modifications needed for AddtaskFlow works again local, on the grid and on caf

Correct formula for phi, in case of current local X <0, in GetLocalXat and GetPhiZat

Bug fix: AliTRDseedV1:GetMomentum needs pointer to Float_t, not Double_t

update to get the eventplane from hijing

Added new class AliTPCMisAligner

Added some protection

some cosmetics + start of new macro to merge output of different jobs

Adding a control flag to AliMUONRawStreamTriggerHP to allow the decoder
interface to either return the original local structure IDs found in the raw
data or calculated ones instead. This is needed in case hardware returns
incorrect or duplicate values.
(Artur)

In MUONTRK*da:
Minor changes to match the ECS environment (for Online processing)
(Jean-Luc)

add trending infrastructure
add trending variables (resolution example)

Some unused PDF are not compiled to reduce the memory consumption when loading liblhapdf.so (bug #50690)

modifications to TLists naming to allow merging

Minor typo error fixed.

updated macros for train

Corrected figures

New version of the train allowing to write the proof output in AliEn.

Removing checks for library loading because it is not longer necessary with the new plugin mechanism and just causes problems.

bugfix: making reading of MC information in ESDConverter independent of
data block sequence

adding NULL pointer protection to Cluster Finder

adding more options to the simulation macro and using the right options
for the CA tracker. bugfix: set the merger again as input to the ESD
converter

added Rsn cut on required PID and methods to set and retrieve this information

Method to set jet finder put back.

add list of V0 to the data transported to tasks
update PID ref maker to use the new data

Correction for delta AOD handling in proof and saving in AliEn

Toolkit for pi0 calibration.

Add first version of the TRD software writeup

Fix for bug #50614: 4-prong D0-> Kstar pi pi not switched off for kHadronicDWithout4Bodies (Marco)

Added the AliHLTTPCHWClusterTransformComponent to the package file.

Implementation of aliroot --version (Laurent)

Possibility to include ARVersion.h

Remove obsolete stepmanager functions and Bethe-Bloch implementations

Possibility to include ARVersion.h witihin the user code (avoid the gmake circular dep). Closes the savannah bug#48269 and allows to implement the code related to bug#50049

T0 responsibles modified (M. Oledzki removed)

Fix for bug #45751: Low V0 efficiency at low momentum and large radii. Ported from v4-16-Release, rev. 30636: The check on the return value is temporarily disabled.

Updated list of files (cmake)

Correct alignment of simulated HLT raw data
https://savannah.cern.ch/bugs/?50574

Kelly:
Added a new component for transforming hardware clusters into spacepoints.
Added new data type for the hardware clusters.

Analysis with correction for double hits (work in progress) and analysis independent of OCDB and geometry

Introducing the fixes needed in order to read the old RCU firmware format (v<3) with the new altro decoder. The fixes are done in a way so that it would be easy to remove this addition whenever the backward compatibility will not be needed anymore. Removal of some obsolete code related to the dummy altro trailer. It is not used by the detectors for long time as they implemented their real hardware mapping.

Fixes needed by gfortran, it doesn't perform lazy evaluation (Piotr)

Randomize pair particle order for identical particles

fix possible (in theory) divide by zero

Use selection cut in qinvf CF

Improved calculation of error on SPD vertex for B=0 (F. Prino)

do not update GRP-like entries while allows the normal behaviour when copying cdb objects (bug #50129)

Correct charge for pim, use LCSM in SH CF

Checking for SPDMultiplicity in the histogram names to allow printouts (D. Elia)

Adding getter for current time stamp (Marian)

new class added - AliTPCMisAligner

Generation of the TPC misalignment

add the CA tracker to the HLT TPC simulation macro. The algorithm
is chosen via an option string. Available options for the
moment: "CA" (default), "CM"

bugfix esd_hlt_tracks.C:
  use the esd_track_propagator_setup as it is done from the esd_track macro

More SysInfo stamps

Reducing verbosity: AliInfo --> AliDebug

Added possibility to use Alien plugin (Renu, Andrea)

Support for processing delta AOD files via the plugin (A.Dainese)

Added support for copying the outputs of the analysis in an AliEn folder from a
PROOF job. One has just to supply a valid path to an Alien location to the method:
   AliAnalysisManager->SetSpecialOutputLocation(path); where:
path = "alien:///alice/cern.ch/user/.../myOutput/" has to be prefixed by alien://
and must correspond to the user token that started the proof job. The common
output files (AOD) will be copied to this location as AliAOD_n.root from each
slave (n) while the rest of the outputs (histograms) will be first merged then
copied to the same location.

Updated list of files

Class to produce misalignments by R. Grosso added

Class to produce misalignments by R. Grosso

Implemented additional functionality according to the
https://savannah.cern.ch/bugs/?47411

(J.Belikov)

Fixing the problem that was causing the dip (savannah bug 48080):
the azimuth of the track momentum was used instead of the azimuth of the
track position. The protection introduced by Ruben and Martin (Rev 32258
and 32424) is not removed, because it makes sense (A. Dainese)

Removed hardwired Bethe-Bloch from the AliTPCseed.
Using  AliMathBase::BetheBlochAleph function

<http://savannah.cern.ch/bugs/?44266>

(Marian)

Another round of fixes in order to use the event specie in the QA. The procedure is the following: 1. The QA data maker gets the event specie as defined by AliRecoParam class. 2. If the detector's reco-param object has different event specie the previous value is overwritten and QA uses the specie defined by the detector. If the event specie from AliRecoParam and the detector's event specie are both set to default, the QA will not fill any histograms. Therefore the detectors should properly implement and put in OCDB at least one reco-param object (there should be also one and only one default object) with event specie set to low-mult, high-mul, cosmic or calibration specie. The changes were prepared and tested by Yves.

Change details on DCS boards

Ignore *.ps and GRP

Handling of Terminate in frame corrected

modifications to SMcalib help script to deal with new RCU and FEE firmware (register and syntax changes) - for APD HV settings

Update the RCU trailer reading accordingto the RCU frimware V2 user's manual. Thanks to Jens for reporting the problem.

Revised TRD geometry with corrected positions of support rails and more detailed material description

Revised TRD geometry with corrected positions of support rails and more detailed material description

Train configuration can be now saved and replayed. If 'saveTrain' flag is set,
the train will generate a directory name and run in this directory.
A configuration file 'ConfigTrain.C' will be generated. One can replay at any
time the train via:
   root[1] AnalysisTrainNew(ana_mode, plugin_mode, "train_default_<date>/ConfigTrain.C")

renamed estimateSpread to showSpread

macro to show the spread of results from independent runs (poors mans error estimate)

Fix for bug #48080: the same modifications as in GetLocalXat are introduced in GetLocalZat

 Fix for bug #48080: Dip at zero in the distribution of Delta-phi and d: PbPb events

Corrected index (Antonin)

Bug fix: the object counter should be never reset inside the raw-data root-ification since the referenced objects are reused and this can lead to raw-data payloads mixing in case the data is read in an order different to the writing one. The fix should be propagated to v4-16-Release together with the new raw-data event format.

fix spelling error

Improvement in the algorithm that collects neighbouring pads to form clusters

Adding two track QA macros

Change pretrigger phase to 2 (Matus)

Update for checking the sign before invariant mass calculation (A. Maire)

- add LUT correction for y coordinate of clusters (fitted)
  (AliTRDcluster)
- use corrected radial coordinate for dq/dl calculation (AliTRDseedV1)
- first definition of a charge resolution plot (AliTRDresolution)
- chi2 plot for each degree of freedom (no of tracklets) (AliTRDcheckDET)
- miscellaneous

Temporary fix: verbose printout commented out, additional protection

Updated list of files

Return pointer to the base class

making the libHLTqadm conditional in the HLT build system (dependence on AliQAv1)

New flat raw-data event format. The details can be found at: http://indico.cern.ch/getFile.py/access?contribId=2&resId=0&materialId=slides&confId=58946. The raw-data tags are still to be revised.

removed obsolete implementation files from package

Main changes:
- modify the logic of exporting files to the FXS: GLOBAl and REGIONAL files
are exported whenever at least one of the four configuration files (GLOBAL,
REGIONAL, LOCAL, LUT) change the version in the detector DB
- if DA is disabled, only export files to FXS (if it is the case), do not read
the input data from the DAQ
- add lots of Doxygen comments
(Bogdan V.)

Adding functionality to read the MC data in HLT. Also updated some classes to read the new 32 bit format with the new AliHLTTPCDigitReader32Bit

Technical fix for bug #50441: Track-cluster matching not done correctly during reconstruction (Jennifer)

Updated list of files

Additional shapshots of the track parameters (ITSout, TPCout, TRDin) stored in the ESD friends for debug purposes (Marian)

Config for charged + neutral

replaced by ...FastJet

Configuration files for charged + EMCAL reconstruction.

added newline at end of file

removed classes not compatible with new package

Improved precision in SDD raw data decompression from 8 to 10 bits (F. Prino)

fit with changes to TOFFEE data structure (enable status of single HPTDC chips)

added new TOFFEE file