automatically generated LinkDef: append option '+' to all class definitions in order
to use 'new' streamer concept (introduced in ROOT 3.0)

Surveyer measurements, report 818098

added a new class AliTPCAlign

Class creating the aligmnent object fro the surveyor measurements.

kPyJet: PARP(67) set to 2.5. ISR parameter that describes best the D0 djet analysis.

Additional include files (Matthias)

First round of ESD clean-up at the physics level: removing the tracks that do not enter ITS and are not attached to any secondary vertex

Introducing the notion of QA data acquisition cycle (needed by online)

Initialization of some data members (Christian)

Temporary fix until I figure out how to handle endian checking under Mac OS.

Adding options to control the data output better. Specifically to write to ROOT files using the dHLT Rootifier component. Also added parameter to specify path to LUT files.

Adding processing component to translate dHLT internal raw data blocks into ROOT objects of type AliHLTMUONRecHit, AliHLTMUONTriggerRecord and AliHLTMUONMansoTrack.

Adding ROOT classes to be able to store dHLT internal data in ROOT files.

Changing fSignal from short to int to prevent gaps in the data structure after compiler applied word alignment.

Adding flags for better control of event loading from the event number ID.

Introducing Raw data QA and replacing the QA data histograms by a Tlist of histograms

Introducing Raw data QA and replacing the QA data histograms by a Tlist of histograms

Adding a TStatToolkit
Some frequently used statistical functions

Operation on arrays
Histograms
Trees

Marian

Adding missing implementaion of GetInputBlock.

Fixing logic for generating log messages.

The file publisher now closes files when it is done with them during a given event processing. An optional flag has been added to implement the old behaviour (Bug #29876).

Fixing code to compile properly under debug build.

Drift velocity depends on anode (F. Prino)

Drif velocity depends on anode (F. Prino)

Estiamate of errors  for primary vertex position

Redundant lines removed.

AliDCSClient "multiSplit" option added in the DCS configuration
in AliDCSMessage: variable MAX_BODY_SIZE set to 500000

bugfix #29879: multiple subscribers in AliHLTSystem; code cleanup, documentation

TPC default configuration

bugfix: forward data type of the incoming block

Macros for Lee Yang Zeroes from Naomi van der Kolk

Initial classes for Lee Yang Zeroes from Naomi van der Kolk

Bug in rec from digits corrected

Adding binary package to create debugging utility within AliRoot build system.

init fixed after chenges by Cvetan; scanning of options moved to AliHLTSystem

Adding customised makefile for building the dHLTdumpraw standalone program.

apply idendical policy as PubSub for exchanged data blocks: NULL output allowed, all data blocks of publisher send to subscriber (bug #29871)

avoid repeated scanning of digit via a static instance

minor fix: documentation/compilation warnings

added switch for usage of internal or external HOMER library

Removing quick code hack and unnecessary methods. Now have a much cleaner implementation of the trigger DDL reconstructor.

Detectors can have more than one AMANDA server. SHUTTLE queries the servers sequentially,
merges the dcs aliases/DPs in one TMap and sends it to the preprocessor.

Fixing segfault in example components. Bug #29877.

Fix bug in creation of matrix arrays and rename functions and arrays

A small fix to cope with the bug of the default TChain constructor

- Added new option (AliMUONVTrackReconstructor::fgkComplementTracks) to add
  potentially missing clusters to the reconstructed tracks.
  (This can happen when muons hit 2 detection elements within the same chamber,
  because they overlap).
- Modified the option ImproveTracks() to remove bad tracks.
- Added timer info to monitor the tracking algorithm.
(Philippe P.)

autodict variable reset

AliTRDtrackerHLT removed as obsolete. All tracking done with offline code. New AliHLTTRDEsdWriterComponent.

26-sep-2007 NvE AliTrack extended with GetNsignals for a specific signal class.
                Also AliJet extended with GetNtracks for a specified track name.
27-sep-2007 NvE New memberfunction RemoveDevice() introduced in AliEvent.
                AliAstrolab derived from TTask, to provide a base class for TTask
                based processors.
                New class AliEventSelector introduced.
27-sep-2007 NvE Check for event selection/rejection flag introduced in IceCalibrate.cxx,
                IceChi2.cxx, IceCleanHits.cxx, IceDwalk.cxx, IceDwalkx.cxx, IceLinefit.cxx,
                IceMakeHits.cxx, IcePandel.cxx and IceXtalk.cxx.
27-sep-2007 NvE Check for event selection flag introduced in IceF2k.cxx and IceRawTWR.cxx
                to provide selected event output.

Modifying logging output of components.
Also added a optional flag to the Manso Tracker component to optionally send warnings if unexpected data block types are received rather than always
logging an error.

Reset method added in AliBin in order to avoid multiple delete/new calls (F. Prino)

charge matching patched (F.Prino)

Missing declarations related to the PMD DA code. Corrected destructors of the calibration objects

Fix to avoid memory resident tree in the vertexer (Marco)

Possiblity to store the space-points with the covariance matrix obtained during the tracking (Andrea)

minor code cleanup

New treatment of the cluster coordinate (Christoph)

More robust setting of fit range in FitRawSignal (P. Hristov)

Sign error for dphi move of jet axis close to phi = 0 corrected.

libMLP needed by TRD

online gain calibration added

tree is written

online gain calibration class

Implementation of local caching in the CDB access framework
exploiting the TFile caching functionality.

Local caching is activated in the AliCDBStorage initialisation. It is sufficent
to specify a local cache folder in the AliEn storage URI, e.g.:

AliCDBManager::Instance()->SetDefaultStorage("alien://dbFolder=/alice/simulation/OCDB?cacheFolder=/tmp/LocalCache");

If cache folder is specified AliCDBGrid opens the remote file with the option
"CACHEREAD".

In aliSimulation and AliReconstruction the activation of the "RemoteStorage" is
now obsolete and has been commented out.

bugfix: do not increment event counter in case of event processing failure

coding conventions, compilation warnings, code cleanup

scanning of options migrated from AliHLTReconstructor to AliHLTSystem; chain configuration via macros added;

Updated version (Bogdan)

Important changes to the reconstructor classes. Complete elimination of the run-loaders, which are now steered only from AliReconstruction. Removal of the corresponding Reconstruct() and FillESD() methods.

First implementation of neural network PID

Coding convention + var inizialization corrected

Histograms binning and limits are set in new constructor.

New methods for retrieving QA histograms + coding conventions (F.Prino)

Revertin some changes committed by mistake to the CVS HEAD

New classes

Update classes for the new analysis framwork

Obsolete classes with the new analysis framwork

Typo in Reset()

For Heavy Flavor off: switching of QQbar splittings is responsibility of
decayer.

Memory leak corrected.

Changes needed because of change of AliESDCaloCluster format.

Obsolete files removed.
No V1/V2 anymore. Versions updated and merged in offline as well.

Temporary hack to prevent error messages during pathological cases with particular types of DDL input data.

Memory leaks corrected (Ch. Klein-Boesing)

"Ali"-dependence in Notify removed from AliAnalysisManager.

Fixing logging option. It was not working properly.

Adding fixes and updates for memory handling. Also several extra debug messages added. (Indra).

Adding a macro to run the dHLT chain. This can be used as an example until AliHLTReconstructor is ready.

Bug fix and reduced memory consumption (F.Prino)

 Response of the 4 towers for the 2 neutron calorimeters since,
 in Pb-Pb we will provide event by event the centroid of the neutron
 impact point over the calorimeters. This quantity can be used
 to determine the reaction plane and therefore for flow analysis.
(Chiara Oppedisano)

The test function static (A.Kalweit)

Huber estimator used for robust fitting (A.Kalweit)

Small modification by Mateusz

Remove old clusterizers

Changing component naming to follow the rest of HLT.

Update and cleanup triggered by the offline developments.
Removal of obsolete files.

Minor script fixes

silvermy@ornl.gov : reverting to version 1.2

Crash protection ::Freq when n of elements ZERO - this should also trigger changes in the offline code

Bug fix: The component was not behaving correctly when processing empty DDL data and caused system errors.
Also:
1) Added a optional flag for logging warnings if we receive an unexpected data block type.
2) Removing unecessary memory copy and temporary buffer.