Fix issue with THnSparse derived types in header file; use base class pointer

Modification for pythia hard bin input

Adding Pythia6. Make the Packages selection simpler (as alien can find the root and geant3 versions given an aliroot one) (Laurent)

Update from debojit

Task and library for jet test in ESE spectra analysis (M Tangaro)

This new tasks builts the jet spectra using the standard PWG-JE
machinery in events with high and low q. This is used to evaluate
possible biases from hard processes in the computation of the Q
vector.  It is built as a separate lib because it depends on the Jet
libraries (building it in libPWGspectra would have introduced a
dependency on the latter).

Added possibility to plot fit results from Becattini et al and few more plots

Added some plots

Updated filtering train macro. Added revertexing option and related cuts (Mihaela Gheata)

corre t trearment of multiplicity trigger signals

added streamer fix for header pointers and switch for define IO in constructor

fix to implementation of jet method for hadronic correction

added snippets to save histos in header

fixed event setter, put switch in for PID sparse for ALL/minimal fill

Removing printout (Davide)

Removing printout (Davide)

move condition of no clusters in event from fatal to return, add setter for minimum cluster energy for invariant mass calculation

change most axis labels of histograms to italics

dont call revertexing routine if it is not explicitly requested

move initializations depending on calo to beguining on main exec method, add histograms to check the energy distribution in the calorimeter, fix recalculation of shower shape for different weights

increase cluster energy cut for inv mass histo to 0.5, remove call to method averaging time of cluster and move it to needed places, remove switch on simple TH1 histograms, plus cosmetics

Correct LG time for LHC13bcdef

New starttime timestamp: Sun, 04 May 2014 20:00:00

Map for LHC12d updated (Satoshi)

Get Extra Tracks from Embedding

Small update from Rongrong

Distinguish seed creation for backpropagation from refitInward. In former case alsways use external seed from ESDtrack (after dedicated chi2 check)

Added separate chi2 cut for ITS/TPC matching

updated

Jet task updated in readme for QA AOD plot macro's

Updates: DptDpt MC

A better parameterization for the cooked matrix

Adding DEtaDPhi correlation functions with corrections in AliFemto

Weight added for MC

Initialization of magnetic field fixed

chi2 comparison and debug output block was repeated twice in FollowBackPropagation

add a protection and a warning against running with bash version < 4

PWGPP-53 fix run data extraction during the period level QA by reusing the
original input file path

Adding base classes for zmq networking and modificiations to event server

making histogram range consistent for all raw historams

Merge branch 'master' of https://git.cern.ch/reps/AliRoot
merge with central repository
anging user names ?

Fix for raw ctp decoding (Marek)

fixing clang issues

increasing output buffer size in AliHLTTPCCATrackerComponent

empty block generation in AliHLTTPCHWClusterDecoder

needed for testing

Adding warning if no data header was found in HLTRawReaderPublisher

consolidate zero-length arrays (aka struct hack)

HLT uses a lot of structs with zero-length arrays, using #ifdef for
platforms not supporting those (setting array_t array[1] instead of
array[0]). These ifdef were inconsistent. Sometimes also array[] instead
of array[0] was used. Moreover, for some structs clang was excluded
(defined(__clang__)), which lead to inconsistencies when calculating sizes
with sizeof() and ultimately runtime errors (output buffer too small in
TPC cluster transformation component). This patch tries to make all
zero-length array structs consistent and removes exceptions for clang.

Whether or not the __SUNPRO et al. defines are still needed is unclear,
maybe they can be removed in the future.

updated for conversion study

Weights for MC simulations added

update comments

Add pt weights for lhc12a12, lhc12a12bis, lhc13e2fix

Switch to AliCaloPhotons

Correct Nch weight getter for pp

Updated comments

Adding EMCAL to EINCLUDE

Merge with TRDdev.2.0

MC calibration updated for LHC13b2, LHC13e7

Removing returns that were use for debug purposes

ATO-17 Removing compilation warnings (copy constructor)

ATO-17
Optional usage of debug streamer  configured

ATO-17 Adding dummy function:  AliTPCDigitizer::DigitizeWithTailAndCrossTalk
First implementation - copy paste from current implementation +
adding extended pseudo code

Create TRD streamers in recreate mode (to avoid crashes in case of reopen)

ATO-37 - for OCDb entries which can not be retrieved (wahtever reason)
         size and MD5(hash) sum is reset to default -1 0

ATO-37 -  STEER/CDB/AliOCDBtoolkit.cxx - Use consistently SetSpecificStorage
AliCDBId.h - vertual function GetName implemented
AliOCDBtoolkit.cxx

ATO-37 -  STEER/CDB/AliOCDBtoolkit.cx  - catch exception in case not valid OCDB entries for OCDB dump
          PWGPP/CalibMacros/AliOCDBtoolkit.sh enable core dumps by default

PWGPP-1 - Applying chi2 cut between the TPC/TRD track matching

PWGPP-55, ATO-36, ATO-35  Process ITS standalone tracks find match with chi2 closest TPC(or combined tracks) tracks
Adding print in AliLog in case of enabled core dumps

PWGPP-4 ATO-35 - optional enablig of core dumps in case envirnment variables ALIROOT_FORCE_COREDUMP set

Modifications from Alexandru

ATO-17 ATO-34  Adding switch to use crosstalk in the reconstruction/simulation

ATO-17 ATO-34 Modification of code before implementing of Ion tail and Crosstalk
Adding pseudo code to implement
Change of the nmae of local variale, making code more readable.
sec,row ->sector,padRow
nrows,ncols ->nTimeBins,nPads
rows,col    ->iTimeBin,iPad

ATO-15 STEER/CDB/AliOCDBtoolkit.{h,cxx} - implementing LoadOCDB functions +  reordering functions
       STEER/CDB/AliCDBManager.{h.cxx}  AliCDBManager::DumpToSnapshotFile -
        a.) always dump also simple list
        b.) Do not exit after MakeSnapshot
        c.) Optionaly catch mising entry exception in the AliCDBManage::Get

Adding cut value for the TPC/TRD chi2 cut for the RefitInward

PWGPP-4  Functionality to make a program snapshot -core file
  //   gcore - Generate a core file for a running process
  //   gcore dmake a current snapshot, program can continue further
  //   We assum that gcore is installed
  //   for details see:  man gcore
  // Example use - make default core file for current process:  AliLog::MakeCoreDump(0)
  // Automatic core dump creation in case of the AliFatal can be specified using
  // static void  EnableCoreDump(Bool_t enabled);
  // Core dump is created in addition to the stack trace ()
  // marian.ivanov@cern.ch

STEER/STEERBase/AliLog.cxx STEER/STEERBase/AliLog.h - functionality to make a core file

PWGPP-4 Memory leak (M.Gheata)
PWGPP/TPC/AliPerformanceMatch.cxx

[ATO-16] stream cluster information for all clusters.

Check presence of the OCDB entries. Error message in case OCDb entry not available. Before it was crash

rename mode -> dEdxMode

Exaple usage case added

Fixes from Marian:
AliTRDseedV1.cxx    - adding correction for pad crossing 0 with effective factor for incoplete model
AliTRDtrackerV1.cxx  - adding chi2 to the streamer
AliTRDrecoParam.h AliTRDrecoParam.cxx AliTRDtrackerV1.cxx  - parameterised chi2 cut /tracklet to track
AliTRDseedV1.cxx - increase error estimate for crossing tracklets  -taking incount unisochronity, and crosscorelation of errors

Fix of sigmaZ for crossing tracklets from Alex

technical fixes

Added debug streamer steering from Marian and new tracklet fit from Alex

Fix in tracklets sz2 assignment for crossings

adapted to new version of FitRobust

xxx

fix in calling of gaussian spread function

commit to clean dev branch

MC part improved

including the overflow/underflow of track match in the "cutable" range

update from Markus

Fixed container name in Sigma* macro (Enrico) + Fixed cuts options in K* macro (Francesca)

updated EMCal tasks

update from Prabhat

Merge branch 'master' of https://git.cern.ch/reps/AliRoot

from Jan Wagner:
- accept QAresults_barrel.root as input QA file
- small fixes in the html generation

Time calculation corrected

Time calibration for LHC13bcdef updated

fix the attempt to reweight the cluster cell energy distribution

add functionality to weight cell/cluster energy fraction, add function to check if cluster is shared by 2 SM

add new functionalities by Adam

Add Muon Corrections