PID array initialization fixed.

Repeated #include removed.

Switch between Geant3 and Fluka introduced.

Added various files used for analysis of HLT output data.
These files provides code examples for anyone who wants
to analyze HLT output data.

Most of this code will be used online in HLT at some later stage.

Iolated mip trigger for PHOS HLT

quick fix

Partial removal of coding convention violations (A. Dainese)

Minor changes

Forgot this one

added new files

Improved Online display, The Handle event function
of TH2D is overwritten to have the possibility to
click in the display to show raw data

FEE configuration file

added new files

Added new files to build system

Fast online clusterizer now working (Oystein)

new classes for cosmic calibration

Classes for online creation of root trees

Changes in AliHLTPHOSBase classes, all Processors now inherits
from AliHLTPHOSConfig (hlt configuration), and AliHLTPHOSAltroConfig (FEE configuration)

Data quality monitoring (Oystein)

General purphose component (Oystein)

Improved online calibration algorithms, Energy and Dead channel histograms updated
to file during run if requested by user

Minor changes needed for debugging purphoses

fixed code violation

New classes to make AliHLTPHOSDigits online (Oystein)

New definitions

New classes for PHOS DA / calibration tasks (Oystein)

MediumId() implemented.

Modified structure and new class for all HLT PHOS componentsx

baseLinkDef &LibT0base with new classes

classes for alignment from Tomek

Monitoring of process information: updated version (Marian)

Obsolete code commented out (Annalisa)

Bug fix: The Next Bunch function now works properly

Added new paramater for bunch size

Minor changes

Problem with shYOUT1 corrected (repeating section). (A. Gheata)

Allow material names without _

15-oct-2007 NvE Typo corrected in docs of AliAstrolab.cxx and memberfunctions GetMedian
                and GetSpread of AliSample.cxx extended for Y-values of histo data.

Coding conventions

Stepping called right after source using sodraw.

Protection in calculation of sqrt(1-c*c) expression.

Pemf generation option is obsolete. Removed.

If gamma in eta acceptance rotate event into PHOS phi acceptance.
(R. Diaz Valdes)

Introduced the checking of QA results from previous step before entering the event loop

Fix which prevents the decoder crash in case of corrupted RCU trailer data (Per Thomas)

Optional input event handler.

Method SetInputTree() added to the interface.

add initialization of TOF SM configuration in the ctors (S.Arcelli-A.De Caro)

Fix coding viols

Fixed coding conventions

Correct deleting of character strings.

Handler for AOD input for analysis.

Port changes from v4-06-Release to the HEAD

Handler for ESD input for analysis.

Realisation of VEventHandler for input events.
Serves as base class for ESD and AOD input.

recent LookUpTable

reading and writing raw with recent LookUpTable

AliDCSSensor: Updated Eval method to return first/last value of fit if specified time is outside fit period. AliDCSSensorArray: Added function to report how many detectors where a succesful fit was made. AliTPCSensorTemp, AliTPCSensorTempArray: Entered possibility to configure Amanda string for temperature parameters. AliTPCPreprocessor: Corrected Amanda string for temperature DCS maps. Corrections to meet requirements from failover tests. (Haavard)

Coding violations corrected.

Coding convention fixes from Stefan

removed TPC CA tracker

rootcint sees ALI_DATE and not DATE_ROOT

Coding violations corrected.

coding conventions

Primary ionisation electrons come now correctly ordered from FLUKA.

bugfix AliHLTDataBuffer: correct handling of pointer and offset in block descriptor, fixes bug #29974
AliHLTComponent: reverting previous changes which were supposed to fix the mentioned bug
minor argument check in external interface and correction in documentation

Moving AliMillepede from MUON to libSTEER

Mistyping corrected.

time offset and charge conversion to energy unit moved from Cluster finder V2 to response class

Close the file in TerminateIO()

Method GetCalibrationObjects removed from AliITSsimulationSPD. New calibration default file for SPD with 1% random dead channels

bugfix: creation of objects in and from the out/input buffer, fixes bug #29974

improvements in RawReaderPublisher (merged from v4-07-Release)

bugfix: option key has been changed

bugfix: implement low level GetEvent method, otherwise it is not called because AliHLTFilePublisher implements low level method

new class AliITSClusterParam. It has GetError and GetNTeor methods, previously included in AliITStrackerMI. Possibility to disable use of amplitude info (dE in TPC and in SDD/SSD) for cluster-track matching by using AliITSRecoParam::SetUseAmplitudeInfo(kFALSE) - A. Dainese

GetFile error handling modified after Shuttle failover tests

Retrieving and merging the raw data tags - output object/file location should be discussed

Switch back to number based input.

Protection against 0 number of pedestal samples in corrupted data

Check first if a material (element) has been predefined by FLUKA.
If yes, use the same index.

bugfix: set USE_ROOT define for AliRoot build system

Bug fix in Mlem(): adding protection against division by zero
(Sasha)

Additional protection against the absence of QA reference data

fix in hlt build system

pintout removed

removed setting of the CouplingRow default. Now in AliITSCalibrationSPD

new default value for CouplingRow

updated as required to create proper calibration file using the macro AliITSStoreDeadSPD.C

new macro to create the SPD calibration file

Updating serial manu numbers for station 1 and station 2
(Christian)

Adding check for correct initialization:
do not process subprocessors if initialization failed.
(Laurent)

Protection against the absence of QA reference data

Writing all the QA results in a single root file

set as default configuration the geometry with PHOS holes

Adding setter to switch on-off for Kink Finder (Marian)

Array of track references added to AliMCParticle.
The implementation uses a TRefArrays to objects cashed in AliMCEvent.

Removing an extra directory

Adding ia64 platform as little endian

Float_t and Double_t replace by Double32_t.
AliAODVertex* replaced by TRef to AliAODVertex.