Merge from EVE-dev to HEAD.

New file: initialization script for reve when launched from root.exe (there is unsolved problem with exception-catching in main event-loop).

Changing access to magnetic field (Christian)

Remove files accidentally commited to HEAD.

A new function returning a unit vector along the track direction

Update to FLUKA 2006.3(respin)

updated plots

removing AliSelector, AliSelectorRL that has been moved to STEER

New file: combined top-level TRD and TOF geometry.

New file: full alice geometry.

New file: TRD hits split by z-coordinate.

New file: PMD geometry.

Updated for FLUKA 2006.3(respin)

Macros for residual and full misalignment, collected by Raffaele

Coding conventions

Adding Riostream.h

New transformation description

remove EMCAL-specific alignment objects - obsolete

AddAlignableVolumes() method added for EMCAL

remove EMCAL-specific alignment classes - obsolete

simple Config.C for testing EMCAL

some simple test macros for EMCAL simulation and reconstruction

new (mis-)alignment macro for EMCAL, based a little bit on PHOS

new alignment files for EMCAL

remove old alignment data object, to be replaced with new version

Now have consistant definition of slope and intersept in line fit and
fixed up coding convension violations.

Effective C++ changes

Replacing the friend declarations by setters and getters (Federico)

Modified for CAF

And the last friend leaves ...

There goes one more friend

Mods due to recently changed CDB interface

Remove AliTRDtrackHits

Loading libpythia.so before libpdf.so

MUONrectrigger and MUONrectracks fixed (Christian)

Using herwig65.inc instead of HERWIG65.INC

More precise formula for estimating the covariance matrix of the impact parameters (A.Dainese)

Extraction of Local Trigger Board number included (Christian, Philippe)

Added target for smell checker

Add copy ctr & assignement opr (Christian)

Create TriggerCircuit and TriggerCrateStore object (Christian)

Get TriggerCircuit info from  Reconstructor class (Christian)

Get TriggerCrateStore info from Reconstructor class (Christian)

Make calibration default wise, remove the switch (Laurent & Christian)

Loading map field for extrapolation (Christian)

Define map field from outside (Christian)

Using AliTracker (external mag field) instead of gAlice->Field (Nicolas & Christian)

remove AliMUONTriggerCircuit.cxx AliMUONTriggerDecision.cxx AliMUONTriggerDecisionV1.cxx AliMUONTriggerCircuit.h AliMUONTriggerDecision.h AliMUONTriggerDecisionV1.h

small bug in ichamber numbering fixed (Christian)

remove calls to old trigger code and set new trigger code as default

remove switch to select trigger code version

remove usage old trigger code

remove old trigger code, AliMUONTriggerCircuit. Set NewDigitizerNewTrigger as default for DigitizerType

digitizerType changed to default

remove AliMUONTriggerCircuit and call to old trigger code

remove calls to AliMUONTriggerDecision

remove AliMUONTriggerCircuit

remove AliMUONTriggerDecision AliMUONTriggerDecisionV1

Also dropping references to AliMUONTriggerCircuit which are depricated. This is a temporary solution. Need to move to new L0 trigger classes.

extensions in AliHLTTPCDisplay
- handling of new include directory structure of the HOMER header files
- default geometry file introduced
- library compile time and property functions added
- geometry file alice.geom added to distribution; to be installed in
  <prefix>/share/alice-hlt

moved AliSelector, AliSelectorRL to STEER
splitted AliPWG0Helper classes in ESD/RL-dependent part
introduced x-sections study in selectors
many more things...

adapting to new CDB classes

In RunSimulation the run number is set into AliCDBManager but the storages
are not activated (this is done in Run()), and then AliCDBManager tries to
query the CDB for valid files. The problem was that there was no check that
the storage existed, and that was the cause of the crash. I added that
protection, now the query is skipped if the storage is not activated.

Alberto

fixing wrong define

applying to the new interface

changing order of library loading

fixed copy constructor

Added Reset function

Dropping references to AliMUONLocalTrigger which are depricated. This is a temporary solution.

Remove declaration of unimplemented method

Max. angle in mag. field limited to 10deg.

empty selector that can be used as basis to build analysis that builds on top of AliSelector

Example of PHOS shuttle usage (B.Polichtchouk)

First PHOS shuttle classes

replaced by lower case

Move to symbolic links

new trigger code set to default

changing brackets of include

6.5 includes

SetTriggerEffCells and GetTriggerEffCells corrected

kPyLhwgMb added.

PARP(81) set to 0. for HF production (A. Dainese)

Start trigger chamber id from 10 (same convention as tracker) (Christian)

added trigger plots

switch to activate trigger chamber efficiency from Config (Diego, Philippe)

bug fix for keeping correctly .ml files

- Clean-up
- EffC++ Warnings

added a couple of functions

Implemented Raw2SDigits for trigger (Christian)

new SDD preprocessor + removal of eff C++ warning (base) - E. Crescio

update (alberto):
fixed memory leaks
storing of objects that failed to be stored to the grid before
interfacing of shuttle status table in daq system

Implement symbolic links

Direct dependence on TGeant3 removed (P. Hristov)

New srcml based smell detector

Minor fixes needed on Mac with g95

Dummy codes for CTEQ6 pdfs

adding copyright lines

Small interface change in StoreReferenceData

Small interface change of function StoreReferenceData in Shuttle

Obsolete pdf commented out.