Merge branch 'master' of https://git.cern.ch/reps/AliRoot

Backward compatibilities

Various updates, and prep for Train base class

ATO-58 digitization and hit creation in anohter loop (to take into account properly diffusion)

ATO-18 - a.) Removed upper limit on number of electrons. b.)Use qMax correction if signal fully under threshold

Small fix:
- adding impact parameter range as optional

Update AMPT macro:
- adding user options: string melting and no ART
- adding Boost to LHC
- adding decayer

Update User Task

Fixing a little memory leak

Remove compiler warnings

put different cluster parameters (time, n cells, n SM) in the AOD particle, recover it in different analysis task

Update

including possibility of selecting negatively charged kaons and pions

cosmetics

added correlation plot for pt resolution vs length of track, eventplane determination modified, cleanup of unused functions

Adding efficiency for the following selections: ctau, ficutial volumen and transverse momentum of daughters

Restrict amount of trigger bits to size of int

Fix case sensitivity on Linux

- Add simple QA to the trigger patch maker and set the default to
  disabled
- Identify L0 patches by the trigger bits in MC and by the timing cut in
  data

Changing GetZv to GetZ

Making the cluster finder ignore digits with large RO cycle values

TPC percentile calibration

Moving required CMake version from 2.8.4 to 2.8.8

fix run number when no run list is provided (C.Hadjidakis)

Usage of VZERO equalized multiplicity. (a) Add function to compute it (b) Add flag to evaluate different z-vertex corrections: 0=none, 1=data-driven, 2=esd-parameterization (c) Evaluate the correlation among estimators

changed binning, sparse axis used, removed unused code

AliAnalysisTaskEmcalJet: Add possibility to not use pileup rejection with AnaUtils. HighMulTrigger: add SPD cluster vs tracklets correlation + change event selection

classes for trigger studies

fix some warnings

move class to correct lib (PatchFromCellMaker to PWG/EMCAL)

add event selection

Merge branch 'master' of https://git.cern.ch/reps/AliRoot

move string data members to int; add more calo specific information: time, ncells, sm number; cosmetics

Compilation with Root6, lost in the previous commit

Adding using std::...

Adding STEER/ESD to EINCLUDE

Merge branch 'master' of https://git.cern.ch/reps/AliRoot

fine tuning of TOF tail (developing task)

Bugfix for empty event mixing histograms
- do not add vertex/centrality subbins, if event mixing histogram is empty
- store number of triggers
- subtract from all triggers for correct normalization

AliAnalysisTaskGammaConvDalitzV1: Bug in the TruePhotonCandidates function fixed

 removed unnecessary include path

 cmake and linkdef changes for new task

 new task from nagmeh

Calculation Ecross resored

Fixing compilation issues after merging

Fixed casts in calls to AliAODEvent::GetHeater/GetTrack

Fixed cast to AliVAODHeader

Added missing cxx for AliVAODHeader

CMake pkg file and linkdef changed accordingly.

Fixed LinkDef after renaming some NanoAOD classes

Undoing changes to AliGlauberMC

Added dynamic_cast to AliAnalysisTaskFemtoESE.cxx (GetZv->GetZ)

Completed changes needed because of previous commit

AliAODEvent::GetTrack was changed to return AliVTrack* This required
patching several users tasks.  The most common patch consisted in
adding an explicit dynamic_cast to the GetTrack and checking for a non
null pointer.

Changed AliAODEvent::GetTrack to return AliVTrack* (and not AliAODTrack)

This change is needed for the NanoAOD developement.
In this commit, AliAODEvent has been patched so that the track type is
explicitly checked when needed.
This commit does not compile (tasks still to be patched).

AliAODEvent::GetHeader() returns AliVHeader

Transition completed, added dynamic or c-style casts where needed

AliAODEvent::GetHeader now return AliVHeader

This required patching the base classes in a few places and moving
some of the NanoAOD to STEER/AOD and checking which actual header is
contained in the AODEvent class in a few places.  This commit does not
compile (analysis tasks which use AliAODEvent::GetHeader still need to
be patched)

Adding AliVAODHeader

Fixed GetZv -> GetZ

Corrected getters after renaming

Undoing some unwanted method renames

In commit 6826c9114dfc107099ef06942a79f7b15a2ca495 some methods
were renamed to make the AOD and ESD interface more homogeneous.
The regexp used introduced some unwanted renames that are undone
here

Added method to save glauber ntuple

Fixed issue in PWGCF/Correlations/DPhi/AliAnalysisTaskDptDptQA.cxx

Adding PWGCF/Correlations/DPhi/AliAnalysisTaskDptDptQA.cxx

AliAODTrack::GetNtracks()->AliAODTrack::GetNumberOfTracks()

changes for Vertex and Tracks classes

Added commet to explain AliAODTrack::fType, AliAODTrack::XAtDCA(), YAtDCA(), ZAtDCA(), PxAtDCA(), PyAtDCA(), PzAtDCA(). Added AliAODTrack::GetNcls(Int_t idet)

AliAODEvent::GetPrimaryVertexTPC() implemented and AliAODEvent::GetVertex() added as an alias of AliAODEvent::GetPrimaryVertexSPD()

AliAODEvent::GetNTracks() changed with AliAODEvent::GetNumberOfTracks()

QA task for UD-diffraction

QA plots for q vector

q vector seelction from TPC

Minor bug on T0-AC resolution fixed. TOF resolution no longer read from TOHheader but read from OADB (F. Noferini)

Minor bug on T0-AC resolution fixed. TOF resolution no longer read from TOHheader but read from OADB (F. Noferini)

DIM is installed only together with DATE, protect the usual case with no DIM

Put in agreement with updated Tender

Bug in dispCore filling corrected; cleanup

Update of macro

include DCal in introduction and how to init it in geometry, change some of the intro figures to lower resolution

Fix crash during merging

warnings corrected

Merge branch 'master' of https://git.cern.ch/reps/AliRoot

Conflicts:
LHAPDF/CMakeliblhapdf5_9_1.pkg

New Analysis Tools for the MFT
Merge branch 'master' of https://git.cern.ch/reps/AliRoot

New MFT Analysis Tools

simple macro to read the trigger OCDB

Reduce verbosity

Merge branch 'master' of https://git.cern.ch/reps/AliRoot

Fix for Next50 class bit mask propagation to esd

Fix from F.Noferini: treatment of the case when nTofClusters is not available in the header

AliRawReaderDate does not require DATE, only event.h available in RAW

Fix for include path for Fortran file

add tuning of TOF TOF tail for MC (under deveolping)

small bugfixes

event server now checks for current run on startup

alieventrecontruction with more output for tests

Return to full E; try coreDispersion

Added macro for local merging of the QA output

method to tune TOF tail added to TOF reponse (F. Noferini)

method to tune TOF tail added to TOF reponse (F. Noferini)

New macro for Femto QA: sjena

Merge branch 'master' of http://git.cern.ch/pub/AliRoot

Number of bin

updates in macros for Femto QA in train

Update analysis qa GA macro: sjena

Tuning bin limits