Added possibility to show the trend of calibrations of single SDD modules

Fix in SDD correction maps for cases of negative drift length

- added the new function call that sets the pass for the centrality task

- synchronized the overlay macro to the changes of the drawing one
  (although draTHnSparse.C provides the same functionality)
- changed the max Pt range according to the value defined in the CB task
- added functionality to define the X axis range for overlaying histograms

- removed method plotAid, its functionality has been moved to other functions
- reduced the number of arguments in several methods
- the canvases are now created and filled inside the functions and under conditions
  that the respective THnSparse objects have non-zero entries
- the canvas with the overlaid histograms is created and filled only when there is more than one
  set of cuts to be studied
- added a canvas with overlaid track distributions for the offline tracks too
- took care of the way the statistics boxes are printed, now entries, mean and RMS appear

Minor change in SetLaddersOnLayer2 to speed-up the code

QA updates

Clean at the end of loop

Misplaced initialisation of ntimes corrected.

fixing backward incompatible operator=, check for existence of fEventPlaneP

-- changes for mean pT vs multiplicity studies (M. Knichel)
M    dNdPt/AlidNdPtAnalysis.h
M    dNdPt/AlidNdPtAnalysis.cxx

New track selection and new track matching

New macro to print SDD configuration from JTAG hex files

Minor fixes in SDD macros

Optionally the log term of Rossi parameterization for mult.scattering can be
accounted by SetUseLogTermMS static method. The default behaviour did not
change (no log term).

- changed the min range for track multiplicity

- Macro to create the "raw" data file with selected events
Magnus

-This line, and those below, will be ignored--

A    rawmerge.C

using common base class functions to access OCDB objects

optimizing access to OCDB objects https://savannah.cern.ch/bugs/?80488, adding more error messages to the helper functions

Added OADB as external library dependency to ANALYSISalice. OADB will get automatically loaded when trying to load ANALYSISalice

- broaden the pt range that is filled in the track THnSparse
- small comment about the use of GetEventSpecie() for HLT data

Using At instead of UncheckedAt (Marian)

declaring some getters const

including -dataspec option in the configuration for file publisher

moving internal initialization and allocation from constructor to DoInit

Warnings fixed

covery

Updating EMCAL configuration for test setup.

forgot use collision option

update some settings, add option depending on year, collision type, output file name

Loading libOADB in the generated macros of the plugin

do not divide chi2 by ndf, can be done later and need to check with Marian

New feature to plot raw data of single module

Changes for #80876: Change in AliTOFPIDResponse

Updated drift gas. It's Ne-CO2 90/10 now.

Update by A. Matyja

Adding support for the fast cluster to the physics selection

here are correct for LHC11a, what i committed before was pilot version

i forget that before 16March due to CTP changes CFD time values were ~23000, but check in task was <9999 and for normal time

-- trigger selecion changed
M    dNdPt/AlidNdPtAnalysis.cxx
M    dNdPt/AlidNdPtAnalysisPbPb.cxx
-- post output in CreateOutputObjects
M    dNdPt/AlidNdPtTask.cxx
-- new TPC track selection criteria (M. Knichel)
M    dNdPt/macros/CreatedNdPtTrackCuts.C

correct usage of low p_T cut off, more options for background calculatiom (S. Jangal)

correct usage of low p_T cut off, more options for background calculatiom (S. Jangal)

Coverity warnings

Adding ruleckecher files into the distribbution

Changes for #80800 following bugs #80687: commit to trunk + port to the release (Rachid)

storing the chi2 of the constraint TPC track not of the unconstraint

Updated flow code and scripts from A.Hansen (hansena)

Check if any of the 4 electrons from pi0 measured in conversions is used in the correlation or isolation, modified debug print in the maker

Fix bug in rapidity calculation (Leonardo)

Size of   fTrackLabel array increased to 4
Gustavo Conesa

Reverting revision 49171;
as it gives linking errors on some platforms which have to be investigated

Add possibility to have at least 2 MC labels in the new cluster (Jocelyn)

In case geometry matrices are set via SetMatrixAlign, force their use instead the ones in gGeoManager

adding the information of the DCA to the constraint TPC only track, (DCA parameters of the uconstrained TPC track after RelateTOvertex)

set geometry matrices if not yet set

Removed obsolete macros

Version number increased.

Adding macros folder.
PlotOptimizeLength.C and PlotDoseExtrapolat.C are two files that can estimate occupancy, detector dimension and dose extrapolation at different radii (G. Buno)

Coverity:
AliHelix.cxx    - dead code
TTreeStream.cxx - sprintf =>snprintf
AliSplineFit.cxx  - sprintf
+
AliSysInfo.cxx   - adding static function to estimate  the size of object in memory

Marian

Removed deprecatet function AliTriggerAnalysis::GetActiveBit

Changed the check of trigger bit mask uniqueness.

Updated to use AliCentrality and to allow for asymmetric eta and ZV selections

Coverity Fix

AliEventplane introduced a dependence from ESD on STEERBase
Solved now.
Michele Floris

Linking with libOADB needed by libANALYSISalice

IsFromBGEvent
check for HIJING+Signal if a particle is in the underlying BG event.

Fix in compapctification of object before cloning

In AliMUONSt1GeometryBuilderV2:
Moving constant definition from .cxx in .h as it is required now with a new
coding rule.

- added the SPD vertex information

ProcessOutput update: deal with both TFileMerged merged data (histos inside TList) and mergeCalibObjects merged (histos not in TList)

Bugfix for AMORE (Jochen)

Updated parameterizations of peak positions (R. Russo, F. Prino)

- access the run number and respective date from the HLT tree
  (when offline data are not there, the run number was 0 and the date 19700101)
- moved this access inside the UserExec where the HLT tree is accessible
- removed NotifyRun with the access to the offline tree (that might not always be there)

Bit for the EMCAL trigger (Michele)

OADB Classes for the physics selection and filling scheme

Removed

Major update of the physics selection and trigger analysis class

- Trigger class names and online/offline trigger conditions moved to OADB
- Online/Offline trigger conditions can be provided as logical expression
- AliTriggerAnalysis parses the tonken used to form trigger conditions
- Muon and EMCAL classes used in the 2.76 TeV pp data enabled by default
- TPC laser warm up cut supported but not enabled by default

(Michele and Jan Fiete)

OADB classes and root files for the physics selection

In loadlibs.C:
Moving libPhysics before libSTEERBase what is now required to get libSTEERBase
loaded.
(Lauerent)

Utility for normalization

- Removing circular dependencies (the use of AliMUONConstants replaced with   AliMpConstants in lower lever libraries)
- Fixing typo in a forward declaration in AliMUONReAlignTask.h

Improved protection. Related savannah bug 80203 (F.Bellini)

naming conventions

update to reflect latest changes

added new options and fixed binary eccentricity

PileUp tagging (M.Chojnacki)

fix in TOF calibration to deal with L0-L1 orbit-crossing (negative values)

UPdate to digitize correctly with RELDIS

Set the TPC BB properly in case of MC

New TPC BB for PbPb pass2 (Rossella)

Enable fast and slow trackmatching, and use secondaries as well

SetLabel added and Printf commented

version increased

Fix for #80619: Missing protections in AliDCSValue::Getxxx

In trigger classes:
- Provide an external access to the trigger chamber efficiency graphs and errors
- Minor fix to access the efficiency objects stored on grid
- Minor change in the display of the non-bending plane object
(Diego)

reverted change 49142 (wrong header)

Protections added (F.Bellini)

addressing remaining  current rulechecker violations that did not seem to be false positives

coverity & pass2 preparation

coverity