chiara)

some protection

Inherit from TNamed

Protection for a sqrt in the DA for SDD PULSER (F. Prino)

added merging for QA

new ALIRECO.par target for creating the reconstruction par file. Uses loadlibsrec.C macro in order to load the aliroot reconstruction libraries assuming that aliroot is installed on the proof clulster.

Removing delete which for some reason causes a double call to free().

Applying option to not reset the histograms after being published in AliHLTMUONRawDataHistoComponent.
Also adding an quick and dirty version of a monitoring script to display the output of the histogramming components online.

stopped a loop in merging of QA Results

setting the alien environment

Example for mixing analysis.

Obsolete

correct call to QADataMakerSteer ctor

introduce getter for PID quality

Bug fix (F. Prino)

set proper OCD location

set proper OCD location

fix clash with status bits reserved by ROOT

fix a clash with the status bits reserved by ROOT

SDD injector analysis updated for operation at 20 MHz (F. Prino)

new lines

Fixing buffer size requirements and reseting histograms after publishing them.

Make the histograms memory resident, otherwise they belong to a wrong file and we have segm. violation in the destructor

fixes for memory leak in AliTRDtrackV1::Clone()
-iThis line, and those below, will be ignored--

M    AliTRDseedV1.h
M    AliTRDseedV1.cxx
M    AliTRDtrackV1.cxx

added some print methods and q vector for higher harmonics

Take out print statements

Add resolution class

Make the histograms memory resident, otherwise they belong to a wrong file and we have segm. violation in the destructor

Fix memory leak

a few fixes for rare bugs/malfunctions
- AliHLTProcessor/AliHLTDataSource: setting the output size to zero by default
  if the high level component interface is used. This handles the case of a component
  using the high level interface, but not publishing an output block for a particular
  event -> PubSub relies on output size zero if no data has been written
- toolbox publisher components handle output size correctly
- AliHLTTask: increase headroom in the output buffer to allow small extra data blocks
  from the base class
- HLTOUT handler for kAliHLTDataTypeComponentTable added
- TPCEsdWriterComponent handles output size correctly for SOR/EOR events

AOD replication (Roberta Arnaldi, AM)

Additional flags for AOD replication (Roberta Arnaldi, AM)

Minor bug fix in return value from GetOutputDataTypes.

Enabling the QA

New database entry with correct ID

COORFW->CORRFW typo

updated for the new recoParam representation

Adding functionality so that AliHLTMUONRawDataHistoComponent histograms raw data decoder error codes and signals.

Minor fix for the proton analysis QA

Updated version (Mikolaj)

Updates for correct use of cut flag. (D. Perrino)

allow PushBack with empty buffer, this is useful to just insert a block discriptor without payload; optional component description data block send with component output on SOR/EOR

handling of multiple forwarded data blocks; some code documentation

FileWriters: handling of control events and PRIV data blocks: ignored by default, added options -write-all-events, -write-all-blocks and -write-all to override default

Adding first version of histogramming component for raw data. This will be useful for monitoring.

Using std::vector instead of simply vector

Change in the calculation of track parameters for chambers w/o clusters

Updated pedestals to avoid warnings

propagate modifications to the recoParams

Update of macros

added function returning number in truncated gaussian (user passes mean, sigma and half-window)

Update of cdb->SetDefaultStorage (E.Cuautle)

Reading properly the corrections' container

Proper handling of the chain entries, hopefully this time it is correct.

Make use of new method AliRawReader::GetNumberOfEvents() - goinf to the last event and event-cycling is now supported also when raw-data is the only source (for AliRawReaderRoot/Chain).

Entry with updated list of triggered detectors, number of detectors, LHCperiod

rearranged initialization of data type variables in order to compile on Solaris

New IsRawReaderValid() method which returns false in case the raw-data file, chain etc. was not found or is invalid. AliRawReader::Create() uses this new method in order to return NULL in case of invalid raw-data input.

test load of library depending on availability of module

Last modifications on option parsing

Fix problem with analysis of SDD data at 20 MHz (F. Prino)

Added few basic QA-plots on SPD tracklets (D. Elia)

Bug fix to SSD AMORE interface (Panos)