Enable global deselection of AOD extensions

Add data members for jet background, enable filling (Leticia Mendez)

fix of some rule violations

Not-existing QA histogram call: bug fixed (F.Bellini)

Added protection agains null primary vertex pointer

- BX id filtering implemented for 7 TeV runs up to 122375
- The fraction of BX slots for the different trigger classes, needed to compute
  the residual BG after cuts, are now computed from the data (they were hardcoded
  in the previous version)

Switch to the new raw reader (Julian, Raphaelle)

Adding macros for ACORDE: sim&rec, read raw-data,esd & hits (*.C macros and AliAnalysisTask)

Deleting AcoReco.C macro

Now AliGenACORDE::SetNumberOfParticles is included

Fast simulation of vertex shift added
(Marian)

- removed the option to run over the first 500 events of the file, (committed by accident)

Use copy of GeoMatrix instead of pointer

The abj arrays with the histograms with bad channels need to be streamed

fixing coding violations

Minor changes

violations fixed

fixing warnings from FC

Fixing violations and warnings motivated by FC

LHC clock phase simulation added. Set to "0", waiting for the implementation in the reconstruction

Added step for the PID selection (Chiara Z)

adding member documentation

fixed warnings and coding conventions

Adding VZERO to the standard embedding test suite

Brand-new implementation of Raw->SDigits. One first reconstructs the signal from raw data. Then it is parametrized according to the mean signal shape. Finally, a SDigit is produced. The procedure is not exact, but it is the best one can do with the insufficient information in the raw-data stream. Anyway, it should be enough for any embedding-related exercises with vzero. The code was test with test/embedding suit of aliroot and gives no technical problems. Sim->Dig->Raw->SDigit->Dig sequence was checked by comparing the reconstructed ESD. Concering the validation of the whole embedding procedure would need some physics case where one can address the quality of the implemented procedure. All this is in discussion with Adam K.

use Terminate function for producing summary plots (Markus)

comment out query to AliTRDcalibDB which is not yet in place

code cleanup after r41831, more efficient conversion to output cluster format (Gaute)

compilation warnings fixed (r42022)

compilation warnings fixed (r42022)

reverting r42022, changes to be committed separately in order to disentangle backporting

TOT=0 check removed from TOF-T0 algorithm

CalorimeterUtils: Only if pointer with bad channels exist, access to its content
PartCorr Task: Post the TList with the parameters to the container and not its contents

new classes for TRD trending and alarm management

style modifications (Markus)

style modifications (Ionut)

Corrected memory leak

Removing some compilation warnings.

Fixing compilation error.

Bug fix (Rossella)

hits time information taken into account in the digitization

Modified to be usable on the grid, and added an initialization function (Matthieu)

Added method to set only covariance matrix

Warning removal - swaped initialization in constructor
(Marian)

Compilation warnings removal (Marian)

added a dummy object in QAref

added a dummy object in QAref

added a dummy object in QAref

added a dummy object in QAref

added a dummy object in QAref

- added configuration handler for TRAP configuration (Uwe)
  contains the parameter calculation of tracklet parameters
  as on the DCS board (e.g. deflection correction)
- bugfixes (catch unconfigured PID LUT, corrected array declaration)

Changes to use the mean vertexer DA

Use 1kHz sampling as default.

updates to produce summary plots on the grid (if our request will be approved). Markus

Correction for
 <http://savannah.cern.ch/bugs/?69400>

In AliMUONVPainter:
Fixing compiler warning introduced in previous commit.

Last fixes (hopefully) for the kParamContainer mode. Tested in "full", "terminate" and "test" modes.

fixing compiler warning

Objects to remedy bug in FMD reconstruction - proper run number

Objects to remedy bug in FMD reconstruction

fix warnings

Fixed compiler warnings

compilation warning fix

Set the analysis parameters/cuts used in a folder in the output file, in TObjString format

Changes for the Lambdac (Chiara, Rossella)

Update from Timo: Initialisation of AliGeomManager added

added fake OCDB object needed for QA

added fake OCDB object needed for QA

added fake OCDB object needed for QA

added fake OCDB object needed for QA

added fake OCDB object needed for QA

fix to handle the cases when the SPD vertex is reconstructed but vertex_with_tracks is not (Ruben)

added fake OCDB object needed for QA

added fake OCDB object needed for QA

compilation worning removed

fixing a bug in the FMD preprocessor affecting the FMD reconstruction

Fixing coding conventions

Removed warning

Compilation warning

Compilation warning

Fix compiler warnings

Warning corrected

Removing libANALYSISRL.pkg from dependencies

warning suppression

1. Initialisation of AliTPCParam added
2. Access to the alignment database moved to the constructor

Fix compilation warning.

Fixes to suppress warnings

In reconstruction:
Removed option for creating trigger digits in AliMUONReconstructor,
as they are needed in AliMUONTrackHitPattern; this avoids re-creating
digit store with each event and fixes the problem report #69261
(improper use of TClonesArray).
(Diego)

Bug in DQM agent resetting solved

deleting second FF task

Obsolete code removed.

Fixed coding rules violations. Note that RC16 cannot be fixed since the plugin is generating a validation script which is supposed to checj for strings like "segmentation violation" ,...

Adding fixes for backward compatibility of AliHLTReadoutList.

Hadron Correlation: Correlate charged partcle only when it is leading, add few histograms (Yaxian)
AliIsolationCut: Allow to isolate with tracks and clusters or only with tracks or only with clusters
AliNeutralMesonSelection: Avoid the selection via de opening angle if requested (Yaxian)

Bug corrected in QA checker

Added more cuts to the pi0 analyis (Ana)

From Stefano -- coding convention violation fixes.

Fixing problem in handling old format of AliHLTEventTriggerData.

Updating version number.

Update (Mikolaj)