We have implemented, in AliGenMuonlib.cxx, the possibility to generate JPsi events with a realistic distribution in one variable (eg. pt)
and a flat distribution in another variable,  for example y. This is useful to compute systematics error on our acceptance evaluation.
R. Arnaldi
E. Scomparin

Bug fix

From D.Stocco: changed data member types to explicit TH1F and TH2F to avoid problems in streaming.

update of HLT TRD reconstruction macro (Theo)

Activating some parts of the code which have been commented out by mistake. Prevents the TRD preprocessor from crashing when no TRD tracks were found (Raphaelle)

Updated code to read LV.and.HV status maps during a run. Waiting numbering conversion problem at DCS-Amanda level before toupdate HW status map in OCDB.

Coding convention violations: fixed

Coding rules

increase class number

additional functionality

Fixing bug in generated trigger logic code for checking class inheritance.
Fixing bug due to possible missing dictionaries when loading the global decision. Had to put back explicit checks for NULL pointers since the custom streamer is not
guaranteed to be called if the object was written to a TTree with split-mode > 0.

The changes are:
a) more histograms added
b) reduced dependency on friends information
c) small bug correction

Updates from Renzhuo to enter the mini train

Updated
(F. Prino)

Typos fixed.

Updates.
Annalisa Mastroserio

Changing structure of the directory:

- Pass0
All the files (.jdl, .sh, .C) needed for Pass0

- PassX
All the files (.jdl, .sh, .C) needed for PassX

- MergeCalibration
All the files (.jdl, .sh, .C) needed for merging and extracting the calibration objects (run level)

(Marian + Chiara)

Fixing coding conventions violations

- commented out the line sim.SetMakeTrigger(""); , otherwise the macro crashes with r39941.

Fixing bugs.
A crash was being caused by incorrect checking of pointers in AliHLTMUONDecision.
AliHLTMUONRootifierComponent was incorrectly making duplicate track objects if they were not found.
The deep copy of AliHLTMUONEvent was not maintaining the cross reference pointers correctly.
Fixing documentation for AliHLTMUONMansoTrack.
Improving checking for MUON module in AliHLTMUONAgent.

Fix for bug https://savannah.cern.ch/bugs/?64829

Protection against division by 0

Upgrades and fixes of warnings from FC

fixes code viols

Technical fix: possibility to use partial EMCAL geometry

Fixing warnings

- fixing compilation warning

- complete modification of the creation of AliTPCseed objects from HLT tracks (now method from AliHLTTPCdEdxComponent is used)
- added MC labels on the seeds for comparison between HLT and offline results
- dEdx information present (histogram)

This component is not used in the calibration any more. At the moment it will serve more as a means of comparison with offline. After optimization and correct placement
of the process on the HLT cluster, it can be used for providing the dEdx online.

- testing macro based on AliSimulation producing a TObjArray of AliTPCseed objects per event

Fixing coding conventions violations

Further 3% more speed for pp (Theo)

Speedup up clusterizer (Theo)

adding the date to the comment and other updates

Bug fix for the case HLT is running but no track found in the TRD (Raphaelle)

coding conventions

Adding time delays (channel-by-channel) as an OCDB entry. Measured only once since it is determined by the length of the optical fibers and cables.

Added the method AddDateToComment, adding the current date to the comment datamember.
This method is supposed to be useful if called at the time when the object
is created, so that later it can more easily be tracked, in particular
when the date of the file can be lost or when one is interested in the
date of creation, irrespective of a later copy of it

- new resolution picture for track resolution vs MC
- fix no. of clusters/track picture

Make data members static for speed (Theo)

Make operator= private, modified copy c'tor (Gustavo)

Bug fixed

Fixing coding rule violations

Coding convention violations: fixed

- dimuon Dalitz included
Ralf Averbeck

Adding more histograms

Warnings corrected.

Warning corrected.

Warnings corrected.

Coding rule violations corrected.

added comments to satisfy coding conventions

JetCorrel fixes for mini train (Paul Constantin)

******** From the discussion at the Offline Week, 19 March 2010

-Not filling the GRP object with the energy and beam type from the DAQ logbook (reading them, but not using them).

Update sign of SDD correction map (S. Beole)

coding violation fixes

fixed warning

fixes for coding violations

removing obsolete code, for propagation of TPC only track

Memory leak initialize AODJet to 0

Compilation warnings

Fixing coding violations from FC

Do not Dump the track info for high p_T just print out

add configurable segmentation for y resolution/residual plots

updates requested by HLT
- cache calibration params at tracking chamber level
- recalculate cluster error parameterization for HLT during tracking
  chamber building
- do a vertex constrained fit in case of HLT before leaving MakeSeeds

Corrected default values.

fixing compilation in HLT build system

new short-cut macro to merge performance files

added documentation

Federico: Adding special rec point for EMCAL

Federico: AliHLTEMCALGeometry handles transformation from local to global coordinates

- added energy correction from AliPHOSPIDv1

- dummy implementation of CDB interface functions.

Coding conv viols fixed.

new resolution plots
remove left-over print statment

Updates from Paul Constantin

More stable numerical calculation of combined mass

Fixes for report #64730 High virtual memory consumption in the ITS standalone tracker

Avoid numerical problems in calc. if eff. mass.
(suggested by Matus Kalisky)

Fix a shadowed variable

forward declaration of TString

Delete TRefArray before placement new, avoid mem leak

Fix warnings

new method added for the Mean threshold scan (A. Mastroserio)

Coding conventions fixes

adding cmake setup for HLT TRD macros, update of macro (Theo)

Fix for report #64208 Missing OCDB (GRP/Calib/MeanVertex) object in GRP

trigger algorithms parameter names changed according to PIT names (A. Mastroserio)

Correct memory leak when using PHOS geometry, remove the TObjStrings from the histogram output container, to be used in the cuts container later

Keep track of missing DCS points in DDL maps (flagged by 'x')
Compress HighVoltage maps  - delete new point if less than 1e-4 different from previous one.

********** Following discussion at Offline Week, 19 March 2010

- Implementing aliases:
energy -> LHC_Beam_Energy
machine mode -> LHC_MachineMode
beam mode -> LHC_BeamMode
beam types 1/2 -> not yet defined
- Implementing check on the time stamps for machine mode and beam mode
- Updating test files (local + nightly shuttle tests)

Fixed size array.

Minor changes in a macro

Disable the retrieval of dead modules in SDD and SSD. To be replaced by new code from Enrico and Francesco (bug#64752)

Extrusion corrected.

Removing fRandome

Making Instance() create the class

One more macro for ZDC shifters

VZEROQA from library.

Coding rule violations corrected :-)

Protection needed in case of kinematics-only-analysis.

Add a new variable, that is the radial position of the track at the end
of the muon absorber, both in ESD and AOD. This variable has proven to
be extremely useful to better understand the effects of the absorber in
the data taken by the muon spectrometer.
(Philippe P.)

 This is a backward incompatible change in AliRoot. The following methods have been removed

-   const char*   AliRun:: GetTriggerDescriptor() const {return fTriggerDescriptor.Data();}
-   void                AliRun::SetTriggerDescriptor(const char *name) {fTriggerDescriptor = name;}

as their only function was to store temporarily the beam type in AliRun to be transferred to AliSimulation. This information is used for the trigger configuration. Instead, we have introduced the two methods

+  void                   AliSimulation::SetTriggerConfig(TString conf) {fTriggerConfig=conf;}
+  const Char_t*  AliSimulation::GetTriggerConfig() const {return fTriggerConfig.Data();}

To store and get directly this info from the AliSimulation class. This change is completely transparent, however what is NOT transparent is the setting of the beam type which is done in the Config.C. Typically the change is the following

-    gAlice->SetTriggerDescriptor("Pb-Pb");
+    AliSimulation::Instance()->SetTriggerConfig("Pb-Pb");

All the macros in AliRoot have been changed, but also all private macros will have to be changed. The symptom will be very easy to detect, as CINT will complain that there is no method SetTriggerConfig in AliRun.

One subtle point here is that with this change Config.C will require the presence of AliSimulation. If it is not there, it will be created by the Instance() call. This is not a problem in normal usage, but if Config.C is not used for simulation, it will create an instance of AliSimulation, that will not be used. Again, this should not be a problem, but users might as well be aware o fit.