refine files out name

Add option to reject exotic cells prior to clustering

Added missing class definitins and includes

Fixed LaTeX label for hypertriton

This is the initial commit for a pilot nanoAOD implementation
Please not that this code is still in a very early developement phase
Do not use it for anything real!
The purpose of the commit is a large scale test on the analysis trains

Protection for momentum conservation in correction framework

Adding MC part and PID

macro for QPythia and PyQuen

TriggerPID: Updates from Debojit

Merge branch 'master' of https://git.cern.ch/reps/AliRoot

Upadates from Debojit: TriggerPID

TRDtriggerCheck: reduce verbosity and write to common output file

Added function to write thermus input files

some fixes for running with makeflow

updated for systematic study

Added new library (libPWGLFthermalfits)
Added checks for duplicates to AliParticleYield

fix treename and add a null pointer protection

update from Prabhat

Fixes for the DA RPMs

From Massimo: updated task and macros for D0 analysis

Fixed warning + added protection for non-existing TOF QA output

First version of a class to process particle yields file

Initializing arrays

update to latest version, possibly still not the final one

adding possibility to select only primary protons for momentum resolution correction study

Updating eta storing

- add the possibility to process highPt trees as QA input for expert tracking QA
- add in TRK.sh script the logic to produce expert QA
- additional condition for log validation: "Interpreter error recovered"

Yvonne for the TPC-TOF MB pPb analysis

added the alien caching script with example config

fixed compilation issues

fixed compiler warning in AliPHOSClusterSelection::EvalCoreLambdas

improved readability/maintainability of AliPHOSClusterSelection to/from string

fix:  AliPHOSClusterSelection::fIsCore float->bool

- optional output to debug stream for AliTRDmcmSim

- add header guards to AliFigure

- mark data as invalid in case of errors (not evaluated at the moment)

- fix copy constructor and assignment operator for AliTRDarrayADC
- add flag to mark data as invalid

make it work on MacOSX

add includeDetectors option, update documentation and example

bugfix: Use FindBin for correction matrix (otherwise bin mismatch for pT which has bins with non uniform width)

Changes from Jochen

commenting the printouts

fix in reading TPC signal in MC analysis (AliFemtoEventReaderESDChainKine class)

Updated TOF script for QA trending

updated config file for Kaon Femto train

bugfix (phi range for correction map, was done in deg instead of rad for 2011 PbPb)

Do not write tmp files in /tmp (Diego)

Bug fix in checking file existence (Diego)

Merge branch 'master' of https://git.cern.ch/reps/AliRoot

large performance update

Adding Merge option to AddFilterAOD + delete some debug printf

update to use DCA from global tracks on TPC-only

update for using DCA from global tracks on TPC-only tracks

- dalitz code changes by Pedro Gonzales

New train files for Ashutosh's analysis

- move AliTRDTriggerAnalysis from ANALYSIS to PWG/TRD

Calibration for LHC13b2 updated

- first version of PWGTRD lib

update from Prabhat

reevaluate NDF by hand

Add efficiency histos in the task for combinatorics (Francesco) + updated macro for running this task (AndreaR)

Commit for Simone

Adding HFCJ QA task

Common HFCJ QA task for filter bit, track and jet properties, PID and EMCAL response monitoring

Printout forgotten

Some fixes to make the KF macro working (was very old)

fix for module->chip and protection against histos lost at directory change

Add cell E,eta,phi histo to QA task

add timing cut setters to AddTask macro of ClusterizerFast

From Massimo:
- added optional check on momentum conservation for MC pairs (default=disabled)
- update to the D0 analysis config macro for train

Modifying AddTask for PhiQA

Switching to a new function name

103998: Fix in Hijing: to be committed to master, and then to Release

 revert addidental change of defaults

Adding eta info at hit level

root has sometimes problems parsing the arguments to a called macro if there are spaces in between arguments. This removes the spaces

Updating track cuts macro for harmonization of filter bits.

AOD extensions and filters have now a flag tomerge that can be set via SetToMerge() (that should be called by the extension creator), used by the plugin to merge these files. Should be used with plugin->SetMergeAOD().

Merge branch 'master' of https://git.cern.ch/reps/AliRoot

Option to switch pi0 decay off

Fix for adding the event pointer to the AOD tracks produced by the filter.

 even more correlation histograms ... correlating p values to reduced chi2 values

fix excluding of detectors

changing histo axis bin size and centering

mc settings and fixed warning

- Removed TOF electron exclusion (el contamination in TOF pi sample can be treated by TPC PID as an afterburner) and adapted inclusion and exclusion cuts

add control histograms: reduced chi2 vs centrality, p-value versus centrality, kolgoromov-p versus centrality

Added folder for trending macros for TOF QA + new macros for automatic trending in the QA repository

updating correction maps (asymmetric pT bins) for pPb analysis

default (empty) QA script for tracking. The expert QA is going to be in
that place

make explicit the possibility to process the high pt trees for expert QA
as they are produced by default by the standard QA and are present in
the archive.

follow the old and nasty naming for consistency: FilterEvents_Trees.root

protect agains null pointers

Introduce Cascade meson daughter swap tests in MC

Updated macros for D0 analysis (Massimo)

Update pPb Ntraklets bins and include Ntrk-zvtx corrections for D+ and D* (J.Wilkinson, ZCdV)

Protection for missing shadowing histograms

Update on D+ and D* MB pPb systematics (G.Luparello, R.Russo)

updated for photonic study and checks

Merge branch 'master' of https://git.cern.ch/reps/AliRoot