Updated DA config file + syntax error fix.

Adding a parameter with the min number of phys event required + additional printout about the events stat.

Improved check on PostData, fix of fix to mgr->GetRunFromPath

SDDRP - removed cdb->SetRun, initialize CDB clib objects at the first call of UserExec rather than UserCreateOutputObjects. ITStracking, ImpParRes - added PostData in UserCreateOutputObjects. SPD - no need to load geometry since in the train it is already done by AliTaskCDBconnect (protected via fTest)

Fix for savannah bug report 87728 (Laurent) + fix invalid read found with valgrind (Peter)

Improved version of AliAnalysisManager::GetRunFromAlienPath

setting the histogram file name for the TPC compression monitoring chains

adding publishing of histograms, by default all histograms are sent as separate objects; option '-publishing-mode off/separate/list/array' to switch publishing off or publish everything in a TList/TObjArray; removed the default histogram file name, so nothing is stored in local files unless the option '-histogram-file' is used to configure that feature

adding more monitoring histograms, correcting axis labels (Alberica)

Adding a flag for the shuffling + kinematic cuts for the MC analysis

adding further optimized compression format with additional 15% compression ratio in normal compression mode; correcting rounding errors in track model compression to make it lossless with respect to normal mode

Protection against divission by 0

In vmctest/*/g4Config.C:
Adding the physics selection in the TGeant4 title, so that
it can be retrievable in a user application.

Updating responsible list.

Added lambdas to PID histos

Adding possibility to use PID, + routine updates

Adding additional variable
Import for the debugging of derived functions

Updating + memory leak fix

use cosmics in gain calibration (A. Kalweit)

removing a deprecated consistency check which would cause conficts after introducing more HLT links in AliDAQ in r52071

moving iteration of parameter ids to separate function for better consistency with the calling code, fully backward compatible

Bug fix.
M. Weber

Updated DA config following the commit the DA source file.

Multi-vertexerTracks with clusterization + steering options in GRPRecoParam

more coverity fixes (M. Verweij)

coverity fix (M. Verweij)

Fixed warnings [-Wunused-but-set-variable] from GCC 4.6 -
switching to that will sure cause a lot of people to get
their SVN commit rights revoked :-)

bug 87732: memory leak fixed

Fixed warnings [-Wunused-but-set-variable] from GCC 4.6 -
switching to that will sure cause a lot of people to get
their SVN commit rights revoked :-)

Since the trigger bits are not available in the V0 raw-data header, we replace the trigger selection by a cut on the minimum number of TDC flags present.

revert calculation of Material Budget to previous version (TRD=Si) until
TOF bug 86673 is solved

Update (Andrea)

Remove the factor p/pt from the decaylengthXY calculation (Andrea)

Adding the trigger charge and bits to the ESD and AOD. They will be needed by phys sel, EMCAL analysis and any trigger related studies in pb-pb.

Correct index when filling amplitude histograms, L1 amplitude histograms for gamma and jet L1 added

Correct method combining conversion photons and calorimeter clusters, now fill also shower shape and weight histograms for the clusters under neutral meson peak

protection added

Update needed for the new ocdb SPDSparseDead (Annalisa)

Changed message for the DQM shifter - Reactivated check on uidrec=20.  (Melinda)

Adding the trigger charge and bits to the reco chain. Bumping the qa datamaker class version (because of previous commit). Next is to add these 3 new numbers to the V0 esd and aod.

Removed AliPHOSDigitDecalibrate: Digit decalibration now done in simulation

Removed AliPHOSDigitDecalibrate: Digit decalibration now done in simulation

Adding methods to calculate the number of trigger flags on each side and fill the V0 trigger bits which should be contained in the raw-data header.

Adding the centrality-trigger charge sums. Adding also the corresponding histogram in the qa datamaker. Changing also some qa histo ranges in order to cope with the HI data. More commits to come.

Fix for #86577: AliReconstruction::SlaveTerminate instantiate ALL Reconstructors

Compact TH1F fraction histograms into a single TH2F, coverity fix, cosmetics, add Terminate method

Coverity fixes

Protection added (Levente)

Fix for #87692: Patch request for new HLT links

Preventative fix for ROOT v5-30, which dropped string reference counting.

fix against 0 chi2 (M. Verweij)

empty task to estimate base line of memory and cpu for train testing

Changes needed for new HLT output DDLs.

Update for the status code related to the task #23161

Change of module numbers for display purposes

Fix for #76933: Fix access operator

TrackQA: included QA for golden chi2 + chi2 between global and global constrained track
Spectra: Added NClustersIter1 to the correction framework container. Only 6 bins in Ncls (0 70 80 90 100 120) to minimize memory usage. Efficiency can now be easily calculated for different cut values (M. Verweij)

Updated LambdaC analysis task: 1) Use AliPIDResponse instead of AliAODpidUtil x PID infos, 2)PID contamination histos: changed filling schema, 3) added 2 TList of histos (x multiplicity and priors studies) (Annalisa)

Add approximate estimation of the trigger pt-cut as a function of the run number (Diego)

Complete the set of correction steps, available for ESD and AODs. Histos which are not needed anymore were removed.

Code clean-up (Massimo)

Fix for #79704: G__exception in LHC10h pass 2

MCEventHandler derives from InputEventHandler
M. Vala

propagating patches from the online system

- initialization of AliTPCcalibDB
  patch https://savannah.cern.ch/patch/?5039#comment3
  bug https://savannah.cern.ch/bugs/?86155

- eliminating debug messages and correcting data oigin
  patch https://savannah.cern.ch/patch/?5039#comment4

Modifications required for marking that the 'Original Data Present' bit should be set in the CDH.

Fixes for #86279 Improper usage of TClonesArrays in MUON

speedup of track model compression by another factor 2

First implementation of EMCAL trigger QA from Nicola Arbor

Fix for the naming of DA's

Chambers occupancy stored in the ESDs, it has been packed with the reconstructed Cherenkov angle value. All the parts of code affected by the change have been accordingly modified

Fix for #87488 Commit + port request. New methods in AliStrLine

Disable use of HLT one pad clusters for tracking

Configuration file for the new pb-pb DA.

Bug fix.

changing default configuration to -deflater-mode 2 -mode 1

adding protection for invalid array index

added Print functions

correcting thresholds for cluster verification; typo in error message fixed

re-defining the TPC-compression chain to send also the HW clusters for easy qa in the reconstruction via an HLTOUT handler; drafting the handler

speeding up the loop over track clusters; masking a false error message

add macro to set HLTUsage

Global re-calibration added, Nonlinearity _on_ by default

Pass min E cut to unfolding class

Update the output file only in case minimum number of physics events is reached. Otherwise the results accumulated from previous runs.

Adding liblzma.a

Fixing coverity defects: 17612, 17611

Decalibration restored (was erroneously deleted in a previous commit).

SentNSysInfo propagated to the generated test

improved handleing of HLT input

In case of unfolding, the splitted energy of the shared cells must not be lower than threshold used in normal cells, in such case, do not split the cell and put it in cluster with more energy, from Adam

In case of recalibrating all cells, check not only the energy recalibration flag but also the time recalibration flag

Add possibility to apply non-linearity to cells

Pass the name of the MC model (Geant3, Geant4, Fluka), and title (G4 Physics list) to the geometry to set accordingly the sampling fraction. First approximate values for the sampling fraction in G4 based on recent grid G4 simulations

Fix number of events in Add method

Coverity fixes in QA and Pi0EbE
Pi0EbE: Add time per selected cluster and ncells per selected cluster histogram, remove diff time vs asymmetry histogram; Simplify code filling shower shape histograms, move to method
Electron: Add time histogram

Updates (Michael Weber)

removing unused code to correct compilation warning

adding histogram to monitor the number of failed cluster verifications; bugfix: correcting the sigmaY/Z^2 histograms by taking pad width and time pitch into account

better assignment of remaining clusters to tracks; minor bugfix in the calculation of the compression ratio: in verification mode the cluster id blocks had been wrongly taken into account

sorting the raw trackpoints in the array to be better consistent with loop over padrows, the unordered sequence caused in rare circumstances decoding errors due to misidentification of trackpoint ids with rows; adding fatal error message if pad or time of an associate cluster exceeds the range for the compressed format