Updating doc

change a default cut

Pi0 histogram range changed

Pi0 finder added

hard-coded cuts are moved to the parameter set

final plotting macros

Add protection for missing pressure sensors

changes related to PWG1 train and small cleaning (A. Bercuci)

vertex finder moved from GlobalESDConverter to a separate component GlobalVertexer
It has to be called after the ESD converter
The component produces primary vertex histograms

fix compilation

fix BxByBz - testing

better ESD performance plot

fix compilation mismatches in the new framework

Process kPyMbAtlasTuneMC09 added

Fix in LoadCTPTimeParamsCDB() (Plamen)

QA for shifters revisited - Custom object removed

Changed logging level

Init event before deleting it !

Add example of how to assign lines to a module.

Oups. We probably do not want the memory leak checks part of the production version

Fixing a serious memory leak

Limited printout

Extended the set of deltaAOD jets and added general SISCONE config

copy TRD performance train to PWG1

Release the error coming from HLT

New class for SSD QA checker (Panos)

 added high p_T track cut, standard loose cuts + ITSRefit

Protection reinforced

Added setter for jet "radius" in DA

AliAnaCalorimeterQA: add PWG1 validation train wagon, remove prints on screen, implement a switch for the plots made in Terminate

add pid comparison macro

* Adding explicit priority settings for the global trigger menu items.
  This allows one to form priority groups which allows trigger menus to be operated in 3 modes:
  1) The trigger menu is evaluated until the first entry matches the trigger condition and further evaluation is stopped.
  2) All entries in the trigger menu are evaluated.
  3) A mixture of the above two extremes.
  A default merging operator for the trigger condition and domain merging expressions can now be specified in the trigger menu.
  In addition, one can add trailing operators to the trigger condition and domain merging expressions,
  which are used implicitly to concatenate sub-expressions from each trigger menu for case 2 and 3 above.
  This gives more flexibility than just having a default merging operator.
* Had to significantly change how the generated trigger logic is loaded, in particular to be able to use CINT to interpret the code.
  Got rid of the class factory concept in AliHLTGlobalTrigger and simplified the class.
  This was necessary because the factory concept did not want to work with CINT.
  Had to add the AliHLTGlobalTriggerWrapper class which interfaces between compiled code and an interpreted AliHLTGlobalTrigger class.
* Interpreting of trigger menu logic rather than on the fly compilation now works (however compilation is default for speed).
* Adding proper unit tests for the global trigger component in testGlobalTriggerComponent.C
* Added a comparison operator to the AliHLTTriggerDomain that can be used to compare if two domains are equivalent.
* Also improved the class documentation.

Fix coding violations

Fixing bug in destruction of global instance.

Rulechecker-complying update from P.Ganoti (pganoti@phys.uoa.gr)

Possibility to read as input the AOD that was just created from the ESD, in the same train

Added method to add a default set of jet fidners for a deltaAOD

Fix compiler warning

change clashing names

warning fix

new performance graph for energy loss in different TRD layers

Adding GRP/CTP/CTPtiming OCDB entry in AliRoot, from the file
used to generate the dummy one.

move trending variables from ASCII to binary (TList) (Federico
suggestion)
minimize number of output debug files to only one
TRD.DebugPerformance.root. reorganize debug printouts/data

Bug fix

Creating the detector-specific subdirectories

AliCTPTimeParams added (Plamen,Cvetan)

Updating dummy file for CTPtime params, and file used in the nightly tests
(Plamen).

function to create the standard jets added

account for limits of thrust variable (Sona)

Fix for the merged xml file name to be copied in alien in case of individual run numbers input (J.Castillo)

major updates to plotting macros

Bug fix: the TObjArray of input objects was not properly cleaned, because GetEntries() returns the number of non-zero pointers, not the array
size. Now this is changed to GetEntriesFast().

Fixed bug in NoCutV0s and moved the xy calculation to correct place

OCDB map, OCDB file list and Bz written to UserInfo of spTree

Fixing compilation warnings

GPU update from David Rohr

Store list of fired trigger classes.

Adding a fast parametric fitter

PreReading of MC information on demand.

Warnings...

coding violations fix (changed naming, added comments, made methods const)

Warning corrected.

Updating Strange tasks (by H.Ricaud, hricaud@gsi.de)

In AliMUONTriggerQADataMakerRec:
Adding missing comments.
(Diego)

Warning corrected

make definiton of number of clusters robust
modify ImproveSeeds functionality of the stand alone tracker
limit default verbosity and move to AliDebug

fix compiler warnings

- fixing compilation warning

Fix to the raw reader that properly decodes the parameter settings in the
RCU trailer.

Raw writer prepared for getting the number of bits written.

Added comment in display.

Updated flow examples.

Fix compiler warnings

Mods for Solaris

removed GetThrustAxis

new energy distributions for 900 GeV

- added OCDB folder and respective entry for the configuration of the HLT TPCHWClusterTransform component

Fix coding rule violations

Corrected comments for Doxygen

Update of 2 SSD macros (Panos)

Fix coding rule violations

updates to plotting macros for ppr

Creation of vertex constrained track parameters is moved to AliHLTVertexer,
Reading of the corresponding configuration flag fixed

deltas type modified, getdeltas added.

Increased class version

Removing macros MUONResoEffChamber.C, loadFromOCDB.C, now obsolete.
(Philippe P.)

Class AliMUONCDB:
- Changed to namespace (remove constructor and destructor)
- Added new functions to ease the loading of Mapping, Magnetic Field and RecoParam from OCDB (OCDB path and run number must properly set before using any of these function)
- Moved from libMUONbase in libMUONrec

Class AliMUONESDInterface:
- Adding a flag in functions converting ESD track to MUON track to disable the refitting of track parameters at each cluster. That way, you do not need to load the proper RecoParam and magnetic field, but the drawback is that only the track parameters at first cluster, copied directly from ESD, is meaningful.

Macros:
- Remove the unnecessary access to geometry, mapping, magnetic field and/or recoParam
- Use the new functionalities of AliMUONCDB to load these informations from the OCDB when needed (except geometry for now)

Updated relevant READMEs

(Philippe P., Ivana)

Adding new macros in loadmacros.C

Corrected comments for Doxygen

added additional protection against usage of custom QA data objects in Ref (see also savanah 57704)

declare the method Run for TNtuple virtual

removed unecessary protection

In MTR QA:
- Fixed normalization problems on shifter's histos when running with AMORE.
- Correctly filled the MTR "display" histos for experts.
- Improved code readability and re-usability.
(Aurelien, Diego)

Cut on min. amplitude (>10 ADC) in High and Low gain introduced.

Bug fix by Raphaelle

The problem with check-if-file-exists-in-alien has been committed to root trunk -- add comment saying to revert the change after we move to root 5.26.

libcurses needed in the compilation  of static executables if we use Root v5-25-02

- fixing bug in digit maker causing it to crash with new firmware

Fix bug in the definition of number of clusters/tracklet
The number of clustres/tracklet was artificially limited to 32
The bug was preventing tracklets in local high densities of clusters to
be constructed

- changed track storage to AliHLTGlobalBarrelTrack
- switched to the AliExternalTrackParam function for the calculation of cluster residuals (cluster errors need to be updated)
- implemented reconfigurable arguments:
  -event-modulo 20 (default), for the number of events which the track multiplity should be averaged over
  -buffer-size 5000(default), for the maximum number of entries for the ntuples filled (circular buffer approach)
- implemented functions for the reconfiguration from the OCDB entry
- removed obsolete or unnecessary functions
- removed dE/dx plot, will be produced by another HLT component

* AliEveEventSelectorWindow
  - Delete the displayed histogram before drawing a new one. Before the old
    axis range was used.
  - Make alignment of widgets pixel-perfect.

* visscan_init.C
  - Move QA browser tab after event selection tab.

- made OCDB configuration object for the HLT TPCTrackHisto component

improve tracklet error messaging
improve tracking tracker errors by new debug streams