Corrected bug - 2 media had the same material

Updates for Mixing (M. Vala)

- added the DCA for the HLT tracks, as calculated by the HLT reconstruction, however not activated,
  as not all ESD files contain this information and the distribution will be empty for older HLT runs.
  Besides the DCA value differences are minor between what the task calculates at the momemt and what
  the HLT reconstruction delivers. The commit is for completion of information.

Centrality selection task update (A. Toia)

Task to inter-calibrate hadronic PMTs (by A. De Falco)

Updates (A. Toia)

Centrality Task (A. Toia)

move warning to debug message

fix coverity

fix coverity and codding conventions

fix codding conventions

Changes for new signal timing

Adding trigger counters class derived from AliHLTScalars, which will be used to store global HLT trigger counts and their rates.

Modifications required for deriving classes.

Fixing error message.

Fix for par files compilation (Philippe)

macro AddTaskHMPID.C, removed by mistake, added

- added more information about the primary vertex

fix: generate DataContainer highmult data only it is needed

Setting rmaxcut for all extrem r cuts definitions, otherwise default value is not set again.

Corrected protection.
Fixes https://savannah.cern.ch/bugs/index.php?74532

Updated DAs

Updates (A. Toia)

Centrality selection macro and test input (A. Toia)

Centrality selection task. (A. Toia)

changes are needed in order to implement the code to be used in the TRIGGER PreProcessor which will store in the OCDB a new object containing the relevant information about TOF trigger status for each run

changes to include AliPerformanceMach component (Michael Knichel)

implementing the copy contructors for two helper classes because compiler on macos seems to have a different implementation of stl::find which needs the copy constructor. Other implementations avoid this

Solves compilation error
***** Compiling HLT/BASE/AliHLTComponent.cxx *****
HLT/BASE/AliHLTComponent.cxx: In member function ‘int AliHLTComponent::ProcessEvent(const AliHLTComponentEventData&, const AliHLTComponentBlockData*, AliHLTComponentTriggerData&, AliHLTUInt8_t*, AliHLTUInt32_t&, AliHLTUInt32_t&, AliHLTComponentBlockData*&, AliHLTComponentEventDoneData*&)’:
HLT/BASE/AliHLTComponent.cxx:1733: error: ‘<unnamed>::AliHLTComponentStatisticsId::AliHLTComponentStatisticsId(const<unnamed>::AliHLTComponentStatisticsId&)’ is private
HLT/BASE/AliHLTComponent.cxx:1899: error: within this context
HLT/BASE/AliHLTComponent.cxx:1755: error: ‘<unnamed>::AliHLTComponentBlockDataSpecification::AliHLTComponentBlockDataSpecification(const<unnamed>::AliHLTComponentBlockDataSpecification&)’ is private
HLT/BASE/AliHLTComponent.cxx:1906: error: within this context
make[1]: *** [HLT/tgt_macosx64/BASE/AliHLTComponent.o] Error 1
make: *** [default] Error 2

EMCAL_FIRSTYEARV1 added to the valid name of geometry

Adding a new common utility class to hold a list of named scalars.

converting AliHLTGlobalHistogramVariables to template class in order to be used with both float and int values
adding track integer value array to the component, currently Track_status is the only variable

New class for normalization studies (Giacomo)

Change to fix par files compilation (ChiaraB)

Possibility for more selective PID (Giacomo)

load XML configuration file into object (Lars Christian)

fixing a typo in documentation, no functional change

disable component statistics for the control task, only inserts the desired control data blocks

update of the CompStatCollector component to handle more complex chains
- assign unique tags according to processing level and component id
- allocate filling arrays for tree branches dynamically
- suppress duplicated entries

Making component statistic framework capable of hanling more complex configurations
- send processing level with the component table entry
- use CRC id for data specification of component statistics blocks
- suppress duplicated entries, caused by multiple components in the online system or
  merging of two processing paths

excluding D0Trigger from the inputs of the HLTGlobalTrigger because of a rare segfault to be investigated
https://savannah.cern.ch/bugs/?72590

ESD Centrality class (A. Toia)

Update to speed up the calculation (and the accuracy) to calculate space charge effects due to floating wires in 3D

- bug fix

New hook needed for fast mixing.

fix compilation warning

Many fixes:
Add example configuration macro for pi0 analysis, change way several cut parameters are set.
Remove btag analysis from train configuration macro
Add posibility to switch off the Terminate execution per analysis, off by default
Mem Leak fixes in case analysis with kinematics stack
Several fixes in isolation analysis

Some additions for mixing.

move printf to debug mode

- added the possibility to access the data from the GRID in order to extract the HLT ESD from the raw data files
- updated documentation, the macro now takes arguments

Fixes from Christian related to merging

adding the dash as valid character in directory names (avoids svn level3 directories in TRIGGER prompting an error)

fixed compilation warning

added macro to access noise reference data

fix codding conventions

Enable submission of chunks of runs, correct call to AddTaskMinijets

Spectator signal @ 1.38 TeV updated both 4 lumi and divergence

Corrected call of output container for proper runnning in the PWG4 train.

revert unwanted changes

fix coverity

Add line in makefile to allow compilation of PWG4PartCorrDep.par, add libPhysics and libMatrix to analysis macros, in case of compilation of EMCALUtils, update analysis macros, correct compilation warning in AliAnaPi0, correct tabs in AliAnaCalorimeterQA and coverity warning

Fixing up streaming of global decision using new ROOT I/O schema rules. Should now have no problems streaming these objects with TTree for any split level.

extra macro to illustrate behavior centrality variables

fix coverity

Corrected t0spread stored in AliTOFHeader object and changed log infos

nan check (needed if class is used in standalone root)

- fixed coding violations (Gaute)

- correct argument for the TPC cluster finder when it comes to propagating MC information (was turned off!)

Corrected warnings

fix coverity

EMCAL_FIRSTYEARV1 - geometry for December 2009 to December 2010 run period;
 1. Fixed bug for positions of modules inside SM
    (first module has tilt 0.75 degree);
 2. Added Al front plate (width 1 cm) and 2 paper sheets per sampling
    layer (additional 0.2 mm)
    The sizes have updated with last information from production
    drawing (end of October 2010).

move histogram initialization from MC case only to any analysis usage

Changes for report #74254: ZDC and STEER (AliESDZDC) changes for TDC

Added plots for errors VS pt (ChiaraB)

New macro for generating MC OCDB for PbPb.

update pi0 analysis with pi0 mass vs track multiplicity and pi0 mass combining different PHOS or EMCAL modules

Changes for report #72965: New AliESDCaloTrigger + associated modifs in AliESDEvent

Changes for report #74151: Important update in AliTOFPIDResponse class: use also T0 detector information to make Time-Of_flight PID

Fix for Savannah bug 74286

fixed coding conventions

minor change to macro

A first attempt to make final merging stage on the client working, in case analysis was done on several runs.

 calculate track multiplicity using the standard ESD cuts, and a cut on eta. Filter task, fill array with matches

fill histogram Markus Koehler

disable storage of HLT TPC clusters in HLTOUT in simulation
accounts for bug https://savannah.cern.ch/bugs/?73618

dded and corrected defines for new Fermi GPU type (David)

correct setting of fidutial regions

Handling of repeated requests of buffers greather than the default page size. Allocated memory increased whenever a new event required more space than available in each of the currently allocated buffers.
Releasing unused pages whenever a new page with more capacity is allocated. Decreasing also the default page size from 50 to 30 MB.
Adding a page summary for the statistics printout in debug mode.

Allow adding par files in the list of additional libs

Add SetOwner() for output lists

Coverity -unused variable- fix

MC tracks and header written now to all filters when available.

Increased glue thickness for IFC.
Added Central Drum segmentation

fixed typo

Adding Eva's minijet task to the compilation, updated call to AddTaskMinijet

Fix Coverity defects

minor coverity corrections

Move option to reclusterizer with calibrated amplitudes from NxN to mother Clusterizer, update calibration method to account for this option

Fix (Yifei)

Remove a run that is bad for V0 (350k events)

 fix memory leak from https://savannah.cern.ch/bugs/?72189